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'data scaling' http://www.mpimf-heidelberg.mpg.de/~kabsch/xds/html_doc/xscale_program.html ? ? 2 CNS . ? package 'Axel T. Brunger' axel.brunger@yale.edu refinement http://cns-online.org/ Fortran_77 ? 3 PDB_EXTRACT 3.005 'June 11, 2008' package PDB help@deposit.rcsb.org 'data extraction' http://sw-tools.pdb.org/apps/PDB_EXTRACT/ C++ ? 4 XDS . ? ? ? ? 'data scaling' ? ? ? 5 XDS . ? ? ? ? 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O94258 1 ? 978 ? 1 978 2 1 3IBV B 3 ? 980 ? O94258 1 ? 978 ? 1 978 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 3IBV GLY A 1 ? UNP O94258 ? ? 'expression tag' -1 1 1 3IBV PRO A 2 ? UNP O94258 ? ? 'expression tag' 0 2 2 3IBV GLY B 1 ? UNP O94258 ? ? 'expression tag' -1 3 2 3IBV PRO B 2 ? UNP O94258 ? ? 'expression tag' 0 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? monomeric 1 2 author_defined_assembly ? monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,C,D 2 1 B,E,F # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 MET A 3 ? ASP A 17 ? MET A 1 ASP A 15 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 2 GLY A 21 ? SER A 38 ? GLY A 19 SER A 36 1 ? 18 HELX_P HELX_P3 3 THR A 40 ? PHE A 49 ? THR A 38 PHE A 47 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 4 LYS A 56 ? TRP A 74 ? LYS A 54 TRP A 72 1 ? 19 HELX_P HELX_P5 5 ASN A 79 ? LEU A 97 ? ASN A 77 LEU A 95 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 6 ALA A 104 ? TYR A 122 ? ALA A 102 TYR A 120 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 7 ASP A 128 ? SER A 141 ? ASP A 126 SER A 139 1 ? 14 HELX_P HELX_P8 8 GLN A 142 ? ALA A 161 ? GLN A 140 ALA A 159 1 ? 20 HELX_P HELX_P9 9 THR A 168 ? ASP A 186 ? THR A 166 ASP A 184 1 ? 19 HELX_P HELX_P10 10 ASP A 186 ? ALA A 204 ? ASP A 184 ALA A 202 1 ? 19 HELX_P HELX_P11 11 ASN A 206 ? VAL A 221 ? ASN A 204 VAL A 219 1 ? 16 HELX_P HELX_P12 12 ASN A 225 ? ASN A 231 ? ASN A 223 ASN A 229 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 13 ASN A 231 ? LEU A 242 ? ASN A 229 LEU A 240 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 14 ILE A 244 ? LYS A 261 ? ILE A 242 LYS A 259 1 ? 18 HELX_P HELX_P15 15 LYS A 264 ? SER A 282 ? LYS A 262 SER A 280 1 ? 19 HELX_P HELX_P16 16 ASP A 290 ? SER A 313 ? ASP A 288 SER A 311 1 ? 24 HELX_P HELX_P17 17 SER A 319 ? LEU A 333 ? SER A 317 LEU A 331 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 18 LEU A 333 ? SER A 342 ? LEU A 331 SER A 340 1 ? 10 HELX_P HELX_P19 19 TYR A 345 ? ALA A 351 ? TYR A 343 ALA A 349 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 20 VAL A 352 ? SER A 367 ? VAL A 350 SER A 365 1 ? 16 HELX_P HELX_P21 21 SER A 373 ? LYS A 390 ? SER A 371 LYS A 388 1 ? 18 HELX_P HELX_P22 22 GLU A 407 ? ASP A 429 ? GLU A 405 ASP A 427 1 ? 23 HELX_P HELX_P23 23 ASP A 429 ? ALA A 449 ? ASP A 427 ALA A 447 1 ? 21 HELX_P HELX_P24 24 SER A 452 ? PHE A 470 ? SER A 450 PHE A 468 1 ? 19 HELX_P HELX_P25 25 GLY A 476 ? PHE A 480 ? GLY A 474 PHE A 478 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 THR A 489 ? SER A 501 ? THR A 487 SER A 499 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 27 HIS A 508 ? TYR A 522 ? HIS A 506 TYR A 520 1 ? 15 HELX_P HELX_P28 28 ALA A 523 ? TYR A 528 ? ALA A 521 TYR A 526 5 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 ALA A 532 ? VAL A 541 ? ALA A 530 VAL A 539 1 ? 