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'X-RAY DIFFRACTION' . # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? -0.474252 0.869131 -0.140345 -0.847760 -0.493832 -0.193475 -0.237461 0.027223 0.971015 25.908501 103.467003 9.307340 2 given ? -0.494056 -0.840801 -0.221273 0.857896 -0.512767 0.032931 -0.141150 -0.173560 0.974656 102.459000 29.799101 13.913900 # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 A 1 2 B 1 3 C # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 A PRO 8 . A ILE 332 . A PRO 10 A ILE 334 ? 'chain A' 1 2 1 B LYS 6 . B ILE 332 . B LYS 8 B ILE 334 ? 'chain B' 1 3 1 C PRO 8 . C VAL 23 . C PRO 10 C VAL 25 ? 'chain C and not resid 334' # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _struct.entry_id 3ME1 _struct.title 'Crystal Structure of the Desulfovibro vulgaris Urea Transporter in the P3(1) Space Group at 3.86' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3ME1 _struct_keywords.text ;Membrane protein, channel, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, New York Consortium on Membrane Protein Structure, NYCOMPS, TRANSPORT PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code Q72CX3_DESVH _struct_ref.pdbx_db_accession Q72CX3 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;GEQLLKNPLIEFCDSVCRGCGQVMFQNNTVTGLLFFAGIFYNSTTLGVCAVLGTAASTLTAQLLGVDKPLVRAGLFGFNG TLAGIALPFFFNYEPAMLGYVALNGAFTTIIMASLLNFLGKWGVPALTAPFVLATWLLMFGVYKLSLFHPGALIAPALPS VAGLADMGTVTGRTFMEGLFKGVGEVMFQDNIVTGVIFVVAILVNSRISALFAVIGSLVGLCTALIMHSPETPVRLGLYG FNSVLCGIAMGGIFFYLNIRTFLYALGCMVLGAIATGAFSVLLSPIGMPALTWPFIVVTWLFLFAGSMFRNIAQVPTEKA GTPEDNLRSLAIGSR ; _struct_ref.pdbx_align_begin 3 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3ME1 A 1 ? 335 ? Q72CX3 3 ? 337 ? 3 337 2 1 3ME1 B 1 ? 335 ? Q72CX3 3 ? 337 ? 3 337 3 1 3ME1 C 1 ? 335 ? Q72CX3 3 ? 337 ? 3 337 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'The biological assembly is the asymmetric unit.' # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 PRO A 8 ? 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ILE A 261 LEU A 285 1 ? 25 HELX_P HELX_P16 16 THR A 292 ? SER A 307 ? THR A 294 SER A 309 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 17 PRO A 316 ? ALA A 320 ? PRO A 318 ALA A 322 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 18 GLU A 324 ? SER A 329 ? GLU A 326 SER A 331 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 19 ASN B 7 ? GLN B 22 ? ASN B 9 GLN B 24 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 20 VAL B 23 ? PHE B 25 ? VAL B 25 PHE B 27 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 21 ASN B 28 ? TYR B 41 ? ASN B 30 TYR B 43 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 22 SER B 43 ? LEU B 64 ? SER B 45 LEU B 66 1 ? 22 HELX_P HELX_P23 23 ASP B 67 ? ALA B 73 ? ASP B 69 ALA B 75 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 24 GLY B 77 ? PHE B 90 ? GLY B 79 PHE B 92 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 25 ALA B 96 ? LYS B 121 ? ALA B 98 LYS B 123 1 ? 26 HELX_P HELX_P26 26 THR B 128 ? GLY B 141 ? THR B 130 GLY B 143 1 ? 14 HELX_P HELX_P27 27 VAL B 142 ? LEU B 145 ? VAL B 144 LEU B 147 5 ? 4 HELX_P HELX_P28 28 THR B 171 ? VAL B 186 ? THR B 173 VAL B 188 1 ? 16 HELX_P HELX_P29 29 ASN B 191 ? SER B 206 ? ASN B 193 SER B 208 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 30 SER B 206 ? MET B 227 ? SER B 208 MET B 229 1 ? 