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J.Struct.Biol. 155 482 492 2006 JSBIEM US 1047-8477 0803 ? 16904907 10.1016/j.jsb.2006.06.008 1 'Crystal structure of wild-type chaperonin GROEL' J.Mol.Biol. 354 940 951 2005 JMOBAK UK 0022-2836 0070 ? 16288915 10.1016/j.jmb.2005.09.096 2 'A mutant chaperonin with rearranged inter-ring electrostatic contacts and temperature-sensitive dissociation' Nat.Struct.Mol.Biol. 11 1128 1133 2004 ? US 1545-9993 ? ? 15475965 10.1038/nsmb844 3 'Conformational variability in the refined structure of the chaperonin GroEL at 2.8 A resolution' Nature 2 1083 1094 1995 NATUAS UK 0028-0836 0006 ? 8846220 10.1038/nsb1295-1083 4 'The crystal structure of the asymmetric GroEL-GroES-(ADP)7 chaperonin complex' Nature 388 741 750 1997 NATUAS UK 0028-0836 0006 ? 9285585 10.1038/41944 5 ;Ionic interactions at both inter-ring contact sites of GroEL are involved in transmission of the allosteric signal: a time-resolved infrared difference study ; 'Protein Sci.' 14 2267 2274 2005 PRCIEI US 0961-8368 0795 ? 16081650 10.1110/ps.051469605 6 'Salt bridges at the inter-ring interface regulate the thermostat of GroEL' J.Biol.Chem. 277 34024 34029 2002 JBCHA3 US 0021-9258 0071 ? 12110685 10.1074/jbc.M205733200 7 'GroEL stability and function. 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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location ? _entity_src_gen.host_org_common_name ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name 'Escherichia coli' _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id 562 _entity_src_gen.host_org_genus Escherichia _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ ? _entity_src_gen.host_org_species ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector ? _entity_src_gen.host_org_details ? _entity_src_gen.expression_system_id ? _entity_src_gen.plasmid_name ? 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'X-RAY DIFFRACTION' ? # _pdbx_xplor_file.serial_no 1 _pdbx_xplor_file.param_file PROTEIN_REP.PARAM _pdbx_xplor_file.topol_file ? _pdbx_xplor_file.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 2EU1 _struct.title 'Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2EU1 _struct_keywords.pdbx_keywords 'CHAPERONE/PEPTIDE BINDING PROTEIN' _struct_keywords.text 'chaperonin, GROEL, HSP60, E461K, CHAPERONE-PEPTIDE BINDING PROTEIN COMPLEX' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 1 ? N N N 1 ? # loop_ _struct_biol.id _struct_biol.details _struct_biol.pdbx_parent_biol_id 1 'The biological GroELE461K molecule is formed in the crystal by the association of two rings from neighbouring asymmetric units.' ? 