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_entity_name_com.entity_id 1 _entity_name_com.name 'GTP-bound aEF1 alpha, EF-1-alpha, Elongation factor Tu, EF-Tu' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;GSHMAEKPHMNLVVIGHVDHGKSTLVGHLLYRLGYIEEKKLKELEEQAKSRGKESFKFAWILDKMKEERERGITIDLTFM KFETKKYVFTIIDAPGHRDFVKNMITGASQADAAILVVSARKGEFEAGMSTEGQTREHLLLARTMGIEQIIVAVNKMDAP DVNYDQKRYEFVVSVLKKFMKGLGYQVDKIPFIPVSAWKGDNLIERSPNMPWYNGPTLVEALDQLQPPAKPVDKPLRIPV QNVYSIPGAGTVPVGRVETGVLRVGDKVVFMPPGVVGEVRSIEMHYQQLQQAEPGDNIGFAVRGVSKSDIKRGDVAGHLD KPPTVAEEFEARIFVIWHPSAITVGYTPVIHVHTASVSSRIIEIKAKLDPKTGQVVEQNPQFLKAGDAAIVRFKPVKPLV VEKFSEIPQLGRFAMRDMNRTVGIGIVTDVKPAKVDIKAKLARGSGC ; ;GSHMAEKPHMNLVVIGHVDHGKSTLVGHLLYRLGYIEEKKLKELEEQAKSRGKESFKFAWILDKMKEERERGITIDLTFM 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'X-RAY DIFFRACTION' . # _database_PDB_matrix.entry_id 3WXM _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 3WXM _struct.title 'Crystal structure of archaeal Pelota and GTP-bound EF1 alpha complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3WXM _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLATION/HYDROLASE _struct_keywords.text 'mRNA surveillance, Ribosome, TRANSLATION-HYDROLASE complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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X N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP EF1A_AERPE Q9YAV0 1 ;MAEKPHMNLVVIGHVDHGKSTLVGHLLYRLGYIEEKKLKELEEQAKSRGKESFKFAWILDKMKEERERGITIDLTFMKFE TKKYVFTIIDAPGHRDFVKNMITGASQADAAILVVSARKGEFEAGMSTEGQTREHLLLARTMGIEQIIVAVNKMDAPDVN YDQKRYEFVVSVLKKFMKGLGYQVDKIPFIPVSAWKGDNLIERSPNMPWYNGPTLVEALDQLQPPAKPVDKPLRIPVQNV YSIPGAGTVPVGRVETGVLRVGDKVVFMPPGVVGEVRSIEMHYQQLQQAEPGDNIGFAVRGVSKSDIKRGDVAGHLDKPP TVAEEFEARIFVIWHPSAITVGYTPVIHVHTASVSSRIIEIKAKLDPKTGQVVEQNPQFLKAGDAAIVRFKPVKPLVVEK FSEIPQLGRFAMRDMNRTVGIGIVTDVKPAKVDIKAK ; 1 ? 2 UNP PELO_AERPE Q9YAZ5 2 ;MRVEVLDNKRRIVRLRPESEEDLWLLRITLRPGDVVRIRTSRDVPVGSGRKERVVMTLRIRLDSIEFQPFTGKLRISGIV VEGPDEFGVKGRRHSTAVSIGTWLVVERDKGWSEQELERLASGRARGTAVIAAVDYDEFALAVLAGHGMKILEDTSARLP GKDDPSREQEVEKYVDRAAKRIVEEAARHRSPIAVIAGPGQLKTSVAEKVQRAMPSLKVATVDTSMGGVAGVREALRRES VTRILRELSIVEAEGVLEEFLRRIAKSRDTVAYTPGEVLAVARMGAVDTVLLVDTLLHSPDDAVREAVDEALRLVESMGG RVIIIPGDSPAGERLVSFGGVIALLRYPVPQEARRL ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3WXM A 4 ? 440 ? Q9YAV0 1 ? 437 ? 1 437 2 2 3WXM B 21 ? 376 ? Q9YAZ5 1 ? 356 ? 1 356 3 1 3WXM C 4 ? 440 ? Q9YAV0 1 ? 437 ? 1 437 4 2 3WXM D 21 ? 376 ? Q9YAZ5 1 ? 356 ? 1 356 5 1 3WXM E 4 ? 440 ? Q9YAV0 1 ? 437 ? 1 437 6 2 3WXM F 21 ? 376 ? Q9YAZ5 1 ? 356 ? 1 356 7 1 3WXM G 4 ? 440 ? Q9YAV0 1 ? 437 ? 1 437 8 2 3WXM H 21 ? 376 ? Q9YAZ5 1 ? 356 ? 1 356 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 3WXM GLY A 1 ? UNP Q9YAV0 ? ? 'expression tag' -2 1 1 3WXM SER A 2 ? UNP Q9YAV0 ? ? 'expression tag' -1 2 1 3WXM HIS A 3 ? UNP Q9YAV0 ? ? 'expression tag' 0 3 1 3WXM LEU A 441 ? UNP Q9YAV0 ? ? 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'expression tag' 0 120 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 4 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 3980 ? 1 MORE -22 ? 1 'SSA (A^2)' 32280 ? 2 'ABSA (A^2)' 4020 ? 2 MORE -23 ? 2 'SSA (A^2)' 32410 ? 3 'ABSA (A^2)' 3830 ? 3 MORE -18 ? 3 'SSA (A^2)' 32510 ? 4 'ABSA (A^2)' 3910 ? 4 MORE -20 ? 4 'SSA (A^2)' 32420 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,I,J,Q,R 2 1 C,D,K,L,S,T 3 1 E,F,M,N,U,V 4 1 G,H,O,P,W,X # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 21 ? 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PHE C 55 LEU C 59 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 31 MET C 65 ? GLY C 72 ? MET C 62 GLY C 69 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 32 HIS C 97 ? ASP C 99 ? HIS C 94 ASP C 96 5 ? 3 HELX_P HELX_P33 33 PHE C 100 ? ALA C 111 ? PHE C 97 ALA C 108 1 ? 12 HELX_P HELX_P34 34 GLY C 123 ? SER C 130 ? GLY C 120 SER C 127 1 ? 8 HELX_P HELX_P35 35 GLY C 133 ? MET C 145 ? GLY C 130 MET C 142 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 36 ASP C 165 ? GLY C 184 ? ASP C 162 GLY C 181 1 ? 