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'European rabbit,Japanese white rabbit,domestic rabbit,rabbits' 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? 'European rabbit,Japanese white rabbit,domestic rabbit,rabbits' 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample ? ? 'European rabbit,Japanese white rabbit,domestic rabbit,rabbits' 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP CAC1S_RABIT P07293 1 ;MEPSSPQDEGLRKKQPKKPLPEVLPRPPRALFCLTLQNPLRKACISIVEWKPFETIILLTIFANCVALAVYLPMPEDDNN SLNLGLEKLEYFFLTVFSIEAAMKIIAYGFLFHQDAYLRSGWNVLDFIIVFLGVFTAILEQVNVIQSNTAPMSSKGAGLD VKALRAFRVLRPLRLVSGVPSLQVVLNSIFKAMLPLFHIALLVLFMVIIYAIIGLELFKGKMHKTCYYIGTDIVATVENE KPSPCARTGSGRPCTINGSECRGGWPGPNHGITHFDNFGFSMLTVYQCITMEGWTDVLYWVNDAIGNEWPWIYFVTLILL GSFFILNLVLGVLSGEFTKEREKAKSRGTFQKLREKQQLEEDLRGYMSWITQGEVMDVEDLREGKLSLEEGGSDTESLYE IEGLNKIIQFIRHWRQWNRVFRWKCHDLVKSRVFYWLVILIVALNTLSIASEHHNQPLWLTHLQDIANRVLLSLFTIEML LKMYGLGLRQYFMSIFNRFDCFVVCSGILELLLVESGAMTPLGISVLRCIRLLRLFKITKYWTSLSNLVASLLNSIRSIA SLLLLLFLFIIIFALLGMQLFGGRYDFEDTEVRRSNFDNFPQALISVFQVLTGEDWNSVMYNGIMAYGGPSYPGVLVCIY FIILFVCGNYILLNVFLAIAVDNLAEAESLTSAQKAKAEERKRRKMSRGLPDKTEEEKSVMAKKLEQKPKGEGIPTTAKL KVDEFESNVNEVKDPYPSADFPGDDEEDEPEIPVSPRPRPLAELQLKEKAVPIPEASSFFIFSPTNKVRVLCHRIVNATW FTNFILLFILLSSAALAAEDPIRAESVRNQILGYFDIAFTSVFTVEIVLKMTTYGAFLHKGSFCRNYFNILDLLVVAVSL ISMGLESSTISVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQCVFVAIRTIGNIVLVTTLLQFMFACIGVQLFKGKFFSCNDL SKMTEEECRGYYYVYKDGDPTQMELRPRQWIHNDFHFDNVLSAMMSLFTVSTFEGWPQLLYRAIDSNEEDMGPVYNNRVE MAIFFIIYIILIAFFMMNIFVGFVIVTFQEQGETEYKNCELDKNQRQCVQYALKARPLRCYIPKNPYQYQVWYVVTSSYF EYLMFALIMLNTICLGMQHYHQSEEMNHISDILNVAFTIIFTLEMILKLLAFKARGYFGDPWNVFDFLIVIGSIIDVILS EIDTFLASSGGLYCLGGGCGNVDPDESARISSAFFRLFRVMRLIKLLSRAEGVRTLLWTFIKSFQALPYVALLIVMLFFI YAVIGMQMFGKIALVDGTQINRNNNFQTFPQAVLLLFRCATGEAWQEILLACSYGKLCDPESDYAPGEEYTCGTNFAYYY FISFYMLCAFLIINLFVAVIMDNFDYLTRDWSILG ; 1 ? 2 PDB 3JBR 3JBR 1 ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; 1396 ? 3 UNP CAC1S_RABIT P07293 1 ;GKFYATFLIQEHFRKFMKRQEEYYGYRPKKDTVQIQAGLRTIEEEAAPEIRRTISGDLTAEEELERAMVEAAMEERIFRR TGGLFGQVDTFLERTNSLPPVMANQRPLQFAEIEMEELESPVFLEDFPQDARTNPLARANTNNANANVAYGNSNHSNNQM FSSVHCEREFPGEAETPAAGRGALSHSHRALGPHSKPCAGKLNGQLVQPGMPINQAPPAPCQQPSTDPPERGQRRTSLTG SLQDEAPQRRSSEGSTPRRPAPATALLIQEALVRGGLDTLAADAGFVTATSQALADACQMEPEEVEVAATELLKARESVQ GMASVPGSLSRRSSLGSLDQVQGSQETLIPPRP ; 1521 ? 4 UNP CACB2_RAT Q8VGC3 2 ;GSADSYTSRPSDSDVSLEEDREAVRREAERQAQAQLEKAKTKPVAFAVRTNVRYSAAQEDDVPVPGMAISFEAKDFLHVK EKFNNDWWIGRLVKEGCEIGFIPSPVKLENMRLQHEQRAKQGKFYSSKS ; 68 ? 5 UNP CACB2_RAT Q8VGC3 2 ;SKEKRMPFFKKTEHTPPYDVVPSMRPVVLVGPSLKGYEVTDMMQKALFDFLKHRFEGRISITRVTADISLAKRSVLNNPS KHAIIERSNTRSSLAEVQSEIERIFELARTLQLVVLDADTINHPAQLSKTSLAPIIVYVKISSPKVLQRLIKSRGKSQAK HLNVQMVAADKLAQCPPQESFDVILDENQLEDACEHLADYLEAYWKATHPPSSNLPNPLLSR ; 254 ? 