data_3J9U # _entry.id 3J9U # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.387 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI RCSB RCSB160432 ? ? PDB 3J9U pdb_00003j9u 10.2210/pdb3j9u/pdb WWPDB D_1000160432 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2015-05-13 2 'Structure model' 1 1 2015-05-20 3 'Structure model' 1 2 2015-06-03 4 'Structure model' 1 3 2018-07-18 5 'Structure model' 1 4 2024-02-21 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Database references' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 5 'Structure model' 'Data collection' 5 5 'Structure model' 'Database references' 6 5 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' em_software 2 5 'Structure model' chem_comp_atom 3 5 'Structure model' chem_comp_bond 4 5 'Structure model' database_2 5 5 'Structure model' em_3d_fitting_list 6 5 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 2 4 'Structure model' '_em_software.name' 3 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 4 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 5 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.accession_code' 6 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id' 7 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.source_name' 8 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.type' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 3J9U _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2015-02-23 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type _pdbx_database_related.details EMDB EMD-6285 'associated EM volume' . EMDB EMD-6284 'other EM volume' . EMDB EMD-6286 'other EM volume' . PDB 3J9T unspecified . PDB 3J9V unspecified . # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Zhao, J.' 1 'Benlekbir, S.' 2 'Rubinstein, J.L.' 3 # _citation.id primary _citation.title 'Electron cryomicroscopy observation of rotational states in a eukaryotic V-ATPase.' _citation.journal_abbrev Nature _citation.journal_volume 521 _citation.page_first 241 _citation.page_last 245 _citation.year 2015 _citation.journal_id_ASTM NATUAS _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0028-0836 _citation.journal_id_CSD 0006 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 25971514 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/nature14365 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhao, J.' 1 ? primary 'Benlekbir, S.' 2 ? primary 'Rubinstein, J.L.' 3 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit D' 29235.023 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit F' 13479.170 1 ? ? ? ? 3 polymer nat 'V-type proton ATPase catalytic subunit A' 67665.305 3 '3.6.3.14, 3.1.-.-' ? 'SEE REMARK 999' ? 4 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit B' 57815.023 3 ? ? ? ? 5 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit d' 39822.484 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit G' 12738.706 3 ? ? ? ? 7 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit E' 26508.393 3 ? ? ? ? 8 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit H' 54482.609 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform' 95625.484 1 ? ? ? ? 10 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit C' 44241.352 1 ? ? ? ? 11 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit c' 16357.501 10 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'V-ATPase subunit D, Vacuolar proton pump subunit D' 2 'V-ATPase subunit F, V-ATPase 14 kDa subunit, Vacuolar proton pump subunit F' 3 'V-ATPase subunit A, Vacuolar proton pump subunit A, Endonuclease PI-SceI, Sce VMA intein, VMA1-derived endonuclease, VDE' 4 'V-ATPase subunit B, V-ATPase 57 kDa subunit, Vacuolar proton pump subunit B' 5 'V-ATPase subunit d, V-ATPase 39 kDa subunit, V-ATPase subunit M39, Vacuolar proton pump subunit d' 6 'V-ATPase subunit G, V-ATPase 13 kDa subunit, Vacuolar proton pump subunit G' 7 'V-ATPase subunit E, V-ATPase 27 kDa subunit, Vacuolar proton pump subunit E' 8 'V-ATPase subunit H, V-ATPase 54 kDa subunit, Vacuolar proton pump subunit H' 9 ;V-ATPase a 1 subunit, V-ATPase 95 kDa subunit, Vacuolar pH protein 1, Vacuolar proton pump a subunit, Vacuolar proton translocating ATPase subunit a 1 ; 10 'V-ATPase subunit C, V-ATPase 42 kDa subunit, Vacuolar proton pump subunit C' 11 'V-ATPase subunit c, Guanine nucleotide exchange factor 2, V-ATPase 16 kDa proteolipid subunit 1, Vacuolar proton pump c subunit' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; M ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; N ? 3 'polypeptide(L)' no no ;AGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGLT VGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYGS 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LRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIKEDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQKA VANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEKLLSTMQERFAESTD ; C,E,A ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; D,F,B ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MEGVYFNIDNGFIEGVVRGYRNGLLSNNQYINLTQCDTLEDLKLQLSSTDYGNFLSSVSSESLTTSLIQEYASSKLYHEF NYIRDQSSGSTRKFMDYITYGYMIDNVALMITGTIHDRDKGEILQRCHPLGWFDTLPTLSVATDLESLYETVLVDTPLAP YFKNCFDTAEELDDMNIEIIRNKLYKAYLEDFYNFVTEEIPEPAKECMQTLLGFEADRRSINIALNSLQSSDIDPDLKSD LLPNIGKLYPLATFHLAQAQDFEGVRAALANVYEYRGFLETGNLEDHFYQLEMELCRDAFTQQFAISTVWAWMKSKEQEV RNITWIAECIAQNQRERINNYISVY ; ;MEGVYFNIDNGFIEGVVRGYRNGLLSNNQYINLTQCDTLEDLKLQLSSTDYGNFLSSVSSESLTTSLIQEYASSKLYHEF NYIRDQSSGSTRKFMDYITYGYMIDNVALMITGTIHDRDKGEILQRCHPLGWFDTLPTLSVATDLESLYETVLVDTPLAP YFKNCFDTAEELDDMNIEIIRNKLYKAYLEDFYNFVTEEIPEPAKECMQTLLGFEADRRSINIALNSLQSSDIDPDLKSD