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'U(-49)G, U(-48)G, U(-71)C, A(-15)G, A(-14)C, A(-13)C' ? 'Domain D2 of the trs mRNA operator from E.coli (nucleotides -49 to -13)' 2 polymer man 'Threonyl-tRNA synthetase' 46725.180 8 6.1.1.3 ? 'Catalytic and anticodon binding domains (residues 242 to 642)' ? 3 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 8 ? ? ? ? 4 non-polymer syn "5'-O-(N-(L-THREONYL)-SULFAMOYL)ADENOSINE" 447.424 8 ? ? ? ? 5 water nat water 18.015 170 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polyribonucleotide no no GGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCC GGCGUAUGUGAUCUUUCGUGUGGGUCACCACUGCGCC I,J,K,L,M,N,O,P ? 2 'polypeptide(L)' no no ;RDHRKIGKQLDLYHMQEEAPGMVFWHNDGWTIFRELEVFVRSKLKEYQYQEVKGPFMMDRVLWEKTGHWDNYKDAMFTTS SENREYCIKPMNCPGHVQIFNQGLKSYRDLPLRMAEFGSCHRNEPSGSLHGLMRVRGFTQDDAHIFCTEEQIRDEVNGCI RLVYDMYSTFGFEKIVVKLSTRPEKRIGSDEMWDRAEADLAVALEENNIPFEYQLGEGAFYGPKIEFTLYDCLDRAWQCG TVQLDFSLPSRLSASYVGEDNERKVPVMIHRAILGSMERFIGILTEEFAGFFPTWLAPVQVVIMNITDSQSEYVNELTQK 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348 ARG n 2 349 VAL n 2 350 PRO n 2 351 TYR n 2 352 MET n 2 353 LEU n 2 354 VAL n 2 355 CYS n 2 356 GLY n 2 357 ASP n 2 358 LYS n 2 359 GLU n 2 360 VAL n 2 361 GLU n 2 362 SER n 2 363 GLY n 2 364 LYS n 2 365 VAL n 2 366 ALA n 2 367 VAL n 2 368 ARG n 2 369 THR n 2 370 ARG n 2 371 ARG n 2 372 GLY n 2 373 LYS n 2 374 ASP n 2 375 LEU n 2 376 GLY n 2 377 SER n 2 378 MET n 2 379 ASP n 2 380 VAL n 2 381 ASN n 2 382 GLU n 2 383 VAL n 2 384 ILE n 2 385 GLU n 2 386 LYS n 2 387 LEU n 2 388 GLN n 2 389 GLN n 2 390 GLU n 2 391 ILE n 2 392 ARG n 2 393 SER n 2 394 ARG n 2 395 SER n 2 396 LEU n 2 397 LYS n 2 398 GLN n 2 399 LEU n 2 400 GLU n 2 401 GLU n # _entity_src_gen.entity_id 2 _entity_src_gen.pdbx_src_id 1 _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag sample _entity_src_gen.pdbx_seq_type ? _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num ? _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num ? _entity_src_gen.gene_src_common_name ? _entity_src_gen.gene_src_genus Escherichia _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene ? 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_pdbx_entity_src_syn.details ;This is the natural sequence of domain D2 of the trs mRNA operator from E. coli, covering residues -49 to -13 (69 to 105 in the present coordinate file) of E.coli trs mRNA, except for the first 3 base pairs. It was synthesized in vitro by T7 transcription. ; # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP SYT_ECOLI 2 ;RDHRKIGKQLDLYHMQEEAPGMVFWHNDGWTIFRELEVFVRSKLKEYQYQEVKGPFMMDRVLWEKTGHWDNYKDAMFTTS SENREYCIKPMNCPGHVQIFNQGLKSYRDLPLRMAEFGSCHRNEPSGSLHGLMRVRGFTQDDAHIFCTEEQIRDEVNGCI RLVYDMYSTFGFEKIVVKLSTRPEKRIGSDEMWDRAEADLAVALEENNIPFEYQLGEGAFYGPKIEFTLYDCLDRAWQCG TVQLDFSLPSRLSASYVGEDNERKVPVMIHRAILGSMERFIGILTEEFAGFFPTWLAPVQVVIMNITDSQSEYVNELTQK LSNAGIRVKADLRNEKIGFKIREHTLRRVPYMLVCGDKEVESGKVAVRTRRGKDLGSMDVNEVIEKLQQEIRSRSLKQLE E ; 242 P0A8M3 ? 2 PDB 1KOG 1 ? ? 1KOG ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1KOG A 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 2 1 1KOG B 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 3 1 1KOG C 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 4 1 1KOG D 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 5 1 1KOG E 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 6 1 1KOG F 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 7 1 1KOG G 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 8 1 1KOG H 1 ? 401 ? P0A8M3 242 ? 642 ? 