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'X-RAY DIFFRACTION' # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 3.00 _refine_ls_shell.d_res_low 3.081 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 2677 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.297 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 97.54 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.388 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 141 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 2 given ? -0.988584 0.039094 -0.145508 0.054861 0.992854 -0.105978 0.140325 -0.112751 -0.983665 136.62363 -3.28051 16.33627 3 given ? -0.994212 -0.053887 -0.092947 0.047685 -0.996565 0.067701 -0.096276 0.062876 0.993367 135.74771 -4.44907 -19.35456 # _database_PDB_matrix.entry_id 3UEL _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 3UEL _struct.title 'Crystal structure of the catalytic domain of rat poly (ADP-ribose) glycohydrolase bound to ADP-HPD' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3UEL _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE _struct_keywords.text 'mammalian PARG, macrodomain, ADP-HPD, HYDROLASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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Q9QYM2 385 ? 972 ? 385 972 2 1 3UEL B 1 ? 588 ? Q9QYM2 385 ? 972 ? 385 972 3 1 3UEL C 1 ? 588 ? Q9QYM2 385 ? 972 ? 385 972 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 2 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 3 author_and_software_defined_assembly PISA monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,D 2 1 B,E 3 1 C,F # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 PRO A 69 ? 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PRO A 759 ILE A 762 5 ? 4 HELX_P HELX_P16 16 VAL A 379 ? THR A 384 ? VAL A 763 THR A 768 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 TYR A 407 ? TYR A 411 ? TYR A 791 TYR A 795 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 18 ARG A 443 ? PHE A 448 ? ARG A 827 PHE A 832 5 ? 6 HELX_P HELX_P19 19 VAL A 449 ? LEU A 465 ? VAL A 833 LEU A 849 1 ? 17 HELX_P HELX_P20 20 ASP A 490 ? GLU A 506 ? ASP A 874 GLU A 890 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 21 ASP A 516 ? ARG A 533 ? ASP A 900 ARG A 917 1 ? 18 HELX_P HELX_P22 22 ASN A 536 ? CYS A 552 ? ASN A 920 CYS A 936 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 23 LYS A 563 ? SER A 574 ? LYS A 947 SER A 958 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 24 PRO B 69 ? MET B 73 ? PRO B 453 MET B 457 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 25 ARG B 147 ? LEU B 156 ? ARG B 531 LEU B 540 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 26 ARG B 161 ? ASN B 173 ? ARG B 545 ASN B 557 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 27 VAL B 174 ? SER B 177 ? VAL B 558 SER B 561 5 ? 4 HELX_P HELX_P28 28 PHE B 182 ? LYS B 191 ? PHE B 566 LYS B 575 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 29 GLU B 194 ? SER B 204 ? GLU B 578 SER B 588 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 30 SER B 204 ? CYS B 215 ? SER B 588 CYS B 599 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 31 LEU B 216 ? ILE B 219 ? LEU B 600 ILE B 603 5 ? 4 HELX_P HELX_P32 32 GLN B 239 ? PHE B 251 ? GLN B 623 PHE B 635 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 33 GLU B 264 ? TYR B 268 ? GLU B 648 TYR B 652 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 34 ASN B 272 ? GLU B 278 ? ASN B 656 GLU B 662 5 ? 7 HELX_P HELX_P35 35 SER B 282 ? LYS B 301 ? SER B 666 LYS B 685 1 ? 20 HELX_P HELX_P36 36 THR B 337 ? GLY B 342 ? THR B 721 GLY B 726 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 37 VAL B 365 ? ASN B 374 ? VAL B 749 ASN B 758 1 ? 10 HELX_P HELX_P38 38 PRO B 375 ? ILE B 378 ? PRO B 759 ILE B 762 5 ? 4 HELX_P HELX_P39 39 VAL B 379 ? THR B 384 ? VAL B 763 THR B 768 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 40 TYR B 407 ? TYR B 411 ? TYR B 791 TYR B 795 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 41 LEU B 445 ? PHE B 448 ? LEU B 829 PHE B 832 5 ? 4 HELX_P HELX_P42 42 VAL B 449 ? LEU B 465 ? VAL B 833 LEU B 849 1 ? 17 HELX_P HELX_P43 43 ASP B 490 ? GLU B 506 ? ASP B 874 GLU B 890 1 ? 17 HELX_P HELX_P44 44 ASP B 516 ? LYS B 534 ? ASP B 900 LYS B 918 1 ? 19 HELX_P HELX_P45 45 ASN B 536 ? CYS B 552 ? ASN B 920 CYS B 936 1 ? 17 HELX_P HELX_P46 46 LYS B 563 ? GLU B 573 ? LYS B 947 GLU B 957 1 ? 11 HELX_P HELX_P47 47 PRO C 69 ? MET C 73 ? PRO C 453 MET C 457 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 48 ARG C 147 ? LEU C 156 ? ARG C 531 LEU C 540 1 ? 10 HELX_P HELX_P49 49 ARG C 161 ? ASN C 173 ? ARG C 545 ASN C 557 1 ? 13 HELX_P HELX_P50 50 VAL C 174 ? SER C 177 ? VAL C 558 SER C 561 5 ? 4 HELX_P HELX_P51 51 PHE C 182 ? LYS C 191 ? PHE C 566 LYS C 575 1 ? 10 HELX_P HELX_P52 52 GLU C 194 ? SER C 204 ? GLU C 578 SER C 588 1 ? 11 HELX_P HELX_P53 53 SER C 204 ? CYS C 215 ? SER C 588 CYS C 599 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 54 LEU C 216 ? ILE C 219 ? LEU C 600 ILE C 603 5 ? 4 HELX_P HELX_P55 55 GLN C 239 ? PHE C 251 ? GLN C 623 PHE C 635 1 ? 13 HELX_P HELX_P56 56 SER C 263 ? TYR C 268 ? SER C 647 TYR C 652 5 ? 6 HELX_P HELX_P57 57 PHE C 273 ? GLU C 278 ? 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LYS C 947 ALA C 956 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 MET 76 A . ? MET 460 A PRO 77 A ? PRO 461 A 1 -1.65 2 PHE 110 A . ? PHE 494 A PRO 111 A ? PRO 495 A 1 -1.52 3 MET 76 B . ? MET 460 B PRO 77 B ? PRO 461 B 1 8.81 4 PHE 110 B . ? PHE 494 B PRO 111 B ? PRO 495 B 1 -1.42 5 MET 76 C . ? MET 460 C PRO 77 C ? PRO 461 C 1 15.81 6 PHE 110 C . ? PHE 494 C PRO 111 C ? PRO 495 C 1 -0.47 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 10 ? B ? 2 ? C ? 2 ? D ? 10 ? E ? 2 ? F ? 2 ? G ? 10 ? H ? 2 ? I ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? parallel A 3 4 ? parallel A 4 5 ? parallel A 5 6 ? parallel A 6 7 ? anti-parallel A 7 8 ? anti-parallel A 8 9 ? anti-parallel A 9 10 ? parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? parallel D 3 4 ? parallel D 4 5 ? parallel D 5 6 ? parallel D 6 7 ? anti-parallel D 7 8 ? anti-parallel D 8 9 ? anti-parallel D 9 10 ? parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? parallel G 5 6 ? parallel G 6 7 ? anti-parallel G 7 8 ? anti-parallel G 8 9 ? anti-parallel G 9 10 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 TRP A 65 ? 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