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O VAL 213 CG2 # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal PHENIX refinement '(PHENIX.REFINE)' ? 1 XDS 'data reduction' . ? 2 XSCALE 'data scaling' . ? 3 PHASER phasing . ? 4 # _cell.entry_id 2Y9H _cell.length_a 85.860 _cell.length_b 149.810 _cell.length_c 87.260 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 94.60 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2Y9H _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 # _exptl.entry_id 2Y9H _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.32 _exptl_crystal.density_percent_sol 47.0 _exptl_crystal.description NONE # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.2 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details '0.1 M MES, PH 6.2, 8% PEG (W/V) 10000.' # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC CCD' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2010-09-12 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.999963 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ALS BEAMLINE 8.2.1' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ALS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 8.2.1 _diffrn_source.pdbx_wavelength 0.999963 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 2Y9H _reflns.observed_criterion_sigma_I 2.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 58.70 _reflns.d_resolution_high 2.50 _reflns.number_obs 75718 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 99.8 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.10 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 13.84 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 46.27 _reflns.pdbx_redundancy 5.6 # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 2.50 _reflns_shell.d_res_low 2.56 _reflns_shell.percent_possible_all 99.8 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.78 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.14 _reflns_shell.pdbx_redundancy 5.2 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 2Y9H _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 75718 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 1.99 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 58.697 _refine.ls_d_res_high 2.500 _refine.ls_percent_reflns_obs 99.77 _refine.ls_R_factor_obs 0.2320 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2305 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2895 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 2.3 _refine.ls_number_reflns_R_free 1761 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean 49.2 _refine.aniso_B[1][1] 1.6493 _refine.aniso_B[2][2] -2.0188 _refine.aniso_B[3][3] 0.3695 _refine.aniso_B[1][2] 0.0000 _refine.aniso_B[1][3] -2.7582 _refine.aniso_B[2][3] 0.0000 _refine.solvent_model_details 'FLAT BULK SOLVENT MODEL' _refine.solvent_model_param_ksol 0.368 _refine.solvent_model_param_bsol 48.777 _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.11 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.90 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ;CHAIN E RESIDUES 160-161 ARE DISORDERED. CHAIN G RESIDUES 51-55 AND 159-166 ARE DISORDERED. CHAIN I RESIDUES 52-54, 74, 140-141 AND 156- 167 ARE DISORDERED. CHAIN K RESIDUES 52-54, 140-143 AND 156-169 ARE DISORDERED. CHAIN M RESIDUES 51-55, 140-142 AND 157-168 ARE DISORDERED. CHAIN O RESIDUES 51-55, 71- 75, 138-143 AND 154-172 ARE DISORDERED. SIDE CHAINS FOR CHAIN O WERE OMITTED DUE TO HIGH DEGREES OF DISORDER THROUGHOUT THE MOLECULE. PHOSPHATE BETWEEN A22 AND U23 IS PRESENT FOR CHAINS B, D, F, H, J AND L, AND REST OF U23 IS DISORDERED FOR ALL RNA CHAINS. ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRY 2Y8W' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ML _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML 0.49 _refine.pdbx_overall_phase_error 36.15 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 12116 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 3072 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 475 _refine_hist.number_atoms_total 15663 _refine_hist.d_res_high 2.500 _refine_hist.d_res_low 58.697 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.009 ? ? 15787 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_d 1.215 ? ? 22096 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_dihedral_angle_d 15.927 ? ? 6367 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_chiral_restr 0.070 ? ? 2593 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_plane_restr 0.007 ? ? 2341 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.5000 2.5894 7355 0.3339 100.00 0.4263 . . 177 . . 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'X-RAY DIFFRACTION' . 5.3849 58.7127 7395 0.2212 98.00 0.2421 . . 177 . . # _database_PDB_matrix.entry_id 2Y9H _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 2Y9H _struct.title 'Structure A of CRISPR endoribonuclease Cse3 bound to 19 nt RNA' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2Y9H _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE/RNA _struct_keywords.text 'HYDROLASE-RNA COMPLEX, FERREDOXIN-LIKE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'expression tag' 0 32 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 4 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 5 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 6 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 7 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 8 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 2230 ? 