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GLN A 307 GLY A 311 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 SER A 307 ? GLU A 320 ? SER A 320 GLU A 333 1 ? 14 HELX_P HELX_P17 17 GLU A 324 ? ALA A 339 ? GLU A 337 ALA A 352 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 18 HIS A 340 ? CYS A 342 ? HIS A 353 CYS A 355 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 19 ASP B 40 ? GLU B 53 ? ASP B 53 GLU B 66 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 20 VAL B 64 ? GLU B 67 ? VAL B 77 GLU B 80 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 21 GLY B 68 ? GLY B 76 ? GLY B 81 GLY B 89 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 22 LYS B 103 ? GLN B 119 ? LYS B 116 GLN B 132 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 23 PRO B 136 ? GLU B 150 ? PRO B 149 GLU B 163 1 ? 15 HELX_P HELX_P24 24 ALA B 162 ? GLY B 177 ? ALA B 175 GLY B 190 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 25 ARG B 193 ? THR B 197 ? ARG B 206 THR B 210 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 GLU B 198 ? GLY B 207 ? GLU B 211 GLY B 220 1 ? 10 HELX_P HELX_P27 27 LEU B 216 ? GLY B 223 ? LEU B 229 GLY B 236 5 ? 8 HELX_P HELX_P28 28 LYS B 226 ? ASP B 231 ? LYS B 239 ASP B 244 5 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 TRP B 244 ? TRP B 253 ? 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HA 4 HOH 1 2001 2001 HOH HOH K . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PQS dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PQS dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PQS dimeric 2 4 author_and_software_defined_assembly PQS dimeric 2 5 author_and_software_defined_assembly PQS dimeric 2 6 author_and_software_defined_assembly PQS dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,L,M,N,AA,BA 2 1 C,D,O,P,Q,CA 3 1 E,F,R,S,T,DA,EA 4 1 G,H,U,V,W,FA,GA 5 1 I,J,X,Y 6 1,2 K,Z,HA # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 5_555 x-y,-y,-z+1/3 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 163.4990000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2006-05-12 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 3 'Structure model' 1 2 2013-12-04 4 'Structure model' 1 3 2018-01-24 5 'Structure model' 1 4 2019-05-08 6 'Structure model' 1 5 2023-12-13 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' Advisory 2 2 'Structure model' 'Version format compliance' 3 3 'Structure model' 'Database references' 4 3 'Structure model' 'Derived calculations' 5 3 'Structure model' Other 6 3 'Structure model' 'Source and taxonomy' 7 4 'Structure model' 'Database references' 8 5 'Structure model' 'Data collection' 9 5 'Structure model' 'Experimental preparation' 10 6 'Structure model' 'Data collection' 11 6 'Structure model' 'Database references' 12 6 'Structure model' 'Derived calculations' 13 6 'Structure model' Other 14 6 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' citation_author 2 5 'Structure model' exptl_crystal_grow 3 6 'Structure model' chem_comp_atom 4 6 'Structure model' chem_comp_bond 5 6 'Structure model' database_2 6 6 'Structure model' pdbx_database_status 7 6 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model 8 6 'Structure model' struct_conn 9 6 'Structure model' struct_site # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_citation_author.name' 2 5 'Structure model' '_exptl_crystal_grow.method' 3 6 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 4 6 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 5 6 'Structure model' '_pdbx_database_status.status_code_sf' 6 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 7 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 8 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 9 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 10 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 11 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 12 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 13 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 14 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 15 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_atom_id' 16 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 17 6 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_seq_id' 18 6 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 19 6 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 20 6 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id' # loop_ _pdbx_refine_tls.pdbx_refine_id _pdbx_refine_tls.id _pdbx_refine_tls.details _pdbx_refine_tls.method _pdbx_refine_tls.origin_x _pdbx_refine_tls.origin_y _pdbx_refine_tls.origin_z _pdbx_refine_tls.T[1][1] _pdbx_refine_tls.T[2][2] _pdbx_refine_tls.T[3][3] _pdbx_refine_tls.T[1][2] _pdbx_refine_tls.T[1][3] _pdbx_refine_tls.T[2][3] _pdbx_refine_tls.L[1][1] _pdbx_refine_tls.L[2][2] _pdbx_refine_tls.L[3][3] _pdbx_refine_tls.L[1][2] _pdbx_refine_tls.L[1][3] _pdbx_refine_tls.L[2][3] _pdbx_refine_tls.S[1][1] _pdbx_refine_tls.S[1][2] _pdbx_refine_tls.S[1][3] _pdbx_refine_tls.S[2][1] _pdbx_refine_tls.S[2][2] _pdbx_refine_tls.S[2][3] _pdbx_refine_tls.S[3][1] _pdbx_refine_tls.S[3][2] _pdbx_refine_tls.S[3][3] 