LLPNIGKLYPLATFHLAQAQDFEGVRAALANVYEYRGFLETGNLEDHFYQLEMELCRDAFTQQFAISTVWAWMKSKEQEV RNITWIAECIAQNQRERINNYISVY ; Q ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKAEAGVQGEL AEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL ; ;MSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKAEAGVQGEL AEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL ; L,H,J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; K,G,I ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MGATKILMDSTHFNEIRSIIRSRSVAWDALARSEELSEIDASTAKALESILVKKNIGDGLSSSNNAHSGFKVNGKTLIPL IHLLSTSDNEDCKKSVQNLIAELLSSDKYGDDTVKFFQEDPKQLEQLFDVSLKGDFQTVLISGFNVVSLLVQNGLHNVKL VEKLLKNNNLINILQNIEQMDTCYVCIRLLQELAVIPEYRDVIWLHEKKFMPTLFKILQRATDSQLATRIVATNSNHLGI QLQYHSLLLIWLLTFNPVFANELVQKYLSDFLDLLKLVKITIKEKVSRLCISIILQCCSTRVKQHKKVIKQLLLLGNALP TVQSLSERKYSDEELRQDISNLKEILENEYQELTSFDEYVAELDSKLLCWSPPHVDNGFWSDNIDEFKKDNYKIFRQLIE LLQAKVRNGDVNAKQEKIIIQVALNDITHVVELLPESIDVLDKTGGKADIMELLNHSDSRVKYEALKATQAIIGYTFK ; ;MGATKILMDSTHFNEIRSIIRSRSVAWDALARSEELSEIDASTAKALESILVKKNIGDGLSSSNNAHSGFKVNGKTLIPL IHLLSTSDNEDCKKSVQNLIAELLSSDKYGDDTVKFFQEDPKQLEQLFDVSLKGDFQTVLISGFNVVSLLVQNGLHNVKL VEKLLKNNNLINILQNIEQMDTCYVCIRLLQELAVIPEYRDVIWLHEKKFMPTLFKILQRATDSQLATRIVATNSNHLGI QLQYHSLLLIWLLTFNPVFANELVQKYLSDFLDLLKLVKITIKEKVSRLCISIILQCCSTRVKQHKKVIKQLLLLGNALP TVQSLSERKYSDEELRQDISNLKEILENEYQELTSFDEYVAELDSKLLCWSPPHVDNGFWSDNIDEFKKDNYKIFRQLIE LLQAKVRNGDVNAKQEKIIIQVALNDITHVVELLPESIDVLDKTGGKADIMELLNHSDSRVKYEALKATQAIIGYTFK ; P ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MAEKEEAIFRSAEMALVQFYIPQEISRDSAYTLGQLGLVQFRDLNSKVRAFQRTFVNEIRRLDNVERQYRYFYSLLKKHD IKLYEGDTDKYLDGSGELYVPPSGSVIDDYVRNASYLEERLIQMEDATDQIEVQKNDLEQYRFILQSGDEFFLKGDNTDS TSYMDEDMIDANGENIAAAIGASVNYVTGVIARDKVATLEQILWRVLRGNLFFKTVEIEQPVYDVKTREYKHKNAFIVFS HGDLIIKRIRKIAESLDANLYDVDSSNEGRSQQLAKVNKNLSDLYTVLKTTSTTLESELYAIAKELDSWFQDVTREKAIF EILNKSNYDTNRKILIAEGWIPRDELATLQARLGEMIARLGIDVPSIIQVLDTNHTPPTFHRTNKFTAGFQSICDCYGIA QYREINAGLPTIVTFPFMFAIMFGDMGHGFLMTLAALSLVLNEKKINKMKRGEIFDMAFTGRYIILLMGVFSMYTGFLYN DIFSKTMTIFKSGWKWPDHWKKGESITATSVGTYPIGLDWAWHGTENALLFSNSYKMKLSILMGFIHMTYSYFFSLANHL YFNSMIDIIGNFIPGLLFMQGIFGYLSVCIVYKWAVDWVKDGKPAPGLLNMLINMFLSPGTIDDELYPHQAKVQVFLLLM ALVCIPWLLLVKPLHFKFTHKKKSHEPLPSTEADASSEDLEAQQLISAMDADDAEEEEVGSGSHGEDFGDIMIHQVIHTI EFCLNCVSHTASYLRLWALSLAHAQLSSVLWTMTIQIAFGFRGFVGVFMTVALFAMWFALTCAVLVLMEGTSAMLHSLRL HWVESMSKFFVGEGLPYEPFAFEYKDMEVAVASASSSASS ; ;MAEKEEAIFRSAEMALVQFYIPQEISRDSAYTLGQLGLVQFRDLNSKVRAFQRTFVNEIRRLDNVERQYRYFYSLLKKHD IKLYEGDTDKYLDGSGELYVPPSGSVIDDYVRNASYLEERLIQMEDATDQIEVQKNDLEQYRFILQSGDEFFLKGDNTDS TSYMDEDMIDANGENIAAAIGASVNYVTGVIARDKVATLEQILWRVLRGNLFFKTVEIEQPVYDVKTREYKHKNAFIVFS HGDLIIKRIRKIAESLDANLYDVDSSNEGRSQQLAKVNKNLSDLYTVLKTTSTTLESELYAIAKELDSWFQDVTREKAIF EILNKSNYDTNRKILIAEGWIPRDELATLQARLGEMIARLGIDVPSIIQVLDTNHTPPTFHRTNKFTAGFQSICDCYGIA QYREINAGLPTIVTFPFMFAIMFGDMGHGFLMTLAALSLVLNEKKINKMKRGEIFDMAFTGRYIILLMGVFSMYTGFLYN DIFSKTMTIFKSGWKWPDHWKKGESITATSVGTYPIGLDWAWHGTENALLFSNSYKMKLSILMGFIHMTYSYFFSLANHL YFNSMIDIIGNFIPGLLFMQGIFGYLSVCIVYKWAVDWVKDGKPAPGLLNMLINMFLSPGTIDDELYPHQAKVQVFLLLM ALVCIPWLLLVKPLHFKFTHKKKSHEPLPSTEADASSEDLEAQQLISAMDADDAEEEEVGSGSHGEDFGDIMIHQVIHTI EFCLNCVSHTASYLRLWALSLAHAQLSSVLWTMTIQIAFGFRGFVGVFMTVALFAMWFALTCAVLVLMEGTSAMLHSLRL HWVESMSKFFVGEGLPYEPFAFEYKDMEVAVASASSSASS ; b ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; O ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MTELCPVYAPFFGAIGCASAIIFTSLGAAYGTAKSGVGICATCVLRPDLLFKNIVPVIMAGIIAIYGLVVSVLVCYSLGQ KQALYTGFIQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGSSQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALLLNSRATQDVVC ; ;MTELCPVYAPFFGAIGCASAIIFTSLGAAYGTAKSGVGICATCVLRPDLLFKNIVPVIMAGIIAIYGLVVSVLVCYSLGQ KQALYTGFIQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGSSQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALLLNSRATQDVVC ; 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B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 9 ? N N N 10 ? O N N 6 ? P N N 7 ? Q N N 6 ? R N N 7 ? S N N 11 ? T N N 11 ? U N N 11 ? V N N 11 ? W N N 11 ? X N N 11 ? Y N N 11 ? Z N N 11 ? AA N N 11 ? BA N N 11 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP VATD_YEAST P32610 1 ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; 1 ? 2 UNP VATF_YEAST P39111 2 ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; 1 ? 3 UNP VATA_YEAST P17255 3 ;AGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGLT VGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYGS VFENSLISSHKILLPPRSRGTITWIAPAGEYTLDEKILEVEFDGKKSDFTLYHTWPVRVPRPVTEKLSADYPLLTGQRVL DALFPCVQGGTTCIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDAIIYVG ; 2 ? 4 UNP VATA_YEAST P17255 3 ;CGERGNEMAEVLMEFPELYTEMSGTKEPIMKRTTLVANTSNMPVAAREASIYTGITLAEYFRDQGKNVSMIADSSSRWAE ALREISGRLGEMPADQGFPAYLGAKLASFYERAGKAVALGSPDRTGSVSIVAAVSPAGGDFSDPVTTATLGITQVFWGLD KKLAQRKHFPSINTSVSYSKYTNVLNKFYDSNYPEFPVLRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIK EDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQKAVANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEK LLSTMQERFAESTD ; 738 ? 5 UNP VATB_YEAST P16140 4 ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; 1 ? 6 UNP VA0D_YEAST P32366 5 ;MEGVYFNIDNGFIEGVVRGYRNGLLSNNQYINLTQCDTLEDLKLQLSSTDYGNFLSSVSSESLTTSLIQEYASSKLYHEF NYIRDQSSGSTRKFMDYITYGYMIDNVALMITGTIHDRDKGEILQRCHPLGWFDTLPTLSVATDLESLYETVLVDTPLAP YFKNCFDTAEELDDMNIEIIRNKLYKAYLEDFYNFVTEEIPEPAKECMQTLLGFEADRRSINIALNSLQSSDIDPDLKSD LLPNIGKLYPLATFHLAQAQDFEGVRAALANVYEYRGFLETGNLEDHFYQLEMELCRDAFTQQFAISTVWAWMKSKEQEV RNITWIAECIAQNQRERINNYISVY ; 1 ? 7 UNP VATG_YEAST P48836 6 ;MSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKAEAGVQGEL AEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL ; 1 ? 8 UNP VATE_YEAST P22203 7 ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; 1 ? 