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H SER 2 H ALA 777 4 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? # _struct.entry_id 2W3R _struct.title 'Crystal Structure of Xanthine Dehydrogenase (desulfo form) from Rhodobacter capsulatus in complex with hypoxanthine' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2W3R _struct_keywords.pdbx_keywords OXIDOREDUCTASE _struct_keywords.text 'XDH, GOUT, IRON, XANTHINE, IRON-SULFUR, MOLYBDENUM COFACTOR, HYPOXANTHINE, METAL-BINDING, OXIDOREDUCTASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 4 ? L N N 5 ? M N N 6 ? N N N 7 ? O N N 8 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 4 ? S N N 5 ? T N N 6 ? U N N 7 ? V N N 8 ? W N N 3 ? X N N 3 ? Y N N 4 ? Z N N 5 ? AA N N 6 ? BA N N 7 ? CA N N 8 ? DA N N 3 ? EA N N 3 ? FA N N 4 ? 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LEU A 318 PHE A 321 1 ? 4 HELX_P HELX_P19 19 ALA A 394 ? ALA A 400 ? ALA A 394 ALA A 400 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 20 ARG A 407 ? LEU A 415 ? ARG A 407 LEU A 415 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 21 LEU A 417 ? PHE A 422 ? LEU A 417 PHE A 422 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 22 SER A 431 ? SER A 451 ? SER A 431 SER A 451 1 ? 21 HELX_P HELX_P23 23 SER B 11 ? THR B 17 ? SER B 11 THR B 17 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 24 TYR B 22 ? LEU B 26 ? TYR B 22 LEU B 26 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 25 LEU B 52 ? GLU B 57 ? LEU B 52 GLU B 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 26 ALA B 68 ? LEU B 70 ? ALA B 68 LEU B 70 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 27 SER B 105 ? ARG B 114 ? SER B 105 ARG B 114 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 28 THR B 128 ? ASP B 136 ? THR B 128 ASP B 136 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 29 ASP B 150 ? GLY B 157 ? ASP B 150 GLY B 157 1 ? 8 HELX_P HELX_P30 30 HIS B 198 ? GLY B 211 ? HIS B 198 GLY B 211 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 31 ALA B 213 ? HIS B 215 ? ALA B 213 HIS B 215 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 32 GLY B 235 ? GLY B 250 ? GLY B 235 GLY B 250 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 33 ASP B 258 ? THR B 266 ? ASP B 258 THR B 266 1 ? 9 HELX_P HELX_P34 34 LEU B 303 ? HIS B 314 ? LEU B 303 HIS B 314 1 ? 12 HELX_P HELX_P35 35 GLY B 345 ? MET B 364 ? GLY B 345 MET B 364 1 ? 20 HELX_P HELX_P36 36 ASP B 367 ? ASN B 375 ? ASP B 367 ASN B 375 1 ? 9 HELX_P HELX_P37 37 VAL B 413 ? ALA B 425 ? VAL B 413 ALA B 425 1 ? 13 HELX_P HELX_P38 38 ASN B 426 ? SER B 439 ? ASN B 426 SER B 439 1 ? 14 HELX_P HELX_P39 39 LEU B 461 ? LEU B 464 ? LEU B 461 LEU B 464 5 ? 4 HELX_P HELX_P40 40 GLY B 491 ? GLY B 505 ? GLY B 491 GLY B 505 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 41 ASP B 507 ? VAL B 509 ? ASP B 507 VAL B 509 5 ? 3 HELX_P HELX_P42 42 SER B 530 ? GLY B 560 ? SER B 530 GLY B 560 1 ? 31 HELX_P HELX_P43 43 ALA B 562 ? VAL B 566 ? ALA B 562 VAL B 566 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 PHE B 582 ? ARG B 593 ? PHE B 582 ARG B 593 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 45 ASN B 656 ? LEU B 675 ? ASN B 656 LEU B 675 1 ? 20 HELX_P HELX_P46 46 ALA B 700 ? ARG B 704 ? ALA B 700 ARG B 704 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 47 THR B 721 ? ARG B 724 ? THR B 721 ARG B 724 5 ? 4 HELX_P HELX_P48 48 GLU B 730 ? LEU B 735 ? GLU B 730 LEU B 735 5 ? 6 HELX_P HELX_P49 49 GLY B 736 ? ALA B 749 ? GLY B 736 ALA B 749 1 ? 14 HELX_P HELX_P50 50 THR B 762 ? GLY B 775 ? THR B 762 GLY B 775 1 ? 14 HELX_P HELX_P51 51 SER C 22 ? GLY C 31 ? SER C 22 GLY C 31 1 ? 10 HELX_P HELX_P52 52 LEU C 67 ? ALA C 71 ? LEU C 67 ALA C 71 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 53 THR C 77 ? ILE C 81 ? THR C 77 ILE C 81 5 ? 5 HELX_P HELX_P54 54 HIS C 89 ? HIS C 98 ? HIS C 89 HIS C 98 1 ? 10 HELX_P HELX_P55 55 CYS C 106 ? ARG C 120 ? CYS C 106 ARG C 120 1 ? 15 HELX_P HELX_P56 56 ASP C 124 ? LEU C 129 ? ASP C 124 LEU C 129 1 ? 6 HELX_P HELX_P57 57 TYR C 139 ? ALA C 150 ? TYR C 139 ALA C 150 1 ? 12 HELX_P HELX_P58 58 ALA C 155 ? ALA C 160 ? ALA C 155 ALA C 160 1 ? 6 HELX_P HELX_P59 59 THR C 185 ? HIS C 196 ? THR C 185 HIS C 196 1 ? 