data_1EBR # _entry.id 1EBR # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.355 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 1EBR pdb_00001ebr 10.2210/pdb1ebr/pdb WWPDB D_1000172997 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 1EBQ 'ENSEMBLE OF 5 STRUCTURES' unspecified PDB 1EBS 'ENSEMBLE OF 5 STRUCTURES' unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1EBR _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 1997-03-20 _pdbx_database_status.deposit_site ? _pdbx_database_status.process_site BNL _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Peterson, R.D.' 1 'Feigon, J.' 2 # _citation.id primary _citation.title 'Structural change in Rev responsive element RNA of HIV-1 on binding Rev peptide.' _citation.journal_abbrev J.Mol.Biol. _citation.journal_volume 264 _citation.page_first 863 _citation.page_last 877 _citation.year 1996 _citation.journal_id_ASTM JMOBAK _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0022-2836 _citation.journal_id_CSD 0070 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 9000617 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1006/jmbi.1996.0683 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Peterson, R.D.' 1 ? primary 'Feigon, J.' 2 ? # _cell.entry_id 1EBR _cell.length_a 1.000 _cell.length_b 1.000 _cell.length_c 1.000 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1EBR _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description 'HIV-1 REV RESPONSIVE ELEMENT RNA' _entity.formula_weight 9691.801 _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGACGGUACACC _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGACGGUACACC _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 G n 1 5 G n 1 6 G n 1 7 C n 1 8 G n 1 9 C n 1 10 A n 1 11 G n 1 12 C n 1 13 U n 1 14 U n 1 15 C n 1 16 G n 1 17 G n 1 18 C n 1 19 U n 1 20 G n 1 21 A n 1 22 C n 1 23 G n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 A n 1 27 C n 1 28 A n 1 29 C n 1 30 C n # _struct_ref.id 1 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 1EBR _struct_ref.pdbx_db_accession 1EBR _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin ? # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 1EBR _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 30 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 1EBR _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 30 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 30 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 1EBR _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number ? _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 5 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria ? # _pdbx_nmr_software.classification refinement _pdbx_nmr_software.name X-PLOR _pdbx_nmr_software.version 3.1 _pdbx_nmr_software.authors BRUNGER _pdbx_nmr_software.ordinal 1 # _exptl.entry_id 1EBR _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.crystals_number ? # _struct.entry_id 1EBR _struct.title ;STRUCTURE OF RNA (5'-GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGCGGUACCAC-3'), NMR, 5 STRUCTURES ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1EBR _struct_keywords.pdbx_keywords RNA _struct_keywords.text 'RIBONUCLEIC ACID, RNA' # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A G 1 N1 ? ? ? 1_555 A C 30 N3 ? ? A G 1 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 1 N2 ? ? ? 1_555 A C 30 O2 ? ? A G 1 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 1 O6 ? ? ? 1_555 A C 30 N4 ? ? A G 1 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A C 29 N3 ? ? A G 2 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 2 N2 ? ? ? 1_555 A C 29 O2 ? ? A G 2 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A C 29 N4 ? ? A G 2 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A U 3 N3 ? ? ? 1_555 A A 28 N1 ? ? A U 3 A A 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A U 3 O4 ? ? ? 1_555 A A 28 N6 ? ? A U 3 A A 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A G 4 N1 ? ? ? 1_555 A C 27 N3 ? ? A G 4 A C 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A G 4 N2 ? ? ? 1_555 A C 27 O2 ? ? A G 4 A C 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A G 4 O6 ? ? ? 1_555 A C 27 N4 ? ? A G 4 A C 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A G 5 N1 ? ? ? 1_555 A A 26 N1 ? ? A G 5 A A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A G 5 O6 ? ? ? 1_555 A A 26 N6 ? ? A G 5 A A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A G 6 N1 ? ? ? 1_555 A G 24 O6 ? ? A G 6 A G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_3_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A G 6 O6 ? ? ? 