1 MORE -21.8 ? 1 'SSA (A^2)' 13890 ? 2 'ABSA (A^2)' 2190 ? 2 MORE -22.1 ? 2 'SSA (A^2)' 13690 ? 3 'ABSA (A^2)' 2130 ? 3 MORE -22.0 ? 3 'SSA (A^2)' 13880 ? 4 'ABSA (A^2)' 2110 ? 4 MORE -22.7 ? 4 'SSA (A^2)' 12740 ? 5 'ABSA (A^2)' 2010 ? 5 MORE -19.6 ? 5 'SSA (A^2)' 12730 ? 6 'ABSA (A^2)' 1850 ? 6 MORE -17.3 ? 6 'SSA (A^2)' 12570 ? 7 'ABSA (A^2)' 1950 ? 7 MORE -18.6 ? 7 'SSA (A^2)' 12240 ? 8 'ABSA (A^2)' 860 ? 8 MORE -11.7 ? 8 'SSA (A^2)' 13210 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,Q,R 2 1 C,D,S,T 3 1 E,F,U,V 4 1 G,H,W,X 5 1 I,J,Y,Z 6 1 K,L,AA,BA 7 1 M,N,CA,DA 8 1 O,P,EA,FA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 SER A 16 ? 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GLY O 199 GLY O 203 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 78 A . ? GLU 74 A GLY 79 A ? GLY 75 A 1 9.48 2 GLY 166 C . ? GLY 162 C GLU 167 C ? GLU 163 C 1 5.05 3 GLU 145 E . ? GLU 141 E ARG 146 E ? ARG 142 E 1 0.13 4 GLU 78 K . ? GLU 74 K GLY 79 K ? 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OD ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AB 3 4 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AD 1 2 ? parallel AE 1 2 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AF 3 4 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AG 3 4 ? parallel AH 1 2 ? anti-parallel CA 1 2 ? anti-parallel CA 2 3 ? anti-parallel CA 3 4 ? anti-parallel CB 1 2 ? anti-parallel CB 2 3 ? anti-parallel CB 3 4 ? anti-parallel CC 1 2 ? anti-parallel CD 1 2 ? parallel CE 1 2 ? anti-parallel CF 1 2 ? anti-parallel CF 2 3 ? anti-parallel CF 3 4 ? anti-parallel CG 1 2 ? anti-parallel CG 2 3 ? anti-parallel CG 3 4 ? parallel CH 1 2 ? anti-parallel EA 1 2 ? anti-parallel EA 2 3 ? anti-parallel EA 3 4 ? anti-parallel EB 1 2 ? anti-parallel EB 2 3 ? anti-parallel EB 3 4 ? anti-parallel EC 1 2 ? anti-parallel ED 1 2 ? parallel EE 1 2 ? anti-parallel EF 1 2 ? anti-parallel EF 2 3 ? anti-parallel EF 3 4 ? anti-parallel EG 1 2 ? anti-parallel EG 2 3 ? anti-parallel EG 3 4 ? parallel EH 1 2 ? anti-parallel GA 1 2 ? anti-parallel GA 2 3 ? anti-parallel GA 3 4 ? anti-parallel GB 1 2 ? anti-parallel GB 2 3 ? anti-parallel GB 3 4 ? anti-parallel GC 1 2 ? anti-parallel GD 1 2 ? parallel GE 1 2 ? anti-parallel GF 1 2 ? anti-parallel GF 2 3 ? anti-parallel GF 3 4 ? anti-parallel GG 1 2 ? anti-parallel GG 2 3 ? anti-parallel GG 3 4 ? parallel GH 1 2 ? anti-parallel IA 1 2 ? anti-parallel IA 2 3 ? anti-parallel IA 3 4 ? anti-parallel IB 1 2 ? anti-parallel IB 2 3 ? anti-parallel IB 3 4 ? anti-parallel IC 1 2 ? anti-parallel ID 1 2 ? parallel IE 1 2 ? anti-parallel IF 