6 UNP CCG1_RABIT P19518 3 ;MSPTEAPKVRVTLFCILVGIVLAMTAVVSDHWAVLSPHMENHNTTCEAAHFGLWRICTKRIALGEDRSCGPITLPGEKNC SYFRHFNPGESSEIFEFTTQKEYSISAAAISVFSLGFLIMGTICALMAFRKKRDYLLRPASMFYVFAGLCLFVSLEVMRQ SVKRMIDSEDTVWIEYYYSWSFACACAAFVLLFLGGISLLLFSLPRMPQNPWESCMDAEPEH ; 1 ? 7 UNP CA2D1_RABIT P13806 4 MAAGRPLAWTLTLWQAWLILIGPSSEEPFPSAVTIKSWV 1 ? 8 PDB 3JBR 3JBR 4 XXXXXXXXXXXXXXXX 40 ? 9 UNP CA2D1_RABIT P13806 4 ;VHQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDLDP EKNDSEPGSQRIKPVFIDDANFRRQVSYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDDVFKKNREEDPSLLWQVFGSATG LARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVAS FNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIF AKYNKDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDA LELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKPIG VGIPTINLRKRRPNVQNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVN GTDYSSLALVLPTYSFYYIKAKIEETITQARYSETLKPDNFEESGY ; 56 ? 10 PDB 3JBR 3JBR 4 ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; 662 ? 11 UNP CA2D1_RABIT P13806 4 ;RLLEAADMEDDDFTASMSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHVEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLI QAEQTSDGPDPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWSIIGIQFVLLWLVSGSRHCLL ; 956 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3JBR A 1 ? 1395 ? P07293 1 ? 1395 ? 1 1395 2 2 3JBR A 1396 ? 1520 ? 3JBR 1396 ? 1520 ? 1396 1520 3 3 3JBR A 1521 ? 1873 ? P07293 1521 ? 1873 ? 1521 1873 4 4 3JBR B 4 ? 132 ? Q8VGC3 68 ? 196 ? 17 200 5 5 3JBR B 134 ? 355 ? Q8VGC3 254 ? 475 ? 202 424 6 6 3JBR E 1 ? 222 ? P19518 1 ? 222 ? 1 222 7 7 3JBR F 1 ? 39 ? P13806 1 ? 39 ? 1 39 8 8 3JBR F 40 ? 55 ? 3JBR 40 ? 55 ? 40 55 9 9 3JBR F 56 ? 661 ? P13806 56 ? 661 ? 56 661 10 10 3JBR F 662 ? 955 ? 3JBR 662 ? 955 ? 662 955 11 11 3JBR F 956 ? 1106 ? P13806 956 ? 1106 ? 956 1106 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 4 3JBR GLY B 1 ? UNP Q8VGC3 ? ? 'expression tag' 14 1 4 3JBR HIS B 2 ? UNP Q8VGC3 ? ? 'expression tag' 15 2 4 3JBR MET B 3 ? UNP Q8VGC3 ? ? 'expression tag' 16 3 5 3JBR MET B 133 ? UNP Q8VGC3 ? ? linker 201 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ? 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 3JBR _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.crystals_number ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 16234 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 233 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 16467 _refine_hist.d_res_high . _refine_hist.d_res_low . # _struct.entry_id 3JBR _struct.title 'Cryo-EM structure of the rabbit voltage-gated calcium channel Cav1.1 complex at 4.2 angstrom' _struct.pdbx_descriptor ;Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3JBR _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.text 'membrane protein, voltage-gated calcium channel' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 6 ? H N N 6 ? I N N 6 ? J N N 6 ? K N N 6 ? L N N 6 ? M N N 6 ? N N N 6 ? O N N 6 ? P N N 6 ? Q N N 6 ? R N N 6 ? S N N 6 ? T N N 6 ? U N N 7 ? V N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 PRO A 39 ? GLU A 49 ? PRO A 39 GLU A 49 1 ? 