data_2KQG # _entry.id 2KQG # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.391 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 2KQG pdb_00002kqg 10.2210/pdb2kqg/pdb RCSB RCSB101445 ? ? WWPDB D_1000101445 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2009-11-24 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 3 'Structure model' 1 2 2024-05-01 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' 4 3 'Structure model' 'Derived calculations' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' chem_comp_atom 2 3 'Structure model' chem_comp_bond 3 3 'Structure model' database_2 4 3 'Structure model' pdbx_nmr_software 5 3 'Structure model' pdbx_nmr_spectrometer 6 3 'Structure model' struct_site # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 3 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' 4 3 'Structure model' '_pdbx_nmr_spectrometer.model' 5 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 6 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 7 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id' # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id SPRSDE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2009-11-24 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 2KQG _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 2KJ0 _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ? # _pdbx_database_status.deposit_site BMRB _pdbx_database_status.entry_id 2KQG _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2009-11-05 _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # _pdbx_database_related.db_name PDB _pdbx_database_related.db_id 2KQH _pdbx_database_related.content_type unspecified _pdbx_database_related.details . # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Hsu, S.-T.D.' 1 'Varnai, P.' 2 'Bugaut, A.' 3 'Reszka, A.P.' 4 'Neidle, S.' 5 'Balasubramanian, S.' 6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.journal_id_ASTM _citation.country _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_id_CSD _citation.book_publisher _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'A G-rich sequence within the c-kit oncogene promoter forms a parallel G-quadruplex having asymmetric G-tetrad dynamics' J.Am.Chem.Soc. 131 13399 13409 2009 JACSAT US 0002-7863 0004 ? 19705869 10.1021/ja904007p 1 'A conserved quadruplex motif located in a transcription activation site of the human c-kit oncogene' Biochemistry 45 7854 7860 2006 BICHAW US 0006-2960 0033 ? 16784237 10.1021/bi0601510 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Hsu, S.-T.D.' 1 ? primary 'Varnai, P.' 2 ? primary 'Bugaut, A.' 3 ? primary 'Reszka, A.P.' 4 ? primary 'Neidle, S.' 5 ? primary 'Balasubramanian, S.' 6 ? 1 'Fernando, H.' 7 ? 1 'Reszka, A.P.' 8 ? 1 'Huppert, J.' 9 ? 1 'Ladame, S.' 10 ? 1 'Rankin, S.' 11 ? 1 'Venkitaraman, A.R.' 12 ? 1 'Neidle, S.' 13 ? 1 'Balasubramanian, S.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn "5'-D(*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*AP*CP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3'" 6635.259 1 ? ? ? ? 2 non-polymer syn 'POTASSIUM ION' 39.098 2 ? ? ? ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;(DC)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG) (DT) ; _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can CGGGCGGGCACGAGGGAGGGT _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2 _pdbx_entity_nonpoly.name 'POTASSIUM ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id K # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DG n 1 3 DG n 1 4 DG n 1 5 DC n 1 6 DG n 1 7 DG n 1 8 DG n 1 9 DC n 1 10 DA n 1 11 DC n 1 12 DG n 1 13 DA n 1 14 DG n 1 15 DG n 1 16 DG n 1 17 DA n 1 18 DG n 1 19 DG n 1 20 DG n 1 21 DT n # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 K non-polymer . 'POTASSIUM ION' ? 'K 1' 39.098 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC DC A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 DG 3 3 3 DG DG A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DC 5 5 5 DC DC A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG DG A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG DG A . n A 1 9 DC 9 9 9 DC DC A . n A 1 10 DA 10 10 10 DA DA A . n A 1 11 DC 11 11 11 DC DC A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n A 1 13 DA 13 13 13 DA DA A . n A 1 14 DG 14 14 14 DG DG A . n A 1 15 DG 15 15 15 DG DG A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DA 17 17 17 DA DA A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG DG A . n A 1 19 DG 19 19 19 DG DG A . n A 1 20 DG 20 20 20 DG DG A . n A 1 21 DT 21 21 21 DT DT A . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 K 1 22 22 K K A . C 2 K 1 23 23 K K A . # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.entry_id 2KQG _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 2KQG _struct.title 'A G-rich sequence within the c-kit oncogene promoter forms a parallel G-quadruplex having asymmetric G-tetrad dynamics' _struct.pdbx_model_details 'lowest energy, model 1' _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2KQG _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'c-kit2, oncogene, promoter, G-quadruplex, DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 2KQG _struct_ref.pdbx_db_accession 2KQG _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_align_begin 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code CGGGCGGGCACGAGGGAGGGT _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 2KQG _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 21 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 2KQG _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 21 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 21 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 2 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? ? metalc2 metalc ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 3 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.100 ? ? metalc3 metalc ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 3 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? ? metalc4 metalc ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 