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PDB 3JBY unspecified . # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Ru, H.' 1 'Chambers, M.G.' 2 'Fu, T.-M.' 3 'Tong, A.B.' 4 'Liao, M.' 5 'Wu, H.' 6 # _citation.id primary _citation.title 'Molecular Mechanism of V(D)J Recombination from Synaptic RAG1-RAG2 Complex Structures.' _citation.journal_abbrev 'Cell(Cambridge,Mass.)' _citation.journal_volume 163 _citation.page_first 1138 _citation.page_last 1152 _citation.year 2015 _citation.journal_id_ASTM CELLB5 _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0092-8674 _citation.journal_id_CSD 0998 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 26548953 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2015.10.055 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Ru, H.' 1 ? primary 'Chambers, M.G.' 2 ? primary 'Fu, T.M.' 3 ? primary 'Tong, A.B.' 4 ? primary 'Liao, M.' 5 ? primary 'Wu, H.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'V(D)J recombination-activating protein 1' 87684.125 2 '3.1.-.-, 6.3.2.-' ? ? ? 2 polymer man 'V(D)J recombination-activating protein 2' 59435.930 2 ? ? ? ? 3 polymer syn "5'-D(*CP*AP*CP*AP*GP*TP*GP*CP*TP*AP*CP*AP*GP*AP*C)-3'" 4562.988 2 ? ? ? 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KIFQDEIGEVYQKPNPSREERRRWRSTLDKQLRKKMKLKPVMRMNGNYARRLMTREAVEAVCELVPSEERREALLKLMDL YLQMKPVWRSTCPSRDCPDQLCQYSYNSQQFADLLSSMFKYRYDGKITNYLHKTLAHVPEIVERDGSIGAWASEGNESGN KLFRRFRKMNARQSKTFELEDILKHHWLYTSKYLQKFMEAHKNS ; A,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;GGSMSLQPLTAVNCGSLVQPGFSLLDLEGDVYLFGQKGWPKRSCPTGIFGVRIKKGELKLRAISFSNNSSYLPPLRCPAI AHFEAQDGKPECYLIHGGRTPNNELSSSLYMLSVDSRGCNRKVTLRCEEKELVGDVPSARYGHTLSVINSRGKTACVLFG GRSYMPPTERTTQNWNSVVDCPPQVYLIDLEFGCCTAHTLPELTDGQSFHVALARQDCVYFLGGHILSSDCRPSRLIRLH VELLLGSPVLTCTILHEGLTITSAIASPIGYHEYIIFGGYQSETQKRMECTYVGLDDVGVHMESREPPQWTSEISHSRTW FGGSLGKGTALVAIPSEGNPTPPEAYHFYQVSFQKEQDGEATAQGGSQESTDFEDSAPLEDSEELYFGREPHELEYSSDV EGDTYNEEDEEDESQTGYWIKCCLSCQVDPNIWEPYYSTELTRPAMIFCSRGEGGHWVHAQCMELPESLLLQLSQDNSKY FCLDHGGLPKQEMTPPKQMLPVKRVPMKMTHRKAPVSLKMTPAKKTFLRRLFD ; ;GGSMSLQPLTAVNCGSLVQPGFSLLDLEGDVYLFGQKGWPKRSCPTGIFGVRIKKGELKLRAISFSNNSSYLPPLRCPAI AHFEAQDGKPECYLIHGGRTPNNELSSSLYMLSVDSRGCNRKVTLRCEEKELVGDVPSARYGHTLSVINSRGKTACVLFG 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_entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLY n 1 2 GLY n 1 3 SER n 1 4 ARG n 1 5 CYS n 1 6 GLN n 1 7 ARG n 1 8 ASP n 1 9 HIS n 1 10 LEU n 1 11 SER n 1 12 THR n 1 13 LYS n 1 14 LEU n 1 15 ILE n 1 16 PRO n 1 17 THR n 1 18 GLU n 1 19 VAL n 1 20 PRO n 1 21 ALA n 1 22 ASP n 1 23 LEU n 1 24 ILE n 1 25 ARG n 1 26 ALA n 1 27 VAL n 1 28 THR n 1 29 CYS n 1 30 GLN n 1 31 VAL n 1 32 CYS n 1 33 ASP n 1 34 HIS n 1 35 LEU n 1 36 LEU n 1 37 SER n 1 38 ASP n 1 39 PRO n 1 40 VAL n 1 41 GLN n 1 42 SER n 1 43 PRO n 1 44 CYS n 1 45 ARG n 1 46 HIS n 1 47 LEU n 1 48 PHE n 1 49 CYS n 1 50 ARG n 1 51 LEU n 1 52 CYS n 1 53 ILE n 1 54 ILE n 1 55 ARG n 1 56 TYR n 1 57 THR n 1 58 HIS n 1 59 ALA n 1 60 LEU n 1 61 GLY n 1 62 PRO n 1 63 ASN n 1 64 CYS n 1 65 PRO n 1 66 THR n 1 67 