9 UNP VATH_YEAST P41807 8 ;MGATKILMDSTHFNEIRSIIRSRSVAWDALARSEELSEIDASTAKALESILVKKNIGDGLSSSNNAHSGFKVNGKTLIPL IHLLSTSDNEDCKKSVQNLIAELLSSDKYGDDTVKFFQEDPKQLEQLFDVSLKGDFQTVLISGFNVVSLLVQNGLHNVKL VEKLLKNNNLINILQNIEQMDTCYVCIRLLQELAVIPEYRDVIWLHEKKFMPTLFKILQRATDSQLATRIVATNSNHLGI QLQYHSLLLIWLLTFNPVFANELVQKYLSDFLDLLKLVKITIKEKVSRLCISIILQCCSTRVKQHKKVIKQLLLLGNALP TVQSLSERKYSDEELRQDISNLKEILENEYQELTSFDEYVAELDSKLLCWSPPHVDNGFWSDNIDEFKKDNYKIFRQLIE LLQAKVRNGDVNAKQEKIIIQVALNDITHVVELLPESIDVLDKTGGKADIMELLNHSDSRVKYEALKATQAIIGYTFK ; 1 ? 10 UNP VPH1_YEAST P32563 9 ;MAEKEEAIFRSAEMALVQFYIPQEISRDSAYTLGQLGLVQFRDLNSKVRAFQRTFVNEIRRLDNVERQYRYFYSLLKKHD IKLYEGDTDKYLDGSGELYVPPSGSVIDDYVRNASYLEERLIQMEDATDQIEVQKNDLEQYRFILQSGDEFFLKGDNTDS TSYMDEDMIDANGENIAAAIGASVNYVTGVIARDKVATLEQILWRVLRGNLFFKTVEIEQPVYDVKTREYKHKNAFIVFS HGDLIIKRIRKIAESLDANLYDVDSSNEGRSQQLAKVNKNLSDLYTVLKTTSTTLESELYAIAKELDSWFQDVTREKAIF EILNKSNYDTNRKILIAEGWIPRDELATLQARLGEMIARLGIDVPSIIQVLDTNHTPPTFHRTNKFTAGFQSICDCYGIA QYREINAGLPTIVTFPFMFAIMFGDMGHGFLMTLAALSLVLNEKKINKMKRGEIFDMAFTGRYIILLMGVFSMYTGFLYN DIFSKTMTIFKSGWKWPDHWKKGESITATSVGTYPIGLDWAWHGTENALLFSNSYKMKLSILMGFIHMTYSYFFSLANHL YFNSMIDIIGNFIPGLLFMQGIFGYLSVCIVYKWAVDWVKDGKPAPGLLNMLINMFLSPGTIDDELYPHQAKVQVFLLLM ALVCIPWLLLVKPLHFKFTHKKKSHEPLPSTEADASSEDLEAQQLISAMDADDAEEEEVGSGSHGEDFGDIMIHQVIHTI EFCLNCVSHTASYLRLWALSLAHAQLSSVLWTMTIQIAFGFRGFVGVFMTVALFAMWFALTCAVLVLMEGTSAMLHSLRL HWVESMSKFFVGEGLPYEPFAFEYKDMEVAVASASSSASS ; 1 ? 11 UNP VATC_YEAST P31412 10 ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; 1 ? 12 UNP VATL1_YEAST P25515 11 ;MTELCPVYAPFFGAIGCASAIIFTSLGAAYGTAKSGVGICATCVLRPDLLFKNIVPVIMAGIIAIYGLVVSVLVCYSLGQ KQALYTGFIQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGSSQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALLLNSRATQDVVC ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3J9U M 1 ? 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P25515 1 ? 160 ? 1 160 23 12 3J9U X 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 24 12 3J9U a 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 25 12 3J9U R 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 26 12 3J9U Z 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 27 12 3J9U S 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 28 12 3J9U Y 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 29 12 3J9U T 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 30 12 3J9U V 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 31 12 3J9U W 1 ? 160 ? P25515 1 ? 160 ? 1 160 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 28-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 28 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 MET A 13 ? 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GLY C 287 LEU C 300 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 16 ILE C 311 ? LYS C 313 ? ILE C 311 LYS C 313 5 ? 3 HELX_P HELX_P17 17 PRO C 325 ? ASP C 345 ? PRO C 325 ASP C 345 1 ? 21 HELX_P HELX_P18 18 SER C 356 ? GLY C 372 ? SER C 356 GLY C 372 1 ? 17 HELX_P HELX_P19 19 ALA C 376 ? PHE C 380 ? ALA C 376 PHE C 380 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 20 ALA C 382 ? ALA C 395 ? ALA C 382 ALA C 395 1 ? 14 HELX_P HELX_P21 21 ASP C 425 ? THR C 435 ? ASP C 425 THR C 435 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 22 ASP C 442 ? ARG C 448 ? ASP C 442 ARG C 448 1 ? 7 HELX_P HELX_P23 23 TYR C 463 ? TYR C 475 ? TYR C 463 TYR C 475 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 24 GLU C 477 ? VAL C 502 ? GLU C 477 VAL C 502 1 ? 26 HELX_P HELX_P25 25 SER C 508 ? PHE C 525 ? SER C 508 PHE C 525 1 ? 18 HELX_P HELX_P26 26 PRO C 539 ? ASN C 563 ? PRO C 539 ASN C 563 1 ? 25 HELX_P HELX_P27 27 ASN C 566 ? GLY C 575 ? ASN C 566 GLY C 575 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 28 GLY C 575 ? SER C 583 ? GLY C 575 SER C 583 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 29 SER C 584 ? PHE C 587 ? 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THR I 9 ASN I 112 1 ? 104 HELX_P HELX_P198 198 ASN R 113 ? LEU R 133 ? ASN I 113 LEU I 133 1 ? 21 HELX_P HELX_P199 199 ASP R 145 ? SER R 151 ? ASP I 145 SER I 151 1 ? 7 HELX_P HELX_P200 200 MET R 152 ? GLU R 162 ? MET I 152 GLU I 162 1 ? 11 HELX_P HELX_P201 201 LEU R 203 ? TYR R 223 ? LEU I 203 TYR I 223 1 ? 21 HELX_P HELX_P202 202 PHE S 12 ? ARG S 46 ? PHE U 12 ARG U 46 1 ? 35 HELX_P HELX_P203 203 LEU S 49 ? MET S 59 ? LEU U 49 MET U 59 1 ? 11 HELX_P HELX_P204 204 ILE S 62 ? SER S 77 ? ILE U 62 SER U 77 1 ? 16 HELX_P HELX_P205 205 ALA S 83 ? GLN S 122 ? ALA U 83 GLN U 122 1 ? 40 HELX_P HELX_P206 206 LEU S 125 ? THR S 155 ? LEU U 125 THR U 155 1 ? 31 HELX_P HELX_P207 207 PHE T 12 ? CYS T 43 ? PHE X 12 CYS X 43 1 ? 32 HELX_P HELX_P208 208 LEU T 49 ? ILE T 58 ? LEU X 49 ILE X 58 1 ? 10 HELX_P HELX_P209 209 MET T 59 ? GLY T 61 ? MET X 59 GLY X 61 5 ? 3 HELX_P HELX_P210 210 ILE T 62 ? SER T 77 ? ILE X 62 SER X 77 1 ? 16 HELX_P HELX_P211 211 ALA T 83 ? GLN T 122 ? 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LEU R 125 ALA R 136 1 ? 12 HELX_P HELX_P226 226 GLU V 137 ? THR V 155 ? GLU R 137 THR R 155 1 ? 19 HELX_P HELX_P227 227 PHE W 12 ? ARG W 46 ? PHE Z 12 ARG Z 46 1 ? 35 HELX_P HELX_P228 228 LEU W 49 ? ILE W 54 ? LEU Z 49 ILE Z 54 1 ? 6 HELX_P HELX_P229 229 ILE W 54 ? ALA W 60 ? ILE Z 54 ALA Z 60 1 ? 7 HELX_P HELX_P230 230 ILE W 62 ? SER W 77 ? ILE Z 62 SER Z 77 1 ? 16 HELX_P HELX_P231 231 ALA W 83 ? GLN W 122 ? ALA Z 83 GLN Z 122 1 ? 40 HELX_P HELX_P232 232 LEU W 125 ? GLU W 137 ? LEU Z 125 GLU Z 137 1 ? 13 HELX_P HELX_P233 233 GLU W 137 ? THR W 155 ? GLU Z 137 THR Z 155 1 ? 19 HELX_P HELX_P234 234 THR W 155 ? CYS W 160 ? THR Z 155 CYS Z 160 1 ? 6 HELX_P HELX_P235 235 PHE X 12 ? CYS X 43 ? PHE S 12 CYS S 43 1 ? 