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'EXPRESSION TAG' -55 7 1 3R2F GLN A 8 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -54 8 1 3R2F GLN A 9 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -53 9 1 3R2F MET A 10 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -52 10 1 3R2F GLY A 11 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -51 11 1 3R2F ARG A 12 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -50 12 1 3R2F GLY A 13 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -49 13 1 3R2F SER A 14 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -48 14 2 3R2F MET B 1 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -61 15 2 3R2F ALA B 2 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -60 16 2 3R2F SER B 3 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -59 17 2 3R2F MET B 4 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -58 18 2 3R2F THR B 5 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -57 19 2 3R2F GLY B 6 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -56 20 2 3R2F GLY B 7 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -55 21 2 3R2F GLN B 8 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -54 22 2 3R2F GLN B 9 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -53 23 2 3R2F MET B 10 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -52 24 2 3R2F GLY B 11 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -51 25 2 3R2F ARG B 12 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -50 26 2 3R2F GLY B 13 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -49 27 2 3R2F SER B 14 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -48 28 3 3R2F MET D 1 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -61 29 3 3R2F ALA D 2 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -60 30 3 3R2F SER D 3 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -59 31 3 3R2F MET D 4 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -58 32 3 3R2F THR D 5 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -57 33 3 3R2F GLY D 6 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -56 34 3 3R2F GLY D 7 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -55 35 3 3R2F GLN D 8 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -54 36 3 3R2F GLN D 9 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -53 37 3 3R2F MET D 10 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -52 38 3 3R2F GLY D 11 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -51 39 3 3R2F ARG D 12 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -50 40 3 3R2F GLY D 13 ? UNP P56817 ? ? 'EXPRESSION TAG' -49 41 3 3R2F SER D 14 ? UNP P56817 ? ? 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'C36 H50 F2 N4 O5' 656.803 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso 1 A 1544 0.07 0.05 'tight positional' 1 1 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 B 1544 0.07 0.05 'tight positional' 1 2 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 3 D 1544 0.05 0.05 'tight positional' 1 3 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 4 E 1544 0.05 0.05 'tight positional' 1 4 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 1 A 188 0.00 0.05 'tight positional' 2 5 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 B 188 0.00 0.05 'tight positional' 2 6 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 3 D 188 0.00 0.05 'tight positional' 2 7 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 4 E 188 0.00 0.05 'tight positional' 2 8 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 1 A 1490 0.52 0.50 'medium positional' 1 9 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 B 1490 0.44 0.50 'medium positional' 1 10 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 3 D 1490 0.58 0.50 'medium positional' 1 11 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 4 E 1490 0.51 0.50 'medium positional' 1 12 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 1 A 1544 0.04 0.50 'tight thermal' 1 13 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 B 1544 0.05 0.50 'tight thermal' 1 14 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 3 D 1544 0.05 0.50 'tight thermal' 1 15 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 4 E 1544 0.05 0.50 'tight thermal' 1 16 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 1 A 188 0.00 0.50 'tight thermal' 2 17 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 B 188 0.00 0.50 'tight thermal' 2 18 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 3 D 188 0.00 0.50 'tight thermal' 2 19 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 4 E 188 0.00 0.50 'tight thermal' 2 20 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 1 A 1490 0.33 2.00 'medium thermal' 1 21 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 B 1490 0.40 2.00 'medium thermal' 1 22 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 3 D 1490 0.39 2.00 'medium thermal' 1 23 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 4 E 1490 0.36 2.00 'medium thermal' 1 24 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 2.529 _refine_ls_shell.d_res_low ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 3860 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.344 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 86.47 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.382 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 203 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 A 1 2 B 1 3 D 1 4 E 1 1 A 2 2 B 2 3 D 2 4 E 2 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 A -5 A 385 1 2 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? 2 B -5 B 385 1 2 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? 3 D -5 D 385 1 2 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? 4 E -5 E 385 1 2 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? 