data_1Q75 # _entry.id 1Q75 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.355 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 1Q75 pdb_00001q75 10.2210/pdb1q75/pdb RCSB RCSB020000 ? ? WWPDB D_1000020000 ? ? # _pdbx_database_related.db_name PDB _pdbx_database_related.db_id 1NA2 _pdbx_database_related.details 'The wildtype P2b hairpin from human telomerase RNA' _pdbx_database_related.content_type unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1Q75 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2003-08-15 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Theimer, C.A.' 1 'Finger, L.D.' 2 'Feigon, J.' 3 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.journal_id_ASTM _citation.country _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_id_CSD _citation.book_publisher _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'YNMG tetraloop formation by a dyskeratosis congenita mutation in human telomerase RNA.' Rna 9 1446 1455 2003 RNARFU UK 1355-8382 2122 ? 14624001 10.1261/rna.5152303 1 'Mutations linked to dyskeratosis congenita cause changes in the structural equilibrium in telomerase RNA' Proc.Natl.Acad.Sci.USA 100 449 454 2003 PNASA6 US 0027-8424 0040 ? ? 10.1073/pnas.242720799 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Theimer, C.A.' 1 ? primary 'Finger, L.D.' 2 ? primary 'Feigon, J.' 3 ? 1 'Theimer, C.A.' 4 ? 1 'Finger, L.D.' 5 ? 1 'Trantirek, L.' 6 ? 1 'Feigon, J.' 7 ? # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description 'DKC mutant P2b telomerase RNA' _entity.formula_weight 4783.889 _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation 'G107A, C108G' _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code GGCUCUCAGUGAGCC _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can GGCUCUCAGUGAGCC _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 G n 1 3 C n 1 4 U n 1 5 C n 1 6 U n 1 7 C n 1 8 A n 1 9 G n 1 10 U n 1 11 G n 1 12 A n 1 13 G n 1 14 C n 1 15 C n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific ? _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id ? _pdbx_entity_src_syn.details ;THE RNA WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED using in vitro transcription with T7 RNA polymerase and a partially double-stranded DNA template. THE SEQUENCE OF THE RNA IS NATURALLY FOUND IN HOMO SAPIENS (HUMAN) who have a certain type of autosomal dominant dyskeratosis congenita. ; # _struct_ref.id 1 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 1Q75 _struct_ref.pdbx_db_accession 1Q75 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin ? # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 1Q75 _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 15 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 1Q75 _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 15 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 15 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D NOESY (1,1echo and watergate)' 2 2 2 '2D 15N-HMQC, 2D 15N-CPMG-NOESY, 2D JNN-HNN-COSY' 3 3 3 '2D NOESY, 2D TOCSY' 4 4 4 '31P-spin echo difference CT HSQC' 5 4 4 '3D 13C-NOESY HMQC, 2D 13C-HMQC,2D HCCH COSY, 3D HCCH TOCSY' 6 4 4 CT-CE-HSQC # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 283 ambient 6.3 '200mM KCl' ? K 2 283 ambient 6.3 '200mM KCl' ? K 3 293 ambient 6.3 '200mM KCl' ? K 4 293 ambient 6.3 '200mM KCl' ? K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system 1 '1mM unlabeled RNA, 10mM sodium phosphate buffer, pH 6.3, 200mM KCl, 50uM EDTA, 0.2% sodium azide, 95% H2O,5% D2O' '95% H2O/5% D2O' 2 '1mM 13C,15N-labeled RNA, 10mM sodium phosphate buffer, pH 6.3, 200mM KCl, 50uM EDTA, 0.2% sodium azide, 95% H2O,5% D2O' '95% H2O/5% D2O' 3 '1mM unlabeled RNA, 10mM sodium phosphate buffer, pH 6.3, 200mM KCl, 50uM EDTA, 0.2% sodium azide, 100% D2O' '100% D2O' 4 '1mM 13C,15N-labeled RNA, 10mM sodium phosphate buffer, pH 6.3, 200mM KCl, 50uM EDTA, 0.2% sodium azide, 100% D2O' '100% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.type _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 1 ? Bruker DRX 500 2 ? Bruker DRX 600 # _pdbx_nmr_refine.entry_id 1Q75 _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ;Structures are based on 283 NOE-derived distance constraints, 86 dihedral angle restraints, 16 distance restraints from hydrogen bonds, and 14 H-C residual dipolar couplings. ; _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_details.entry_id 1Q75 _pdbx_nmr_details.text 'CT-CE-HSQC was used for determining residual dipolar couplings' # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 1Q75 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 200 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 20 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 1Q75 _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.ordinal XwinNMR 2.6 collection Bruker 1 XwinNMR 2.6 processing Bruker 2 AURELIA 3.108 'data analysis' Brunger 3 X-PLOR 3.851 'structure solution' NIH 4 X-PLOR 3.851 refinement NIH 5 # _exptl.entry_id 1Q75 _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.crystals_number ? # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type ? # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _struct.entry_id 1Q75 _struct.title 'Solution structure of the dyskeratosis congenita mutant P2b hairpin from human telomerase RNA' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1Q75 _struct_keywords.pdbx_keywords RNA _struct_keywords.text 'TETRALOOP, PENTALOOP, UUCG, YNMG, RNA' # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A G 1 N1 ? ? ? 1_555 A C 15 N3 ? ? A G 1 A C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 1 N2 ? ? ? 1_555 A C 15 O2 ? ? A G 1 A C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 1 O6 ? ? ? 