4 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? ? metalc5 metalc ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 6 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? ? metalc6 metalc ? ? A DG 7 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 7 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.788 ? ? metalc7 metalc ? ? A DG 7 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 7 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? ? metalc8 metalc ? ? A DG 8 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 8 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? ? metalc9 metalc ? ? A DG 14 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 14 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.680 ? ? metalc10 metalc ? ? A DG 15 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 15 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.680 ? ? metalc11 metalc ? ? A DG 15 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 15 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? ? metalc12 metalc ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 16 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? ? metalc13 metalc ? ? A DG 18 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 18 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? ? metalc14 metalc ? ? A DG 19 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 19 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? ? metalc15 metalc ? ? A DG 19 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 19 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.003 ? ? metalc16 metalc ? ? A DG 20 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 20 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 A DG 6 O6 ? ? A DG 2 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 A DG 6 N7 ? ? A DG 2 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DG 2 N7 ? ? ? 1_555 A DG 18 N2 ? ? A DG 2 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 A DG 18 N1 ? ? A DG 2 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 3 N1 ? ? ? 1_555 A DG 7 O6 ? ? A DG 3 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 3 N2 ? ? ? 1_555 A DG 7 N7 ? ? A DG 3 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 3 N7 ? ? ? 1_555 A DG 19 N2 ? ? A DG 3 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 A DG 19 N1 ? ? A DG 3 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 A DG 8 O6 ? ? A DG 4 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 A DG 8 N7 ? ? A DG 4 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 4 N7 ? ? ? 1_555 A DG 20 N2 ? ? A DG 4 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 A DG 20 N1 ? ? A DG 4 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 A DG 14 O6 ? ? A DG 6 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 A DG 14 N7 ? ? A DG 6 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 A DG 15 O6 ? ? A DG 7 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 A DG 15 N7 ? ? A DG 7 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 A DG 16 O6 ? ? A DG 8 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 A DG 16 N7 ? ? A DG 8 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 14 N1 ? ? ? 1_555 A DG 18 O6 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 14 N2 ? ? ? 1_555 A DG 18 N7 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 15 N1 ? ? ? 1_555 A DG 19 O6 ? ? A DG 15 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 15 N2 ? ? ? 1_555 A DG 19 N7 ? ? A DG 15 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 16 N1 ? ? ? 1_555 A DG 20 O6 ? ? A DG 16 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 16 N2 ? ? ? 1_555 A DG 20 N7 ? ? A DG 16 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 16 N1 ? ? ? 1_555 A DT 21 O4 ? ? A DG 16 A DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DT MISPAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 76.0 ? 2 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 72.3 ? 3 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 91.8 ? 4 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 121.9 ? 5 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 61.9 ? 6 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 71.2 ? 7 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 116.5 ? 8 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 157.6 ? 9 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 76.0 ? 10 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 96.2 ? 11 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 159.2 ? 12 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 96.5 ? 13 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 127.9 ? 14 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 68.2 ? 15 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 77.4 ? 16 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 72.2 ? 17 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 125.9 ? 18 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 117.7 ? 19 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 165.8 ? 20 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 76.5 ? 21 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 98.1 ? 22 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 92.0 ? 23 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 63.6 ? 24 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 153.8 ? 25 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 101.9 ? 26 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 130.2 ? 27 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 67.5 ? 28 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 74.9 ? 29 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 80.1 ? 30 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 66.1 ? 31 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 96.7 ? 32 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 126.7 ? 33 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 71.4 ? 34 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 73.6 ? 35 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 101.8 ? 36 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 159.7 ? 