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E CYS 5087 E CYS 5116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf10 disulf ? ? E CYS 254 SG ? ? ? 1_555 E CYS 265 SG ? ? E CYS 5274 E CYS 5285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 67 SG ? ? ? 1_555 F CYS 96 SG ? ? F CYS 6087 F CYS 6116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 254 SG ? ? ? 1_555 F CYS 265 SG ? ? F CYS 6274 F CYS 6285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? covale1 covale none ? M GD7 . P1 ? ? ? 1_555 A SER 201 OG ? ? A GD7 1 A SER 1221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.761 ? ? covale2 covale one ? N NAG . C1 ? ? ? 1_555 A ASN 59 ND2 ? ? A NAG 179 A ASN 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? N-Glycosylation covale3 covale none ? N NAG . O5 ? ? ? 1_555 A ASN 59 CG ? ? A NAG 179 A ASN 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.886 ? ? covale4 covale none ? N NAG . O5 ? ? ? 1_555 A ASN 59 ND2 ? ? A NAG 179 A ASN 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? ? covale5 covale none ? R GD7 . P1 ? ? ? 1_555 B SER 201 OG ? ? B GD7 1 B SER 2221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.754 ? ? covale6 covale one ? S NAG . C1 ? ? ? 1_555 B ASN 59 ND2 ? ? B NAG 279 B ASN 2079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? N-Glycosylation covale7 covale none ? W GD7 . P1 ? ? ? 1_555 C SER 201 OG ? ? C GD7 1 C SER 3221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.757 ? ? covale8 covale one ? Y NAG . C1 ? ? ? 1_555 C ASN 59 ND2 ? ? C NAG 379 C ASN 3079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale9 covale none ? BA GD7 . P1 ? ? ? 1_555 D SER 201 OG ? ? D GD7 1 D SER 4221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.763 ? ? covale10 covale one ? CA NAG . C1 ? ? ? 1_555 D ASN 59 ND2 ? ? D NAG 479 D ASN 4079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? N-Glycosylation covale11 covale none ? CA NAG . O5 ? ? ? 1_555 D ASN 59 ND2 ? ? D NAG 479 D ASN 4079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.946 ? ? covale12 covale none ? GA GD7 . P1 ? ? ? 1_555 E SER 201 OG ? ? E GD7 1 E SER 5221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.750 ? ? covale13 covale one ? HA NAG . C1 ? ? ? 1_555 E ASN 59 ND2 ? ? E NAG 579 E ASN 5079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale14 covale none ? KA GD7 . P1 ? ? ? 1_555 F SER 201 OG ? ? F GD7 1 F SER 6221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.763 ? ? covale15 covale one ? MA NAG . C1 ? ? ? 1_555 F ASN 59 ND2 ? ? F NAG 679 F ASN 6079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale16 covale none ? MA NAG . O5 ? ? ? 1_555 F ASN 59 ND2 ? ? F NAG 679 F ASN 6079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.839 ? ? covale17 covale none ? MA NAG . C2 ? ? ? 1_555 F ASN 59 ND2 ? ? F NAG 679 F ASN 6079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? covale18 covale both ? G GLC . C1 ? ? ? 1_555 G FRU . O2 ? ? G GLC 1 G FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 sing ? covale19 covale both ? H GLC . C1 ? ? ? 1_555 H FRU . O2 ? ? H GLC 1 H FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 sing ? covale20 covale both ? I GLC . C1 ? ? ? 1_555 I FRU . O2 ? ? I GLC 1 I FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 sing ? covale21 covale both ? J GLC . C1 ? ? ? 1_555 J FRU . O2 ? ? J GLC 1 J FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 sing ? covale22 covale both ? K GLC . C1 ? ? ? 1_555 K FRU . O2 ? ? K GLC 1 K FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 sing ? covale23 covale both ? L GLC . C1 ? ? ? 1_555 L FRU . O2 ? ? L GLC 1 L FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 sing ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 11 ? C ? 2 ? D ? 3 ? E ? 11 ? F ? 2 ? G ? 3 ? H ? 11 ? I ? 2 ? J ? 3 ? K ? 11 ? L ? 2 ? M ? 3 ? N ? 11 ? O ? 2 ? P ? 3 ? Q ? 