1 2 ? anti-parallel IF 2 3 ? anti-parallel IF 3 4 ? anti-parallel IG 1 2 ? anti-parallel IG 2 3 ? anti-parallel IG 3 4 ? parallel IH 1 2 ? anti-parallel KA 1 2 ? anti-parallel KA 2 3 ? anti-parallel KA 3 4 ? anti-parallel KB 1 2 ? anti-parallel KB 2 3 ? anti-parallel KB 3 4 ? anti-parallel KC 1 2 ? anti-parallel KD 1 2 ? anti-parallel KD 2 3 ? anti-parallel KD 3 4 ? anti-parallel KE 1 2 ? anti-parallel MA 1 2 ? anti-parallel MA 2 3 ? anti-parallel MA 3 4 ? anti-parallel MB 1 2 ? anti-parallel MB 2 3 ? anti-parallel MB 3 4 ? anti-parallel MC 1 2 ? anti-parallel MD 1 2 ? parallel ME 1 2 ? anti-parallel MF 1 2 ? anti-parallel MF 2 3 ? anti-parallel MF 3 4 ? anti-parallel MG 1 2 ? anti-parallel MG 2 3 ? anti-parallel MG 3 4 ? parallel MH 1 2 ? anti-parallel OA 1 2 ? anti-parallel OA 2 3 ? anti-parallel OA 3 4 ? anti-parallel OB 1 2 ? anti-parallel OB 2 3 ? anti-parallel OC 1 2 ? anti-parallel OC 2 3 ? anti-parallel OD 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA 1 LEU A 49 ? LEU A 52 ? LEU A 45 LEU A 48 AA 2 VAL A 62 ? THR A 67 ? VAL A 58 THR A 63 AA 3 MET A 5 ? LEU A 12 ? MET A 1 LEU A 8 AA 4 ALA A 81 ? VAL A 83 ? ALA A 77 VAL A 79 AB 1 LEU A 49 ? LEU A 52 ? LEU A 45 LEU A 48 AB 2 VAL A 62 ? THR A 67 ? VAL A 58 THR A 63 AB 3 MET A 5 ? LEU A 12 ? MET A 1 LEU A 8 AB 4 LYS A 87 ? PHE A 89 ? LYS A 83 PHE A 85 AC 1 ALA A 81 ? VAL A 83 ? ALA A 77 VAL A 79 AC 2 MET A 5 ? LEU A 12 ? MET A 1 LEU A 8 AD 1 PHE A 139 ? LEU A 141 ? PHE A 135 LEU A 137 AD 2 LEU A 172 ? VAL A 186 ? LEU A 168 VAL A 182 AE 1 VAL A 150 ? ARG A 162 ? VAL A 146 ARG A 158 AE 2 LEU A 172 ? VAL A 186 ? LEU A 168 VAL A 182 AF 1 SER A 212 ? ALA A 214 ? SER A 208 ALA A 210 AF 2 ARG A 98 ? ALA A 105 ? ARG A 94 ALA A 101 AF 3 LEU A 172 ? VAL A 186 ? LEU A 168 VAL A 182 AF 4 VAL A 150 ? ARG A 162 ? VAL A 146 ARG A 158 AG 1 SER A 212 ? ALA A 214 ? SER A 208 ALA A 210 AG 2 ARG A 98 ? ALA A 105 ? ARG A 94 ALA A 101 AG 3 LEU A 172 ? VAL A 186 ? LEU A 168 VAL A 182 AG 4 PHE A 139 ? LEU A 141 ? PHE A 135 LEU A 137 AH 1 ALA A 108 ? ARG A 110 ? ALA A 104 ARG A 106 AH 2 ARG A 117 ? ALA A 119 ? ARG A 113 ALA A 115 CA 1 LEU C 49 ? GLU C 53 ? LEU C 45 GLU C 49 CA 2 VAL C 62 ? THR C 67 ? VAL C 58 THR C 63 CA 3 TRP C 6 ? LEU C 12 ? TRP C 2 LEU C 8 CA 4 ALA C 81 ? VAL C 83 ? ALA C 77 VAL C 79 CB 1 LEU C 49 ? GLU C 53 ? LEU C 45 GLU C 49 CB 2 VAL C 62 ? THR C 67 ? VAL C 58 THR C 63 CB 3 TRP C 6 ? LEU C 12 ? TRP C 2 LEU C 8 CB 4 LYS C 87 ? PRO C 88 ? LYS C 83 PRO C 84 CC 1 ALA C 81 ? VAL C 83 ? ALA C 77 VAL C 79 CC 2 TRP C 6 ? LEU C 12 ? TRP C 2 LEU C 8 CD 1 PHE C 139 ? LEU C 141 ? PHE C 135 LEU C 137 CD 2 LEU C 172 ? VAL C 186 ? LEU C 168 VAL C 182 CE 1 VAL C 150 ? ARG C 162 ? VAL C 146 ARG C 158 CE 2 LEU C 172 ? VAL C 186 ? LEU C 168 VAL C 182 CF 1 LEU C 211 ? ALA C 214 ? LEU C 207 ALA C 210 CF 2 ARG C 98 ? ALA C 105 ? ARG C 94 ALA C 101 CF 3 LEU C 172 ? VAL C 186 ? LEU C 168 VAL C 182 CF 4 VAL C 150 ? ARG C 162 ? VAL C 146 ARG C 158 CG 1 LEU C 211 ? ALA C 214 ? LEU C 207 ALA C 210 CG 2 ARG C 98 ? ALA C 105 ? ARG C 94 ALA C 101 CG 3 LEU C 172 ? VAL C 186 ? LEU C 168 VAL C 182 CG 4 PHE C 139 ? LEU C 141 ? PHE C 135 LEU C 137 CH 1 ALA C 108 ? ARG C 110 ? ALA C 104 ARG C 106 CH 2 ARG C 117 ? ALA C 119 ? ARG C 113 ALA C 115 EA 1 LEU E 49 ? LEU E 52 ? LEU E 45 LEU E 48 EA 2 VAL E 62 ? THR E 67 ? VAL E 58 THR E 63 EA 3 MET E 5 ? LEU E 12 ? MET E 1 LEU E 8 EA 4 ALA E 81 ? VAL E 83 ? ALA E 77 VAL E 79 EB 1 LEU E 49 ? LEU E 52 ? LEU E 45 LEU E 48 EB 2 VAL E 62 ? THR E 67 ? VAL E 58 THR E 63 EB 3 MET E 5 ? LEU E 12 ? MET E 1 LEU E 8 EB 4 LYS E 87 ? PHE E 89 ? LYS E 83 PHE E 85 EC 1 ALA E 81 ? VAL E 83 ? ALA E 77 VAL E 79 EC 2 MET E 5 ? LEU E 12 ? MET E 1 LEU E 8 ED 1 PHE E 139 ? LEU E 141 ? PHE E 135 LEU E 137 ED 2 LEU E 173 ? VAL E 186 ? LEU E 169 VAL E 182 EE 1 VAL E 150 ? ARG E 161 ? VAL E 146 ARG E 157 EE 2 LEU E 173 ? VAL E 186 ? LEU E 169 VAL E 182 EF 1 LEU E 210 ? ALA E 214 ? LEU E 206 ALA E 210 EF 2 ARG E 98 ? ALA E 105 ? ARG E 94 ALA E 101 EF 3 LEU E 173 ? VAL E 186 ? LEU E 169 VAL E 182 EF 4 VAL E 150 ? ARG E 161 ? VAL E 146 ARG E 157 EG 1 LEU E 210 ? ALA E 214 ? LEU E 206 ALA E 210 EG 2 ARG E 98 ? ALA E 105 ? ARG E 94 ALA E 101 EG 3 LEU E 173 ? VAL E 186 ? LEU E 169 VAL E 182 EG 4 PHE E 139 ? LEU E 141 ? PHE E 135 LEU E 137 EH 1 ALA E 108 ? ARG E 110 ? ALA E 104 ARG E 106 EH 2 ARG E 117 ? ALA E 119 ? ARG E 113 ALA E 115 GA 1 LEU G 49 ? GLU G 53 ? LEU G 45 GLU G 49 GA 2 VAL G 62 ? THR G 67 ? VAL G 58 THR G 63 GA 3 MET G 5 ? LEU G 12 ? MET G 1 LEU G 8 GA 4 ALA G 81 ? VAL G 83 ? ALA G 77 VAL G 79 GB 1 LEU G 49 ? GLU G 53 ? LEU G 45 GLU G 49 GB 2 VAL G 62 ? THR G 67 ? VAL G 58 THR G 63 GB 3 MET G 5 ? LEU G 12 ? MET G 1 LEU G 8 GB 4 LYS G 87 ? PHE G 89 ? LYS G 83 PHE G 85 GC 1 ALA G 81 ? VAL G 83 ? ALA G 77 VAL G 79 GC 2 MET G 5 ? LEU G 12 ? MET G 1 LEU G 8 GD 1 PHE G 139 ? LEU G 141 ? PHE G 135 LEU G 137 GD 2 LEU G 173 ? VAL G 186 ? LEU G 169 VAL G 182 GE 1 VAL G 150 ? ARG G 161 ? VAL G 146 ARG G 157 GE 2 LEU G 173 ? VAL G 186 ? LEU G 169 VAL G 182 GF 1 LEU G 211 ? ALA G 214 ? LEU G 207 ALA G 210 GF 2 ARG G 98 ? ALA G 105 ? ARG G 94 ALA G 101 GF 3 LEU G 173 ? VAL G 186 ? LEU G 169 VAL G 182 GF 4 VAL G 150 ? ARG G 161 ? VAL G 146 ARG G 157 GG 1 LEU G 211 ? ALA G 214 ? LEU G 207 ALA G 210 GG 2 ARG G 98 ? ALA G 105 ? ARG G 94 ALA G 101 GG 3 LEU G 173 ? VAL G 186 ? LEU G 169 VAL G 182 GG 4 PHE G 139 ? LEU G 141 ? PHE G 135 LEU G 137 GH 1 ALA G 108 ? ARG G 110 ? ALA G 104 