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N VAL D 31 E 2 3 N GLU D 30 ? N GLU D 30 O ASN D 63 ? O ASN D 63 E 3 4 N ILE D 62 ? N ILE D 62 O VAL D 136 ? O VAL D 136 E 4 5 O CYS D 135 ? O CYS D 135 N THR D 132 ? N THR D 132 E 5 6 O VAL D 127 ? O VAL D 127 N LEU D 110 ? N LEU D 110 E 6 7 O PHE D 107 ? O PHE D 107 N GLU D 100 ? N GLU D 100 F 1 2 O PHE E 42 ? O PHE E 42 N VAL E 31 ? N VAL E 31 F 2 3 N GLU E 30 ? N GLU E 30 O ASN E 63 ? O ASN E 63 F 3 4 N THR E 60 ? N THR E 60 O VAL E 136 ? O VAL E 136 G 1 2 N GLU E 100 ? N GLU E 100 O PHE E 107 ? O PHE E 107 G 2 3 N LEU E 110 ? N LEU E 110 O VAL E 127 ? O VAL E 127 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 GLU A 25 ? ? -96.79 -72.51 2 1 TYR A 34 ? ? -128.89 -169.48 3 1 SER A 35 ? ? -152.96 -158.66 4 1 GLU A 37 ? ? -134.96 -69.58 5 1 HIS A 120 ? ? -64.20 94.64 6 1 LYS A 133 ? ? 55.29 -102.49 7 1 ARG A 165 ? ? -81.88 -153.67 8 1 ARG A 202 ? ? 32.18 67.06 9 1 GLU A 206 ? ? 70.04 -4.28 10 1 ASP A 238 ? ? -119.13 -103.02 11 1 VAL A 239 ? ? 50.77 71.34 12 1 GLU A 244 ? ? -110.93 -161.93 13 1 GLU A 246 ? ? -126.46 -50.27 14 1 TRP A 325 ? ? 38.13 72.11 15 1 LYS A 346 ? ? 65.31 -13.92 16 1 GLU B 25 ? ? -98.54 -73.48 17 1 SER B 35 ? ? -123.96 -154.31 18 1 GLU B 37 ? ? -130.20 -62.74 19 1 ASN B 104 ? ? -120.13 -57.94 20 1 ASN B 118 ? ? -63.62 -71.52 21 1 HIS B 120 ? ? -67.03 98.42 22 1 LYS B 133 ? ? 54.07 -109.44 23 1 ARG B 165 ? ? -79.47 -156.20 24 1 LEU B 200 ? ? -71.95 -74.77 25 1 ARG B 202 ? ? 57.45 85.49 26 1 GLU B 206 ? ? 68.85 -7.62 27 1 ASP B 238 ? ? -128.77 -99.85 28 1 VAL B 239 ? ? 50.32 71.05 29 1 LYS B 245 ? ? 65.49 -27.09 30 1 GLU B 246 ? ? -71.02 -70.51 31 1 LYS B 346 ? ? 56.09 72.75 32 1 GLU C 25 ? ? -98.65 -68.37 33 1 SER C 35 ? ? -151.20 -157.95 34 1 GLU C 37 ? ? -132.99 -60.85 35 1 GLU C 38 ? ? -107.14 -169.61 36 1 PHE C 102 ? ? -128.45 -155.37 37 1 ASN C 104 ? ? -131.38 -59.25 38 1 LYS C 133 ? ? 53.30 -109.67 39 1 ARG C 202 ? ? 31.23 69.83 40 1 GLU C 206 ? ? 71.11 -7.08 41 1 ASP C 238 ? ? -133.60 -86.06 42 1 VAL C 239 ? ? 50.94 75.24 43 1 GLU C 244 ? ? -122.66 -165.45 44 1 THR C 247 ? ? 66.20 -13.27 45 1 TRP C 323 ? ? -89.01 -151.41 46 1 TRP C 325 ? ? 54.23 71.21 47 1 PHE C 345 ? ? -79.15 -166.01 48 1 GLU D 37 ? ? -121.97 -66.47 49 1 ASN D 104 ? ? -122.82 -51.14 50 1 ASN D 118 ? ? 58.21 19.54 51 1 LYS D 133 ? ? 53.82 -114.83 52 1 ARG D 165 ? ? -86.73 -159.91 53 1 ARG D 202 ? ? 30.60 67.61 54 1 ASP D 238 ? ? -114.79 -83.08 55 1 VAL D 239 ? ? 27.76 68.72 56 1 PRO D 249 ? ? -54.44 -4.29 57 1 PHE D 315 ? ? -130.15 -156.09 58 1 GLU D 316 ? ? -83.79 -75.46 59 1 GLU E 25 ? ? -92.51 -81.37 60 1 SER E 35 ? ? -123.53 -150.52 61 1 GLU E 37 ? ? -131.86 -60.46 62 1 ASN E 104 ? ? -122.85 -59.35 63 1 LYS E 133 ? ? 53.84 -104.32 64 1 PRO E 203 ? ? -78.67 49.08 65 1 GLU E 206 ? ? -128.13 -62.55 66 1 ASP E 238 ? ? -131.72 -79.96 67 1 VAL E 239 ? ? 25.64 69.24 68 1 LYS E 245 ? ? 76.12 -0.75 69 1 GLU E 246 ? ? -129.64 -68.23 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 3JCG _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 3JCG _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method RELION _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 1.352 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 1.352 _em_3d_reconstruction.resolution 7.06 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ;Final maps were calculated from two merged datasets. (Single particle details: The particles were selected using an automatic selection program. 3D classification, 3D refinement, and postprocessing were done using RELION 1.3.) (Single particle--Applied symmetry: C1) ; _em_3d_reconstruction.num_particles 26271 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '50 mM HEPES, pH 7.3, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 0.5 mM DDM' _em_buffer.pH 7.3 _em_buffer.details '50 mM HEPES, pH 7.3, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 0.5 mM DDM' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'CorA from Thermotoga maritima in the absence of magnesium, state I' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym CorA _em_entity_assembly.details 'One homopentamer of CorA' _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 3JCG _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 2498 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 3JCG _em_imaging.id 1 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2014-10-15 _em_imaging.temperature 79.7 _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.nominal_defocus_min 890 _em_imaging.nominal_defocus_max 2700 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.calibrated_magnification 105000 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details 'Parallel beam illumination' _em_imaging.specimen_holder_type 'Liquid nitrogen-cooled' _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.recording_temperature_minimum 79.6 _em_imaging.recording_temperature_maximum 79.8 _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params 5 _em_imaging.astigmatism 'Objective lens astigmatism was corrected at 105,000 times magnification.' _em_imaging.citation_id ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details '300 mesh Cu R1.2/1.3 holey carbon grids from Quantifoil, plasma-cleaned' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 3JCG _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details 'Grids were blotted at 4 degrees Celsius for 7 seconds after a 10-second pre-blotting period, then plunge-frozen in liquid ethane.' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 86 _em_vitrification.temp 90 _em_vitrification.instrument 'LEICA EM GP' _em_vitrification.method 'Grids were blotted at 4 degrees Celsius for 7 seconds after a 10-second pre-blotting period, then plunge-frozen in liquid ethane.' _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3JCG _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3JCG _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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