1_555 A C 15 N4 ? ? A G 1 A C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A C 14 N3 ? ? A G 2 A C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 2 N2 ? ? ? 1_555 A C 14 O2 ? ? A G 2 A C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A C 14 N4 ? ? A G 2 A C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A C 3 N3 ? ? ? 1_555 A G 13 N1 ? ? A C 3 A G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A C 3 N4 ? ? ? 1_555 A G 13 O6 ? ? A C 3 A G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A C 3 O2 ? ? ? 1_555 A G 13 N2 ? ? A C 3 A G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 4 N3 ? ? ? 1_555 A A 12 N1 ? ? A U 4 A A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 4 O4 ? ? ? 1_555 A A 12 N6 ? ? A U 4 A A 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A C 5 N3 ? ? ? 1_555 A G 11 N1 ? ? A C 5 A G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A C 5 N4 ? ? ? 1_555 A G 11 O6 ? ? A C 5 A G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A C 5 O2 ? ? ? 1_555 A G 11 N2 ? ? A C 5 A G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A U 6 O2 ? ? ? 1_555 A G 9 N1 ? ? A U 6 A G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1Q75 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 1Q75 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 G 1 1 1 G G A . n A 1 2 G 2 2 2 G G A . n A 1 3 C 3 3 3 C C A . n A 1 4 U 4 4 4 U U A . n A 1 5 C 5 5 5 C C A . n A 1 6 U 6 6 6 U U A . n A 1 7 C 7 7 7 C C A . n A 1 8 A 8 8 8 A A A . n A 1 9 G 9 9 9 G G A . n A 1 10 U 10 10 10 U U A . n A 1 11 G 11 11 11 G G A . n A 1 12 A 12 12 12 A A A . n A 1 13 G 13 13 13 G G A . n A 1 14 C 14 14 14 C C A . n A 1 15 C 15 15 15 C C A . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2003-12-23 2 'Structure model' 1 1 2008-04-29 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2022-03-02 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Database references' 5 4 'Structure model' 'Derived calculations' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' database_2 2 4 'Structure model' pdbx_nmr_software 3 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly 4 4 'Structure model' pdbx_struct_oper_list # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 "O2'" A C 5 ? ? "H5'" A U 6 ? ? 1.53 2 1 "O2'" A C 14 ? ? "H5'" A C 15 ? ? 1.58 3 2 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.44 4 2 "O2'" A G 2 ? ? "H5'" A C 3 ? ? 1.58 5 2 "O2'" A C 5 ? ? "H5'" A U 6 ? ? 1.59 6 3 "HO2'" A C 7 ? ? O6 A G 9 ? ? 1.41 7 4 "O2'" A C 3 ? ? "H5'" A U 4 ? ? 1.54 8 4 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.57 9 5 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.51 10 5 "O2'" A C 5 ? ? "H5'" A U 6 ? ? 1.57 11 8 "O2'" A C 14 ? ? "H5'" A C 15 ? ? 1.51 12 8 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.55 13 8 "O2'" A C 5 ? ? "H5'" A U 6 ? ? 1.56 14 9 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.50 15 10 "O2'" A C 14 ? ? "H5'" A C 15 ? ? 1.51 16 11 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.58 17 11 "O2'" A C 5 ? ? "H5'" A U 6 ? ? 1.58 18 12 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.51 19 13 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.52 20 15 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.58 21 16 "O2'" A C 5 ? ? "H5'" A U 6 ? ? 1.51 22 17 "O2'" A C 5 ? ? "H5'" A U 6 ? ? 1.58 23 17 "O2'" A G 2 ? ? "H5'" A C 3 ? ? 1.58 24 18 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.58 25 19 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.54 26 20 "O2'" A U 4 ? ? "H5'" A C 5 ? ? 1.56 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 2 1 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 3 1 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.56 113.10 4.46 0.50 N 4 1 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.63 106.40 -2.77 0.40 N 5 1 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.48 113.80 3.68 0.50 N 6 1 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.81 113.10 4.71 0.50 N 7 1 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.66 106.40 -2.74 0.40 N 8 1 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 9 1 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 10 1 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 11 1 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 12 1 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.78 106.40 -2.62 0.40 N 13 2 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.61 113.10 4.51 0.50 N 14 2 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.80 106.40 -2.60 0.40 N 15 2 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.54 113.10 4.44 0.50 N 16 2 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.72 106.40 -2.68 0.40 N 17 2 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 18 2 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.85 113.10 4.75 0.50 N 19 2 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.61 106.40 -2.79 0.40 N 20 2 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 21 2 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N 22 2 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.45 113.80 3.65 0.50 N 23 2 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 24 2 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 25 3 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.73 113.10 4.63 0.50 N 26 3 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.65 106.40 -2.75 0.40 N 27 3 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.54 113.10 4.44 0.50 N 28 3 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.60 106.40 -2.80 0.40 N 29 3 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.50 113.80 3.70 0.50 N 30 