242 642 9 2 1KOG I 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 10 2 1KOG J 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 11 2 1KOG K 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 12 2 1KOG L 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 13 2 1KOG M 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 14 2 1KOG N 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 15 2 1KOG O 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 16 2 1KOG P 1 ? 37 ? 1KOG 69 ? 105 ? 69 105 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TSB non-polymer . "5'-O-(N-(L-THREONYL)-SULFAMOYL)ADENOSINE" ? 'C14 H21 N7 O8 S' 447.424 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.entry_id 1KOG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol 68 _exptl_crystal.density_Matthews 3.6 _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 277 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.6 _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'ammonium sulfate, magnesium chloride, cacodylate, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # loop_ _exptl_crystal_grow_comp.crystal_id _exptl_crystal_grow_comp.id _exptl_crystal_grow_comp.sol_id _exptl_crystal_grow_comp.name _exptl_crystal_grow_comp.conc _exptl_crystal_grow_comp.volume _exptl_crystal_grow_comp.details 1 1 1 'ammonium sulfate' ? ? ? 1 2 1 MgCl2 ? ? ? 1 3 1 cacodylate ? ? ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 4' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2001-02-16 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.934 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ESRF BEAMLINE ID14-2' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ESRF _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline ID14-2 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.934 # _reflns.entry_id 1KOG _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 30 _reflns.d_resolution_high 3.46 _reflns.number_obs 88408 _reflns.number_all 88408 _reflns.percent_possible_obs 97.9 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.0630000 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 15.7 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 82.0 _reflns.pdbx_redundancy 3.74 _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _reflns_shell.d_res_high 3.46 _reflns_shell.d_res_low 3.58 _reflns_shell.percent_possible_all 82.8 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.3460000 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 4.7 _reflns_shell.pdbx_redundancy 3.8 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all 8790 _reflns_shell.pdbx_diffrn_id ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 1KOG _refine.ls_number_reflns_obs 78341 _refine.ls_number_reflns_all 87032 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 2.0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF 10000. _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF 0.000000 _refine.ls_d_res_low 29.80 _refine.ls_d_res_high 3.50 _refine.ls_percent_reflns_obs 90.0 _refine.ls_R_factor_obs 0.2510000 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2510000 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2870000 _refine.ls_R_factor_R_free_error 0.003 _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 9.9 _refine.ls_number_reflns_R_free 7774 _refine.ls_number_parameters ? 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? ? 