CYS n 1 68 ASN n 1 69 GLN n 1 70 HIS n 1 71 LEU n 1 72 ASN n 1 73 PRO n 1 74 SER n 1 75 HIS n 1 76 LEU n 1 77 ILE n 1 78 LYS n 1 79 PRO n 1 80 ALA n 1 81 LYS n 1 82 PHE n 1 83 PHE n 1 84 LEU n 1 85 ALA n 1 86 THR n 1 87 LEU n 1 88 SER n 1 89 SER n 1 90 LEU n 1 91 PRO n 1 92 LEU n 1 93 LEU n 1 94 CYS n 1 95 PRO n 1 96 SER n 1 97 GLU n 1 98 GLU n 1 99 CYS n 1 100 SER n 1 101 ASP n 1 102 TRP n 1 103 VAL n 1 104 ARG n 1 105 LEU n 1 106 ASP n 1 107 SER n 1 108 PHE n 1 109 ARG n 1 110 GLU n 1 111 HIS n 1 112 CYS n 1 113 LEU n 1 114 ASN n 1 115 HIS n 1 116 TYR n 1 117 ARG n 1 118 GLU n 1 119 LYS n 1 120 GLU n 1 121 SER n 1 122 GLN n 1 123 GLU n 1 124 GLU n 1 125 GLN n 1 126 THR n 1 127 PRO n 1 128 SER n 1 129 GLU n 1 130 GLN n 1 131 ASN n 1 132 LEU n 1 133 ASP n 1 134 GLY n 1 135 TYR n 1 136 LEU n 1 137 PRO n 1 138 VAL n 1 139 ASN n 1 140 LYS n 1 141 GLY n 1 142 GLY n 1 143 ARG n 1 144 PRO n 1 145 ARG n 1 146 GLN n 1 147 HIS n 1 148 LEU n 1 149 LEU n 1 150 SER n 1 151 LEU n 1 152 THR n 1 153 ARG n 1 154 ARG n 1 155 ALA n 1 156 GLN n 1 157 LYS n 1 158 HIS n 1 159 ARG n 1 160 LEU n 1 161 ARG n 1 162 ASP n 1 163 LEU n 1 164 LYS n 1 165 ASN n 1 166 GLN n 1 167 VAL n 1 168 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'ELECTRON MICROSCOPY' f_angle_d 23828 1.056 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' f_chiral_restr 2600 0.040 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' f_plane_restr 2682 0.005 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' f_dihedral_angle_d 6636 20.923 ? ? ? # loop_ _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs 3.4002 3.5217 10 100.0000 70299 . 0.5150 0.5767 . 144 . 70443 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 3.5217 3.6627 10 100.0000 69303 . 0.4996 0.5033 . 144 . 69447 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 3.6627 3.8294 10 100.0000 70153 . 0.4744 0.5610 . 132 . 70285 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 3.8294 4.0314 10 100.0000 69980 . 0.4515 0.4832 . 132 . 70112 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.0314 4.2840 10 100.0000 70178 . 0.4110 0.5019 . 144 . 70322 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.2840 4.6148 10 100.0000 69864 . 0.3513 0.4586 . 96 . 69960 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.6148 5.0792 10 100.0000 70275 . 0.3023 0.3004 . 156 . 70431 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 5.0792 5.8142 10 100.0000 69820 . 0.2903 0.3155 . 144 . 69964 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 5.8142 7.3254 10 100.0000 70148 . 0.2953 0.2937 . 108 . 70256 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 7.3254 236.7316 10 99.0000 69564 . 0.2085 0.2417 . 168 . 