3 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.86 113.10 4.76 0.50 N 31 3 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 32 3 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 33 3 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 34 3 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.43 113.80 3.63 0.50 N 35 3 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 36 3 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.80 106.40 -2.60 0.40 N 37 4 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.74 113.10 4.64 0.50 N 38 4 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.59 106.40 -2.81 0.40 N 39 4 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.44 113.10 4.34 0.50 N 40 4 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 41 4 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 42 4 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.83 113.10 4.73 0.50 N 43 4 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.61 106.40 -2.79 0.40 N 44 4 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 45 4 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 46 4 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.55 113.80 3.75 0.50 N 47 4 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.68 113.10 4.58 0.50 N 48 4 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.72 106.40 -2.68 0.40 N 49 5 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 50 5 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 51 5 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.55 113.10 4.45 0.50 N 52 5 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.57 106.40 -2.83 0.40 N 53 5 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.58 113.80 3.78 0.50 N 54 5 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.75 113.10 4.65 0.50 N 55 5 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 56 5 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 57 5 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 58 5 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 59 5 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 60 5 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 61 6 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.57 113.10 4.47 0.50 N 62 6 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.68 106.40 -2.72 0.40 N 63 6 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 64 6 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 65 6 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 66 6 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 67 6 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.69 106.40 -2.71 0.40 N 68 6 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 69 6 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.68 106.40 -2.72 0.40 N 70 6 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.58 113.80 3.78 0.50 N 71 6 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 72 6 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 73 7 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.69 113.10 4.59 0.50 N 74 7 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.60 106.40 -2.80 0.40 N 75 7 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.62 113.10 4.52 0.50 N 76 7 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.60 106.40 -2.80 0.40 N 77 7 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.45 113.80 3.65 0.50 N 78 7 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 79 7 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.66 106.40 -2.74 0.40 N 80 7 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.62 113.10 4.52 0.50 N 81 7 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.81 106.40 -2.59 0.40 N 82 7 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.36 113.80 3.56 0.50 N 83 7 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 84 7 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.72 106.40 -2.68 0.40 N 85 8 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 86 8 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.63 106.40 -2.77 0.40 N 87 8 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.51 113.10 4.41 0.50 N 88 8 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 89 8 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.43 113.80 3.63 0.50 N 90 8 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.80 113.10 4.70 0.50 N 91 8 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.66 106.40 -2.74 0.40 N 92 8 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 93 8 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 94 8 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.37 113.80 3.57 0.50 N 95 8 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 96 8 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 97 9 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 98 9 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.62 106.40 -2.78 0.40 N 99 9 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.47 113.10 4.37 0.50 N 100 9 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 101 9 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 102 9 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.83 113.10 4.73 0.50 N 103 9 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.65 106.40 -2.75 0.40 N 104 9 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 105 9 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 106 9 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.48 113.80 3.68 0.50 N 107 9 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 108 9 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N 109 10 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 110 10 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.65 