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Pig 'Sus scrofa' 9823 ? ? ? medula ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP AT1A1_PIG P05024 1 ;AKKERDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSRGLTPARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSMLLW IGAILCFLAYGIQAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSINAEEV VVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRT VMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLT LTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWSDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLALSRIA GLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYTKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTAEPRHLL VMKGAPERILDRCSSILIHGKEQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPLDNLCF VGLISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAKACVV HGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPASKKADIGVAMGIAGSDVSKQA ADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYE QAESDIMKRQPRNPKTDKLVNEQLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVNWDDRWINDVEDSYGQQ WTYEQRKIVEFTCHTPFFVTIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKP TWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKETYY ; 24 ? 2 UNP AT1B1_PIG P05027 2 ;NSEKKEFLGRTGGSWFKILLFYVIFYGCLAGIFIGTIQVMLLTISEFKPTYQDRVAPPGLTQIPQSQKTEISFRPNDPQS YESYVVSIVRFLEKYKDLAQKDDMIFEDCGNVPSELKERGEYNNERGERKVCRFRLEWLGNCSGLNDETYGYKDGKPCVI IKLNRVLGFKPKPPKNESLETYPVMKYNPYVLPVHCTGKRDEDKEKVGTMEYFGLGGYPGFPLQYYPYYGKLLQPKYLQP LMAVQFTNLTMDTEIRIECKAYGENIGYSEKDRFQGRFDVKIEVKS ; 18 ? 3 UNP Q58K79_PIG Q58K79 3 YETVRNGGLIFAALAFIVGLIIILSKR 23 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3KDP A 1 ? 998 ? 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UNP Q58K79 ILE 45 CONFLICT 45 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CLR non-polymer . CHOLESTEROL ? 'C27 H46 O' 386.654 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MF4 non-polymer . 'TETRAFLUOROMAGNESATE(2-)' MAGNESIUMTETRAFLUORIDE 'F4 Mg -2' 100.299 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 RB non-polymer . 'RUBIDIUM ION' ? 'Rb 1' 85.468 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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_diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.078 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SLS BEAMLINE X06SA' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X06SA _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.078 # _reflns.entry_id 3KDP _reflns.observed_criterion_sigma_I 1.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F 1.0 _reflns.d_resolution_low 48 _reflns.d_resolution_high 3.5 _reflns.number_obs 77431 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 99.8 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.258 _reflns.pdbx_Rsym_value 0.258 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 13.8 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 13.8 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? 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'X-RAY DIFFRACTION' . 7.7657 38.8600 7303 0.2281 100.00 0.2658 . . 140 . . . . # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 ? 1 2 ? 1 1 ? 2 2 ? 2 1 ? 3 2 ? 3 1 ? 4 2 ? 4 1 ? 5 2 ? 5 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'chain A and (resseq 19:80 or resseq 154:274 or resseq 344:382 or resseq 592:765 or resseq 2001:2002 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'chain C and (resseq 19:80 or resseq 154:274 or resseq 344:382 or resseq 592:765 or resseq 2001:2002 )' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain A and (resseq 383:591 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain C and (resseq 383:591 )' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'chain A and (resseq 766:1016 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'chain C and (resseq 766:1016 )' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'chain B and (resseq 18:303 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'chain D and (resseq 18:303 )' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 'chain G and (resseq 23:49 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 'chain H and (resseq 23:49 )' # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? # _struct.entry_id 3KDP _struct.title 'Crystal structure of the sodium-potassium pump' _struct.pdbx_descriptor ;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 (E.C.3.6.3.9), Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, Na+/K+ ATPase gamma subunit transcript variant a ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3KDP _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE _struct_keywords.text ;alpha helical, heterotrimeric membrane protein complex, ATP-binding, Hydrolase, Ion transport, Magnesium, Membrane, Metal-binding, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Potassium, Potassium transport, Sodium transport, Sodium/potassium transport, Transmembrane, Transport, Disulfide bond, Glycoprotein, Signal-anchor ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 6 ? J N N 6 ? K N N 6 ? L N N 7 ? M N N 4 ? N N N 5 ? O N N 6 ? P N N 6 ? Q N N 6 ? R N N 7 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LYS A 3 ? ASP A 8 ? LYS A 21 ASP A 26 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 GLU A 9 ? GLU A 13 ? GLU A 27 GLU A 31 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 SER A 22 ? LYS A 29 ? 