2 ? ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 9 ? VAL A 29 ? GLY A 9 VAL A 29 1 ? 21 HELX_P HELX_P2 2 ASP A 52 ? ILE A 60 ? ASP A 52 ILE A 60 1 ? 9 HELX_P HELX_P3 3 ASP A 64 ? GLY A 86 ? 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N . n # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? tetradecameric 14 2 author_and_software_defined_assembly PQS heptameric 7 3 software_defined_assembly PISA heptameric 7 4 software_defined_assembly PISA,PQS heptameric 7 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1,2 A,B,C,D,E,F,G 2 1 H,I,J,K,L,M,N 3 1 H,I,J,K,L,M,N 4 1 A,B,C,D,E,F,G # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 3 'ABSA (A^2)' 21710 ? 3 MORE -99 ? 3 'SSA (A^2)' 150750 ? 4 'ABSA (A^2)' 22150 ? 4 MORE -95 ? 4 'SSA (A^2)' 150340 ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 4_566 x,-y+1,-z+1 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 290.6410000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 247.0060000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2006-08-29 2 'Structure model' 1 1 2008-05-01 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2018-01-31 5 'Structure model' 1 4 2021-10-20 6 'Structure model' 1 5 2023-08-23 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? 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? 174.03 137.93 207 1 ASN F 326 ? ? -109.40 -167.36 208 1 ASP F 328 ? ? -150.64 28.10 209 1 ASP F 334 ? ? 67.65 102.37 210 1 GLU F 339 ? ? -55.82 -3.09 211 1 THR F 357 ? ? -73.03 28.03 212 1 ASN F 479 ? ? -67.15 99.87 213 1 GLU F 483 ? ? 46.17 19.59 214 1 LYS G 34 ? ? -76.93 33.53 215 1 SER G 43 ? ? -1.10 -85.58 216 1 PRO G 47 ? ? -51.41 172.34 217 1 GLU G 61 ? ? -169.55 102.52 218 1 ALA G 109 ? ? -67.45 4.13 219 1 PRO G 137 ? ? -52.99 170.10 220 1 CYS G 138 ? ? -166.38 85.57 221 1 SER G 141 ? ? -54.11 -2.24 222 1 ALA G 152 ? ? 178.87 53.13 223 1 ASN G 153 ? ? 42.69 27.97 224 1 SER G 154 ? ? 75.29 44.26 225 1 GLN G 184 ? ? 84.46 136.57 226 1 GLU G 191 ? ? -58.29 104.67 227 1 SER G 201 ? ? 167.51 140.15 228 1 PRO G 202 ? ? -62.17 -143.48 229 1 TYR G 203 ? ? 66.12 -55.63 230 1 PRO G 208 ? ? -48.29 -8.83 231 1 GLU G 214 ? ? -173.11 124.48 232 1 SER G 217 ? ? 39.46 46.48 233 1 LYS G 225 ? ? 167.62 163.93 234 1 ALA G 243 ? ? 71.93 -16.31 235 1 ASP G 253 ? ? 168.41 153.25 236 1 ILE G 270 ? ? -68.96 80.76 237 1 VAL G 271 ? ? 78.47 123.79 238 1 LEU G 309 ? ? -65.61 11.08 239 1 LYS G 311 ? ? -78.62 36.09 240 1 THR G 313 ? ? -77.13 -152.07 241 1 ARG G 322 ? ? 174.12 136.72 242 1 ASN G 326 ? ? -110.58 -169.02 243 1 ASP G 328 ? ? -151.54 27.71 244 1 ASP G 334 ? ? 