69732 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . # _database_PDB_matrix.entry_id 3JBX _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 3JBX _struct.title 'Cryo-electron microscopy structure of RAG Signal End Complex (C2 symmetry)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3JBX _struct_keywords.pdbx_keywords RECOMBINATION/DNA _struct_keywords.text ;RAG1, RAG2, V(D)J recombination, Signal end complex, Antigen receptor gene recombination, T and B cell development, RECOMBINATION-DNA complex ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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R N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP RAG1_DANRE O13033 1 ;RCQRDHLSTKLIPTEVPADLIRAVTCQVCDHLLSDPVQSPCRHLFCRLCIIRYTHALGPNCPTCNQHLNPSHLIKPAKFF LATLSSLPLLCPSEECSDWVRLDSFREHCLNHYREKESQEEQTPSEQNLDGYLPVNKGGRPRQHLLSLTRRAQKHRLRDL KNQVKTFAEKEEGGDVKSVCLTLFLLALRAGNEHKQADELEAMMQGRGFGLHPAVCLAIRVNTFLSCSQYHKMYRTVKAT SGRQIFQPLHTLRNAEKELLPGFHQFEWQPALKNVSTSWDVGIIDGLSGWTVSVDDVPADTISRRFRYDVALVSALKDLE EDIMEGLRERALDDSMCTSGFTVVVKESCDGMGDVSEKHGSGPAVPEKAVRFSFTIMSISIRLEGEDDGITIFQEQKPNS ELSCRPLCLMFVDESDHETLTAILGPVVAERKAMMESRLIISVGGLLRSFRFFFRGTGYDEKMVREMEGLEASGSTYICT LCDSTRAEASQNMVLHSITRSHDENLERYEIWRKNPFSESADELRDRVKGVSAKPFMETQPTLDALHCDIGNATEFYKIF QDEIGEVYQKPNPSREERRRWRSTLDKQLRKKMKLKPVMRMNGNYARRLMTREAVEAVCELVPSEERREALLKLMDLYLQ MKPVWRSTCPSRDCPDQLCQYSYNSQQFADLLSSMFKYRYDGKITNYLHKTLAHVPEIVERDGSIGAWASEGNESGNKLF RRFRKMNARQSKTFELEDILKHHWLYTSKYLQKFMEAHKNS ; 271 ? 2 UNP Q1RLW7_DANRE Q1RLW7 2 ;MSLQPLTAVNCGSLVQPGFSLLDLEGDVYLFGQKGWPKRSCPTGIFGVRIKKGELKLRAISFSNNSSYLPPLRCPAIAHF EAQDGKPECYLIHGGRTPNNELSSSLYMLSVDSRGCNRKVTLRCEEKELVGDVPSARYGHTLSVINSRGKTACVLFGGRS YMPPTERTTQNWNSVVDCPPQVYLIDLEFGCCTAHTLPELTDGQSFHVALARQDCVYFLGGHILSSDCRPSRLIRLHVEL LLGSPVLTCTILHEGLTITSAIASPIGYHEYIIFGGYQSETQKRMECTYVGLDDVGVHMESREPPQWTSEISHSRTWFGG SLGKGTALVAIPSEGNPTPPEAYHFYQVSFQKEQDGEATAQGGSQESTDFEDSAPLEDSEELYFGREPHELEYSSDVEGD TYNEEDEEDESQTGYWIKCCLSCQVDPNIWEPYYSTELTRPAMIFCSRGEGGHWVHAQCMELPESLLLQLSQDNSKYFCL DHGGLPKQEMTPPKQMLPVKRVPMKMTHRKAPVSLKMTPAKKTFLRRLFD ; 1 ? 3 PDB 3JBX 3JBX 3 CACAGTGCTACAGAC 1 ? 4 PDB 3JBX 3JBX 4 GTCTGTAGCACTGTG 1 ? 5 PDB 3JBX 3JBX 5 GCGATGGTTAACCA 1 ? 6 PDB 3JBX 3JBX 6 GCGATGGTTAACCA 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3JBX A 4 ? 764 ? O13033 271 ? 1031 ? 271 1031 2 2 3JBX B 4 ? 533 ? Q1RLW7 1 ? 530 ? 1 530 3 1 3JBX C 4 ? 764 ? O13033 271 ? 1031 ? 271 1031 4 2 3JBX D 4 ? 533 ? Q1RLW7 1 ? 530 ? 1 530 5 3 3JBX E 1 ? 15 ? 3JBX 1 ? 15 ? 1 15 6 3 3JBX H 1 ? 15 ? 3JBX 1 ? 15 ? 1 15 7 4 3JBX F 1 ? 15 ? 3JBX 1 ? 15 ? 1 15 8 4 3JBX G 1 ? 15 ? 3JBX 1 ? 15 ? 1 15 9 5 3JBX I 1 ? 14 ? 3JBX 1 ? 14 ? 1 14 10 5 3JBX K 1 ? 14 ? 3JBX 1 ? 14 ? 1 14 11 6 3JBX J 1 ? 14 ? 3JBX 1 ? 14 ? 1 14 12 6 3JBX L 1 ? 14 ? 3JBX 1 ? 14 ? 1 14 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 3JBX GLY A 1 ? UNP O13033 ? ? 'expression tag' 268 1 1 3JBX GLY A 2 ? UNP O13033 ? ? 'expression tag' 269 2 1 3JBX SER A 3 ? UNP O13033 ? ? 'expression tag' 270 3 2 3JBX GLY B 1 ? UNP Q1RLW7 ? ? 'expression tag' -2 4 2 3JBX GLY B 2 ? UNP Q1RLW7 ? ? 'expression tag' -1 5 2 3JBX SER B 3 ? UNP Q1RLW7 ? ? 'expression tag' 0 6 3 3JBX GLY C 1 ? UNP O13033 ? ? 'expression tag' 268 7 3 3JBX GLY C 2 ? UNP O13033 ? ? 'expression tag' 269 8 3 3JBX SER C 3 ? UNP O13033 ? ? 'expression tag' 270 9 4 3JBX GLY D 1 ? UNP Q1RLW7 ? ? 'expression tag' -2 10 4 3JBX GLY D 2 ? UNP Q1RLW7 ? ? 'expression tag' -1 11 4 3JBX SER D 3 ? UNP Q1RLW7 ? ? 