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SER A 687 GLN A 701 1 ? 15 HELX_P HELX_P32 32 ASP A 696 ? LYS A 701 ? ASP A 714 LYS A 719 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 33 SER A 714 ? ALA A 720 ? SER A 732 ALA A 738 1 ? 7 HELX_P HELX_P34 34 ALA A 731 ? SER A 757 ? ALA A 749 SER A 775 1 ? 27 HELX_P HELX_P35 35 ASN A 758 ? ALA A 771 ? ASN A 776 ALA A 789 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 36 GLY A 778 ? LEU A 783 ? GLY A 796 LEU A 801 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 37 ASP A 790 ? SER A 796 ? ASP A 808 SER A 814 1 ? 7 HELX_P HELX_P38 38 LEU A 797 ? GLU A 800 ? LEU A 815 GLU A 818 5 ? 4 HELX_P HELX_P39 39 ASP A 805 ? ARG A 809 ? ASP A 823 ARG A 827 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 40 ASN A 821 ? TYR A 829 ? ASN A 839 TYR A 847 1 ? 9 HELX_P HELX_P41 41 GLN A 831 ? GLU A 850 ? GLN A 849 GLU A 868 1 ? 20 HELX_P HELX_P42 42 LEU A 854 ? GLY A 860 ? LEU A 872 GLY A 878 5 ? 7 HELX_P HELX_P43 43 LEU A 861 ? ASP A 866 ? LEU A 879 ASP A 884 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 44 THR A 882 ? VAL A 910 ? THR A 900 VAL A 928 1 ? 29 HELX_P HELX_P45 45 SER A 918 ? GLY A 923 ? 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TYR H 23 LEU H 46 1 ? 24 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? B CYS 109 SG ? ? ? 1_555 B CYS 132 SG ? ? B CYS 126 B CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf2 disulf ? ? B CYS 142 SG ? ? ? 1_555 B CYS 158 SG ? ? B CYS 159 B CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? disulf3 disulf ? ? B CYS 196 SG ? ? ? 1_555 B CYS 259 SG ? ? B CYS 213 B CYS 276 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf4 disulf ? ? E CYS 109 SG ? ? ? 1_555 E CYS 132 SG ? ? D CYS 126 D CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf5 disulf ? ? E CYS 142 SG ? ? ? 1_555 E CYS 158 SG ? ? D CYS 159 D CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf6 disulf ? ? E CYS 196 SG ? ? ? 1_555 E CYS 259 SG ? ? D CYS 213 D CYS 276 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc1 metalc ? ? D ASP 692 OD2 ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? C ASP 710 C MG 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc2 metalc ? ? A ASP 692 OD2 ? ? ? 1_555 H MG . MG ? ? A ASP 710 A MG 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc3 metalc ? ? D THR 353 O ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? C THR 371 C MG 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc4 metalc ? ? 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D ASP 786 OD2 ? ? ? 1_555 O RB . RB ? ? C ASP 804 C RB 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? metalc14 metalc ? ? D SER 757 OG ? ? ? 1_555 O RB . RB ? ? C SER 775 C RB 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.900 ? metalc15 metalc ? ? A SER 757 OG ? ? ? 1_555 I RB . RB ? ? A SER 775 A RB 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc16 metalc ? ? A ASN 758 OD1 ? ? ? 1_555 I RB . RB ? ? A ASN 776 A RB 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.940 ? metalc17 metalc ? ? D ASP 351 OD1 ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? C ASP 369 C MG 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.990 ? metalc18 metalc ? ? A ASP 786 OD2 ? ? ? 1_555 J RB . RB ? ? A ASP 804 A RB 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.036 ? metalc19 metalc ? ? A VAL 304 O ? ? ? 1_555 J RB . RB ? ? A VAL 322 A RB 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.055 ? metalc20 metalc ? ? A GLU 309 OE1 ? ? ? 1_555 J RB . RB ? ? A GLU 327 A RB 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.093 ? metalc21 metalc ? ? A VAL 307 O ? ? ? 1_555 J RB . RB ? ? A VAL 325 A RB 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.095 ? metalc22 metalc ? ? D VAL 304 O ? ? ? 1_555 P RB . RB ? ? C VAL 322 C RB 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.147 ? metalc23 metalc ? ? D GLU 761 OE2 ? ? ? 1_555 O RB . RB ? ? C GLU 779 C RB 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.186 ? metalc24 metalc ? ? A GLU 761 OE2 ? ? ? 1_555 J RB . RB ? ? A GLU 779 A RB 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.188 ? metalc25 metalc ? ? A GLU 761 OE2 ? ? ? 1_555 I RB . RB ? ? A GLU 779 A RB 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.192 ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ALA 474 A . ? ALA 492 A GLU 475 A ? GLU 493 A 1 6.17 2 LYS 4 B . ? LYS 21 B LYS 5 B ? LYS 22 B 1 2.54 3 SER 14 B . ? SER 31 B TRP 15 B ? 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