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_entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample ? ? ? human Homo 'IgG1 heavy chain' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? 'Chinese hamster' 'Cricetulus griseus' 10029 Cricetulus ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? ? ? Simplexvirus 'GE, US8' 'Human herpesvirus 1' KOS ? ? ? ? 'Human herpesvirus 1' 10306 ? ? ? ? ? ? ? 'fall armyworm' 'Spodoptera frugiperda' 7108 Spodoptera ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP IGHG1_HUMAN P01857 1 ;THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRV VSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE SNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK ; 106 ? 2 UNP VGLE_HHV11 P04488 2 ;GTPKTSWRRVSVGEDVSLLPAPGPTGRGPTQKLLWAVEPLDGCGPLHPSWVSLMPPKQVPETVVDAACMRAPVPLAMAYA PPAPSATGGLRTDFVWQERAAVVNRSLVIHGVRETDSGLYTLSVGDIKDPARQVASVVLVVQPAPVPTPPPTPADYDEDD NDEGEDESLAGTPASGTPRLPPPPAPPRSWPSAPEVSHVRGVTVRMETPEAILFSPGETFSTNVSIHAIAHDDQTYSMDV VWLRFDVPTSCAEMRIYESCLYHPQLPECLSPADAPCAASTWTSRLAVRSYAGCSRTNPPPRCSAEAHMEPVPGLAWQAA SVNLEFRDASPQHSGLYLCVVYVNDHIHAWGHITISTAAQYRNAVVEQPLPQRGADLAEPTHPHVGAPPHAPPTHGALR ; 21 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2GJ7 A 3 ? 227 ? P01857 106 ? 330 ? 223 447 2 1 2GJ7 B 3 ? 227 ? P01857 106 ? 330 ? 223 447 3 2 2GJ7 F 1 ? 399 ? P04488 21 ? 419 ? 21 419 4 2 2GJ7 E 1 ? 399 ? P04488 21 ? 419 ? 21 419 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 2GJ7 LEU A 1 ? UNP P01857 ? ? 'cloning artifact' 221 1 1 2GJ7 GLU A 2 ? UNP P01857 ? ? 'cloning artifact' 222 2 1 2GJ7 GLU A 136 ? UNP P01857 ASP 239 conflict 356 3 1 2GJ7 MET A 138 ? UNP P01857 LEU 241 conflict 358 4 2 2GJ7 LEU B 1 ? UNP P01857 ? ? 'cloning artifact' 221 5 2 2GJ7 GLU B 2 ? UNP P01857 ? ? 'cloning artifact' 222 6 2 2GJ7 GLU B 136 ? UNP P01857 ASP 239 conflict 356 7 2 2GJ7 MET B 138 ? UNP P01857 LEU 241 conflict 358 8 3 2GJ7 ASP F 400 ? UNP P04488 ? ? 'cloning artifact' 420 9 3 2GJ7 ILE F 401 ? UNP P04488 ? ? 'cloning artifact' 421 10 4 2GJ7 ASP E 400 ? UNP P04488 ? ? 'cloning artifact' 420 11 4 2GJ7 ILE E 401 ? UNP P04488 ? ? 'cloning artifact' 421 12 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 FUC 'L-saccharide, alpha linking' . alpha-L-fucopyranose 'alpha-L-fucose; 6-deoxy-alpha-L-galactopyranose; L-fucose; fucose' 'C6 H12 O5' 164.156 GAL 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-galactopyranose 'beta-D-galactose; D-galactose; galactose' 'C6 H12 O6' 180.156 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.crystals_number 5 _exptl.entry_id 2GJ7 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_Matthews 5.71 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol 78.47 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.pH 7.5 _exptl_crystal_grow.temp 293 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details '0.9-1.1 M sodium malonate, 0.1 M Hepes or 0.1 M MES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # loop_ _diffrn.id _diffrn.ambient_temp _diffrn.ambient_temp_details _diffrn.crystal_id 1 100 ? 1 2 100 ? 1 3 100 ? 1 4 100 ? 1 5 100 ? 1 1,2,3,4,5 ? ? 1 # loop_ _diffrn_detector.diffrn_id _diffrn_detector.detector _diffrn_detector.type _diffrn_detector.pdbx_collection_date _diffrn_detector.details 1 'IMAGE PLATE' 'MAR scanner 345 mm plate' 2002-05-16 ? 2 CCD 'MARMOSAIC 325 mm CCD' 2005-05-25 ? 3 CCD 'MARMOSAIC 325 mm CCD' 2005-07-06 ? 4 CCD 'MARMOSAIC 325 mm CCD' 2005-07-06 ? 5 CCD 'MARMOSAIC 325 mm CCD' 2005-07-06 ? # loop_ _diffrn_radiation.diffrn_id _diffrn_radiation.wavelength_id _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol _diffrn_radiation.monochromator _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type 1 1 'SINGLE WAVELENGTH' MIRRORS M x-ray 2 1 'SINGLE WAVELENGTH' 'Double crystal monochromator' M x-ray 3 1 'SINGLE WAVELENGTH' 'Double crystal monochromator' M x-ray 4 1 'SINGLE WAVELENGTH' 'Double crystal monochromator' M x-ray 5 1 'SINGLE WAVELENGTH' 'Double crystal monochromator' M x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 0.9537 1.0 2 1.1048 1.0 3 1.0717 1.0 4 1.0060 1.0 5 1.2140 1.0 # loop_ _diffrn_source.diffrn_id _diffrn_source.source _diffrn_source.type _diffrn_source.pdbx_wavelength _diffrn_source.pdbx_wavelength_list _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 1 SYNCHROTRON 'SSRL BEAMLINE BL9-1' ? 