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167 ERN H252 H N N 168 ERN H26 H N N 169 ERN H271 H N N 170 ERN H272 H N N 171 ERN H273 H N N 172 ERN H281 H N N 173 ERN H282 H N N 174 ERN H283 H N N 175 ERN H291 H N N 176 ERN H292 H N N 177 ERN H293 H N N 178 ERN H3 H N N 179 ERN H14 H N N 180 ERN H151 H N N 181 ERN H152 H N N 182 ERN H201 H N N 183 ERN H202 H N N 184 ERN H203 H N N 185 ERN H191 H N N 186 ERN H192 H N N 187 ERN H193 H N N 188 ERN H17 H N N 189 ERN H18 H N N 190 ERN H211 H N N 191 ERN H212 H N N 192 ERN H213 H N N 193 G OP3 O N N 194 G P P N N 195 G OP1 O N N 196 G OP2 O N N 197 G "O5'" O N N 198 G "C5'" C N N 199 G "C4'" C N R 200 G "O4'" O N N 201 G "C3'" C N S 202 G "O3'" O N N 203 G "C2'" C N R 204 G "O2'" O N N 205 G "C1'" C N R 206 G N9 N Y N 207 G C8 C Y N 208 G N7 N Y N 209 G C5 C Y N 210 G C6 C N N 211 G O6 O N N 212 G N1 N N N 213 G C2 C N N 214 G N2 N N N 215 G N3 N N N 216 G C4 C Y N 217 G HOP3 H N N 218 G HOP2 H N N 219 G "H5'" H N N 220 G "H5''" H N N 221 G "H4'" H N N 222 G "H3'" H N N 223 G "HO3'" H N N 224 G "H2'" H N N 225 G "HO2'" H N N 226 G "H1'" H N N 227 G H8 H N N 228 G H1 H N N 229 G H21 H N N 230 G H22 H N N 231 U OP3 O N N 232 U P P N N 233 U OP1 O N N 234 U OP2 O N N 235 U "O5'" O N N 236 U "C5'" C N N 237 U "C4'" C N R 238 U "O4'" O N N 239 U "C3'" C N S 240 U "O3'" O N N 241 U "C2'" C N R 242 U "O2'" O N N 243 U "C1'" C N R 244 U N1 N N N 245 U C2 C N N 246 U O2 O N N 247 U N3 N N N 248 U C4 C N N 249 U O4 O N N 250 U C5 C N N 251 U C6 C N N 252 U HOP3 H N N 253 U HOP2 H N N 254 U "H5'" H N N 255 U "H5''" H N N 256 U "H4'" H N N 257 U "H3'" H N N 258 U "HO3'" H N N 259 U "H2'" H N N 260 U "HO2'" H N N 261 U "H1'" H N N 262 U H3 H N N 263 U H5 H N N 264 U H6 H N N 265 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A OP3 P sing N N 1 A OP3 HOP3 sing N N 2 A P OP1 doub N N 3 A P OP2 sing N N 4 A P "O5'" sing N N 5 A OP2 HOP2 sing N N 6 A "O5'" "C5'" sing N N 7 A "C5'" "C4'" sing N N 8 A "C5'" "H5'" sing N N 9 A "C5'" "H5''" sing N N 10 A "C4'" "O4'" sing N N 11 A "C4'" "C3'" sing N N 12 A "C4'" "H4'" sing N N 13 A "O4'" "C1'" sing N N 14 A "C3'" "O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" sing N N 24 A N9 C8 sing Y N 25 A N9 C4 sing Y N 26 A C8 N7 doub Y N 27 A C8 H8 sing N N 28 A N7 C5 sing Y N 29 A C5 C6 sing Y N 30 A C5 C4 doub Y N 31 A C6 N6 sing N N 32 A C6 N1 doub Y N 33 A N6 H61 sing N N 34 A N6 H62 sing N N 35 A N1 C2 sing Y N 36 A C2 N3 doub Y N 37 A C2 H2 sing N N 38 A N3 C4 sing Y N 39 C OP3 P sing N N 40 C OP3 HOP3 sing N N 41 C P OP1 doub N N 42 C P OP2 sing N N 43 C P "O5'" sing N N 44 C OP2 HOP2 sing N N 45 C "O5'" "C5'" sing N N 46 C "C5'" "C4'" sing N N 47 C "C5'" "H5'" sing N N 48 C "C5'" "H5''" sing N N 49 C "C4'" "O4'" sing N N 50 C "C4'" "C3'" sing N N 51 C "C4'" "H4'" sing N N 52 C "O4'" "C1'" sing N N 53 C "C3'" "O3'" sing N N 