1_555 A G 24 N1 ? ? A G 6 A G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_3_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A C 7 N3 ? ? ? 1_555 A G 23 N1 ? ? A C 7 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A C 7 N4 ? ? ? 1_555 A G 23 O6 ? ? A C 7 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A C 7 O2 ? ? ? 1_555 A G 23 N2 ? ? A C 7 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A G 8 N1 ? ? ? 1_555 A C 22 N3 ? ? A G 8 A C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A G 8 N2 ? ? ? 1_555 A C 22 O2 ? ? A G 8 A C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A G 8 O6 ? ? ? 1_555 A C 22 N4 ? ? A G 8 A C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A C 9 N3 ? ? ? 1_555 A G 20 N1 ? ? A C 9 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A C 9 N4 ? ? ? 1_555 A G 20 O6 ? ? A C 9 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A C 9 O2 ? ? ? 1_555 A G 20 N2 ? ? A C 9 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A A 10 N1 ? ? ? 1_555 A U 19 N3 ? ? A A 10 A U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A A 10 N6 ? ? ? 1_555 A U 19 O4 ? ? A A 10 A U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 11 N1 ? ? ? 1_555 A C 18 N3 ? ? A G 11 A C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 11 N2 ? ? ? 1_555 A C 18 O2 ? ? A G 11 A C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A G 11 O6 ? ? ? 1_555 A C 18 N4 ? ? A G 11 A C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A C 12 N3 ? ? ? 1_555 A G 17 N1 ? ? A C 12 A G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A C 12 N4 ? ? ? 1_555 A G 17 O6 ? ? A C 12 A G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A C 12 O2 ? ? ? 1_555 A G 17 N2 ? ? A C 12 A G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A U 13 O2 ? ? ? 1_555 A G 16 N1 ? ? A U 13 A G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1EBR _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 1EBR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 G 1 1 1 G G A . n A 1 2 G 2 2 2 G G A . n A 1 3 U 3 3 3 U U A . n A 1 4 G 4 4 4 G G A . n A 1 5 G 5 5 5 G G A . n A 1 6 G 6 6 6 G G A . n A 1 7 C 7 7 7 C C A . n A 1 8 G 8 8 8 G G A . n A 1 9 C 9 9 9 C C A . n A 1 10 A 10 10 10 A A A . n A 1 11 G 11 11 11 G G A . n A 1 12 C 12 12 12 C C A . n A 1 13 U 13 13 13 U U A . n A 1 14 U 14 14 14 U U A . n A 1 15 C 15 15 15 C C A . n A 1 16 G 16 16 16 G G A . n A 1 17 G 17 17 17 G G A . n A 1 18 C 18 18 18 C C A . n A 1 19 U 19 19 19 U U A . n A 1 20 G 20 20 20 G G A . n A 1 21 A 21 21 21 A A A . n A 1 22 C 22 22 22 C C A . n A 1 23 G 23 23 23 G G A . n A 1 24 G 24 24 24 G G A . n A 1 25 U 25 25 25 U U A . n A 1 26 A 26 26 26 A A A . n A 1 27 C 27 27 27 C C A . n A 1 28 A 28 28 28 A A A . n A 1 29 C 29 29 29 C C A . n A 1 30 C 30 30 30 C C A . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 1997-07-07 2 'Structure model' 1 1 2008-03-24 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2022-02-16 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' 'Database references' 4 4 'Structure model' 'Derived calculations' 5 4 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' database_2 2 4 'Structure model' pdbx_database_status 3 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly 4 4 'Structure model' pdbx_struct_oper_list # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 4 'Structure model' '_pdbx_database_status.process_site' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal X-PLOR 'model building' 3.1 ? 1 X-PLOR refinement 3.1 ? 2 X-PLOR phasing 3.1 ? 3 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 "HO2'" A C 7 ? ? "O5'" A G 8 ? ? 1.51 2 1 "HO2'" A C 9 ? ? "O5'" A A 10 ? ? 1.51 3 1 "O2'" A G 20 ? ? H5 A C 22 ? ? 1.52 4 1 "HO2'" A G 6 ? ? "O4'" A C 7 ? ? 1.57 5 2 "HO2'" A A 26 ? ? "O5'" A C 27 ? ? 1.36 6 2 O2 A U 13 ? ? H21 A G 16 ? ? 1.40 7 2 "HO2'" A C 9 ? ? "O5'" A A 10 ? ? 1.43 8 2 "HO2'" A G 5 ? ? OP2 A G 6 ? ? 1.46 9 2 "O2'" A G 20 ? ? H5 A C 22 ? ? 1.56 10 2 "O2'" A A 26 ? ? H6 A C 27 ? ? 1.56 11 2 "HO2'" A C 7 ? ? "O5'" A G 8 ? ? 1.57 12 3 "HO2'" A A 21 ? ? "O5'" A C 22 ? ? 1.32 13 3 "HO2'" A C 9 ? ? "O5'" A A 10 ? ? 1.33 14 3 "HO2'" A C 15 ? ? "O5'" A G 16 ? ? 1.39 15 3 "HO2'" A G 23 ? ? "O5'" A G 24 ? ? 1.43 16 3 "HO2'" A G 24 ? ? "O5'" A U 25 ? ? 1.47 17 3 "HO2'" A G 8 ? ? "O4'" A C 9 ? ? 1.50 18 3 "HO2'" A C 7 ? ? "O5'" A G 8 ? ? 1.60 19 3 O2 A U 13 ? ? H21 A G 16 ? ? 1.60 20 4 H3 A U 13 ? ? "O2'" A C 15 ? ? 1.31 21 4 "HO2'" A C 15 ? ? "O5'" A G 16 ? ? 1.32 22 4 "HO2'" A G 23 ? ? "O5'" A G 24 ? ? 1.35 23 4 "HO2'" A A 26 ? ? "O5'" A C 27 ? ? 1.40 24 4 "HO2'" A G 6 ? ? "O4'" A C 7 ? ? 