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'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 8 _refine_ls_shell.d_res_high 3.50 _refine_ls_shell.d_res_low 3.66 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 7475 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.3270000 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 76.8 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.3640000 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error 0.013 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free 9.6 _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 792 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # loop_ _pdbx_xplor_file.serial_no _pdbx_xplor_file.param_file _pdbx_xplor_file.topol_file _pdbx_xplor_file.pdbx_refine_id 1 PROTEIN_REP.PARAM PROTEIN.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' 2 DNA-RNA_REP.PARAM DNA-RNA.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' 3 TSA_NEW.PAR TSA_NEW.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' 4 ION.PARAM ION.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' 5 WATER_REP.PARAM WATER.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 1KOG _struct.title 'Crystal structure of E. coli threonyl-tRNA synthetase interacting with the essential domain of its mRNA operator' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1KOG _struct_keywords.pdbx_keywords LIGASE/RNA _struct_keywords.text 'Protein-RNA complex, RNA stem-loop, RNA double helix, RNA base triples, LIGASE-RNA COMPLEX' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 3 ? R N N 4 ? S N N 3 ? T N N 4 ? U N N 3 ? V N N 4 ? W N N 3 ? X N N 4 ? Y N N 3 ? Z N N 4 ? AA N N 3 ? BA N N 4 ? CA N N 3 ? DA N N 4 ? EA N N 3 ? FA N N 4 ? GA N N 5 ? HA N N 5 ? IA N N 5 ? JA N N 5 ? KA N N 5 ? LA N N 5 ? MA N N 5 ? NA N N 5 ? OA N N 5 ? PA N N 5 ? QA N N 5 ? RA N N 5 ? SA N N 5 ? TA N N 5 ? UA N N 5 ? 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D ZN 1 D TSB 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? ? metalc20 metalc ? ? W ZN . ZN ? ? ? 1_555 X TSB . N ? ? D ZN 1 D TSB 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.770 ? ? metalc21 metalc ? ? Y ZN . ZN ? ? ? 1_555 M CYS 93 SG ? ? E ZN 1 E CYS 334 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? ? metalc22 metalc ? ? Y ZN . ZN ? ? ? 1_555 M HIS 144 NE2 ? ? E ZN 1 E HIS 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? metalc23 metalc ? ? Y ZN . ZN ? ? ? 1_555 M HIS 270 ND1 ? ? E ZN 1 E HIS 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? ? metalc24 metalc ? ? Y ZN . ZN ? ? ? 1_555 Z TSB . N ? ? E ZN 1 E TSB 6002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? ? metalc25 metalc ? ? Y ZN . ZN ? ? ? 1_555 Z TSB . OG1 ? ? E ZN 1 E TSB 6002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? ? metalc26 metalc ? ? AA ZN . ZN ? ? ? 1_555 N CYS 93 SG ? ? F ZN 1 F CYS 334 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? ? metalc27 metalc ? ? AA ZN . ZN ? ? ? 1_555 N HIS 144 NE2 ? ? F ZN 1 F HIS 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? ? metalc28 metalc ? ? AA ZN . ZN ? ? ? 1_555 N HIS 270 ND1 ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A C 3 N3 ? ? ? 1_555 A G 35 N1 ? ? I C 71 I G 103 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A C 3 N4 ? ? ? 1_555 A G 35 O6 ? ? I C 71 I G 103 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A C 3 O2 ? ? ? 1_555 A G 35 N2 ? ? I C 71 I G 103 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A G 4 N1 ? ? ? 1_555 A C 34 N3 ? ? I G 72 I C 102 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A G 4 N2 ? ? ? 1_555 A C 34 O2 ? ? I G 72 I C 102 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A G 4 O6 ? ? ? 1_555 A C 34 N4 ? ? I G 72 I C 102 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A U 5 N3 ? ? ? 