data_2KTT # _entry.id 2KTT # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.391 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 2KTT pdb_00002ktt 10.2210/pdb2ktt/pdb RCSB RCSB101564 ? ? WWPDB D_1000101564 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2010-03-09 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 3 'Structure model' 1 2 2024-05-01 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' 4 3 'Structure model' 'Derived calculations' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' chem_comp_atom 2 3 'Structure model' chem_comp_bond 3 3 'Structure model' database_2 4 3 'Structure model' pdbx_nmr_software 5 3 'Structure model' pdbx_nmr_spectrometer 6 3 'Structure model' struct_conn 7 3 'Structure model' struct_ref_seq 8 3 'Structure model' struct_site # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 3 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' 4 3 'Structure model' '_pdbx_nmr_spectrometer.model' 5 3 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 6 3 'Structure model' '_struct_ref_seq.db_align_beg' 7 3 'Structure model' '_struct_ref_seq.db_align_end' 8 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 9 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 10 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id' # _pdbx_database_status.deposit_site BMRB _pdbx_database_status.entry_id 2KTT _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2010-02-08 _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Rettig, M.' 1 'Weingarth, M.' 2 'Langel, W.' 3 'Kamal, A.' 4 'Kumar, P.P.' 5 'Weisz, K.' 6 # _citation.id primary _citation.title 'Solution structure of a covalently bound pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-benzimidazole hybrid to a 10mer DNA duplex.' _citation.journal_abbrev Biochemistry _citation.journal_volume 48 _citation.page_first 12223 _citation.page_last 12232 _citation.year 2009 _citation.journal_id_ASTM BICHAW _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0006-2960 _citation.journal_id_CSD 0033 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 19911838 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1021/bi901655t # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Rettig, M.' 1 ? primary 'Weingarth, M.' 2 ? primary 'Langel, W.' 3 ? primary 'Kamal, A.' 4 ? primary 'Kumar, P.P.' 5 ? primary 'Weisz, K.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn "5'-D(*AP*AP*CP*AP*AP*TP*TP*GP*TP*T)-3'" 3043.029 2 ? ? ? ? 2 non-polymer syn ;(11aS)-7-methoxy-8-(3-{4-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]phenoxy}propoxy)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-one ; 596.719 1 ? ? ? ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code '(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DT)(DT)' _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can AACAATTGTT _entity_poly.pdbx_strand_id A,B _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2 _pdbx_entity_nonpoly.name ;(11aS)-7-methoxy-8-(3-{4-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]phenoxy}propoxy)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-one ; _pdbx_entity_nonpoly.comp_id PBH # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DA n 1 2 DA n 1 3 DC n 1 4 DA n 1 5 DA n 1 6 DT n 1 7 DT n 1 8 DG n 1 9 DT n 1 10 DT n # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 PBH non-polymer . ;(11aS)-7-methoxy-8-(3-{4-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]phenoxy}propoxy)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-one ; ? 'C34 H40 N6 O4' 596.719 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DA 1 1 1 DA DA A . n A 1 2 DA 2 2 2 DA DA A . n A 1 3 DC 3 3 3 DC DC A . n A 1 4 DA 4 4 4 DA DA A . n A 1 5 DA 5 5 5 DA DA A . n A 1 6 DT 6 6 6 DT DT A . n A 1 7 DT 7 7 7 DT DT A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG DG A . n A 1 9 DT 9 9 9 DT DT A . n A 1 10 DT 10 10 10 DT DT A . n B 1 1 DA 1 11 11 DA DA B . n B 1 2 DA 2 12 12 DA DA B . n B 1 3 DC 3 13 13 DC DC B . n B 1 4 DA 4 14 14 DA DA B . n B 1 5 DA 5 15 15 DA DA B . n B 1 6 DT 6 16 16 DT DT B . n B 1 7 DT 7 17 17 DT DT B . n B 1 8 DG 8 18 18 DG DG B . n B 1 9 DT 9 19 19 DT DT B . n B 1 10 DT 10 20 20 DT DT B . n # _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id C _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 2 _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id PBH _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 22 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 22 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id PBH _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id PBH _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id A _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code . # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.entry_id 2KTT _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 2KTT _struct.title 'Solution Structure of a Covalently Bound Pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-Benzimidazole Hybrid to a 10mer DNA Duplex' _struct.pdbx_model_details 'lowest energy, model 1' _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2KTT _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'DNA duplex, Pyrrolobenzodiazepine, PBD-benzimidazole hybrid, DNA-drug complex, DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 2KTT _struct_ref.pdbx_db_accession 2KTT _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_align_begin ? _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2KTT A 1 ? 10 ? 2KTT 1 ? 10 ? 1 10 2 1 2KTT B 1 ? 10 ? 2KTT 11 ? 20 ? 11 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale none ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 C PBH . C11 ? ? A DG 8 A PBH 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DA 1 N1 ? ? ? 1_555 B DT 10 N3 ? ? A DA 1 B DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DA 1 N6 ? ? ? 1_555 B DT 10 O4 ? ? A DA 1 B DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DA 2 N1 ? ? ? 1_555 B DT 9 N3 ? ? A DA 2 B DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DA 2 N6 ? ? ? 1_555 B DT 9 O4 ? ? A DA 2 B DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DC 3 N3 ? ? ? 1_555 B DG 8 N1 ? ? A DC 3 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DC 3 N4 ? ? ? 1_555 B DG 8 O6 ? ? A DC 3 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 3 O2 ? ? ? 1_555 B DG 8 N2 ? ? A DC 3 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DA 4 N1 ? ? ? 1_555 B DT 7 N3 ? ? A DA 4 B DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DA 4 N6 ? ? ? 1_555 B DT 7 O4 ? ? A DA 4 B DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DA 5 N1 ? ? ? 1_555 B DT 6 N3 ? ? A DA 5 B DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DA 5 N6 ? ? ? 1_555 B DT 6 O4 ? ? A DA 5 B DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DT 6 N3 ? ? ? 1_555 B DA 5 N1 ? ? A DT 6 B DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DT 6 O4 ? ? ? 1_555 B DA 5 N6 ? ? A DT 6 B DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DT 7 N3 ? ? ? 1_555 B DA 4 N1 ? ? A DT 7 B DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DT 7 O4 ? ? ? 1_555 B DA 4 N6 ? ? A DT 7 B DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 B DC 3 N3 ? ? A DG 8 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 B DC 3 O2 ? ? A DG 8 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 8 O6 ? ? ? 