1 A 394 A 394 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 2 B 394 B 394 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 3 C 394 C 394 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 4 D 394 D 394 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? # _struct.entry_id 3R2F _struct.title ;Crystal structure of beta-site app-cleaving enzyme 1 (BACE-WT) complex with BMS-693391 AKA (2S)-2-((3R)-3-acetamido-3-isobutyl-2-oxo-1-pyrrolidinyl)-N-((1S,2R)-1-(3,5-difluorobenzyl)-2-hydroxy-2-((2R,4R)-4-propoxy-2-pyrrolidinyl)ethyl)-4-phenylbutanamide ; _struct.pdbx_descriptor 'Beta-secretase 1 (E.C.3.4.23.46)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3R2F _struct_keywords.pdbx_keywords 'HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR' _struct_keywords.text ;Alzheimer's Disease, aspartic protease, beta-secretase, memapsin 2, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 PHE A 61 ? VAL A 65 ? PHE A -1 VAL A 3 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 2 GLN A 115 ? SER A 119 ? GLN A 53 SER A 57 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 TYR A 185 ? ALA A 189 ? TYR A 123 ALA A 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 4 PRO A 197 ? THR A 206 ? PRO A 135 THR A 144 1 ? 10 HELX_P HELX_P5 5 ASN A 224 ? SER A 231 ? ASN A 162 SER A 169 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 6 ASP A 242 ? SER A 244 ? ASP A 180 SER A 182 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 7 ASP A 278 ? ASN A 283 ? ASP A 216 ASN A 221 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 8 LYS A 300 ? SER A 314 ? LYS A 238 SER A 252 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 9 PRO A 320 ? LEU A 325 ? PRO A 258 LEU A 263 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 10 PRO A 338 ? PHE A 342 ? PRO A 276 PHE A 280 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 11 LEU A 363 ? TYR A 367 ? LEU A 301 TYR A 305 1 ? 5 HELX_P HELX_P12 12 GLY A 396 ? GLU A 401 ? GLY A 334 GLU A 339 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 13 PHE B 61 ? VAL B 65 ? PHE B -1 VAL B 3 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 14 GLN B 115 ? SER B 119 ? GLN B 53 SER B 57 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 15 TYR B 185 ? ALA B 189 ? TYR B 123 ALA B 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 PRO B 197 ? THR B 206 ? PRO B 135 THR B 144 1 ? 10 HELX_P HELX_P17 17 ASN B 224 ? SER B 231 ? ASN B 162 SER B 169 1 ? 8 HELX_P HELX_P18 18 ASP B 242 ? SER B 244 ? ASP B 180 SER B 182 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 19 ASP B 278 ? ASN B 283 ? ASP B 216 ASN B 221 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 20 LYS B 300 ? SER B 314 ? LYS B 238 SER B 252 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 21 PRO B 320 ? LEU B 325 ? PRO B 258 LEU B 263 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 22 PRO B 338 ? PHE B 342 ? PRO B 276 PHE B 280 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 23 LEU B 363 ? TYR B 367 ? LEU B 301 TYR B 305 1 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 GLY B 396 ? GLU B 401 ? GLY B 334 GLU B 339 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 25 PHE C 61 ? VAL C 65 ? PHE D -1 VAL D 3 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 GLN C 115 ? SER C 119 ? GLN D 53 SER D 57 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 27 TYR C 185 ? ALA C 189 ? TYR D 123 ALA D 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 28 PRO C 197 ? THR C 206 ? PRO D 135 THR D 144 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 29 ASN C 224 ? SER C 231 ? ASN D 162 SER D 169 1 ? 8 HELX_P HELX_P30 30 ASP C 242 ? SER C 244 ? ASP D 180 SER D 182 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 31 ASP C 278 ? ASN C 283 ? ASP D 216 ASN D 221 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 32 LYS C 300 ? SER C 314 ? LYS D 238 SER D 252 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 33 PRO C 320 ? LEU C 325 ? PRO D 258 LEU D 263 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 34 PRO C 338 ? PHE C 342 ? PRO D 276 PHE D 280 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 35 LEU C 363 ? TYR C 367 ? LEU D 301 TYR D 305 1 ? 5 HELX_P HELX_P36 36 GLY C 396 ? GLU C 401 ? GLY D 334 GLU D 339 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 37 PHE D 61 ? VAL D 65 ? PHE E -1 VAL E 3 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 38 GLN D 115 ? SER D 119 ? GLN E 53 SER E 57 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 39 TYR D 185 ? ALA D 189 ? TYR E 123 ALA E 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 40 PRO D 197 ? THR D 206 ? PRO E 135 THR E 144 1 ? 10 HELX_P HELX_P41 41 ASN D 224 ? SER D 231 ? ASN E 162 SER E 169 1 ? 8 HELX_P HELX_P42 42 ASP D 242 ? SER D 244 ? ASP E 180 SER E 182 5 ? 3 HELX_P HELX_P43 43 LYS D 280 ? TYR D 284 ? LYS E 218 TYR E 222 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 LYS D 300 ? SER D 314 ? LYS E 238 SER E 252 1 ? 15 HELX_P HELX_P45 45 PRO D 320 ? LEU D 325 ? PRO E 258 LEU E 263 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 46 PRO D 338 ? PHE D 342 ? PRO E 276 PHE E 280 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 47 LEU D 363 ? TYR D 367 ? LEU E 301 TYR E 305 1 ? 5 HELX_P HELX_P48 48 GLY D 396 ? GLU D 401 ? GLY E 334 GLU E 339 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? A CYS 217 SG ? ? ? 1_555 A CYS 421 SG ? ? A CYS 155 A CYS 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? disulf2 disulf ? ? A CYS 279 SG ? ? ? 1_555 A CYS 444 SG ? ? A CYS 217 A CYS 382 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? disulf3 disulf ? ? A CYS 331 SG ? ? ? 1_555 A CYS 381 SG ? ? A CYS 269 A CYS 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.966 ? disulf4 disulf ? ? B CYS 217 SG ? ? ? 1_555 B CYS 421 SG ? ? B CYS 155 B CYS 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.958 ? disulf5 disulf ? ? B CYS 279 SG ? ? ? 1_555 B CYS 444 SG ? ? B CYS 217 B CYS 382 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.973 ? disulf6 disulf ? ? B CYS 331 SG ? ? ? 1_555 B CYS 381 SG ? ? B CYS 269 B CYS 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? disulf7 disulf ? ? C CYS 217 SG ? ? ? 1_555 C CYS 421 SG ? ? D CYS 155 D CYS 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? disulf8 disulf ? ? C CYS 331 SG ? ? ? 1_555 C CYS 381 SG ? ? D CYS 269 D CYS 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? disulf9 disulf ? ? D CYS 217 SG ? ? ? 1_555 D CYS 421 SG ? ? E CYS 155 E CYS 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? disulf10 disulf ? ? 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