1_555 A G 33 O6 ? ? I U 73 I G 101 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A U 5 O2 ? ? ? 1_555 A G 33 N1 ? ? I U 73 I G 101 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A A 6 N6 ? ? ? 1_555 A C 29 N3 ? ? I A 74 I C 97 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog199 hydrog ? ? F G 1 O6 ? ? ? 1_555 F C 37 N4 ? ? N G 69 N C 105 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog200 hydrog ? ? F G 2 N1 ? ? ? 1_555 F C 36 N3 ? ? N G 70 N C 104 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog201 hydrog ? ? F G 2 N2 ? ? ? 1_555 F C 36 O2 ? ? N G 70 N C 104 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog202 hydrog ? ? F G 2 O6 ? ? ? 1_555 F C 36 N4 ? ? N G 70 N C 104 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog203 hydrog ? ? F C 3 N3 ? ? ? 1_555 F G 35 N1 ? ? N C 71 N G 103 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog204 hydrog ? ? F C 3 N4 ? ? ? 1_555 F G 35 O6 ? ? N C 71 N G 103 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog205 hydrog ? ? F C 3 O2 ? ? ? 1_555 F G 35 N2 ? ? N C 71 N G 103 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog206 hydrog ? ? F G 4 N1 ? ? ? 1_555 F C 34 N3 ? ? N G 72 N C 102 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog207 hydrog ? ? F G 4 N2 ? ? ? 1_555 F C 34 O2 ? ? N G 72 N C 102 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog208 hydrog ? ? F G 4 O6 ? ? ? 1_555 F C 34 N4 ? ? N G 72 N C 102 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog209 hydrog ? ? F U 5 N3 ? ? ? 1_555 F G 33 O6 ? ? N U 73 N G 101 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog210 hydrog ? ? F U 5 O2 ? ? ? 1_555 F G 33 N1 ? ? N U 73 N G 101 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog211 hydrog ? ? F A 6 N6 ? ? ? 1_555 F C 29 N3 ? ? N A 74 N C 97 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog212 hydrog ? ? F A 6 N7 ? ? ? 1_555 F C 29 N4 ? ? N A 74 N C 97 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog213 hydrog ? ? F A 6 N1 ? ? ? 1_555 F U 32 N3 ? ? N A 74 N U 100 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog214 hydrog ? ? F A 6 N6 ? ? ? 1_555 F U 32 O4 ? ? N A 74 N U 100 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog215 hydrog ? ? F G 8 N1 ? ? ? 1_555 F C 28 N3 ? ? N G 76 N C 96 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog216 hydrog ? ? F G 8 N2 ? ? ? 1_555 F C 28 O2 ? ? N G 76 N C 96 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'C-C MISPAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 110 I . ? LEU 351 A PRO 111 I ? PRO 352 A 1 -0.11 2 LEU 110 J . ? LEU 351 B PRO 111 J ? PRO 352 B 1 -0.06 3 LEU 110 K . ? LEU 351 C PRO 111 K ? PRO 352 C 1 0.93 4 LEU 110 L . ? 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AR ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel A 6 7 ? anti-parallel A 7 8 ? parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel C 2 3 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? parallel E 2 3 ? parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel G 4 5 ? anti-parallel G 5 6 ? anti-parallel G 6 7 ? anti-parallel G 7 8 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel I 1 2 ? parallel I 2 3 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? parallel K 2 3 ? parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel L 1 2 ? parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel L 5 6 ? anti-parallel L 6 7 ? anti-parallel L 7 8 ? parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel N 1 2 ? parallel N 2 3 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? parallel P 3 4 ? anti-parallel P 4 5 