1.43 25 4 "O2'" A A 26 ? ? H6 A C 27 ? ? 1.46 26 4 "O2'" A G 20 ? ? H5 A C 22 ? ? 1.50 27 4 "HO2'" A C 9 ? ? "O5'" A A 10 ? ? 1.52 28 4 "HO2'" A C 7 ? ? "O5'" A G 8 ? ? 1.53 29 4 "HO2'" A G 5 ? ? OP2 A G 6 ? ? 1.53 30 5 "HO2'" A C 9 ? ? "O5'" A A 10 ? ? 1.43 31 5 "HO2'" A C 22 ? ? "O5'" A G 23 ? ? 1.47 32 5 "HO2'" A G 24 ? ? "O5'" A U 25 ? ? 1.55 33 5 "HO2'" A C 7 ? ? "O5'" A G 8 ? ? 1.58 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 C5 A G 1 ? ? N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? 100.35 104.30 -3.95 0.50 N 2 1 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 120.09 113.10 6.99 0.50 N 3 1 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 102.55 106.40 -3.85 0.40 N 4 1 C5 A G 2 ? ? N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? 100.30 104.30 -4.00 0.50 N 5 1 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 120.08 113.10 6.98 0.50 N 6 1 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 102.62 106.40 -3.78 0.40 N 7 1 C5 A G 4 ? ? N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? 100.30 104.30 -4.00 0.50 N 8 1 N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? 120.11 113.10 7.01 0.50 N 9 1 C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? C4 A G 4 ? ? 102.58 106.40 -3.82 0.40 N 10 1 C5 A G 5 ? ? N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? 100.46 104.30 -3.84 0.50 N 11 1 N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? 120.24 113.10 7.14 0.50 N 12 1 C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? C4 A G 5 ? ? 102.35 106.40 -4.05 0.40 N 13 1 C5 A G 6 ? ? N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? 100.15 104.30 -4.15 0.50 N 14 1 N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? 119.99 113.10 6.89 0.50 N 15 1 C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? C4 A G 6 ? ? 102.66 106.40 -3.74 0.40 N 16 1 C5 A G 8 ? ? N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? 100.35 104.30 -3.95 0.50 N 17 1 N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? 120.26 113.10 7.16 0.50 N 18 1 C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? C4 A G 8 ? ? 102.54 106.40 -3.86 0.40 N 19 1 C5 A A 10 ? ? N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? 100.18 103.90 -3.72 0.50 N 20 1 N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? 120.18 113.80 6.38 0.50 N 21 1 C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? C4 A A 10 ? ? 102.39 105.80 -3.41 0.40 N 22 1 C5 A G 11 ? ? N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? 100.31 104.30 -3.99 0.50 N 23 1 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 120.10 113.10 7.00 0.50 N 24 1 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 102.62 106.40 -3.78 0.40 N 25 1 C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? 100.43 104.30 -3.87 0.50 N 26 1 N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? 120.14 113.10 7.04 0.50 N 27 1 C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? 102.49 106.40 -3.91 0.40 N 28 1 C5 A G 17 ? ? N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? 100.28 104.30 -4.02 0.50 N 29 1 N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? 120.10 113.10 7.00 0.50 N 30 1 C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? C4 A G 17 ? ? 102.68 106.40 -3.72 0.40 N 31 1 "C3'" A G 20 ? ? "C2'" A G 20 ? ? "C1'" A G 20 ? ? 106.50 101.50 5.00 0.80 N 32 1 C5 A G 20 ? ? N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? 100.34 104.30 -3.96 0.50 N 33 1 N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? 119.94 113.10 6.84 0.50 N 34 1 C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? C4 A G 20 ? ? 102.64 106.40 -3.76 0.40 N 35 1 C5 A A 21 ? ? N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? 100.28 103.90 -3.62 0.50 N 36 1 N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? 120.08 113.80 6.28 0.50 N 37 1 C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? C4 A A 21 ? ? 102.16 105.80 -3.64 0.40 N 38 1 "C3'" A C 22 ? ? "C2'" A C 22 ? ? "C1'" A C 22 ? ? 106.43 101.50 4.93 0.80 N 39 1 C5 A G 23 ? ? N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? 100.32 104.30 -3.98 0.50 N 40 1 N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? 120.08 113.10 6.98 0.50 N 41 1 C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? C4 A G 23 ? ? 102.67 106.40 -3.73 0.40 N 42 1 C5 A G 24 ? ? N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? 100.30 104.30 -4.00 0.50 N 43 1 N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? 120.12 113.10 7.02 0.50 N 44 1 C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? C4 A G 24 ? ? 102.37 106.40 -4.03 0.40 N 45 1 C5 A A 26 ? ? N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? 