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;MKLSKDTTALLKNFATINSGIMLKSGQFIMTRAVNGTTYAEANISDVIDFDVAIYDLNGFLGILSLVNDDAEISQSEDGN IKIADARSTIFWPAADPSTVVAPNKPIPFPVASAVTEIKAEDLQQLLRVSRGLQIDTIAITVKEGKIVINGFNKVEDSAL TRVKYSLTLGDYDGENTFNFIINMANMKMQPGNYKLLLWAKGKQGAAKFEGEHANYVVALEADSTHDF ; G,H,F,Q,R,P ? 4 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DG) (DT)(DA)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC) ; TTTTTTTTTTTATGTACTCGTAGTGTCTGC I,S ? 5 polydeoxyribonucleotide no no '(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DA)' GCAGACACTACGAGTACATA J,T ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLY n 1 2 PRO n 1 3 GLY n 1 4 GLY n 1 5 SER n 1 6 MET n 1 7 ILE n 1 8 THR n 1 9 VAL n 1 10 ASN n 1 11 GLU n 1 12 LYS n 1 13 GLU n 1 14 HIS n 1 15 ILE n 1 16 LEU n 1 17 GLU n 1 18 GLN n 1 19 LYS n 1 20 TYR n 1 21 ARG n 1 22 PRO n 1 23 SER n 1 24 THR n 1 25 ILE n 1 26 ASP n 1 27 GLU n 1 28 CYS n 1 29 ILE n 1 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_entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample ? ? ? ? ? '44, gp44' ? ? ? ? ? ? 'Enterobacteria phage T4' 10665 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? 'T7 Express' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? ? ? ? '62, gp62' ? ? ? ? ? ? 'Enterobacteria phage T4' 10665 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? 'T7 Express' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? ? ? ? '45, gp45' ? ? ? ? ? ? 'Enterobacteria phage T4' 10665 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? 'T7 Express' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP DPA44_BPT4 P04526 1 ;MITVNEKEHILEQKYRPSTIDECILPAFDKETFKSITSKGKIPHIILHSPSPGTGKTTVAKALCHDVNADMMFVNGSDCK IDFVRGPLTNFASAASFDGRQKVIVIDEFDRSGLAESQRHLRSFMEAYSSNCSIIITANNIDGIIKPLQSRCRVITFGQP TDEDKIEMMKQMIRRLTEICKHEGIAIADMKVVAALVKKNFPDFRKTIGELDSYSSKGVLDAGILSLVTNDRGAIDDVLE SLKNKDVKQLRALAPKYAADYSWFVGKLAEEIYSRVTPQSIIRMYEIVGENNQYHGIAANTELHLAYLFIQLACEMQWK ; 1 ? 2 UNP DPA62_BPT4 P04527 2 ;SLFKDDIQLNEHQVAWYSKDWTAVQSAADSFKEKAENEFFEIIGAINNKTKCSIAQKDYSKFMVENALSQFPECMPAVYA MNLIGSGLSDEAHFNYLMAAVPRGKRYGKWAKLVEDSTEVLIIKLLAKRYQVNTNDAINYKSILTKNGKLPLVLKELKGL VTDDFLKEVTKNVKEQKQLKKLALEW ; 2 ? 3 UNP DPA5_BPT4 P04525 3 ;MKLSKDTTALLKNFATINSGIMLKSGQFIMTRAVNGTTYAEANISDVIDFDVAIYDLNGFLGILSLVNDDAEISQSEDGN IKIADARSTIFWPAADPSTVVAPNKPIPFPVASAVTEIKAEDLQQLLRVSRGLQIDTIAITVKEGKIVINGFNKVEDSAL TRVKYSLTLGDYDGENTFNFIINMANMKMQPGNYKLLLWAKGKQGAAKFEGEHANYVVALEADSTHDF ; 1 ? 4 PDB 3U5Z 3U5Z 4 TTTTTTTTTTTATGTACTCGTAGTGTCTGC ? ? 5 PDB 3U5Z 3U5Z 5 GCAGACACTACGAGTACATA ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3U5Z B 6 ? 324 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 ? 1 2 ? 1 1 ? 2 2 ? 2 3 ? 2 4 ? 2 5 ? 2 6 ? 2 1 ? 3 2 ? 3 1 ? 4 2 ? 4 3 ? 4 4 ? 4 1 ? 5 2 ? 5 1 ? 6 2 ? 6 1 ? 7 2 ? 7 3 ? 7 4 ? 7 1 ? 8 2 ? 8 1 ? 9 2 ? 9 3 ? 9 4 ? 9 5 ? 9 6 ? 9 7 ? 9 8 ? 9 1 ? 10 2 ? 10 1 ? 11 2 ? 11 1 ? 12 2 ? 12 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'chain D and resid 1:16' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'chain N and resid 1:16' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain A and resid 1:16' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain B and resid 1:16' 3 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain C and resid 1:16' 4 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain K and resid 1:16' 5 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain L and resid 1:16' 