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_pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Yang, Z.' 1 'Kollman, J.M.' 2 'Pandi, L.' 3 'Doolittle, R.F.' 4 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.journal_id_ASTM _citation.country _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_id_CSD _citation.book_publisher _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'Crystal Structure of Native Chicken Fibrinogen at 2.7 A Resolution' Biochemistry 40 12515 12523 2001 BICHAW US 0006-2960 0033 ? 11601975 10.1021/bi011394p 1 'Crystal Structure of Native Chicken Fibrinogen at 5.5-A Resolution' Proc.Natl.Acad.Sci.USA 97 3907 3912 2000 PNASA6 US 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'The peptide is chemically synthesized.' 5 1 sample ? ? ? ? ? 'The peptide is chemically synthesized.' # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP FIBA_CHICK 1 ;QDGKTTFEKEGGGGRGPRILENMHESSCKYEKNWPICVDDDWGTKCPSCCRMQGIIDDTDQNYSQRIDNIRQQLADSQNK YKTSNRVIVETINILKPGLEGAQQLDENYGHVSTELRRRIVTLKQRVATQVNRIKALQNSIQEQVVEMKRLEVDIDIKIR ACKGSCARSFDYQVDKEGYDNIQKHLTQASSIDMHPDFQTTTLSTLKMRPLKDSNVPEHFKLKPSPEMQAMSAFNNIKQM QVVLERPETDHVAEARGDSSPSHTGKLITSSHRRESPSLVDKTSSASSVHRCTRTVTKKVISGPDGPREEIVEKMVSSDG SDCSHLQGGREGSTYHFSGTGDFHKLDRLLPDLESFFTHDSVSTSSRHSIGSSTSSHVTGAGSSHLGTGGKDKFTDLGEE EEDDFGGLQPSGFAAGSASHSKTVLTSSSSSFNKGGSTFETKSLKTRETSEQLGGVQHDQSAEDTPDFKARSFRPAAMST RRSYNGKGTQK ; 19 P14448 ? 2 UNP FIBB_CHICK 2 ;ASVEYDNEEDSPQIDARAHRPLDKRQEAAPTLRPVAPPISGTGYQPRPPKQDKQAMKKGPIIYPDAGGCKHPLDELGVLC PTGCELQTTLLKQEKTVKPVLRDLKDRVAKFSDTSTTMYQYVNMIDNKLVKTQKQRKDNDIILSEYNTEMELHYNYIKDN LDNNIPSSLRVLRAVIDSLHKKIQKLENAIATQTDYCRSPCVASCNIPVVSGRECEDIYRKGGETSEMYIIQPDPFTTPY RVYCDMETDNGGWTLIQNRQDGSVNFGRAWDEYKRGFGNIAKSGGKKYCDTPGEYWLGNDKISQLTKIGPTKVLIEMEDW NGDKVSALYGGFTIHNEGNKYQLSVSNYKGNAGNALMEGASQLYGENRTMTIHNGMYFSTYDRDNDGWLTTDPRKQCSKE DGGGWWYNRCHAANPNGRYYWGGTYSWDMAKHGTDDGIVWMNWKGSWYSMKKMSMKIKPYFPD ; 1 Q02020 ? 3 UNP O93568_CHICK 3 ;YIATRENCCILDERFGSYCPTTCGIADFFNKYRLTTDGELLEIEGLLQQATNSTGSIEYLIQHIKTIYPSEKQTLPQSIE QLTQKSKKIIEEIIRYENTILAHENTIQQLTDMHIMNSNKITQLKQKIAQLESHCQEPCKDTAEIQETTGRDCQDIANKG ARKSGLYFIKPQKAKQSFLVYCEIDTYGNGWTVLQRRLDGSEDFRRNWVQYKEGFGHLSPDDTTEFWLGNEKIHLITTQS TLPYALRIELEDWSGKKGTADYAVFKVGTEEDKYRLTYAYFIGGERGDAFDGFNFGDDPSDKSYTYHNGMRFSTFDNDND NFEGNCAEQDGSGWWMNRCHAGHLNGPYYIGGVYSRDTGTNSYDNGIIWATWRDRWYSMKKTTMKIIPFNRLSIDGQQHS GGLKQVGDS ; 27 O93568 ? 4 PDB 1M1J 4 ? ? 1M1J ? 5 PDB 1M1J 5 ? ? 1M1J ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1M1J A 1 ? 491 ? 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UNP O93568 ARG 312 'SEE REMARK 999' 286 3 4 1M1J GLY D 49 ? UNP P14448 CYS 67 'SEE REMARK 999' 49 4 5 1M1J GLN E 1 ? UNP Q02020 ? ? 