0.9537 SSRL BL9-1 2 SYNCHROTRON 'SSRL BEAMLINE BL9-2' ? 1.1048 SSRL BL9-2 3 SYNCHROTRON 'SSRL BEAMLINE BL9-2' ? 1.0717 SSRL BL9-2 4 SYNCHROTRON 'SSRL BEAMLINE BL9-2' ? 1.0060 SSRL BL9-2 5 SYNCHROTRON 'SSRL BEAMLINE BL9-2' ? 1.2140 SSRL BL9-2 # _reflns.entry_id 2GJ7 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.observed_criterion_sigma_I 1.0 _reflns.d_resolution_high 5.00 _reflns.d_resolution_low 36 _reflns.number_all 21938 _reflns.number_obs 21931 _reflns.percent_possible_obs 99.7 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.106 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 21.3 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 11.2 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1,2,3,4,5 # _reflns_shell.d_res_high 5.00 _reflns_shell.d_res_low 5.27 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.percent_possible_all 100.0 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.708 _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 4.2 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.pdbx_redundancy 10.6 _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1,2,3,4,5 # _refine.entry_id 2GJ7 _refine.B_iso_mean ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MR, MIRAS' _refine.ls_d_res_high 5 _refine.ls_d_res_low 36 _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs 21931 _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.details ;No refinement done. The molecular replacement model contains Fc and the C-terminal domain of the HSV-1 gE ectodomain. HSV-1 gI ectodomain and the N-terminal domain of the HSV-1 gE ectodomain are contained in the crystal but not modeled in the structure. ; _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 5956 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 192 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 6148 _refine_hist.d_res_high 5 _refine_hist.d_res_low 36 # _struct.entry_id 2GJ7 _struct.title 'Crystal Structure of a gE-gI/Fc complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2GJ7 _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM/VIRUS/VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.text 'Fc receptor, low resolution, IMMUNE SYSTEM-VIRUS-VIRAL PROTEIN COMPLEX' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'The asymmetric unit contains one biological complex (1 Fc dimer and 2 gE-gI heterodimers).' _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LYS A 26 ? MET A 32 ? LYS A 246 MET A 252 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 2 LEU A 89 ? ASN A 95 ? LEU A 309 ASN A 315 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 3 SER A 134 ? LYS A 140 ? SER A 354 LYS A 360 5 ? 7 HELX_P HELX_P4 4 LYS A 194 ? GLN A 199 ? LYS A 414 GLN A 419 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 5 LEU A 212 ? ASN A 214 ? LEU A 432 ASN A 434 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 6 GLU B 258 ? HIS B 263 ? GLU F 278 HIS F 283 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 7 LEU B 266 ? SER B 271 ? LEU F 286 SER F 291 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 8 ASP B 274 ? PRO B 276 ? ASP F 294 PRO F 296 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 9 SER B 330 ? SER B 334 ? SER F 350 SER F 354 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 10 LYS C 26 ? MET C 32 ? LYS B 246 MET B 252 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 11 LEU C 89 ? ASN C 95 ? LEU B 309 ASN B 315 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 12 SER C 134 ? LYS C 140 ? SER B 354 LYS B 360 5 ? 