1_555 B DC 3 N4 ? ? A DG 8 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DT 9 N3 ? ? ? 1_555 B DA 2 N1 ? ? A DT 9 B DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DT 9 O4 ? ? ? 1_555 B DA 2 N6 ? ? A DT 9 B DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DT 10 N3 ? ? ? 1_555 B DA 1 N1 ? ? A DT 10 B DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DT 10 O4 ? ? ? 1_555 B DA 1 N6 ? ? A DT 10 B DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A PBH 22 ? 12 'BINDING SITE FOR RESIDUE PBH A 22' 1 ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 12 DA A 4 ? DA A 4 . ? 1_555 ? 2 AC1 12 DT A 6 ? DT A 6 . ? 1_555 ? 3 AC1 12 DT A 7 ? DT A 7 . ? 1_555 ? 4 AC1 12 DG A 8 ? DG A 8 . ? 1_555 ? 5 AC1 12 DT A 9 ? DT A 9 . ? 1_555 ? 6 AC1 12 DC B 3 ? DC B 13 . ? 1_555 ? 7 AC1 12 DA B 4 ? DA B 14 . ? 1_555 ? 8 AC1 12 DA B 5 ? DA B 15 . ? 1_555 ? 9 AC1 12 DT B 6 ? DT B 16 . ? 1_555 ? 10 AC1 12 DT B 7 ? DT B 17 . ? 1_555 ? 11 AC1 12 DG B 8 ? DG B 18 . ? 1_555 ? 12 AC1 12 DT B 9 ? DT B 19 . ? 1_555 ? # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 "HO5'" _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 B _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 DA _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 11 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 OP1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 B _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 DA _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 12 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 1.56 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 2 C8 A DA 1 ? ? N9 A DA 1 ? ? 1.451 1.373 0.078 0.008 N 2 2 N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? 1.437 1.344 0.093 0.006 N 3 2 C6 A DA 2 ? ? N6 A DA 2 ? ? 1.269 1.335 -0.066 0.008 N 4 2 P A DC 3 ? ? "O5'" A DC 3 ? ? 1.524 1.593 -0.069 0.010 N 5 2 N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? 1.271 1.335 -0.064 0.007 N 6 2 C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 1.308 1.351 -0.043 0.007 N 7 2 N9 A DA 4 ? ? C4 A DA 4 ? ? 1.420 1.374 0.046 0.006 N 8 2 C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 1.275 1.335 -0.060 0.008 N 9 2 C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 1.273 1.351 -0.078 0.007 N 10 2 C8 A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 1.319 1.373 -0.054 0.008 N 11 2 "C3'" A DT 6 ? ? "C2'" A DT 6 ? ? 1.612 1.518 0.094 0.012 N 12 2 C5 A DT 6 ? ? C6 A DT 6 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.007 N 13 2 P A DT 7 ? ? "O5'" A DT 7 ? ? 1.694 1.593 0.101 0.010 N 14 2 "C4'" A DT 7 ? ? "C3'" A DT 7 ? ? 1.610 1.529 0.081 0.010 N 15 2 N1 A DT 7 ? ? C2 A DT 7 ? ? 1.432 1.376 0.056 0.008 N 16 2 C5 A DT 7 ? ? C6 A DT 7 ? ? 1.394 1.339 0.055 0.007 N 17 2 "O3'" A DT 7 ? ? P A DG 8 ? ? 1.533 1.607 -0.074 0.012 Y 18 2 N3 A DG 8 ? ? C4 A DG 8 ? ? 1.398 1.350 0.048 0.007 N 19 2 N1 A DT 9 ? ? C2 A DT 9 ? ? 1.442 1.376 0.066 0.008 N 20 2 "C5'" A DT 10 ? ? "C4'" A DT 10 ? ? 1.565 1.512 0.053 0.007 N 21 2 N1 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? 1.321 1.376 -0.055 0.008 N 22 2 C2 A DT 10 ? ? N3 A DT 10 ? ? 1.291 1.373 -0.082 0.008 N 23 2 C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 1.540 1.496 0.044 0.006 N 24 2 C5 B DA 11 ? ? C6 B DA 11 ? ? 1.472 1.406 0.066 0.009 N 25 2 "C5'" B DA 12 ? ? "C4'" B DA 12 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 26 2 "C4'" B DA 12 ? ? "C3'" B DA 12 ? ? 1.611 1.529 0.082 0.010 N 27 2 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 1.473 1.406 0.067 0.009 N 28 2 C5 B DA 12 ? ? N7 B DA 12 ? ? 1.437 1.388 0.049 0.006 N 29 2 C2 B DC 13 ? ? N3 B DC 13 ? ? 1.289 1.353 -0.064 0.008 N 30 2 N3 B DC 13 ? ? C4 B DC 13 ? ? 1.292 1.335 -0.043 0.007 N 31 2 "C4'" B DA 14 ? ? "C3'" B DA 14 ? ? 1.604 1.529 0.075 0.010 N 32 2 P B DA 15 ? ? "O5'" B DA 15 ? ? 1.518 1.593 -0.075 0.010 N 33 2 "C2'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? 1.588 1.519 0.069 0.010 N 34 2 N3 B DA 15 ? ? C4 B DA 15 ? ? 1.413 1.344 0.069 0.006 N 35 2 "O4'" B DT 16 ? ? "C4'" B DT 16 ? ? 1.368 1.446 -0.078 0.010 N 36 2 C5 B DT 16 ? ? C6 B DT 16 ? ? 1.388 1.339 0.049 0.007 N 37 2 C5 B DT 16 ? ? C7 B DT 16 ? ? 1.444 1.496 -0.052 0.006 N 38 2 "C5'" B DT 17 ? ? "C4'" B DT 17 ? ? 1.569 1.512 0.057 0.007 N 39 2 N1 B DT 17 ? ? C2 B DT 17 ? ? 1.426 1.376 0.050 0.008 N 40 2 C5 B DT 17 ? ? C6 B DT 17 ? ? 1.383 1.339 0.044 0.007 N 41 2 C2 B DT 17 ? ? O2 B DT 17 ? ? 1.273 1.220 0.053 0.008 N 42 2 C6 B DG 18 ? ? N1 B DG 18 ? ? 1.349 1.391 -0.042 0.007 N 43 2 N1 B DT 19 ? ? C2 B DT 19 ? ? 1.439 1.376 0.063 0.008 N 44 2 "C2'" B DT 20 ? ? "C1'" B DT 20 ? ? 1.584 1.519 0.065 0.010 N 45 3 "O4'" A DA 2 ? ? "C4'" A DA 2 ? ? 1.369 1.446 -0.077 0.010 N 46 3 N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? 1.396 1.344 0.052 0.006 N 47 3 N9 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? 1.338 1.374 -0.036 0.006 N 48 3 "C5'" A DC 3 ? ? "C4'" A DC 3 ? ? 1.619 1.512 0.107 0.007 N 49 3 C4 A DC 3 ? ? N4 A DC 3 ? ? 1.246 1.335 -0.089 0.009 N 50 3 "O3'" A DA 4 ? ? "C3'" A DA 4 ? ? 1.380 1.419 -0.039 0.006 N 51 3 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 1.466 1.406 0.060 0.009 N 52 3 C5 A DA 4 ? ? N7 A DA 4 ? ? 1.433 1.388 0.045 0.006 N 53 3 C8 A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 1.427 1.373 0.054 0.008 N 54 3 "C5'" A DA 5 ? ? "C4'" A DA 5 ? ? 1.556 1.512 0.044 0.007 N 55 3 P A DT 6 ? ? "O5'" A DT 6 ? ? 1.696 1.593 0.103 0.010 N 56 3 C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 1.568 1.496 0.072 0.006 N 57 3 N3 A DT 7 ? ? C4 A DT 7 ? ? 1.441 1.382 0.059 0.008 N 58 3 C5 A DT 7 ? ? C6 A DT 7 ? ? 1.392 1.339 0.053 0.007 N 59 3 C6 A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 1.422 1.378 0.044 0.007 N 60 3 "C5'" A DG 8 ? ? "C4'" A DG 8 ? ? 1.561 1.512 0.049 0.007 N 61 3 "O4'" A DG 8 ? ? "C4'" A DG 8 ? ? 1.379 1.446 -0.067 0.010 N 62 3 C2 A DG 8 ? ? N3 A DG 8 ? ? 1.383 1.323 0.060 0.008 N 63 3 C5 A DG 8 ? ? C6 A DG 8 ? ? 1.493 1.419 0.074 0.010 N 64 3 "C2'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? 1.442 1.518 -0.076 0.010 N 65 3 "O3'" A DT 9 ? ? "C3'" A DT 9 ? ? 1.376 1.419 -0.043 0.006 N 66 3 C5 A DT 9 ? ? C6 A DT 9 ? ? 1.390 1.339 0.051 0.007 N 67 3 "C5'" B DA 11 ? ? "C4'" B DA 11 ? ? 1.563 1.512 0.051 0.007 N 68 3 "C2'" B DA 11 ? ? "C1'" B DA 11 ? ? 1.457 1.518 -0.061 0.010 N 69 3 C5 B DA 11 ? ? N7 B DA 11 ? ? 1.464 1.388 0.076 0.006 N 70 3 N7 B DA 11 ? ? C8 B DA 11 ? ? 1.266 1.311 -0.045 0.007 N 71 3 "O3'" B DA 11 ? ? P B DA 12 ? ? 1.526 1.607 -0.081 0.012 Y 72 3 "O3'" B DA 12 ? ? "C3'" B DA 12 ? ? 1.351 1.419 -0.068 0.006 N 73 3 N3 B DA 12 ? ? C4 B DA 12 ? ? 1.412 1.344 0.068 0.006 N 74 3 C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 1.291 1.351 -0.060 0.007 N 75 3 P B DC 13 ? ? "O5'" B DC 13 ? ? 1.532 1.593 -0.061 0.010 N 76 3 "C5'" B DC 13 ? ? "C4'" B DC 13 ? ? 1.564 1.512 0.052 0.007 N 77 3 "C2'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? 1.591 1.519 0.072 0.010 N 78 3 P B DA 14 ? ? "O5'" B DA 14 ? ? 1.496 1.593 -0.097 0.010 N 79 3 "O3'" B DA 14 ? ? "C3'" B DA 14 ? ? 1.372 1.419 -0.047 0.006 N 80 3 C2 B DA 14 ? ? N3 B DA 14 ? ? 1.266 1.331 -0.065 0.009 N 81 3 C5 B DA 14 ? ? N7 B DA 14 ? ? 1.430 1.388 0.042 0.006 N 82 3 C8 B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 1.430 1.373 0.057 0.008 N 83 3 N9 B DA 15 ? ? C4 B DA 15 ? ? 