100.08 103.90 -3.82 0.50 N 46 1 N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? 119.84 113.80 6.04 0.50 N 47 1 C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? C4 A A 26 ? ? 102.54 105.80 -3.26 0.40 N 48 1 C5 A A 28 ? ? N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? 100.04 103.90 -3.86 0.50 N 49 1 N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? 120.04 113.80 6.24 0.50 N 50 1 C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? C4 A A 28 ? ? 102.49 105.80 -3.31 0.40 N 51 2 C5 A G 1 ? ? N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? 100.40 104.30 -3.90 0.50 N 52 2 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 120.10 113.10 7.00 0.50 N 53 2 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 102.53 106.40 -3.87 0.40 N 54 2 C5 A G 2 ? ? N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? 100.40 104.30 -3.90 0.50 N 55 2 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 120.02 113.10 6.92 0.50 N 56 2 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 102.69 106.40 -3.71 0.40 N 57 2 C5 A G 4 ? ? N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? 100.27 104.30 -4.03 0.50 N 58 2 N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? 120.14 113.10 7.04 0.50 N 59 2 C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? C4 A G 4 ? ? 102.66 106.40 -3.74 0.40 N 60 2 C5 A G 5 ? ? N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? 100.34 104.30 -3.96 0.50 N 61 2 N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? 120.09 113.10 6.99 0.50 N 62 2 C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? C4 A G 5 ? ? 102.52 106.40 -3.88 0.40 N 63 2 C5 A G 6 ? ? N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? 100.15 104.30 -4.15 0.50 N 64 2 N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? 119.93 113.10 6.83 0.50 N 65 2 C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? C4 A G 6 ? ? 102.62 106.40 -3.78 0.40 N 66 2 C5 A G 8 ? ? N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? 100.34 104.30 -3.96 0.50 N 67 2 N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? 120.14 113.10 7.04 0.50 N 68 2 C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? C4 A G 8 ? ? 102.59 106.40 -3.81 0.40 N 69 2 C5 A A 10 ? ? N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? 100.21 103.90 -3.69 0.50 N 70 2 N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? 119.97 113.80 6.17 0.50 N 71 2 C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? C4 A A 10 ? ? 102.45 105.80 -3.35 0.40 N 72 2 C5 A G 11 ? ? N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? 100.33 104.30 -3.97 0.50 N 73 2 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 120.11 113.10 7.01 0.50 N 74 2 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 102.58 106.40 -3.82 0.40 N 75 2 C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? 100.34 104.30 -3.96 0.50 N 76 2 N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? 119.99 113.10 6.89 0.50 N 77 2 C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? 102.55 106.40 -3.85 0.40 N 78 2 C5 A G 17 ? ? N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? 100.30 104.30 -4.00 0.50 N 79 2 N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? 120.13 113.10 7.03 0.50 N 80 2 C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? C4 A G 17 ? ? 102.61 106.40 -3.79 0.40 N 81 2 "C3'" A G 20 ? ? "C2'" A G 20 ? ? "C1'" A G 20 ? ? 106.36 101.50 4.86 0.80 N 82 2 C5 A G 20 ? ? N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? 100.37 104.30 -3.93 0.50 N 83 2 N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? 119.89 113.10 6.79 0.50 N 84 2 C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? C4 A G 20 ? ? 102.71 106.40 -3.69 0.40 N 85 2 C5 A A 21 ? ? N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? 100.32 103.90 -3.58 0.50 N 86 2 N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? 120.05 113.80 6.25 0.50 N 87 2 C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? C4 A A 21 ? ? 102.20 105.80 -3.60 0.40 N 88 2 "C3'" A C 22 ? ? "C2'" A C 22 ? ? "C1'" A C 22 ? ? 106.43 101.50 4.93 0.80 N 89 2 C5 A G 23 ? ? N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? 100.21 104.30 -4.09 0.50 N 90 2 N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? 120.00 113.10 6.90 0.50 N 91 2 C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? C4 A G 23 ? ? 102.70 106.40 -3.70 0.40 N 92 2 C5 A G 24 ? ? N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? 100.38 104.30 -3.92 0.50 N 93 2 N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? 120.16 113.10 7.06 0.50 N 94 2 C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? C4 A G 24 ? ? 