6 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'chain M and resid 1:16' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'chain A and resid 17:158' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'chain K and resid 17:158' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'chain B and resid 17:158' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'chain C and resid 17:158' 3 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'chain L and resid 17:158' 4 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'chain M and resid 17:158' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 'chain D and resid 17:158' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 'chain N and resid 17:158' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 'chain A and resid 159:230' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 'chain K and resid 159:230' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 'chain B and resid 159:230' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 'chain C and resid 159:230' 3 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 'chain L and resid 159:230' 4 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 'chain M and resid 159:230' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 'chain D and resid 159:230' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 'chain N and resid 159:230' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain A and resid 234:316' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain B and resid 234:316' 3 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain C and resid 234:316' 4 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain D and resid 234:316' 5 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain K and resid 234:316' 6 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain L and resid 234:316' 7 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain M and resid 234:316' 8 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 'chain N and resid 234:316' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 'chain E and resid 1:34' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 'chain O and resid 1:34' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 'chain E and resid 36:111' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 'chain O and resid 36:111' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 'chain E and resid 112:199' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 'chain O and resid 112:199' # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? 8 ? 9 ? 10 ? 11 ? 12 ? # _struct.entry_id 3U5Z _struct.title 'Structure of T4 Bacteriophage clamp loader bound to the T4 clamp, primer-template DNA, and ATP analog' _struct.pdbx_descriptor 'DNA polymerase accessory protein 44, DNA polymerase accessory protein 62, DNA polymerase processivity component' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3U5Z _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' _struct_keywords.text 'AAA+, ATP hydrolase, clamp loader, sliding clamp, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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H ASN 183 C ? ? ? 1_555 H MSE 184 N ? ? F ASN 7183 F MSE 7184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale29 covale ? ? H MSE 184 C ? ? ? 1_555 H ALA 185 N ? ? F MSE 7184 F ALA 7185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale30 covale ? ? H ASN 186 C ? ? ? 