11 ? R ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? parallel B 5 6 ? parallel B 6 7 ? parallel B 7 8 ? parallel B 8 9 ? parallel B 9 10 ? parallel B 10 11 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? parallel E 5 6 ? parallel E 6 7 ? parallel E 7 8 ? parallel E 8 9 ? parallel E 9 10 ? parallel E 10 11 ? anti-parallel F 1 2 ? parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? parallel H 5 6 ? parallel H 6 7 ? parallel H 7 8 ? parallel H 8 9 ? parallel H 9 10 ? parallel H 10 11 ? anti-parallel I 1 2 ? parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? parallel K 5 6 ? parallel K 6 7 ? parallel K 7 8 ? parallel K 8 9 ? parallel K 9 10 ? parallel K 10 11 ? anti-parallel L 1 2 ? parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? parallel N 5 6 ? parallel N 6 7 ? parallel N 7 8 ? parallel N 8 9 ? parallel N 9 10 ? parallel N 10 11 ? anti-parallel O 1 2 ? parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? parallel Q 5 6 ? parallel Q 6 7 ? parallel Q 7 8 ? parallel Q 8 9 ? parallel Q 9 10 ? parallel Q 10 11 ? anti-parallel R 1 2 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 VAL A 5 ? 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PHE B 2043 PRO B 2054 E 3 TYR B 98 ? THR B 103 ? TYR B 2118 THR B 2123 E 4 VAL B 144 ? ILE B 148 ? VAL B 2164 ILE B 2168 E 5 LEU B 113 ? ILE B 119 ? LEU B 2133 ILE B 2139 E 6 GLY B 190 ? GLU B 200 ? GLY B 2210 GLU B 2220 E 7 ARG B 222 ? GLU B 226 ? ARG B 2242 GLU B 2246 E 8 TYR B 326 ? ASN B 331 ? TYR B 2346 ASN B 2351 E 9 THR B 423 ? GLN B 429 ? THR B 2444 GLN B 2450 E 10 GLY B 504 ? GLY B 509 ? GLY B 2525 GLY B 2530 E 11 GLN B 513 ? GLN B 516 ? GLN B 2534 GLN B 2537 F 1 MET B 66 ? CYS B 67 ? MET B 2086 CYS B 2087 F 2 LEU B 92 ? SER B 93 ? LEU B 2112 SER B 2113 G 1 VAL C 5 ? THR C 8 ? VAL C 3025 THR C 3028 G 2 GLY C 11 ? LEU C 14 ? GLY C 3031 LEU C 3034 G 3 VAL C 57 ? ASN C 59 ? VAL C 3077 ASN C 3079 H 1 LYS C 16 ? VAL C 18 ? LYS C 3036 VAL C 3038 H 2 VAL C 27 ? PRO C 34 ? VAL C 3047 PRO C 3054 H 3 TYR C 98 ? THR C 103 ? TYR C 3118 THR C 3123 H 4 VAL C 144 ? ILE C 148 ? VAL C 3164 ILE C 3168 H 5 LEU C 113 ? ILE C 119 ? LEU C 3133 ILE C 3139 H 6 GLY C 190 ? GLU C 200 ? GLY C 3210 GLU C 3220 H 7 ARG C 222 ? GLU C 226 ? ARG C 3242 GLU C 3246 H 8 TYR C 326 ? ASN C 331 ? TYR C 3346 ASN C 3351 H 9 THR C 423 ? PHE C 428 ? THR C 3444 PHE C 3449 H 10 TYR C 505 ? ILE C 508 ? TYR C 3526 ILE C 3529 H 11 GLN C 513 ? ALA C 515 ? GLN C 3534 ALA C 3536 I 1 MET C 66 ? CYS C 67 ? MET C 3086 CYS C 3087 I 2 LEU C 92 ? SER C 93 ? LEU C 3112 SER C 3113 J 1 VAL D 5 ? THR D 8 ? VAL D 4025 THR D 4028 J 2 GLY D 11 ? LEU D 14 ? GLY D 4031 LEU D 4034 J 3 VAL D 57 ? ASN D 59 ? VAL D 4077 ASN D 4079 K 1 LYS D 16 ? VAL D 18 ? LYS D 4036 VAL D 4038 K 2 VAL D 27 ? PRO D 34 ? VAL D 4047 PRO D 4054 K 3 TYR D 98 ? THR D 103 ? TYR D 4118 THR D 4123 K 4 VAL D 144 ? ILE D 148 ? VAL D 4164 ILE D 4168 K 5 LEU D 113 ? ILE D 119 ? LEU D 4133 ILE D 4139 K 6 GLY D 190 ? GLU D 200 ? GLY D 4210 GLU D 4220 K 7 ARG D 222 ? GLU D 226 ? ARG D 4242 GLU D 4246 K 8 TYR D 326 ? ASN D 331 ? TYR D 4346 ASN D 4351 K 9 THR D 423 ? PHE D 428 ? THR D 4444 PHE D 4449 K 10 GLY D 504 ? ILE D 508 ? GLY D 4525 ILE D 4529 K 11 GLN D 513 ? GLN D 516 ? GLN D 4534 GLN D 4537 L 1 MET D 66 ? CYS D 67 ? MET D 4086 CYS D 4087 L 2 LEU D 92 ? SER D 93 ? LEU D 4112 SER D 4113 M 1 VAL E 5 ? THR E 8 ? VAL E 5025 THR E 5028 M 2 GLY E 11 ? LEU E 14 ? GLY E 5031 LEU E 5034 M 3 VAL E 57 ? ASN E 59 ? VAL E 5077 ASN E 5079 N 1 LYS E 16 ? LEU E 20 ? LYS E 5036 LEU E 5040 N 2 PHE E 23 ? PRO E 34 ? PHE E 5043 PRO E 5054 N 3 TYR E 98 ? THR E 103 ? TYR E 5118 THR E 5123 N 4 VAL E 144 ? ILE E 148 ? VAL E 5164 ILE E 5168 N 5 LEU E 113 ? ILE E 119 ? LEU E 5133 ILE E 5139 N 6 GLY E 190 ? GLU E 200 ? GLY E 5210 GLU E 5220 N 7 ARG E 222 ? GLU E 226 ? ARG E 5242 GLU E 5246 N 8 TYR E 326 ? ASN E 331 ? TYR E 5346 ASN E 5351 N 9 THR E 423 ? PHE E 428 ? THR E 5444 PHE E 5449 N 10 GLY E 504 ? ILE E 508 ? GLY E 5525 ILE E 5529 N 11 GLN E 513 ? GLN E 516 ? GLN E 5534 GLN E 5537 O 1 MET E 66 ? CYS E 67 ? MET E 5086 CYS E 5087 O 2 LEU E 92 ? SER E 93 ? LEU E 5112 SER E 5113 P 1 VAL F 5 ? THR F 8 ? 