106.40 -2.75 0.40 N 111 10 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.57 113.10 4.47 0.50 N 112 10 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.61 106.40 -2.79 0.40 N 113 10 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 114 10 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.80 113.10 4.70 0.50 N 115 10 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.69 106.40 -2.71 0.40 N 116 10 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 117 10 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.80 106.40 -2.60 0.40 N 118 10 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.40 113.80 3.60 0.50 N 119 10 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 120 10 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 121 11 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.76 113.10 4.66 0.50 N 122 11 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.59 106.40 -2.81 0.40 N 123 11 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.49 113.10 4.39 0.50 N 124 11 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.60 106.40 -2.80 0.40 N 125 11 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 126 11 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.92 113.10 4.82 0.50 N 127 11 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.62 106.40 -2.78 0.40 N 128 11 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 129 11 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.69 106.40 -2.71 0.40 N 130 11 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 131 11 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 132 11 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.78 106.40 -2.62 0.40 N 133 12 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 134 12 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 135 12 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 136 12 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 137 12 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 138 12 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.94 113.10 4.84 0.50 N 139 12 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.65 106.40 -2.75 0.40 N 140 12 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 141 12 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.78 106.40 -2.62 0.40 N 142 12 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.55 113.80 3.75 0.50 N 143 12 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 144 12 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 145 13 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 146 13 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.66 106.40 -2.74 0.40 N 147 13 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 148 13 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.57 106.40 -2.83 0.40 N 149 13 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 150 13 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.80 113.10 4.70 0.50 N 151 13 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 152 13 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 153 13 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 154 13 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.38 113.80 3.58 0.50 N 155 13 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 156 13 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.83 106.40 -2.57 0.40 N 157 14 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 158 14 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.61 106.40 -2.79 0.40 N 159 14 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.52 113.10 4.42 0.50 N 160 14 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 161 14 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 162 14 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.82 113.10 4.72 0.50 N 163 14 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 164 14 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 165 14 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 166 14 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.48 113.80 3.68 0.50 N 167 14 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.68 113.10 4.58 0.50 N 168 14 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 169 15 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.58 113.10 4.48 0.50 N 170 15 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.78 106.40 -2.62 0.40 N 171 15 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 172 15 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 173 15 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.41 113.80 3.61 0.50 N 174 15 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.87 113.10 4.77 0.50 N 175 15 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 176 15 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 177 15 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 178 15 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.64 113.80 3.84 0.50 N 179 15 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 180 15 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 181 16 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.61 113.10 4.51 0.50 N 182 16 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.66 106.40 -2.74 0.40 N 183 16 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.52 113.10 4.42 0.50 N 184 16 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 185 16 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.58 113.80 3.78 0.50 N 186 16 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.80 113.10 4.70 0.50 N 187 16 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.69 106.40 -2.71 0.40 N 188 16 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.58 113.10 4.48 0.50 N 189 16 