1_555 H MSE 187 N ? ? F ASN 7186 F MSE 7187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale31 covale ? ? H MSE 187 C ? ? ? 1_555 H LYS 188 N ? ? F MSE 7187 F LYS 7188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale32 covale ? ? H LYS 188 C ? ? ? 1_555 H MSE 189 N ? ? F LYS 7188 F MSE 7189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale33 covale ? ? H MSE 189 C ? ? ? 1_555 H GLN 190 N ? ? F MSE 7189 F GLN 7190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale34 covale ? ? P MSE 1 C ? ? ? 1_555 P LYS 2 N ? ? Q MSE 5001 Q LYS 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale35 covale ? ? P ILE 21 C ? ? ? 1_555 P MSE 22 N ? ? Q ILE 5021 Q MSE 5022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale36 covale ? ? P MSE 22 C ? ? ? 1_555 P LEU 23 N ? ? Q MSE 5022 Q LEU 5023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale37 covale ? ? P ILE 29 C ? ? ? 1_555 P MSE 30 N ? ? Q ILE 5029 Q MSE 5030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale38 covale ? ? P MSE 30 C ? ? ? 1_555 P THR 31 N ? ? Q MSE 5030 Q THR 5031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale39 covale ? ? P ASN 183 C ? ? ? 1_555 P MSE 184 N ? ? Q ASN 5183 Q MSE 5184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale40 covale ? ? P MSE 184 C ? ? ? 1_555 P ALA 185 N ? ? Q MSE 5184 Q ALA 5185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale41 covale ? ? P ASN 186 C ? ? ? 1_555 P MSE 187 N ? ? Q ASN 5186 Q MSE 5187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale42 covale ? ? P MSE 187 C ? ? ? 1_555 P LYS 188 N ? ? Q MSE 5187 Q LYS 5188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale43 covale ? ? P LYS 188 C ? ? ? 1_555 P MSE 189 N ? ? Q LYS 5188 Q MSE 5189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale44 covale ? ? P MSE 189 C ? ? ? 1_555 P GLN 190 N ? ? Q MSE 5189 Q GLN 5190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale45 covale ? ? Q MSE 1 C ? ? ? 1_555 Q LYS 2 N ? ? R MSE 6001 R LYS 6002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale46 covale ? ? Q ILE 21 C ? ? ? 1_555 Q MSE 22 N ? ? R ILE 6021 R MSE 6022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale47 covale ? ? Q MSE 22 C ? ? ? 1_555 Q LEU 23 N ? ? R MSE 6022 R LEU 6023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale48 covale ? ? Q ILE 29 C ? ? ? 1_555 Q MSE 30 N ? ? R ILE 6029 R MSE 6030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale49 covale ? ? Q MSE 30 C ? ? ? 1_555 Q THR 31 N ? ? R MSE 6030 R THR 6031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale50 covale ? ? Q ASN 183 C ? ? ? 1_555 Q MSE 184 N ? ? R ASN 6183 R MSE 6184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale51 covale ? ? Q MSE 184 C ? ? ? 1_555 Q ALA 185 N ? ? R MSE 6184 R ALA 6185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale52 covale ? ? Q ASN 186 C ? ? ? 1_555 Q MSE 187 N ? ? R ASN 6186 R MSE 6187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale53 covale ? ? Q MSE 187 C ? ? ? 1_555 Q LYS 188 N ? ? R MSE 6187 R LYS 6188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale54 covale ? ? Q LYS 188 C ? ? ? 1_555 Q MSE 189 N ? ? R LYS 6188 R MSE 6189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale55 covale ? ? Q MSE 189 C ? ? ? 1_555 Q GLN 190 N ? ? R MSE 6189 R GLN 6190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale56 covale ? ? R MSE 1 C ? ? ? 