37 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 66.5 ? 38 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 92.1 ? 39 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 156.6 ? 40 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 115.3 ? 41 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 125.3 ? 42 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 76.4 ? 43 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 70.2 ? 44 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 65.0 ? 45 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 133.2 ? 46 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 96.5 ? 47 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 155.1 ? 48 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 63.1 ? 49 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 92.2 ? 50 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 89.4 ? 51 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 73.2 ? 52 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 155.1 ? 53 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 121.9 ? 54 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 126.8 ? 55 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 79.2 ? 56 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 76.2 ? # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A K 22 ? 9 'BINDING SITE FOR RESIDUE K A 22' AC2 Software A K 23 ? 9 'BINDING SITE FOR RESIDUE K A 23' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 9 DG A 2 ? DG A 2 . ? 1_555 ? 2 AC1 9 DG A 3 ? DG A 3 . ? 1_555 ? 3 AC1 9 DG A 6 ? DG A 6 . ? 1_555 ? 4 AC1 9 DG A 7 ? DG A 7 . ? 1_555 ? 5 AC1 9 DG A 14 ? DG A 14 . ? 1_555 ? 6 AC1 9 DG A 15 ? DG A 15 . ? 1_555 ? 7 AC1 9 DG A 18 ? DG A 18 . ? 1_555 ? 8 AC1 9 DG A 19 ? DG A 19 . ? 1_555 ? 9 AC1 9 K C . ? K A 23 . ? 1_555 ? 10 AC2 9 DG A 3 ? DG A 3 . ? 1_555 ? 11 AC2 9 DG A 4 ? DG A 4 . ? 1_555 ? 12 AC2 9 DG A 7 ? DG A 7 . ? 1_555 ? 13 AC2 9 DG A 8 ? DG A 8 . ? 1_555 ? 14 AC2 9 DG A 15 ? DG A 15 . ? 1_555 ? 15 AC2 9 DG A 16 ? DG A 16 . ? 1_555 ? 16 AC2 9 DG A 19 ? DG A 19 . ? 1_555 ? 17 AC2 9 DG A 20 ? DG A 20 . ? 1_555 ? 18 AC2 9 K B . ? K A 22 . ? 1_555 ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.52 118.90 3.62 0.60 N 2 1 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 115.50 121.90 -6.40 0.70 N 3 1 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.38 108.30 4.08 0.30 N 4 1 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 115.17 108.30 6.87 0.30 N 5 1 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 113.22 108.30 4.92 0.30 N 6 1 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 7 1 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.56 121.90 -4.34 0.70 N 8 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.12 108.30 4.82 0.30 N 9 1 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.57 119.90 -4.33 0.70 N 10 1 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 11 1 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.42 121.90 -4.48 0.70 N 12 1 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 113.47 108.30 5.17 0.30 N 13 1 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.60 117.70 3.90 0.50 N 14 1 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.52 118.60 -5.08 0.60 N 15 1 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.12 121.90 -4.78 0.70 N 16 1 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 17 1 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 112.82 108.30 4.52 0.30 N 18 1 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 19 1 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 114.42 118.60 -4.18 0.60 N 20 1 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.81 108.30 4.51 0.30 N 21 1 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 22 1 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.38 108.30 5.08 0.30 N 23 1 "O4'" A DA 17 ? ? "C1'" A DA 17 ? ? "C2'" A DA 17 ? ? 100.69 105.90 -5.21 0.80 N 24 1 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 25 1 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 26 1 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 112.63 118.60 -5.97 0.60 N 27 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 28 1 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 29 1 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 30 1 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 112.42 108.30 4.12 0.30 N 31 1 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 32 2 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.43 121.90 -4.47 0.70 N 33 2 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.32 108.30 4.02 0.30 N 34 2 C8 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 103.97 106.40 -2.43 0.40 N 35 2 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.41 119.90 -4.49 0.70 N 36 2 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 114.28 108.30 5.98 0.30 N 37 2 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 113.16 108.30 4.86 0.30 N 38 2 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 112.27 108.30 3.97 0.30 N 39 2 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.39 121.90 -4.51 0.70 N 40 2 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.91 108.30 5.61 0.30 N 41 2 "O4'" A DC 9 ? ? "C4'" A DC 9 ? ? "C3'" A DC 9 ? ? 99.85 104.50 -4.65 0.40 N 42 2 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 115.25 108.30 6.95 0.30 N 43 2 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 123.45 118.90 4.55 0.60 N 44 2 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.38 121.90 -5.52 0.70 N 45 2 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 46 2 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.26 117.00 -3.74 0.50 N 47 2 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 120.98 117.70 3.28 0.50 N 48 2 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.17 118.60 -6.43 0.60 N 49 2 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.40 121.90 -4.50 0.70 N 50 2 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 51 2 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 52 2 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.54 117.00 -3.46 0.50 N 53 2 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 54 2 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.38 118.60 -5.22 0.60 N 55 2 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 56 2 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.50 108.30 4.20 0.30 N 57 2 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 111.07 108.30 2.77 0.30 N 58 2 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.63 117.00 -3.37 0.50 N 59 2 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 60 2 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 111.76 118.60 -6.84 0.60 N 61 2 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 62 2 N1 A DG 19 ? ? C6 A DG 19 ? ? O6 A DG 19 ? ? 