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel R 6 7 ? anti-parallel R 7 8 ? parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel T 1 2 ? parallel T 2 3 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? parallel V 2 3 ? parallel V 3 4 ? anti-parallel V 4 5 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel X 1 2 ? parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel X 4 5 ? anti-parallel X 5 6 ? anti-parallel X 6 7 ? anti-parallel X 7 8 ? parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Z 1 2 ? parallel Z 2 3 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AB 1 2 ? parallel AB 2 3 ? parallel AB 3 4 ? anti-parallel AB 4 5 ? anti-parallel AC 1 2 ? parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AC 4 5 ? anti-parallel AC 5 6 ? anti-parallel AC 6 7 ? anti-parallel AC 7 8 ? parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AE 1 2 ? parallel AE 2 3 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AG 1 2 ? parallel AG 2 3 ? parallel AG 3 4 ? anti-parallel AG 4 5 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AI 1 2 ? parallel AI 2 3 ? anti-parallel AI 3 4 ? anti-parallel AI 4 5 ? anti-parallel AI 5 6 ? anti-parallel AI 6 7 ? anti-parallel AI 7 8 ? parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AK 1 2 ? parallel AK 2 3 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AM 1 2 ? parallel AM 2 3 ? parallel AM 3 4 ? anti-parallel AM 4 5 ? anti-parallel AN 1 2 ? parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? anti-parallel AN 4 5 ? anti-parallel AN 5 6 ? anti-parallel AN 6 7 ? anti-parallel AN 7 8 ? parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? anti-parallel AP 1 2 ? parallel AP 2 3 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AR 1 2 ? parallel AR 2 3 ? parallel AR 3 4 ? anti-parallel AR 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 GLN I 50 ? 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RA 5 HOH 7 5009 408 HOH HOH D . RA 5 HOH 8 5010 409 HOH HOH D . RA 5 HOH 9 5011 410 HOH HOH D . RA 5 HOH 10 5012 416 HOH HOH D . RA 5 HOH 11 5013 421 HOH HOH D . RA 5 HOH 12 5014 437 HOH HOH D . RA 5 HOH 13 5015 1222 HOH HOH D . RA 5 HOH 14 5016 1223 HOH HOH D . SA 5 HOH 1 6003 501 HOH HOH E . SA 5 HOH 2 6004 502 HOH HOH E . SA 5 HOH 3 6005 504 HOH HOH E . SA 5 HOH 4 6006 506 HOH HOH E . SA 5 HOH 5 6007 507 HOH HOH E . SA 5 HOH 6 6008 508 HOH HOH E . SA 5 HOH 7 6009 516 HOH HOH E . SA 5 HOH 8 6010 521 HOH HOH E . SA 5 HOH 9 6011 532 HOH HOH E . SA 5 HOH 10 6012 537 HOH HOH E . SA 5 HOH 11 6013 1323 HOH HOH E . TA 5 HOH 1 7003 601 HOH HOH F . TA 5 HOH 2 7004 602 HOH HOH F . TA 5 HOH 3 7005 604 HOH HOH F . TA 5 HOH 4 7006 607 HOH HOH F . TA 5 HOH 5 7007 608 HOH HOH F . TA 5 HOH 6 7008 609 HOH HOH F . TA 5 HOH 7 7009 610 HOH HOH F . TA 5 HOH 8 7010 616 HOH HOH F . TA 5 HOH 9 7011 617 HOH HOH F . TA 5 HOH 10 7012 620 HOH HOH F . TA 5 HOH 11 7013 635 HOH HOH F . TA 5 HOH 12 7014 1430 HOH HOH F . TA 5 HOH 13 7015 1440 HOH HOH F . UA 5 HOH 1 701 701 HOH HOH G . UA 5 HOH 2 702 702 HOH HOH G . UA 5 HOH 3 704 704 HOH HOH G . UA 5 HOH 4 706 706 HOH HOH G . UA 5 HOH 5 707 707 HOH HOH G . UA 5 HOH 6 708 708 HOH HOH G . UA 5 HOH 7 709 709 HOH HOH G . UA 5 HOH 8 710 710 HOH HOH G . UA 5 HOH 9 715 715 HOH HOH G . UA 5 HOH 10 716 716 HOH HOH G . UA 5 HOH 11 720 720 HOH HOH G . UA 5 HOH 12 726 726 HOH HOH G . UA 5 HOH 13 732 732 HOH HOH G . VA 5 HOH 1 109 109 HOH HOH H . VA 5 HOH 2 801 801 HOH HOH H . VA 5 HOH 3 802 802 HOH HOH H . VA 5 HOH 4 804 804 HOH HOH H . VA 5 HOH 5 805 805 HOH HOH H . VA 5 HOH 6 806 806 HOH HOH H . VA 5 HOH 7 807 807 HOH HOH H . VA 5 HOH 8 808 808 HOH HOH H . VA 5 HOH 9 810 810 HOH HOH H . VA 5 HOH 10 815 815 HOH HOH H . VA 5 HOH 11 817 817 HOH HOH H . VA 5 HOH 12 820 820 HOH HOH H . VA 5 HOH 13 821 821 HOH HOH H . VA 5 HOH 14 826 826 HOH HOH H . VA 5 HOH 15 835 835 HOH HOH H . VA 5 HOH 16 1612 1612 HOH HOH H . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? tetrameric 4 2 author_defined_assembly ? tetrameric 4 3 author_defined_assembly ? tetrameric 4 4 author_defined_assembly ? tetrameric 4 5 author_defined_assembly ? tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,I,J,Q,R,S,T,GA,HA,OA,PA 2 1 C,D,K,L,U,V,W,X,IA,JA,QA,RA 3 1 E,F,M,N,Y,Z,AA,BA,KA,LA,SA,TA 4 1,2 G,O,CA,DA,MA,UA 5 1,3 H,P,EA,FA,NA,VA # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,y,-z -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 3 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y,-z+1 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 106.1017629588 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 181.5356809451 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? I CYS 93 ? A CYS 334 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 NE2 ? I HIS 144 ? A HIS 385 ? 1_555 102.7 ? 2 SG ? I CYS 93 ? A CYS 334 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 ND1 ? I HIS 270 ? A HIS 511 ? 1_555 103.3 ? 3 NE2 ? I HIS 144 ? A HIS 385 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 ND1 ? I HIS 270 ? A HIS 511 ? 1_555 90.9 ? 4 SG ? I CYS 93 ? A CYS 334 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 OG1 ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 148.8 ? 5 NE2 ? I HIS 144 ? A HIS 385 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 OG1 ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 79.2 ? 6 ND1 ? I HIS 270 ? A HIS 511 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 OG1 ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 107.8 ? 7 SG ? I CYS 93 ? A CYS 334 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 N ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 82.3 ? 8 NE2 ? I HIS 144 ? A HIS 385 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 N ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 144.7 ? 9 ND1 ? I HIS 270 ? A HIS 511 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 N ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 122.4 ? 10 OG1 ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 ZN ? Q ZN . ? A ZN 1 ? 1_555 N ? R TSB . ? A TSB 2002 ? 1_555 79.4 ? 11 SG ? J CYS 93 ? B CYS 334 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 NE2 ? J HIS 144 ? B HIS 385 ? 1_555 95.2 ? 12 SG ? J CYS 93 ? B CYS 334 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 ND1 ? J HIS 270 ? B HIS 511 ? 1_555 95.2 ? 13 NE2 ? J HIS 144 ? B HIS 385 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 ND1 ? J HIS 270 ? B HIS 511 ? 1_555 84.1 ? 14 SG ? J CYS 93 ? B CYS 334 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 OG1 ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 157.6 ? 15 NE2 ? J HIS 144 ? B HIS 385 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 OG1 ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 76.7 ? 16 ND1 ? J HIS 270 ? B HIS 511 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 OG1 ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 104.5 ? 17 SG ? J CYS 93 ? B CYS 334 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 N ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 92.5 ? 18 NE2 ? J HIS 144 ? B HIS 385 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 N ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 141.6 ? 