67.93 101.03 245 1 GLU G 339 ? ? -57.05 -2.13 246 1 THR G 357 ? ? -72.20 28.13 247 1 MET G 447 ? ? -59.52 -5.42 248 1 GLU G 460 ? ? -100.19 -169.87 249 1 GLU G 483 ? ? 43.83 21.88 250 1 ASN H 10 ? ? -23.98 -47.07 251 1 LEU H 23 ? ? -62.94 -75.61 252 1 PRO H 33 ? ? 8.93 -28.44 253 1 SER H 43 ? ? 15.34 -89.62 254 1 PRO H 47 ? ? -46.79 162.89 255 1 GLU H 61 ? ? -176.45 104.74 256 1 LYS H 65 ? ? -35.74 -38.13 257 1 LYS H 80 ? ? -47.13 -19.28 258 1 ASP H 87 ? ? 174.61 169.67 259 1 ALA H 109 ? ? -67.90 0.64 260 1 GLU H 130 ? ? -66.08 4.44 261 1 PRO H 137 ? ? -40.02 155.56 262 1 SER H 141 ? ? -58.66 6.97 263 1 SER H 151 ? ? -88.17 31.69 264 1 ALA H 152 ? ? -160.50 45.95 265 1 SER H 154 ? ? 62.53 60.07 266 1 GLN H 184 ? ? 76.62 128.69 267 1 PRO H 202 ? ? -65.68 -147.51 268 1 TYR H 203 ? ? 67.57 -54.96 269 1 ILE H 205 ? ? -47.18 155.83 270 1 ASN H 206 ? ? -157.64 22.52 271 1 LYS H 207 ? ? -147.03 55.10 272 1 PRO H 208 ? ? -44.71 -10.63 273 1 GLU H 214 ? ? -173.79 125.66 274 1 SER H 217 ? ? 30.21 46.34 275 1 LYS H 225 ? ? 162.93 174.73 276 1 SER H 228 ? ? -147.77 -6.81 277 1 ARG H 231 ? ? -58.35 -8.11 278 1 VAL H 236 ? ? -143.42 33.50 279 1 ALA H 243 ? ? 73.61 46.16 280 1 PRO H 246 ? ? -44.11 152.62 281 1 ASP H 253 ? ? 174.00 159.22 282 1 GLU H 257 ? ? -48.62 -78.76 283 1 VAL H 264 ? ? -78.16 -70.20 284 1 VAL H 271 ? ? 70.22 108.10 285 1 ALA H 278 ? ? -48.65 156.85 286 1 GLU H 304 ? ? -47.20 -16.85 287 1 LYS H 311 ? ? -76.67 30.85 288 1 THR H 313 ? ? -71.41 -122.18 289 1 ARG H 322 ? ? 177.47 137.27 290 1 ASN H 326 ? ? -112.57 -154.40 291 1 ASP H 328 ? ? -150.41 37.56 292 1 THR H 329 ? ? -160.51 119.54 293 1 ASP H 334 ? ? 60.62 101.84 294 1 VAL H 336 ? ? -68.00 9.24 295 1 GLU H 355 ? ? -75.22 36.37 296 1 THR H 357 ? ? -83.43 41.70 297 1 ASN I 10 ? ? -27.39 -47.78 298 1 LEU I 23 ? ? -60.25 -74.64 299 1 VAL I 29 ? ? -64.45 8.39 300 1 SER I 43 ? ? 14.49 -89.32 301 1 PRO I 47 ? ? -48.00 163.87 302 1 GLU I 61 ? ? -176.25 103.91 303 1 ASP I 87 ? ? 173.38 169.31 304 1 ALA I 109 ? ? -67.47 0.78 305 1 MET I 114 ? ? -47.56 -18.22 306 1 GLU I 130 ? ? -66.81 4.23 307 1 PRO I 137 ? ? -39.95 153.81 308 1 SER I 141 ? ? -58.73 6.95 309 1 SER I 151 ? ? -86.46 30.73 310 1 ALA I 152 ? ? -159.20 45.53 311 1 GLN I 184 ? ? 78.29 129.44 312 1 PRO I 202 ? ? -64.32 -148.38 313 1 TYR I 203 ? ? 67.98 -55.32 314 1 ILE I 205 ? ? -47.89 155.32 315 1 ASN I 206 ? ? -157.91 22.66 316 1 LYS I 207 ? ? -147.55 55.43 317 1 PRO I 208 ? ? -45.42 -10.70 318 1 GLU I 214 ? ? -173.44 126.27 319 1 SER I 217 ? ? 29.27 46.20 320 1 LYS I 225 ? ? 163.39 174.36 321 1 SER I 228 ? ? -147.84 -7.06 322 1 ARG I 231 ? ? -58.26 -8.47 323 1 VAL I 236 ? ? -143.74 32.96 324 1 ALA I 243 ? ? 