11 HELX_P HELX_P2 2 LYS A 51 ? LEU A 72 ? LYS A 51 LEU A 72 1 ? 22 HELX_P HELX_P3 3 LEU A 82 ? ILE A 106 ? LEU A 82 ILE A 106 1 ? 25 HELX_P HELX_P4 4 LEU A 111 ? GLN A 114 ? LEU A 111 GLN A 114 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 5 ASP A 115 ? LEU A 139 ? ASP A 115 LEU A 139 1 ? 25 HELX_P HELX_P6 6 LYS A 162 ? ARG A 168 ? LYS A 162 ARG A 168 1 ? 7 HELX_P HELX_P7 7 VAL A 169 ? ARG A 171 ? VAL A 169 ARG A 171 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 8 PRO A 172 ? GLY A 178 ? PRO A 172 GLY A 178 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 9 SER A 181 ? LEU A 194 ? SER A 181 LEU A 194 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 10 LEU A 196 ? LEU A 215 ? LEU A 196 LEU A 215 1 ? 20 HELX_P HELX_P11 11 GLU A 216 ? CYS A 226 ? GLU A 216 CYS A 226 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 12 ASN A 277 ? THR A 290 ? ASN A 277 THR A 290 1 ? 14 HELX_P HELX_P13 13 GLY A 293 ? ALA A 304 ? GLY A 293 ALA A 304 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 14 TRP A 309 ? ALA A 344 ? TRP A 309 ALA A 344 1 ? 36 HELX_P HELX_P15 15 GLN A 358 ? GLN A 372 ? GLN A 358 GLN A 372 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 16 HIS A 426 ? ARG A 432 ? HIS A 426 ARG A 432 1 ? 7 HELX_P HELX_P17 17 LEU A 437 ? LEU A 460 ? LEU A 437 LEU A 460 1 ? 24 HELX_P HELX_P18 18 SER A 473 ? ASN A 497 ? SER A 473 ASN A 497 1 ? 25 HELX_P HELX_P19 19 ASN A 497 ? VAL A 503 ? ASN A 497 VAL A 503 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 20 VAL A 503 ? GLY A 517 ? VAL A 503 GLY A 517 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 21 ILE A 524 ? LEU A 535 ? ILE A 524 LEU A 535 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 22 PHE A 536 ? TYR A 541 ? PHE A 536 TYR A 541 5 ? 6 HELX_P HELX_P23 23 SER A 544 ? LEU A 580 ? SER A 544 LEU A 580 1 ? 37 HELX_P HELX_P24 24 ASN A 599 ? GLY A 613 ? ASN A 599 GLY A 613 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 25 ASP A 615 ? TYR A 627 ? ASP A 615 TYR A 627 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 26 GLY A 634 ? VAL A 637 ? GLY A 634 VAL A 637 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 27 CYS A 638 ? SER A 669 ? CYS A 638 SER A 669 1 ? 32 HELX_P HELX_P28 28 THR A 799 ? LEU A 807 ? THR A 799 LEU A 807 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 29 PHE A 808 ? ASN A 829 ? PHE A 808 ASN A 829 1 ? 22 HELX_P HELX_P30 30 GLN A 830 ? ILE A 837 ? GLN A 830 ILE A 837 5 ? 8 HELX_P HELX_P31 31 PHE A 839 ? SER A 862 ? PHE A 839 SER A 862 1 ? 24 HELX_P HELX_P32 32 ASN A 866 ? ASP A 872 ? ASN A 866 ASP A 872 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 33 ASP A 872 ? LEU A 885 ? ASP A 872 LEU A 885 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 34 ILE A 895 ? LEU A 902 ? ILE A 895 LEU A 902 5 ? 