1.419 1.374 0.045 0.006 N 84 3 C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 1.271 1.335 -0.064 0.008 N 85 3 "O3'" B DA 15 ? ? P B DT 16 ? ? 1.687 1.607 0.080 0.012 Y 86 3 "O3'" B DT 16 ? ? "C3'" B DT 16 ? ? 1.351 1.419 -0.068 0.006 N 87 3 N1 B DT 16 ? ? C2 B DT 16 ? ? 1.429 1.376 0.053 0.008 N 88 3 C5 B DT 16 ? ? C6 B DT 16 ? ? 1.389 1.339 0.050 0.007 N 89 3 C5 B DT 16 ? ? C7 B DT 16 ? ? 1.555 1.496 0.059 0.006 N 90 3 C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 1.534 1.496 0.038 0.006 N 91 3 "O3'" B DT 17 ? ? P B DG 18 ? ? 1.680 1.607 0.073 0.012 Y 92 3 "O3'" B DG 18 ? ? "C3'" B DG 18 ? ? 1.376 1.419 -0.043 0.006 N 93 3 C8 B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 1.328 1.374 -0.046 0.007 N 94 3 "C2'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? 1.579 1.519 0.060 0.010 N 95 3 N1 B DT 20 ? ? C2 B DT 20 ? ? 1.447 1.376 0.071 0.008 N 96 3 C2 B DT 20 ? ? N3 B DT 20 ? ? 1.318 1.373 -0.055 0.008 N 97 3 C2 B DT 20 ? ? O2 B DT 20 ? ? 1.280 1.220 0.060 0.008 N 98 4 "C5'" A DA 1 ? ? "C4'" A DA 1 ? ? 1.560 1.512 0.048 0.007 N 99 4 "C4'" A DA 1 ? ? "C3'" A DA 1 ? ? 1.611 1.529 0.082 0.010 N 100 4 N3 A DA 1 ? ? C4 A DA 1 ? ? 1.419 1.344 0.075 0.006 N 101 4 N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? 1.382 1.344 0.038 0.006 N 102 4 C6 A DA 2 ? ? N1 A DA 2 ? ? 1.308 1.351 -0.043 0.007 N 103 4 N9 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? 1.429 1.374 0.055 0.006 N 104 4 "C5'" A DC 3 ? ? "C4'" A DC 3 ? ? 1.573 1.512 0.061 0.007 N 105 4 N1 A DC 3 ? ? C6 A DC 3 ? ? 1.421 1.367 0.054 0.006 N 106 4 C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 1.277 1.335 -0.058 0.008 N 107 4 C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 1.257 1.335 -0.078 0.008 N 108 4 "C5'" A DT 6 ? ? "C4'" A DT 6 ? ? 1.557 1.512 0.045 0.007 N 109 4 N1 A DT 6 ? ? C2 A DT 6 ? ? 1.445 1.376 0.069 0.008 N 110 4 C5 A DT 6 ? ? C6 A DT 6 ? ? 1.426 1.339 0.087 0.007 N 111 4 "C2'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? 1.580 1.519 0.061 0.010 N 112 4 N1 A DT 9 ? ? C2 A DT 9 ? ? 1.430 1.376 0.054 0.008 N 113 4 C5 A DT 9 ? ? C6 A DT 9 ? ? 1.396 1.339 0.057 0.007 N 114 4 "O4'" A DT 10 ? ? "C4'" A DT 10 ? ? 1.381 1.446 -0.065 0.010 N 115 4 N3 A DT 10 ? ? C4 A DT 10 ? ? 1.311 1.382 -0.071 0.008 N 116 4 C8 B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? 1.432 1.373 0.059 0.008 N 117 4 "C5'" B DA 12 ? ? "C4'" B DA 12 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 118 4 "O3'" B DA 12 ? ? "C3'" B DA 12 ? ? 1.360 1.419 -0.059 0.006 N 119 4 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? 1.437 1.383 0.054 0.007 N 120 4 C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 1.288 1.351 -0.063 0.007 N 121 4 N9 B DA 12 ? ? C4 B DA 12 ? ? 1.310 1.374 -0.064 0.006 N 122 4 C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 1.278 1.335 -0.057 0.008 N 123 4 "C5'" B DC 13 ? ? "C4'" B DC 13 ? ? 1.566 1.512 0.054 0.007 N 124 4 C8 B DA 14 ? ? N9 B DA 14 ? ? 1.422 1.373 0.049 0.008 N 125 4 C5 B DA 15 ? ? N7 B DA 15 ? ? 1.349 1.388 -0.039 0.006 N 126 4 C5 B DT 17 ? ? C6 B DT 17 ? ? 1.387 1.339 0.048 0.007 N 127 4 "O3'" B DG 18 ? ? "C3'" B DG 18 ? ? 1.356 1.419 -0.063 0.006 N 128 4 N3 B DG 18 ? ? C4 B DG 18 ? ? 1.415 1.350 0.065 0.007 N 129 4 C5 B DG 18 ? ? C6 B DG 18 ? ? 1.485 1.419 0.066 0.010 N 130 4 P B DT 19 ? ? "O5'" B DT 19 ? ? 1.695 1.593 0.102 0.010 N 131 4 "C5'" B DT 19 ? ? "C4'" B DT 19 ? ? 1.586 1.512 0.074 0.007 N 132 4 "O4'" B DT 20 ? ? "C4'" B DT 20 ? ? 1.360 1.446 -0.086 0.010 N 133 4 C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 1.541 1.496 0.045 0.006 N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? N9 A DA 1 ? ? 112.04 108.30 3.74 0.30 N 2 1 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.05 117.70 3.35 0.50 N 3 1 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 4 1 C5 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N1 A DA 2 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 5 1 N1 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N6 A DA 2 ? ? 113.42 118.60 -5.18 0.60 N 6 1 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 111.55 108.30 3.25 0.30 N 7 1 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 117.30 121.90 -4.60 0.70 N 8 1 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 9 1 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 10 1 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 11 1 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.38 118.60 -5.22 0.60 N 12 1 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.47 117.00 -3.53 0.50 N 13 1 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 14 1 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.09 118.60 -6.51 0.60 N 15 1 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 16 1 N3 A DT 7 ? ? C2 A DT 7 ? ? O2 A DT 7 ? ? 118.54 122.30 -3.76 0.60 N 17 1 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 111.86 108.30 3.56 0.30 N 18 1 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.75 108.30 3.45 0.30 N 19 1 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.08 122.90 -3.82 0.60 N 20 1 "O4'" B DA 11 ? ? "C1'" B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 21 1 C4 B DA 11 ? ? C5 B DA 11 ? ? C6 B DA 11 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 22 1 C5 B DA 11 ? ? C6 B DA 11 ? ? N1 B DA 11 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 23 1 N1 B DA 11 ? ? C6 B DA 11 ? ? N6 B DA 11 ? ? 113.25 118.60 -5.35 0.60 N 24 1 "O4'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? N9 B DA 12 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 25 1 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.41 117.00 -3.59 0.50 N 26 1 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 27 1 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 112.70 118.60 -5.90 0.60 N 28 1 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.03 121.90 -4.87 0.70 N 29 1 "O4'" B DA 14 ? ? "C1'" B DA 14 ? ? N9 B DA 14 ? ? 112.49 108.30 4.19 0.30 N 30 1 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 31 1 C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N1 B DA 14 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 32 1 N1 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N6 B DA 14 ? ? 112.43 118.60 -6.17 0.60 N 33 1 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 34 1 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 35 1 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.03 117.70 3.33 0.50 N 36 1 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 112.68 118.60 -5.92 0.60 N 37 1 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 112.21 108.30 3.91 0.30 N 38 1 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 119.06 122.90 -3.84 0.60 N 39 1 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 40 2 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? "C2'" A DA 1 ? ? 113.09 106.80 6.29 0.50 N 41 2 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? N9 A DA 1 ? ? 120.11 108.30 11.81 0.30 N 42 2 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 120.83 117.70 3.13 0.50 N 43 2 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 110.32 118.60 -8.28 0.60 N 44 2 N1 A DA 2 ? ? C2 A DA 2 ? ? N3 A DA 2 ? ? 123.21 129.30 -6.09 0.50 N 45 2 C2 A DA 2 ? ? N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? 