73.76 45.94 325 1 PRO I 246 ? ? -42.58 153.13 326 1 ASP I 253 ? ? 172.44 158.72 327 1 GLU I 257 ? ? -48.00 -79.70 328 1 VAL I 264 ? ? -77.90 -70.57 329 1 VAL I 271 ? ? 70.70 108.55 330 1 GLU I 304 ? ? -47.11 -17.99 331 1 LYS I 311 ? ? -75.80 30.94 332 1 THR I 313 ? ? -70.78 -121.07 333 1 ARG I 322 ? ? 177.33 138.11 334 1 ASN I 326 ? ? -115.56 -155.31 335 1 ASP I 328 ? ? -150.68 36.85 336 1 THR I 329 ? ? -160.09 119.05 337 1 ASP I 334 ? ? 59.90 100.46 338 1 GLU I 355 ? ? -75.40 37.28 339 1 THR I 357 ? ? -85.90 42.91 340 1 ASN J 10 ? ? -25.02 -47.87 341 1 LEU J 23 ? ? -63.10 -73.50 342 1 VAL J 29 ? ? -62.89 1.24 343 1 PRO J 33 ? ? -0.80 -54.63 344 1 LYS J 34 ? ? -94.63 38.71 345 1 SER J 43 ? ? 15.48 -89.80 346 1 PRO J 47 ? ? -46.40 164.45 347 1 GLU J 61 ? ? -178.96 104.12 348 1 LYS J 65 ? ? -37.49 -36.54 349 1 LYS J 80 ? ? -46.61 -19.71 350 1 ASP J 87 ? ? 173.36 167.88 351 1 MET J 114 ? ? -47.04 -19.63 352 1 GLU J 130 ? ? -65.98 2.88 353 1 PRO J 137 ? ? -40.71 153.52 354 1 SER J 141 ? ? -57.84 6.97 355 1 SER J 151 ? ? -86.51 31.39 356 1 ALA J 152 ? ? -160.14 45.17 357 1 SER J 154 ? ? 61.28 60.64 358 1 GLN J 184 ? ? 77.85 129.89 359 1 PRO J 202 ? ? -64.41 -147.93 360 1 TYR J 203 ? ? 67.43 -56.42 361 1 ILE J 205 ? ? -49.09 154.47 362 1 ASN J 206 ? ? -157.21 22.72 363 1 LYS J 207 ? ? -147.47 55.30 364 1 PRO J 208 ? ? -45.38 -11.11 365 1 GLU J 214 ? ? -173.48 126.63 366 1 SER J 217 ? ? 31.09 44.86 367 1 LYS J 225 ? ? 163.28 174.43 368 1 SER J 228 ? ? -147.96 -7.06 369 1 ARG J 231 ? ? -58.53 -8.28 370 1 VAL J 236 ? ? -143.41 33.71 371 1 ALA J 243 ? ? 74.19 45.98 372 1 PRO J 246 ? ? -43.00 153.60 373 1 ASP J 253 ? ? 171.82 158.68 374 1 GLU J 257 ? ? -48.92 -79.70 375 1 VAL J 264 ? ? -77.46 -70.01 376 1 VAL J 271 ? ? 70.24 108.52 377 1 ALA J 278 ? ? -49.46 156.45 378 1 GLU J 304 ? ? -46.56 -16.80 379 1 LYS J 311 ? ? -76.55 31.58 380 1 THR J 313 ? ? -71.36 -122.63 381 1 ARG J 322 ? ? 179.54 139.60 382 1 ASN J 326 ? ? -114.45 -155.96 383 1 ASP J 328 ? ? -149.98 37.23 384 1 ASP J 334 ? ? 62.05 99.06 385 1 VAL J 336 ? ? -68.92 7.93 386 1 GLU J 355 ? ? -75.03 36.95 387 1 THR J 357 ? ? -84.34 42.17 388 1 ASN J 475 ? ? -95.73 31.31 389 1 ASN K 10 ? ? -26.91 -46.76 390 1 LEU K 23 ? ? -63.91 -74.89 391 1 VAL K 29 ? ? -54.51 -2.93 392 1 SER K 43 ? ? 16.30 -89.27 393 1 PRO K 47 ? ? -46.54 164.48 394 1 GLU K 61 ? ? -178.47 101.80 395 1 LYS K 65 ? ? -38.14 -35.62 396 1 LYS K 80 ? ? -47.73 -19.40 397 1 ASP K 87 ? ? 