32 HELX_P HELX_P236 236 LEU X 49 ? GLY X 61 ? LEU S 49 GLY S 61 1 ? 13 HELX_P HELX_P237 237 ILE X 62 ? SER X 77 ? ILE S 62 SER S 77 1 ? 16 HELX_P HELX_P238 238 ALA X 83 ? GLN X 122 ? ALA S 83 GLN S 122 1 ? 40 HELX_P HELX_P239 239 LEU X 125 ? ALA X 136 ? 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AO ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? parallel B 2 3 ? parallel B 3 4 ? parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel C 4 5 ? anti-parallel C 5 6 ? anti-parallel C 6 7 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel D 6 7 ? anti-parallel D 7 8 ? anti-parallel D 8 9 ? anti-parallel D 9 10 ? anti-parallel D 10 11 ? anti-parallel D 11 12 ? anti-parallel D 12 13 ? anti-parallel D 13 14 ? anti-parallel D 14 15 ? anti-parallel D 15 16 ? anti-parallel D 16 17 ? anti-parallel D 17 18 ? anti-parallel D 18 19 ? anti-parallel D 19 20 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? parallel F 2 3 ? parallel F 3 4 ? parallel F 4 5 ? parallel F 5 6 ? anti-parallel F 6 7 ? anti-parallel G 1 2 ? parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? parallel G 5 6 ? parallel G 6 7 ? parallel G 7 8 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? parallel K 2 3 ? parallel K 3 4 ? parallel K 4 5 ? parallel K 5 6 ? anti-parallel L 1 2 ? parallel L 2 3 ? parallel L 3 4 ? parallel L 4 5 ? parallel L 5 6 ? parallel L 6 7 ? parallel L 7 8 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? parallel O 2 3 ? parallel O 3 4 ? parallel O 4 5 ? parallel O 5 6 ? anti-parallel O 6 7 ? anti-parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? parallel P 3 4 ? parallel P 4 5 ? parallel P 5 6 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel T 4 5 ? anti-parallel T 5 6 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? parallel V 2 3 ? parallel V 3 4 ? parallel V 4 5 ? parallel V 5 6 ? anti-parallel W 1 2 ? parallel W 2 3 ? parallel W 3 4 ? parallel W 4 5 ? parallel W 5 6 ? parallel W 6 7 ? parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel X 4 5 ? anti-parallel X 6 7 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Y 5 6 ? anti-parallel Y 6 7 ? anti-parallel Y 7 8 ? anti-parallel Y 8 9 ? anti-parallel Y 9 10 ? anti-parallel Y 11 12 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel AA 1 2 ? parallel AA 2 3 ? parallel AA 3 4 ? parallel AA 4 5 ? parallel AA 5 6 ? anti-parallel AA 6 7 ? anti-parallel AB 1 2 ? parallel AB 2 3 ? parallel AB 3 4 ? parallel AB 4 5 ? parallel AB 5 6 ? parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AD 3 4 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AG 1 2 ? parallel AG 2 3 ? parallel AG 3 4 ? parallel AG 4 5 ? parallel AG 5 6 ? anti-parallel AH 1 2 ? parallel AH 2 3 ? parallel AH 3 4 ? parallel AH 4 5 ? parallel AH 5 6 ? parallel AH 6 7 ? parallel AH 7 8 ? anti-parallel AI 1 2 ? parallel AI 2 3 ? anti-parallel AI 3 4 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AK 2 3 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AL 2 3 ? anti-parallel AL 3 4 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AM 3 4 ? anti-parallel AN 1 2 ? parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? anti-parallel AO 1 2 ? parallel AO 2 3 ? anti-parallel AO 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 PHE A 92 ? 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CG C ASP 355 ? ? OD2 C ASP 355 ? ? 112.79 118.30 -5.51 0.90 N 86 1 NE C ARG 365 ? ? CZ C ARG 365 ? ? NH1 C ARG 365 ? ? 126.40 120.30 6.10 0.50 N 87 1 NE C ARG 365 ? ? CZ C ARG 365 ? ? NH2 C ARG 365 ? ? 114.29 120.30 -6.01 0.50 N 88 1 C C ASP 377 ? ? N C GLN 378 ? ? CA C GLN 378 ? ? 137.42 121.70 15.72 2.50 Y 89 1 CB C PHE 380 ? ? CG C PHE 380 ? ? CD2 C PHE 380 ? ? 126.94 120.80 6.14 0.70 N 90 1 CB C PHE 380 ? ? CG C PHE 380 ? ? CD1 C PHE 380 ? ? 112.22 120.80 -8.58 0.70 N 91 1 CB C TYR 383 ? ? CG C TYR 383 ? ? CD1 C TYR 383 ? ? 113.49 121.00 -7.51 0.60 N 92 1 CB C TYR 392 ? ? CG C TYR 392 ? ? CD2 C TYR 392 ? ? 126.59 121.00 5.59 0.60 N 93 1 CB C TYR 392 ? ? CG C TYR 392 ? ? CD1 C TYR 392 ? ? 116.10 121.00 -4.90 0.60 N 94 1 N C ALA 414 ? ? CA C ALA 414 ? ? CB C ALA 414 ? ? 121.40 110.10 11.30 1.40 N 95 1 CB C PHE 423 ? ? CG C PHE 423 ? ? CD2 C PHE 423 ? ? 125.01 120.80 4.21 0.70 N 96 1 CB C PHE 423 ? ? CG C PHE 423 ? ? CD1 C PHE 423 ? ? 115.31 120.80 -5.49 0.70 N 97 1 CB C ASP 425 ? ? CG C ASP 425 ? ? OD2 C ASP 425 ? ? 111.66 118.30 -6.64 0.90 N 98 1 C C ASP 425 ? ? N C PRO 426 ? ? CA C PRO 426 ? ? 132.25 119.30 12.95 1.50 Y 99 1 CA C THR 429 ? ? CB C THR 429 ? ? CG2 C THR 429 ? ? 102.81 112.40 -9.59 1.40 N 100 1 CA C THR 431 ? ? CB C THR 431 ? ? CG2 C THR 431 ? ? 102.82 112.40 -9.58 1.40 N 101 1 CB C PHE 470 ? ? CG C PHE 470 ? ? CD2 C PHE 470 ? ? 126.12 120.80 5.32 0.70 N 102 1 CB C TYR 471 ? ? CG C TYR 471 ? ? CD2 C TYR 471 ? ? 125.90 121.00 4.90 0.60 N 103 1 CB C TYR 471 ? ? CG C TYR 471 ? ? CD1 C TYR 471 ? ? 115.64 121.00 -5.36 0.60 N 104 1 CB C TYR 475 ? ? CG C TYR 475 ? ? CD2 C TYR 475 ? ? 125.50 121.00 4.50 0.60 N 105 1 CB C LEU 515 ? ? CG C LEU 515 ? ? CD2 C LEU 515 ? ? 122.36 111.00 11.36 1.70 N 106 1 CB C LEU 520 ? ? CG C LEU 520 ? ? CD2 C LEU 520 ? ? 122.70 111.00 11.70 1.70 N 107 1 CB C ASP 535 ? ? CG C ASP 535 ? ? OD1 C ASP 535 ? ? 111.82 118.30 -6.48 0.90 N 108 1 CB C ASP 535 ? ? CG C ASP 535 ? ? 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CG A PHE 423 ? ? CD2 A PHE 423 ? ? 116.05 120.80 -4.75 0.70 N 295 1 CB A TRP 439 ? ? CG A TRP 439 ? ? CD2 A TRP 439 ? ? 118.58 126.60 -8.02 1.30 N 296 1 CB A ASP 442 ? ? CG A ASP 442 ? ? OD1 A ASP 442 ? ? 112.60 118.30 -5.70 0.90 N 297 1 NE A ARG 448 ? ? CZ A ARG 448 ? ? NH2 A ARG 448 ? ? 