1_555 R LYS 2 N ? ? P MSE 7001 P LYS 7002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale57 covale ? ? R ILE 21 C ? ? ? 1_555 R MSE 22 N ? ? P ILE 7021 P MSE 7022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale58 covale ? ? R MSE 22 C ? ? ? 1_555 R LEU 23 N ? ? P MSE 7022 P LEU 7023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale59 covale ? ? R ILE 29 C ? ? ? 1_555 R MSE 30 N ? ? P ILE 7029 P MSE 7030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale60 covale ? ? R MSE 30 C ? ? ? 1_555 R THR 31 N ? ? P MSE 7030 P THR 7031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale61 covale ? ? R ASN 183 C ? ? ? 1_555 R MSE 184 N ? ? P ASN 7183 P MSE 7184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale62 covale ? ? R MSE 184 C ? ? ? 1_555 R ALA 185 N ? ? P MSE 7184 P ALA 7185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale63 covale ? ? R ASN 186 C ? ? ? 1_555 R MSE 187 N ? ? P ASN 7186 P MSE 7187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale64 covale ? ? R MSE 187 C ? ? ? 1_555 R LYS 188 N ? ? P MSE 7187 P LYS 7188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? covale65 covale ? ? R LYS 188 C ? ? ? 1_555 R MSE 189 N ? ? P LYS 7188 P MSE 7189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale66 covale ? ? R MSE 189 C ? ? ? 1_555 R GLN 190 N ? ? P MSE 7189 P GLN 7190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? metalc1 metalc ? ? A GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? B GLU 108 B MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc2 metalc ? ? B GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? C GLU 108 C MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc3 metalc ? ? C THR 62 OG1 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? D THR 57 D MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc4 metalc ? ? M GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? N GLU 108 N MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc5 metalc ? ? L GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? M GLU 108 M MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? metalc6 metalc ? ? CA 08T . O1B ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? L 08T 700 L MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc7 metalc ? ? IA ADP . O1B ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? O ADP 700 O MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc8 metalc ? ? B THR 62 OG1 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? C THR 57 C MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.670 ? metalc9 metalc ? ? K THR 62 OG1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? L THR 57 L MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? metalc10 metalc ? ? U 08T . O1B ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? B 08T 700 B MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc11 metalc ? ? L THR 62 OG1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? M THR 57 M MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc12 metalc ? ? C GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? D GLU 108 D MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc13 metalc ? ? M THR 62 OG1 ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? N THR 57 N MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc14 metalc ? ? K GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? L GLU 108 L MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc15 metalc ? ? W 08T . O1B ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? C 08T 700 C MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? metalc16 metalc ? ? M GLU 131 OE1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? N GLU 126 M MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.885 ? metalc17 metalc ? ? D THR 62 OG1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? E THR 57 E MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? metalc18 metalc ? ? AA ADP . O2A ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? E ADP 700 E MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.952 ? metalc19 metalc ? ? AA ADP . O3B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? E ADP 700 E MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? metalc20 metalc ? ? IA ADP . O3B ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? O ADP 700 O MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.983 ? hydrog1 hydrog ? ? I DA 12 N1 ? ? ? 1_555 J DT 19 N3 ? ? I DA 12 J DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? hydrog2 hydrog ? ? I DT 13 N3 ? ? ? 1_555 J DA 18 N1 ? ? I DT 13 J DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? hydrog3 hydrog ? ? I DG 14 N1 ? ? ? 1_555 J DC 17 N3 ? ? I DG 14 J DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? hydrog4 hydrog ? ? I DT 15 N3 ? ? ? 1_555 J DA 16 N1 ? ? I DT 15 J DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? I DT 15 O4 ? ? ? 1_555 J DA 16 N6 ? ? I DT 15 J DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? I DA 16 N1 ? ? ? 1_555 J DG 14 N2 ? ? I DA 16 J DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DG MISPAIR' ? ? hydrog7 hydrog ? ? I DA 16 N1 ? ? ? 1_555 J DT 15 N3 ? ? I DA 16 J DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? I DA 16 N6 ? ? ? 1_555 J DT 15 O4 ? ? I DA 16 J DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? I DC 17 O2 ? ? ? 1_555 J DG 14 N2 ? ? I DC 17 J DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? hydrog10 hydrog ? ? I DT 18 N3 ? ? ? 1_555 J DA 13 N1 ? ? I DT 18 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog11 hydrog ? ? I DT 18 O4 ? ? ? 1_555 J DA 13 N6 ? ? I DT 18 J DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog12 hydrog ? ? I DC 19 O2 ? ? ? 1_555 J DG 12 N2 ? ? I DC 19 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? hydrog13 hydrog ? ? I DG 20 N1 ? ? ? 1_555 J DC 11 N3 ? ? I DG 20 J DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog14 hydrog ? ? I DG 20 N2 ? ? ? 1_555 J DC 11 O2 ? ? I DG 20 J DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog15 hydrog ? ? I DG 20 O6 ? ? ? 1_555 J DC 11 N4 ? ? I DG 20 J DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog16 hydrog ? ? I DT 21 N3 ? ? ? 1_555 J DA 10 N1 ? ? I DT 21 J DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog17 hydrog ? ? I DT 21 O4 ? ? ? 1_555 J DA 10 N6 ? ? I DT 21 J DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog18 hydrog ? ? I DA 22 N1 ? ? ? 1_555 J DT 9 N3 ? ? I DA 22 J DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? I DA 22 N6 ? ? ? 1_555 J DT 9 O4 ? ? I DA 22 J DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? I DG 23 N1 ? ? ? 1_555 J DC 8 N3 ? ? I DG 23 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? I DG 23 N2 ? ? ? 1_555 J DC 8 O2 ? ? I DG 23 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog22 hydrog ? ? I DG 23 O6 ? ? ? 1_555 J DC 8 N4 ? ? I DG 23 J DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog23 hydrog ? ? I DT 24 N3 ? ? ? 