173.81 169.83 398 1 ALA K 109 ? ? -66.80 0.26 399 1 MET K 114 ? ? -45.72 -18.92 400 1 GLU K 130 ? ? -66.05 3.85 401 1 PRO K 137 ? ? -41.69 153.13 402 1 SER K 141 ? ? -58.03 7.06 403 1 SER K 151 ? ? -87.40 31.82 404 1 ALA K 152 ? ? -160.40 44.94 405 1 MET K 166 ? ? -58.45 -9.72 406 1 GLN K 184 ? ? 76.50 128.99 407 1 PRO K 202 ? ? -64.70 -147.74 408 1 TYR K 203 ? ? 67.46 -55.80 409 1 ILE K 205 ? ? -48.46 154.96 410 1 ASN K 206 ? ? -156.89 22.50 411 1 LYS K 207 ? ? -147.29 55.59 412 1 PRO K 208 ? ? -45.48 -10.81 413 1 GLU K 214 ? ? -174.45 125.89 414 1 SER K 217 ? ? 31.10 44.60 415 1 LYS K 225 ? ? 162.68 174.29 416 1 SER K 228 ? ? -147.88 -7.11 417 1 ARG K 231 ? ? -58.30 -8.36 418 1 VAL K 236 ? ? -144.07 32.90 419 1 ALA K 243 ? ? 73.85 45.76 420 1 PRO K 246 ? ? -42.07 153.19 421 1 ASP K 253 ? ? 173.87 160.49 422 1 GLU K 257 ? ? -49.27 -78.85 423 1 VAL K 264 ? ? -77.99 -70.46 424 1 VAL K 271 ? ? 70.64 108.23 425 1 ALA K 278 ? ? -49.41 155.45 426 1 GLU K 304 ? ? -46.68 -16.54 427 1 LYS K 311 ? ? -76.62 31.73 428 1 THR K 313 ? ? -71.41 -122.50 429 1 ARG K 322 ? ? 179.06 138.48 430 1 ASN K 326 ? ? -113.34 -155.06 431 1 ASP K 328 ? ? -150.57 37.12 432 1 THR K 329 ? ? -160.35 119.88 433 1 ASP K 334 ? ? 60.44 101.41 434 1 VAL K 336 ? ? -67.79 8.18 435 1 GLU K 355 ? ? -74.01 37.03 436 1 THR K 357 ? ? -84.48 42.07 437 1 ASN K 475 ? ? -95.28 30.03 438 1 ASN L 10 ? ? -26.43 -47.71 439 1 LEU L 23 ? ? -61.94 -75.60 440 1 VAL L 29 ? ? -68.55 15.59 441 1 LEU L 31 ? ? -44.12 85.97 442 1 PRO L 33 ? ? 22.11 -50.78 443 1 SER L 43 ? ? 17.33 -89.40 444 1 PRO L 47 ? ? -45.12 165.48 445 1 GLU L 61 ? ? -176.69 103.60 446 1 LYS L 65 ? ? -36.92 -37.10 447 1 ASP L 87 ? ? 173.96 170.45 448 1 MET L 114 ? ? -44.25 -18.76 449 1 GLU L 130 ? ? -66.68 4.33 450 1 PRO L 137 ? ? -40.74 154.99 451 1 SER L 141 ? ? -57.68 6.76 452 1 SER L 151 ? ? -86.65 32.20 453 1 ALA L 152 ? ? -160.10 43.49 454 1 SER L 154 ? ? 61.61 60.88 455 1 MET L 166 ? ? -58.77 -9.83 456 1 GLN L 184 ? ? 78.67 129.65 457 1 PRO L 202 ? ? -64.59 -147.52 458 1 TYR L 203 ? ? 67.10 -54.61 459 1 ILE L 205 ? ? -48.39 155.54 460 1 ASN L 206 ? ? -157.21 22.28 461 1 LYS L 207 ? ? -147.26 55.45 462 1 PRO L 208 ? ? -44.98 -10.73 463 1 GLU L 214 ? ? -173.81 127.07 464 1 SER L 217 ? ? 29.69 46.54 465 1 LYS L 225 ? ? 162.75 174.23 466 1 SER L 228 ? ? -147.84 -6.48 467 1 ARG L 231 ? ? -57.98 -8.71 468 1 VAL L 236 ? ? -143.39 33.19 469 1 ALA L 243 ? ? 73.90 46.77 470 1 PRO L 246 ? ? -42.68 154.18 471 1 ASP L 253 ? ? 172.81 159.90 472 1 GLU L 257 ? ? -48.87 -79.56 473 1 VAL L 271 ? ? 70.00 108.42 474 1 ALA L 278 ? ? -49.34 156.69 475 1 GLU L 304 ? ? -46.11 -17.11 476 1 LYS L 311 ? ? -76.66 31.42 477 1 THR L 313 ? 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