ARG G 106 GH 2 ARG G 117 ? ALA G 119 ? ARG G 113 ALA G 115 IA 1 LEU I 49 ? LEU I 52 ? LEU I 45 LEU I 48 IA 2 VAL I 62 ? THR I 67 ? VAL I 58 THR I 63 IA 3 MET I 5 ? LEU I 12 ? MET I 1 LEU I 8 IA 4 ALA I 81 ? VAL I 83 ? ALA I 77 VAL I 79 IB 1 LEU I 49 ? LEU I 52 ? LEU I 45 LEU I 48 IB 2 VAL I 62 ? THR I 67 ? VAL I 58 THR I 63 IB 3 MET I 5 ? LEU I 12 ? MET I 1 LEU I 8 IB 4 LYS I 87 ? PHE I 89 ? LYS I 83 PHE I 85 IC 1 ALA I 81 ? VAL I 83 ? ALA I 77 VAL I 79 IC 2 MET I 5 ? LEU I 12 ? MET I 1 LEU I 8 ID 1 PHE I 139 ? LEU I 141 ? PHE I 135 LEU I 137 ID 2 VAL I 175 ? VAL I 186 ? VAL I 171 VAL I 182 IE 1 VAL I 150 ? LEU I 158 ? VAL I 146 LEU I 154 IE 2 VAL I 175 ? VAL I 186 ? VAL I 171 VAL I 182 IF 1 LEU I 211 ? ALA I 214 ? LEU I 207 ALA I 210 IF 2 ARG I 98 ? ALA I 105 ? ARG I 94 ALA I 101 IF 3 VAL I 175 ? VAL I 186 ? VAL I 171 VAL I 182 IF 4 VAL I 150 ? LEU I 158 ? VAL I 146 LEU I 154 IG 1 LEU I 211 ? ALA I 214 ? LEU I 207 ALA I 210 IG 2 ARG I 98 ? ALA I 105 ? ARG I 94 ALA I 101 IG 3 VAL I 175 ? VAL I 186 ? VAL I 171 VAL I 182 IG 4 PHE I 139 ? LEU I 141 ? PHE I 135 LEU I 137 IH 1 ALA I 108 ? ARG I 110 ? ALA I 104 ARG I 106 IH 2 ARG I 117 ? ALA I 119 ? ARG I 113 ALA I 115 KA 1 LEU K 49 ? LEU K 52 ? LEU K 45 LEU K 48 KA 2 VAL K 62 ? THR K 67 ? VAL K 58 THR K 63 KA 3 MET K 5 ? LEU K 12 ? MET K 1 LEU K 8 KA 4 ALA K 81 ? VAL K 83 ? ALA K 77 VAL K 79 KB 1 LEU K 49 ? LEU K 52 ? LEU K 45 LEU K 48 KB 2 VAL K 62 ? THR K 67 ? VAL K 58 THR K 63 KB 3 MET K 5 ? LEU K 12 ? MET K 1 LEU K 8 KB 4 LYS K 87 ? PHE K 89 ? LYS K 83 PHE K 85 KC 1 ALA K 81 ? VAL K 83 ? ALA K 77 VAL K 79 KC 2 MET K 5 ? LEU K 12 ? MET K 1 LEU K 8 KD 1 PHE K 139 ? LEU K 158 ? PHE K 135 LEU K 154 KD 2 VAL K 175 ? VAL K 186 ? VAL K 171 VAL K 182 KD 3 ARG K 98 ? ALA K 105 ? ARG K 94 ALA K 101 KD 4 LEU K 211 ? ALA K 214 ? LEU K 207 ALA K 210 KE 1 ALA K 108 ? ARG K 110 ? ALA K 104 ARG K 106 KE 2 ARG K 117 ? ALA K 119 ? ARG K 113 ALA K 115 MA 1 LEU M 49 ? LEU M 52 ? LEU M 45 LEU M 48 MA 2 VAL M 62 ? THR M 67 ? VAL M 58 THR M 63 MA 3 MET M 5 ? LEU M 12 ? MET M 1 LEU M 8 MA 4 ALA M 81 ? VAL M 83 ? ALA M 77 VAL M 79 MB 1 LEU M 49 ? LEU M 52 ? LEU M 45 LEU M 48 MB 2 VAL M 62 ? THR M 67 ? VAL M 58 THR M 63 MB 3 MET M 5 ? LEU M 12 ? MET M 1 LEU M 8 MB 4 LYS M 87 ? PHE M 89 ? LYS M 83 PHE M 85 MC 1 ALA M 81 ? VAL M 83 ? ALA M 77 VAL M 79 MC 2 MET M 5 ? LEU M 12 ? MET M 1 LEU M 8 MD 1 PHE M 139 ? LEU M 141 ? PHE M 135 LEU M 137 MD 2 GLN M 174 ? VAL M 186 ? GLN M 170 VAL M 182 ME 1 VAL M 150 ? GLU M 159 ? VAL M 146 GLU M 155 ME 2 GLN M 174 ? VAL M 186 ? GLN M 170 VAL M 182 MF 1 LEU M 211 ? ALA M 214 ? LEU M 207 ALA M 210 MF 2 ARG M 98 ? ALA M 105 ? ARG M 94 ALA M 101 MF 3 GLN M 174 ? VAL M 186 ? GLN M 170 VAL M 182 MF 4 