19 ND1 ? J HIS 270 ? B HIS 511 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 N ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 132.5 ? 20 OG1 ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 ZN ? S ZN . ? B ZN 1 ? 1_555 N ? T TSB . ? B TSB 3002 ? 1_555 82.1 ? 21 SG ? K CYS 93 ? C CYS 334 ? 1_555 ZN ? U ZN . ? C ZN 1 ? 1_555 NE2 ? K HIS 144 ? C HIS 385 ? 1_555 97.8 ? 22 SG ? K CYS 93 ? C CYS 334 ? 1_555 ZN ? U ZN . ? C ZN 1 ? 1_555 ND1 ? K HIS 270 ? C HIS 511 ? 1_555 108.4 ? 23 NE2 ? K HIS 144 ? C HIS 385 ? 1_555 ZN ? U ZN . ? C ZN 1 ? 1_555 ND1 ? K HIS 270 ? C HIS 511 ? 1_555 91.6 ? 24 SG ? K CYS 93 ? C CYS 334 ? 1_555 ZN ? U ZN . ? C ZN 1 ? 1_555 N ? V TSB . ? C TSB 4002 ? 1_555 87.5 ? 25 NE2 ? K HIS 144 ? C HIS 385 ? 1_555 ZN ? U ZN . ? C ZN 1 ? 1_555 N ? V TSB . ? C TSB 4002 ? 1_555 131.0 ? 26 ND1 ? K HIS 270 ? C HIS 511 ? 1_555 ZN ? U ZN . ? C ZN 1 ? 1_555 N ? V TSB . ? C TSB 4002 ? 1_555 132.9 ? 27 SG ? K CYS 93 ? C CYS 334 ? 1_555 ZN ? U ZN . ? C ZN 1 ? 1_555 OG1 ? V TSB . ? C TSB 4002 ? 1_555 143.1 ? 28 NE2 ? K HIS 144 ? 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218 GLU N H2 sing N N 219 GLU CA C sing N N 220 GLU CA CB sing N N 221 GLU CA HA sing N N 222 GLU C O doub N N 223 GLU C OXT sing N N 224 GLU CB CG sing N N 225 GLU CB HB2 sing N N 226 GLU CB HB3 sing N N 227 GLU CG CD sing N N 228 GLU CG HG2 sing N N 229 GLU CG HG3 sing N N 230 GLU CD OE1 doub N N 231 GLU CD OE2 sing N N 232 GLU OE2 HE2 sing N N 233 GLU OXT HXT sing N N 234 GLY N CA sing N N 235 GLY N H sing N N 236 GLY N H2 sing N N 237 GLY CA C sing N N 238 GLY CA HA2 sing N N 239 GLY CA HA3 sing N N 240 GLY C O doub N N 241 GLY C OXT sing N N 242 GLY OXT HXT sing N N 243 HIS N CA sing N N 244 HIS N H sing N N 245 HIS N H2 sing N N 246 HIS CA C sing N N 247 HIS CA CB sing N N 248 HIS CA HA sing N N 249 HIS C O doub N N 250 HIS C OXT sing N N 251 HIS CB CG sing N N 252 HIS CB HB2 sing N N 253 HIS CB HB3 sing N N 254 HIS CG ND1 sing Y N 255 HIS CG CD2 doub Y N 256 HIS ND1 CE1 doub Y N 257 HIS ND1 HD1 sing N N 258 HIS CD2 NE2 sing Y N 259 HIS CD2 HD2 sing N N 260 HIS CE1 NE2 sing Y N 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LEU CD1 HD13 sing N N 304 LEU CD2 HD21 sing N N 305 LEU CD2 HD22 sing N N 306 LEU CD2 HD23 sing N N 307 LEU OXT HXT sing N N 308 LYS N CA sing N N 309 LYS N H sing N N 310 LYS N H2 sing N N 311 LYS CA C sing N N 312 LYS CA CB sing N N 313 LYS CA HA sing N N 314 LYS C O doub N N 315 LYS C OXT sing N N 316 LYS CB CG sing N N 317 LYS CB HB2 sing N N 318 LYS CB HB3 sing N N 319 LYS CG CD sing N N 320 LYS CG HG2 sing N N 321 LYS CG HG3 sing N N 322 LYS CD CE sing N N 323 LYS CD HD2 sing N N 324 LYS CD HD3 sing N N 325 LYS CE NZ sing N N 326 LYS CE HE2 sing N N 327 LYS CE HE3 sing N N 328 LYS NZ HZ1 sing N N 329 LYS NZ HZ2 sing N N 330 LYS NZ HZ3 sing N N 331 LYS OXT HXT sing N N 332 MET N CA sing N N 333 MET N H sing N N 334 MET N H2 sing N N 335 MET CA C sing N N 336 MET CA CB sing N N 337 MET CA HA sing N N 338 MET C O doub N N 339 MET C OXT sing N N 340 MET CB CG sing N N 341 MET CB HB2 sing N N 342 MET CB HB3 sing N N 343 MET CG SD sing N N 344 MET CG HG2 sing N N 345 MET CG HG3 sing N N 346 MET SD CE sing N N 347 MET CE HE1 sing N N 348 MET CE HE2 sing N N 349 MET CE HE3 sing N N 350 MET OXT HXT sing N N 351 PHE N CA sing N N 352 PHE N H sing N N 353 PHE N H2 sing N N 354 PHE CA C sing N N 355 PHE CA CB sing N N 356 PHE CA HA sing N N 357 PHE C O doub N N 358 PHE C OXT sing N N 359 PHE CB CG sing N N 360 PHE CB HB2 sing N N 361 PHE CB HB3 sing N N 362 PHE CG CD1 doub Y N 363 PHE CG CD2 sing Y N 364 PHE CD1 CE1 sing Y