116.71 120.30 -3.59 0.50 N 298 1 CA A THR 456 ? ? CB A THR 456 ? ? CG2 A THR 456 ? ? 103.78 112.40 -8.62 1.40 N 299 1 CB A TYR 460 ? ? CG A TYR 460 ? ? CD2 A TYR 460 ? ? 115.38 121.00 -5.62 0.60 N 300 1 CB A TYR 460 ? ? CG A TYR 460 ? ? CD1 A TYR 460 ? ? 125.19 121.00 4.19 0.60 N 301 1 CB A TYR 463 ? ? CG A TYR 463 ? ? CD2 A TYR 463 ? ? 116.10 121.00 -4.90 0.60 N 302 1 CB A TYR 463 ? ? CG A TYR 463 ? ? CD1 A TYR 463 ? ? 126.63 121.00 5.63 0.60 N 303 1 CB A ASN 468 ? ? CA A ASN 468 ? ? C A ASN 468 ? ? 123.25 110.40 12.85 2.00 N 304 1 CB A TYR 471 ? ? CG A TYR 471 ? ? CD1 A TYR 471 ? ? 116.93 121.00 -4.07 0.60 N 305 1 CB A ASP 472 ? ? CG A ASP 472 ? ? 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CG A ASP 545 ? ? OD2 A ASP 545 ? ? 110.40 118.30 -7.90 0.90 N 318 1 CB A PHE 550 ? ? CG A PHE 550 ? ? CD1 A PHE 550 ? ? 114.23 120.80 -6.57 0.70 N 319 1 CB A ASP 555 ? ? CG A ASP 555 ? ? OD1 A ASP 555 ? ? 127.89 118.30 9.59 0.90 N 320 1 CB A ASP 555 ? ? CG A ASP 555 ? ? OD2 A ASP 555 ? ? 109.99 118.30 -8.31 0.90 N 321 1 CB A ALA 565 ? ? CA A ALA 565 ? ? C A ALA 565 ? ? 100.53 110.10 -9.57 1.50 N 322 1 CG A TRP 567 ? ? CD2 A TRP 567 ? ? CE3 A TRP 567 ? ? 128.49 133.90 -5.41 0.90 N 323 1 CB A ASP 576 ? ? CG A ASP 576 ? ? OD2 A ASP 576 ? ? 111.10 118.30 -7.20 0.90 N 324 1 NE A ARG 591 ? ? CZ A ARG 591 ? ? NH1 A ARG 591 ? ? 123.60 120.30 3.30 0.50 N 325 1 CB A PHE 600 ? ? CG A PHE 600 ? ? CD2 A PHE 600 ? ? 115.18 120.80 -5.62 0.70 N 326 1 NE A ARG 610 ? ? CZ A ARG 610 ? ? NH1 A ARG 610 ? ? 115.89 120.30 -4.41 0.50 N 327 1 NE A ARG 610 ? ? CZ A ARG 610 ? ? NH2 A ARG 610 ? ? 124.48 120.30 4.18 0.50 N 328 1 NE B ARG 48 ? ? CZ B ARG 48 ? ? 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CG B ASP 286 ? ? OD2 B ASP 286 ? ? 123.73 118.30 5.43 0.90 N 353 1 NE B ARG 295 ? ? CZ B ARG 295 ? ? NH1 B ARG 295 ? ? 123.38 120.30 3.08 0.50 N 354 1 NE B ARG 302 ? ? CZ B ARG 302 ? ? NH1 B ARG 302 ? ? 124.32 120.30 4.02 0.50 N 355 1 CB B TYR 309 ? ? CG B TYR 309 ? ? CD2 B TYR 309 ? ? 114.79 121.00 -6.21 0.60 N 356 1 CB B TYR 316 ? ? CG B TYR 316 ? ? CD2 B TYR 316 ? ? 116.68 121.00 -4.32 0.60 N 357 1 CB B TYR 316 ? ? CG B TYR 316 ? ? CD1 B TYR 316 ? ? 124.76 121.00 3.76 0.60 N 358 1 CB B ALA 319 ? ? CA B ALA 319 ? ? C B ALA 319 ? ? 99.87 110.10 -10.23 1.50 N 359 1 NE B ARG 321 ? ? CZ B ARG 321 ? ? NH1 B ARG 321 ? ? 124.03 120.30 3.73 0.50 N 360 1 NE B ARG 321 ? ? CZ B ARG 321 ? ? NH2 B ARG 321 ? ? 116.83 120.30 -3.47 0.50 N 361 1 CB B TYR 352 ? ? CG B TYR 352 ? ? CD2 B TYR 352 ? ? 115.88 121.00 -5.12 0.60 N 362 1 CB B TYR 352 ? ? CG B TYR 352 ? ? CD1 B TYR 352 ? ? 126.12 121.00 5.12 0.60 N 363 1 CB B TYR 370 ? ? CG B TYR 370 ? ? 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CG Q TYR 82 ? ? CD2 Q TYR 82 ? ? 110.00 121.00 -11.00 0.60 N 388 1 CB Q TYR 82 ? ? CG Q TYR 82 ? ? CD1 Q TYR 82 ? ? 133.44 121.00 12.44 0.60 N 389 1 NE Q ARG 92 ? ? CZ Q ARG 92 ? ? NH2 Q ARG 92 ? ? 116.33 120.30 -3.97 0.50 N 390 1 CB Q PHE 94 ? ? CG Q PHE 94 ? ? CD1 Q PHE 94 ? ? 115.45 120.80 -5.35 0.70 N 391 1 CB Q TYR 97 ? ? CG Q TYR 97 ? ? CD2 Q TYR 97 ? ? 112.85 121.00 -8.15 0.60 N 392 1 CB Q TYR 97 ? ? CG Q TYR 97 ? ? CD1 Q TYR 97 ? ? 128.06 121.00 7.06 0.60 N 393 1 CB Q TYR 100 ? ? CG Q TYR 100 ? ? CD2 Q TYR 100 ? ? 116.07 121.00 -4.93 0.60 N 394 1 CG Q TYR 100 ? ? CD1 Q TYR 100 ? ? CE1 Q TYR 100 ? ? 115.65 121.30 -5.65 0.80 N 395 1 CA Q THR 114 ? ? CB Q THR 114 ? ? CG2 Q THR 114 ? ? 102.65 112.40 -9.75 1.40 N 396 1 NE Q ARG 126 ? ? CZ Q ARG 126 ? ? NH1 Q ARG 126 ? ? 123.61 120.30 3.31 0.50 N 397 1 CB Q PHE 133 ? ? CG Q PHE 133 ? ? CD2 Q PHE 133 ? ? 116.48 120.80 -4.32 0.70 N 398 1 CB Q TYR 149 ? ? CG Q TYR 149 ? ? CD2 Q TYR 149 ? ? 124.88 121.00 3.88 0.60 N 399 1 CB Q TYR 149 ? ? CG Q TYR 149 ? ? CD1 Q TYR 149 ? ? 115.09 121.00 -5.91 0.60 N 400 1 N Q PRO 157 ? ? CA Q PRO 157 ? ? CB Q PRO 157 ? ? 109.94 102.60 7.34 1.10 N 401 1 CB Q PHE 162 ? ? CG Q PHE 162 ? ? CD1 Q PHE 162 ? ? 116.22 120.80 -4.58 0.70 N 402 1 CB Q TYR 188 ? ? CG Q TYR 188 ? ? CD2 Q TYR 188 ? ? 116.82 121.00 -4.18 0.60 N 403 1 CB Q TYR 188 ? ? CG Q TYR 188 ? ? CD1 Q TYR 188 ? ? 127.15 121.00 6.15 0.60 N 404 1 CB Q ASP 217 ? ? CG Q ASP 217 ? ? OD2 Q ASP 217 ? ? 112.38 118.30 -5.92 0.90 N 405 1 NE Q ARG 218 ? ? CZ Q ARG 218 ? ? NH1 Q ARG 218 ? ? 123.82 120.30 3.52 0.50 N 406 1 NE Q ARG 218 ? ? CZ Q ARG 218 ? ? NH2 Q ARG 218 ? ? 116.42 120.30 -3.88 0.50 N 407 1 CB Q TYR 249 ? ? CG Q TYR 249 ? ? CD1 Q TYR 249 ? ? 116.27 121.00 -4.73 0.60 N 408 1 CB Q PHE 254 ? ? CG Q PHE 254 ? ? CD2 Q PHE 254 ? ? 114.27 120.80 -6.53 0.70 N 409 1 CB Q PHE 254 ? ? CG Q PHE 254 ? ? CD1 Q PHE 254 ? ? 125.05 120.80 4.25 0.70 N 410 1 CB Q PHE 262 ? ? CG Q PHE 262 ? ? CD2 Q PHE 262 ? ? 114.38 120.80 -6.42 0.70 N 411 1 CB Q PHE 262 ? ? CG Q PHE 262 ? ? CD1 Q PHE 262 ? ? 128.24 120.80 7.44 0.70 N 412 1 N Q TYR 273 ? ? CA Q TYR 273 ? ? CB Q TYR 273 ? ? 123.58 110.60 12.98 1.80 N 413 1 NE Q ARG 297 ? ? CZ Q ARG 297 ? ? NH1 Q ARG 297 ? ? 125.82 120.30 5.52 0.50 N 414 1 NE Q ARG 297 ? ? CZ Q ARG 297 ? ? NH2 Q ARG 297 ? ? 115.14 120.30 -5.16 0.50 N 415 1 CB Q PHE 300 ? ? CG Q PHE 300 ? ? CD2 Q PHE 300 ? ? 113.92 120.80 -6.88 0.70 N 416 1 CB Q PHE 300 ? ? CG Q PHE 300 ? ? CD1 Q PHE 300 ? ? 130.16 120.80 9.36 0.70 N 417 1 CB Q PHE 304 ? ? CG Q PHE 304 ? ? CD2 Q PHE 304 ? ? 125.12 120.80 4.32 0.70 N 418 1 C Q GLN 332 ? ? N Q ASN 333 ? ? CA Q ASN 333 ? ? 136.73 121.70 15.03 2.50 Y 419 1 NE Q ARG 335 ? ? CZ Q ARG 335 ? ? NH2 Q ARG 335 ? ? 123.46 120.30 3.16 0.50 N 420 1 CG Q TYR 341 ? ? CD2 Q TYR 341 ? ? CE2 Q TYR 341 ? ? 127.13 121.30 5.83 0.80 N 421 1 CZ Q TYR 341 ? ? CE2 Q TYR 341 ? ? CD2 Q TYR 341 ? ? 114.39 119.80 -5.41 0.90 N 422 1 N Q TYR 345 ? ? CA Q TYR 345 ? ? CB Q TYR 345 ? ? 