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UNP Q9LCZ4 GLY 399 'engineered mutation' 399 4 5 2DHR LEU E 274 ? UNP Q9LCZ4 GLY 399 'engineered mutation' 399 5 6 2DHR LEU F 274 ? UNP Q9LCZ4 GLY 399 'engineered mutation' 399 6 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 2DHR _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.24 _exptl_crystal.density_percent_sol 62.01 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 293 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.2 _exptl_crystal_grow.pdbx_details '0.1M Tris-HCl, 1% PEG8K, 0.2mM Zn acetate, 2.5mM ADP, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 315' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2005-05-20 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator Si _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.00000 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SPRING-8 BEAMLINE BL41XU' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SPring-8 _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline BL41XU _diffrn_source.pdbx_wavelength ? 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ASP B 327 HIS B 338 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 31 LEU B 225 ? THR B 232 ? LEU B 350 THR B 357 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 32 GLY B 237 ? ALA B 252 ? GLY B 362 ALA B 377 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 33 GLU B 265 ? VAL B 271 ? GLU B 390 VAL B 396 1 ? 7 HELX_P HELX_P34 34 LEU B 274 ? LYS B 278 ? LEU B 399 LYS B 403 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 35 ARG B 285 ? ALA B 301 ? ARG B 410 ALA B 426 1 ? 17 HELX_P HELX_P36 36 ARG B 318 ? PHE B 324 ? ARG B 443 PHE B 449 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 37 MET B 325 ? GLU B 330 ? MET B 450 GLU B 455 1 ? 6 HELX_P HELX_P38 38 SER B 336 ? ILE B 344 ? SER B 461 ILE B 469 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 39 ILE B 344 ? PHE B 358 ? ILE B 469 PHE B 483 1 ? 15 HELX_P HELX_P40 40 GLU B 366 ? GLU B 382 ? GLU B 491 GLU B 507 1 ? 17 HELX_P HELX_P41 41 SER B 411 ? GLU B 439 ? SER B 536 GLU B 564 1 ? 29 HELX_P HELX_P42 42 LYS B 440 ? GLU B 455 ? LYS B 565 GLU B 580 1 ? 16 HELX_P HELX_P43 43 ALA B 459 ? GLU B 467 ? ALA B 584 GLU B 592 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 44 ALA C 36 ? ASN C 52 ? ALA C 161 ASN C 177 1 ? 17 HELX_P HELX_P45 45 PRO C 53 ? PHE C 56 ? PRO C 178 PHE C 181 5 ? 4 HELX_P HELX_P46 46 GLY C 76 ? ALA C 88 ? GLY C 201 ALA C 213 1 ? 13 HELX_P HELX_P47 47 SER C 98 ? VAL C 101 ? SER C 223 VAL C 226 5 ? 4 HELX_P HELX_P48 48 GLY C 106 ? GLU C 117 ? GLY C 231 GLU C 242 1 ? 12 HELX_P HELX_P49 49 GLU C 131 ? VAL C 135 ? GLU C 256 VAL C 260 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 50 ASN C 147 ? MET C 161 ? ASN C 272 MET C 286 1 ? 15 HELX_P HELX_P51 51 ASP C 162 ? PHE C 164 ? ASP C 287 PHE C 289 5 ? 