1_555 J DA 7 N1 ? ? I DT 24 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog24 hydrog ? ? I DT 24 O4 ? ? ? 1_555 J DA 7 N6 ? ? I DT 24 J DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? I DG 25 N1 ? ? ? 1_555 J DC 6 O2 ? ? I DG 25 J DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog26 hydrog ? ? I DG 25 N2 ? ? ? 1_555 J DC 6 N3 ? ? I DG 25 J DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog27 hydrog ? ? I DT 26 N3 ? ? ? 1_555 J DA 5 N1 ? ? I DT 26 J DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? I DT 26 O4 ? ? ? 1_555 J DA 5 N6 ? ? I DT 26 J DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog29 hydrog ? ? I DC 27 N3 ? ? ? 1_555 J DG 4 N1 ? ? I DC 27 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog30 hydrog ? ? I DC 27 N4 ? ? ? 1_555 J DG 4 O6 ? ? I DC 27 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? I DC 27 O2 ? ? ? 1_555 J DG 4 N2 ? ? I DC 27 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? I DT 28 N3 ? ? ? 1_555 J DA 3 N1 ? ? I DT 28 J DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? I DT 28 O4 ? ? ? 1_555 J DA 3 N6 ? ? I DT 28 J DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? I DG 29 N1 ? ? ? 1_555 J DC 2 N3 ? ? I DG 29 J DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? I DG 29 N2 ? ? ? 1_555 J DC 2 O2 ? ? I DG 29 J DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? I DG 29 O6 ? ? ? 1_555 J DC 2 N4 ? ? I DG 29 J DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? I DC 30 N3 ? ? ? 1_555 J DG 1 N1 ? ? I DC 30 J DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog38 hydrog ? ? I DC 30 N4 ? ? ? 1_555 J DG 1 O6 ? ? I DC 30 J DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog39 hydrog ? ? I DC 30 O2 ? ? ? 1_555 J DG 1 N2 ? ? I DC 30 J DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog40 hydrog ? ? S DA 12 N1 ? ? ? 1_555 T DT 19 N3 ? ? S DA 12 T DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? hydrog41 hydrog ? ? S DT 13 N3 ? ? ? 1_555 T DA 18 N1 ? ? S DT 13 T DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog42 hydrog ? ? S DT 13 O4 ? ? ? 1_555 T DA 18 N6 ? ? S DT 13 T DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog43 hydrog ? ? S DG 14 N1 ? ? ? 1_555 T DC 17 O2 ? ? S DG 14 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog44 hydrog ? ? S DG 14 N2 ? ? ? 1_555 T DC 17 N3 ? ? S DG 14 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog45 hydrog ? ? S DT 15 N3 ? ? ? 1_555 T DA 16 N1 ? ? S DT 15 T DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? S DT 15 O4 ? ? ? 1_555 T DA 16 N6 ? ? S DT 15 T DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? S DA 16 N1 ? ? ? 1_555 T DG 14 N1 ? ? S DA 16 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? hydrog48 hydrog ? ? S DA 16 N6 ? ? ? 1_555 T DG 14 O6 ? ? S DA 16 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? hydrog49 hydrog ? ? S DA 16 N1 ? ? ? 1_555 T DT 15 N3 ? ? S DA 16 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog50 hydrog ? ? S DA 16 N6 ? ? ? 1_555 T DT 15 O4 ? ? S DA 16 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog51 hydrog ? ? S DC 17 N3 ? ? ? 1_555 T DG 14 N1 ? ? S DC 17 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog52 hydrog ? ? S DC 17 N4 ? ? ? 1_555 T DG 14 O6 ? ? S DC 17 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog53 hydrog ? ? S DC 17 O2 ? ? ? 