7 HELX_P HELX_P13 13 LYS C 194 ? GLN C 199 ? LYS B 414 GLN B 419 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 14 LEU C 212 ? ASN C 214 ? LEU B 432 ASN B 434 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 15 GLU D 258 ? HIS D 263 ? GLU E 278 HIS E 283 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 16 LEU D 266 ? SER D 271 ? LEU E 286 SER E 291 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 ASP D 274 ? PRO D 276 ? ASP E 294 PRO E 296 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 18 SER D 330 ? SER D 334 ? SER E 350 SER E 354 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 41 SG ? ? ? 1_555 A CYS 101 SG ? ? A CYS 261 A CYS 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 147 SG ? ? ? 1_555 A CYS 205 SG ? ? A CYS 367 A CYS 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 251 SG ? ? ? 1_555 B CYS 277 SG ? ? F CYS 271 F CYS 297 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 260 SG ? ? ? 1_555 B CYS 269 SG ? ? F CYS 280 F CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 294 SG ? ? ? 1_555 B CYS 303 SG ? ? F CYS 314 F CYS 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 41 SG ? ? ? 1_555 C CYS 101 SG ? ? B CYS 261 B CYS 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf7 disulf ? ? C CYS 147 SG ? ? ? 1_555 C CYS 205 SG ? ? B CYS 367 B CYS 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 251 SG ? ? ? 1_555 D CYS 277 SG ? ? E CYS 271 E CYS 297 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf9 disulf ? ? D CYS 260 SG ? ? ? 1_555 D CYS 269 SG ? ? E CYS 280 E CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf10 disulf ? ? D CYS 294 SG ? ? ? 1_555 D CYS 303 SG ? ? E CYS 314 E CYS 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? covale1 covale one ? A THR 36 CG2 ? ? ? 1_555 B ALA 319 C ? ? A THR 256 F ALA 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.535 ? ? covale2 covale none ? A THR 36 CG2 ? ? ? 1_555 B ALA 319 O ? ? A THR 256 F ALA 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.131 ? ? covale3 covale none ? A THR 36 CA ? ? ? 1_555 B ALA 320 O ? ? A THR 256 F ALA 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.306 ? ? covale4 covale one ? A THR 36 CB ? ? ? 1_555 B ALA 320 C ? ? A THR 256 F ALA 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.572 ? ? covale5 covale none ? A THR 36 OG1 ? ? ? 1_555 B SER 321 CA ? ? A THR 256 F SER 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? ? covale6 covale one ? A ASN 77 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 297 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale7 covale none ? A ASN 95 CG ? ? ? 1_555 B ARG 302 NH2 ? ? A ASN 315 F ARG 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.550 ? ? covale8 covale none ? A HIS 213 ND1 ? ? ? 1_555 B ARG 296 CG ? ? A HIS 433 F ARG 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.382 ? ? covale9 covale none ? A HIS 213 ND1 ? ? ? 1_555 B ARG 296 CD ? ? A HIS 433 F ARG 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.225 ? ? covale10 covale none ? A HIS 213 CE1 ? ? ? 1_555 B ARG 296 CG ? ? A HIS 433 F ARG 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.556 ? ? covale11 covale one ? A ASN 214 ND2 ? ? ? 1_555 B ALA 230 N ? ? A ASN 434 F ALA 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.234 ? ? covale12 covale none ? C THR 36 CB ? ? ? 1_555 D ALA 319 O ? ? B THR 256 E ALA 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.532 ? ? covale13 covale none ? C THR 36 OG1 ? ? ? 1_555 D ALA 319 O ? ? B THR 256 E ALA 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ? ? covale14 covale none ? C THR 36 CG2 ? ? ? 1_555 D ALA 319 O ? ? B THR 256 E ALA 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.263 ? ? covale15 covale one ? C ASN 77 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? B ASN 297 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale16 covale none ? C HIS 213 CE1 ? ? ? 1_555 D ARG 296 CG ? ? B HIS 433 E ARG 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.359 ? ? covale17 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale18 covale both ? E NAG . O6 ? ? ? 1_555 E FUC . C1 ? ? C NAG 1 C FUC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale19 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E BMA . C1 ? ? C NAG 2 C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale20 covale both ? E BMA . O6 ? ? ? 