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U . n U 2 97 ALA 97 97 ? ? ? U . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 21-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 21 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 62390 ? 1 MORE -390.12 ? 1 'SSA (A^2)' 321960 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2006-01-25 2 'Structure model' 1 1 2011-05-08 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2017-08-23 5 'Structure model' 1 4 2019-10-02 6 'Structure model' 1 5 2019-10-23 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 5 'Structure model' 'Data collection' 5 5 'Structure model' Other 6 6 'Structure model' 'Data collection' 7 6 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' em_software 2 5 'Structure model' atom_sites 3 5 'Structure model' cell 4 6 'Structure model' cell # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_em_software.fitting_id' 2 4 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 3 5 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]' 4 5 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]' 5 5 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]' 6 5 'Structure model' '_cell.length_a' 7 5 'Structure model' '_cell.length_b' 8 5 'Structure model' '_cell.length_c' 9 6 'Structure model' '_cell.Z_PDB' # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED. ; # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 2C7C _em_3d_fitting.ref_protocol OTHER _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details 'METHOD--RECIPROCAL SPACE FITTING IN URO' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 2C7C _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.num_particles 16281 _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'PROJECTION MATCHING-BASED ANGULAR REFINEMENT OF MSA GENERATED CLASSES. ITERATIVE ALGEBRAIC RECONSTRUCTION IN SPIDER.' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 1.4 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.resolution 7.7 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ;RECIPROCAL SPACE FITTING OF SEVEN INDEPENDENT RIGID BODIES WITH URO. FITTED ENTITIES WERE GROEL EQUATORIAL (RESIDUES 3-136 AND 410-524), INTERMEDIATE (RESIDUES 137-192 AND 374-409) AND APICAL (RESIDUES 192-373) DOMAINS, PLUS A GROES SUBUNIT. THE MAP INTO WHICH THESE COORDINATES WERE FITTED IS AVAILABLE AT THE EMD (EMD-1180) ; _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details '12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name GROEL-ATP7-GROES _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 2C7C _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 189 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 2C7C _em_imaging.id 1 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature 100 _em_imaging.microscope_model 'FEI TECNAI F20' _em_imaging.nominal_defocus_min 1100 _em_imaging.nominal_defocus_max 3200 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.0 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_magnification 50000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 2C7C _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details 'LIQUID ETHANE' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 2C7C _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 2C7C _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C7 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ARG A 36 ? ? -93.95 -155.11 2 1 ASN A 153 ? ? 74.05 42.43 3 1 SER A 154 ? ? 80.02 18.32 4 1 ARG A 197 ? ? 128.00 131.81 5 1 TYR A 203 ? ? -69.13 13.91 6 1 ILE A 205 ? ? -59.08 99.00 7 1 SER A 217 ? ? -28.90 91.16 8 1 LYS A 225 ? ? 176.70 162.34 9 1 VAL A 271 ? ? -170.35 140.52 10 1 GLU A 310 ? ? -52.13 -9.48 11 1 ASN A 326 ? ? -112.90 -159.76 12 1 ASP A 334 ? ? 