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_diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.918 # _reflns.entry_id 3OPY _reflns.observed_criterion_sigma_I 1.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F 1.0 _reflns.d_resolution_low 29.8 _reflns.d_resolution_high 3.05 _reflns.number_obs 262877 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 53.2 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate 75.78 _reflns.pdbx_redundancy 97.5 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 3OPY _refine.ls_number_reflns_obs 255838 _refine.ls_number_reflns_all 617625 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 29.8 _refine.ls_d_res_high 3.05 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs 0.2019 _refine.ls_R_factor_all 0.247 _refine.ls_R_factor_R_work 0.2003 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2318 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.03 _refine.ls_number_reflns_R_free 12864 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.8802 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.8458 _refine.B_iso_mean 68.17 _refine.aniso_B[1][1] -13.4997 _refine.aniso_B[2][2] 9.7517 _refine.aniso_B[3][3] 3.7480 _refine.aniso_B[1][2] 0.0000 _refine.aniso_B[1][3] -1.0224 _refine.aniso_B[2][3] 0.0000 _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'Engh & Huber' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_analyze.entry_id 3OPY _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_obs 0.529 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_obs ? _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_obs ? _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_free ? _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_free ? _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_free ? _refine_analyze.number_disordered_residues ? _refine_analyze.occupancy_sum_hydrogen ? _refine_analyze.occupancy_sum_non_hydrogen ? _refine_analyze.pdbx_Luzzati_d_res_high_obs ? _refine_analyze.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 64576 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 449 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 65025 _refine_hist.d_res_high 3.05 _refine_hist.d_res_low 29.8 # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'X-RAY DIFFRACTION' t_dihedral_angle_d 22308 ? ? 2.000 SINUSOIDAL 'X-RAY DIFFRACTION' t_trig_c_planes 1608 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' t_improper_torsion 16 ? ? 0.000 HARMONIC 'X-RAY DIFFRACTION' t_pseud_angle ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' t_chiral_improper_torsion 8988 ? ? 5.000 SEMIHARMONIC 'X-RAY DIFFRACTION' t_sum_occupancies ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' t_utility_distance ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' t_utility_angle ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' t_utility_torsion ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' t_ideal_dist_contact 76198 ? ? 