data_3PGW # _entry.id 3PGW # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.387 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 3PGW pdb_00003pgw 10.2210/pdb3pgw/pdb NDB NA0851 ? ? RCSB RCSB062358 ? ? WWPDB D_1000062358 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2010-12-29 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 3 'Structure model' 1 2 2017-11-08 4 'Structure model' 1 3 2024-02-21 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Refinement description' 3 4 'Structure 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_pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Weber, G.' 1 'Trowitzsch, S.' 2 'Kastner, B.' 3 'Luehrmann, R.' 4 'Wahl, M.C.' 5 # _citation.id primary _citation.title 'Functional organization of the Sm core in the crystal structure of human U1 snRNP.' _citation.journal_abbrev 'Embo J.' _citation.journal_volume 29 _citation.page_first 4172 _citation.page_last 4184 _citation.year 2010 _citation.journal_id_ASTM EMJODG _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0261-4189 _citation.journal_id_CSD 0897 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 21113136 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/emboj.2010.295 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Weber, G.' 1 ? primary 'Trowitzsch, S.' 2 ? primary 'Kastner, B.' 3 ? primary 'Luhrmann, R.' 4 ? primary 'Wahl, M.C.' 5 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat U1-A 31319.533 2 ? ? ? ? 2 polymer nat U1-70K 51683.184 2 ? ? ? ? 3 polymer nat Sm-D3 13940.308 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Sm B' 23686.004 2 ? ? ? ? 5 polymer nat Sm-D1 13310.653 2 ? ? ? ? 6 polymer nat Sm-D2 13551.928 2 ? ? ? ? 7 polymer nat Sm-F 9734.171 2 ? ? ? ? 8 polymer nat Sm-E 10817.601 2 ? ? ? ? 9 polymer nat 'Sm G' 8508.084 2 ? ? ? ? 10 polymer nat 'U1 snRNA' 52697.070 2 ? ? ? ? 11 polymer syn ;DNA 5'-D(*AP*GP*GP*TP*AP*AP*GP*TP*A)-3' ; 2803.873 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'U1 snRNP A, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, U1A' 2 'U1 snRNP 70 kDa, snRNP70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa' 3 'Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, snRNP core 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;MAVPETRPNHTIYINNLNEKIKKDELKKSLYAIFSQFGQILDILVSRSLKMRGQAFVIFKEVSSATNALRSMQGFPFYDK PMRIQYAKTDSDIIAKMKGTFVERDRKREKRKPKSQETPATKKAVQGGGATPVVGAVQGPVPGMPPMTQAPRIMHHMPGQ PPYMPPPGMIPPPGLAPGQIPPGAMPPQQLMPGQMPPAQPLSENPPNHILFLTNLPEETNELMLSMLFNQFPGFKEVRLV PGRHDIAFVEFDNEVQAGAARDALQGFKITQNNAMKISFAKK ; A,P ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MTQFLPPNLLALFAPRDPIPYLPPLEKLPHEKHHNQPYCGIAPYIREFEDPRDAPPPTRAETREERMERKRREKIERRQQ EVETELKMWDPHNDPNAQGDAFKTLFVARVNYDTTESKLRREFEVYGPIKRIHMVYSKRSGKPRGYAFIEYEHERDMHSA YKHADGKKIDGRRVLVDVERGRTVKGWRPRRLGGGLGGTRRGGADVNIRHSGRDDTSRYDERPGPSPLPHRDRDRDRERE RRERSRERDKERERRRSRSRDRRRRSRSRDKEERRRSRERSKDKDRDRKRRSSRSRERARRERERKEELRGGGGDMAEPS EAGDAPPDDGPPGELGPDGPDGPEEKGRDRDRERRRSHRSERERRRDRDRDRDRDREHKRGERGSERGRDEARGGGGGQD NGLEGLGNDSRDMYMESEGGDGYLAPENGYLMEAAPE ; ;MTQFLPPNLLALFAPRDPIPYLPPLEKLPHEKHHNQPYCGIAPYIREFEDPRDAPPPTRAETREERMERKRREKIERRQQ EVETELKMWDPHNDPNAQGDAFKTLFVARVNYDTTESKLRREFEVYGPIKRIHMVYSKRSGKPRGYAFIEYEHERDMHSA YKHADGKKIDGRRVLVDVERGRTVKGWRPRRLGGGLGGTRRGGADVNIRHSGRDDTSRYDERPGPSPLPHRDRDRDRERE RRERSRERDKERERRRSRSRDRRRRSRSRDKEERRRSRERSKDKDRDRKRRSSRSRERARRERERKEELRGGGGDMAEPS EAGDAPPDDGPPGELGPDGPDGPEEKGRDRDRERRRSHRSERERRRDRDRDRDRDREHKRGERGSERGRDEARGGGGGQD NGLEGLGNDSRDMYMESEGGDGYLAPENGYLMEAAPE ; S,L ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNA PMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR ; ;MSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNA PMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR ; Z,W ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSM TVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATAS IAGAPTQYPPGRGGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGLL ; ;MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSM TVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATAS IAGAPTQYPPGRGGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGLL ; B,Q ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLL VDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR ; ;MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLL VDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR ; X,U ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKS GKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK ; ;MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKS GKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK ; Y,V ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGVEEEEE DGEMRE ; ;MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGVEEEEE DGEMRE ; F,I ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLK GDNITLLQSVSN ; ;MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLK GDNITLLQSVSN ; E,H ? 9 'polypeptide(L)' no no MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERV MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERV G,J ? 10 polyribonucleotide no no ;AUACUUACCUGGCAGGGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCCAGGGCGAGGCUUAUCCAUUGCACUCCGGAUGU GCUGACCCCUGCGAUUUCCCCAAAUGUGGGAAACUCGACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGGGGGACUGCGUUCGCGCUUUCC CCUG ; ;AUACUUACCUGGCAGGGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCCAGGGCGAGGCUUAUCCAUUGCACUCCGGAUGU GCUGACCCCUGCGAUUUCCCCAAAUGUGGGAAACUCGACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGGGGGACUGCGUUCGCGCUUUCC CCUG ; R,N ? 11 polydeoxyribonucleotide no no '(DA)(DG)(DG)(DT)(DA)(DA)(DG)(DT)(DA)' AGGTAAGTA D,M ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 VAL n 1 4 PRO n 1 5 GLU n 1 6 THR n 1 7 ARG n 1 8 PRO n 1 9 ASN n 1 10 HIS n 1 11 THR n 1 12 ILE n 1 13 TYR n 1 14 ILE n 1 15 ASN n 1 16 ASN n 1 17 LEU n 1 18 ASN n 1 19 GLU n 1 20 LYS n 1 21 ILE n 1 22 LYS n 1 23 LYS n 1 24 ASP n 1 25 GLU n 1 26 LEU n 1 27 LYS n 1 28 LYS n 1 29 SER n 1 30 LEU n 1 31 TYR n 1 32 ALA n 1 33 ILE n 1 34 PHE n 1 35 SER n 1 36 GLN n 1 37 PHE n 1 38 GLY n 1 39 GLN n 1 40 ILE n 1 41 LEU n 1 42 ASP n 1 43 ILE n 1 44 LEU n 1 45 VAL n 1 46 SER n 1 47 ARG n 1 48 SER n 1 49 LEU n 1 50 LYS n 1 51 MET n 1 52 ARG n 1 53 GLY n 1 54 GLN n 1 55 ALA n 1 56 PHE n 1 57 VAL n 1 58 ILE n 1 59 PHE n 1 60 LYS n 1 61 GLU n 1 62 VAL n 1 63 SER n 1 64 SER n 1 65 ALA n 1 66 THR n 1 67 ASN n 1 68 ALA n 1 69 LEU n 1 70 ARG n 1 71 SER n 1 72 MET n 1 73 GLN n 1 74 GLY n 1 75 PHE n 1 76 PRO n 1 77 PHE n 1 78 TYR n 1 79 ASP n 1 80 LYS n 1 81 PRO n 1 82 MET n 1 83 ARG n 1 84 ILE n 1 85 GLN n 1 86 TYR n 1 87 ALA n 1 88 LYS n 1 89 THR n 1 90 ASP n 1 91 SER n 1 92 ASP n 1 93 ILE n 1 94 ILE n 1 95 ALA n 1 96 LYS n 1 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n 1 181 PRO n 1 182 PRO n 1 183 GLY n 1 184 ALA n 1 185 MET n 1 186 PRO n 1 187 PRO n 1 188 GLN n 1 189 GLN n 1 190 LEU n 1 191 MET n 1 192 PRO n 1 193 GLY n 1 194 GLN n 1 195 MET n 1 196 PRO n 1 197 PRO n 1 198 ALA n 1 199 GLN n 1 200 PRO n 1 201 LEU n 1 202 SER n 1 203 GLU n 1 204 ASN n 1 205 PRO n 1 206 PRO n 1 207 ASN n 1 208 HIS n 1 209 ILE n 1 210 LEU n 1 211 PHE n 1 212 LEU n 1 213 THR n 1 214 ASN n 1 215 LEU n 1 216 PRO n 1 217 GLU n 1 218 GLU n 1 219 THR n 1 220 ASN n 1 221 GLU n 1 222 LEU n 1 223 MET n 1 224 LEU n 1 225 SER n 1 226 MET n 1 227 LEU n 1 228 PHE n 1 229 ASN n 1 230 GLN n 1 231 PHE n 1 232 PRO n 1 233 GLY n 1 234 PHE n 1 235 LYS n 1 236 GLU n 1 237 VAL n 1 238 ARG n 1 239 LEU n 1 240 VAL n 1 241 PRO n 1 242 GLY n 1 243 ARG n 1 244 HIS n 1 245 ASP n 1 246 ILE n 1 247 ALA n 1 248 PHE n 1 249 VAL n 1 250 GLU n 1 251 PHE n 1 252 ASP n 1 253 ASN n 1 254 GLU n 1 255 VAL n 1 256 GLN n 1 257 ALA n 1 258 GLY n 1 259 ALA n 1 260 ALA n 1 261 ARG n 1 262 ASP n 1 263 ALA n 1 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