'expression tag' 0 12 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 HIS A 215 ? 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ASN C 872 MET C 880 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 44 THR C 614 ? GLU C 623 ? THR C 881 GLU C 890 1 ? 10 HELX_P HELX_P45 45 SER C 627 ? LYS C 645 ? SER C 894 LYS C 912 1 ? 19 HELX_P HELX_P46 46 CYS C 652 ? CYS C 657 ? CYS C 919 CYS C 924 1 ? 6 HELX_P HELX_P47 47 CYS C 657 ? GLN C 663 ? CYS C 924 GLN C 930 1 ? 7 HELX_P HELX_P48 48 GLN C 663 ? PHE C 679 ? GLN C 930 PHE C 946 1 ? 17 HELX_P HELX_P49 49 PHE C 679 ? ASP C 684 ? PHE C 946 ASP C 951 1 ? 6 HELX_P HELX_P50 50 THR C 688 ? HIS C 697 ? THR C 955 HIS C 964 1 ? 10 HELX_P HELX_P51 51 HIS C 697 ? GLY C 706 ? HIS C 964 GLY C 973 1 ? 10 HELX_P HELX_P52 52 SER C 713 ? ASN C 730 ? SER C 980 ASN C 997 1 ? 18 HELX_P HELX_P53 53 GLU C 738 ? SER C 751 ? GLU C 1005 SER C 1018 1 ? 14 HELX_P HELX_P54 54 SER C 751 ? ALA C 760 ? SER C 1018 ALA C 1027 1 ? 10 HELX_P HELX_P55 55 THR D 311 ? SER D 317 ? 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'DC-DG PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OD1 ? 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A HIS 959 ? 1_555 103.4 ? 10 SG ? A CYS 482 ? A CYS 749 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 697 ? A HIS 964 ? 1_555 130.6 ? 11 SG ? A CYS 485 ? A CYS 752 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 697 ? A HIS 964 ? 1_555 81.7 ? 12 NE2 ? A HIS 692 ? A HIS 959 ? 1_555 ZN ? M ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 697 ? A HIS 964 ? 1_555 131.9 ? 13 OD1 ? C ASP 353 ? C ASP 620 ? 1_555 MG ? Q MG . ? C MG 1102 ? 1_555 OE2 ? C GLU 717 ? C GLU 984 ? 1_555 83.0 ? 14 OD1 ? C ASP 353 ? C ASP 620 ? 1_555 MG ? Q MG . ? C MG 1102 ? 1_555 "O3'" ? F DG 15 ? F DG 15 ? 1_555 148.0 ? 15 OE2 ? C GLU 717 ? C GLU 984 ? 1_555 MG ? Q MG . ? C MG 1102 ? 1_555 "O3'" ? F DG 15 ? F DG 15 ? 1_555 71.5 ? 16 SG ? C CYS 482 ? C CYS 749 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? C ZN 1101 ? 1_555 SG ? C CYS 485 ? C CYS 752 ? 1_555 102.6 ? 17 SG ? C CYS 482 ? C CYS 749 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? C ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? C HIS 692 ? C HIS 959 ? 1_555 131.8 ? 18 SG ? C CYS 485 ? C CYS 752 ? 1_555 ZN ? P ZN . ? C ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? C HIS 692 ? C HIS 959 ? 1_555 119.7 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 245 A . ? GLY 512 A ARG 246 A ? ARG 513 A 1 -5.45 2 GLN 272 A . ? GLN 539 A PRO 273 A ? PRO 540 A 1 -12.26 3 GLY 365 A . ? GLY 632 A PRO 366 A ? PRO 633 A 1 -1.06 4 LEU 386 A . ? LEU 653 A GLU 387 A ? GLU 654 A 1 15.31 5 ALA 475 A . ? ALA 742 A SER 476 A ? SER 743 A 1 -25.20 6 ARG 732 A . ? ARG 999 A GLN 733 A ? GLN 1000 A 1 1.71 7 ASP 87 B . ? ASP 84 B GLY 88 B ? GLY 85 B 1 -14.22 8 PRO 90 B . ? PRO 87 B GLU 91 B ? GLU 88 B 1 -9.71 9 HIS 96 B . ? HIS 93 B GLY 97 B ? GLY 94 B 1 -16.06 10 ARG 117 B . ? ARG 114 B GLY 118 B ? GLY 115 B 1 -23.02 11 GLY 118 B . ? GLY 115 B CYS 119 B ? CYS 116 B 1 -11.71 12 ARG 151 B . ? ARG 148 B GLY 152 B ? GLY 