116.84 110.60 6.24 0.50 N 46 2 N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? C5 A DA 2 ? ? 122.11 126.80 -4.69 0.70 N 47 2 C5 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N1 A DA 2 ? ? 121.96 117.70 4.26 0.50 N 48 2 C4 A DA 2 ? ? C5 A DA 2 ? ? N7 A DA 2 ? ? 107.17 110.70 -3.53 0.50 N 49 2 N9 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? C5 A DA 2 ? ? 108.60 105.80 2.80 0.40 N 50 2 C6 A DA 2 ? ? C5 A DA 2 ? ? N7 A DA 2 ? ? 138.39 132.30 6.09 0.70 N 51 2 N1 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N6 A DA 2 ? ? 113.70 118.60 -4.90 0.60 N 52 2 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? "C2'" A DC 3 ? ? 99.76 105.90 -6.14 0.80 N 53 2 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 54 2 C6 A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? 117.59 120.30 -2.71 0.40 N 55 2 C2 A DA 4 ? ? N3 A DA 4 ? ? C4 A DA 4 ? ? 114.15 110.60 3.55 0.50 N 56 2 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 57 2 N7 A DA 4 ? ? C8 A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 117.85 113.80 4.05 0.50 N 58 2 C8 A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? C4 A DA 4 ? ? 99.93 105.80 -5.87 0.40 N 59 2 N9 A DA 4 ? ? C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? 108.26 105.80 2.46 0.40 N 60 2 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? "C2'" A DA 5 ? ? 100.94 105.90 -4.96 0.80 N 61 2 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.71 108.30 2.41 0.30 N 62 2 N1 A DA 5 ? ? C2 A DA 5 ? ? N3 A DA 5 ? ? 124.98 129.30 -4.32 0.50 N 63 2 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 112.33 117.00 -4.67 0.50 N 64 2 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 120.72 117.70 3.02 0.50 N 65 2 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? N7 A DA 5 ? ? 113.75 110.70 3.05 0.50 N 66 2 C5 A DA 5 ? ? N7 A DA 5 ? ? C8 A DA 5 ? ? 98.04 103.90 -5.86 0.50 N 67 2 N7 A DA 5 ? ? C8 A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 118.48 113.80 4.68 0.50 N 68 2 N9 A DA 5 ? ? C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? 102.20 105.80 -3.60 0.40 N 69 2 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 109.96 118.60 -8.64 0.60 N 70 2 "O4'" A DT 6 ? ? "C4'" A DT 6 ? ? "C3'" A DT 6 ? ? 111.24 106.00 5.24 0.60 N 71 2 C5 A DT 6 ? ? C4 A DT 6 ? ? O4 A DT 6 ? ? 120.69 124.90 -4.21 0.70 N 72 2 C4 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 122.96 119.00 3.96 0.60 N 73 2 "C3'" A DT 7 ? ? "C2'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? 96.87 102.40 -5.53 0.80 N 74 2 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 75 2 N3 A DT 7 ? ? C4 A DT 7 ? ? O4 A DT 7 ? ? 123.79 119.90 3.89 0.60 N 76 2 N1 A DG 8 ? ? C2 A DG 8 ? ? N3 A DG 8 ? ? 119.26 123.90 -4.64 0.60 N 77 2 C5 A DG 8 ? ? C6 A DG 8 ? ? N1 A DG 8 ? ? 115.07 111.50 3.57 0.50 N 78 2 C5 A DG 8 ? ? N7 A DG 8 ? ? C8 A DG 8 ? ? 100.89 104.30 -3.41 0.50 N 79 2 N7 A DG 8 ? ? C8 A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 118.54 113.10 5.44 0.50 N 80 2 C8 A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? C4 A DG 8 ? ? 101.94 106.40 -4.46 0.40 N 81 2 N3 A DG 8 ? ? C2 A DG 8 ? ? N2 A DG 8 ? ? 127.05 119.90 7.15 0.70 N 82 2 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? "C2'" A DT 9 ? ? 100.48 105.90 -5.42 0.80 N 83 2 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 114.65 108.30 6.35 0.30 N 84 2 N1 A DT 9 ? ? C2 A DT 9 ? ? N3 A DT 9 ? ? 118.35 114.60 3.75 0.60 N 85 2 C2 A DT 9 ? ? N3 A DT 9 ? ? C4 A DT 9 ? ? 122.25 127.20 -4.95 0.60 N 86 2 C4 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C6 A DT 9 ? ? 123.44 118.00 5.44 0.60 N 87 2 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 115.81 122.90 -7.09 0.60 N 88 2 "C5'" A DT 10 ? ? "C4'" A DT 10 ? ? "O4'" A DT 10 ? ? 121.87 109.80 12.07 1.10 N 89 2 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 90 2 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 116.88 122.30 -5.42 0.60 N 91 2 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 127.17 122.90 4.27 0.60 N 92 2 "O4'" B DA 11 ? ? "C4'" B DA 11 ? ? "C3'" B DA 11 ? ? 117.02 106.00 11.02 0.60 N 93 2 "C1'" B DA 11 ? ? "O4'" B DA 11 ? ? "C4'" B DA 11 ? ? 100.39 110.10 -9.71 1.00 N 94 2 N7 B DA 11 ? ? C8 B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? 110.75 113.80 -3.05 0.50 N 95 2 C8 B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? C4 B DA 11 ? ? 108.78 105.80 2.98 0.40 N 96 2 "O4'" B DA 12 ? ? "C4'" B DA 12 ? ? "C3'" B DA 12 ? ? 115.08 106.00 9.08 0.60 N 97 2 "C4'" B DA 12 ? ? "C3'" B DA 12 ? ? "C2'" B DA 12 ? ? 95.11 102.20 -7.09 0.70 N 98 2 "C3'" B DA 12 ? ? "C2'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? 109.99 102.50 7.49 1.20 N 99 2 "O4'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? N9 B DA 12 ? ? 113.33 108.30 5.03 0.30 N 100 2 C2 B DA 12 ? ? N3 B DA 12 ? ? C4 B DA 12 ? ? 113.83 110.60 3.23 0.50 N 101 2 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.49 117.00 -3.51 0.50 N 102 2 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 103 2 C5 B DA 12 ? ? N7 B DA 12 ? ? C8 B DA 12 ? ? 100.05 103.90 -3.85 0.50 N 104 2 N3 B DC 13 ? ? C4 B DC 13 ? ? N4 B DC 13 ? ? 112.73 118.00 -5.27 0.70 N 105 2 "O4'" B DA 14 ? ? "C4'" B DA 14 ? ? "C3'" B DA 14 ? ? 110.01 106.00 4.01 0.60 N 106 2 "O4'" B DA 14 ? ? "C1'" B DA 14 ? ? N9 B DA 14 ? ? 113.99 108.30 5.69 0.30 N 107 2 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? 109.32 117.00 -7.68 0.50 N 108 2 C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N1 B DA 14 ? ? 123.76 117.70 6.06 0.50 N 109 2 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? N7 B DA 14 ? ? 114.53 110.70 3.83 0.50 N 110 2 C5 B DA 14 ? ? N7 B DA 14 ? ? C8 B DA 14 ? ? 100.43 103.90 -3.47 0.50 N 111 2 N9 B DA 14 ? ? C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? 102.53 105.80 -3.27 0.40 N 112 2 N1 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N6 B DA 14 ? ? 111.52 118.60 -7.08 0.60 N 113 2 "C1'" B DA 15 ? ? "O4'" B DA 15 ? ? "C4'" B DA 15 ? ? 101.91 110.10 -8.19 1.00 N 114 2 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 111.68 117.00 -5.32 0.50 N 115 2 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 123.02 117.70 5.32 0.50 N 116 2 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 112.28 118.60 -6.32 0.60 N 117 2 "O4'" B DT 16 ? ? "C1'" B DT 16 ? ? "C2'" B DT 16 ? ? 99.76 105.90 -6.14 0.80 N 118 2 "O4'" B DT 16 ? ? "C1'" B DT 16 ? ? N1 B DT 16 ? ? 112.08 108.30 3.78 0.30 N 119 2 N1 B DT 16 ? ? C2 B DT 16 ? ? N3 B DT 16 ? ? 118.95 114.60 4.35 0.60 N 120 2 C4 B DT 16 ? ? C5 B DT 16 ? ? C6 B DT 16 ? ? 122.78 118.00 4.78 0.60 N 121 2 C5 B DT 16 ? ? C6 B DT 16 ? ? N1 B DT 16 ? ? 118.19 123.70 -5.51 0.60 N 122 2 N3 B DT 16 ? ? C2 B DT 16 ? ? O2 B DT 16 ? ? 117.28 122.30 -5.02 0.60 N 123 2 C6 B DT 16 ? ? C5 B DT 16 ? ? C7 B DT 16 ? ? 115.09 122.90 -7.81 0.60 N 124 2 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? "C2'" B DT 17 ? ? 111.42 106.80 4.62 0.50 N 125 2 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 119.09 122.90 -3.81 0.60 N 126 2 "C1'" B DG 18 ? ? "O4'" B DG 18 ? ? "C4'" B DG 18 ? ? 102.57 110.10 -7.53 1.00 N 127 2 N9 B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? "C2'" B DG 18 ? ? 123.21 114.30 8.91 1.40 N 128 2 N3 B DG 18 ? ? C4 B DG 18 ? ? C5 B DG 18 ? ? 124.64 128.60 -3.96 0.50 N 129 2 C4 B DG 18 ? ? C5 B DG 18 ? ? N7 B DG 18 ? ? 106.54 110.80 -4.26 0.40 N 130 2 C6 B DG 18 ? ? C5 B DG 18 ? ? N7 B DG 18 ? ? 