1_555 E MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? ? covale21 covale both ? E BMA . O3 ? ? ? 1_555 E MAN . C1 ? ? C BMA 3 C MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? ? covale22 covale both ? E MAN . O2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? C MAN 4 C NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? ? covale23 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E GAL . C1 ? ? C NAG 5 C GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? ? covale24 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? ? covale25 covale both ? F NAG . O6 ? ? ? 1_555 F FUC . C1 ? ? D NAG 1 D FUC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? ? covale26 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F BMA . C1 ? ? D NAG 2 D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? ? covale27 covale both ? F BMA . O6 ? ? ? 1_555 F MAN . C1 ? ? D BMA 3 D MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? ? covale28 covale both ? F BMA . O3 ? ? ? 1_555 F MAN . C1 ? ? D BMA 3 D MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? ? covale29 covale both ? F MAN . O2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? D MAN 4 D NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.378 ? ? covale30 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F GAL . C1 ? ? D NAG 5 D GAL 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 153 A . ? TYR 373 A PRO 154 A ? PRO 374 A 1 -0.13 2 TYR 153 C . ? TYR 373 B PRO 154 C ? PRO 374 B 1 -0.16 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 4 ? C ? 4 ? D ? 4 ? E ? 4 ? F ? 4 ? G ? 2 ? H ? 6 ? I ? 3 ? J ? 3 ? K ? 4 ? L ? 4 ? M ? 4 ? N ? 4 ? O ? 4 ? P ? 4 ? Q ? 2 ? R ? 6 ? S ? 3 ? T ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel H 1 2 ? parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel J 1 2 ? parallel J 2 3 ? parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel T 1 2 ? parallel T 2 3 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 SER A 19 ? 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ALA A 378 SER A 383 F 3 PHE A 203 ? MET A 208 ? PHE A 423 MET A 428 F 4 TYR A 216 ? LEU A 221 ? TYR A 436 LEU A 441 G 1 VAL B 202 ? GLU B 207 ? VAL F 222 GLU F 227 G 2 SER B 225 ? ALA B 230 ? SER F 245 ALA F 250 H 1 ALA B 211 ? LEU B 213 ? ALA F 231 LEU F 233 H 2 HIS B 346 ? SER B 356 ? HIS F 366 SER F 376 H 3 GLY B 335 ? VAL B 343 ? GLY F 355 VAL F 363 H 4 TYR B 236 ? PHE B 245 ? TYR F 256 PHE F 265 H 5 ALA B 287 ? CYS B 294 ? ALA F 307 CYS F 314 H 6 SER B 304 ? MET B 309 ? SER F 324 MET F 329 I 1 PHE B 220 ? SER B 221 ? PHE F 240 SER F 241 I 2 LEU B 324 ? PHE B 326 ? LEU F 344 PHE F 346 I 3 LEU B 315 ? TRP B 317 ? LEU F 335 TRP F 337 J 1 ALA B 278 ? ALA B 279 ? ALA F 298 ALA F 299 J 2 MET B 254 ? TYR B 257 ? MET F 274 TYR F 277 J 3 ALA B 364 ? GLU B 367 ? ALA F 384 GLU F 387 K 1 SER C 19 ? PHE C 23 ? SER B 239 PHE B 243 K 2 GLU C 38 ? SER C 47 ? GLU B 258 SER B 267 K 3 THR C 79 ? THR C 87 ? THR B 299 THR B 307 K 4 LYS C 68 ? THR C 69 ? LYS B 288 THR B 289 L 1 SER C 19 ? PHE C 23 ? SER B 239 PHE B 243 L 2 GLU C 38 ? SER C 47 ? GLU B 258 SER B 267 L 3 THR C 79 ? THR C 87 ? THR B 299 THR B 307 L 4 GLU C 73 ? GLU C 74 ? GLU B 293 GLU B 294 M 1 VAL C 62 ? VAL C 64 ? VAL B 282 VAL B 284 M 2 LYS C 54 ? VAL C 59 ? LYS B 274 VAL B 279 M 3 TYR C 99 ? SER C 104 ? TYR B 319 SER B 324 M 4 ILE C 112 ? ILE C 116 ? ILE B 332 ILE B 336 N 1 GLN C 127 ? LEU C 131 ? GLN B 347 LEU B 351 N 2 GLN C 142 ? PHE C 152 ? GLN B 362 PHE B 372 N 3 PHE C 184 ? ASP C 193 ? PHE B 404 ASP B 413 N 4 TYR C 171 ? THR C 173 ? TYR B 391 THR B 393 O 1 GLN C 127 ? LEU C 131 ? GLN B 347 LEU B 351 O 2 GLN C 142 ? PHE C 152 ? GLN B 362 PHE B 372 O 3 PHE C 184 ? ASP C 193 ? PHE B 404 ASP B 413 O 4 VAL C 177 ? LEU C 178 ? VAL B 397 LEU B 398 P 1 GLN C 166 ? GLU C 168 ? GLN B 386 GLU B 388 P 2 ALA C 158 ? SER C 163 ? ALA B 378 SER B 383 P 3 PHE C 203 ? MET C 208 ? PHE B 423 MET B 428 P 4 TYR C 216 ? LEU C 221 ? TYR B 436 LEU B 441 Q 1 VAL D 202 ? GLU D 207 ? VAL E 222 GLU E 227 Q 2 SER D 225 ? ALA D 230 ? 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