VAL M 150 ? GLU M 159 ? VAL M 146 GLU M 155 MG 1 LEU M 211 ? ALA M 214 ? LEU M 207 ALA M 210 MG 2 ARG M 98 ? ALA M 105 ? ARG M 94 ALA M 101 MG 3 GLN M 174 ? VAL M 186 ? GLN M 170 VAL M 182 MG 4 PHE M 139 ? LEU M 141 ? PHE M 135 LEU M 137 MH 1 ALA M 108 ? ARG M 110 ? ALA M 104 ARG M 106 MH 2 ARG M 117 ? ALA M 119 ? ARG M 113 ALA M 115 OA 1 LEU O 49 ? ARG O 51 ? LEU O 45 ARG O 47 OA 2 VAL O 63 ? THR O 67 ? VAL O 59 THR O 63 OA 3 MET O 5 ? LEU O 10 ? MET O 1 LEU O 6 OA 4 PHE O 84 ? PHE O 89 ? PHE O 80 PHE O 85 OB 1 ARG O 98 ? LEU O 99 ? ARG O 94 LEU O 95 OB 2 LEU O 184 ? VAL O 186 ? LEU O 180 VAL O 182 OB 3 PHE O 139 ? ARG O 140 ? PHE O 135 ARG O 136 OC 1 ARG O 102 ? ALA O 105 ? ARG O 98 ALA O 101 OC 2 VAL O 178 ? GLY O 182 ? VAL O 174 GLY O 178 OC 3 VAL O 150 ? ILE O 152 ? VAL O 146 ILE O 148 OD 1 ALA O 108 ? ARG O 110 ? ALA O 104 ARG O 106 OD 2 ARG O 117 ? ALA O 119 ? 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-64.48 71.50 22 1 TRP I 145 ? ? -67.11 81.64 23 1 ASP K 73 ? ? -97.38 32.57 24 1 GLU K 74 ? ? -33.79 143.08 25 1 ARG K 136 ? ? -162.94 118.77 26 1 TRP K 145 ? ? -62.94 65.92 27 1 VAL M 33 ? ? -145.89 28.53 28 1 GLU M 74 ? ? -121.33 -59.05 29 1 LYS M 117 ? ? -99.06 -68.44 30 1 ARG M 136 ? ? -165.16 119.94 31 1 TRP M 145 ? ? -68.39 60.02 32 1 ASP M 151 ? ? -157.68 79.75 33 1 THR M 152 ? ? -110.17 -157.31 34 1 LEU O 8 ? ? -41.07 156.72 35 1 ARG O 17 ? ? -94.16 -67.73 36 1 ASP O 18 ? ? -56.35 -4.54 37 1 THR O 28 ? ? -65.79 -72.64 38 1 LYS O 31 ? ? -59.82 7.14 39 1 VAL O 33 ? ? -139.67 -69.36 40 1 SER O 34 ? ? 55.73 -54.54 41 1 ARG O 41 ? ? -98.28 46.96 42 1 VAL O 79 ? ? -57.48 106.78 43 1 PRO O 82 ? ? -30.62 127.27 44 1 HIS O 86 ? ? -113.88 79.04 45 1 PRO O 87 ? ? -37.33 133.42 46 1 LEU O 89 ? ? 39.72 37.00 47 1 ALA O 101 ? ? -155.10 -152.13 48 1 ASN O 102 ? ? -158.41 84.49 49 1 VAL O 123 ? ? -58.43 -6.69 50 1 TRP O 145 ? ? -65.71 73.05 51 1 ALA O 210 ? ? -172.39 142.65 # loop_ _pdbx_refine_tls.pdbx_refine_id _pdbx_refine_tls.id _pdbx_refine_tls.details _pdbx_refine_tls.method _pdbx_refine_tls.origin_x _pdbx_refine_tls.origin_y _pdbx_refine_tls.origin_z _pdbx_refine_tls.T[1][1] _pdbx_refine_tls.T[2][2] _pdbx_refine_tls.T[3][3] _pdbx_refine_tls.T[1][2] _pdbx_refine_tls.T[1][3] _pdbx_refine_tls.T[2][3] _pdbx_refine_tls.L[1][1] _pdbx_refine_tls.L[2][2] _pdbx_refine_tls.L[3][3] _pdbx_refine_tls.L[1][2] _pdbx_refine_tls.L[1][3] _pdbx_refine_tls.L[2][3] _pdbx_refine_tls.S[1][1] _pdbx_refine_tls.S[1][2] _pdbx_refine_tls.S[1][3] _pdbx_refine_tls.S[2][1] _pdbx_refine_tls.S[2][2] _pdbx_refine_tls.S[2][3] _pdbx_refine_tls.S[3][1] _pdbx_refine_tls.S[3][2] _pdbx_refine_tls.S[3][3] 'X-RAY DIFFRACTION' 1 ? 