134.26 130.40 3.86 0.60 N 131 2 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 114.85 119.90 -5.05 0.70 N 132 2 C4 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C6 B DT 19 ? ? 122.53 118.00 4.53 0.60 N 133 2 N3 B DT 19 ? ? C2 B DT 19 ? ? O2 B DT 19 ? ? 115.85 122.30 -6.45 0.60 N 134 2 N3 B DT 19 ? ? C4 B DT 19 ? ? O4 B DT 19 ? ? 124.67 119.90 4.77 0.60 N 135 2 C4 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 113.84 119.00 -5.16 0.60 N 136 2 C6 B DT 20 ? ? N1 B DT 20 ? ? C2 B DT 20 ? ? 118.29 121.30 -3.01 0.50 N 137 3 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? "C2'" A DA 1 ? ? 111.93 106.80 5.13 0.50 N 138 3 N1 A DA 1 ? ? C2 A DA 1 ? ? N3 A DA 1 ? ? 125.86 129.30 -3.44 0.50 N 139 3 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.05 117.70 3.35 0.50 N 140 3 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.61 118.60 -4.99 0.60 N 141 3 "C1'" A DA 2 ? ? "O4'" A DA 2 ? ? "C4'" A DA 2 ? ? 115.13 110.30 4.83 0.70 N 142 3 "O4'" A DA 2 ? ? "C1'" A DA 2 ? ? "C2'" A DA 2 ? ? 100.66 105.90 -5.24 0.80 N 143 3 N1 A DA 2 ? ? C2 A DA 2 ? ? N3 A DA 2 ? ? 126.21 129.30 -3.09 0.50 N 144 3 C2 A DA 2 ? ? N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? 115.66 110.60 5.06 0.50 N 145 3 N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? C5 A DA 2 ? ? 121.98 126.80 -4.82 0.70 N 146 3 C5 A DA 2 ? ? N7 A DA 2 ? ? C8 A DA 2 ? ? 100.18 103.90 -3.72 0.50 N 147 3 N3 A DA 2 ? ? C4 A DA 2 ? ? N9 A DA 2 ? ? 133.34 127.40 5.94 0.80 N 148 3 N1 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N6 A DA 2 ? ? 111.77 118.60 -6.83 0.60 N 149 3 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 150 3 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 117.54 121.90 -4.36 0.70 N 151 3 C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? C2 A DA 4 ? ? 114.22 118.60 -4.38 0.60 N 152 3 N1 A DA 4 ? ? C2 A DA 4 ? ? N3 A DA 4 ? ? 133.45 129.30 4.15 0.50 N 153 3 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 111.43 117.00 -5.57 0.50 N 154 3 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 122.84 117.70 5.14 0.50 N 155 3 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? N7 A DA 4 ? ? 114.18 110.70 3.48 0.50 N 156 3 C5 A DA 4 ? ? N7 A DA 4 ? ? C8 A DA 4 ? ? 99.58 103.90 -4.32 0.50 N 157 3 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 111.52 118.60 -7.08 0.60 N 158 3 "C3'" A DA 4 ? ? "O3'" A DA 4 ? ? P A DA 5 ? ? 129.26 119.70 9.56 1.20 Y 159 3 "C4'" A DA 5 ? ? "C3'" A DA 5 ? ? "C2'" A DA 5 ? ? 111.18 103.10 8.08 0.90 N 160 3 "C3'" A DA 5 ? ? "C2'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? 97.35 102.40 -5.05 0.80 N 161 3 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.84 108.30 4.54 0.30 N 162 3 N1 A DA 5 ? ? C2 A DA 5 ? ? N3 A DA 5 ? ? 124.83 129.30 -4.47 0.50 N 163 3 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 122.02 117.70 4.32 0.50 N 164 3 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? N7 A DA 5 ? ? 105.35 110.70 -5.35 0.50 N 165 3 N9 A DA 5 ? ? C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? 109.59 105.80 3.79 0.40 N 166 3 C6 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? N7 A DA 5 ? ? 139.45 132.30 7.15 0.70 N 167 3 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 110.06 118.60 -8.54 0.60 N 168 3 "O4'" A DT 6 ? ? "C4'" A DT 6 ? ? "C3'" A DT 6 ? ? 113.53 106.00 7.53 0.60 N 169 3 "C1'" A DT 6 ? ? "O4'" A DT 6 ? ? "C4'" A DT 6 ? ? 101.69 110.10 -8.41 1.00 N 170 3 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? "C2'" A DT 6 ? ? 112.45 106.80 5.65 0.50 N 171 3 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 113.29 108.30 4.99 0.30 N 172 3 C4 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C6 A DT 6 ? ? 122.87 118.00 4.87 0.60 N 173 3 N3 A DT 6 ? ? C2 A DT 6 ? ? O2 A DT 6 ? ? 117.81 122.30 -4.49 0.60 N 174 3 N3 A DT 6 ? ? C4 A DT 6 ? ? O4 A DT 6 ? ? 116.16 119.90 -3.74 0.60 N 175 3 C5 A DT 6 ? ? C4 A DT 6 ? ? O4 A DT 6 ? ? 129.69 124.90 4.79 0.70 N 176 3 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 118.15 122.90 -4.75 0.60 N 177 3 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 113.41 108.30 5.11 0.30 N 178 3 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.65 108.30 4.35 0.30 N 179 3 C4 A DG 8 ? ? C5 A DG 8 ? ? N7 A DG 8 ? ? 115.38 110.80 4.58 0.40 N 180 3 C5 A DG 8 ? ? N7 A DG 8 ? ? C8 A DG 8 ? ? 99.65 104.30 -4.65 0.50 N 181 3 N1 A DG 8 ? ? C2 A DG 8 ? ? N2 A DG 8 ? ? 109.71 116.20 -6.49 0.90 N 182 3 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? "C2'" A DT 9 ? ? 100.89 105.90 -5.01 0.80 N 183 3 "O4'" A DT 9 ? ? "C1'" A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 112.61 108.30 4.31 0.30 N 184 3 C6 A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? C2 A DT 9 ? ? 124.77 121.30 3.47 0.50 N 185 3 C2 A DT 9 ? ? N3 A DT 9 ? ? C4 A DT 9 ? ? 123.28 127.20 -3.92 0.60 N 186 3 C4 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C6 A DT 9 ? ? 121.97 118.00 3.97 0.60 N 187 3 C5 A DT 9 ? ? C6 A DT 9 ? ? N1 A DT 9 ? ? 116.99 123.70 -6.71 0.60 N 188 3 N3 A DT 9 ? ? C2 A DT 9 ? ? O2 A DT 9 ? ? 118.00 122.30 -4.30 0.60 N 189 3 C4 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 127.28 119.00 8.28 0.60 N 190 3 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 110.65 122.90 -12.25 0.60 N 191 3 "O4'" A DT 10 ? ? "C4'" A DT 10 ? ? "C3'" A DT 10 ? ? 101.06 104.50 -3.44 0.40 N 192 3 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.52 108.30 3.22 0.30 N 193 3 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 116.85 122.30 -5.45 0.60 N 194 3 "O4'" B DA 11 ? ? "C1'" B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? 115.74 108.30 7.44 0.30 N 195 3 C4 B DA 11 ? ? C5 B DA 11 ? ? N7 B DA 11 ? ? 106.54 110.70 -4.16 0.50 N 196 3 N9 B DA 11 ? ? C4 B DA 11 ? ? C5 B DA 11 ? ? 109.38 105.80 3.58 0.40 N 197 3 N3 B DA 11 ? ? C4 B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? 121.66 127.40 -5.74 0.80 N 198 3 C6 B DA 11 ? ? C5 B DA 11 ? ? N7 B DA 11 ? ? 138.92 132.30 6.62 0.70 N 199 3 "O4'" B DA 12 ? ? "C4'" B DA 12 ? ? "C3'" B DA 12 ? ? 110.53 106.00 4.53 0.60 N 200 3 "O4'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? N9 B DA 12 ? ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 201 3 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 202 3 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 123.33 117.70 5.63 0.50 N 203 3 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? N7 B DA 12 ? ? 107.15 110.70 -3.55 0.50 N 204 3 N9 B DA 12 ? ? C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? 110.02 105.80 4.22 0.40 N 205 3 C6 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? N7 B DA 12 ? ? 138.86 132.30 6.56 0.70 N 206 3 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 109.69 118.60 -8.91 0.60 N 207 3 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? "C2'" B DC 13 ? ? 100.09 105.90 -5.81 0.80 N 208 3 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 114.16 108.30 5.86 0.30 N 209 3 C2 B DC 13 ? ? N3 B DC 13 ? ? C4 B DC 13 ? ? 116.84 119.90 -3.06 0.50 N 210 3 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 126.29 118.90 7.39 0.60 N 211 3 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 111.80 121.90 -10.10 0.70 N 212 3 "O4'" B DA 14 ? ? "C4'" B DA 14 ? ? "C3'" B DA 14 ? ? 110.47 106.00 4.47 0.60 N 213 3 "O4'" B DA 14 ? ? "C1'" B DA 14 ? ? "C2'" B DA 14 ? ? 101.05 105.90 -4.85 0.80 N 214 3 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? 