149 B 1 -15.92 13 GLU 191 B . ? GLU 188 B PHE 192 B ? PHE 189 B 1 -7.01 14 LEU 245 B . ? LEU 242 B GLY 246 B ? GLY 243 B 1 3.01 15 ASN 339 B . ? ASN 336 B PRO 340 B ? PRO 337 B 1 5.67 16 PRO 342 B . ? PRO 339 B PRO 343 B ? PRO 340 B 1 -14.10 17 GLY 245 C . ? GLY 512 C ARG 246 C ? ARG 513 C 1 -8.73 18 GLN 272 C . ? GLN 539 C PRO 273 C ? PRO 540 C 1 -11.93 19 GLY 365 C . ? GLY 632 C PRO 366 C ? PRO 633 C 1 0.80 20 LEU 386 C . ? LEU 653 C GLU 387 C ? GLU 654 C 1 15.09 21 ALA 475 C . ? ALA 742 C SER 476 C ? SER 743 C 1 -17.16 22 ARG 732 C . ? ARG 999 C GLN 733 C ? GLN 1000 C 1 2.12 23 ASP 87 D . ? ASP 84 D GLY 88 D ? GLY 85 D 1 -9.82 24 PRO 90 D . ? PRO 87 D GLU 91 D ? GLU 88 D 1 -14.94 25 HIS 96 D . ? HIS 93 D GLY 97 D ? GLY 94 D 1 -17.39 26 ARG 117 D . ? ARG 114 D GLY 118 D ? GLY 115 D 1 13.04 27 GLY 118 D . ? GLY 115 D CYS 119 D ? CYS 116 D 1 13.36 28 GLY 134 D . ? GLY 131 D ASP 135 D ? ASP 132 D 1 0.83 29 ARG 151 D . ? ARG 148 D GLY 152 D ? GLY 149 D 1 -16.33 30 GLU 191 D . ? GLU 188 D PHE 192 D ? PHE 189 D 1 -5.73 31 LEU 245 D . ? LEU 242 D GLY 246 D ? GLY 243 D 1 4.59 32 ASN 339 D . ? ASN 336 D PRO 340 D ? PRO 337 D 1 2.98 33 PRO 342 D . ? PRO 339 D PRO 343 D ? PRO 340 D 1 -8.90 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 8 ? B ? 6 ? C ? 4 ? D ? 4 ? E ? 4 ? F ? 2 ? G ? 4 ? H ? 2 ? I ? 4 ? J ? 4 ? K ? 3 ? L ? 5 ? M ? 6 ? N ? 4 ? O ? 4 ? P ? 4 ? Q ? 4 ? R ? 2 ? S ? 4 ? T ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel A 6 7 ? anti-parallel A 7 8 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? parallel B 4 5 ? anti-parallel B 5 6 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel M 5 6 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 GLU A 270 ? GLN A 272 ? GLU A 537 GLN A 539 A 2 ARG A 441 ? VAL A 446 ? ARG A 708 VAL A 713 A 3 LEU A 449 ? GLY A 459 ? LEU A 716 GLY A 726 A 4 PHE A 344 ? MET A 355 ? PHE A 611 MET A 622 A 5 ALA A 372 ? ILE A 384 ? ALA A 639 ILE A 651 A 6 ARG A 408 ? PHE A 414 ? ARG A 675 PHE A 681 A 7 ILE A 305 ? ARG A 308 ? ILE A 572 ARG A 575 A 8 ILE A 287 ? ASP A 288 ? ILE A 554 ASP A 555 B 1 GLU A 270 ? GLN A 272 ? GLU A 537 GLN A 539 B 2 ARG A 441 ? VAL A 446 ? ARG A 708 VAL A 713 B 3 LEU A 449 ? GLY A 459 ? LEU A 716 GLY A 726 B 4 PHE A 344 ? MET A 355 ? PHE A 611 MET A 622 B 5 ALA A 372 ? ILE A 384 ? ALA A 639 ILE A 651 B 6 ILE A 393 ? GLN A 397 ? ILE A 660 GLN A 664 C 1 LEU B 6 ? LEU B 9 ? LEU B 3 LEU B 6 C 2 TYR B 346 ? SER B 352 ? TYR B 343 SER B 349 C 3 THR B 329 ? PRO B 335 ? THR B 326 PRO B 332 C 4 PHE B 321 ? GLY B 326 ? PHE B 318 GLY B 323 D 1 SER B 23 ? ASP B 26 ? SER B 20 ASP B 23 D 2 VAL B 31 ? PHE B 34 ? VAL B 28 PHE B 31 D 3 ILE B 48 ? LYS B 54 ? ILE B 45 LYS B 51 D 4 GLU B 57 ? ALA B 62 ? GLU B 54 ALA B 59 E 1 ALA B 79 ? PHE B 83 ? ALA B 76 PHE B 80 E 2 CYS B 92 ? HIS B 96 ? CYS B 89 HIS B 93 E 3 TYR B 110 ? ARG B 117 ? TYR B 107 ARG B 114 E 4 VAL B 123 ? GLU B 129 ? VAL B 120 GLU B 126 F 1 ARG B 99 ? THR B 100 ? ARG B 96 THR B 97 F 2 GLU B 104 ? LEU B 105 ? GLU B 101 LEU B 102 G 1 THR B 144 ? SER B 150 ? THR B 141 SER B 147 G 2 LYS B 153 ? PHE B 