121.95 110.60 11.35 1.80 N 423 1 CB Q TYR 345 ? ? CG Q TYR 345 ? ? CD2 Q TYR 345 ? ? 117.38 121.00 -3.62 0.60 N 424 1 CB Q TYR 345 ? ? CG Q TYR 345 ? ? CD1 Q TYR 345 ? ? 127.33 121.00 6.33 0.60 N 425 1 NE L ARG 28 ? ? CZ L ARG 28 ? ? NH2 L ARG 28 ? ? 114.65 120.30 -5.65 0.50 N 426 1 O L ALA 87 ? ? C L ALA 87 ? ? N L GLU 88 ? ? 112.97 122.70 -9.73 1.60 Y 427 1 NE K ARG 25 ? ? CZ K ARG 25 ? ? NH2 K ARG 25 ? ? 124.62 120.30 4.32 0.50 N 428 1 CB K LYS 83 ? ? CA K LYS 83 ? ? C K LYS 83 ? ? 98.22 110.40 -12.18 2.00 N 429 1 NE K ARG 85 ? ? CZ K ARG 85 ? ? NH1 K ARG 85 ? ? 124.29 120.30 3.99 0.50 N 430 1 NE K ARG 85 ? ? CZ K ARG 85 ? ? NH2 K ARG 85 ? ? 117.17 120.30 -3.13 0.50 N 431 1 NE K ARG 92 ? ? CZ K ARG 92 ? ? NH1 K ARG 92 ? ? 123.91 120.30 3.61 0.50 N 432 1 NE K ARG 92 ? ? CZ K ARG 92 ? ? NH2 K ARG 92 ? ? 113.39 120.30 -6.91 0.50 N 433 1 CB K PHE 100 ? ? CG K PHE 100 ? ? CD1 K PHE 100 ? ? 125.87 120.80 5.07 0.70 N 434 1 NE K ARG 114 ? ? CZ K ARG 114 ? ? NH1 K ARG 114 ? ? 116.87 120.30 -3.43 0.50 N 435 1 NE K ARG 144 ? ? CZ K ARG 144 ? ? NH1 K ARG 144 ? ? 125.26 120.30 4.96 0.50 N 436 1 CB K ASP 154 ? ? CG K ASP 154 ? ? OD2 K ASP 154 ? ? 123.93 118.30 5.63 0.90 N 437 1 CB K TYR 160 ? ? CG K TYR 160 ? ? CD1 K TYR 160 ? ? 116.84 121.00 -4.16 0.60 N 438 1 NE K ARG 166 ? ? CZ K ARG 166 ? ? NH1 K ARG 166 ? ? 123.85 120.30 3.55 0.50 N 439 1 CB K LEU 169 ? ? CG K LEU 169 ? ? CD1 K LEU 169 ? ? 121.42 111.00 10.42 1.70 N 440 1 CB K TYR 178 ? ? CG K TYR 178 ? ? CD2 K TYR 178 ? ? 124.88 121.00 3.88 0.60 N 441 1 CB K TYR 178 ? ? CG K TYR 178 ? ? CD1 K TYR 178 ? ? 116.71 121.00 -4.29 0.60 N 442 1 CB K TYR 223 ? ? CG K TYR 223 ? ? CD1 K TYR 223 ? ? 116.51 121.00 -4.49 0.60 N 443 1 NE P ARG 21 ? ? CZ P ARG 21 ? ? NH2 P ARG 21 ? ? 124.02 120.30 3.72 0.50 N 444 1 N P SER 22 ? ? CA P SER 22 ? ? CB P SER 22 ? ? 119.73 110.50 9.23 1.50 N 445 1 N P SER 33 ? ? 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CD1 b TYR 110 ? ? 124.79 121.00 3.79 0.60 N 492 1 CB b TYR 116 ? ? CG b TYR 116 ? ? CD1 b TYR 116 ? ? 125.18 121.00 4.18 0.60 N 493 1 CA b VAL 133 ? ? CB b VAL 133 ? ? CG1 b VAL 133 ? ? 121.19 110.90 10.29 1.50 N 494 1 CB b TYR 141 ? ? CG b TYR 141 ? ? CD2 b TYR 141 ? ? 125.29 121.00 4.29 0.60 N 495 1 CB b TYR 141 ? ? CG b TYR 141 ? ? CD1 b TYR 141 ? ? 115.66 121.00 -5.34 0.60 N 496 1 NE b ARG 142 ? ? CZ b ARG 142 ? ? NH2 b ARG 142 ? ? 113.87 120.30 -6.43 0.50 N 497 1 CB b ASP 149 ? ? CG b ASP 149 ? ? OD1 b ASP 149 ? ? 123.82 118.30 5.52 0.90 N 498 1 CB b PHE 151 ? ? CG b PHE 151 ? ? CD2 b PHE 151 ? ? 114.30 120.80 -6.50 0.70 N 499 1 CB b PHE 151 ? ? CG b PHE 151 ? ? CD1 b PHE 151 ? ? 127.82 120.80 7.02 0.70 N 500 1 CA b ILE 176 ? ? CB b ILE 176 ? ? CG1 b ILE 176 ? ? 123.25 111.00 12.25 1.90 N 501 1 CB b TYR 186 ? ? CG b TYR 186 ? ? CD2 b TYR 186 ? ? 114.43 121.00 -6.57 0.60 N 502 1 CB b TYR 186 ? ? CG b TYR 186 ? ? CD1 b TYR 186 ? ? 129.96 121.00 8.96 0.60 N 503 1 CB b ASP 194 ? ? CG b ASP 194 ? ? OD2 b ASP 194 ? ? 123.73 118.30 5.43 0.90 N 504 1 NE b ARG 208 ? ? CZ b ARG 208 ? ? NH1 b ARG 208 ? ? 123.74 120.30 3.44 0.50 N 505 1 NE b ARG 248 ? ? CZ b ARG 248 ? ? NH2 b ARG 248 ? ? 116.73 120.30 -3.57 0.50 N 506 1 CB b ASP 262 ? ? CG b ASP 262 ? ? OD2 b ASP 262 ? ? 111.17 118.30 -7.13 0.90 N 507 1 NE b ARG 270 ? ? CZ b ARG 270 ? ? NH1 b ARG 270 ? ? 123.91 120.30 3.61 0.50 N 508 1 CB b TYR 285 ? ? CG b TYR 285 ? ? CD2 b TYR 285 ? ? 125.28 121.00 4.28 0.60 N 509 1 N b SER 292 ? ? CA b SER 292 ? ? CB b SER 292 ? ? 121.78 110.50 11.28 1.50 N 510 1 CB b TYR 300 ? ? CG b TYR 300 ? ? CD1 b TYR 300 ? ? 125.01 121.00 4.01 0.60 N 511 1 CB b PHE 320 ? ? CG b PHE 320 ? ? CD2 b PHE 320 ? ? 115.52 120.80 -5.28 0.70 N 512 1 CB b PHE 320 ? ? CG b PHE 320 ? ? CD1 b PHE 320 ? ? 129.53 120.80 8.73 0.70 N 513 1 CB b ASN 324 ? ? CG b ASN 324 ? ? OD1 b ASN 324 ? ? 109.31 121.60 -12.29 2.00 N 514 1 NE b ARG 343 ? ? CZ b ARG 343 ? ? 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C O ALA 160 ? ? 98.82 110.10 -11.28 1.50 N 527 1 NE O ARG 173 ? ? CZ O ARG 173 ? ? NH1 O ARG 173 ? ? 126.02 120.30 5.72 0.50 N 528 1 NE O ARG 173 ? ? CZ O ARG 173 ? ? NH2 O ARG 173 ? ? 114.49 120.30 -5.81 0.50 N 529 1 CA O VAL 196 ? ? CB O VAL 196 ? ? CG2 O VAL 196 ? ? 100.77 110.90 -10.13 1.50 N 530 1 C O VAL 198 ? ? N O PRO 199 ? ? CA O PRO 199 ? ? 130.04 119.30 10.74 1.50 Y 531 1 CB O LEU 202 ? ? CG O LEU 202 ? ? CD2 O LEU 202 ? ? 121.54 111.00 10.54 1.70 N 532 1 CB O PHE 206 ? ? CG O PHE 206 ? ? CD2 O PHE 206 ? ? 115.68 120.80 -5.12 0.70 N 533 1 CB O TYR 210 ? ? CG O TYR 210 ? ? CD2 O TYR 210 ? ? 115.62 121.00 -5.38 0.60 N 534 1 CB O TYR 231 ? ? CG O TYR 231 ? ? CD2 O TYR 231 ? ? 116.99 121.00 -4.01 0.60 N 535 1 CB O TYR 231 ? ? CG O TYR 231 ? ? CD1 O TYR 231 ? ? 125.37 121.00 4.37 0.60 N 536 1 CZ O TYR 231 ? ? CE2 O TYR 231 ? ? CD2 O TYR 231 ? ? 125.71 119.80 5.91 0.90 N 537 1 CB O PHE 246 ? ? CG O PHE 246 ? ? CD1 O PHE 246 ? ? 125.22 120.80 4.42 0.70 N 538 1 NE O ARG 258 ? ? CZ O ARG 258 ? ? NH1 O ARG 258 ? ? 117.22 120.30 -3.08 0.50 N 539 1 CB O ASP 268 ? ? CG O ASP 268 ? ? OD2 O ASP 268 ? ? 124.43 118.30 6.13 0.90 N 540 1 NE O ARG 285 ? ? CZ O ARG 285 ? ? NH1 O ARG 285 ? ? 125.06 120.30 4.76 0.50 N 541 1 CB O TYR 296 ? ? CG O TYR 296 ? ? CD2 O TYR 296 ? ? 113.27 121.00 -7.73 0.60 N 542 1 CB O TYR 296 ? ? CG O TYR 296 ? ? CD1 O TYR 296 ? ? 127.87 121.00 6.87 0.60 N 543 1 CA O VAL 299 ? ? CB O VAL 299 ? ? CG2 O VAL 299 ? ? 101.23 110.90 -9.67 1.50 N 544 1 CB O PHE 300 ? ? CG O PHE 300 ? ? CD1 O PHE 300 ? ? 115.20 120.80 -5.60 0.70 N 545 1 CG O TRP 303 ? ? CD2 O TRP 303 ? ? CE3 O TRP 303 ? ? 127.96 133.90 -5.94 0.90 N 546 1 NE O ARG 318 ? ? CZ O ARG 318 ? ? NH2 O ARG 318 ? ? 