111.28 117.00 -5.72 0.50 N 215 3 C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N1 B DA 14 ? ? 121.81 117.70 4.11 0.50 N 216 3 N1 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N6 B DA 14 ? ? 113.98 118.60 -4.62 0.60 N 217 3 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 114.25 108.30 5.95 0.30 N 218 3 N1 B DA 15 ? ? C2 B DA 15 ? ? N3 B DA 15 ? ? 125.76 129.30 -3.54 0.50 N 219 3 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 109.70 117.00 -7.30 0.50 N 220 3 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 123.43 117.70 5.73 0.50 N 221 3 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? N7 B DA 15 ? ? 114.08 110.70 3.38 0.50 N 222 3 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 109.18 118.60 -9.42 0.60 N 223 3 "O4'" B DT 16 ? ? "C1'" B DT 16 ? ? N1 B DT 16 ? ? 118.40 108.30 10.10 0.30 N 224 3 C4 B DT 16 ? ? C5 B DT 16 ? ? C6 B DT 16 ? ? 122.09 118.00 4.09 0.60 N 225 3 C5 B DT 16 ? ? C6 B DT 16 ? ? N1 B DT 16 ? ? 118.36 123.70 -5.34 0.60 N 226 3 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 227 3 C4 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C6 B DT 17 ? ? 122.42 118.00 4.42 0.60 N 228 3 C5 B DT 17 ? ? C6 B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 119.08 123.70 -4.62 0.60 N 229 3 N3 B DT 17 ? ? C2 B DT 17 ? ? O2 B DT 17 ? ? 116.47 122.30 -5.83 0.60 N 230 3 C4 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 125.80 119.00 6.80 0.60 N 231 3 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 111.77 122.90 -11.13 0.60 N 232 3 "O5'" B DG 18 ? ? "C5'" B DG 18 ? ? "C4'" B DG 18 ? ? 104.36 109.40 -5.04 0.80 N 233 3 "C1'" B DG 18 ? ? "O4'" B DG 18 ? ? "C4'" B DG 18 ? ? 104.09 110.10 -6.01 1.00 N 234 3 C5 B DG 18 ? ? C6 B DG 18 ? ? O6 B DG 18 ? ? 132.75 128.60 4.15 0.60 N 235 3 "C4'" B DT 19 ? ? "C3'" B DT 19 ? ? "C2'" B DT 19 ? ? 96.29 102.20 -5.91 0.70 N 236 3 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? "C2'" B DT 19 ? ? 97.61 105.90 -8.29 0.80 N 237 3 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 113.36 108.30 5.06 0.30 N 238 3 C5 B DT 19 ? ? C6 B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 117.51 123.70 -6.19 0.60 N 239 3 N3 B DT 19 ? ? C2 B DT 19 ? ? O2 B DT 19 ? ? 117.48 122.30 -4.82 0.60 N 240 3 C4 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 123.68 119.00 4.68 0.60 N 241 3 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 115.97 122.90 -6.93 0.60 N 242 3 "C4'" B DT 20 ? ? "C3'" B DT 20 ? ? "C2'" B DT 20 ? ? 108.55 103.10 5.45 0.90 N 243 3 C5 B DT 20 ? ? C6 B DT 20 ? ? N1 B DT 20 ? ? 118.37 123.70 -5.33 0.60 N 244 3 N3 B DT 20 ? ? C4 B DT 20 ? ? O4 B DT 20 ? ? 113.68 119.90 -6.22 0.60 N 245 3 C5 B DT 20 ? ? C4 B DT 20 ? ? O4 B DT 20 ? ? 132.64 124.90 7.74 0.70 N 246 3 C4 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 122.86 119.00 3.86 0.60 N 247 3 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 115.59 122.90 -7.31 0.60 N 248 4 "O4'" A DA 1 ? ? "C4'" A DA 1 ? ? "C3'" A DA 1 ? ? 110.65 106.00 4.65 0.60 N 249 4 "C1'" A DA 1 ? ? "O4'" A DA 1 ? ? "C4'" A DA 1 ? ? 101.80 110.10 -8.30 1.00 N 250 4 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? "C2'" A DA 1 ? ? 112.81 106.80 6.01 0.50 N 251 4 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 110.47 117.00 -6.53 0.50 N 252 4 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.96 117.70 4.26 0.50 N 253 4 C6 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? N7 A DA 1 ? ? 140.39 132.30 8.09 0.70 N 254 4 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 111.26 118.60 -7.34 0.60 N 255 4 "C3'" A DA 1 ? ? "O3'" A DA 1 ? ? P A DA 2 ? ? 127.02 119.70 7.32 1.20 Y 256 4 "O4'" A DA 2 ? ? "C4'" A DA 2 ? ? "C3'" A DA 2 ? ? 109.74 106.00 3.74 0.60 N 257 4 "O4'" A DA 2 ? ? "C1'" A DA 2 ? ? N9 A DA 2 ? ? 112.39 108.30 4.09 0.30 N 258 4 C6 A DA 2 ? ? N1 A DA 2 ? ? C2 A DA 2 ? ? 114.95 118.60 -3.65 0.60 N 259 4 C5 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N1 A DA 2 ? ? 121.71 117.70 4.01 0.50 N 260 4 N1 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N6 A DA 2 ? ? 106.81 118.60 -11.79 0.60 N 261 4 C5 A DA 2 ? ? C6 A DA 2 ? ? N6 A DA 2 ? ? 130.85 123.70 7.15 0.80 N 262 4 "C1'" A DC 3 ? ? "O4'" A DC 3 ? ? "C4'" A DC 3 ? ? 103.03 110.10 -7.07 1.00 N 263 4 N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 124.82 121.90 2.92 0.40 N 264 4 C5 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? N4 A DC 3 ? ? 114.55 120.20 -5.65 0.70 N 265 4 "C3'" A DA 4 ? ? "C2'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? 96.42 102.40 -5.98 0.80 N 266 4 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 267 4 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 268 4 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 122.27 117.70 4.57 0.50 N 269 4 N9 A DA 4 ? ? C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? 103.30 105.80 -2.50 0.40 N 270 4 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 108.65 118.60 -9.95 0.60 N 271 4 "O4'" A DA 5 ? ? "C4'" A DA 5 ? ? "C3'" A DA 5 ? ? 109.84 106.00 3.84 0.60 N 272 4 "C4'" A DA 5 ? ? "C3'" A DA 5 ? ? "C2'" A DA 5 ? ? 96.32 102.20 -5.88 0.70 N 273 4 "C3'" A DA 5 ? ? "C2'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? 111.17 102.50 8.67 1.20 N 274 4 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? "C2'" A DA 5 ? ? 99.03 105.90 -6.87 0.80 N 275 4 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 120.88 117.70 3.18 0.50 N 276 4 C5 A DA 5 ? ? N7 A DA 5 ? ? C8 A DA 5 ? ? 99.59 103.90 -4.31 0.50 N 277 4 N7 A DA 5 ? ? C8 A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 118.22 113.80 4.42 0.50 N 278 4 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.92 118.60 -5.68 0.60 N 279 4 "O4'" A DT 6 ? ? "C1'" A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 103.77 108.00 -4.23 0.70 N 280 4 C4 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C6 A DT 6 ? ? 124.43 118.00 6.43 0.60 N 281 4 C5 A DT 6 ? ? C6 A DT 6 ? ? N1 A DT 6 ? ? 116.09 123.70 -7.61 0.60 N 282 4 N3 A DT 6 ? ? C2 A DT 6 ? ? O2 A DT 6 ? ? 116.68 122.30 -5.62 0.60 N 283 4 C6 A DT 6 ? ? C5 A DT 6 ? ? C7 A DT 6 ? ? 113.36 122.90 -9.54 0.60 N 284 4 "O4'" A DT 7 ? ? "C4'" A DT 7 ? ? "C3'" A DT 7 ? ? 110.30 106.00 4.30 0.60 N 285 4 C4 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C6 A DT 7 ? ? 122.59 118.00 4.59 0.60 N 286 4 N3 A DT 7 ? ? C2 A DT 7 ? ? O2 A DT 7 ? ? 115.81 122.30 -6.49 0.60 N 287 4 "O4'" A DG 8 ? ? "C4'" A DG 8 ? ? "C3'" A DG 8 ? ? 101.10 104.50 -3.40 0.40 N 288 4 N1 A DG 8 ? ? C2 A DG 8 ? ? N3 A DG 8 ? ? 119.22 123.90 -4.68 0.60 N 289 4 N1 A DG 8 ? ? C6 A DG 8 ? ? O6 A DG 8 ? ? 115.78 119.90 -4.12 0.60 N 290 4 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 118.59 122.90 -4.31 0.60 N 291 4 C2 A DT 10 ? ? N3 A DT 10 ? ? C4 A DT 10 ? ? 120.84 127.20 -6.36 0.60 N 292 4 N3 A DT 10 ? ? C4 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? 119.45 115.20 4.25 0.60 N 293 4 C5 A DT 10 ? ? C6 A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 119.27 123.70 -4.43 0.60 N 294 4 N3 A DT 10 ? ? C4 A DT 10 ? ? O4 A DT 10 ? ? 112.71 119.90 -7.19 0.60 N 295 4 C4 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 122.86 119.00 3.86 0.60 N 296 4 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 116.08 122.90 -6.82 0.60 N 297 4 "O4'" B DA 11 ? ? "C1'" B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? 