'X-RAY DIFFRACTION' 1 ? refined -10.9763 25.3426 57.9276 -0.2567 -0.4228 -0.3698 0.1895 0.1623 0.0927 2.4098 2.7948 5.7681 0.4961 0.1586 0.5625 -0.4065 0.1865 -0.1912 0.0698 0.0278 -0.1690 0.8424 0.9820 0.3787 'X-RAY DIFFRACTION' 2 ? refined -46.8953 32.3069 49.0870 -0.3814 0.0083 -0.2916 -0.1230 0.2221 -0.2253 2.0748 3.7949 4.9780 0.0012 0.4678 -0.9005 -0.0962 -0.0921 0.0636 0.3535 -0.2393 0.4314 0.2123 -1.5582 0.3355 'X-RAY DIFFRACTION' 3 ? refined -86.2911 -21.4996 42.2693 -0.4119 -0.0461 -0.3702 0.1334 -0.0794 -0.1822 3.8062 1.6831 5.1092 0.2778 0.8931 -0.3010 0.0970 0.3532 -0.3435 -0.0251 0.0233 -0.1291 1.1409 0.2367 -0.1204 'X-RAY DIFFRACTION' 4 ? refined -93.1117 13.2717 29.3346 -0.3812 -0.0450 -0.3721 0.0896 -0.0281 -0.1668 3.3309 1.5325 4.7581 0.2876 -0.5919 -0.7727 -0.0809 -0.2971 0.2452 0.1673 0.0695 -0.0530 -1.2201 -0.0739 0.0115 'X-RAY DIFFRACTION' 5 ? refined -45.4043 32.7112 13.2515 -0.3907 -0.0687 -0.3183 -0.0248 -0.0225 -0.1955 2.3881 4.4440 3.4351 0.0495 -0.2424 -0.4884 -0.0586 0.0660 0.0504 -0.5354 -0.1486 0.3818 0.1415 -0.9975 0.2072 'X-RAY DIFFRACTION' 6 ? refined -8.5745 36.2333 6.4823 -0.3662 -0.4264 -0.3656 0.1113 0.0692 0.0218 2.3141 3.3447 4.3015 -0.7183 -0.5747 0.5501 0.0280 -0.1176 0.1551 -0.0422 -0.1437 -0.2177 -0.1285 0.6038 0.1156 'X-RAY DIFFRACTION' 7 ? refined -9.5358 -27.2850 69.8438 -0.1887 -0.3158 -0.3628 -0.4771 -0.0958 0.1664 2.9842 3.0094 5.2664 -0.8769 -0.8871 0.6342 -0.2813 0.3706 0.0329 -0.1149 0.0287 0.0377 -0.3184 0.7216 0.2527 'X-RAY DIFFRACTION' 8 ? refined -40.1660 -46.1268 59.7311 -0.0884 0.1804 -0.0003 -0.6163 0.0662 -0.2266 3.2072 3.7204 3.2741 -1.0355 -0.1033 -0.1621 -0.3547 0.5095 -0.3805 0.0046 -0.0989 0.5837 0.5848 -1.0865 0.4537 'X-RAY DIFFRACTION' 9 ? refined -37.2228 -45.3988 24.0080 0.3432 0.7028 0.0545 -0.7189 -0.0865 -0.4931 3.5523 3.2026 3.3633 -1.4197 -0.5523 0.0168 -0.0330 0.8239 -0.5677 -0.3885 -0.2997 0.4804 0.6658 -0.9898 0.3326 'X-RAY DIFFRACTION' 10 ? refined -12.8006 -17.3796 17.5214 0.3891 0.3949 0.1169 -0.5135 0.1211 -0.3197 3.7730 2.9327 2.5464 -1.0580 -0.8324 -0.3721 0.3083 -0.1669 0.5256 -0.2603 -0.1533 -0.2527 -0.2397 0.1379 -0.1550 'X-RAY DIFFRACTION' 11 ? refined -86.2956 18.9123 85.3833 -0.3746 -0.3654 -0.4279 -0.0518 0.1817 0.0104 3.7524 2.0018 5.2574 0.1636 -0.6106 0.5162 0.2120 -0.0568 0.2335 -0.2391 0.0705 -0.2236 -1.0059 0.3437 -0.2825 # loop_ _pdbx_refine_tls_group.pdbx_refine_id _pdbx_refine_tls_group.id _pdbx_refine_tls_group.refine_tls_id _pdbx_refine_tls_group.beg_auth_asym_id _pdbx_refine_tls_group.beg_auth_seq_id _pdbx_refine_tls_group.beg_label_asym_id _pdbx_refine_tls_group.beg_label_seq_id _pdbx_refine_tls_group.end_auth_asym_id _pdbx_refine_tls_group.end_auth_seq_id _pdbx_refine_tls_group.end_label_asym_id _pdbx_refine_tls_group.end_label_seq_id _pdbx_refine_tls_group.selection _pdbx_refine_tls_group.selection_details 'X-RAY DIFFRACTION' 1 1 A 38 ? ? A 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 2 2 B 38 ? ? B 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 3 3 C 38 ? ? C 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 4 4 D 38 ? ? D 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 5 5 E 38 ? ? E 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 6 6 F 38 ? ? F 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 7 7 G 38 ? ? G 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 8 8 H 38 ? ? H 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 9 9 I 38 ? ? I 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 10 10 J 38 ? ? J 360 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 11 11 K 38 ? ? K 360 ? ? ? ? # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal REFMAC refinement 5.2.0019 ? 1 XDS 'data reduction' . ? 2 XSCALE 'data scaling' . ? 3 PHASER phasing . ? 4 # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 9-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 10-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. ; # _pdbx_entry_details.entry_id 2CLP _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;DISCREPANCIES FOUND IN THE SEQUENCE ARE DUE TO KNOWN DIFFERENCES BETWEEN VARIANTS. THE SEQUENCE USED FOR DESIGNING OUR CONSTRUCT CORRESPONDS TO THE SEQUENCE FOUND IN: GI|19343680 OR BC025709. IN UNIPROT THIS VARIANT IS REFERRED BY THE FTID=VAR_017417 ; _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 NZ I LYS 237 ? ? O1X I NDP 1361 ? ? 2.01 2 1 OG B SER 319 ? ? O1X B NDP 1361 ? ? 2.02 3 1 OD2 A ASP 137 ? ? O A HOH 2001 ? ? 2.15 4 1 OG E SER 319 ? ? O1X E NDP 1361 ? ? 2.17 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CB F HIS 269 ? ? 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