8 HELX_P HELX_P35 35 PRO A 904 ? ALA A 911 ? PRO A 904 ALA A 911 5 ? 8 HELX_P HELX_P36 36 LYS A 912 ? ILE A 928 ? LYS A 912 ILE A 928 1 ? 17 HELX_P HELX_P37 37 ILE A 928 ? LYS A 951 ? ILE A 928 LYS A 951 1 ? 24 HELX_P HELX_P38 38 ASN A 999 ? THR A 1012 ? ASN A 999 THR A 1012 1 ? 14 HELX_P HELX_P39 39 GLY A 1015 ? ASP A 1025 ? GLY A 1015 ASP A 1025 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 40 ARG A 1038 ? GLU A 1040 ? ARG A 1038 GLU A 1040 5 ? 3 HELX_P HELX_P41 41 MET A 1041 ? TYR A 1076 ? MET A 1041 TYR A 1076 1 ? 36 HELX_P HELX_P42 42 ASN A 1105 ? SER A 1117 ? ASN A 1105 SER A 1117 1 ? 13 HELX_P HELX_P43 43 SER A 1118 ? MET A 1137 ? SER A 1118 MET A 1137 1 ? 20 HELX_P HELX_P44 44 GLU A 1145 ? LEU A 1170 ? GLU A 1145 LEU A 1170 1 ? 26 HELX_P HELX_P45 45 PRO A 1181 ? ILE A 1202 ? PRO A 1181 ILE A 1202 1 ? 22 HELX_P HELX_P46 46 ASP A 1203 ? THR A 1204 ? ASP A 1203 THR A 1204 5 ? 2 HELX_P HELX_P47 47 ARG A 1229 ? ARG A 1229 ? ARG A 1229 ARG A 1229 5 ? 1 HELX_P HELX_P48 48 ILE A 1230 ? MET A 1241 ? ILE A 1230 MET A 1241 1 ? 12 HELX_P HELX_P49 49 LEU A 1243 ? ALA A 1250 ? LEU A 1243 ALA A 1250 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 50 VAL A 1253 ? GLN A 1265 ? VAL A 1253 GLN A 1265 1 ? 13 HELX_P HELX_P51 51 LEU A 1267 ? GLN A 1287 ? LEU A 1267 GLN A 1287 1 ? 21 HELX_P HELX_P52 52 THR A 1308 ? CYS A 1319 ? THR A 1308 CYS A 1319 1 ? 12 HELX_P HELX_P53 53 ALA A 1320 ? GLY A 1322 ? ALA A 1320 GLY A 1322 5 ? 3 HELX_P HELX_P54 54 ALA A 1324 ? SER A 1333 ? ALA A 1324 SER A 1333 1 ? 10 HELX_P HELX_P55 55 ALA A 1357 ? ASN A 1383 ? ALA A 1357 ASN A 1383 1 ? 27 HELX_P HELX_P56 56 ASN A 1383 ? GLY A 1395 ? ASN A 1383 GLY A 1395 1 ? 13 HELX_P HELX_P57 57 UNK A 1400 ? UNK A 1411 ? UNK A 1400 UNK A 1411 1 ? 12 HELX_P HELX_P58 58 UNK A 1416 ? UNK A 1423 ? UNK A 1416 UNK A 1423 1 ? 8 HELX_P HELX_P59 59 UNK A 1423 ? UNK A 1434 ? UNK A 1423 UNK A 1434 1 ? 12 HELX_P HELX_P60 60 UNK A 1440 ? UNK A 1454 ? UNK A 1440 UNK A 1454 1 ? 15 HELX_P HELX_P61 61 UNK A 1459 ? UNK A 1475 ? UNK A 1459 UNK A 1475 1 ? 17 HELX_P HELX_P62 62 UNK A 1479 ? UNK A 1484 ? UNK A 1479 UNK A 1484 5 ? 6 HELX_P HELX_P63 63 UNK A 1487 ? UNK A 1498 ? UNK A 1487 UNK A 1498 1 ? 12 HELX_P HELX_P64 64 UNK A 1505 ? UNK A 1520 ? UNK A 1505 UNK A 1520 1 ? 16 HELX_P HELX_P65 65 ARG B 29 ? THR B 44 ? ARG B 42 THR B 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P66 66 ALA B 60 ? ASP B 64 ? ALA B 73 ASP B 77 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 67 SER B 107 ? ALA B 122 ? SER B 120 ALA B 135 1 ? 16 HELX_P HELX_P68 68 TYR B 170 ? PHE B 188 ? TYR B 239 PHE B 257 1 ? 19 HELX_P HELX_P69 69 ASP B 200 ? ALA B 204 ? ASP B 269 ALA B 273 5 ? 5 HELX_P HELX_P70 70 SER B 226 ? ALA B 241 ? SER B 295 ALA B 310 1 ? 16 HELX_P HELX_P71 71 ARG B 242 ? LEU B 244 ? ARG B 311 LEU B 313 5 ? 3 HELX_P HELX_P72 72 HIS B 256 ? THR B 263 ? HIS B 325 THR B 332 5 ? 