62.23 65.54 13 1 GLU A 355 ? ? -145.24 27.66 14 1 SER A 358 ? ? -176.36 -176.95 15 1 ALA A 373 ? ? -147.48 -46.41 16 1 GLU A 409 ? ? -152.92 -25.11 17 1 PRO A 525 ? ? -56.64 105.71 18 1 ALA B 12 ? ? -65.43 -72.15 19 1 VAL B 29 ? ? -69.99 0.15 20 1 PRO B 47 ? ? -47.56 160.76 21 1 ASP B 87 ? ? -128.11 -144.01 22 1 ASN B 153 ? ? 79.85 82.70 23 1 SER B 154 ? ? 76.35 -4.22 24 1 TYR B 203 ? ? -69.73 0.33 25 1 ILE B 205 ? ? -66.38 91.37 26 1 LYS B 207 ? ? -116.43 78.31 27 1 THR B 210 ? ? -141.99 -33.67 28 1 SER B 217 ? ? 39.65 48.31 29 1 SER B 228 ? ? -148.58 -37.78 30 1 GLU B 255 ? ? -125.79 -164.26 31 1 PHE B 281 ? ? 179.21 158.49 32 1 ASN B 326 ? ? -123.59 -164.39 33 1 ASP B 334 ? ? 65.06 81.76 34 1 GLU B 338 ? ? -53.60 103.68 35 1 GLU B 355 ? ? -140.35 23.57 36 1 LEU B 372 ? ? -135.87 -34.19 37 1 ALA B 373 ? ? -87.26 -127.27 38 1 ASN C 10 ? ? -56.32 -73.67 39 1 ALA C 12 ? ? -60.34 -71.28 40 1 ARG C 36 ? ? -92.75 -157.94 41 1 ASP C 87 ? ? -115.09 -169.43 42 1 SER C 139 ? ? -175.63 20.77 43 1 ASN C 153 ? ? 77.79 55.86 44 1 THR C 181 ? ? -142.23 -9.71 45 1 ILE C 205 ? ? -68.92 85.28 46 1 SER C 228 ? ? -151.52 -39.49 47 1 GLU C 255 ? ? -135.46 -148.68 48 1 ASN C 326 ? ? -115.24 -166.76 49 1 GLU C 363 ? ? -57.46 -72.91 50 1 LYS C 364 ? ? -68.97 2.93 51 1 ALA C 373 ? ? -163.69 -33.33 52 1 GLU C 483 ? ? 97.75 45.41 53 1 GLU D 61 ? ? -170.16 130.39 54 1 ASP D 64 ? ? -68.61 98.14 55 1 SER D 139 ? ? -164.55 -35.61 56 1 ASN D 153 ? ? 80.21 47.02 57 1 SER D 154 ? ? 79.20 39.99 58 1 THR D 181 ? ? -91.21 47.72 59 1 ASP D 196 ? ? -84.99 39.09 60 1 ILE D 205 ? ? -67.68 85.78 61 1 LYS D 207 ? ? -119.81 79.68 62 1 ASP D 224 ? ? -84.02 33.48 63 1 GLU D 255 ? ? -158.32 -159.94 64 1 ASP D 334 ? ? 53.07 71.53 65 1 VAL D 336 ? ? -88.00 47.39 66 1 ALA D 373 ? ? -103.09 -108.72 67 1 GLU D 460 ? ? -85.42 -159.36 68 1 GLU D 483 ? ? 84.84 50.34 69 1 ARG E 36 ? ? -113.15 -153.61 70 1 ASP E 83 ? ? -74.35 24.13 71 1 ALA E 84 ? ? -158.67 -38.16 72 1 ASN E 153 ? ? 87.12 34.92 73 1 SER E 154 ? ? 96.42 17.33 74 1 ASP E 196 ? ? -91.78 41.65 75 1 ILE E 205 ? ? -68.05 91.00 76 1 SER E 217 ? ? -17.13 83.09 77 1 MET E 233 ? ? -142.66 -43.89 78 1 GLU E 310 ? ? -54.83 3.69 79 1 LYS E 311 ? ? -156.36 9.67 80 1 LEU E 314 ? ? -67.03 0.05 81 1 ASP E 334 ? ? 68.56 132.79 82 1 GLU E 355 ? ? -147.12 20.92 83 1 THR E 357 ? ? -69.84 14.75 84 1 SER E 358 ? ? 179.09 172.13 85 1 LYS E 364 ? ? -68.52 5.25 86 1 GLU E 483 ? ? 86.36 18.15 87 1 GLU F 63 ? ? -75.12 20.02 88 1 GLU F 76 ? ? -63.06 -70.24 89 1 ALA F 85 ? ? -146.23 -2.77 90 1 ASN F 153 ? ? 81.15 53.57 91 1 ASP F 155 ? ? -69.29 90.06 92 1 ASP F 179 ? ? -54.31 89.83 93 1 ASP F 196 ? ? -79.50 35.03 94 1 THR F 210 ? ? -148.57 -15.09 95 1 ASP F 224 ? ? -90.10 42.93 96 1 SER F 228 ? ? -146.47 -42.33 97 1 MET F 307 ? ? -69.78 97.23 98 1 GLU F 308 ? ? -66.63 92.64 99 1 GLU F 310 ? ? -59.11 -4.79 100 1 ASP F 334 ? ? 48.42 72.23 101 1 VAL F 336 ? ? -67.32 -88.02 102 1 GLU F 355 ? ? -140.12 -13.52 103 1 LYS F 364 ? ? -69.30 9.78 104 1 ALA F 373 ? ? -146.35 -14.68 105 1 GLU F 483 ? ? 83.70 28.62 106 1 ARG G 36 ? ? -94.59 -151.05 107 1 ALA G 85 ? ? -153.73 1.57 108 1 SER G 135 ? ? -69.17 68.56 109 1 ASN G 153 ? ? 77.96 44.73 110 1 SER G 154 ? ? 82.11 26.92 111 1 ASP G 196 ? ? -73.32 43.48 112 1 ILE G 205 ? ? -68.48 84.51 113 1 SER G 217 ? ? 0.04 77.10 114 1 LYS G 225 ? ? 172.63 157.88 115 1 LYS G 272 ? ? -68.23 97.26 116 1 ASN G 326 ? ? -106.04 -162.85 117 1 ASP G 334 ? ? 52.83 78.07 118 1 GLU G 367 ? ? -37.64 -31.71 119 1 ALA G 373 ? ? -87.31 -122.54 120 1 THR G 482 ? ? -137.31 -38.16 121 1 GLU G 483 ? ? 94.52 33.14 122 1 LYS H 42 ? ? -165.35 108.90 123 1 ALA H 85 ? ? -143.86 -24.00 124 1 ASP H 87 ? ? -171.76 -170.30 125 1 SER H 135 ? ? -59.47 104.61 126 1 SER H 139 ? ? -168.21 -51.78 127 1 ASN H 153 ? ? 74.65 -0.23 128 1 SER H 154 ? ? 115.10 2.93 129 1 THR H 176 ? ? -141.33 -140.96 130 1 LEU H 183 ? ? -80.23 48.75 131 1 ASP H 196 ? 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