54 C "C3'" "C2'" sing N N 55 C "C3'" "H3'" sing N N 56 C "O3'" "HO3'" sing N N 57 C "C2'" "O2'" sing N N 58 C "C2'" "C1'" sing N N 59 C "C2'" "H2'" sing N N 60 C "O2'" "HO2'" sing N N 61 C "C1'" N1 sing N N 62 C "C1'" "H1'" sing N N 63 C N1 C2 sing N N 64 C N1 C6 sing N N 65 C C2 O2 doub N N 66 C C2 N3 sing N N 67 C N3 C4 doub N N 68 C C4 N4 sing N N 69 C C4 C5 sing N N 70 C N4 H41 sing N N 71 C N4 H42 sing N N 72 C C5 C6 doub N N 73 C C5 H5 sing N N 74 C C6 H6 sing N N 75 ERN C9 C8 sing N N 76 ERN C9 N2 sing N N 77 ERN C9 C10 sing N N 78 ERN C9 H9 sing N N 79 ERN C10 C34 sing N N 80 ERN C10 C11 sing N N 81 ERN C10 H10 sing N N 82 ERN C12 C11 sing N N 83 ERN C12 O11 sing N N 84 ERN C12 C13 sing N N 85 ERN C12 C35 sing N N 86 ERN N2 HN21 sing N N 87 ERN N2 HN22 sing N N 88 ERN C34 H341 sing N N 89 ERN C34 H342 sing N N 90 ERN C34 H343 sing N N 91 ERN C11 O12 sing N N 92 ERN C11 H11 sing N N 93 ERN O12 HO12 sing N N 94 ERN O11 HO11 sing N N 95 ERN O2 C1 sing N N 96 ERN O2 C13 sing N N 97 ERN O1 C1 doub N N 98 ERN C36 C13 sing N N 99 ERN C36 C37 sing N N 100 ERN C36 H361 sing N N 101 ERN C36 H362 sing N N 102 ERN C37 H371 sing N N 103 ERN C37 H372 sing N N 104 ERN C37 H373 sing N N 105 ERN C1 C2 sing N N 106 ERN C2 C3 sing N N 107 ERN C2 C30 sing N N 108 ERN C2 H2 sing N N 109 ERN O10 C6 sing N N 110 ERN O10 HO10 sing N N 111 ERN C30 H301 sing N N 112 ERN C30 H302 sing N N 113 ERN C30 H303 sing N N 114 ERN C6 C32 sing N N 115 ERN C6 C7 sing N N 116 ERN C6 C5 sing N N 117 ERN C32 H321 sing N N 118 ERN C32 H322 sing N N 119 ERN C32 H323 sing N N 120 ERN C7 C8 sing N N 121 ERN C7 H71 sing N N 122 ERN C7 H72 sing N N 123 ERN C8 C33 sing N N 124 ERN C8 H8 sing N N 125 ERN C33 H331 sing N N 126 ERN C33 H332 sing N N 127 ERN C33 H333 sing N N 128 ERN C35 H351 sing N N 129 ERN C35 H352 sing N N 130 ERN C35 H353 sing N N 131 ERN C13 H13 sing N N 132 ERN O9 C26 sing N N 133 ERN O9 C22 sing N N 134 ERN O7 C22 sing N N 135 ERN O7 C5 sing N N 136 ERN O8 C23 sing N N 137 ERN O8 HO8 sing N N 138 ERN O3 C3 sing N N 139 ERN O3 C14 sing N N 140 ERN O5 C20 sing N N 141 ERN O5 C16 sing N N 142 ERN O6 C17 sing N N 143 ERN O6 HO6 sing N N 144 ERN O4 C18 sing N N 145 ERN O4 C14 sing N N 146 ERN N1 C28 sing N N 147 ERN N1 C29 sing N N 148 ERN N1 C24 sing N N 149 ERN C4 C5 sing N N 150 ERN C4 C31 sing N N 151 ERN C4 C3 sing N N 152 ERN C4 H4 sing N N 153 ERN C31 H311 sing N N 154 ERN C31 H312 sing N N 155 ERN C31 H313 sing N N 156 ERN C5 H5 sing N N 157 ERN C22 C23 sing N N 158 ERN C22 H22 sing N N 159 ERN C23 C24 sing N N 160 ERN C23 H23 sing N N 161 ERN C24 C25 sing N N 162 ERN C24 H24 sing N N 163 ERN C25 C26 sing N N 164 ERN C25 H251 sing N N 165 ERN C25 H252 sing N N 166 ERN C26 C27 sing N N 167 ERN C26 H26 sing N N 168 ERN C27 H271 sing N N 169 ERN C27 H272 sing N N 170 ERN C27 H273 sing N N 171 ERN C28 H281 sing N N 172 ERN C28 H282 sing