8 HELX_P HELX_P73 73 SER B 276 ? ARG B 287 ? SER B 345 ARG B 356 1 ? 12 HELX_P HELX_P74 74 LEU B 295 ? CYS B 308 ? LEU B 364 CYS B 377 1 ? 14 HELX_P HELX_P75 75 PRO B 309 ? PHE B 314 ? PRO B 378 PHE B 383 1 ? 6 HELX_P HELX_P76 76 GLN B 322 ? HIS B 342 ? GLN B 391 HIS B 411 1 ? 21 HELX_P HELX_P77 77 PRO B 343 ? ASN B 347 ? PRO B 412 ASN B 416 5 ? 5 HELX_P HELX_P78 78 ALA C 6 ? SER C 29 ? ALA E 6 SER E 29 1 ? 24 HELX_P HELX_P79 79 PHE C 97 ? ALA C 128 ? PHE E 97 ALA E 128 1 ? 32 HELX_P HELX_P80 80 LYS C 131 ? ILE C 166 ? LYS E 131 ILE E 166 1 ? 36 HELX_P HELX_P81 81 TRP C 180 ? LEU C 204 ? TRP E 180 LEU E 204 1 ? 25 HELX_P HELX_P82 82 UNK D 52 ? UNK D 54 ? UNK F 52 UNK F 54 5 ? 3 HELX_P HELX_P83 83 UNK D 55 ? ASP D 68 ? UNK F 55 ASP F 68 1 ? 14 HELX_P HELX_P84 84 ALA D 77 ? ALA D 112 ? ALA F 77 ALA F 112 1 ? 36 HELX_P HELX_P85 85 SER D 178 ? GLU D 201 ? SER F 178 GLU F 201 1 ? 24 HELX_P HELX_P86 86 ARG D 243 ? GLY D 249 ? ARG F 243 GLY F 249 1 ? 7 HELX_P HELX_P87 87 GLY D 268 ? LEU D 285 ? GLY F 268 LEU F 285 1 ? 18 HELX_P HELX_P88 88 VAL D 314 ? ASN D 326 ? VAL F 314 ASN F 326 1 ? 13 HELX_P HELX_P89 89 TYR D 335 ? ASN D 348 ? TYR F 335 ASN F 348 1 ? 14 HELX_P HELX_P90 90 ALA D 371 ? ASN D 379 ? ALA F 371 ASN F 379 1 ? 9 HELX_P HELX_P91 91 ARG D 398 ? ASN D 408 ? ARG F 398 ASN F 408 1 ? 11 HELX_P HELX_P92 92 GLY D 419 ? LEU D 429 ? GLY F 419 LEU F 429 1 ? 11 HELX_P HELX_P93 93 ASP D 430 ? LEU D 432 ? ASP F 430 LEU F 432 5 ? 3 HELX_P HELX_P94 94 GLY D 433 ? LEU D 438 ? GLY F 433 LEU F 438 1 ? 6 HELX_P HELX_P95 95 LEU D 485 ? GLY D 491 ? LEU F 485 GLY F 491 1 ? 7 HELX_P HELX_P96 96 ASP D 562 ? GLU D 567 ? ASP F 562 GLU F 567 1 ? 6 HELX_P HELX_P97 97 ASP D 571 ? ILE D 581 ? ASP F 571 ILE F 581 1 ? 11 HELX_P HELX_P98 98 GLU D 639 ? LYS D 652 ? GLU F 639 LYS F 652 1 ? 14 HELX_P HELX_P99 99 UNK D 663 ? UNK D 677 ? UNK F 663 UNK F 677 1 ? 15 HELX_P HELX_P100 100 UNK D 681 ? UNK D 697 ? UNK F 681 UNK F 697 1 ? 17 HELX_P HELX_P101 101 UNK D 732 ? UNK D 751 ? UNK F 732 UNK F 751 1 ? 20 HELX_P HELX_P102 102 UNK D 752 ? UNK D 765 ? UNK F 752 UNK F 765 1 ? 14 HELX_P HELX_P103 103 UNK D 778 ? UNK D 799 ? UNK F 778 UNK F 799 1 ? 22 HELX_P HELX_P104 104 UNK D 859 ? UNK D 867 ? UNK F 859 UNK F 867 1 ? 9 HELX_P HELX_P105 105 UNK D 903 ? UNK D 912 ? UNK F 903 UNK F 912 1 ? 10 HELX_P HELX_P106 106 UNK D 931 ? UNK D 938 ? UNK F 931 UNK F 938 1 ? 8 HELX_P HELX_P107 107 ILE D 978 ? ASP D 989 ? ILE F 978 ASP F 989 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_conn.id disulf1 _struct_conn.conn_type_id disulf _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag ? _struct_conn.pdbx_PDB_id ? _struct_conn.ptnr1_label_asym_id D _struct_conn.ptnr1_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 406 _struct_conn.ptnr1_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id ? _struct_conn.ptnr1_symmetry 1_555 _struct_conn.ptnr2_label_asym_id D _struct_conn.ptnr2_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 1062 _struct_conn.ptnr2_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code ? _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id F _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id 406 _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id F _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id 1062 _struct_conn.ptnr2_symmetry 1_555 _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code ? _struct_conn.details ? _struct_conn.pdbx_dist_value 2.033 _struct_conn.pdbx_value_order ? _struct_conn.pdbx_role ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 73 A . ? PRO 73 A MET 74 A ? MET 74 A 1 -3.95 2 ILE 256 A . ? ILE 256 A ASN 257 A ? ASN 257 A 1 1.97 3 ILE 305 A . ? ILE 305 A GLY 306 A ? GLY 306 A 1 2.00 4 TYR 435 A . ? TYR 435 A TRP 436 A ? TRP 436 A 1 -0.64 5 HIS 462 A . ? HIS 462 A LEU 463 A ? LEU 463 A 1 -3.02 6 PRO 521 A . ? PRO 521 A LEU 522 A ? LEU 522 A 1 1.55 7 ASP 589 A . ? ASP 589 A THR 590 A ? THR 590 A 1 -2.63 8 GLU 591 A . ? GLU 591 A VAL 592 A ? VAL 592 A 1 -0.86 9 ASN 958 A . ? ASN 958 A ASP 959 A ? ASP 959 A 1 -11.16 10 GLN 989 A . ? GLN 989 A TRP 990 A ? TRP 990 A 1 -2.84 11 PRO 1033 A . ? PRO 1033 A VAL 1034 A ? VAL 1034 A 1 1.78 12 GLN 1142 A . ? GLN 1142 A SER 1143 A ? SER 1143 A 1 -1.15 13 UNK 1415 A . ? UNK 1415 A UNK 1416 A ? UNK 1416 A 1 -1.73 14 GLY 164 B . ? GLY 233 B PRO 165 B ? PRO 234 B 1 -2.63 15 GLU 123 D . ? GLU 123 F VAL 124 D ? VAL 124 F 1 -6.98 16 VAL 124 D . ? VAL 124 F VAL 125 D ? VAL 125 F 1 -2.53 17 PRO 203 D . ? PRO 203 F SER 204 D ? SER 204 F 1 5.03 18 PRO 224 D . ? PRO 224 F TRP 225 D ? 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K ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel C 2 3 ? parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel F 4 5 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 VAL A 974 ? 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ASP F 255 VAL F 260 G 4 LYS D 358 ? THR D 364 ? LYS F 358 THR F 364 G 5 VAL D 384 ? SER D 390 ? VAL F 384 SER F 390 H 1 LYS D 500 ? ARG D 501 ? LYS F 500 ARG F 501 H 2 SER D 620 ? LEU D 624 ? SER F 620 LEU F 624 H 3 TYR D 609 ? PRO D 613 ? TYR F 609 PRO F 613 I 1 VAL D 594 ? SER D 596 ? VAL F 594 SER F 596 I 2 ASP D 603 ? GLY D 605 ? ASP F 603 GLY F 605 J 1 UNK D 806 ? UNK D 807 ? UNK F 806 UNK F 807 J 2 UNK D 818 ? UNK D 819 ? UNK F 818 UNK F 819 K 1 UNK D 827 ? UNK D 832 ? UNK F 827 UNK F 832 K 2 UNK D 839 ? UNK D 844 ? UNK F 839 UNK F 844 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N VAL A 974 ? 