3 HELX_P HELX_P52 52 ARG C 178 ? LEU C 182 ? ARG C 303 LEU C 307 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 53 ASP C 202 ? HIS C 213 ? ASP C 327 HIS C 338 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 54 LEU C 225 ? LYS C 230 ? LEU C 350 LYS C 355 1 ? 6 HELX_P HELX_P55 55 VAL C 236 ? GLY C 255 ? VAL C 361 GLY C 380 1 ? 20 HELX_P HELX_P56 56 MET C 261 ? MET C 272 ? MET C 386 MET C 397 1 ? 12 HELX_P HELX_P57 57 ARG C 285 ? HIS C 302 ? ARG C 410 HIS C 427 1 ? 18 HELX_P HELX_P58 58 MET C 325 ? GLU C 330 ? 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-74.37 28.93 114 1 LYS B 383 ? ? 164.54 112.96 115 1 THR B 385 ? ? -114.35 -169.14 116 1 LYS B 387 ? ? -60.26 4.42 117 1 ALA B 393 ? ? -84.41 -74.42 118 1 ASP B 394 ? ? -48.63 -14.16 119 1 VAL B 396 ? ? -98.41 56.49 120 1 MET B 397 ? ? -149.88 -27.45 121 1 PRO B 409 ? ? -44.77 -4.74 122 1 ALA B 425 ? ? -17.95 -64.05 123 1 PHE B 428 ? ? -152.46 -153.52 124 1 GLU B 430 ? ? 58.16 126.12 125 1 VAL B 435 ? ? -167.96 -162.32 126 1 HIS B 436 ? ? -173.14 137.69 127 1 LYS B 437 ? ? 154.17 117.95 128 1 PRO B 452 ? ? -86.83 49.90 129 1 ARG B 454 ? ? -82.97 -72.47 130 1 GLU B 455 ? ? -87.56 49.94 131 1 MET B 457 ? ? -176.44 100.33 132 1 TRP B 460 ? ? -65.53 -175.82 133 1 ARG B 462 ? ? -39.16 -38.49 134 1 ARG B 476 ? ? -55.24 -80.04 135 1 ALA B 477 ? ? -5.06 -81.84 136 1 ASP B 484 ? ? -48.21 51.46 137 1 ALA B 490 ? ? -153.89 62.64 138 1 LEU B 500 ? ? -76.70 -75.55 139 1 GLU B 507 ? ? -149.23 -52.46 140 1 HIS B 511 ? ? -91.00 40.84 141 1 PRO B 512 ? ? -31.26 178.06 142 1 GLU B 513 ? ? -22.86 -6.30 143 1 PRO B 516 ? ? -35.47 -2.58 144 1 ALA B 518 ? ? -108.79 73.71 145 1 ASP B 524 ? ? -119.25 -140.00 146 1 THR B 525 ? ? 55.54 171.91 147 1 TYR B 526 ? ? -36.58 -86.95 148 1 GLN B 534 ? ? -171.58 74.74 149 1 GLU B 538 ? ? -53.04 -70.55 150 1 THR B 539 ? ? -44.31 -19.93 151 1 GLU B 545 ? ? -44.32 -81.02 152 1 ALA B 546 ? ? 5.09 -67.90 153 1 ARG B 566 ? ? -56.30 10.56 154 1 LEU B 569 ? ? -55.60 -75.62 155 1 GLU B 570 ? ? -66.58 47.09 156 1 ARG B 571 ? ? -141.28 -54.37 157 1 GLU B 580 ? ? 52.06 16.19 158 1 THR B 581 ? ? 166.17 126.67 159 1 ALA B 584 ? ? 46.57 -92.86 160 1 GLU B 597 ? ? -76.76 -166.33 161 1 ALA B 598 ? ? -61.99 90.61 162 1 GLU C 149 ? ? 57.80 -51.79 163 1 ALA C 150 ? ? 159.98 125.00 164 1 VAL C 153 ? ? 74.90 111.71 165 1 GLU C 163 ? ? -59.98 1.94 166 1 ALA C 164 ? ? -123.12 -51.34 167 1 PHE C 181 ? ? -138.76 -40.74 168 1 PRO C 189 ? ? -24.90 -43.36 169 1 LYS C 190 ? ? 65.74 -27.45 170 1 PRO C 197 ? ? -65.94 -168.60 171 1 SER C 223 ? ? -37.35 -39.71 172 1 PHE C 229 ? ? -65.89 -172.62 173 1 ASP C 258 ? ? -33.61 -28.11 174 1 ARG C 262 ? ? 165.14 142.30 175 1 ARG C 264 ? ? -148.61 -57.87 176 1 ASN C 272 ? ? -90.80 -74.61 177 1 GLN C 277 ? ? -73.76 -79.86 178 1 ASN C 280 ? ? -71.72 35.14 179 1 GLU C 290 ? ? -86.21 -130.89 180 1 ASP C 292 ? ? -81.25 40.29 181 1 THR C 301 ? ? -176.17 136.91 182 1 PRO C 309 ? ? -56.52 3.10 183 1 ARG C 316 ? ? -83.36 -147.23 184 1 PHE C 317 ? ? -62.16 81.41 185 1 ASP C 318 ? ? -103.62 49.62 186 1 PRO C 326 ? ? -60.10 18.57 187 1 ASP C 327 ? ? -45.11 163.99 188 1 LYS C 342 ? ? 