10 HELX_P HELX_P30 30 VAL A 553 ? ILE A 568 ? VAL A 551 ILE A 566 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 31 TYR A 575 ? LEU A 583 ? TYR A 573 LEU A 581 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 32 GLY A 584 ? ASN A 588 ? GLY A 582 ASN A 586 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 33 THR A 603 ? ASN A 610 ? THR A 601 ASN A 608 1 ? 8 HELX_P HELX_P34 34 ASP A 612 ? GLY A 630 ? ASP A 610 GLY A 628 1 ? 19 HELX_P HELX_P35 35 THR A 633 ? SER A 657 ? THR A 631 SER A 655 1 ? 25 HELX_P HELX_P36 36 GLU A 664 ? GLY A 682 ? GLU A 662 GLY A 680 1 ? 19 HELX_P HELX_P37 37 ALA A 692 ? MET A 711 ? ALA A 690 MET A 709 1 ? 20 HELX_P HELX_P38 38 ASN A 714 ? ILE A 729 ? ASN A 712 ILE A 727 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 39 VAL A 732 ? LEU A 737 ? VAL A 730 LEU A 735 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 40 LYS A 739 ? ILE A 751 ? LYS A 737 ILE A 749 1 ? 13 HELX_P HELX_P41 41 GLU A 755 ? TYR A 770 ? GLU A 753 TYR A 768 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 42 MET A 774 ? LEU A 793 ? MET A 772 LEU A 791 1 ? 20 HELX_P HELX_P43 43 ASP A 801 ? LYS A 823 ? ASP A 799 LYS A 821 1 ? 23 HELX_P HELX_P44 44 GLY A 826 ? PHE A 830 ? GLY A 824 PHE A 828 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 45 THR A 831 ? VAL A 836 ? THR A 829 VAL A 834 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 46 TYR A 837 ? ALA A 849 ? TYR A 835 ALA A 847 1 ? 13 HELX_P HELX_P47 47 PRO A 855 ? LEU A 871 ? PRO A 853 LEU A 869 1 ? 17 HELX_P HELX_P48 48 GLY A 880 ? MET A 895 ? GLY A 878 MET A 893 1 ? 16 HELX_P HELX_P49 49 PRO A 896 ? ASN A 898 ? PRO A 894 ASN A 896 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 50 LEU A 909 ? VAL A 937 ? LEU A 907 VAL A 935 1 ? 29 HELX_P HELX_P51 51 VAL A 947 ? ALA A 955 ? VAL A 945 ALA A 953 1 ? 9 HELX_P HELX_P52 52 ILE A 972 ? SER A 977 ? ILE A 970 SER A 975 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 53 MET B 3 ? ASP B 17 ? MET B 1 ASP B 15 1 ? 15 HELX_P HELX_P54 54 ILE B 23 ? SER B 38 ? ILE B 21 SER B 36 1 ? 16 HELX_P HELX_P55 55 THR B 40 ? PHE B 49 ? THR B 38 PHE B 47 1 ? 10 HELX_P HELX_P56 56 LYS B 56 ? TRP B 74 ? LYS B 54 TRP B 72 1 ? 19 HELX_P HELX_P57 57 ASN B 79 ? GLU B 96 ? ASN B 77 GLU B 94 1 ? 18 HELX_P HELX_P58 58 PRO B 103 ? TYR B 122 ? PRO B 101 TYR B 120 1 ? 20 HELX_P HELX_P59 59 ASP B 128 ? SER B 141 ? ASP B 126 SER B 139 1 ? 14 HELX_P HELX_P60 60 GLN B 142 ? ALA B 161 ? GLN B 140 ALA B 159 1 ? 20 HELX_P HELX_P61 61 THR B 168 ? ASP B 186 ? THR B 166 ASP B 184 1 ? 19 HELX_P HELX_P62 62 ASP B 186 ? ALA B 204 ? ASP B 184 ALA B 202 1 ? 19 HELX_P HELX_P63 63 ASN B 206 ? VAL B 221 ? ASN B 204 VAL B 219 1 ? 16 HELX_P HELX_P64 64 ASN B 225 ? VAL B 230 ? ASN B 223 VAL B 228 1 ? 6 HELX_P HELX_P65 65 GLU B 232 ? PHE B 241 ? GLU B 230 PHE B 239 1 ? 10 HELX_P HELX_P66 66 LEU B 242 ? GLU B 246 ? LEU B 240 GLU B 244 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 67 LEU B 247 ? ASN B 260 ? LEU B 245 ASN B 258 1 ? 14 HELX_P HELX_P68 68 LYS B 264 ? LYS B 283 ? LYS B 262 LYS B 281 1 ? 20 HELX_P HELX_P69 69 ASP B 290 ? SER B 313 ? ASP B 288 SER B 311 1 ? 24 HELX_P HELX_P70 70 SER B 319 ? LEU B 333 ? SER B 317 LEU B 331 1 ? 