159 ? LYS B 150 PHE B 156 G 3 VAL B 185 ? ILE B 188 ? VAL B 182 ILE B 185 G 4 CYS B 195 ? HIS B 198 ? CYS B 192 HIS B 195 H 1 ARG B 162 ? TYR B 164 ? ARG B 159 TYR B 161 H 2 VAL B 178 ? ASP B 180 ? VAL B 175 ASP B 177 I 1 ALA B 212 ? ARG B 215 ? ALA B 209 ARG B 212 I 2 CYS B 218 ? PHE B 221 ? CYS B 215 PHE B 218 I 3 LEU B 236 ? GLU B 242 ? LEU B 233 GLU B 239 I 4 VAL B 249 ? LEU B 255 ? VAL B 246 LEU B 252 J 1 ALA B 266 ? SER B 267 ? ALA B 263 SER B 264 J 2 TYR B 274 ? ILE B 276 ? TYR B 271 ILE B 273 J 3 CYS B 290 ? LEU B 295 ? CYS B 287 LEU B 292 J 4 VAL B 300 ? ARG B 305 ? VAL B 297 ARG B 302 K 1 GLU C 270 ? GLN C 272 ? GLU C 537 GLN C 539 K 2 ARG C 441 ? VAL C 446 ? ARG C 708 VAL C 713 K 3 LEU C 449 ? PHE C 453 ? LEU C 716 PHE C 720 L 1 ILE C 287 ? ASP C 288 ? ILE C 554 ASP C 555 L 2 SER C 306 ? ARG C 308 ? SER C 573 ARG C 575 L 3 ARG C 408 ? MET C 413 ? ARG C 675 MET C 680 L 4 ALA C 372 ? ILE C 384 ? ALA C 639 ILE C 651 L 5 THR C 394 ? GLN C 397 ? THR C 661 GLN C 664 M 1 ILE C 287 ? ASP C 288 ? ILE C 554 ASP C 555 M 2 SER C 306 ? ARG C 308 ? SER C 573 ARG C 575 M 3 ARG C 408 ? MET C 413 ? ARG C 675 MET C 680 M 4 ALA C 372 ? ILE C 384 ? ALA C 639 ILE C 651 M 5 PHE C 344 ? MET C 355 ? PHE C 611 MET C 622 M 6 PHE C 455 ? GLY C 459 ? PHE C 722 GLY C 726 N 1 SER D 5 ? LEU D 9 ? SER D 2 LEU D 6 N 2 TYR D 346 ? SER D 352 ? TYR D 343 SER D 349 N 3 THR D 329 ? PRO D 335 ? THR D 326 PRO D 332 N 4 PHE D 321 ? GLY D 326 ? PHE D 318 GLY D 323 O 1 SER D 23 ? ASP D 26 ? SER D 20 ASP D 23 O 2 VAL D 31 ? PHE D 34 ? VAL D 28 PHE D 31 O 3 PHE D 49 ? LYS D 54 ? PHE D 46 LYS D 51 O 4 GLU D 57 ? ALA D 62 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' 14 1 L 1 L 14 all ? ? ? ? ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 3JBX _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 3JBX _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'Projection matching' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 1.23 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 1.23 _em_3d_reconstruction.resolution 3.4 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details '(Single particle details: Image processing was carried out using SAMUEL and Relion.) (Single particle--Applied symmetry: C2)' _em_3d_reconstruction.num_particles 63853 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name 'Polymix buffer' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details '150 mM NaCl, 20 mM HEPES, 5 mM MgCl2, 1 mM TCEP' # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 'Signal End Complex of RAG1-RAG2' COMPLEX 0 ? 'Dimer of RAG1-RAG2 binds to 12-RSS and 23-RSS products with HMGB1' ? 2 'Recombination Activating Gene 1 and 2' ? 1 ? ? ? 3 'Recombination Activating Gene 2' ? 