62.97 132.81 189 1 ALA C 345 ? ? -93.34 52.19 190 1 ASP C 347 ? ? -155.28 -10.65 191 1 LEU C 350 ? ? 62.90 -24.06 192 1 LEU C 352 ? ? -68.13 0.91 193 1 PHE C 360 ? ? 169.10 129.16 194 1 LYS C 383 ? ? 68.77 149.61 195 1 THR C 385 ? ? -66.13 -179.23 196 1 PRO C 400 ? ? -59.88 77.64 197 1 ALA C 401 ? ? 152.03 -135.50 198 1 LYS C 402 ? ? -132.41 -39.16 199 1 LEU C 407 ? ? -105.74 71.94 200 1 PRO C 409 ? ? -49.12 -9.99 201 1 ALA C 425 ? ? -82.66 -83.93 202 1 ALA C 426 ? ? -39.91 -19.84 203 1 PHE C 428 ? ? -137.32 -149.85 204 1 GLU C 430 ? ? 57.19 87.90 205 1 HIS C 431 ? ? 88.95 -9.54 206 1 VAL C 435 ? ? -134.49 -153.37 207 1 HIS C 436 ? ? -170.17 134.24 208 1 LYS C 437 ? ? 178.49 109.28 209 1 VAL C 441 ? ? 72.00 82.98 210 1 ARG C 443 ? ? 77.21 -62.99 211 1 ARG C 445 ? ? -34.79 -36.12 212 1 ALA C 446 ? ? -64.29 26.48 213 1 PHE C 449 ? ? -75.77 32.81 214 1 MET C 450 ? ? -176.49 -79.56 215 1 PRO C 452 ? ? -59.11 21.18 216 1 ASP C 456 ? ? -144.11 49.50 217 1 MET C 457 ? ? 8.04 120.93 218 1 LEU C 458 ? ? 178.22 146.89 219 1 HIS C 459 ? ? -61.37 97.75 220 1 TRP C 460 ? ? -69.28 -167.59 221 1 ARG C 476 ? ? -62.23 -78.46 222 1 ALA C 477 ? ? -11.76 -76.22 223 1 ALA C 478 ? ? -23.98 -74.38 224 1 ILE C 481 ? ? -74.48 -87.39 225 1 ASP C 484 ? ? -43.97 29.56 226 1 ASP C 485 ? ? 53.79 9.76 227 1 ASN C 492 ? ? -27.64 -55.23 228 1 ASP C 493 ? ? -25.96 -63.72 229 1 HIS C 511 ? ? -88.40 45.77 230 1 PRO C 512 ? ? -23.68 177.54 231 1 PRO C 516 ? ? -101.26 43.00 232 1 VAL C 521 ? ? -156.88 54.34 233 1 ARG C 522 ? ? -38.55 109.48 234 1 ASP C 524 ? ? -150.86 49.11 235 1 ARG C 533 ? ? -177.78 149.97 236 1 TYR C 535 ? ? -116.22 -119.17 237 1 SER C 536 ? ? -171.77 138.06 238 1 GLU C 537 ? ? -22.96 -53.86 239 1 THR C 539 ? ? -56.92 -9.88 240 1 GLU C 580 ? ? 68.71 -55.07 241 1 GLU D 149 ? ? -105.56 -169.20 242 1 VAL D 153 ? ? 84.45 108.08 243 1 THR D 154 ? ? -105.13 -162.10 244 1 PRO D 189 ? ? -5.41 -75.73 245 1 LYS D 190 ? ? 100.29 -43.34 246 1 LYS D 202 ? ? -51.15 -94.60 247 1 HIS D 204 ? ? -34.88 -34.14 248 1 ARG D 214 ? ? 56.28 90.85 249 1 PRO D 216 ? ? -66.83 99.61 250 1 MET D 228 ? ? -82.85 -124.27 251 1 HIS D 247 ? ? -90.85 54.46 252 1 VAL D 260 ? ? -90.21 -61.17 253 1 GLU D 274 ? ? -40.36 -70.81 254 1 ASP D 292 ? ? -75.84 31.94 255 1 ILE D 295 ? ? -172.48 117.24 256 1 ALA D 300 ? ? -170.24 127.70 257 1 LEU D 311 ? ? -69.04 2.13 258 1 ARG D 313 ? ? -42.90 154.39 259 1 ARG D 316 ? ? -88.20 -133.54 260 1 ASP D 318 ? ? -114.65 50.84 261 1 ARG D 319 ? ? 177.29 145.02 262 1 ALA D 325 ? ? -64.25 -83.77 263 1 PRO D 326 ? ? -88.15 -121.37 264 1 ASP D 327 ? ? 110.90 151.72 265 1 GLU D 332 ? ? -46.43 -82.01 266 1 GLN D 333 ? ? -26.38 -50.15 267 1 HIS D 338 ? ? -94.65 34.27 268 1 LYS D 342 ? ? 