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F . n D 4 1066 ASN 1066 1066 ? ? ? F . n D 4 1067 VAL 1067 1067 ? ? ? F . n D 4 1068 LEU 1068 1068 ? ? ? F . n D 4 1069 GLU 1069 1069 ? ? ? F . n D 4 1070 ASP 1070 1070 ? ? ? F . n D 4 1071 TYR 1071 1071 ? ? ? F . n D 4 1072 THR 1072 1072 ? ? ? F . n D 4 1073 ASP 1073 1073 ? ? ? F . n D 4 1074 CYS 1074 1074 ? ? ? F . n D 4 1075 GLY 1075 1075 ? ? ? F . n D 4 1076 GLY 1076 1076 ? ? ? F . n D 4 1077 VAL 1077 1077 ? ? ? F . n D 4 1078 SER 1078 1078 ? ? ? F . n D 4 1079 GLY 1079 1079 ? ? ? F . n D 4 1080 LEU 1080 1080 ? ? ? F . n D 4 1081 ASN 1081 1081 ? ? ? F . n D 4 1082 PRO 1082 1082 ? ? ? F . n D 4 1083 SER 1083 1083 ? ? ? F . n D 4 1084 LEU 1084 1084 ? ? ? F . n D 4 1085 TRP 1085 1085 ? ? ? F . n D 4 1086 SER 1086 1086 ? ? ? F . n D 4 1087 ILE 1087 1087 ? ? ? F . n D 4 1088 ILE 1088 1088 ? ? ? F . n D 4 1089 GLY 1089 1089 ? ? ? F . n D 4 1090 ILE 1090 1090 ? ? ? F . n D 4 1091 GLN 1091 1091 ? ? ? F . n D 4 1092 PHE 1092 1092 ? ? ? F . n D 4 1093 VAL 1093 1093 ? ? ? F . n D 4 1094 LEU 1094 1094 ? ? ? F . n D 4 1095 LEU 1095 1095 ? ? ? F . n D 4 1096 TRP 1096 1096 ? ? ? F . n D 4 1097 LEU 1097 1097 ? ? ? F . n D 4 1098 VAL 1098 1098 ? ? ? F . n D 4 1099 SER 1099 1099 ? ? ? F . n D 4 1100 GLY 1100 1100 ? ? ? F . n D 4 1101 SER 1101 1101 ? ? ? F . n D 4 1102 ARG 1102 1102 ? ? ? F . n D 4 1103 HIS 1103 1103 ? ? ? F . n D 4 1104 CYS 1104 1104 ? ? ? F . n D 4 1105 LEU 1105 1105 ? ? ? F . n D 4 1106 LEU 1106 1106 ? ? ? F . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 CA 1 1901 1901 CA CA A . F 6 NAG 1 1201 1201 NAG NAG F . G 6 NAG 1 1202 1202 NAG NAG F . H 6 NAG 1 1203 1203 NAG NAG F . I 6 NAG 1 1204 1204 NAG NAG F . J 6 NAG 1 1205 1205 NAG NAG F . K 6 NAG 1 1206 1206 NAG NAG F . L 6 NAG 1 1207 1207 NAG NAG F . M 6 NAG 1 1208 1208 NAG NAG F . N 6 NAG 1 1209 1209 NAG NAG F . O 6 NAG 1 1210 1210 NAG NAG F . P 6 NAG 1 1211 1211 NAG NAG F . Q 6 NAG 1 1212 1212 NAG NAG F . R 6 NAG 1 1213 1213 NAG NAG F . S 6 NAG 1 1214 1214 NAG NAG F . T 6 NAG 1 1215 1215 NAG NAG F . U 7 BMA 1 1216 1216 BMA BMA F . V 7 BMA 1 1217 1217 BMA BMA F . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2015-12-30 2 'Structure model' 1 1 2019-12-18 3 'Structure model' 1 2 2020-07-29 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 3 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' 'Data collection' 4 3 'Structure model' 'Derived calculations' 5 3 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' database_2 2 2 'Structure model' em_image_scans 3 2 'Structure model' em_software 4 2 'Structure model' struct_ref_seq_dif 5 3 'Structure model' chem_comp 6 3 'Structure model' entity 7 3 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 8 3 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 9 3 'Structure model' struct_site 10 3 'Structure model' struct_site_gen # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_em_software.fitting_id' 2 2 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 3 2 'Structure model' '_em_software.name' 4 2 'Structure model' '_struct_ref_seq_dif.details' 5 3 'Structure model' '_chem_comp.name' 6 3 'Structure model' '_chem_comp.type' 7 3 'Structure model' '_entity.pdbx_description' 8 3 'Structure