102.41 106.40 -3.99 0.40 N 95 2 "C3'" A A 26 ? ? "C2'" A A 26 ? ? "C1'" A A 26 ? ? 106.60 101.50 5.10 0.80 N 96 2 C5 A A 26 ? ? N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? 100.10 103.90 -3.80 0.50 N 97 2 N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? 120.03 113.80 6.23 0.50 N 98 2 C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? C4 A A 26 ? ? 102.54 105.80 -3.26 0.40 N 99 2 C5 A A 28 ? ? N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? 100.16 103.90 -3.74 0.50 N 100 2 N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? 120.11 113.80 6.31 0.50 N 101 2 C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? C4 A A 28 ? ? 102.37 105.80 -3.43 0.40 N 102 3 C5 A G 1 ? ? N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? 100.35 104.30 -3.95 0.50 N 103 3 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 120.10 113.10 7.00 0.50 N 104 3 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 102.57 106.40 -3.83 0.40 N 105 3 C5 A G 2 ? ? N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? 100.42 104.30 -3.88 0.50 N 106 3 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 120.04 113.10 6.94 0.50 N 107 3 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 102.60 106.40 -3.80 0.40 N 108 3 C5 A G 4 ? ? N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? 100.26 104.30 -4.04 0.50 N 109 3 N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? 120.11 113.10 7.01 0.50 N 110 3 C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? C4 A G 4 ? ? 102.59 106.40 -3.81 0.40 N 111 3 C5 A G 5 ? ? N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? 100.46 104.30 -3.84 0.50 N 112 3 N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? 120.22 113.10 7.12 0.50 N 113 3 C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? C4 A G 5 ? ? 102.37 106.40 -4.03 0.40 N 114 3 C5 A G 6 ? ? N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? 100.16 104.30 -4.14 0.50 N 115 3 N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? 120.05 113.10 6.95 0.50 N 116 3 C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? C4 A G 6 ? ? 102.63 106.40 -3.77 0.40 N 117 3 "C3'" A C 7 ? ? "C2'" A C 7 ? ? "C1'" A C 7 ? ? 106.60 101.50 5.10 0.80 N 118 3 C5 A G 8 ? ? N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? 100.27 104.30 -4.03 0.50 N 119 3 N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? 119.89 113.10 6.79 0.50 N 120 3 C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? C4 A G 8 ? ? 102.79 106.40 -3.61 0.40 N 121 3 "C3'" A C 9 ? ? "C2'" A C 9 ? ? "C1'" A C 9 ? ? 106.44 101.50 4.94 0.80 N 122 3 C5 A A 10 ? ? N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? 100.15 103.90 -3.75 0.50 N 123 3 N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? 120.15 113.80 6.35 0.50 N 124 3 C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? C4 A A 10 ? ? 102.42 105.80 -3.38 0.40 N 125 3 C5 A G 11 ? ? N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? 100.29 104.30 -4.01 0.50 N 126 3 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 120.07 113.10 6.97 0.50 N 127 3 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 102.59 106.40 -3.81 0.40 N 128 3 C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? 100.44 104.30 -3.86 0.50 N 129 3 N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? 120.14 113.10 7.04 0.50 N 130 3 C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? 102.44 106.40 -3.96 0.40 N 131 3 C5 A G 17 ? ? N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? 100.27 104.30 -4.03 0.50 N 132 3 N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? 120.02 113.10 6.92 0.50 N 133 3 C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? C4 A G 17 ? ? 102.70 106.40 -3.70 0.40 N 134 3 C5 A G 20 ? ? N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? 100.31 104.30 -3.99 0.50 N 135 3 N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? 120.03 113.10 6.93 0.50 N 136 3 C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? C4 A G 20 ? ? 102.58 106.40 -3.82 0.40 N 137 3 C5 A A 21 ? ? N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? 100.29 103.90 -3.61 0.50 N 138 3 N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? 119.89 113.80 6.09 0.50 N 139 3 C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? C4 A A 21 ? ? 102.34 105.80 -3.46 0.40 N 140 3 "C3'" A C 22 ? ? "C2'" A C 22 ? ? "C1'" A C 22 ? ? 106.38 101.50 4.88 0.80 N 141 3 C5 A G 23 ? ? N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? 100.27 104.30 -4.03 0.50 N 142 3 N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? 120.09 113.10 6.99 0.50 N 143 3 C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? C4 A G 23 ? ? 