67.76 168.64 269 1 ASP D 347 ? ? -48.88 -7.93 270 1 LEU D 350 ? ? 52.22 11.21 271 1 ALA D 354 ? ? -36.90 -30.94 272 1 PRO D 358 ? ? -87.67 -122.85 273 1 ASP D 364 ? ? -76.68 26.13 274 1 LYS D 383 ? ? 163.24 112.46 275 1 THR D 385 ? ? -116.99 -168.43 276 1 LYS D 387 ? ? -61.07 5.36 277 1 ALA D 393 ? ? -82.08 -77.61 278 1 ASP D 394 ? ? -44.79 -14.47 279 1 VAL D 396 ? ? -99.61 56.61 280 1 MET D 397 ? ? -149.08 -27.83 281 1 PRO D 409 ? ? -46.29 -3.58 282 1 ILE D 414 ? ? -68.87 -73.28 283 1 ALA D 425 ? ? -15.99 -66.26 284 1 PHE D 428 ? ? -153.53 -152.83 285 1 GLU D 430 ? ? 57.27 125.92 286 1 VAL D 435 ? ? -166.26 -158.14 287 1 HIS D 436 ? ? -179.65 136.17 288 1 LYS D 437 ? ? 158.59 118.15 289 1 PRO D 452 ? ? -85.69 49.34 290 1 ARG D 454 ? ? -85.06 -71.30 291 1 GLU D 455 ? ? -89.13 49.49 292 1 MET D 457 ? ? -174.35 103.28 293 1 TRP D 460 ? ? -62.52 -173.70 294 1 ARG D 476 ? ? -58.38 -79.80 295 1 ALA D 477 ? ? -3.97 -82.11 296 1 ASP D 484 ? ? -45.58 55.55 297 1 ASP D 485 ? ? 34.23 55.40 298 1 LEU D 500 ? ? -69.91 -80.98 299 1 ALA D 501 ? ? -29.82 -54.02 300 1 MET D 504 ? ? -37.83 -33.49 301 1 GLU D 507 ? ? -152.10 -49.81 302 1 HIS D 511 ? ? -93.26 41.93 303 1 PRO D 512 ? ? -34.66 176.80 304 1 GLU D 513 ? ? -28.25 -2.28 305 1 PRO D 516 ? ? -29.46 -10.15 306 1 ASP D 524 ? ? -118.53 -139.39 307 1 THR D 525 ? ? 56.85 175.79 308 1 TYR D 526 ? ? -41.94 -84.96 309 1 GLN D 534 ? ? -174.25 80.09 310 1 ALA D 546 ? ? -7.42 -68.47 311 1 ARG D 549 ? ? -36.52 -73.14 312 1 GLU D 564 ? ? -68.98 14.20 313 1 LYS D 565 ? ? -142.73 10.72 314 1 ARG D 566 ? ? -63.16 12.53 315 1 LEU D 569 ? ? -58.00 -73.39 316 1 GLU D 570 ? ? -65.38 47.64 317 1 ARG D 571 ? ? -145.44 -59.68 318 1 GLU D 580 ? ? 48.13 17.43 319 1 THR D 581 ? ? 169.17 126.41 320 1 ALA D 584 ? ? 47.49 -95.59 321 1 GLU D 597 ? ? -77.21 -163.76 322 1 ALA D 598 ? ? -64.56 90.06 323 1 PRO D 599 ? ? -59.20 171.42 324 1 GLU E 149 ? ? 57.80 -52.42 325 1 ALA E 150 ? ? 160.59 125.64 326 1 VAL E 153 ? ? 73.17 113.16 327 1 GLU E 163 ? ? -59.89 1.78 328 1 PHE E 181 ? ? -139.67 -39.87 329 1 PRO E 189 ? ? -24.25 -44.44 330 1 LYS E 190 ? ? 67.92 -28.01 331 1 PRO E 197 ? ? -65.47 -167.93 332 1 LYS E 202 ? ? -64.41 -70.71 333 1 PHE E 229 ? ? -64.45 -172.27 334 1 GLU E 256 ? ? 39.48 57.80 335 1 ASP E 258 ? ? -36.14 -27.24 336 1 ARG E 262 ? ? 165.66 143.46 337 1 ARG E 264 ? ? -148.23 -57.51 338 1 ASN E 272 ? ? -90.61 -75.47 339 1 GLN E 277 ? ? -74.92 -79.81 340 1 ASN E 280 ? ? -73.40 35.77 341 1 GLU E 290 ? ? -86.65 -130.06 342 1 ASP E 292 ? ? -81.99 41.72 343 1 THR E 301 ? ? -174.32 137.38 344 1 PRO E 309 ? ? -56.00 -0.32 345 1 ARG E 316 ? ? -81.09 -146.99 346 1 PHE E 317 ? ? -62.83 80.59 347 1 ASP E 318 ? ? -101.96 49.74 348 1 PRO E 326 ? ? -59.75 17.02 349 1 ASP E 327 ? ? -44.56 163.74 350 1 LYS E 342 ? ? 63.36 132.96 351 1 ALA E 345 ? ? -92.53 53.45 352 1 ASP E 347 ? ? -156.14 -10.49 353 1 LEU E 350 ? 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