'SEE REMARK 999' 1 5 6 1M1J ALA F 286 ? UNP O93568 ARG 312 'SEE REMARK 999' 286 6 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 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C GLY 324 C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc10 metalc ? ? E ASP 385 OD2 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? E ASP 385 E CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? ? metalc11 metalc ? ? E ASP 385 OD1 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? E ASP 385 E CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? ? metalc12 metalc ? ? E ASP 387 OD2 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? E ASP 387 E CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.261 ? ? metalc13 metalc ? ? E ASP 387 OD1 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? E ASP 387 E CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? ? metalc14 metalc ? ? E TRP 389 O ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? E TRP 389 E CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.390 ? ? metalc15 metalc ? ? F ASP 318 OD1 ? ? ? 1_555 T CA . CA ? ? F ASP 318 F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? ? metalc16 metalc ? ? F ASP 318 OD2 ? ? ? 1_555 T CA . CA ? ? F ASP 318 F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? ? metalc17 metalc ? ? F ASP 320 OD1 ? ? ? 1_555 T CA . CA ? ? F ASP 320 F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? ? metalc18 metalc ? ? F PHE 322 O ? ? ? 1_555 T CA . CA ? ? F PHE 322 F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? ? metalc19 metalc ? ? F GLY 324 O ? ? ? 1_555 T CA . CA ? ? F GLY 324 F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 3 ? C ? 2 ? D ? 8 ? E ? 8 ? F ? 7 ? G ? 7 ? H ? 2 ? I ? 2 ? J ? 3 ? K ? 2 ? L ? 2 ? M ? 2 ? N ? 8 ? O ? 8 ? P ? 7 ? Q ? 7 ? R ? 2 ? S ? 2 ? T ? 2 ? 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In the alpha chain, residue 49 is GLY, not CYS. In the beta chain, residue 1 genetically must be a GLN. In the gamma chain, residue 286 is ALA, not ARG. Chains G and H mimic A16-A19 of the fibrin sequence with PRO replacing ILE A19 of the fibrin sequence. Chains I and J mimic B19-B22 of the fibrin sequence, with GLY replacing ALA B19 of the fibrin sequence. ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 NH2 C ARG 197 ? ? O C GLY 346 ? ? 2.16 2 1 NH2 F ARG 197 ? ? O F GLY 346 ? ? 2.16 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 N C ARG 338 ? ? 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? -86.95 42.56 22 1 PRO A 217 ? ? -79.54 39.80 23 1 PRO B 65 ? ? -60.88 -97.03 24 1 ASP B 66 ? ? 79.66 118.90 25 1 ALA B 67 ? ? -173.35 148.03 26 1 PRO B 73 ? ? -59.37 3.61 27 1 ASP B 75 ? ? -35.03 -30.90 28 1 PRO B 82 ? ? -38.01 138.15 29 1 THR B 83 ? ? -69.63 -178.37 30 1 LEU B 92 ? ? -39.95 -34.57 31 1 SER B 145 ? ? -38.00 -29.54 32 1 ASN B 164 ? ? -139.44 -69.30 33 1 SER B 205 ? ? -106.51 78.31 34 1 GLU B 228 ? ? -171.47 -174.37 35 1 ASP B 250 ? ? 36.06 65.30 36 1 GLN B 261 ? ? -165.78 -12.15 37 1 ASP B 262 ? ? -159.24 3.99 38 1 LYS B 287 ? ? -57.68 172.78 39 1 SER B 347 ? ? 178.35 -176.70 40 1 LYS B 350 ? ? -175.74 124.21 41 1 ASN B 355 ? ? -65.33 83.96 42 1 ASN B 386 ? ? -141.87 15.50 43 1 ASN B 409 ? ? -112.14 -114.50 44 1 ARG B 410 ? ? -92.00 43.37 45 1 CYS B 411 ? ? 95.62 -107.31 46 1 ASN B 443 ? ? -52.77 0.98 47 1 TRP B 448 ? ? -95.47 38.80 48 1 PRO B 463 ? ? -59.06 95.77 49 1 LEU C 11 ? ? -89.56 -115.86 50 1 ASP C 12 ? ? 98.17 103.58 51 1 THR C 22 ? ? -64.93 13.09 52 1 LYS C 72 ? 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