115.74 119.90 -4.16 0.60 N 63 2 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 112.91 108.30 4.61 0.30 N 64 2 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.34 122.90 -4.56 0.60 N 65 3 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 66 3 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.35 108.30 3.05 0.30 N 67 3 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.20 119.90 -4.70 0.70 N 68 3 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 112.98 108.30 4.68 0.30 N 69 3 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 70 3 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 112.35 108.30 4.05 0.30 N 71 3 N3 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? N2 A DG 6 ? ? 115.61 119.90 -4.29 0.70 N 72 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 73 3 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 123.10 118.90 4.20 0.60 N 74 3 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 115.71 121.90 -6.19 0.70 N 75 3 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.94 108.30 3.64 0.30 N 76 3 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 77 3 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 78 3 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 114.15 118.60 -4.45 0.60 N 79 3 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 111.13 108.30 2.83 0.30 N 80 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 81 3 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 113.03 108.30 4.73 0.30 N 82 3 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 83 3 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 84 3 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 85 3 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 86 3 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.45 108.30 5.15 0.30 N 87 3 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.17 108.30 4.87 0.30 N 88 3 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 89 3 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 90 3 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 113.19 118.60 -5.41 0.60 N 91 3 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.34 108.30 4.04 0.30 N 92 3 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 93 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? "C2'" A DC 1 ? ? 100.56 105.90 -5.34 0.80 N 94 4 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.97 108.30 4.67 0.30 N 95 4 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 117.21 108.30 8.91 0.30 N 96 4 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 97 4 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 98 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.29 108.30 4.99 0.30 N 99 4 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 100 4 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 111.63 108.30 3.33 0.30 N 101 4 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 102 4 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 110.94 108.30 2.64 0.30 N 103 4 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 104 4 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 105 4 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 114.43 118.60 -4.17 0.60 N 106 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 107 4 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 108 4 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.30 117.00 -3.70 0.50 N 109 4 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 110 4 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.94 118.60 -5.66 0.60 N 111 4 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 112 4 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.63 108.30 3.33 0.30 N 113 4 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 111.84 108.30 3.54 0.30 N 114 4 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 115 4 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.77 117.70 4.07 0.50 N 116 4 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 114.51 118.60 -4.09 0.60 N 117 4 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 118 4 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 113.11 108.30 4.81 0.30 N 119 4 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 120 4 N3 A DT 21 ? ? C2 A DT 21 ? ? O2 A DT 21 ? ? 118.68 122.30 -3.62 0.60 N 121 4 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.02 122.90 -3.88 0.60 N 122 5 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 123 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.02 121.90 -4.88 0.70 N 124 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.47 108.30 4.17 0.30 N 125 5 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 114.51 108.30 6.21 0.30 N 126 5 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.86 108.30 4.56 0.30 N 127 5 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.91 108.30 2.61 0.30 N 128 5 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.26 121.90 -4.64 0.70 N 129 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 130 5 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 112.37 108.30 4.07 0.30 N 131 5 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.96 121.90 -4.94 0.70 N 132 5 "C3'" A DC 9 ? ? "O3'" A DC 9 ? ? P A DA 10 ? ? 