1_555 T DG 14 N2 ? ? S DC 17 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog54 hydrog ? ? S DT 18 N3 ? ? ? 1_555 T DA 13 N1 ? ? S DT 18 T DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog55 hydrog ? ? S DT 18 O4 ? ? ? 1_555 T DA 13 N6 ? ? S DT 18 T DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog56 hydrog ? ? S DC 19 O2 ? ? ? 1_555 T DG 12 N2 ? ? S DC 19 T DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? hydrog57 hydrog ? ? S DG 20 N1 ? ? ? 1_555 T DC 11 O2 ? ? S DG 20 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? hydrog58 hydrog ? ? S DT 21 N3 ? ? ? 1_555 T DA 10 N1 ? ? S DT 21 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog59 hydrog ? ? S DT 21 O4 ? ? ? 1_555 T DA 10 N6 ? ? 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'DC-DG PAIR' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 54 A . ? SER 49 B PRO 55 A ? PRO 50 B 1 -26.36 2 SER 54 B . ? SER 49 C PRO 55 B ? PRO 50 C 1 -27.69 3 SER 54 C . ? SER 49 D PRO 55 C ? PRO 50 D 1 -26.74 4 SER 54 D . ? 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? -120.07 -54.91 85 1 ALA N 259 ? ? -73.75 -74.81 86 1 PRO O 26 ? ? -73.48 -169.64 87 1 ALA O 27 ? ? -71.10 -72.06 88 1 PRO O 43 ? ? -71.10 -169.65 89 1 GLU O 108 ? ? 57.67 75.21 90 1 ARG O 111 ? ? -67.67 -174.70 91 1 SER O 112 ? ? -95.59 -62.14 92 1 PHE O 124 ? ? -95.20 -60.64 93 1 LYS O 199 ? ? -51.09 -71.80 94 1 ALA O 259 ? ? -73.89 -74.35 95 1 PHE K 4 ? ? 74.02 -29.29 96 1 LYS K 5 ? ? 49.53 12.92 97 1 ILE K 8 ? ? -38.79 115.04 98 1 GLU K 34 ? ? 39.14 69.13 99 1 ALA K 36 ? ? -123.03 -73.76 100 1 GLU K 37 ? ? 62.49 -121.14 101 1 ASN K 38 ? ? 48.19 75.15 102 1 THR K 51 ? ? -126.70 -168.97 103 1 SER K 54 ? ? 60.85 62.59 104 1 ALA K 56 ? ? 68.08 -17.75 105 1 ASN K 83 ? ? -91.54 -67.45 106 1 LYS K 106 ? ? 170.80 156.50 107 1 ARG K 107 ? ? -172.38 148.06 108 1 LYS K 150 ? ? 60.08 -9.02 109 1 THR K 163 ? ? -38.42 129.97 110 1 LEU K 185 ? ? -113.92 -76.95 111 1 ILE Q 5017 ? ? -94.62 -60.54 112 1 ARG Q 5087 ? ? -94.92 -61.60 113 1 GLU Q 5144 ? ? 48.98 70.61 114 1 SER Q 5158 ? ? 76.88 -31.18 115 1 LEU Q 5169 ? ? -88.12 -78.99 116 1 HIS Q 5213 ? ? -95.74 -64.78 117 1 HIS Q 5226 ? ? 178.30 159.98 118 1 ASN R 6068 ? ? -66.43 -176.16 119 1 ASP R 6070 ? ? -52.62 -70.24 120 1 ASN R 6104 ? ? 66.86 -8.71 121 1 VAL R 6111 ? ? 170.80 167.82 122 1 GLN R 6134 ? ? 61.16 72.93 123 1 LEU R 6160 ? ? 39.22 39.80 124 1 THR R 6161 ? ? -98.52 -66.16 125 1 PRO R 6191 ? ? -59.17 -167.90 126 1 SER P 7045 ? ? -46.94 -71.21 127 1 ASP P 7085 ? ? -68.46 -175.67 128 1 ALA P 7086 ? ? -59.56 -72.76 129 1 PRO P 7106 ? ? -69.44 72.37 130 1 PRO P 7110 ? ? -59.17 -177.63 131 1 THR P 7116 ? ? -161.61 -166.64 132 1 LEU P 7169 ? ? -108.38 -62.29 133 1 ASN P 7176 ? ? 175.05 157.34 134 1 PRO P 7191 ? ? -58.88 -178.92 135 1 LYS P 7201 ? ? -130.60 -45.45 136 1 LYS P 7203 ? ? -60.00 -3.72 137 1 ALA P 7219 ? ? -69.57 -174.44 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 ASN B 200 ? ? PHE B 201 ? ? -149.20 2 1 THR C 229 ? ? ASN C 230 ? ? -139.00 3 1 SER D 0 ? ? MET D 1 ? ? 147.43 4 1 ASN L 200 ? ? PHE L 201 ? ? -148.17 5 1 ASN L 230 ? ? ASP L 231 ? ? 148.60 6 1 THR M 229 ? ? ASN M 230 ? ? -137.99 7 1 ASN M 230 ? ? ASP M 231 ? ? -148.70 8 1 ASN N 230 ? ? ASP N 231 ? ? -127.49 9 1 GLY N 233 ? ? ALA N 234 ? ? 