115.94 120.30 -4.36 0.50 N 547 1 C O PRO 322 ? ? N O PRO 323 ? ? CA O PRO 323 ? ? 129.59 119.30 10.29 1.50 Y 548 1 CA O CYS 340 ? ? CB O CYS 340 ? ? SG O CYS 340 ? ? 121.92 114.20 7.72 1.10 N 549 1 CB O ASP 346 ? ? CG O ASP 346 ? ? 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NH2 I ARG 25 ? ? 116.09 120.30 -4.21 0.50 N 586 1 CB I TYR 43 ? ? CG I TYR 43 ? ? CD2 I TYR 43 ? ? 114.82 121.00 -6.18 0.60 N 587 1 CG I TYR 43 ? ? CD2 I TYR 43 ? ? CE2 I TYR 43 ? ? 115.98 121.30 -5.32 0.80 N 588 1 CB I PHE 62 ? ? CG I PHE 62 ? ? CD1 I PHE 62 ? ? 125.33 120.80 4.53 0.70 N 589 1 NE I ARG 85 ? ? CZ I ARG 85 ? ? NH1 I ARG 85 ? ? 124.09 120.30 3.79 0.50 N 590 1 NE I ARG 85 ? ? CZ I ARG 85 ? ? NH2 I ARG 85 ? ? 112.60 120.30 -7.70 0.50 N 591 1 CG1 I VAL 88 ? ? CB I VAL 88 ? ? CG2 I VAL 88 ? ? 100.28 110.90 -10.62 1.60 N 592 1 NE I ARG 92 ? ? CZ I ARG 92 ? ? NH1 I ARG 92 ? ? 124.13 120.30 3.83 0.50 N 593 1 CB I ASP 97 ? ? CG I ASP 97 ? ? OD2 I ASP 97 ? ? 112.61 118.30 -5.69 0.90 N 594 1 CB I PHE 100 ? ? CG I PHE 100 ? ? CD1 I PHE 100 ? ? 127.21 120.80 6.41 0.70 N 595 1 NE I ARG 114 ? ? CZ I ARG 114 ? ? NH2 I ARG 114 ? ? 117.11 120.30 -3.19 0.50 N 596 1 CB I TYR 117 ? ? CG I TYR 117 ? ? CD1 I TYR 117 ? ? 117.27 121.00 -3.73 0.60 N 597 1 CB I LEU 129 ? ? CG I LEU 129 ? ? CD2 I LEU 129 ? ? 121.28 111.00 10.28 1.70 N 598 1 NE I ARG 158 ? ? CZ I ARG 158 ? ? NH2 I ARG 158 ? ? 117.25 120.30 -3.05 0.50 N 599 1 C I GLN 165 ? ? N I ARG 166 ? ? CA I ARG 166 ? ? 137.50 121.70 15.80 2.50 Y 600 1 CB I ASP 195 ? ? CG I ASP 195 ? ? OD1 I ASP 195 ? ? 124.21 118.30 5.91 0.90 N 601 1 NE I ARG 206 ? ? CZ I ARG 206 ? ? NH1 I ARG 206 ? ? 124.46 120.30 4.16 0.50 N 602 1 N I SER 211 ? ? CA I SER 211 ? ? CB I SER 211 ? ? 120.26 110.50 9.76 1.50 N 603 1 NE I ARG 219 ? ? CZ I ARG 219 ? ? NH2 I ARG 219 ? ? 115.96 120.30 -4.34 0.50 N 604 1 CB I TYR 223 ? ? CG I TYR 223 ? ? CD2 I TYR 223 ? ? 115.41 121.00 -5.59 0.60 N 605 1 CB I TYR 223 ? ? CG I TYR 223 ? ? CD1 I TYR 223 ? ? 126.35 121.00 5.35 0.60 N 606 1 CB U PHE 11 ? ? CG U PHE 11 ? ? CD1 U PHE 11 ? ? 116.14 120.80 -4.66 0.70 N 607 1 CB U PHE 12 ? ? CG U PHE 12 ? ? CD2 U PHE 12 ? ? 114.82 120.80 -5.98 0.70 N 608 1 CB U PHE 12 ? ? CG U PHE 12 ? ? CD1 U PHE 12 ? ? 125.46 120.80 4.66 0.70 N 609 1 N U ALA 18 ? ? CA U ALA 18 ? ? CB U ALA 18 ? ? 120.33 110.10 10.23 1.40 N 610 1 CB U LEU 26 ? ? CG U LEU 26 ? ? CD2 U LEU 26 ? ? 121.45 111.00 10.45 1.70 N 611 1 N U ALA 29 ? ? CA U ALA 29 ? ? CB U ALA 29 ? ? 118.78 110.10 8.68 1.40 N 612 1 CA U THR 32 ? ? CB U THR 32 ? ? CG2 U THR 32 ? ? 102.92 112.40 -9.48 1.40 N 613 1 N U SER 35 ? ? CA U SER 35 ? ? CB U SER 35 ? ? 121.62 110.50 11.12 1.50 N 614 1 CA U CYS 40 ? ? CB U CYS 40 ? ? SG U CYS 40 ? ? 121.28 114.20 7.08 1.10 N 615 1 NE U ARG 117 ? ? CZ U ARG 117 ? ? NH2 U ARG 117 ? ? 114.87 120.30 -5.43 0.50 N 616 1 CB U PHE 126 ? ? CG U PHE 126 ? ? CD2 U PHE 126 ? ? 126.54 120.80 5.74 0.70 N 617 1 CB U PHE 126 ? ? CG U PHE 126 ? ? CD1 U PHE 126 ? ? 116.12 120.80 -4.68 0.70 N 618 1 CB U ALA 136 ? ? CA U ALA 136 ? ? C U ALA 136 ? ? 98.10 110.10 -12.00 1.50 N 619 1 NH1 U ARG 153 ? ? CZ U ARG 153 ? ? NH2 U ARG 153 ? ? 111.46 119.40 -7.94 1.10 N 620 1 NE U ARG 153 ? ? CZ U ARG 153 ? ? NH1 U ARG 153 ? ? 124.29 120.30 3.99 0.50 N 621 1 NE U ARG 153 ? ? CZ U ARG 153 ? ? NH2 U ARG 153 ? ? 124.25 120.30 3.95 0.50 N 622 1 CB U ASP 157 ? ? CG U ASP 157 ? ? OD2 U ASP 157 ? ? 109.86 118.30 -8.44 0.90 N 623 1 CB X PHE 11 ? ? CG X PHE 11 ? ? CD2 X PHE 11 ? ? 116.20 120.80 -4.60 0.70 N 624 1 CB X PHE 23 ? ? CG X PHE 23 ? ? CD2 X PHE 23 ? ? 114.42 120.80 -6.38 0.70 N 625 1 CB X PHE 23 ? ? CG X PHE 23 ? ? CD1 X PHE 23 ? ? 125.17 120.80 4.37 0.70 N 626 1 CA X THR 32 ? ? CB X THR 32 ? ? CG2 X THR 32 ? ? 103.26 112.40 -9.14 1.40 N 627 1 CB X PHE 51 ? ? CG X PHE 51 ? ? CD2 X PHE 51 ? ? 111.61 120.80 -9.19 0.70 N 628 1 CB X PHE 51 ? ? CG X PHE 51 ? ? CD1 X PHE 51 ? ? 125.83 120.80 5.03 0.70 N 629 1 CB X ALA 64 ? ? CA X ALA 64 ? ? C X ALA 64 ? ? 99.58 110.10 -10.52 1.50 N 630 1 CB X TYR 76 ? ? CG X TYR 76 ? ? CD2 X TYR 76 ? ? 116.22 121.00 -4.78 0.60 N 631 1 CB X TYR 76 ? ? CG X TYR 76 ? ? CD1 X TYR 76 ? ? 125.24 121.00 4.24 0.60 N 632 1 CB X ASP 113 ? ? CG X ASP 113 ? ? OD1 X ASP 113 ? ? 110.97 118.30 -7.33 0.90 N 633 1 CB X ASP 113 ? ? CG X ASP 113 ? ? OD2 X ASP 113 ? ? 123.80 118.30 5.50 0.90 N 634 1 CB X PHE 135 ? ? CG X PHE 135 ? ? CD2 X PHE 135 ? ? 114.06 120.80 -6.74 0.70 N 635 1 CG X PHE 135 ? ? CD2 X PHE 135 ? ? CE2 X PHE 135 ? ? 114.11 120.80 -6.69 1.10 N 636 1 CA X TYR 142 ? ? CB X TYR 142 ? ? CG X TYR 142 ? ? 125.61 113.40 12.21 1.90 N 637 1 CB X TYR 142 ? ? CG X TYR 142 ? ? CD2 X TYR 142 ? ? 116.83 121.00 -4.17 0.60 N 638 1 CB X TYR 142 ? ? CG X TYR 142 ? ? CD1 X TYR 142 ? ? 125.95 121.00 4.95 0.60 N 639 1 NE X ARG 153 ? ? CZ X ARG 153 ? ? NH1 X ARG 153 ? ? 124.38 120.30 4.08 0.50 N 640 1 NE X ARG 153 ? ? CZ X ARG 153 ? ? NH2 X ARG 153 ? ? 116.65 120.30 -3.65 0.50 N 641 1 CB a PHE 12 ? ? CG a PHE 12 ? ? CD2 a PHE 12 ? ? 127.64 120.80 6.84 0.70 N 642 1 CB a PHE 12 ? ? CG a PHE 12 ? ? CD1 a PHE 12 ? ? 115.78 120.80 -5.02 0.70 N 643 1 N a SER 19 ? ? CA a SER 19 ? ? CB a SER 19 ? ? 120.39 110.50 9.89 1.50 N 644 1 CB a TYR 30 ? ? CG a TYR 30 ? ? CD2 a TYR 30 ? ? 115.11 121.00 -5.89 0.60 N 645 1 CB a TYR 30 ? ? CG a TYR 30 ? ? CD1 a TYR 30 ? ? 125.42 121.00 4.42 0.60 N 646 1 N a ALA 33 ? ? CA a ALA 33 ? ? CB a ALA 33 ? ? 120.29 110.10 10.19 1.40 N 647 1 N a SER 35 ? ? CA a SER 35 ? ? CB a SER 35 ? ? 121.81 110.50 11.31 1.50 N 648 1 CB a TYR 76 ? ? CG a TYR 76 ? ? CD2 a TYR 76 ? ? 115.95 121.00 -5.05 0.60 N 649 1 N a SER 100 ? ? CA a SER 100 ? ? CB a SER 100 ? ? 120.21 110.50 9.71 1.50 N 650 1 NE a ARG 117 ? ? CZ a ARG 117 ? ? NH1 a ARG 117 ? ? 