12 HELX_P HELX_P60 60 VAL C 208 ? LYS C 214 ? 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S MTE . "S2'" ? ? ? 1_555 V MOM . MO1 ? ? D MTE 1778 D MOM 1781 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? ? metalc29 metalc ? ? E CYS 39 SG ? ? ? 1_555 X FES . FE1 ? ? E CYS 39 E FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? ? metalc30 metalc ? ? E CYS 44 SG ? ? ? 1_555 X FES . FE1 ? ? E CYS 44 E FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? ? metalc31 metalc ? ? E CYS 47 SG ? ? ? 1_555 X FES . FE2 ? ? E CYS 47 E FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? ? metalc32 metalc ? ? E CYS 63 SG ? ? ? 1_555 X FES . FE2 ? ? E CYS 63 E FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? ? metalc33 metalc ? ? E CYS 103 SG ? ? ? 1_555 W FES . FE2 ? ? E CYS 103 E FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? ? metalc34 metalc ? ? E CYS 106 SG ? ? ? 1_555 W FES . FE1 ? ? E CYS 106 E FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? ? metalc35 metalc ? ? E CYS 134 SG ? ? ? 1_555 W FES . FE1 ? ? E CYS 134 E FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? ? metalc36 metalc ? ? E CYS 136 SG ? ? ? 1_555 W FES . FE2 ? ? E CYS 136 E FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc37 metalc ? ? F GLU 172 OE2 ? ? ? 1_555 AA CA . CA ? ? F GLU 172 F CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.974 ? ? metalc38 metalc ? ? F HIS 173 ND1 ? ? ? 1_555 AA CA . CA ? ? F HIS 173 F CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? ? metalc39 metalc ? ? F THR 266 OG1 ? ? ? 1_555 AA CA . CA ? ? F THR 266 F CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? ? metalc40 metalc ? ? F GLY 267 O ? ? ? 1_555 AA CA . CA ? ? F GLY 267 F CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? ? metalc41 metalc ? ? Z MTE . "S1'" ? ? ? 1_555 CA MOM . MO1 ? ? F MTE 1778 F MOM 1781 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? ? metalc42 metalc ? ? Z MTE . "S2'" ? ? ? 1_555 CA MOM . MO1 ? ? F MTE 1778 F MOM 1781 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? ? metalc43 metalc ? ? G CYS 39 SG ? ? ? 1_555 EA FES . FE1 ? ? G CYS 39 G FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? ? metalc44 metalc ? ? G CYS 44 SG ? ? ? 1_555 EA FES . FE1 ? ? G CYS 44 G FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? ? metalc45 metalc ? ? G CYS 47 SG ? ? ? 1_555 EA FES . FE2 ? ? G CYS 47 G FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? ? metalc46 metalc ? ? G CYS 63 SG ? ? ? 1_555 EA FES . FE2 ? ? G CYS 63 G FES 1464 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? ? metalc47 metalc ? ? G CYS 103 SG ? ? ? 1_555 DA FES . FE2 ? ? G CYS 103 G FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? ? metalc48 metalc ? ? G CYS 106 SG ? ? ? 1_555 DA FES . FE1 ? ? G CYS 106 G FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? ? metalc49 metalc ? ? G CYS 134 SG ? ? ? 1_555 DA FES . FE1 ? ? G CYS 134 G FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc50 metalc ? ? G CYS 136 SG ? ? ? 1_555 DA FES . FE2 ? ? G CYS 136 G FES 1463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? ? metalc51 metalc ? ? H GLU 172 OE1 ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? H GLU 172 H CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? ? metalc52 metalc ? ? H GLU 172 OE2 ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? H GLU 172 H CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.155 ? ? metalc53 metalc ? ? H HIS 173 ND1 ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? H HIS 173 H CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? ? metalc54 metalc ? ? H THR 266 OG1 ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? H THR 266 H CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? ? metalc55 metalc ? ? H GLY 267 O ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? H GLY 267 H CA 1779 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? ? metalc56 metalc ? ? GA MTE . "S1'" ? ? ? 1_555 JA MOM . MO1 ? ? H MTE 1778 H MOM 1781 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? ? metalc57 metalc ? ? GA MTE . "S2'" ? ? ? 1_555 JA MOM . MO1 ? ? H MTE 1778 H MOM 1781 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ALA 759 B . ? ALA 759 B PRO 760 B ? PRO 760 B 1 2.41 2 ALA 759 D . ? ALA 759 D PRO 760 D ? PRO 760 D 1 -5.33 3 ALA 759 F . ? ALA 759 F PRO 760 F ? 