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refined -34.4004 -10.5622 13.7537 0.2814 0.1386 0.1203 0.0444 -0.0515 -0.0378 0.6910 0.6878 0.2102 0.5020 0.1023 -0.1725 -0.0622 0.2724 -0.0048 0.1113 -0.0433 0.1522 -0.1316 -0.1030 0.0018 'X-RAY DIFFRACTION' 7 ? refined -52.2247 -51.4232 35.8596 0.1392 0.1341 0.1475 0.0085 -0.0927 0.0240 0.3660 1.3687 0.4502 -0.4570 0.0613 -0.4427 0.1076 0.0034 0.0115 -0.0283 -0.2199 -0.0929 -0.0017 -0.0012 0.0738 'X-RAY DIFFRACTION' 8 ? refined -32.4624 -50.4676 37.1035 0.1001 0.2425 0.5961 -0.0048 -0.1178 0.2149 0.0311 1.4340 0.8699 -0.0096 -0.0803 0.4862 -0.0981 0.0565 0.1498 -0.0041 -0.0779 -1.0845 -0.0965 0.4430 0.2082 'X-RAY DIFFRACTION' 9 ? refined 3.0466 -34.0490 48.6026 0.1414 0.0638 0.1315 0.0380 -0.0331 -0.0008 1.1491 0.0670 0.5410 -0.4493 0.1035 0.1024 -0.0793 -0.0307 -0.0696 -0.0044 0.0859 0.1424 0.1327 0.0313 -0.0024 'X-RAY DIFFRACTION' 10 ? refined 8.6394 -34.2969 28.8641 0.2008 0.2781 0.0609 0.0378 -0.0192 -0.0190 0.6500 0.5107 0.6331 -0.5247 -0.1656 -0.2905 0.3032 -0.0811 -0.0990 -0.3109 -0.0950 0.0813 -0.0735 0.1828 -0.0994 'X-RAY DIFFRACTION' 11 ? 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'CHAIN P' # loop_ _pdbx_distant_solvent_atoms.id _pdbx_distant_solvent_atoms.PDB_model_num _pdbx_distant_solvent_atoms.auth_atom_id _pdbx_distant_solvent_atoms.label_alt_id _pdbx_distant_solvent_atoms.auth_asym_id _pdbx_distant_solvent_atoms.auth_comp_id _pdbx_distant_solvent_atoms.auth_seq_id _pdbx_distant_solvent_atoms.PDB_ins_code _pdbx_distant_solvent_atoms.neighbor_macromolecule_distance _pdbx_distant_solvent_atoms.neighbor_ligand_distance 1 1 O ? O HOH 2009 ? 7.16 . 2 1 O ? 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C2 N3 sing N N 136 C N3 C4 doub N N 137 C C4 N4 sing N N 138 C C4 C5 sing N N 139 C N4 H41 sing N N 140 C N4 H42 sing N N 141 C C5 C6 doub N N 142 C C5 H5 sing N N 143 C C6 H6 sing N N 144 DG OP3 P sing N N 145 DG OP3 HOP3 sing N N 146 DG P OP1 doub N N 147 DG P OP2 sing N N 148 DG P "O5'" sing N N 149 DG OP2 HOP2 sing N N 150 DG "O5'" "C5'" sing N N 151 DG "C5'" "C4'" sing N N 152 DG "C5'" "H5'" sing N N 153 DG "C5'" "H5''" sing N N 154 DG "C4'" "O4'" sing N N 155 DG "C4'" "C3'" sing N N 156 DG "C4'" "H4'" sing N N 157 DG "O4'" "C1'" sing N N 158 DG "C3'" "O3'" sing N N 159 DG "C3'" "C2'" sing N N 160 DG "C3'" "H3'" sing N N 161 DG "O3'" "HO3'" sing N N 162 DG "C2'" "C1'" sing N N 163 DG "C2'" "H2'" sing N N 164 DG "C2'" "H2''" sing N N 165 DG "C1'" N9 sing N N 166 DG "C1'" "H1'" sing N N 167 DG N9 C8 sing Y N 168 DG N9 C4 sing Y N 169 DG C8 N7 doub Y N 170 DG C8 H8 sing N N 171 DG N7 C5 sing Y N 172 DG C5 C6 sing N N 173 DG C5 C4 doub Y N 174 DG C6 O6 doub N N 175 DG C6 N1 sing N N 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