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_pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 4 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 5 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 6 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 7 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 8 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 9 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 10 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 11 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 12 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 13 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_atom_id' 14 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 15 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_seq_id' 16 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 17 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 18 4 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_pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1N6D _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2002-11-10 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 1K32 . unspecified PDB 1N6E '1N6E contains tridecapeptide chloromethyl derivative' unspecified PDB 1N6F '1N6F contains Z-Phe-diketo-Arg-Glu-Phe' unspecified # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Kim, J.-S.' 1 'Groll, M.' 2 'Huber, R.' 3 'Brandstetter, H.' 4 # _citation.id primary _citation.title ;Navigation Inside a Protease: Substrate Selection and Product Exit in the Tricorn Protease from Thermoplasma acidophilum ; _citation.journal_abbrev J.Mol.Biol. _citation.journal_volume 324 _citation.page_first 1041 _citation.page_last 1050 _citation.year 2002 _citation.journal_id_ASTM JMOBAK _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0022-2836 _citation.journal_id_CSD 0070 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 12470958 _citation.pdbx_database_id_DOI '10.1016/S0022-2836(02)01153-1' # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Kim, J.-S.' 1 ? primary 'Groll, M.' 2 ? primary 'Musiol, H.-J.' 3 ? primary 'Behrendt, R.' 4 ? primary 'Kaiser, M.' 5 ? primary 'Moroder, L.' 6 ? primary 'Huber, R.' 7 ? primary 'Brandstetter, H.' 8 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation 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_diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type MARRESEARCH _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2001-08-25 _diffrn_detector.details mirrors # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator graphite _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.05 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'MPG/DESY, HAMBURG BEAMLINE BW6' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site 'MPG/DESY, HAMBURG' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline BW6 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.05 # _reflns.entry_id 1N6D _reflns.observed_criterion_sigma_F -3.0 _reflns.observed_criterion_sigma_I -3.0 _reflns.d_resolution_high 2.8 _reflns.d_resolution_low 20 _reflns.number_all 372512 _reflns.number_obs 172151 _reflns.percent_possible_obs 88.9 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? 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ILE D 682 TYR D 701 1 ? 20 HELX_P HELX_P58 58 ASN G 703 ? ASN G 720 ? ASN D 703 ASN D 720 1 ? 18 HELX_P HELX_P59 59 LEU G 721 ? CYS G 725 ? LEU D 721 CYS D 725 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 60 THR G 727 ? GLU G 741 ? THR D 727 GLU D 741 1 ? 15 HELX_P HELX_P61 61 SER G 793 ? GLY G 799 ? SER D 793 GLY D 799 5 ? 7 HELX_P HELX_P62 62 ASN G 820 ? ALA G 829 ? ASN D 820 ALA D 829 1 ? 10 HELX_P HELX_P63 63 ASP G 855 ? SER G 875 ? ASP D 855 SER D 875 1 ? 21 HELX_P HELX_P64 64 GLY G 888 ? SER G 903 ? GLY D 888 SER D 903 1 ? 16 HELX_P HELX_P65 65 VAL G 920 ? MET G 929 ? VAL D 920 MET D 929 1 ? 10 HELX_P HELX_P66 66 SER G 965 ? LEU G 977 ? SER D 965 LEU D 977 1 ? 13 HELX_P HELX_P67 67 ALA G 1036 ? SER G 1042 ? ALA D 1036 SER D 1042 1 ? 7 HELX_P HELX_P68 68 ASP G 1045 ? LEU G 1059 ? ASP D 1045 LEU D 1059 1 ? 15 HELX_P HELX_P69 69 ILE I 321 ? PHE I 325 ? ILE E 321 PHE E 325 1 ? 5 HELX_P HELX_P70 70 ASN I 550 ? LEU I 554 ? ASN E 550 LEU E 554 5 ? 5 HELX_P HELX_P71 71 PRO I 556 ? THR I 560 ? 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VAL F 920 MET F 929 1 ? 10 HELX_P HELX_P100 100 SER K 965 ? LEU K 977 ? SER F 965 LEU F 977 1 ? 