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_refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean 23.9 _refine.aniso_B[1][1] 1.28 _refine.aniso_B[2][2] -0.73 _refine.aniso_B[3][3] -0.56 _refine.aniso_B[1][2] 0.00 _refine.aniso_B[1][3] 0.00 _refine.aniso_B[2][3] 0.00 _refine.solvent_model_details 'FLAT MODEL' _refine.solvent_model_param_ksol 0.387787 _refine.solvent_model_param_bsol 49.3125 _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model 1zmt _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model RESTRAINED _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'Engh & Huber' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? 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? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg 1.4 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d 23.5 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d 0.90 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcbond_it 1.11 1.50 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcangle_it 1.59 2.00 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scbond_it 1.98 2.00 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scangle_it 2.78 2.50 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 6 _refine_ls_shell.d_res_high 1.90 _refine_ls_shell.d_res_low 2.02 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 59507 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.233 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 95.0 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.266 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error 0.005 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free 5.1 _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 3173 _refine_ls_shell.number_reflns_obs 37204 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _pdbx_xplor_file.serial_no _pdbx_xplor_file.param_file _pdbx_xplor_file.topol_file _pdbx_xplor_file.pdbx_refine_id 1 &_1_PARAMETER_INFILE_1 protein.top 'X-RAY DIFFRACTION' 2 pnso.par dna-rna.top 'X-RAY DIFFRACTION' 3 water_rep.param water.top 'X-RAY DIFFRACTION' 4 ion.param ion.top 'X-RAY DIFFRACTION' 5 protein_rep.param ? 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 1ZO8 _struct.title ;X-ray Structure of the haloalcohol dehalogenase HheC of Agrobacterium radiobacter AD1 in complex with (S)-para-nitrostyrene oxide, with a water molecule in the halide-binding site ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1ZO8 _struct_keywords.pdbx_keywords LYASE _struct_keywords.text 'haloalcohol dehalogenase, halohydrin dehalogenase, enantioselectivity, short-chain dehydrogenase/reductase, Lyase' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 1 ? N N N 1 ? O N N 1 ? P N N 1 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 2 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 2 ? X N N 2 ? Y N N 2 ? Z N N 2 ? AA N N 2 ? BA N N 2 ? CA N N 2 ? DA N N 2 ? EA N N 2 ? FA N N 2 ? GA N N 3 ? HA N N 3 ? IA N N 3 ? JA N N 3 ? KA N N 3 ? LA N N 3 ? MA N N 3 ? NA N N 3 ? OA N N 3 ? PA N N 3 ? QA N N 3 ? RA N N 3 ? SA N N 3 ? TA N N 3 ? UA N N 3 ? VA N N 3 ? # loop_ _struct_biol.id _struct_biol.details _struct_biol.pdbx_parent_biol_id 1 ;There are three biologically relevant tetramers in the asymmetric unit, plus two dimers that form the relevant tetramers via the transformations 1_555, 2_655 and 1_555, 2_755 ; ? 2 ? ? 3 ? ? 4 ? ? 5 ? ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 13 ? ALA A 24 ? GLY A 13 ALA A 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 2 ASP A 32 ? LYS A 36 ? ASP A 32 LYS A 36 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 GLN A 37 ? TYR A 48 ? GLN A 37 TYR A 48 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 4 GLU A 58 ? GLY A 71 ? GLU A 58 GLY A 71 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 5 PRO A 88 ? TYR A 92 ? PRO A 88 TYR A 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 6 ALA A 93 ? GLN A 105 ? ALA A 93 GLN A 105 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 7 GLN A 105 ? LYS A 123 ? GLN A 105 LYS A 123 1 ? 19 HELX_P HELX_P8 8 LEU A 142 ? GLY A 164 ? LEU A 142 GLY A 164 1 ? 23 HELX_P HELX_P9 9 GLU A 165 ? ASN A 167 ? GLU A 165 ASN A 167 5 ? 3 HELX_P HELX_P10 10 PRO A 188 ? LYS A 193 ? PRO A 188 LYS A 193 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 11 ASN A 195 ? THR A 206 ? ASN A 195 THR A 206 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 12 THR A 213 ? SER A 226 ? THR A 213 SER A 226 1 ? 