1 ? ? ? # _em_image_scans.entry_id 3JBX _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 650 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 3JBX _em_imaging.id 1 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2015-03-09 _em_imaging.temperature 100 _em_imaging.microscope_model 'FEI POLARA 300' _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.0 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 31000 _em_imaging.calibrated_magnification 40607 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'GATAN LIQUID NITROGEN' _em_imaging.recording_temperature_minimum 80 _em_imaging.recording_temperature_maximum 105 _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.astigmatism 'Objective lens astigmatism was corrected at 150,000 times magnification.' _em_imaging.citation_id ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details '400 mesh Quantifoil holey carbon grid, glow discharged' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 3JBX _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details 'Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (GATAN CRYOPLUNGE 3).' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 85 _em_vitrification.temp 120 _em_vitrification.instrument 'GATAN CRYOPLUNGE 3' _em_vitrification.method 'Blot for 2.5 seconds before plunging.' _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3JBX _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3JBX _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A GLY 268 ? A GLY 1 2 1 Y 1 A GLY 269 ? A GLY 2 3 1 Y 1 A SER 270 ? A SER 3 4 1 Y 1 A ARG 271 ? A ARG 4 5 1 Y 1 A CYS 272 ? A CYS 5 6 1 Y 1 A GLN 273 ? A GLN 6 7 1 Y 1 A ARG 274 ? A ARG 7 8 1 Y 1 A ASP 275 ? A ASP 8 9 1 Y 1 A HIS 276 ? A HIS 9 10 1 Y 1 A LEU 277 ? A LEU 10 11 1 Y 1 A SER 278 ? A SER 11 12 1 Y 1 A THR 279 ? A THR 12 13 1 Y 1 A LYS 280 ? A LYS 13 14 1 Y 1 A LEU 281 ? A LEU 14 15 1 Y 1 A ILE 282 ? A ILE 15 16 1 Y 1 A PRO 283 ? A PRO 16 17 1 Y 1 A THR 284 ? A THR 17 18 1 Y 1 A GLU 285 ? A GLU 18 19 1 Y 1 A VAL 286 ? A VAL 19 20 1 Y 1 A PRO 287 ? A PRO 20 21 1 Y 1 A ALA 288 ? A ALA 21 22 1 Y 1 A ASP 289 ? A ASP 22 23 1 Y 1 A LEU 290 ? A LEU 23 24 1 Y 1 A ILE 291 ? A ILE 24 25 1 Y 1 A ARG 292 ? A ARG 25 26 1 Y 1 A ALA 293 ? A ALA 26 27 1 Y 1 A VAL 294 ? A VAL 27 28 1 Y 1 A THR 295 ? A THR 28 29 1 Y 1 A CYS 296 ? A CYS 29 30 1 Y 1 A GLN 297 ? A GLN 30 31 1 Y 1 A VAL 298 ? A VAL 31 32 1 Y 1 A CYS 299 ? A CYS 32 33 1 Y 1 A ASP 300 ? A ASP 33 34 1 Y 1 A HIS 301 ? A HIS 34 35 1 Y 1 A LEU 302 ? A LEU 35 36 1 Y 1 A LEU 303 ? A LEU 36 37 1 Y 1 A SER 304 ? A SER 37 38 1 Y 1 A ASP 305 ? A ASP 38 39 1 Y 1 A PRO 306 ? A PRO 39 40 1 Y 1 A VAL 307 ? A VAL 40 41 1 Y 1 A GLN 308 ? A GLN 41 42 1 Y 1 A SER 309 ? A SER 42 43 1 Y 1 A PRO 310 ? A PRO 43 44 1 Y 1 A CYS 311 ? A CYS 44 45 1 Y 1 A ARG 312 ? A ARG 45 46 1 Y 1 A HIS 313 ? A HIS 46 47 1 Y 1 A LEU 314 ? A LEU 47 48 1 Y 1 A PHE 315 ? A PHE 48 49 1 Y 1 A CYS 316 ? A CYS 49 50 1 Y 1 A ARG 317 ? A ARG 50 51 1 Y 1 A LEU 318 ? A LEU 51 52 1 Y 1 A CYS 319 ? A CYS 52 53 1 Y 1 A ILE 320 ? A ILE 53 54 1 Y 1 A ILE 321 ? A ILE 54 55 1 Y 1 A ARG 322 ? A ARG 55 56 1 Y 1 A TYR 323 ? A TYR 56 57 1 Y 1 A THR 324 ? A THR 57 58 1 Y 1 A HIS 325 ? A HIS 58 59 1 Y 1 A ALA 326 ? A ALA 59 60 1 Y 1 A LEU 327 ? A LEU 60 61 1 Y 1 A GLY 328 ? A GLY 61 62 1 Y 1 A PRO 329 ? A PRO 62 63 1 Y 1 A ASN 330 ? A ASN 63 64 1 Y 1 A CYS 331 ? A CYS 64 65 1 Y 1 A PRO 332 ? A PRO 65 66 1 Y 