113.88 108.30 5.58 0.30 N 298 4 C6 B DA 11 ? ? N1 B DA 11 ? ? C2 B DA 11 ? ? 113.03 118.60 -5.57 0.60 N 299 4 C4 B DA 11 ? ? C5 B DA 11 ? ? C6 B DA 11 ? ? 112.20 117.00 -4.80 0.50 N 300 4 C5 B DA 11 ? ? C6 B DA 11 ? ? N1 B DA 11 ? ? 125.70 117.70 8.00 0.50 N 301 4 N7 B DA 11 ? ? C8 B DA 11 ? ? N9 B DA 11 ? ? 110.42 113.80 -3.38 0.50 N 302 4 C6 B DA 11 ? ? C5 B DA 11 ? ? N7 B DA 11 ? ? 136.68 132.30 4.38 0.70 N 303 4 N1 B DA 11 ? ? C6 B DA 11 ? ? N6 B DA 11 ? ? 110.96 118.60 -7.64 0.60 N 304 4 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 111.90 117.00 -5.10 0.50 N 305 4 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 124.57 117.70 6.87 0.50 N 306 4 C5 B DA 12 ? ? N7 B DA 12 ? ? C8 B DA 12 ? ? 100.50 103.90 -3.40 0.50 N 307 4 C6 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? N7 B DA 12 ? ? 137.96 132.30 5.66 0.70 N 308 4 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 114.76 118.60 -3.84 0.60 N 309 4 "C3'" B DC 13 ? ? "C2'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? 94.54 102.40 -7.86 0.80 N 310 4 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 99.87 108.00 -8.13 0.70 N 311 4 C6 B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? 116.36 120.30 -3.94 0.40 N 312 4 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 123.10 118.90 4.20 0.60 N 313 4 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 112.34 121.90 -9.56 0.70 N 314 4 N3 B DC 13 ? ? C4 B DC 13 ? ? N4 B DC 13 ? ? 110.57 118.00 -7.43 0.70 N 315 4 C5 B DC 13 ? ? C4 B DC 13 ? ? N4 B DC 13 ? ? 126.58 120.20 6.38 0.70 N 316 4 "C3'" B DA 14 ? ? "C2'" B DA 14 ? ? "C1'" B DA 14 ? ? 94.60 102.40 -7.80 0.80 N 317 4 "O4'" B DA 14 ? ? "C1'" B DA 14 ? ? N9 B DA 14 ? ? 110.59 108.30 2.29 0.30 N 318 4 N1 B DA 14 ? ? C2 B DA 14 ? ? N3 B DA 14 ? ? 125.99 129.30 -3.31 0.50 N 319 4 C2 B DA 14 ? ? N3 B DA 14 ? ? C4 B DA 14 ? ? 114.88 110.60 4.28 0.50 N 320 4 C4 B DA 14 ? ? C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? 113.05 117.00 -3.95 0.50 N 321 4 C5 B DA 14 ? ? C6 B DA 14 ? ? N1 B DA 14 ? ? 122.22 117.70 4.52 0.50 N 322 4 N1 B DA 15 ? ? C2 B DA 15 ? ? N3 B DA 15 ? ? 125.19 129.30 -4.11 0.50 N 323 4 C2 B DA 15 ? ? N3 B DA 15 ? ? C4 B DA 15 ? ? 114.95 110.60 4.35 0.50 N 324 4 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 110.82 118.60 -7.78 0.60 N 325 4 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 130.15 123.70 6.45 0.80 N 326 4 "C3'" B DA 15 ? ? "O3'" B DA 15 ? ? P B DT 16 ? ? 127.43 119.70 7.73 1.20 Y 327 4 "O4'" B DT 16 ? ? "C4'" B DT 16 ? ? "C3'" B DT 16 ? ? 112.05 106.00 6.05 0.60 N 328 4 N1 B DT 16 ? ? "C1'" B DT 16 ? ? "C2'" B DT 16 ? ? 123.58 114.30 9.28 1.40 N 329 4 C2 B DT 16 ? ? N3 B DT 16 ? ? C4 B DT 16 ? ? 123.07 127.20 -4.13 0.60 N 330 4 "C1'" B DT 17 ? ? "O4'" B DT 17 ? ? "C4'" B DT 17 ? ? 100.61 110.10 -9.49 1.00 N 331 4 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 113.30 108.30 5.00 0.30 N 332 4 C2 B DT 17 ? ? N3 B DT 17 ? ? C4 B DT 17 ? ? 123.02 127.20 -4.18 0.60 N 333 4 C4 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 123.76 119.00 4.76 0.60 N 334 4 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 116.23 122.90 -6.67 0.60 N 335 4 "C3'" B DT 17 ? ? "O3'" B DT 17 ? ? P B DG 18 ? ? 130.08 119.70 10.38 1.20 Y 336 4 C6 B DG 18 ? ? N1 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? 121.35 125.10 -3.75 0.60 N 337 4 N3 B DG 18 ? ? C4 B DG 18 ? ? C5 B DG 18 ? ? 125.33 128.60 -3.27 0.50 N 338 4 C5 B DG 18 ? ? C6 B DG 18 ? ? N1 B DG 18 ? ? 116.68 111.50 5.18 0.50 N 339 4 C4 B DG 18 ? ? C5 B DG 18 ? ? N7 B DG 18 ? ? 108.18 110.80 -2.62 0.40 N 340 4 C6 B DG 18 ? ? C5 B DG 18 ? ? N7 B DG 18 ? ? 134.50 130.40 4.10 0.60 N 341 4 N1 B DG 18 ? ? C6 B DG 18 ? ? O6 B DG 18 ? ? 113.81 119.90 -6.09 0.60 N 342 4 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 115.02 108.30 6.72 0.30 N 343 4 C5 B DT 19 ? ? C6 B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 118.41 123.70 -5.29 0.60 N 344 4 N3 B DT 19 ? ? C4 B DT 19 ? ? O4 B DT 19 ? ? 115.59 119.90 -4.31 0.60 N 345 4 "O4'" B DT 20 ? ? "C1'" B DT 20 ? ? N1 B DT 20 ? ? 113.25 108.30 4.95 0.30 N 346 4 N3 B DT 20 ? ? C4 B DT 20 ? ? O4 B DT 20 ? ? 114.45 119.90 -5.45 0.60 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DA A 2 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 2 1 DA A 5 ? ? 0.049 'SIDE CHAIN' 3 1 DT A 6 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 4 1 DA B 15 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 5 2 DA A 1 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 6 2 DA A 4 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 7 2 DT A 6 ? ? 0.099 'SIDE CHAIN' 8 2 DG A 8 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 9 2 DA B 11 ? ? 0.115 'SIDE CHAIN' 10 2 DA B 12 ? ? 0.116 'SIDE CHAIN' 11 2 DA B 14 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 12 2 DA B 15 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 13 2 DT B 16 ? ? 0.094 'SIDE CHAIN' 14 3 DA A 1 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 15 3 DT A 6 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 16 3 DG A 8 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 17 3 DT A 9 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 18 3 DT A 10 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 19 3 DA B 11 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 20 3 DA B 15 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 21 3 DT B 16 ? ? 0.120 'SIDE CHAIN' 22 3 DT B 17 ? ? 0.093 'SIDE CHAIN' 23 3 DG B 18 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 24 3 DT B 19 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 25 4 DA A 4 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 26 4 DT A 7 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 27 4 DT A 10 ? ? 0.097 'SIDE CHAIN' 28 4 DA B 14 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 29 4 DT B 17 ? ? 0.134 'SIDE CHAIN' 30 4 DT B 20 ? ? 0.105 'SIDE CHAIN' # _struct_site_keywords.site_id 1 _struct_site_keywords.text 'MAJOR GROOVE BINDER, INTERCALATION' # _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'representative conformers of clusters' _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 15000 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 4 _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2KTT _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer 1 _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.entry_id 2KTT _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system ;1 mM DNA (5'-D(*AP*AP*CP*AP*AP*TP*TP*GP*TP*T)-3')-1, 1 mM Pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-Benzimidazole Hybrid-2, 100 mM NaCl-3, 20 mM PO4-4, 100% D2O ; 1 '100% D2O' ;1 mM DNA (5'-D(*AP*AP*CP*AP*AP*TP*TP*GP*TP*T)-3')-5, 1 mM Pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-Benzimidazole Hybrid-6, 100 mM NaCl-7, 20 mM PO4-8, 90% H2O/10% D2O ; 2 '90% H2O/10% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id DNA 1 ? mM ? 1 'Pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-Benzimidazole Hybrid-2' 1 ? mM ? 1 NaCl-3 100 ? mM ? 1 PO4-4 20 ? mM ? 1 DNA 1 ? mM ? 2 'Pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-Benzimidazole Hybrid-6' 1 ? mM ? 2 NaCl-7 100 ? mM ? 2 PO4-8 20 ? mM ? 2 # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 0.28 7 ambient ? 295 K 2 0.28 7 ambient ? 