115.37 120.30 -4.93 0.50 N 651 1 CA a THR 155 ? ? CB a THR 155 ? ? CG2 a THR 155 ? ? 99.73 112.40 -12.67 1.40 N 652 1 CA a CYS 160 ? ? CB a CYS 160 ? ? SG a CYS 160 ? ? 102.45 114.00 -11.55 1.80 N 653 1 CB R PHE 12 ? ? CG R PHE 12 ? ? CD1 R PHE 12 ? ? 125.44 120.80 4.64 0.70 N 654 1 NE R ARG 46 ? ? CZ R ARG 46 ? ? NH2 R ARG 46 ? ? 116.44 120.30 -3.86 0.50 N 655 1 O R ILE 54 ? ? C R ILE 54 ? ? N R VAL 55 ? ? 112.07 122.70 -10.63 1.60 Y 656 1 CB R ALA 60 ? ? CA R ALA 60 ? ? C R ALA 60 ? ? 99.70 110.10 -10.40 1.50 N 657 1 CB R TYR 76 ? ? CG R TYR 76 ? ? CD2 R TYR 76 ? ? 124.71 121.00 3.71 0.60 N 658 1 NE R ARG 117 ? ? CZ R ARG 117 ? ? NH1 R ARG 117 ? ? 125.71 120.30 5.41 0.50 N 659 1 NE R ARG 124 ? ? CZ R ARG 124 ? ? NH1 R ARG 124 ? ? 127.56 120.30 7.26 0.50 N 660 1 NE R ARG 124 ? ? CZ R ARG 124 ? ? NH2 R ARG 124 ? ? 116.94 120.30 -3.36 0.50 N 661 1 N R PHE 126 ? ? CA R PHE 126 ? ? CB R PHE 126 ? ? 121.75 110.60 11.15 1.80 N 662 1 CB R PHE 126 ? ? CG R PHE 126 ? ? CD1 R PHE 126 ? ? 126.00 120.80 5.20 0.70 N 663 1 CB R PHE 135 ? ? CG R PHE 135 ? ? CD2 R PHE 135 ? ? 114.84 120.80 -5.96 0.70 N 664 1 CB R PHE 135 ? ? CG R PHE 135 ? ? CD1 R PHE 135 ? ? 126.64 120.80 5.84 0.70 N 665 1 CB Z TYR 30 ? ? CG Z TYR 30 ? ? CD1 Z TYR 30 ? ? 116.62 121.00 -4.38 0.60 N 666 1 N Z SER 35 ? ? CA Z SER 35 ? ? CB Z SER 35 ? ? 119.92 110.50 9.42 1.50 N 667 1 CB Z LEU 45 ? ? CG Z LEU 45 ? ? CD2 Z LEU 45 ? ? 121.55 111.00 10.55 1.70 N 668 1 CB Z PHE 51 ? ? CG Z PHE 51 ? ? CD2 Z PHE 51 ? ? 126.18 120.80 5.38 0.70 N 669 1 CG Z MET 59 ? ? SD Z MET 59 ? ? CE Z MET 59 ? ? 85.68 100.20 -14.52 1.60 N 670 1 CB Z TYR 76 ? ? CG Z TYR 76 ? ? CD2 Z TYR 76 ? ? 116.32 121.00 -4.68 0.60 N 671 1 CB Z LEU 84 ? ? CG Z LEU 84 ? ? CD2 Z LEU 84 ? ? 100.79 111.00 -10.21 1.70 N 672 1 CB Z TYR 85 ? ? CG Z TYR 85 ? ? CD2 Z TYR 85 ? ? 126.21 121.00 5.21 0.60 N 673 1 CB Z TYR 85 ? ? CG Z TYR 85 ? ? CD1 Z TYR 85 ? ? 112.41 121.00 -8.59 0.60 N 674 1 CB Z LEU 99 ? ? CG Z LEU 99 ? ? CD2 Z LEU 99 ? ? 121.24 111.00 10.24 1.70 N 675 1 CB Z PHE 106 ? ? CG Z PHE 106 ? ? CD2 Z PHE 106 ? ? 114.73 120.80 -6.07 0.70 N 676 1 CB Z PHE 106 ? ? CG Z PHE 106 ? ? CD1 Z PHE 106 ? ? 125.88 120.80 5.08 0.70 N 677 1 NE Z ARG 117 ? ? CZ Z ARG 117 ? ? NH1 Z ARG 117 ? ? 115.44 120.30 -4.86 0.50 N 678 1 NE Z ARG 124 ? ? CZ Z ARG 124 ? ? NH1 Z ARG 124 ? ? 126.23 120.30 5.93 0.50 N 679 1 N Z PHE 126 ? ? CA Z PHE 126 ? ? CB Z PHE 126 ? ? 122.17 110.60 11.57 1.80 N 680 1 CB Z PHE 126 ? ? CG Z PHE 126 ? ? CD2 Z PHE 126 ? ? 125.21 120.80 4.41 0.70 N 681 1 CB Z PHE 135 ? ? CG Z PHE 135 ? ? CD2 Z PHE 135 ? ? 114.31 120.80 -6.49 0.70 N 682 1 CB Z PHE 135 ? ? CG Z PHE 135 ? ? CD1 Z PHE 135 ? ? 125.37 120.80 4.57 0.70 N 683 1 CB Z TYR 142 ? ? CG Z TYR 142 ? ? CD2 Z TYR 142 ? ? 116.08 121.00 -4.92 0.60 N 684 1 CB S TYR 30 ? ? CG S TYR 30 ? ? CD2 S TYR 30 ? ? 115.07 121.00 -5.93 0.60 N 685 1 CB S ASP 48 ? ? CG S ASP 48 ? ? OD1 S ASP 48 ? ? 124.47 118.30 6.17 0.90 N 686 1 CB S LEU 50 ? ? CG S LEU 50 ? ? CD2 S LEU 50 ? ? 122.28 111.00 11.28 1.70 N 687 1 CB S PHE 88 ? ? CG S PHE 88 ? ? CD1 S PHE 88 ? ? 125.74 120.80 4.94 0.70 N 688 1 NE S ARG 117 ? ? CZ S ARG 117 ? ? NH2 S ARG 117 ? ? 114.27 120.30 -6.03 0.50 N 689 1 CB S TYR 142 ? ? CG S TYR 142 ? ? CD2 S TYR 142 ? ? 116.43 121.00 -4.57 0.60 N 690 1 CB S TYR 142 ? ? CG S TYR 142 ? ? CD1 S TYR 142 ? ? 125.76 121.00 4.76 0.60 N 691 1 CB Y PHE 23 ? ? CG Y PHE 23 ? ? CD2 Y PHE 23 ? ? 114.28 120.80 -6.52 0.70 N 692 1 CB Y PHE 51 ? ? CG Y PHE 51 ? ? CD1 Y PHE 51 ? ? 125.32 120.80 4.52 0.70 N 693 1 CB Y ALA 60 ? ? CA Y ALA 60 ? ? 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(Single particle--Applied symmetry: C1) ; _em_3d_reconstruction.num_particles 38347 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.details '50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'Vacuolar-type ATPase' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ;A3B3CDE3FG3HadcXc'Yc''Z where X, Y, and Z indicate unknown stoichiometry and X+Y+Z=10 ; _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 3J9U _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 3685 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 3J9U _em_imaging.id 1 _em_imaging.date 2013-10-19 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.temperature 77 _em_imaging.microscope_model 'FEI TECNAI F20' _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_defocus_max 7000 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.0 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 34483 _em_imaging.calibrated_magnification 34483 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.details 'K2 Summit in counting mode, 2 frames/s for 15 s' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'GATAN LIQUID NITROGEN' _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.astigmatism 'Manually corrected by inspecting FFT' _em_imaging.citation_id ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'Homemade holey carbon on 400 square mesh Cu/Rh grid, glow-discharged 2 mins' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 3J9U _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details 'Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).' _em_vitrification.cryogen_name OTHER _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp 77 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK III' _em_vitrification.method 'Blot for 23 seconds before freezing' _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3J9U _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3J9U _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 M MET 1 ? 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