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'Specific DNA structural attributes modulate platinum anticancer drug site selection and cross-link generation.' _citation.journal_abbrev 'Nucleic Acids Res.' _citation.journal_volume 39 _citation.page_first 8200 _citation.page_last 8212 _citation.year 2011 _citation.journal_id_ASTM NARHAD _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0305-1048 _citation.journal_id_CSD 0389 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 21724603 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1093/nar/gkr491 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wu, B.' 1 ? primary 'Davey, G.E.' 2 ? primary 'Nazarov, A.A.' 3 ? primary 'Dyson, P.J.' 4 ? primary 'Davey, C.A.' 5 ? # _cell.entry_id 3REH _cell.length_a 105.606 _cell.length_b 110.066 _cell.length_c 181.719 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? 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;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT) (DA)(DC)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG) (DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC) (DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG) (DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DC) (DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG) 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? I DC 12 O2 ? ? ? 1_555 J DG 134 N2 ? ? I DC -61 J DG 61 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? I DC 13 N3 ? ? ? 1_555 J DG 133 N1 ? ? I DC -60 J DG 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? I DC 13 N4 ? ? ? 1_555 J DG 133 O6 ? ? I DC -60 J DG 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? I DC 13 O2 ? ? ? 1_555 J DG 133 N2 ? ? I DC -60 J DG 60 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? I DT 14 N3 ? ? ? 1_555 J DA 132 N1 ? ? I DT -59 J DA 59 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? I DG 15 N1 ? ? ? 1_555 J DC 131 N3 ? ? I DG -58 J DC 58 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? I DG 15 N2 ? ? ? 1_555 J DC 131 O2 ? ? I DG -58 J DC 58 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? I DG 15 O6 ? ? ? 1_555 J DC 131 N4 ? ? I DG -58 J DC 58 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? I DC 16 N3 ? ? ? 1_555 J DG 130 N1 ? ? 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J -72 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DA 1 1_555 J DT 145 1_555 I DT 2 1_555 J DA 144 1_555 -0.892 -0.589 2.987 4.159 1.528 37.305 -1.094 1.870 2.849 2.378 -6.473 37.558 1 II_DA-72DT-71:DA71DT72_JJ I -72 ? J 72 ? I -71 ? J 71 ? 1 I DT 2 1_555 J DA 144 1_555 I DC 3 1_555 J DG 143 1_555 0.553 -0.005 3.171 -1.849 0.987 33.883 -0.161 -1.232 3.136 1.691 3.170 33.946 2 II_DT-71DC-70:DG70DA71_JJ I -71 ? J 71 ? I -70 ? J 70 ? 1 I DC 3 1_555 J DG 143 1_555 I DA 4 1_555 J DT 142 1_555 0.005 0.794 3.342 3.059 9.436 36.012 -0.075 0.418 3.424 14.917 -4.836 37.310 3 II_DC-70DA-69:DT69DG70_JJ I -70 ? J 70 ? I -69 ? J 69 ? 1 I DA 4 1_555 J DT 142 1_555 I DA 5 1_555 J DT 141 1_555 -0.705 0.661 3.003 -6.526 1.389 42.102 0.779 0.354 3.093 1.919 9.016 42.603 4 II_DA-69DA-68:DT68DT69_JJ I -69 ? J 69 ? I -68 ? J 68 ? 1 I DA 5 1_555 J DT 141 1_555 I DT 6 1_555 J DA 140 1_555 0.164 -0.613 2.897 1.900 -2.913 22.128 -0.605 0.211 2.955 -7.530 -4.911 22.396 5 II_DA-68DT-67:DA67DT68_JJ I -68 ? J 68 ? I -67 ? J 67 ? 1 I DT 6 1_555 J DA 140 1_555 I DA 7 1_555 J DT 139 1_555 -0.014 -0.329 3.766 1.101 -1.267 44.687 -0.299 0.134 3.772 -1.665 -1.448 44.717 6 II_DT-67DA-66:DT66DA67_JJ I -67 ? J 67 ? I -66 ? J 66 ? 1 I DA 7 1_555 J DT 139 1_555 I DT 8 1_555 J DA 138 1_555 0.429 -1.143 3.336 -2.982 -7.891 35.739 -0.680 -1.111 3.456 -12.641 4.777 36.690 7 II_DA-66DT-65:DA65DT66_JJ I -66 ? J 66 ? I -65 ? J 65 ? 1 I DT 8 1_555 J DA 138 1_555 I DC 9 1_555 J DG 137 1_555 1.221 0.134 3.108 4.595 3.860 38.549 -0.254 -1.288 3.224 5.804 -6.909 38.996 8 II_DT-65DC-64:DG64DA65_JJ I -65 ? J 65 ? I -64 ? J 64 ? 1 I DC 9 1_555 J DG 137 1_555 I DC 10 1_555 J DG 136 1_555 -0.396 -0.247 3.237 1.514 7.804 26.071 -2.432 1.211 3.009 16.809 -3.261 27.236 9 II_DC-64DC-63:DG63DG64_JJ I -64 ? J 64 ? I -63 ? J 63 ? 1 I DC 10 1_555 J DG 136 1_555 I DA 11 1_555 J DT 135 1_555 -0.489 0.310 3.169 -12.239 5.645 32.813 -0.326 -1.009 3.156 9.508 20.615 35.403 10 II_DC-63DA-62:DT62DG63_JJ I -63 ? J 63 ? I -62 ? J 62 ? 1 I DA 11 1_555 J DT 135 1_555 I DC 12 1_555 J DG 134 1_555 0.041 -0.864 3.436 1.411 -1.346 27.994 -1.447 0.266 3.471 -2.777 -2.913 28.060 11 II_DA-62DC-61:DG61DT62_JJ I -62 ? J 62 ? I -61 ? 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