143.69 10 1 GLY K 109 ? ? LYS K 110 ? ? -149.75 # loop_ _pdbx_validate_main_chain_plane.id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_model_num _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_comp_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_asym_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_seq_id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_ins_code _pdbx_validate_main_chain_plane.label_alt_id _pdbx_validate_main_chain_plane.improper_torsion_angle 1 1 ASP A 7 ? ? 10.43 2 1 ASP K 7 ? ? -11.71 # _pdbx_validate_planes.id 1 _pdbx_validate_planes.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_planes.auth_comp_id DC _pdbx_validate_planes.auth_asym_id I _pdbx_validate_planes.auth_seq_id 30 _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code ? _pdbx_validate_planes.label_alt_id ? _pdbx_validate_planes.rmsd 0.364 _pdbx_validate_planes.type 'SIDE CHAIN' # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 A ARG 107 ? CB ? E ARG 106 CB 2 1 Y 1 A ARG 107 ? CG ? E ARG 106 CG 3 1 Y 1 A ARG 107 ? CD ? E ARG 106 CD 4 1 Y 1 A ARG 107 ? NE ? E ARG 106 NE 5 1 Y 1 A ARG 107 ? CZ ? E ARG 106 CZ 6 1 Y 1 A ARG 107 ? NH1 ? E ARG 106 NH1 7 1 Y 1 A ARG 107 ? NH2 ? E ARG 106 NH2 8 1 Y 1 K ARG 107 ? CB ? O ARG 106 CB 9 1 Y 1 K ARG 107 ? CG ? O ARG 106 CG 10 1 Y 1 K ARG 107 ? CD ? O ARG 106 CD 11 1 Y 1 K ARG 107 ? NE ? O ARG 106 NE 12 1 Y 1 K ARG 107 ? CZ ? O ARG 106 CZ 13 1 Y 1 K ARG 107 ? NH1 ? O ARG 106 NH1 14 1 Y 1 K ARG 107 ? NH2 ? O ARG 106 NH2 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 B GLY -4 ? A GLY 1 2 1 Y 1 B PRO -3 ? A PRO 2 3 1 Y 1 B GLY -2 ? A GLY 3 4 1 Y 1 B GLY -1 ? A GLY 4 5 1 Y 1 C GLY -4 ? B GLY 1 6 1 Y 1 C PRO -3 ? B PRO 2 7 1 Y 1 C GLY -2 ? B GLY 3 8 1 Y 1 C GLY -1 ? B GLY 4 9 1 Y 1 D GLY -4 ? C GLY 1 10 1 Y 1 D PRO -3 ? C PRO 2 11 1 Y 1 D GLY -2 ? C GLY 3 12 1 Y 1 D GLY -1 ? C GLY 4 13 1 Y 1 E GLY -4 ? D GLY 1 14 1 Y 1 E PRO -3 ? D PRO 2 15 1 Y 1 E GLY -2 ? D GLY 3 16 1 Y 1 E GLY -1 ? D GLY 4 17 1 Y 1 E SER 0 ? 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S DT 6 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3U5Z 'double helix' 3U5Z 'b-form double helix' 3U5Z 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 I DA 12 1_555 J DT 19 1_555 0.571 0.152 0.209 -20.899 -9.401 10.471 1 I_DA12:DT19_J I 12 ? J 19 ? ? ? 1 I DT 13 1_555 J DA 18 1_555 1.515 -0.130 -0.007 -5.361 0.184 11.247 2 I_DT13:DA18_J I 13 ? J 18 ? ? 1 1 I DG 14 1_555 J DC 17 1_555 0.523 0.203 0.382 -16.954 -2.670 17.941 3 I_DG14:DC17_J I 14 ? J 17 ? ? 1 1 I DT 15 1_555 J DA 16 1_555 0.939 -0.539 0.387 -3.954 -0.976 -2.025 4 I_DT15:DA16_J I 15 ? J 16 ? 20 1 1 I DA 16 1_555 J DT 15 1_555 0.233 -0.543 1.251 -4.313 6.444 1.234 5 I_DA16:DT15_J I 16 ? J 15 ? 20 1 1 I DC 17 1_555 J DG 14 1_555 -2.604 -0.008 0.717 -1.131 -2.880 12.324 6 I_DC17:DG14_J I 17 ? J 14 ? ? ? 1 I DT 18 1_555 J DA 13 1_555 -0.418 -0.010 -0.211 2.912 -11.097 -2.135 7 I_DT18:DA13_J I 18 ? J 13 ? 20 1 1 I DC 19 1_555 J DG 12 1_555 -0.225 0.351 0.171 -2.766 -8.094 13.635 8 I_DC19:DG12_J I 19 ? J 12 ? ? 1 1 I DG 20 1_555 J DC 11 1_555 0.344 -0.157 0.188 -1.345 -13.793 6.756 9 I_DG20:DC11_J I 20 ? J 11 ? 19 1 1 I DT 21 1_555 J DA 10 1_555 -0.187 -0.518 0.074 -2.622 -8.089 0.027 10 I_DT21:DA10_J I 21 ? 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T 1 ? ? ? # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DA 12 1_555 J DT 19 1_555 I DT 13 1_555 J DA 18 1_555 0.183 0.140 2.984 -0.953 1.799 41.141 0.022 -0.355 2.983 2.558 1.356 41.189 1 II_DA12DT13:DA18DT19_JJ I 12 ? 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