127.49 119.70 7.79 1.20 Y 133 5 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 134 5 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.15 117.00 -3.85 0.50 N 135 5 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.67 117.70 3.97 0.50 N 136 5 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.15 118.60 -6.45 0.60 N 137 5 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 138 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 116.75 108.30 8.45 0.30 N 139 5 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 113.83 108.30 5.53 0.30 N 140 5 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 141 5 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 114.07 118.60 -4.53 0.60 N 142 5 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 115.22 108.30 6.92 0.30 N 143 5 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? "C2'" A DG 15 ? ? 100.48 105.90 -5.42 0.80 N 144 5 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.60 108.30 4.30 0.30 N 145 5 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.30 108.30 5.00 0.30 N 146 5 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 147 5 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 114.15 118.60 -4.45 0.60 N 148 5 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 149 5 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 111.97 108.30 3.67 0.30 N 150 5 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 151 5 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 152 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.27 121.90 -4.63 0.70 N 153 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.50 108.30 4.20 0.30 N 154 6 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 115.43 108.30 7.13 0.30 N 155 6 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 156 6 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 113.15 108.30 4.85 0.30 N 157 6 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.76 121.90 -5.14 0.70 N 158 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 159 6 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.19 121.90 -5.71 0.70 N 160 6 "C3'" A DC 9 ? ? "O3'" A DC 9 ? ? P A DA 10 ? ? 127.35 119.70 7.65 1.20 Y 161 6 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 112.41 108.30 4.11 0.30 N 162 6 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.30 117.00 -3.70 0.50 N 163 6 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 164 6 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.89 118.60 -5.71 0.60 N 165 6 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 110.46 108.30 2.16 0.30 N 166 6 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 167 6 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 168 6 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.36 117.00 -3.64 0.50 N 169 6 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 170 6 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.12 118.60 -6.48 0.60 N 171 6 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 172 6 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.85 108.30 4.55 0.30 N 173 6 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.72 108.30 6.42 0.30 N 174 6 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.33 117.00 -3.67 0.50 N 175 6 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.75 117.70 4.05 0.50 N 176 6 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 112.01 118.60 -6.59 0.60 N 177 6 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 178 6 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 110.94 108.30 2.64 0.30 N 179 6 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 180 6 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 181 6 N3 A DT 21 ? ? C2 A DT 21 ? ? O2 A DT 21 ? ? 118.64 122.30 -3.66 0.60 N 182 6 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.98 122.90 -3.92 0.60 N 183 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.81 121.90 -5.09 0.70 N 184 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.77 108.30 4.47 0.30 N 185 7 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 115.01 108.30 6.71 0.30 N 186 7 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.46 108.30 4.16 0.30 N 187 7 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.64 121.90 -4.26 0.70 N 188 7 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.86 108.30 4.56 0.30 N 189 7 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 190 7 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.80 121.90 -5.10 0.70 N 191 7 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 192 7 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 193 7 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.53 118.60 -5.07 0.60 N 194 7 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 195 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.96 108.30 2.66 0.30 N 196 7 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 113.32 108.30 5.02 0.30 N 197 7 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 198 7 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 199 7 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 111.97 118.60 -6.63 0.60 N 200 7 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 201 7 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.96 108.30 5.66 0.30 N 202 7 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 112.87 108.30 4.57 0.30 N 203 7 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 204 7 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.63 117.70 3.93 0.50 N 205 7 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 112.90 118.60 -5.70 0.60 N 206 7 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.03 108.30 2.73 0.30 N 207 7 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 208 7 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 112.17 108.30 3.87 0.30 N 209 7 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 110.46 108.30 2.16 0.30 N 210 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 211 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.63 121.90 -4.27 0.70 N 212 8 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.46 108.30 4.16 0.30 N 213 8 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 114.23 108.30 5.93 0.30 N 214 8 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.33 108.30 3.03 0.30 N 215 8 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.46 121.90 -4.44 