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C4 A G 17 ? ? 103.81 106.40 -2.59 0.40 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 G A 1 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 2 1 C A 3 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 3 1 A A 4 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 4 1 C A 6 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 5 1 G A 17 ? ? 0.049 'SIDE CHAIN' 6 2 G A 1 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 7 2 C A 6 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 8 2 C A 19 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 9 3 G A 1 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 10 3 C A 6 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 11 3 G A 17 ? ? 0.050 'SIDE CHAIN' 12 4 G A 1 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 13 4 C A 3 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 14 4 A A 4 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 15 4 C A 6 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 16 4 G A 15 ? ? 0.048 'SIDE CHAIN' 17 4 G A 17 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 18 4 C A 18 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 19 5 G A 1 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 20 5 C A 3 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 21 5 C A 6 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 22 5 G A 17 ? ? 0.048 'SIDE CHAIN' 23 5 C A 19 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 24 6 G A 1 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 25 6 C A 3 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 26 6 A A 4 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 27 6 G A 17 ? ? 0.049 'SIDE CHAIN' 28 6 C A 19 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 29 7 G A 1 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 30 7 C A 6 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 31 7 G A 15 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 32 7 C A 19 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 33 8 G A 1 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 34 8 A A 4 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 35 8 C A 5 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 36 8 C A 6 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 37 8 G A 15 ? ? 0.049 'SIDE CHAIN' 38 8 C A 19 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 39 9 G A 1 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 40 9 G A 17 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 41 10 G A 1 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 42 10 C A 3 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 43 10 C A 6 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 44 10 C A 19 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1ATO 'a-form double helix' 1ATO 'hairpin loop' 1ATO 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 19 1_555 -0.488 -0.463 0.207 0.735 -7.852 -5.722 1 A_G1:C19_A A 1 ? A 19 ? 19 1 1 A G 2 1_555 A C 18 1_555 -0.383 -0.343 0.245 -1.407 -9.335 -1.875 2 A_G2:C18_A A 2 ? A 18 ? 19 1 1 A C 3 1_555 A G 17 1_555 -0.246 -0.205 0.260 0.184 -9.669 -3.492 3 A_C3:G17_A A 3 ? A 17 ? 19 1 1 A A 4 1_555 A U 16 1_555 0.039 -0.141 0.244 2.661 -10.685 -10.341 4 A_A4:U16_A A 4 ? A 16 ? 20 1 1 A C 5 1_555 A G 15 1_555 -0.087 -0.346 0.178 0.826 -8.932 -3.294 5 A_C5:G15_A A 5 ? A 15 ? 19 1 1 A C 6 1_555 A G 14 1_555 0.310 -0.372 0.252 1.009 -7.903 -1.957 6 A_C6:G14_A A 6 ? A 14 ? 19 1 1 A U 7 1_555 A C 13 1_555 4.785 -2.459 -0.393 6.092 -31.637 -2.722 7 A_U7:C13_A A 7 ? A 13 ? ? ? # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A G 1 1_555 A C 19 1_555 A G 2 1_555 A C 18 1_555 0.369 -0.824 3.732 -1.697 -4.314 35.460 -0.625 -0.883 3.782 -7.046 2.771 35.752 1 AA_G1G2:C18C19_AA A 1 ? A 19 ? A 2 ? A 18 ? 1 A G 2 1_555 A C 18 1_555 A C 3 1_555 A G 17 1_555 -0.332 -1.242 3.442 -0.092 2.513 32.443 -2.672 0.575 3.340 4.490 0.165 32.538 2 AA_G2C3:G17C18_AA A 2 ? A 18 ? A 3 ? A 17 ? 1 A C 3 1_555 A G 17 1_555 A A 4 1_555 A U 16 1_555 -0.799 -1.065 3.126 -0.604 14.031 34.139 -3.399 1.191 2.524 22.743 0.979 36.835 3 AA_C3A4:U16G17_AA A 3 ? A 17 ? A 4 ? A 16 ? 1 A A 4 1_555 A U 16 1_555 A C 5 1_555 A G 15 1_555 0.567 -0.665 3.585 0.210 10.583 35.464 -2.575 -0.864 3.263 16.914 -0.335 36.961 4 AA_A4C5:G15U16_AA A 4 ? A 16 ? A 5 ? A 15 ? 1 A C 5 1_555 A G 15 1_555 A C 6 1_555 A G 14 1_555 0.322 -0.572 3.413 -0.619 16.900 37.526 -2.681 -0.527 2.900 24.788 0.908 41.035 5 AA_C5C6:G14G15_AA A 5 ? A 15 ? A 6 ? A 14 ? 1 A C 6 1_555 A G 14 1_555 A U 7 1_555 A C 13 1_555 0.076 -0.277 4.056 2.659 -16.546 52.988 0.923 0.115 3.973 -18.041 -2.899 55.392 6 AA_C6U7:C13G14_AA A 6 ? A 14 ? A 7 ? A 13 ? #