13 HELX_P HELX_P101 101 ALA K 1036 ? SER K 1042 ? ALA F 1036 SER F 1042 1 ? 7 HELX_P HELX_P102 102 ASP K 1045 ? LEU K 1059 ? 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B ARG 1 N ? ? ? 1_555 M D10 . C1 ? ? G ARG 1101 G D10 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.540 ? ? covale2 covale both ? B LYS 4 C ? ? ? 1_555 B 0QE 5 C1 ? ? G LYS 1104 G 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ? ? covale3 covale one ? B LYS 4 CA ? ? ? 1_555 B 0QE 5 C1 ? ? G LYS 1104 G 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.940 ? ? covale4 covale one ? D ARG 1 N ? ? ? 1_555 N D10 . C1 ? ? H ARG 1101 H D10 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.541 ? ? covale5 covale both ? D LYS 4 C ? ? ? 1_555 D 0QE 5 C1 ? ? H LYS 1104 H 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? ? covale6 covale one ? D LYS 4 CA ? ? ? 1_555 D 0QE 5 C1 ? ? H LYS 1104 H 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.940 ? ? covale7 covale one ? F ARG 1 N ? ? ? 1_555 O D10 . C1 ? ? I ARG 1101 I D10 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.540 ? ? covale8 covale both ? F LYS 4 C ? ? ? 1_555 F 0QE 5 C1 ? ? I LYS 1104 I 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? ? covale9 covale one ? F LYS 4 CA ? ? ? 1_555 F 0QE 5 C1 ? ? I LYS 1104 I 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? ? covale10 covale one ? H ARG 1 N ? ? ? 1_555 P D10 . C1 ? ? J ARG 1101 J D10 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.540 ? ? covale11 covale both ? H LYS 4 C ? ? ? 1_555 H 0QE 5 C1 ? ? J LYS 1104 J 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? ? covale12 covale one ? H LYS 4 CA ? ? ? 1_555 H 0QE 5 C1 ? ? J LYS 1104 J 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? ? covale13 covale one ? J ARG 1 N ? ? ? 1_555 Q D10 . C1 ? ? K ARG 1101 K D10 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.540 ? ? covale14 covale both ? J LYS 4 C ? ? ? 1_555 J 0QE 5 C1 ? ? K LYS 1104 K 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? ? covale15 covale one ? J LYS 4 CA ? ? ? 1_555 J 0QE 5 C1 ? ? K LYS 1104 K 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? ? covale16 covale one ? L ARG 1 N ? ? ? 1_555 R D10 . C1 ? ? L ARG 1101 L D10 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.541 ? ? covale17 covale both ? L LYS 4 C ? ? ? 1_555 L 0QE 5 C1 ? ? L LYS 1104 L 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? ? covale18 covale one ? L LYS 4 CA ? ? ? 1_555 L 0QE 5 C1 ? ? L LYS 1104 L 0QE 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 946 A . ? TYR 946 A PRO 947 A ? PRO 947 A 1 4.69 2 TYR 946 C . ? TYR 946 B PRO 947 C ? PRO 947 B 1 -0.65 3 TYR 946 E . ? TYR 946 C PRO 947 E ? PRO 947 C 1 -3.32 4 TYR 946 G . ? TYR 946 D PRO 947 G ? PRO 947 D 1 -0.27 5 TYR 946 I . ? TYR 946 E PRO 947 I ? PRO 947 E 1 -5.59 6 TYR 946 K . ? TYR 946 F PRO 947 K ? PRO 947 F 1 6.32 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 6 ? C ? 4 ? D ? 4 ? E ? 4 ? F ? 4 ? G ? 3 ? H ? 4 ? I ? 4 ? J ? 4 ? K ? 4 ? L ? 2 ? M ? 7 ? N ? 7 ? O ? 5 ? P ? 2 ? Q ? 2 ? R ? 4 ? S ? 6 ? T ? 4 ? U ? 4 ? V ? 4 ? W ? 4 ? X ? 3 ? Y ? 4 ? Z ? 4 ? AA ? 4 ? AB ? 4 ? AC ? 2 ? AD ? 7 ? AE ? 7 ? AF ? 5 ? AG ? 2 ? AH ? 2 ? AI ? 4 ? AJ ? 6 ? AK ? 4 ? AL ? 4 ? AM ? 4 ? AN ? 4 ? AO ? 4 ? AP ? 4 ? AQ ? 4 ? AR ? 4 ? AS ? 2 ? AT ? 2 ? AU ? 7 ? AV ? 2 ? AW ? 7 ? AX ? 5 ? AY ? 2 ? AZ ? 2 ? BA ? 4 ? BB ? 6 ? BC ? 4 ? BD ? 4 ? BE ? 4 ? BF ? 4 ? BG ? 4 ? BH ? 4 ? BI ? 4 ? BJ ? 4 ? BK ? 2 ? BL ? 2 ? BM ? 7 ? BN ? 2 ? BO ? 7 ? BP ? 5 ? BQ ? 2 ? BR ? 2 ? BS ? 4 ? BT ? 6 ? BU ? 4 ? BV ? 4 ? BW ? 4 ? BX ? 4 ? BY ? 4 ? BZ ? 4 ? CA ? 4 ? CB ? 4 ? CC ? 2 ? CD ? 2 ? CE ? 7 ? CF ? 2 ? CG ? 7 ? CH ? 5 ? CI ? 2 ? CJ ? 2 ? CK ? 4 ? CL ? 6 ? CM ? 4 ? CN ? 4 ? CO ? 4 ? CP ? 4 ? CQ ? 4 ? CR ? 4 ? CS ? 4 ? CT ? 4 ? CU ? 2 ? CV ? 2 ? CW ? 7 ? CX ? 2 ? CY ? 7 ? CZ ? 5 ? DA ? 2 ? DB ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel B 5 6 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel M 5 6 ? anti-parallel M 6 7 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel N 5 6 ? anti-parallel N 6 7 ? anti-parallel O 1 2 ? parallel O 2 3 ? parallel O 3 4 ? parallel O 4 5 ? parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel S 4 5 ? anti-parallel S 5 6 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel Z 3 4 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? 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