0.70 N 216 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 217 8 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.65 108.30 2.35 0.30 N 218 8 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.58 121.90 -5.32 0.70 N 219 8 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 220 8 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.31 117.00 -3.69 0.50 N 221 8 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 222 8 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.44 118.60 -6.16 0.60 N 223 8 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.45 121.90 -4.45 0.70 N 224 8 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.05 108.30 3.75 0.30 N 225 8 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 226 8 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 227 8 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.04 117.70 3.34 0.50 N 228 8 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.84 118.60 -4.76 0.60 N 229 8 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.93 108.30 5.63 0.30 N 230 8 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.99 108.30 5.69 0.30 N 231 8 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.55 117.00 -3.45 0.50 N 232 8 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 233 8 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 114.13 118.60 -4.47 0.60 N 234 8 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.16 108.30 3.86 0.30 N 235 8 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 236 8 C5 A DG 20 ? ? C6 A DG 20 ? ? N1 A DG 20 ? ? 114.59 111.50 3.09 0.50 N 237 8 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.03 122.90 -3.87 0.60 N 238 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.18 121.90 -4.72 0.70 N 239 9 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.08 108.30 4.78 0.30 N 240 9 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 117.31 108.30 9.01 0.30 N 241 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 113.43 108.30 5.13 0.30 N 242 9 N3 A DG 4 ? ? C2 A DG 4 ? ? N2 A DG 4 ? ? 115.18 119.90 -4.72 0.70 N 243 9 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.55 108.30 3.25 0.30 N 244 9 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 122.79 118.90 3.89 0.60 N 245 9 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.09 121.90 -5.81 0.70 N 246 9 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 247 9 "O4'" A DC 9 ? ? "C4'" A DC 9 ? ? "C3'" A DC 9 ? ? 100.10 104.50 -4.40 0.40 N 248 9 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 111.67 108.30 3.37 0.30 N 249 9 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 123.45 118.90 4.55 0.60 N 250 9 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 115.83 121.90 -6.07 0.70 N 251 9 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 110.74 108.30 2.44 0.30 N 252 9 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 120.95 117.70 3.25 0.50 N 253 9 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 114.06 118.60 -4.54 0.60 N 254 9 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 114.97 108.30 6.67 0.30 N 255 9 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.66 121.90 -4.24 0.70 N 256 9 N3 A DC 11 ? ? C4 A DC 11 ? ? N4 A DC 11 ? ? 113.65 118.00 -4.35 0.70 N 257 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.61 108.30 3.31 0.30 N 258 9 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 259 9 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 260 9 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.47 118.60 -5.13 0.60 N 261 9 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 262 9 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.36 108.30 5.06 0.30 N 263 9 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.09 108.30 5.79 0.30 N 264 9 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 265 9 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 266 9 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 113.08 118.60 -5.52 0.60 N 267 9 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 112.38 108.30 4.08 0.30 N 268 9 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.44 108.30 4.14 0.30 N 269 9 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 111.47 108.30 3.17 0.30 N 270 9 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 112.06 108.30 3.76 0.30 N 271 9 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 272 10 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.50 121.90 -4.40 0.70 N 273 10 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.84 108.30 4.54 0.30 N 274 10 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 115.70 108.30 7.40 0.30 N 275 10 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.62 121.90 -4.28 0.70 N 276 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.41 108.30 4.11 0.30 N 277 10 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 103.64 108.00 -4.36 0.70 N 278 10 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 112.80 108.30 4.50 0.30 N 279 10 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.57 121.90 -5.33 0.70 N 280 10 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.90 108.30 3.60 0.30 N 281 10 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 282 10 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.05 118.60 -5.55 0.60 N 283 10 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.52 121.90 -4.38 0.70 N 284 10 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 285 10 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 112.69 108.30 4.39 0.30 N 286 10 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 287 10 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 288 10 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.67 118.60 -5.93 0.60 N 289 10 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 111.39 108.30 3.09 0.30 N 290 10 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.93 108.30 4.63 0.30 N 291 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.63 108.30 5.33 0.30 N 292 10 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.45 117.00 -3.55 0.50 N 293 10 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 294 10 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 113.19 118.60 -5.41 0.60 N 295 10 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 296 10 N3 A DG 19 ? ? C2 A DG 19 ? ? N2 A DG 19 ? ? 