102.67 106.40 -3.73 0.40 N 144 3 C5 A G 24 ? ? N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? 100.26 104.30 -4.04 0.50 N 145 3 N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? 120.20 113.10 7.10 0.50 N 146 3 C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? C4 A G 24 ? ? 102.40 106.40 -4.00 0.40 N 147 3 C5 A A 26 ? ? N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? 100.30 103.90 -3.60 0.50 N 148 3 N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? 119.98 113.80 6.18 0.50 N 149 3 C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? C4 A A 26 ? ? 102.31 105.80 -3.49 0.40 N 150 3 C5 A A 28 ? ? N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? 100.15 103.90 -3.75 0.50 N 151 3 N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? 120.07 113.80 6.27 0.50 N 152 3 C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? C4 A A 28 ? ? 102.45 105.80 -3.35 0.40 N 153 4 C5 A G 1 ? ? N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? 100.28 104.30 -4.02 0.50 N 154 4 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 120.15 113.10 7.05 0.50 N 155 4 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 102.53 106.40 -3.87 0.40 N 156 4 C5 A G 2 ? ? N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? 100.31 104.30 -3.99 0.50 N 157 4 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 120.09 113.10 6.99 0.50 N 158 4 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 102.53 106.40 -3.87 0.40 N 159 4 C5 A G 4 ? ? N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? 100.27 104.30 -4.03 0.50 N 160 4 N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? 120.10 113.10 7.00 0.50 N 161 4 C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? C4 A G 4 ? ? 102.62 106.40 -3.78 0.40 N 162 4 C5 A G 5 ? ? N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? 100.45 104.30 -3.85 0.50 N 163 4 N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? 120.12 113.10 7.02 0.50 N 164 4 C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? C4 A G 5 ? ? 102.45 106.40 -3.95 0.40 N 165 4 C5 A G 6 ? ? N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? 100.14 104.30 -4.16 0.50 N 166 4 N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? 119.79 113.10 6.69 0.50 N 167 4 C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? C4 A G 6 ? ? 102.89 106.40 -3.51 0.40 N 168 4 "C3'" A C 7 ? ? "C2'" A C 7 ? ? "C1'" A C 7 ? ? 106.46 101.50 4.96 0.80 N 169 4 C5 A G 8 ? ? N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? 100.26 104.30 -4.04 0.50 N 170 4 N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? 120.07 113.10 6.97 0.50 N 171 4 C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? C4 A G 8 ? ? 102.70 106.40 -3.70 0.40 N 172 4 C5 A A 10 ? ? N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? 100.19 103.90 -3.71 0.50 N 173 4 N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? 120.11 113.80 6.31 0.50 N 174 4 C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? C4 A A 10 ? ? 102.39 105.80 -3.41 0.40 N 175 4 C5 A G 11 ? ? N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? 100.23 104.30 -4.07 0.50 N 176 4 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 120.25 113.10 7.15 0.50 N 177 4 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 102.47 106.40 -3.93 0.40 N 178 4 C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? 100.26 104.30 -4.04 0.50 N 179 4 N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? 120.02 113.10 6.92 0.50 N 180 4 C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? 102.64 106.40 -3.76 0.40 N 181 4 C5 A G 17 ? ? N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? 100.42 104.30 -3.88 0.50 N 182 4 N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? 120.19 113.10 7.09 0.50 N 183 4 C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? C4 A G 17 ? ? 102.69 106.40 -3.71 0.40 N 184 4 "C3'" A G 20 ? ? "C2'" A G 20 ? ? "C1'" A G 20 ? ? 106.47 101.50 4.97 0.80 N 185 4 C5 A G 20 ? ? N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? 100.27 104.30 -4.03 0.50 N 186 4 N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? 120.00 113.10 6.90 0.50 N 187 4 C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? C4 A G 20 ? ? 102.58 106.40 -3.82 0.40 N 188 4 C5 A A 21 ? ? N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? 100.16 103.90 -3.74 0.50 N 189 4 N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? 120.17 113.80 6.37 0.50 N 190 4 C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? C4 A A 21 ? ? 102.24 105.80 -3.56 0.40 N 191 4 C5 A G 23 ? ? N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? 