15 HELX_P HELX_P71 71 LEU B 333 ? SER B 342 ? LEU B 331 SER B 340 1 ? 10 HELX_P HELX_P72 72 TYR B 345 ? ALA B 351 ? TYR B 343 ALA B 349 1 ? 7 HELX_P HELX_P73 73 VAL B 352 ? SER B 367 ? VAL B 350 SER B 365 1 ? 16 HELX_P HELX_P74 74 SER B 373 ? LYS B 390 ? SER B 371 LYS B 388 1 ? 18 HELX_P HELX_P75 75 GLU B 407 ? ASP B 429 ? GLU B 405 ASP B 427 1 ? 23 HELX_P HELX_P76 76 ASP B 429 ? ALA B 449 ? ASP B 427 ALA B 447 1 ? 21 HELX_P HELX_P77 77 SER B 452 ? GLY B 471 ? SER B 450 GLY B 469 1 ? 20 HELX_P HELX_P78 78 GLY B 476 ? PHE B 480 ? GLY B 474 PHE B 478 5 ? 5 HELX_P HELX_P79 79 THR B 489 ? SER B 501 ? THR B 487 SER B 499 1 ? 13 HELX_P HELX_P80 80 GLN B 502 ? ARG B 505 ? GLN B 500 ARG B 503 5 ? 4 HELX_P HELX_P81 81 HIS B 508 ? TYR B 522 ? HIS B 506 TYR B 520 1 ? 15 HELX_P HELX_P82 82 ALA B 523 ? TYR B 528 ? ALA B 521 TYR B 526 5 ? 6 HELX_P HELX_P83 83 ALA B 532 ? VAL B 541 ? ALA B 530 VAL B 539 1 ? 10 HELX_P HELX_P84 84 ARG B 552 ? ILE B 568 ? ARG B 550 ILE B 566 1 ? 17 HELX_P HELX_P85 85 LYS B 570 ? ASN B 574 ? LYS B 568 ASN B 572 5 ? 5 HELX_P HELX_P86 86 TYR B 575 ? GLY B 584 ? TYR B 573 GLY B 582 1 ? 10 HELX_P HELX_P87 87 ASP B 585 ? LEU B 587 ? ASP B 583 LEU B 585 5 ? 3 HELX_P HELX_P88 88 THR B 603 ? ASN B 610 ? THR B 601 ASN B 608 1 ? 8 HELX_P HELX_P89 89 ASP B 612 ? GLY B 630 ? ASP B 610 GLY B 628 1 ? 19 HELX_P HELX_P90 90 THR B 633 ? LEU B 656 ? THR B 631 LEU B 654 1 ? 24 HELX_P HELX_P91 91 SER B 657 ? ASP B 659 ? SER B 655 ASP B 657 5 ? 3 HELX_P HELX_P92 92 GLU B 664 ? GLY B 682 ? GLU B 662 GLY B 680 1 ? 19 HELX_P HELX_P93 93 VAL B 691 ? MET B 711 ? VAL B 689 MET B 709 1 ? 21 HELX_P HELX_P94 94 GLU B 715 ? VAL B 732 ? GLU B 713 VAL B 730 1 ? 18 HELX_P HELX_P95 95 VAL B 732 ? LEU B 737 ? VAL B 730 LEU B 735 1 ? 6 HELX_P HELX_P96 96 LYS B 739 ? SER B 750 ? LYS B 737 SER B 748 1 ? 12 HELX_P HELX_P97 97 GLU B 755 ? TYR B 770 ? GLU B 753 TYR B 768 1 ? 16 HELX_P HELX_P98 98 MET B 774 ? LEU B 793 ? MET B 772 LEU B 791 1 ? 20 HELX_P HELX_P99 99 ASP B 801 ? GLY B 824 ? ASP B 799 GLY B 822 1 ? 24 HELX_P HELX_P100 100 TYR B 837 ? PHE B 848 ? TYR B 835 PHE B 846 1 ? 12 HELX_P HELX_P101 101 ALA B 856 ? LEU B 871 ? ALA B 854 LEU B 869 1 ? 16 HELX_P HELX_P102 102 GLY B 880 ? MET B 895 ? GLY B 878 MET B 893 1 ? 16 HELX_P HELX_P103 103 VAL B 911 ? GLU B 924 ? VAL B 909 GLU B 922 1 ? 14 HELX_P HELX_P104 104 LYS B 931 ? VAL B 937 ? LYS B 929 VAL B 935 1 ? 7 HELX_P HELX_P105 105 ASP B 946 ? SER B 957 ? ASP B 944 SER B 955 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A ASP 346 OD1 ? ? ? 1_555 C CA . CA ? ? A ASP 344 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? ? metalc2 metalc ? ? A ASP 346 OD2 ? ? ? 1_555 C CA . CA ? ? A ASP 344 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? ? metalc3 metalc ? ? B GLU 253 OE1 ? ? ? 1_555 F CA . CA ? ? B GLU 251 B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? ? metalc4 metalc ? ? B GLU 253 OE2 ? ? ? 1_555 F CA . CA ? ? B GLU 251 B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? ? metalc5 metalc ? ? B ASP 346 OD1 ? ? ? 1_555 E CA . CA ? ? B ASP 344 B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? ? metalc6 metalc ? ? B ASP 346 OD2 ? ? ? 1_555 E CA . CA ? ? B ASP 344 B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OD1 ? 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