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? 26640 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_d 1.705 ? ? 36252 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_dihedral_angle_d 20.397 ? ? 9740 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_chiral_restr 0.114 ? ? 4128 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_plane_restr 0.008 ? ? 4740 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight 1 B 3223 ? ? POSITIONAL 1 1 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 D 3223 0.069 ? POSITIONAL 1 2 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 F 3223 0.065 ? POSITIONAL 1 3 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 4 H 3223 0.067 ? POSITIONAL 1 4 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 3280 ? ? POSITIONAL 2 5 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 C 3280 0.060 ? POSITIONAL 2 6 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 E 3280 0.058 ? POSITIONAL 2 7 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 4 G 3280 0.059 ? POSITIONAL 2 8 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_obs 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.400 2.4274 625 0.2965 13.00 0.3955 . . 66 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4274 2.4559 1248 0.3041 26.00 0.3546 . . 136 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4559 2.4859 1810 0.3395 38.00 0.3831 . . 197 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4859 2.5173 2347 0.3548 48.00 0.3550 . . 236 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.5173 2.5505 2922 0.3662 61.00 0.3885 . . 299 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.5505 2.5854 3334 0.3627 69.00 0.3897 . . 357 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.5854 2.6223 3787 0.3410 80.00 0.3998 . . 457 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.6223 2.6615 4229 0.3382 88.00 0.3969 . . 465 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.6615 2.7030 4587 0.3337 96.00 0.3964 . . 504 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.7030 2.7473 4687 0.3312 98.00 0.3867 . . 501 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.7473 2.7947 4713 0.3327 98.00 0.3686 . . 528 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.7947 2.8455 4797 0.3143 99.00 0.3765 . . 478 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.8455 2.9002 4781 0.3171 99.00 0.3805 . . 524 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.9002 2.9594 4762 0.3223 100.00 0.3751 . . 566 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.9594 3.0237 4774 0.3163 100.00 0.3555 . . 520 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0237 3.0940 4790 0.3229 100.00 0.3781 . . 510 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0940 3.1714 4809 0.3334 100.00 0.3725 . . 564 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1714 3.2571 4764 0.3349 100.00 0.3576 . . 521 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.2571 3.3529 4823 0.3216 100.00 0.3994 . . 527 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.3529 3.4611 4783 0.3114 100.00 0.3681 . . 540 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.4611 3.5847 4825 0.3211 100.00 0.3703 . . 516 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.5847 3.7281 4732 0.3425 98.00 0.4161 . . 527 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.7281 3.8976 4770 0.2781 100.00 0.3222 . . 553 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.8976 4.1029 4811 0.2743 100.00 0.3160 . . 541 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.1029 4.3597 4832 0.2660 100.00 0.3110 . . 542 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.3597 4.6958 4852 0.2493 100.00 0.2812 . . 527 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.6958 5.1675 4832 0.2512 100.00 0.2998 . . 530 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.1675 5.9132 4865 0.2601 100.00 0.3004 . . 545 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.9132 7.4420 4893 0.2572 100.00 0.3045 . . 524 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 7.4420 39.8345 5001 0.2280 100.00 0.2579 . . 519 . . . . # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 ? 1 2 ? 1 3 ? 1 4 ? 1 1 ? 2 2 ? 2 3 ? 2 4 ? 2 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'CHAIN B AND (RESSEQ 4:435 )' ? ? 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'CHAIN D AND (RESSEQ 4:435 )' ? ? 3 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'CHAIN F AND (RESSEQ 4:435 )' ? ? 4 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'CHAIN H AND (RESSEQ 4:435 )' ? ? 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'CHAIN A AND (RESSEQ 24:450 )' ? ? 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'CHAIN C AND (RESSEQ 24:450 )' ? ? 3 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'CHAIN E AND (RESSEQ 24:450 )' ? ? 