4.000 SEMIHARMONIC 'X-RAY DIFFRACTION' t_bond_d 66060 0.010 ? 2.000 HARMONIC 'X-RAY DIFFRACTION' t_angle_deg 89582 1.240 ? 2.000 HARMONIC 'X-RAY DIFFRACTION' t_omega_torsion ? 2.580 ? ? ? 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B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 4 ? P N N 4 ? Q N N 4 ? R N N 4 ? S N N 4 ? T N N 4 ? U N N 4 ? V N N 4 ? W N N 4 ? X N N 4 ? Y N N 4 ? Z N N 5 ? AA N N 4 ? BA N N 4 ? CA N N 4 ? DA N N 4 ? EA N N 4 ? FA N N 4 ? GA N N 4 ? HA N N 4 ? IA N N 4 ? JA N N 4 ? KA N N 4 ? LA N N 4 ? MA N N 5 ? NA N N 4 ? OA N N 4 ? PA N N 4 ? QA N N 4 ? RA N N 4 ? SA N N 4 ? TA N N 4 ? UA N N 4 ? VA N N 4 ? WA N N 4 ? XA N N 4 ? YA N N 5 ? ZA N N 4 ? AB N N 4 ? BB N N 4 ? CB N N 4 ? DB N N 4 ? EB N N 4 ? FB N N 4 ? GB N N 4 ? HB N N 4 ? IB N N 4 ? JB N N 4 ? KB N N 5 ? LB N N 4 ? MB N N 4 ? NB N N 4 ? OB N N 4 ? PB N N 4 ? QB N N 4 ? RB N N 4 ? SB N N 4 ? TB N N 4 ? UB N N 4 ? VB N N 4 ? WB N N 4 ? XB N N 4 ? YB N N 4 ? ZB N N 4 ? AC N N 4 ? BC N N 4 ? CC N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP Q8NJU8_PICPA Q8NJU8 1 ;MPEPSISDLSFTSFVTNDDNLFEETFNFYTKLGFHATRSYVKDNRSDFELTGISTDSIKEIWLESFPLSEVVEASGGREL RKPLQESVGYESEALLGYSPYQSGGVVIKLRLSNHDLEKNNDLPGEVTFFTASIDKLKAKLIEIGAEIIPSKIDLVEFST RDPMGDVISFSSYPSLNSKKITSPDFFLHPKKEVRSEESIVEQVKSEEGKKKIAIITSGGDAPGMNAAVRAVTRAGIFYG CKVYACYEGYTGLVKGGDMLKELQWQDVRGLLSIGGTIIGTARCKEFRERWGRLQACYNMVSNGIDALVVCGGDGSLTGA DLFRKEWPELIKELLGEDKITKEQYETHRNLTIVGLVGSIDNDMCGTDSTIGAYSSLERIIELVDYIDATAASHSRAFVV EVMGRHCGWLGLMSGIATGADYIFIPERPPSESNWKDDLKKVCLRHREKGRRKTTVIVAEGAIDDQLNPITSEEVKDVLV EIGLDTRITRLGHVQRGGAPCAFDRFLATVQGVDAVRAVLESTPAIPSPVISILENKIVRQPLVESVAQTKTVSAAIEAK DFDKALQLRDQEFATSYENFLSVSKYDDGSYLVPESSRLNIAIIHVGAPTSALNPATRVATLNSLAKGHRVFAIRNGFAG LIRHGAVRELNWIDVEDWHNTGGSEIGTNRSLPSDDMGTVAYYFQQYKFDGLIIIGGFEAFTALYELDAARAQYPIFNIP MCCLPATVSNNVPGTEYSLGSDTCLNTLSGYCDAVKQSASASRRRTFVVEVQGGYSGYLASYAGLITGALAVYTPENPIN LQTVQEDIELLTRTYEEDDGKNRSGKIFIHNEKASKVYTTDLIAAIIGEAGKGRFESRTAVPGHVQQGKSPSSIDRVNAC RLAIKCCNFIEDANFQVKHNANLSADERHLRFFYDDGVKTSAVSGKSSVIDDNTSVVIGIQGSEVTFTPVKQLWENETHH KWRKGKNVHWEQLNIVSDLLSGRLSIRTT ; 1 ? 2 UNP Q8TGA0_PICPA Q8TGA0 2 ;MPDASLFNGTSFITLFAPNISLLQASIDFYTNFLGFAIRKNSNQKLFWLQLEEDQNNVSIQLILDPEHAASVSQIDQNIR NLTRSLYRKDWRSIQSNIAFKSSSLSKLVKLLKDGGHPVQQSPNEISPFEVYTVDPLGSLIGFSGFKNPFAVNERSLLPK VSEEKAYRAEDDSEKLLNPVRKTIGVMTSGGDSPGMNPFVRAVVRAGIYKGCKVFCIHEGYEGLVRGGEKYIKETQWHDV RGWLVEGGTNIGTARCKEFRERSGRLKACKNMIDMGIDALIVCGGDGSLTGADRFRSEWPSLIEELLQTEQISQQQFNTH QNLNICGAVGSIDNDMSSTDATIGAFSSLDRICRAIDYIDATANSHSRAFIVEVMGRHCGWLGLLAGLATSADYILIPEK PASSREWQDQMCDIVGKHRARGKRKTIVIVAEGAISNDLSPISCDQVKDVLVNRLGLDTRVTTLGHVQRGGTAVAFDRIY ATLQGVEAVNAVLECDADTPSPMIAIKEDQITRVPLVDAVELTQQVAKSIESRNFKKAISLRDSEFVEHMKNFISTNSAD HVPPSLPLEKRKKIAIINVGAPAGGMNSAVYSMATYCMSRGHVPYAIHNGFSGLARHESVRSINWLDIEGWGSLGGSEIG TNRTLPNDADIGMIAYFFEKYGFDGLILVGGFEAFISLHQLERARINYPSLRIPLVLIPATISNNVPGTEYSLGSDTCLN SFMEYCDVIKQSAAATRNRVFVVEVQGGNSGYIATHAQLACGAQISYVPEEGISLAQLEMDINSLKESFANDQGKTKSGR LILKSENASKVLTTEVISTIIDDEASGRFDSKTAIPGHVQQGGIPSPMDRVRASRFAIRAVSFIERHSDRCQTFKNSISF RQTDEITSTAVVLGIHKSQLRFTPIRQLYDFESDVPRRMRKNIFWSNVREISDMLSGRTSL ; 1 ? 