14 HELX_P HELX_P13 13 CYS A 229 ? THR A 233 ? CYS A 229 THR A 233 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 14 GLY B 13 ? ALA B 24 ? GLY B 13 ALA B 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 15 ASP B 32 ? LYS B 36 ? ASP B 32 LYS B 36 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 GLN B 37 ? TYR B 48 ? GLN B 37 TYR B 48 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 17 GLU B 58 ? GLY B 71 ? GLU B 58 GLY B 71 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 18 PRO B 88 ? TYR B 92 ? PRO B 88 TYR B 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 ALA B 93 ? GLN B 105 ? ALA B 93 GLN B 105 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 20 GLN B 105 ? LYS B 123 ? GLN B 105 LYS B 123 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 21 LEU B 142 ? GLY B 164 ? LEU B 142 GLY B 164 1 ? 23 HELX_P HELX_P22 22 GLU B 165 ? ASN B 167 ? GLU B 165 ASN B 167 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 23 THR B 189 ? LYS B 193 ? THR B 189 LYS B 193 1 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 ASN B 195 ? THR B 206 ? ASN B 195 THR B 206 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 25 THR B 213 ? GLY B 227 ? THR B 213 GLY B 227 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 26 CYS B 229 ? THR B 233 ? CYS B 229 THR B 233 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 27 GLY C 13 ? ALA C 24 ? GLY C 13 ALA C 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 28 ASP C 32 ? LYS C 36 ? ASP C 32 LYS C 36 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 29 GLN C 37 ? TYR C 48 ? GLN C 37 TYR C 48 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 30 GLU C 58 ? GLY C 71 ? GLU C 58 GLY C 71 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 31 PRO C 88 ? TYR C 92 ? PRO C 88 TYR C 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 32 ALA C 93 ? GLN C 105 ? ALA C 93 GLN C 105 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 33 GLN C 105 ? LYS C 123 ? GLN C 105 LYS C 123 1 ? 19 HELX_P HELX_P34 34 ALA C 133 ? GLY C 137 ? ALA C 133 GLY C 137 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 35 LEU C 142 ? GLY C 164 ? LEU C 142 GLY C 164 1 ? 23 HELX_P HELX_P36 36 GLU C 165 ? ASN C 167 ? GLU C 165 ASN C 167 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 37 PRO C 188 ? LYS C 193 ? PRO C 188 LYS C 193 1 ? 6 HELX_P HELX_P38 38 ASN C 195 ? THR C 206 ? ASN C 195 THR C 206 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 39 THR C 213 ? SER C 226 ? THR C 213 SER C 226 1 ? 14 HELX_P HELX_P40 40 CYS C 229 ? THR C 233 ? CYS C 229 THR C 233 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 41 GLY D 13 ? ALA D 24 ? GLY D 13 ALA D 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 42 ASP D 32 ? LYS D 36 ? ASP D 32 LYS D 36 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 43 GLN D 37 ? TYR D 48 ? GLN D 37 TYR D 48 1 ? 12 HELX_P HELX_P44 44 GLU D 58 ? GLY D 71 ? GLU D 58 GLY D 71 1 ? 14 HELX_P HELX_P45 45 PRO D 88 ? TYR D 92 ? PRO D 88 TYR D 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 46 ALA D 93 ? GLN D 105 ? ALA D 93 GLN D 105 1 ? 13 HELX_P HELX_P47 47 GLN D 105 ? LYS D 123 ? GLN D 105 LYS D 123 1 ? 19 HELX_P HELX_P48 48 ALA D 133 ? GLY D 137 ? ALA D 133 GLY D 137 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 49 LEU D 142 ? GLY D 164 ? LEU D 142 GLY D 164 1 ? 23 HELX_P HELX_P50 50 GLU D 165 ? ASN D 167 ? GLU D 165 ASN D 167 5 ? 3 HELX_P HELX_P51 51 PRO D 188 ? LYS D 193 ? PRO D 188 LYS D 193 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 52 ASN D 195 ? THR D 206 ? ASN D 195 THR D 206 1 ? 12 HELX_P HELX_P53 53 THR D 213 ? SER D 226 ? THR D 213 SER D 226 1 ? 14 HELX_P HELX_P54 54 CYS D 229 ? THR D 233 ? CYS D 229 THR D 233 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 55 GLY E 13 ? ALA E 24 ? GLY E 13 ALA E 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P56 56 ASP E 32 ? LYS E 36 ? ASP E 32 LYS E 36 5 ? 5 HELX_P HELX_P57 57 GLN E 37 ? TYR E 48 ? GLN E 37 TYR E 48 1 ? 12 HELX_P HELX_P58 58 GLU E 58 ? GLY E 71 ? GLU E 58 GLY E 71 1 ? 14 HELX_P HELX_P59 59 PRO E 88 ? TYR E 92 ? PRO E 88 TYR E 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 60 ALA E 93 ? GLN E 105 ? ALA E 93 GLN E 105 1 ? 13 HELX_P HELX_P61 61 GLN E 105 ? LYS E 123 ? GLN E 105 LYS E 123 1 ? 19 HELX_P HELX_P62 62 LEU E 142 ? GLY E 164 ? LEU E 142 GLY E 164 1 ? 23 HELX_P HELX_P63 63 GLU E 165 ? ASN E 167 ? GLU E 165 ASN E 167 5 ? 3 HELX_P HELX_P64 64 THR E 189 ? LYS E 193 ? THR E 189 LYS E 193 1 ? 5 HELX_P HELX_P65 65 ASN E 195 ? THR E 206 ? ASN E 195 THR E 206 1 ? 12 HELX_P HELX_P66 66 THR E 213 ? GLY E 227 ? THR E 213 GLY E 227 1 ? 15 HELX_P HELX_P67 67 CYS E 229 ? THR E 233 ? CYS E 229 THR E 233 5 ? 5 HELX_P HELX_P68 68 GLY F 13 ? ALA F 24 ? GLY F 13 ALA F 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P69 69 ASP F 32 ? LYS F 36 ? ASP F 32 LYS F 36 5 ? 5 HELX_P HELX_P70 70 GLN F 37 ? TYR F 48 ? GLN F 37 TYR F 48 1 ? 12 HELX_P HELX_P71 71 GLU F 58 ? GLY F 71 ? GLU F 58 GLY F 71 1 ? 14 HELX_P HELX_P72 72 PRO F 88 ? TYR F 92 ? PRO F 88 TYR F 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P73 73 ALA F 93 ? GLN F 105 ? 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