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XA 5 HOH 104 2104 2104 HOH HOH L . # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal MOSFLM 'data reduction' . ? 1 SCALA 'data scaling' . ? 2 SHELX phasing . ? 3 autoSHARP phasing . ? 4 REFMAC refinement 5.2.0019 ? 5 # _cell.entry_id 2VAT _cell.length_a 121.959 _cell.length_b 109.278 _cell.length_c 197.001 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.23 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2VAT _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 # _exptl.entry_id 2VAT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.56 _exptl_crystal.density_percent_sol 52 _exptl_crystal.description NONE # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH ? _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details '18-19% PEG 4000, 0.1M IMIDAZOLE, 0.5M NACL, 0.2M SODIUM ACETATE' # loop_ _diffrn.id _diffrn.ambient_temp _diffrn.ambient_temp_details _diffrn.crystal_id 1 100 ? 1 2 ? ? 1 # loop_ _diffrn_detector.diffrn_id _diffrn_detector.detector _diffrn_detector.type _diffrn_detector.pdbx_collection_date _diffrn_detector.details 1 CCD 'ADSC CCD' 2004-04-22 'TOROIDAL MIRROR' 2 ? ? ? ? # loop_ _diffrn_radiation.diffrn_id _diffrn_radiation.wavelength_id _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l _diffrn_radiation.monochromator _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type 1 1 M 'DIAMOND (111), GE(220)' 'SINGLE WAVELENGTH' x-ray 2 1 M ? ? x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 0.934 1.0 2 0.978 1.0 # loop_ _diffrn_source.diffrn_id _diffrn_source.source _diffrn_source.type _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline _diffrn_source.pdbx_wavelength _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1 SYNCHROTRON 'ESRF BEAMLINE ID14-1' ESRF ID14-1 0.934 ? 2 SYNCHROTRON 'MAX II BEAMLINE I911-3' 'MAX II' I911-3 0.978 ? # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 2VAT _reflns.observed_criterion_sigma_I 6.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 60.97 _reflns.d_resolution_high 2.20 _reflns.number_obs 258318 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 98.6 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.09 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 10.60 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 3.1 # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 2.20 _reflns_shell.d_res_low 2.32 _reflns_shell.percent_possible_all 95.8 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.25 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 3.70 _reflns_shell.pdbx_redundancy 2.9 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 2VAT _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 253887 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 122.17 _refine.ls_d_res_high 2.20 _refine.ls_percent_reflns_obs 98.5 _refine.ls_R_factor_obs 0.201 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.200 _refine.ls_R_factor_R_free 0.230 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 1.700 _refine.ls_number_reflns_R_free 4405 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.937 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.913 _refine.B_iso_mean 24.46 _refine.aniso_B[1][1] -0.86000 _refine.aniso_B[2][2] 2.10000 _refine.aniso_B[3][3] -1.24000 _refine.aniso_B[1][2] 0.00000 _refine.aniso_B[1][3] -0.09000 _refine.aniso_B[2][3] 0.00000 _refine.solvent_model_details MASK _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.40 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.80 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.80 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. RESIDUES 242-267 ARE DISORDERED. ACETYL MOIETY WAS LEFT UNMODELLED. RESIDUAL DENSITY NEAR SER149, POSSIBLY INDICATING MULTIPLE REACTION STATES WITH PARTIAL OCCUPANCIES, WAS LEFT UNMODELLED. ; _refine.pdbx_starting_model NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct SAD _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.247 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.190 _refine.overall_SU_ML 0.144 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B 5.616 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 32569 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 636 _refine_hist.number_atoms_solvent 1573 _refine_hist.number_atoms_total 34778 _refine_hist.d_res_high 2.20 _refine_hist.d_res_low 122.17 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function r_bond_refined_d 0.019 0.022 ? 34275 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_bond_other_d ? ? ? ? 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? ? ? ? ? 12 L 557 .08 .05 'tight positional' 3 36 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 75 .07 .05 'tight positional' 4 37 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 B 75 .07 .05 'tight positional' 4 38 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 C 75 .07 .05 'tight positional' 4 39 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 4 D 75 .08 .05 'tight positional' 4 40 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 5 E 75 .06 .05 'tight positional' 4 41 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 6 F 75 .09 .05 'tight positional' 4 42 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 7 G 75 .09 .05 'tight positional' 4 43 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 8 H 75 .07 .05 'tight positional' 4 44 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 9 I 75 .07 .05 'tight positional' 4 45 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 10 J 75 .10 .05 'tight positional' 4 46 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 11 K 75 .10 .05 'tight positional' 4 47 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 12 L 75 .09 .05 'tight positional' 4 48 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 757 .12 .05 'tight positional' 5 49 'X-RAY DIFFRACTION' ? 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PRO B 210 TYR B 225 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 30 SER B 286 ? PHE B 294 ? SER B 227 PHE B 235 1 ? 9 HELX_P HELX_P31 31 PRO B 329 ? GLU B 331 ? PRO B 270 GLU B 272 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 32 ALA B 332 ? SER B 347 ? ALA B 273 SER B 288 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 33 ASP B 349 ? LYS B 359 ? ASP B 290 LYS B 300 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 34 PHE B 360 ? HIS B 363 ? PHE B 301 HIS B 304 5 ? 4 HELX_P HELX_P35 35 SER B 372 ? MET B 379 ? SER B 313 MET B 320 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 36 SER B 396 ? ILE B 407 ? SER B 337 ILE B 348 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 37 GLU B 419 ? HIS B 421 ? GLU B 360 HIS B 362 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 38 ASP B 422 ? GLU B 427 ? ASP B 363 GLU B 368 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 39 GLU B 427 ? ASP B 440 ? GLU B 368 ASP B 381 1 ? 14 HELX_P HELX_P40 40 ASN C 66 ? SER C 71 ? ASN C 7 SER C 12 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 41 HIS C 123 ? TRP C 127 ? HIS C 64 TRP C 68 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 42 TRP C 128 ? LEU C 131 ? TRP C 69 LEU C 72 5 ? 4 HELX_P HELX_P43 43 ASP C 164 ? GLU C 168 ? 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