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.78 106.40 -2.62 0.40 N 190 16 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.48 113.80 3.68 0.50 N 191 16 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.61 113.10 4.51 0.50 N 192 16 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.78 106.40 -2.62 0.40 N 193 17 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.61 113.10 4.51 0.50 N 194 17 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 195 17 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.40 113.10 4.30 0.50 N 196 17 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.62 106.40 -2.78 0.40 N 197 17 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 198 17 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.80 113.10 4.70 0.50 N 199 17 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.63 106.40 -2.77 0.40 N 200 17 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 201 17 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 202 17 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.48 113.80 3.68 0.50 N 203 17 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 204 17 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.88 106.40 -2.52 0.40 N 205 18 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.72 113.10 4.62 0.50 N 206 18 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.59 106.40 -2.81 0.40 N 207 18 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.52 113.10 4.42 0.50 N 208 18 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.62 106.40 -2.78 0.40 N 209 18 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.47 113.80 3.67 0.50 N 210 18 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.91 113.10 4.81 0.50 N 211 18 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.70 106.40 -2.70 0.40 N 212 18 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 213 18 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.72 106.40 -2.68 0.40 N 214 18 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.47 113.80 3.67 0.50 N 215 18 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 216 18 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 217 19 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.69 113.10 4.59 0.50 N 218 19 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 219 19 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.55 113.10 4.45 0.50 N 220 19 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 221 19 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 222 19 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.92 113.10 4.82 0.50 N 223 19 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.65 106.40 -2.75 0.40 N 224 19 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 225 19 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.59 106.40 -2.81 0.40 N 226 19 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.62 113.80 3.82 0.50 N 227 19 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.56 113.10 4.46 0.50 N 228 19 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 229 20 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 230 20 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.65 106.40 -2.75 0.40 N 231 20 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 232 20 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.61 106.40 -2.79 0.40 N 233 20 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.53 113.80 3.73 0.50 N 234 20 N7 A G 9 ? ? C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? 117.99 113.10 4.89 0.50 N 235 20 C8 A G 9 ? ? N9 A G 9 ? ? C4 A G 9 ? ? 103.68 106.40 -2.72 0.40 N 236 20 N7 A G 11 ? ? C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? 117.61 113.10 4.51 0.50 N 237 20 C8 A G 11 ? ? N9 A G 11 ? ? C4 A G 11 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 238 20 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.41 113.80 3.61 0.50 N 239 20 N7 A G 13 ? ? C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? 117.78 113.10 4.68 0.50 N 240 20 C8 A G 13 ? ? N9 A G 13 ? ? C4 A G 13 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1Q75 'double helix' 1Q75 'a-form double helix' 1Q75 'hairpin loop' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 15 1_555 -0.880 -0.102 0.067 2.486 -0.447 -3.387 1 A_G1:C15_A A 1 ? A 15 ? 19 1 1 A G 2 1_555 A C 14 1_555 -0.552 0.042 -0.253 -2.151 6.174 -0.523 2 A_G2:C14_A A 2 ? A 14 ? 19 1 1 A C 3 1_555 A G 13 1_555 -0.540 -0.150 -0.012 -3.578 3.142 -0.003 3 A_C3:G13_A A 3 ? A 13 ? 19 1 1 A U 4 1_555 A A 12 1_555 0.595 -0.253 -0.435 7.722 2.985 -12.350 4 A_U4:A12_A A 4 ? A 12 ? 20 1 1 A C 5 1_555 A G 11 1_555 0.656 -0.276 -0.427 3.446 3.664 -1.523 5 A_C5:G11_A A 5 ? A 11 ? 19 1 1 A U 6 1_555 A G 9 1_555 0.341 -6.199 0.180 7.864 1.688 -102.568 6 A_U6:G9_A A 6 ? A 9 ? ? 6 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A G 1 1_555 A C 15 1_555 A G 2 1_555 A C 14 1_555 -0.263 -1.489 4.107 -4.094 -2.011 39.435 -1.895 -0.218 4.180 -2.968 6.042 39.688 1 AA_G1G2:C14C15_AA A 1 ? A 15 ? A 2 ? A 14 ? 1 A G 2 1_555 A C 14 1_555 A C 3 1_555 A G 13 1_555 -0.151 -2.115 4.022 -2.625 -6.469 28.443 -2.360 -0.441 4.382 -12.920 5.242 29.270 2 AA_G2C3:G13C14_AA A 2 ? A 14 ? A 3 ? A 13 ? 1 A C 3 1_555 A G 13 1_555 A U 4 1_555 A A 12 1_555 0.490 -1.572 3.477 5.035 -5.286 36.283 -1.690 -0.022 3.695 -8.385 -7.986 36.986 3 AA_C3U4:A12G13_AA A 3 ? A 13 ? A 4 ? A 12 ? 1 A U 4 1_555 A A 12 1_555 A C 5 1_555 A G 11 1_555 1.184 -1.964 3.644 3.663 15.995 32.527 -5.390 -1.385 2.548 26.554 -6.080 36.332 4 AA_U4C5:G11A12_AA A 4 ? A 12 ? A 5 ? A 11 ? 1 A C 5 1_555 A G 11 1_555 A U 6 1_555 A G 9 1_555 1.379 -1.366 4.923 -15.022 3.397 97.049 -0.988 -1.281 4.695 2.256 9.978 97.959 5 AA_C5U6:G9G11_AA A 5 ? A 11 ? A 6 ? A 9 ? #