22 HELX_P HELX_P31 31 PRO B 230 ? GLY B 237 ? PRO B 232 GLY B 239 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 32 GLY B 240 ? MET B 250 ? GLY B 242 MET B 252 1 ? 11 HELX_P HELX_P33 33 ILE B 259 ? LEU B 283 ? ILE B 261 LEU B 285 1 ? 25 HELX_P HELX_P34 34 THR B 292 ? SER B 307 ? THR B 294 SER B 309 1 ? 16 HELX_P HELX_P35 35 PRO B 316 ? ALA B 320 ? PRO B 318 ALA B 322 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 36 GLU B 324 ? SER B 329 ? GLU B 326 SER B 331 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 37 PRO C 8 ? GLN C 22 ? PRO C 10 GLN C 24 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 38 VAL C 23 ? PHE C 25 ? VAL C 25 PHE C 27 5 ? 3 HELX_P HELX_P39 39 ASN C 28 ? PHE C 40 ? ASN C 30 PHE C 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P40 40 SER C 43 ? LEU C 64 ? SER C 45 LEU C 66 1 ? 22 HELX_P HELX_P41 41 ASP C 67 ? ALA C 73 ? ASP C 69 ALA C 75 1 ? 7 HELX_P HELX_P42 42 GLY C 77 ? PHE C 90 ? GLY C 79 PHE C 92 1 ? 14 HELX_P HELX_P43 43 PRO C 95 ? LYS C 121 ? 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GLU C 326 ILE C 334 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 C A ALA 131 ? ? N A PRO 132 ? ? CA A PRO 132 ? ? 108.34 119.30 -10.96 1.50 Y 2 1 C B ALA 131 ? ? N B PRO 132 ? ? CA B PRO 132 ? ? 108.24 119.30 -11.06 1.50 Y 3 1 C C ALA 131 ? ? N C PRO 132 ? ? 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? -53.66 109.31 53 1 ASN B 260 ? ? -152.78 -158.14 54 1 LEU B 293 ? ? 63.21 -157.89 55 1 THR B 301 ? ? -56.43 -78.85 56 1 SER C 45 ? ? -172.14 112.77 57 1 PHE C 80 ? ? -53.28 -76.22 58 1 PHE C 91 ? ? -55.76 -83.28 59 1 LEU C 118 ? ? -56.32 -71.41 60 1 PHE C 120 ? ? -58.92 -75.35 61 1 LYS C 123 ? ? -65.17 15.72 62 1 TRP C 124 ? ? -148.78 -0.37 63 1 LEU C 129 ? ? 68.36 -176.32 64 1 VAL C 134 ? ? -64.38 -81.09 65 1 LEU C 135 ? ? -33.56 -31.07 66 1 ALA C 136 ? ? -67.95 -79.41 67 1 SER C 148 ? ? -68.85 14.71 68 1 ALA C 157 ? ? -166.95 107.62 69 1 ALA C 159 ? ? -175.99 135.16 70 1 ASP C 192 ? ? -87.23 45.51 71 1 SER C 208 ? ? -170.40 130.15 72 1 MET C 229 ? ? -69.92 2.59 73 1 HIS C 230 ? ? 65.67 79.25 74 1 PRO C 232 ? ? -59.57 108.93 75 1 GLU C 233 ? ? -58.09 13.77 76 1 THR C 234 ? ? -78.46 -71.48 77 1 TYR C 241 ? ? -82.02 31.27 78 1 PHE C 243 ? ? -53.84 -75.14 79 1 TYR C 258 ? ? -54.25 109.09 80 1 ASN C 260 ? ? -153.25 -158.42 81 1 LEU C 293 ? ? 62.78 -157.31 82 1 THR C 301 ? ? -55.97 -78.39 # _pdbx_SG_project.id 1 _pdbx_SG_project.project_name 'PSI, Protein Structure Initiative' _pdbx_SG_project.full_name_of_center 'New York Consortium on Membrane Protein Structure' _pdbx_SG_project.initial_of_center NYCOMPS # loop_ _pdbx_refine_tls.pdbx_refine_id _pdbx_refine_tls.id _pdbx_refine_tls.details _pdbx_refine_tls.method _pdbx_refine_tls.origin_x _pdbx_refine_tls.origin_y _pdbx_refine_tls.origin_z _pdbx_refine_tls.T[1][1] _pdbx_refine_tls.T[2][2] _pdbx_refine_tls.T[3][3] _pdbx_refine_tls.T[1][2] _pdbx_refine_tls.T[1][3] _pdbx_refine_tls.T[2][3] _pdbx_refine_tls.L[1][1] _pdbx_refine_tls.L[2][2] _pdbx_refine_tls.L[3][3] _pdbx_refine_tls.L[1][2] _pdbx_refine_tls.L[1][3] _pdbx_refine_tls.L[2][3] _pdbx_refine_tls.S[1][1] _pdbx_refine_tls.S[2][2] _pdbx_refine_tls.S[3][3] _pdbx_refine_tls.S[1][2] _pdbx_refine_tls.S[1][3] _pdbx_refine_tls.S[2][3] _pdbx_refine_tls.S[2][1] _pdbx_refine_tls.S[3][1] _pdbx_refine_tls.S[3][2] 'X-RAY DIFFRACTION' 1 ? 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