20 HELX_P HELX_P37 37 GLN C 186 ? ILE C 190 ? GLN C 183 ILE C 187 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 38 THR C 217 ? GLN C 224 ? THR C 214 GLN C 221 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 39 ILE C 407 ? LEU C 410 ? ILE C 404 LEU C 407 5 ? 4 HELX_P HELX_P40 40 SER D 39 ? LEU D 50 ? SER D 19 LEU D 30 1 ? 12 HELX_P HELX_P41 41 PRO D 104 ? GLY D 108 ? PRO D 84 GLY D 88 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 42 SER D 133 ? LEU D 140 ? SER D 113 LEU D 120 1 ? 8 HELX_P HELX_P43 43 SER D 186 ? HIS D 209 ? SER D 166 HIS D 189 1 ? 24 HELX_P HELX_P44 44 GLN D 221 ? MET D 234 ? 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G MG 502 G HOH 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.911 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? 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G HOH 724 ? 1_555 158.4 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 71 A . ? ARG 68 A GLY 72 A ? GLY 69 A 1 -12.03 2 MET 271 A . ? MET 268 A PRO 272 A ? PRO 269 A 1 2.43 3 ALA 385 A . ? ALA 382 A GLY 386 A ? GLY 383 A 1 -1.76 4 VAL 66 B . ? VAL 46 B GLY 67 B ? GLY 47 B 1 -2.31 5 ARG 71 C . ? ARG 68 C GLY 72 C ? GLY 69 C 1 -3.75 6 MET 271 C . ? MET 268 C PRO 272 C ? PRO 269 C 1 0.85 7 VAL 66 D . ? VAL 46 D GLY 67 D ? GLY 47 D 1 -0.58 8 ARG 71 E . ? ARG 68 E GLY 72 E ? GLY 69 E 1 -14.05 9 MET 271 E . ? MET 268 E PRO 272 E ? PRO 269 E 1 1.52 10 ALA 385 E . ? ALA 382 E GLY 386 E ? GLY 383 E 1 -5.54 11 VAL 66 F . ? VAL 46 F GLY 67 F ? GLY 47 F 1 -4.48 12 ARG 71 G . ? ARG 68 G GLY 72 G ? GLY 69 G 1 -10.46 13 MET 271 G . ? MET 268 G PRO 272 G ? PRO 269 G 1 1.95 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 6 ? B ? 8 ? C ? 2 ? D ? 8 ? E ? 7 ? F ? 5 ? G ? 4 ? H ? 6 ? I ? 8 ? J ? 2 ? K ? 8 ? L ? 7 ? M ? 5 ? N ? 4 ? O ? 6 ? P ? 8 ? Q ? 2 ? R ? 8 ? S ? 7 ? T ? 5 ? U ? 4 ? V ? 5 ? W ? 8 ? X ? 2 ? Y ? 7 ? Z ? 5 ? AA ? 7 ? AB ? 5 ? AC ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? parallel A 3 4 ? parallel A 4 5 ? parallel A 5 6 ? parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel B 5 6 ? anti-parallel B 6 7 ? anti-parallel B 7 8 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel D 6 7 ? anti-parallel D 7 8 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? anti-parallel E 5 6 ? anti-parallel E 6 7 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? parallel F 4 5 ? parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? parallel H 3 4 ? parallel H 4 5 ? parallel H 5 6 ? parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel I 4 5 ? anti-parallel I 5 6 ? anti-parallel I 6 7 ? anti-parallel I 7 8 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel K 5 6 ? anti-parallel K 6 7 ? anti-parallel K 7 8 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel L 5 6 ? anti-parallel L 6 7 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? parallel M 4 5 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? parallel O 3 4 ? parallel O 4 5 ? parallel O 5 6 ? parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel P 4 5 ? anti-parallel P 5 6 ? anti-parallel P 6 7 ? anti-parallel P 7 8 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel R 6 7 ? anti-parallel R 7 8 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel S 4 5 ? anti-parallel S 5 6 ? anti-parallel S 6 7 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? parallel T 4 5 ? parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? parallel V 3 4 ? parallel V 4 5 ? parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel W 4 5 ? anti-parallel W 5 6 ? anti-parallel W 6 7 ? anti-parallel W 7 8 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Y 4 5 ? anti-parallel Y 5 6 ? anti-parallel Y 6 7 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel Z 3 4 ? anti-parallel Z 4 5 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AA 4 5 ? anti-parallel AA 5 6 ? anti-parallel AA 6 7 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AB 3 4 ? parallel AB 4 5 ? parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 THR A 78 ? 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