N 365 PHE CD1 HD1 sing N N 366 PHE CD2 CE2 doub Y N 367 PHE CD2 HD2 sing N N 368 PHE CE1 CZ doub Y N 369 PHE CE1 HE1 sing N N 370 PHE CE2 CZ sing Y N 371 PHE CE2 HE2 sing N N 372 PHE CZ HZ sing N N 373 PHE OXT HXT sing N N 374 PRO N CA sing N N 375 PRO N CD sing N N 376 PRO N H sing N N 377 PRO CA C sing N N 378 PRO CA CB sing N N 379 PRO CA HA sing N N 380 PRO C O doub N N 381 PRO C OXT sing N N 382 PRO CB CG sing N N 383 PRO CB HB2 sing N N 384 PRO CB HB3 sing N N 385 PRO CG CD sing N N 386 PRO CG HG2 sing N N 387 PRO CG HG3 sing N N 388 PRO CD HD2 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N 432 TRP CG CD2 sing Y N 433 TRP CD1 NE1 sing Y N 434 TRP CD1 HD1 sing N N 435 TRP CD2 CE2 doub Y N 436 TRP CD2 CE3 sing Y N 437 TRP NE1 CE2 sing Y N 438 TRP NE1 HE1 sing N N 439 TRP CE2 CZ2 sing Y N 440 TRP CE3 CZ3 doub Y N 441 TRP CE3 HE3 sing N N 442 TRP CZ2 CH2 doub Y N 443 TRP CZ2 HZ2 sing N N 444 TRP CZ3 CH2 sing Y N 445 TRP CZ3 HZ3 sing N N 446 TRP CH2 HH2 sing N N 447 TRP OXT HXT sing N N 448 TSB CG2 CB sing N N 449 TSB CG2 HG21 sing N N 450 TSB CG2 HG22 sing N N 451 TSB CG2 HG23 sing N N 452 TSB N CA sing N N 453 TSB N HN11 sing N N 454 TSB N HN12 sing N N 455 TSB CA CB sing N N 456 TSB CA C sing N N 457 TSB CA HA sing N N 458 TSB CB OG1 sing N N 459 TSB CB HB sing N N 460 TSB OG1 HG1 sing N N 461 TSB C O doub N N 462 TSB C N8 sing N N 463 TSB N8 S1 sing N N 464 TSB N8 HN8 sing N N 465 TSB S1 O1S doub N N 466 TSB S1 O2S doub N N 467 TSB S1 "O5'" sing N N 468 TSB "O5'" "C5'" sing N N 469 TSB "C5'" "C4'" sing N N 470 TSB "C5'" "H5'1" sing N N 471 TSB "C5'" "H5'2" sing N N 472 TSB "C4'" "O4'" sing N N 473 TSB "C4'" "C3'" sing N N 474 TSB "C4'" "H4'" sing N N 475 TSB "O4'" "C1'" sing N N 476 TSB "C3'" "O3'" sing N N 477 TSB "C3'" "C2'" sing N N 478 TSB "C3'" "H3'" sing N N 479 TSB "O3'" "HO3'" sing N N 480 TSB "C2'" "O2'" sing N N 481 TSB "C2'" "C1'" sing N N 482 TSB "C2'" "H2'" sing N N 483 TSB "O2'" "HO2'" sing N N 484 TSB "C1'" N9 sing N N 485 TSB "C1'" "H1'" sing N N 486 TSB N9 C8 sing Y N 487 TSB N9 C4 sing Y N 488 TSB C8 N7 doub Y N 489 TSB C8 H8 sing N N 490 TSB N7 C5 sing Y N 491 TSB C5 C6 sing Y N 492 TSB C5 C4 doub Y N 493 TSB C6 N6 sing N N 494 TSB C6 N1 doub Y N 495 TSB N6 HN61 sing N N 496 TSB N6 HN62 sing N N 497 TSB N1 C2 sing Y N 498 TSB C2 N3 doub Y N 499 TSB C2 H2 sing N N 500 TSB N3 C4 sing Y N 501 TYR N CA sing N N 502 TYR N H sing N N 503 TYR N H2 sing N N 504 TYR CA C sing N N 505 TYR CA CB sing N N 506 TYR CA HA sing N N 507 TYR C O doub N N 508 TYR C OXT sing N N 509 TYR CB CG sing N N 510 TYR CB HB2 sing N N 511 TYR CB HB3 sing N N 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552 U C2 N3 sing N N 553 U N3 C4 sing N N 554 U N3 H3 sing N N 555 U C4 O4 doub N N 556 U C4 C5 sing N N 557 U C5 C6 doub N N 558 U C5 H5 sing N N 559 U C6 H6 sing N N 560 VAL N CA sing N N 561 VAL N H sing N N 562 VAL N H2 sing N N 563 VAL CA C sing N N 564 VAL CA CB sing N N 565 VAL CA HA sing N N 566 VAL C O doub N N 567 VAL C OXT sing N N 568 VAL CB CG1 sing N N 569 VAL CB CG2 sing N N 570 VAL CB HB sing N N 571 VAL CG1 HG11 sing N N 572 VAL CG1 HG12 sing N N 573 VAL CG1 HG13 sing N N 574 VAL CG2 HG21 sing N N 575 VAL CG2 HG22 sing N N 576 VAL CG2 HG23 sing N N 577 VAL OXT HXT sing N N 578 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1KOG 'double helix' 1KOG 'a-form double helix' 1KOG 'hairpin loop' 1KOG 'bulge loop' 1KOG 'mismatched base pair' 1KOG 'internal loop' 1KOG 'triple helix' 1KOG 'quadruple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id 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