4 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'CHAIN G AND (RESSEQ 24:450 )' ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? # _database_PDB_matrix.entry_id 3PDI _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 3PDI _struct.title 'Precursor bound NifEN' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3PDI _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN BINDING' _struct_keywords.text 'Nitrogenase Cofactor maturation, NifB, NifDK, NifH, PROTEIN BINDING' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 3 ? P N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP C1DH03_AZOVD C1DH03 1 ;MKAKDIAELLDEPACSHNKKEKSGCAKPKPGATDGGCSFDGAQIALLPVADVAHIVHGPIACAGSSWDNRGTRSSGPDLY RIGMTTDLTENDVIMGRAEKRLFHAIRQAVESYSPPAVFVYNTCVPALIGDDVDAVCKAAAERFGTPVIPVDSAGFYGTK NLGNRIAGEAMLKYVIGTREPDPLPVGSERPGIRVHDVNLIGEYNIAGEFWHVLPLLDELGLRVLCTLAGDARYREVQTM HRAEVNMMVCSKAMLNVARKLQETYGTPWFEGSFYGITDTSQALRDFARLLDDPDLTARTEALIAREEAKVRAALEPWRA RLEGKRVLLYTGGVKSWSVVSALQDLGMKVVATGTKKSTEEDKARIRELMGDDVKMLDEGNARVLLKTVDEYQADILIAG GRNMYTALKGRVPFLDINQEREFGYAGYDGMLELVRQLCITLECPVWEAVRRPAPWDIPASQDAAPSAPARSANA ; 1 ? 2 UNP C1DH04_AZOVD C1DH04 2 ;MAEIINRNKALAVSPLKASQTMGAALAILGLARSMPLFHGSQGCTAFAKVFFVRHFREPVPLQTTAMDQVSSVMGADENV VEALKTICERQNPSVIGLLTTGLSETQGCDLHTALHEFRTQYEEYKDVPIVPVNTPDFSGCFESGFAAAVKAIVETLVPE RRDQVGKRPRQVNVLCSANLTPGDLEYIAESIESFGLRPLLIPDLSGSLDGHLDENRFNALTTGGLSVAELATAGQSVAT LVVGQSLAGAADALAERTGVPDRRFGMLYGLDAVDAWLMALAEISGNPVPDRYKRQRAQLQDAMLDTHFMLSSARTAIAA DPDLLLGFDALLRSMGAHTVAAVVPARAAALVDSPLPSVRVGDLEDLEHAARAGQAQLVIGNSHALASARRLGVPLLRAG FPQYDLLGGFQRCWSGYRGSSQVLFDLANLLVEHHQGIQPYHSIYAQKPATEQPQWRH ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3PDI A 9 ? 483 ? C1DH03 1 ? 475 ? 1 475 2 2 3PDI B 1 ? 458 ? C1DH04 1 ? 458 ? 1 458 3 1 3PDI C 9 ? 483 ? C1DH03 1 ? 475 ? 1 475 4 1 3PDI E 9 ? 483 ? C1DH03 1 ? 475 ? 1 475 5 1 3PDI G 9 ? 483 ? C1DH03 1 ? 475 ? 1 475 6 2 3PDI D 1 ? 458 ? C1DH04 1 ? 458 ? 1 458 7 2 3PDI F 1 ? 458 ? C1DH04 1 ? 458 ? 1 458 8 2 3PDI H 1 ? 458 ? C1DH04 1 ? 458 ? 1 458 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 3PDI MET A 1 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -7 1 1 3PDI HIS A 2 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -6 2 1 3PDI HIS A 3 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -5 3 1 3PDI HIS A 4 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -4 4 1 3PDI HIS A 5 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -3 5 1 3PDI HIS A 6 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -2 6 1 3PDI HIS A 7 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -1 7 1 3PDI HIS A 8 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' 0 8 3 3PDI MET C 1 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -7 9 3 3PDI HIS C 2 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -6 10 3 3PDI HIS C 3 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -5 11 3 3PDI HIS C 4 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -4 12 3 3PDI HIS C 5 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -3 13 3 3PDI HIS C 6 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -2 14 3 3PDI HIS C 7 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -1 15 3 3PDI HIS C 8 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' 0 16 4 3PDI MET E 1 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -7 17 4 3PDI HIS E 2 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -6 18 4 3PDI HIS E 3 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -5 19 4 3PDI HIS E 4 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -4 20 4 3PDI HIS E 5 ? UNP C1DH03 ? ? 'expression tag' -3 21 4 3PDI HIS E 6 ? UNP C1DH03 ? ? 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'expression tag' 0 32 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA tetrameric 4 2 author_and_software_defined_assembly PISA tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 15800 ? 1 MORE -118 ? 1 'SSA (A^2)' 60320 ? 2 'ABSA (A^2)' 15660 ? 2 MORE -119 ? 2 'SSA (A^2)' 60410 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,I,J,K,L 2 1 E,F,G,H,M,N,O,P # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 CYS A 45 ? 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? -66.33 -146.34 299 1 ASN H 8 ? ? -156.00 -57.13 300 1 LYS H 9 ? ? 103.60 165.15 301 1 ALA H 10 ? ? -145.47 -16.21 302 1 SER H 14 ? ? 49.80 78.71 303 1 LEU H 29 ? ? -47.96 -11.26 304 1 ALA H 66 ? ? 71.91 31.10 305 1 VAL H 73 ? ? -85.48 -114.30 306 1 MET H 74 ? ? -59.13 101.16 307 1 ALA H 76 ? ? 149.48 4.03 308 1 ASP H 77 ? ? -17.35 -76.93 309 1 ASN H 92 ? ? 60.86 61.58 310 1 ASP H 110 ? ? 31.27 46.90 311 1 LEU H 111 ? ? -53.47 -78.49 312 1 THR H 120 ? ? -121.03 -74.19 313 1 GLN H 121 ? ? -41.45 -90.40 314 1 TYR H 125 ? ? -26.63 -60.95 315 1 LYS H 126 ? ? 81.50 -179.08 316 1 ASP H 127 ? ? 76.91 -7.64 317 1 ASP H 137 ? ? -39.17 -35.81 318 1 VAL H 158 ? ? 83.36 -6.06 319 1 GLU H 160 ? ? -98.30 -79.59 320 1 ARG H 161 ? ? -30.60 -73.23 321 1 GLN H 164 ? ? 42.37 -61.95 322 1 LYS H 167 ? ? -162.91 67.36 323 1 ARG H 168 ? ? -100.69 -71.08 324 1 PRO H 169 ? ? -55.43 -137.20 325 1 ASP H 210 ? ? -161.71 -152.09 326 1 ASN H 219 ? ? 22.04 -65.52 327 1 LEU H 221 ? ? 80.10 -2.63 328 1 THR H 222 ? ? 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