N N 173 ERN C28 H283 sing N N 174 ERN C29 H291 sing N N 175 ERN C29 H292 sing N N 176 ERN C29 H293 sing N N 177 ERN C3 H3 sing N N 178 ERN C14 C15 sing N N 179 ERN C14 H14 sing N N 180 ERN C15 C16 sing N N 181 ERN C15 H151 sing N N 182 ERN C15 H152 sing N N 183 ERN C16 C17 sing N N 184 ERN C16 C19 sing N N 185 ERN C20 H201 sing N N 186 ERN C20 H202 sing N N 187 ERN C20 H203 sing N N 188 ERN C19 H191 sing N N 189 ERN C19 H192 sing N N 190 ERN C19 H193 sing N N 191 ERN C17 C18 sing N N 192 ERN C17 H17 sing N N 193 ERN C18 C21 sing N N 194 ERN C18 H18 sing N N 195 ERN C21 H211 sing N N 196 ERN C21 H212 sing N N 197 ERN C21 H213 sing N N 198 G OP3 P sing N N 199 G OP3 HOP3 sing N N 200 G P OP1 doub N N 201 G P OP2 sing N N 202 G P "O5'" sing N N 203 G OP2 HOP2 sing N N 204 G "O5'" "C5'" sing N N 205 G "C5'" "C4'" sing N N 206 G "C5'" "H5'" sing N N 207 G "C5'" "H5''" sing N N 208 G "C4'" "O4'" sing N N 209 G "C4'" "C3'" sing N N 210 G "C4'" "H4'" sing N N 211 G "O4'" "C1'" sing N N 212 G "C3'" "O3'" sing N N 213 G "C3'" "C2'" sing N N 214 G "C3'" "H3'" sing N N 215 G "O3'" "HO3'" sing N N 216 G "C2'" "O2'" sing N N 217 G "C2'" "C1'" sing N N 218 G "C2'" "H2'" sing N N 219 G "O2'" "HO2'" sing N N 220 G "C1'" N9 sing N N 221 G "C1'" "H1'" sing N N 222 G N9 C8 sing Y N 223 G N9 C4 sing Y N 224 G C8 N7 doub Y N 225 G C8 H8 sing N N 226 G N7 C5 sing Y N 227 G C5 C6 sing N N 228 G C5 C4 doub Y N 229 G C6 O6 doub N N 230 G C6 N1 sing N N 231 G N1 C2 sing N N 232 G N1 H1 sing N N 233 G C2 N2 sing N N 234 G C2 N3 doub N N 235 G N2 H21 sing N N 236 G N2 H22 sing N N 237 G N3 C4 sing N N 238 U OP3 P sing N N 239 U OP3 HOP3 sing N N 240 U P OP1 doub N N 241 U P OP2 sing N N 242 U P "O5'" sing N N 243 U OP2 HOP2 sing N N 244 U "O5'" "C5'" sing N N 245 U "C5'" "C4'" sing N N 246 U "C5'" "H5'" sing N N 247 U "C5'" "H5''" sing N N 248 U "C4'" "O4'" sing N N 249 U "C4'" "C3'" sing N N 250 U "C4'" "H4'" sing N N 251 U "O4'" "C1'" sing N N 252 U "C3'" "O3'" sing N N 253 U "C3'" "C2'" sing N N 254 U "C3'" "H3'" sing N N 255 U "O3'" "HO3'" sing N N 256 U "C2'" "O2'" sing N N 257 U "C2'" "C1'" sing N N 258 U "C2'" "H2'" sing N N 259 U "O2'" "HO2'" sing N N 260 U "C1'" N1 sing N N 261 U "C1'" "H1'" sing N N 262 U N1 C2 sing N N 263 U N1 C6 sing N N 264 U C2 O2 doub N N 265 U C2 N3 sing N N 266 U N3 C4 sing N N 267 U N3 H3 sing N N 268 U C4 O4 doub N N 269 U C4 C5 sing N N 270 U C5 C6 doub N N 271 U C5 H5 sing N N 272 U C6 H6 sing N N 273 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 2O43 'double helix' 2O43 'a-form double helix' 2O43 'parallel strands' 2O43 'hairpin loop' 2O43 tetraloop 2O43 'bulge loop' 2O43 'mismatched base pair' 2O43 'internal loop' 2O43 'triple helix' 2O43 'quadruple helix' 2O43 'three-way junction' 2O43 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id 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