100.33 104.30 -3.97 0.50 N 192 4 N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? 120.06 113.10 6.96 0.50 N 193 4 C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? C4 A G 23 ? ? 102.57 106.40 -3.83 0.40 N 194 4 C5 A G 24 ? ? N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? 100.21 104.30 -4.09 0.50 N 195 4 N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? 120.10 113.10 7.00 0.50 N 196 4 C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? C4 A G 24 ? ? 102.50 106.40 -3.90 0.40 N 197 4 C5 A A 26 ? ? N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? 100.06 103.90 -3.84 0.50 N 198 4 N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? 120.12 113.80 6.32 0.50 N 199 4 C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? C4 A A 26 ? ? 102.39 105.80 -3.41 0.40 N 200 4 C5 A A 28 ? ? N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? 100.23 103.90 -3.67 0.50 N 201 4 N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? 119.92 113.80 6.12 0.50 N 202 4 C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? C4 A A 28 ? ? 102.52 105.80 -3.28 0.40 N 203 5 C5 A G 1 ? ? N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? 100.34 104.30 -3.96 0.50 N 204 5 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 120.08 113.10 6.98 0.50 N 205 5 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 102.62 106.40 -3.78 0.40 N 206 5 C5 A G 2 ? ? N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? 100.29 104.30 -4.01 0.50 N 207 5 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 120.12 113.10 7.02 0.50 N 208 5 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 102.64 106.40 -3.76 0.40 N 209 5 C5 A G 4 ? ? N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? 100.20 104.30 -4.10 0.50 N 210 5 N7 A G 4 ? ? C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? 119.98 113.10 6.88 0.50 N 211 5 C8 A G 4 ? ? N9 A G 4 ? ? C4 A G 4 ? ? 102.70 106.40 -3.70 0.40 N 212 5 C5 A G 5 ? ? N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? 100.44 104.30 -3.86 0.50 N 213 5 N7 A G 5 ? ? C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? 120.20 113.10 7.10 0.50 N 214 5 C8 A G 5 ? ? N9 A G 5 ? ? C4 A G 5 ? ? 102.45 106.40 -3.95 0.40 N 215 5 C5 A G 6 ? ? N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? 100.23 104.30 -4.07 0.50 N 216 5 N7 A G 6 ? ? C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? 119.94 113.10 6.84 0.50 N 217 5 C8 A G 6 ? ? N9 A G 6 ? ? C4 A G 6 ? ? 102.72 106.40 -3.68 0.40 N 218 5 C5 A G 8 ? ? N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? 100.28 104.30 -4.02 0.50 N 219 5 N7 A G 8 ? ? C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? 120.07 113.10 6.97 0.50 N 220 5 C8 A G 8 ? ? N9 A G 8 ? ? C4 A G 8 ? ? 102.65 106.40 -3.75 0.40 N 221 5 C5 A A 10 ? ? N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? 100.13 103.90 -3.77 0.50 N 222 5 N7 A A 10 ? ? C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? 120.11 113.80 6.31 0.50 N 223 5 C8 A A 10 ? ? N9 A A 10 ? ? C4 A A 10 ? ? 102.44 105.80 -3.36 0.40 N 224 5 C5 A G 11 ? ? N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? 100.31 104.30 -3.99 0.50 N 225 5 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 120.10 113.10 7.00 0.50 N 226 5 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 102.54 106.40 -3.86 0.40 N 227 5 C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? 100.28 104.30 -4.02 0.50 N 228 5 N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? 120.06 113.10 6.96 0.50 N 229 5 C8 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? 102.58 106.40 -3.82 0.40 N 230 5 C5 A G 17 ? ? N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? 100.31 104.30 -3.99 0.50 N 231 5 N7 A G 17 ? ? C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? 120.12 113.10 7.02 0.50 N 232 5 C8 A G 17 ? ? N9 A G 17 ? ? C4 A G 17 ? ? 102.63 106.40 -3.77 0.40 N 233 5 "C3'" A G 20 ? ? "C2'" A G 20 ? ? "C1'" A G 20 ? ? 106.39 101.50 4.89 0.80 N 234 5 C5 A G 20 ? ? N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? 100.24 104.30 -4.06 0.50 N 235 5 N7 A G 20 ? ? C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? 120.14 113.10 7.04 0.50 N 236 5 C8 A G 20 ? ? N9 A G 20 ? ? C4 A G 20 ? ? 102.56 106.40 -3.84 0.40 N 237 5 C5 A A 21 ? ? N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? 100.34 103.90 -3.56 0.50 N 238 5 N7 A A 21 ? ? C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? 119.80 113.80 6.00 0.50 N 239 5 C8 A A 21 ? ? N9 A A 21 ? ? C4 A A 21 ? ? 102.47 105.80 -3.33 0.40 N 240 5 C5 A G 23 ? ? N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? 100.22 104.30 -4.08 0.50 N 241 5 N7 A G 23 ? ? C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? 