115.30 119.90 -4.60 0.70 N 297 10 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N 298 10 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 112.24 108.30 3.94 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DC A 1 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 2 1 DG A 2 ? ? 0.141 'SIDE CHAIN' 3 1 DG A 3 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 4 1 DG A 4 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 5 1 DC A 9 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 6 1 DA A 13 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 7 1 DG A 20 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 8 2 DC A 1 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 9 2 DG A 2 ? ? 0.246 'SIDE CHAIN' 10 2 DG A 4 ? ? 0.138 'SIDE CHAIN' 11 2 DG A 8 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 12 2 DC A 9 ? ? 0.131 'SIDE CHAIN' 13 2 DA A 13 ? ? 0.106 'SIDE CHAIN' 14 3 DG A 2 ? ? 0.187 'SIDE CHAIN' 15 3 DG A 4 ? ? 0.164 'SIDE CHAIN' 16 3 DC A 5 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 17 3 DG A 6 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 18 3 DG A 8 ? ? 0.102 'SIDE CHAIN' 19 3 DA A 10 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 20 4 DC A 1 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 21 4 DG A 2 ? ? 0.201 'SIDE CHAIN' 22 4 DG A 4 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 23 4 DC A 5 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 24 4 DG A 6 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 25 4 DG A 8 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 26 4 DC A 9 ? ? 0.094 'SIDE CHAIN' 27 4 DC A 11 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 28 4 DG A 12 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 29 5 DC A 1 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 30 5 DG A 2 ? ? 0.152 'SIDE CHAIN' 31 5 DG A 3 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 32 6 DG A 2 ? ? 0.168 'SIDE CHAIN' 33 6 DG A 4 ? ? 0.120 'SIDE CHAIN' 34 6 DC A 5 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 35 6 DG A 6 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 36 7 DC A 1 ? ? 0.123 'SIDE CHAIN' 37 7 DG A 2 ? ? 0.196 'SIDE CHAIN' 38 7 DG A 3 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 39 7 DG A 4 ? ? 0.125 'SIDE CHAIN' 40 7 DG A 7 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 41 7 DG A 8 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 42 7 DA A 10 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' 43 7 DG A 12 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 44 8 DG A 2 ? ? 0.131 'SIDE CHAIN' 45 8 DG A 3 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 46 8 DG A 4 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 47 8 DG A 7 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 48 8 DA A 17 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 49 8 DG A 19 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 50 9 DC A 1 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 51 9 DG A 2 ? ? 0.170 'SIDE CHAIN' 52 9 DG A 3 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 53 9 DG A 4 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 54 9 DG A 6 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 55 9 DG A 8 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 56 9 DT A 21 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 57 10 DC A 1 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 58 10 DG A 2 ? ? 0.209 'SIDE CHAIN' 59 10 DG A 3 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 60 10 DG A 4 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 61 10 DG A 12 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 62 10 DA A 13 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 63 10 DG A 14 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 64 10 DG A 15 ? ? 0.050 'SIDE CHAIN' # _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the least restraint violations' _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 100 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2KQG _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer 1 _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.entry_id 2KQG _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # _pdbx_nmr_sample_details.contents '200 micro-M DNA; 10mM potassium phosphate; 93% H2O/7% D2O' _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '93% H2O/7% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id ;DNA (5'-D(*(DC5)P*DGP*DGP*DGP*DCP*DGP*DGP*DGP*DCP*DAP*DCP*DGP*DAP*DGP*DGP*DGP*DAP*DGP*DGP*DGP*(DT3))-3')-1 ; 200 ? uM ? 1 'potassium phosphate-2' 10 ? mM ? 1 # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 10 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure ambient _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 2 1 '2D 1H-1H TOCSY' 1 3 1 '2D DQF-COSY' # _pdbx_nmr_refine.entry_id 2KQG _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing, molecular dynamics' _pdbx_nmr_refine.details 'Explicit water refinement including potassium ions within the G-tetrads.' _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # loop_ _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.ordinal Goddard 'chemical shift assignment' Sparky ? 1 'Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, Pfeifer and Bax' processing NMRPipe ? 2 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollm' 'structure solution' Amber ? 3 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollm' refinement Amber ? 4 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 K K K N N 144 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 # _ndb_struct_conf_na.entry_id 2KQG _ndb_struct_conf_na.feature 'quadruple helix' # _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 700 _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.model AVANCE _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.type 'Bruker Avance' # _atom_sites.entry_id 2KQG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H K N O P # loop_