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'X-RAY DIFFRACTION' ? r_sphericity_bonded ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight 1 A 8025 0.21 0.50 'medium positional' 1 1 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 B 8025 0.23 0.50 'medium positional' 1 2 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 C 8025 0.21 0.50 'medium positional' 1 3 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 4 D 8025 0.16 0.50 'medium positional' 1 4 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 5 E 8025 0.18 0.50 'medium positional' 1 5 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 6 F 8025 0.18 0.50 'medium positional' 1 6 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 8025 0.57 2.00 'medium thermal' 1 7 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 B 8025 1.02 2.00 'medium thermal' 1 8 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 C 8025 0.84 2.00 'medium thermal' 1 9 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 4 D 8025 0.73 2.00 'medium thermal' 1 10 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 5 E 8025 0.79 2.00 'medium thermal' 1 11 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 6 F 8025 0.59 2.00 'medium thermal' 1 12 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 2.45 _refine_ls_shell.d_res_low 2.51 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 11439 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.2240 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.2690 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 618 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 0.802580 0.568040 -0.182190 0.568210 -0.820940 -0.056480 -0.181650 -0.058190 -0.981640 -18.96071 83.23276 71.33143 2 given ? -0.810350 -0.582380 0.064560 -0.582970 0.790240 -0.188830 0.058960 -0.190660 -0.979880 48.43149 23.77948 74.68426 3 given ? -0.992760 0.013230 0.119400 0.016230 -0.970030 0.242460 0.119030 0.242640 0.962790 19.97463 87.35296 -12.03426 4 given ? -0.266170 -0.953790 0.139380 0.961860 -0.272270 -0.026300 0.063040 0.127060 0.989890 44.89922 2.22933 63.91455 5 given ? -0.779600 0.625500 -0.031120 0.623650 0.770820 -0.129960 -0.057300 -0.120720 -0.991030 -19.70426 -40.81025 143.64339 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 A 1 2 B 1 3 C 1 4 D 1 5 E 1 6 F 1 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 A PRO 12 . J SO4 . . A PRO 12 A SO4 603 4 ? 1 2 1 B PRO 12 . N SO4 . . B PRO 12 B SO4 603 4 ? 1 3 1 C PRO 12 . R SO4 . . C PRO 12 C SO4 603 4 ? 1 4 1 D PRO 12 . V SO4 . . D PRO 12 D SO4 603 4 ? 1 5 1 E PRO 12 . Z SO4 . . E PRO 12 E SO4 603 4 ? 1 6 1 F PRO 12 . DA SO4 . . F PRO 12 F SO4 603 4 ? # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1UPC _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 1UPC _struct.title 'Carboxyethylarginine synthase from Streptomyces clavuligerus' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1UPC _struct_keywords.pdbx_keywords SYNTHASE _struct_keywords.text 'SYNTHASE, CLAVULANIC ACID, ANTIBIOTIC, LACTAMASE, FLAVOPROTEIN, THIAMINE PYROPHOSPHATE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 2 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 2 ? P N N 3 ? Q N N 4 ? R N N 4 ? S N N 2 ? T N N 3 ? U N N 4 ? V N N 4 ? W N N 2 ? X N N 3 ? Y N N 4 ? Z N N 4 ? AA N N 2 ? BA N N 3 ? CA N N 4 ? DA N N 4 ? EA N N 5 ? FA N N 5 ? GA N N 5 ? HA N N 5 ? IA N N 5 ? JA N N 5 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code Q9LCV9 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin ? _struct_ref.pdbx_db_accession Q9LCV9 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1UPC A 1 ? 573 ? Q9LCV9 1 ? 573 ? 1 573 2 1 1UPC B 1 ? 573 ? Q9LCV9 1 ? 573 ? 1 573 3 1 1UPC C 1 ? 573 ? Q9LCV9 1 ? 