120.00 113.10 6.90 0.50 N 242 5 C8 A G 23 ? ? N9 A G 23 ? ? C4 A G 23 ? ? 102.68 106.40 -3.72 0.40 N 243 5 C5 A G 24 ? ? N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? 100.40 104.30 -3.90 0.50 N 244 5 N7 A G 24 ? ? C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? 120.23 113.10 7.13 0.50 N 245 5 C8 A G 24 ? ? N9 A G 24 ? ? C4 A G 24 ? ? 102.42 106.40 -3.98 0.40 N 246 5 C5 A A 26 ? ? N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? 100.18 103.90 -3.72 0.50 N 247 5 N7 A A 26 ? ? C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? 120.10 113.80 6.30 0.50 N 248 5 C8 A A 26 ? ? N9 A A 26 ? ? C4 A A 26 ? ? 102.46 105.80 -3.34 0.40 N 249 5 C5 A A 28 ? ? N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? 100.21 103.90 -3.69 0.50 N 250 5 N7 A A 28 ? ? C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? 120.01 113.80 6.21 0.50 N 251 5 C8 A A 28 ? ? N9 A A 28 ? ? C4 A A 28 ? ? 102.40 105.80 -3.40 0.40 N # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1EBR 'double helix' 1EBR 'a-form double helix' 1EBR tetraloop 1EBR 'bulge loop' 1EBR 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 30 1_555 -0.942 -0.444 0.253 -0.388 -2.454 -1.912 1 A_G1:C30_A A 1 ? A 30 ? 19 1 1 A G 2 1_555 A C 29 1_555 -0.892 -0.380 -0.098 -2.400 -6.989 -1.124 2 A_G2:C29_A A 2 ? A 29 ? 19 1 1 A U 3 1_555 A A 28 1_555 0.076 -0.157 -0.050 4.097 -10.433 0.435 3 A_U3:A28_A A 3 ? A 28 ? 20 1 1 A G 4 1_555 A C 27 1_555 -0.052 -0.172 -0.084 -8.995 -16.945 -2.111 4 A_G4:C27_A A 4 ? A 27 ? 19 1 1 A G 5 1_555 A A 26 1_555 -0.198 1.526 -0.049 -0.111 -5.917 -16.316 5 A_G5:A26_A A 5 ? A 26 ? 8 ? 1 A G 6 1_555 A G 24 1_555 1.118 1.319 0.015 -5.721 4.515 -173.634 6 A_G6:G24_A A 6 ? A 24 ? 3 ? 1 A C 7 1_555 A G 23 1_555 1.016 -0.461 -0.083 1.622 -0.150 -1.706 7 A_C7:G23_A A 7 ? A 23 ? 19 1 1 A G 8 1_555 A C 22 1_555 -0.511 -0.274 0.420 6.564 2.214 -3.836 8 A_G8:C22_A A 8 ? A 22 ? 19 1 1 A C 9 1_555 A G 20 1_555 0.821 -0.355 0.200 -5.053 0.879 -0.571 9 A_C9:G20_A A 9 ? A 20 ? 19 1 1 A A 10 1_555 A U 19 1_555 -0.140 -0.130 0.154 0.799 -6.978 -2.995 10 A_A10:U19_A A 10 ? A 19 ? 20 1 1 A G 11 1_555 A C 18 1_555 -0.081 -0.137 -0.147 -4.285 -8.701 -0.235 11 A_G11:C18_A A 11 ? A 18 ? 19 1 1 A C 12 1_555 A G 17 1_555 0.958 -0.439 0.169 -2.028 -3.402 -1.262 12 A_C12:G17_A A 12 ? A 17 ? 19 1 1 A U 13 1_555 A G 16 1_555 0.514 -4.693 0.777 -11.356 -15.720 -119.194 13 A_U13:G16_A A 13 ? A 16 ? ? 2 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A G 1 1_555 A C 30 1_555 A G 2 1_555 A C 29 1_555 -0.248 -0.978 3.402 -0.605 17.112 33.401 -3.723 0.309 2.617 27.632 0.976 37.423 1 AA_G1G2:C29C30_AA A 1 ? A 30 ? A 2 ? A 29 ? 1 A G 2 1_555 A C 29 1_555 A U 3 1_555 A A 28 1_555 0.021 -0.553 3.053 -0.378 12.038 36.682 -2.194 -0.074 2.744 18.524 0.582 38.543 2 AA_G2U3:A28C29_AA A 2 ? A 29 ? A 3 ? A 28 ? 1 A U 3 1_555 A A 28 1_555 A G 4 1_555 A C 27 1_555 0.007 -0.752 3.533 1.253 23.920 35.593 -3.500 0.120 2.559 34.715 -1.818 42.684 3 AA_U3G4:C27A28_AA A 3 ? A 28 ? A 4 ? A 27 ? 1 A G 4 1_555 A C 27 1_555 A G 5 1_555 A A 26 1_555 -0.241 -0.260 3.138 4.176 -0.399 35.069 -0.372 0.987 3.093 -0.659 -6.899 35.312 4 AA_G4G5:A26C27_AA A 4 ? A 27 ? A 5 ? A 26 ? 1 A G 5 1_555 A A 26 1_555 A G 6 1_555 A G 24 1_555 -0.495 1.276 3.130 -8.194 -8.543 105.425 0.910 0.205 3.076 -5.358 5.139 105.890 5 AA_G5G6:G24A26_AA A 5 ? A 26 ? A 6 ? A 24 ? 1 A G 6 1_555 A G 24 1_555 A C 7 1_555 A G 23 1_555 4.845 0.336 4.125 13.444 19.719 -23.546 -3.506 10.421 0.811 -38.013 25.916 -33.405 6 AA_G6C7:G23G24_AA A 6 ? A 24 ? A 7 ? A 23 ? 1 A C 7 1_555 A G 23 1_555 A G 8 1_555 A C 22 1_555 -0.271 0.499 3.365 -2.512 23.486 30.937 -2.401 0.071 3.018 37.879 4.052 38.747 7 AA_C7G8:C22G23_AA A 7 ? A 23 ? A 8 ? A 22 ? 1 A G 8 1_555 A C 22 1_555 A C 9 1_555 A G 20 1_555 3.660 0.605 3.064 8.682 20.767 54.829 -0.516 -3.247 3.562 21.565 -9.016 58.936 8 AA_G8C9:G20C22_AA A 8 ? A 22 ? A 9 ? A 20 ? 1 A C 9 1_555 A G 20 1_555 A A 10 1_555 A U 19 1_555 -1.183 -0.652 2.942 -1.111 9.246 29.575 -2.787 2.027 2.663 17.572 2.111 30.976 9 AA_C9A10:U19G20_AA A 9 ? A 20 ? A 10 ? A 19 ? 1 A A 10 1_555 A U 19 1_555 A G 11 1_555 A C 18 1_555 0.260 -0.897 3.416 0.392 17.061 32.296 -3.770 -0.362 2.634 28.337 -0.652 36.421 10 AA_A10G11:C18U19_AA A 10 ? A 19 ? A 11 ? A 18 ? 1 A G 11 1_555 A C 18 1_555 A C 12 1_555 A G 17 1_555 0.000 -0.715 3.237 -1.749 19.784 37.672 -2.893 -0.168 2.567 28.359 2.506 42.418 11 AA_G11C12:G17C18_AA A 11 ? A 18 ? A 12 ? A 17 ? 1 A C 12 1_555 A G 17 1_555 A U 13 1_555 A G 16 1_555 0.038 -1.149 2.795 4.097 8.896 102.337 -0.846 0.026 2.718 5.701 -2.626 102.673 12 AA_C12U13:G16G17_AA A 12 ? A 17 ? A 13 ? A 16 ? #