model' '_pdbx_entity_nonpoly.name' # _pdbx_entry_details.entry_id 3JBR _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;RESIDUES 1396-1520 OF ENTITY 1 (CHAIN A), AND RESIDUES 40-55/662-955 OF ENTITY 4 (CHAIN F) ARE MODELED AS UNK SINCE THE EM DENSITY IS NOT GOOD ENOUGH TO ASSIGN EXACTLY. THE REAL SEQUENCE OF RESIDUES 1396-1520 OF ENTITY 1 (CHAIN A) SHOULD BE (PHHLDEFKAIWAEYDPEAKGRIKHLDVVTLLRRIQPPLGFGKFCPHRVACKRLVGMNMPLNSDGTVTFNATLFALVRTALKIKTEGNFEQANEELRAIIKKIWKRTSMKLLDQVIPPIGDDEVTV). REAL SEQUENCES FOR RESIDUES 40-55/662-955 OF ENTITY 4 SHOULD BE (DMQEDLVTLAKTASG) AND (TFLAPRDYCSDLKPSDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNTDLINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQKNIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKSGPGAYESGIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSIADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFP) RESPECTIVELY. ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 3JBR _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ;REFINEMENT PROTOCOL--rigid body DETAILS--The fitting is mostly refer to a related entry ; _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 1T0J _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.details ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 3JBR _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.resolution 4.2 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details '(Single particle details: The particles were selected using RELION.) (Single particle--Applied symmetry: C1)' _em_3d_reconstruction.num_particles 353372 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '20mM MOPS, 200mM NaCl, 0.5mM CaCl2,0.1% digitonin' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.details '20mM MOPS, 200mM NaCl, 0.5mM CaCl2,0.1% digitonin' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'a membrane protein cryo-sample' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym Cav1.1 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.entry_id 3JBR _em_imaging.id 1 _em_imaging.date 2015-02-02 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.temperature ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.nominal_defocus_min 2.0 _em_imaging.nominal_defocus_max 3.3 _em_imaging.tilt_angle_min 0.0 _em_imaging.tilt_angle_max 0.0 _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.detector_distance 0.0 _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.citation_id ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'carbon coated grid' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 3JBR _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method 'Blot for 2 seconds before plunging' _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3JBR _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3JBR _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 CD1 F ILE 499 ? ? 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