1 A THR 333 ? A THR 66 67 1 Y 1 A CYS 334 ? A CYS 67 68 1 Y 1 A ASN 335 ? A ASN 68 69 1 Y 1 A GLN 336 ? A GLN 69 70 1 Y 1 A HIS 337 ? A HIS 70 71 1 Y 1 A LEU 338 ? A LEU 71 72 1 Y 1 A ASN 339 ? A ASN 72 73 1 Y 1 A PRO 340 ? A PRO 73 74 1 Y 1 A SER 341 ? A SER 74 75 1 Y 1 A HIS 342 ? A HIS 75 76 1 Y 1 A LEU 343 ? A LEU 76 77 1 Y 1 A ILE 344 ? A ILE 77 78 1 Y 1 A LYS 345 ? A LYS 78 79 1 Y 1 A PRO 346 ? A PRO 79 80 1 Y 1 A ALA 347 ? A ALA 80 81 1 Y 1 A LYS 348 ? A LYS 81 82 1 Y 1 A PHE 349 ? A PHE 82 83 1 Y 1 A PHE 350 ? A PHE 83 84 1 Y 1 A LEU 351 ? A LEU 84 85 1 Y 1 A ALA 352 ? A ALA 85 86 1 Y 1 A THR 353 ? A THR 86 87 1 Y 1 A LEU 354 ? A LEU 87 88 1 Y 1 A SER 355 ? A SER 88 89 1 Y 1 A SER 356 ? A SER 89 90 1 Y 1 A LEU 357 ? A LEU 90 91 1 Y 1 A PRO 358 ? A PRO 91 92 1 Y 1 A LEU 359 ? A LEU 92 93 1 Y 1 A LEU 360 ? A LEU 93 94 1 Y 1 A CYS 361 ? A CYS 94 95 1 Y 1 A PRO 362 ? A PRO 95 96 1 Y 1 A SER 363 ? A SER 96 97 1 Y 1 A GLU 364 ? A GLU 97 98 1 Y 1 A GLU 365 ? A GLU 98 99 1 Y 1 A CYS 366 ? A CYS 99 100 1 Y 1 A SER 367 ? A SER 100 101 1 Y 1 A ASP 368 ? A ASP 101 102 1 Y 1 A TRP 369 ? A TRP 102 103 1 Y 1 A VAL 370 ? A VAL 103 104 1 Y 1 A ARG 371 ? A ARG 104 105 1 Y 1 A LEU 372 ? A LEU 105 106 1 Y 1 A ASP 373 ? A ASP 106 107 1 Y 1 A SER 374 ? A SER 107 108 1 Y 1 A PHE 375 ? A PHE 108 109 1 Y 1 A ARG 376 ? A ARG 109 110 1 Y 1 A GLU 377 ? A GLU 110 111 1 Y 1 A HIS 378 ? A HIS 111 112 1 Y 1 A CYS 379 ? A CYS 112 113 1 Y 1 A LEU 380 ? A LEU 113 114 1 Y 1 A ASN 381 ? A ASN 114 115 1 Y 1 A HIS 382 ? A HIS 115 116 1 Y 1 A TYR 383 ? A TYR 116 117 1 Y 1 A ARG 384 ? A ARG 117 118 1 Y 1 A GLU 385 ? A GLU 118 119 1 Y 1 A LYS 386 ? A LYS 119 120 1 Y 1 A GLU 387 ? A GLU 120 121 1 Y 1 A SER 388 ? A SER 121 122 1 Y 1 A GLN 389 ? A GLN 122 123 1 Y 1 A GLU 390 ? A GLU 123 124 1 Y 1 A GLU 391 ? A GLU 124 125 1 Y 1 A GLN 392 ? A GLN 125 126 1 Y 1 A THR 393 ? A THR 126 127 1 Y 1 A PRO 394 ? A PRO 127 128 1 Y 1 A SER 395 ? A SER 128 129 1 Y 1 A GLU 396 ? A GLU 129 130 1 Y 1 A GLN 397 ? A GLN 130 131 1 Y 1 A ASN 398 ? A ASN 131 132 1 Y 1 A LEU 399 ? A LEU 132 133 1 Y 1 A ASP 400 ? A ASP 133 134 1 Y 1 A GLY 401 ? A GLY 134 135 1 Y 1 A TYR 402 ? A TYR 135 136 1 Y 1 A LEU 403 ? A LEU 136 137 1 Y 1 A PRO 404 ? A PRO 137 138 1 Y 1 A VAL 405 ? A VAL 138 139 1 Y 1 A ASN 406 ? A ASN 139 140 1 Y 1 A LYS 407 ? A LYS 140 141 1 Y 1 A GLY 408 ? A GLY 141 142 1 Y 1 A GLY 409 ? A GLY 142 143 1 Y 1 A ARG 410 ? A ARG 143 144 1 Y 1 A PRO 411 ? A PRO 144 145 1 Y 1 A ARG 412 ? A ARG 145 146 1 Y 1 A GLN 413 ? A GLN 146 147 1 Y 1 A HIS 414 ? A HIS 147 148 1 Y 1 A LEU 415 ? A LEU 148 149 1 Y 1 A LEU 416 ? A LEU 149 150 1 Y 1 A SER 417 ? A SER 150 151 1 Y 1 A LEU 418 ? A LEU 151 152 1 Y 1 A THR 419 ? A THR 152 153 1 Y 1 A ARG 420 ? A ARG 153 154 1 Y 1 A ARG 421 ? A ARG 154 155 1 Y 1 A ALA 422 ? A ALA 155 156 1 Y 1 A GLN 423 ? A GLN 156 157 1 Y 1 A LYS 424 ? A LYS 157 158 1 Y 1 A HIS 425 ? A HIS 158 159 1 Y 1 A ARG 426 ? A ARG 159 160 1 Y 1 A LEU 427 ? A LEU 160 161 1 Y 1 A ARG 428 ? A ARG 161 162 1 Y 1 A ASP 429 ? 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