573 ? 1 573 4 1 1UPC D 1 ? 573 ? Q9LCV9 1 ? 573 ? 1 573 5 1 1UPC E 1 ? 573 ? Q9LCV9 1 ? 573 ? 1 573 6 1 1UPC F 1 ? 573 ? Q9LCV9 1 ? 573 ? 1 573 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PQS tetrameric 4 2 author_and_software_defined_assembly PQS tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,EA,FA,GA,HA 2 1,2 E,F,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,IA,JA # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,-y,z -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 THR A 13 ? 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PRO A 279 ALA A 286 1 ? 8 HELX_P HELX_P16 16 ASP A 297 ? ASP A 301 ? ASP A 297 ASP A 301 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 17 ARG A 303 ? GLN A 308 ? ARG A 303 GLN A 308 1 ? 6 HELX_P HELX_P18 18 ASP A 338 ? THR A 350 ? ASP A 338 THR A 350 1 ? 13 HELX_P HELX_P19 19 ILE A 361 ? ASP A 374 ? ILE A 361 ASP A 374 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 20 ARG A 383 ? ALA A 399 ? ARG A 383 ALA A 399 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 21 GLY A 411 ? ALA A 421 ? GLY A 411 ALA A 421 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 22 TYR A 440 ? ARG A 452 ? TYR A 440 ARG A 452 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 23 ASP A 463 ? ASN A 469 ? ASP A 463 ASN A 469 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 24 ASP A 472 ? ASN A 480 ? ASP A 472 ASN A 480 1 ? 9 HELX_P HELX_P25 25 ASN A 493 ? HIS A 505 ? ASN A 493 HIS A 505 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 26 HIS A 508 ? VAL A 512 ? HIS A 508 VAL A 512 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 27 ASP A 518 ? ASN A 526 ? ASP A 518 ASN A 526 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 28 ASN A 535 ? LEU A 549 ? ASN A 535 LEU A 549 1 ? 15 HELX_P HELX_P29 29 GLN A 564 ? PHE A 568 ? 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FC ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA 1 2 ? parallel AA 2 3 ? parallel AA 3 4 ? parallel AA 4 5 ? parallel AA 5 6 ? parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? parallel AC 2 3 ? parallel AC 3 4 ? parallel AC 4 5 ? parallel AC 5 6 ? parallel AD 1 2 ? parallel AD 2 3 ? parallel AD 3 4 ? parallel AD 4 5 ? parallel AD 5 6 ? parallel BA 1 2 ? parallel BA 2 3 ? parallel BA 3 4 ? parallel BA 4 5 ? parallel BA 5 6 ? parallel BB 1 2 ? anti-parallel BC 1 2 ? parallel BC 2 3 ? parallel BC 3 4 ? parallel BC 4 5 ? parallel BC 5 6 ? parallel BD 1 2 ? parallel BD 2 3 ? parallel BD 3 4 ? parallel BD 4 5 ? parallel BD 5 6 ? parallel CA 1 2 ? parallel CA 2 3 ? parallel CA 3 4 ? parallel CA 4 5 ? parallel CA 5 6 ? parallel CB 1 2 ? parallel CB 2 3 ? parallel CB 3 4 ? parallel CB 4 5 ? parallel CB 5 6 ? parallel CC 1 2 ? parallel CC 2 3 ? parallel CC 3 4 ? parallel CC 4 5 ? parallel CC 5 6 ? parallel DA 1 2 ? parallel DA 2 3 ? parallel DA 3 4 ? parallel DA 4 5 ? parallel DA 5 6 ? parallel DB 1 2 ? parallel DB 2 3 ? parallel DB 3 4 ? parallel DB 4 5 ? parallel DB 5 6 ? parallel DC 1 2 ? parallel DC 2 3 ? parallel DC 3 4 ? parallel DC 4 5 ? parallel DC 5 6 ? parallel EA 1 2 ? parallel EA 2 3 ? parallel EA 3 4 ? parallel EA 4 5 ? parallel EA 5 6 ? parallel EB 1 2 ? parallel EB 2 3 ? parallel EB 3 4 ? parallel EB 4 5 ? parallel EB 5 6 ? parallel EC 1 2 ? parallel EC 2 3 ? parallel EC 3 4 ? parallel EC 4 5 ? parallel EC 5 6 ? parallel FA 1 2 ? parallel FA 2 3 ? parallel FA 3 4 ? parallel FA 4 5 ? parallel FA 5 6 ? parallel FB 1 2 ? parallel FB 2 3 ? parallel FB 3 4 ? parallel FB 4 5 ? parallel FB 5 6 ? parallel FC 1 2 ? parallel FC 2 3 ? parallel FC 3 4 ? parallel FC 4 5 ? parallel FC 5 6 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA 1 ASP A 50 ? 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