283 K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 2 1 '2D DQF-COSY' 1 3 1 '2D 1H-1H TOCSY' 2 4 2 '2D 1H-1H NOESY' # _pdbx_nmr_refine.entry_id 2KTT _pdbx_nmr_refine.method 'molecular dynamics' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_software.authors 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo and Kollm' _pdbx_nmr_software.classification refinement _pdbx_nmr_software.name Amber _pdbx_nmr_software.version 9 _pdbx_nmr_software.ordinal 1 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 PBH C1 C N N 144 PBH O2 O N N 145 PBH C3 C N N 146 PBH N4 N N N 147 PBH O4 O N N 148 PBH N5 N N N 149 PBH O5 O N N 150 PBH N6 N N N 151 PBH C7 C Y N 152 PBH C9 C Y N 153 PBH N10 N N N 154 PBH C11 C N N 155 PBH C12 C N N 156 PBH C13 C N N 157 PBH O13 O N N 158 PBH C14 C N N 159 PBH C15 C N N 160 PBH C17 C Y N 161 PBH C18 C Y N 162 PBH C19 C Y N 163 PBH C1A C N S 164 PBH C20 C Y N 165 PBH C21 C Y N 166 PBH C22 C Y N 167 PBH C23 C Y N 168 PBH C24 C Y N 169 PBH C25 C Y N 170 PBH C26 C Y N 171 PBH C27 C Y N 172 PBH C28 C Y N 173 PBH C29 C Y N 174 PBH C2D C N N 175 PBH C30 C N N 176 PBH N30 N Y N 177 PBH C31 C N N 178 PBH C32 C N N 179 PBH C33 C N N 180 PBH C34 C N N 181 PBH N40 N Y N 182 PBH C5A C Y N 183 PBH C5D C N N 184 PBH C6D C Y N 185 PBH C8D C Y N 186 PBH C9A C Y N 187 PBH H1 H N N 188 PBH H1A H N N 189 PBH H3 H N N 190 PBH H3A H N N 191 PBH H9 H N N 192 PBH HN10 H N N 193 PBH H11 H N N 194 PBH H11A H N N 195 PBH H12 H N N 196 PBH H12A H N N 197 PBH H12B H N N 198 PBH H13 H N N 199 PBH H13A H N N 200 PBH H14 H N N 201 PBH H14A H N N 202 PBH H15 H N N 203 PBH H15A H N N 204 PBH H18 H N N 205 PBH H19 H N N 206 PBH H1AA H N N 207 PBH H20 H N N 208 PBH H21 H N N 209 PBH H26 H N N 210 PBH H27 H N N 211 PBH H29 H N N 212 PBH H2D H N N 213 PBH H2DA H N N 214 PBH H30 H N N 215 PBH H30A H N N 216 PBH H31 H N N 217 PBH H31A H N N 218 PBH H32 H N N 219 PBH H32A H N N 220 PBH H33 H N N 221 PBH H33A H N N 222 PBH H34 H N N 223 PBH H34A H N N 224 PBH H34B H N N 225 PBH HN40 H N N 226 PBH H6D H N N 227 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 PBH C1 C1A sing N N 150 PBH C1 C2D sing N N 151 PBH O2 C7 sing N N 152 PBH O2 C12 sing N N 153 PBH C3 N4 sing N N 154 PBH C3 C2D sing N N 155 PBH N4 C1A sing N N 156 PBH N4 C5D sing N N 157 PBH O4 C15 sing N N 158 PBH O4 C17 sing N N 159 PBH N5 C28 sing N N 160 PBH N5 C30 sing N N 161 PBH N5 C31 sing N N 162 PBH O5 C5D doub N N 163 PBH N6 C32 sing N N 164 PBH N6 C33 sing N N 165 PBH N6 C34 sing N N 166 PBH C7 C6D doub Y N 167 PBH C7 C8D sing Y N 168 PBH C9 C8D doub Y N 169 PBH C9 C9A sing Y N 170 PBH N10 C11 sing N N 171 PBH N10 C9A sing N N 172 PBH C11 C1A sing N N 173 PBH C13 O13 sing N N 174 PBH C13 C14 sing N N 175 PBH O13 C8D sing N N 176 PBH C14 C15 sing N N 177 PBH C17 C18 doub Y N 178 PBH C17 C19 sing Y N 179 PBH C18 C20 sing Y N 180 PBH C19 C21 doub Y N 181 PBH C20 C22 doub Y N 182 PBH C21 C22 sing Y N 183 PBH C22 C23 sing Y N 184 PBH C23 N30 doub Y N 185 PBH C23 N40 sing Y N 186 PBH C24 C25 doub Y N 187 PBH C24 C26 sing Y N 188 PBH C24 N40 sing Y N 189 PBH C25 C27 sing Y N 190 PBH C25 N30 sing Y N 191 PBH C26 C28 doub Y N 192 PBH C27 C29 doub Y N 193 PBH C28 C29 sing Y N 194 PBH C30 C32 sing N N 195 PBH C31 C33 sing N N 196 PBH C5A C5D sing N N 197 PBH C5A C6D sing Y N 198 PBH C5A C9A doub Y N 199 PBH C1 H1 sing N N 200 PBH C1 H1A sing N N 201 PBH C3 H3 sing N N 202 PBH C3 H3A sing N N 203 PBH C9 H9 sing N N 204 PBH N10 HN10 sing N N 205 PBH C11 H11 sing N N 206 PBH C11 H11A sing N N 207 PBH C12 H12 sing N N 208 PBH C12 H12A sing N N 209 PBH C12 H12B sing N N 210 PBH C13 H13 sing N N 211 PBH C13 H13A sing N N 212 PBH C14 H14 sing N N 213 PBH C14 H14A sing N N 214 PBH C15 H15 sing N N 215 PBH C15 H15A sing N N 216 PBH C18 H18 sing N N 217 PBH C19 H19 sing N N 218 PBH C1A H1AA sing N N 219 PBH C20 H20 sing N N 220 PBH C21 H21 sing N N 221 PBH C26 H26 sing N N 222 PBH C27 H27 sing N N 223 PBH C29 H29 sing N N 224 PBH C2D H2D sing N N 225 PBH C2D H2DA sing N N 226 PBH C30 H30 sing N N 227 PBH C30 H30A sing N N 228 PBH C31 H31 sing N N 229 PBH C31 H31A sing N N 230 PBH C32 H32 sing N N 231 PBH C32 H32A sing N N 232 PBH C33 H33 sing N N 233 PBH C33 H33A sing N N 234 PBH C34 H34 sing N N 235 PBH C34 H34A sing N N 236 PBH C34 H34B sing N N 237 PBH N40 HN40 sing N N 238 PBH C6D H6D sing N N 239 # _ndb_struct_conf_na.entry_id 2KTT _ndb_struct_conf_na.feature 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DA 1 1_555 B DT 10 1_555 0.002 -0.085 -0.385 8.437 -22.999 1.343 1 A_DA1:DT20_B A 1 ? B 20 ? 20 1 1 A DA 2 1_555 B DT 9 1_555 0.249 0.063 0.076 7.052 -11.528 -2.148 2 A_DA2:DT19_B A 2 ? B 19 ? 20 1 1 A DC 3 1_555 B DG 8 1_555 -0.119 0.000 0.282 13.404 -12.515 0.685 3 A_DC3:DG18_B A 3 ? B 18 ? 19 1 1 A DA 4 1_555 B DT 7 1_555 0.078 0.007 -0.204 4.323 -25.530 0.326 4 A_DA4:DT17_B A 4 ? B 17 ? 20 1 1 A DA 5 1_555 B DT 6 1_555 0.127 0.093 0.187 -6.163 -8.398 7.703 5 A_DA5:DT16_B A 5 ? B 16 ? 20 1 1 A DT 6 1_555 B DA 5 1_555 0.005 -0.035 0.467 0.107 -8.017 3.271 6 A_DT6:DA15_B A 6 ? B 15 ? 20 1 1 A DT 7 1_555 B DA 4 1_555 0.063 -0.060 0.095 9.248 -2.294 1.174 7 A_DT7:DA14_B A 7 ? B 14 ? 20 1 1 A DG 8 1_555 B DC 3 1_555 -0.167 -0.132 -0.369 -4.535 -21.133 0.652 8 A_DG8:DC13_B A 8 ? B 13 ? 19 1 1 A DT 9 1_555 B DA 2 1_555 -0.386 0.009 -0.004 -8.442 -25.886 5.806 9 A_DT9:DA12_B A 9 ? B 12 ? 20 1 1 A DT 10 1_555 B DA 1 1_555 -0.025 0.042 -0.023 -16.165 -6.777 5.299 10 A_DT10:DA11_B A 10 ? B 11 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DA 1 1_555 B DT 10 1_555 A DA 2 1_555 B DT 9 1_555 -0.484 -0.214 3.278 -2.617 4.346 39.238 -0.828 0.406 3.262 6.438 3.877 39.551 1 AA_DA1DA2:DT19DT20_BB A 1 ? B 20 ? A 2 ? B 19 ? 1 A DA 2 1_555 B DT 9 1_555 A DC 3 1_555 B DG 8 1_555 0.822 -0.445 3.152 -2.597 -1.282 28.446 -0.623 -2.228 3.083 -2.601 5.268 28.591 2 AA_DA2DC3:DG18DT19_BB A 2 ? B 19 ? A 3 ? B 18 ? 1 A DC 3 1_555 B DG 8 1_555 A DA 4 1_555 B DT 7 1_555 -0.586 -0.506 3.526 1.716 10.515 36.052 -2.234 1.148 3.228 16.550 -2.700 37.543 3 AA_DC3DA4:DT17DG18_BB A 3 ? B 18 ? A 4 ? B 17 ? 1 A DA 4 1_555 B DT 7 1_555 A DA 5 1_555 B DT 6 1_555 0.521 -1.215 3.516 -2.241 1.204 29.333 -2.665 -1.534 3.416 2.372 4.415 29.441 4 AA_DA4DA5:DT16DT17_BB A 4 ? B 17 ? A 5 ? B 16 ? 1 A DA 5 1_555 B DT 6 1_555 A DT 6 1_555 B DA 5 1_555 -0.198 -0.536 3.284 -1.139 -4.557 36.054 -0.214 0.156 3.329 -7.324 1.831 36.348 5 AA_DA5DT6:DA15DT16_BB A 5 ? B 16 ? A 6 ? B 15 ? 1 A DT 6 1_555 B DA 5 1_555 A DT 7 1_555 B DA 4 1_555 0.142 -0.188 3.200 2.014 -9.037 32.083 1.157 0.083 3.139 -15.941 -3.553 33.358 6 AA_DT6DT7:DA14DA15_BB A 6 ? B 15 ? A 7 ? B 14 ? 1 A DT 7 1_555 B DA 4 1_555 A DG 8 1_555 B DC 3 1_555 -1.254 0.099 3.545 -0.260 5.999 35.057 -0.790 2.013 3.522 9.869 0.428 35.552 7 AA_DT7DG8:DC13DA14_BB A 7 ? B 14 ? A 8 ? B 13 ? 1 A DG 8 1_555 B DC 3 1_555 A DT 9 1_555 B DA 2 1_555 0.607 -0.624 3.233 -1.232 4.796 31.851 -1.954 -1.306 3.083 8.673 2.229 32.224 8 AA_DG8DT9:DA12DC13_BB A 8 ? B 13 ? A 9 ? B 12 ? 1 A DT 9 1_555 B DA 2 1_555 A DT 10 1_555 B DA 1 1_555 1.127 0.319 3.405 2.259 -1.924 40.183 0.692 -1.368 3.442 -2.795 -3.283 40.288 9 AA_DT9DT10:DA11DA12_BB A 9 ? B 12 ? A 10 ? B 11 ? # _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 600 _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.model AVANCE _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.type 'Bruker Avance' # _atom_sites.entry_id 2KTT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_