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ASN 'GLYCOSYLATION SITE' # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,G,H,I,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,QA,RA,SA 2 1 D,E,F,J,K,L,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,TA,UA,VA # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 9180 ? 1 MORE -85 ? 1 'SSA (A^2)' 57980 ? 2 'ABSA (A^2)' 9130 ? 2 MORE -87 ? 2 'SSA (A^2)' 58030 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2007-05-01 2 'Structure model' 1 1 2008-05-01 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 2 0 2020-07-29 5 'Structure model' 2 1 2023-08-30 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 4 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Non-polymer description' 3 3 'Structure model' 'Version format compliance' 4 4 'Structure model' 'Atomic model' 5 4 'Structure model' 'Data collection' 6 4 'Structure model' 'Database references' 7 4 'Structure model' 'Derived calculations' 8 4 'Structure model' 'Non-polymer description' 9 4 'Structure model' 'Structure summary' 10 5 'Structure model' 'Data collection' 11 5 'Structure model' 'Database references' 12 5 'Structure model' 'Refinement description' 13 5 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' atom_site 2 4 'Structure model' chem_comp 3 4 'Structure model' entity 4 4 'Structure model' entity_name_com 5 4 'Structure model' pdbx_branch_scheme 6 4 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 7 4 'Structure model' pdbx_entity_branch 8 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_descriptor 9 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_link 10 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_list 11 4 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 12 4 'Structure model' pdbx_molecule_features 13 4 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 14 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly_gen 15 4 'Structure model' struct_asym 16 4 'Structure model' struct_conn 17 4 'Structure model' struct_ref_seq_dif 18 4 'Structure model' struct_site 19 4 'Structure model' struct_site_gen 20 5 'Structure model' chem_comp 21 5 'Structure model' chem_comp_atom 22 5 'Structure model' chem_comp_bond 23 5 'Structure model' database_2 24 5 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_atom_site.B_iso_or_equiv' 2 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_x' 3 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_y' 4 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_z' 5 4 'Structure model' '_atom_site.auth_asym_id' 6 4 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 7 4 'Structure model' '_atom_site.auth_comp_id' 8 4 'Structure model' '_atom_site.auth_seq_id' 9 4 'Structure model' '_atom_site.label_asym_id' 10 4 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 11 4 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 12 4 'Structure model' '_atom_site.label_entity_id' 13 4 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 14 4 'Structure model' '_chem_comp.formula' 15 4 'Structure model' '_chem_comp.formula_weight' 16 4 'Structure model' '_chem_comp.id' 17 4 'Structure model' '_chem_comp.mon_nstd_flag' 18 4 'Structure model' '_chem_comp.name' 19 4 'Structure model' '_chem_comp.type' 20 4 'Structure model' '_entity.formula_weight' 21 4 'Structure model' '_entity.pdbx_description' 22 4 'Structure model' '_entity.pdbx_number_of_molecules' 23 4 'Structure model' '_entity.src_method' 24 4 'Structure model' '_entity.type' 25 4 'Structure model' '_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list' 26 4 'Structure model' '_struct_asym.entity_id' 27 4 'Structure model' '_struct_ref_seq_dif.details' 28 5 'Structure model' '_chem_comp.pdbx_synonyms' 29 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 30 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal CNS refinement 1.1 ? 1 HKL-2000 'data reduction' . ? 2 HKL-2000 'data scaling' . ? 3 AMoRE phasing . ? 4 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 C8 A NAG 179 ? ? 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