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B MOM 1781 ? 1_555 83.7 ? 36 OM1 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 MO1 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 OM2 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 93.5 ? 37 "S2'" ? L MTE . ? B MTE 1778 ? 1_555 MO1 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 "S1'" ? L MTE . ? B MTE 1778 ? 1_555 79.9 ? 38 OM3 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 MO1 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 "S1'" ? L MTE . ? B MTE 1778 ? 1_555 94.5 ? 39 OM1 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 MO1 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 "S1'" ? L MTE . ? B MTE 1778 ? 1_555 99.8 ? 40 OM2 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 MO1 ? O MOM . ? B MOM 1781 ? 1_555 "S1'" ? L MTE . ? B MTE 1778 ? 1_555 166.6 ? 41 SG ? C CYS 39 ? C CYS 39 ? 1_555 FE1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 S1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 122.7 ? 42 SG ? C CYS 39 ? C CYS 39 ? 1_555 FE1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 S2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 105.7 ? 43 S1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 FE1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 S2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 90.6 ? 44 SG ? C CYS 39 ? C CYS 39 ? 1_555 FE1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 SG ? C CYS 44 ? C CYS 44 ? 1_555 101.6 ? 45 S1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 FE1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 SG ? C CYS 44 ? C CYS 44 ? 1_555 124.9 ? 46 S2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 FE1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 SG ? C CYS 44 ? C CYS 44 ? 1_555 108.5 ? 47 SG ? C CYS 47 ? C CYS 47 ? 1_555 FE2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 S1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 110.2 ? 48 SG ? C CYS 47 ? C CYS 47 ? 1_555 FE2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 S2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 121.0 ? 49 S1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 FE2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 S2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 90.3 ? 50 SG ? C CYS 47 ? C CYS 47 ? 1_555 FE2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 SG ? C CYS 63 ? C CYS 63 ? 1_555 97.2 ? 51 S1 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 FE2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 SG ? C CYS 63 ? C CYS 63 ? 1_555 120.5 ? 52 S2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 FE2 ? Q FES . ? C FES 1464 ? 1_555 SG ? C CYS 63 ? C CYS 63 ? 1_555 119.4 ? 53 SG ? C CYS 103 ? C CYS 103 ? 1_555 FE2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 S1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 97.5 ? 54 SG ? C CYS 103 ? C CYS 103 ? 1_555 FE2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 S2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 124.9 ? 55 S1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 FE2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 S2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 89.3 ? 56 SG ? C CYS 103 ? C CYS 103 ? 1_555 FE2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 SG ? C CYS 136 ? C CYS 136 ? 1_555 112.6 ? 57 S1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 FE2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 SG ? C CYS 136 ? C CYS 136 ? 1_555 113.0 ? 58 S2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 FE2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 SG ? C CYS 136 ? C CYS 136 ? 1_555 114.4 ? 59 SG ? C CYS 106 ? C CYS 106 ? 1_555 FE1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 S1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 112.9 ? 60 SG ? C CYS 106 ? C CYS 106 ? 1_555 FE1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 S2 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 105.3 ? 61 S1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 FE1 ? P FES . ? C FES 1463 ? 1_555 S2 ? P FES . ? 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