3 UNP A7MAS3_PICPA A7MAS3 3 ;MVTKDSIIRDLERENVGPEFGEFLNTLQTDLNSEKPPIEQVKSQLETHFNLAHETQEFSRKNDNAPVDKLLTNYYNNYEV NVLEFVLQMGFSRDLSIPLNVWFVLDMISQLSTSKQDLPLDYYLVLNNSQTGKYSDFVRYLIYEAVGAEIHCFEQGSMPE QYRSSRWEDKVKGPALANRGPIRGNVGAGDRKITFHLLCKKTARMILVGDDRETDFEMSDRSFVTLLLDYYQRVGTTKKI DLLLLTNNFDTNMNNKLQQLKILESLNMLKSNCYVLDYQITVDQVTANFNSYVEGIPAFRRHEIANFLKKRKTPKNADEL IFKYVGRWNICYQKKFHQGNISIHQISGYLD ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3OPY A 1 ? 989 ? Q8NJU8 1 ? 989 ? 1 989 2 2 3OPY B 1 ? 941 ? Q8TGA0 1 ? 941 ? 1 941 3 1 3OPY C 1 ? 989 ? Q8NJU8 1 ? 989 ? 1 989 4 2 3OPY D 1 ? 941 ? Q8TGA0 1 ? 941 ? 1 941 5 1 3OPY E 1 ? 989 ? Q8NJU8 1 ? 989 ? 1 989 6 2 3OPY F 1 ? 941 ? Q8TGA0 1 ? 941 ? 1 941 7 1 3OPY G 1 ? 989 ? Q8NJU8 1 ? 989 ? 1 989 8 2 3OPY H 1 ? 941 ? Q8TGA0 1 ? 941 ? 1 941 9 3 3OPY I 1 ? 351 ? A7MAS3 1 ? 351 ? 1 351 10 3 3OPY J 1 ? 351 ? A7MAS3 1 ? 351 ? 1 351 11 3 3OPY K 1 ? 351 ? A7MAS3 1 ? 351 ? 1 351 12 3 3OPY L 1 ? 351 ? A7MAS3 1 ? 351 ? 1 351 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 92490 ? 1 MORE -1393 ? 1 'SSA (A^2)' 305400 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'Asymmetric unit contains a complete biological assembly' # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP A 18 ? LEU A 32 ? ASP A 18 LEU A 32 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 2 SER A 133 ? ILE A 144 ? SER A 133 ILE A 144 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 3 GLY A 224 ? TYR A 239 ? GLY A 224 TYR A 239 1 ? 16 HELX_P HELX_P4 4 GLU A 248 ? LYS A 255 ? GLU A 248 LYS A 255 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 5 GLY A 270 ? ILE A 274 ? GLY A 270 ILE A 274 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 6 GLU A 289 ? ASN A 303 ? GLU A 289 ASN A 303 1 ? 15 HELX_P HELX_P7 7 GLY A 313 ? TRP A 327 ? GLY A 313 TRP A 327 1 ? 15 HELX_P HELX_P8 8 LYS A 342 ? HIS A 348 ? LYS A 342 HIS A 348 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 9 ALA A 373 ? ALA A 389 ? ALA A 373 ALA A 389 1 ? 17 HELX_P HELX_P10 10 GLY A 408 ? GLY A 419 ? GLY A 408 GLY A 419 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 11 ASN A 434 ? LYS A 449 ? ASN A 434 LYS A 449 1 ? 16 HELX_P HELX_P12 12 THR A 471 ? GLU A 481 ? THR A 471 GLU A 481 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 13 GLY A 492 ? GLY A 497 ? GLY A 492 GLY A 497 5 ? 6 HELX_P HELX_P14 14 CYS A 501 ? GLU A 521 ? CYS A 501 GLU A 521 1 ? 21 HELX_P HELX_P15 15 LEU A 543 ? ALA A 559 ? 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