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PDB 3X1L pdb_00003x1l 10.2210/pdb3x1l/pdb WWPDB D_1000097063 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2015-05-13 2 'Structure model' 1 1 2015-05-20 3 'Structure model' 1 2 2022-08-24 4 'Structure model' 1 3 2024-05-29 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Structure summary' 2 3 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' 'Derived calculations' 4 4 'Structure model' 'Data collection' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' citation 2 3 'Structure model' database_2 3 3 'Structure model' pdbx_struct_conn_angle 4 3 'Structure model' struct_conn 5 3 'Structure model' struct_ref_seq_dif 6 3 'Structure model' struct_site 7 4 'Structure model' chem_comp_atom 8 4 'Structure model' chem_comp_bond # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 2 3 'Structure model' '_citation.page_first' 3 3 'Structure model' '_citation.page_last' 4 3 'Structure model' '_citation.title' 5 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 6 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 7 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id' 8 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id' 9 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id' 10 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id' 11 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id' 12 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id' 13 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id' 14 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id' 15 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id' 16 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id' 17 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id' 18 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id' 19 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id' 20 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id' 21 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id' 22 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id' 23 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id' 24 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id' 25 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id' 26 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id' 27 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.value' 28 3 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_dist_value' 29 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id' 30 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 31 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 32 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 33 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 34 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 35 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 36 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id' 37 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 38 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 39 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 40 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_atom_id' 41 3 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 42 3 'Structure model' '_struct_ref_seq_dif.details' 43 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 44 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 45 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 3X1L _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2014-11-20 _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Osawa, T.' 1 'Numata, T.' 2 # _citation.id primary _citation.title 'Crystal structure of the CRISPR-Cas RNA silencing Cmr complex bound to a target analog.' _citation.journal_abbrev Mol.Cell _citation.journal_volume 58 _citation.page_first 418 _citation.page_last 430 _citation.year 2015 _citation.journal_id_ASTM MOCEFL _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 1097-2765 _citation.journal_id_CSD 2168 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 25921071 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2015.03.018 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Osawa, T.' 1 ? primary 'Inanaga, H.' 2 ? primary 'Sato, C.' 3 ? primary 'Numata, T.' 4 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'CRISPR system Cmr subunit Cmr2' 78226.383 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'CRISPR system Cmr subunit Cmr3' 36366.379 1 ? ? ? ? 3 polymer man Cmr4 39865.824 3 ? ? ? ? 4 polymer man 'CRISPR system Cmr subunit Cmr5' 17407.707 2 ? ? ? ? 5 polymer man Cmr6 40298.773 1 ? ? ? ? 6 polymer syn 'RNA (32-MER)' 12604.483 1 ? ? ? ? 7 polymer syn ;DNA (5'-D(*TP*GP*CP*TP*CP*TP*CP*AP*GP*CP*CP*GP*CP*AP*AP*GP*GP*AP*CP*CP*GP*CP*AP*TP*AP*CP*TP*AP*CP*AP*A)-3') ; 9451.103 1 ? ? ? 'This sequence is complementary to entity 6' 8 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 1 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 1 ? ? ? ? 10 water nat water 18.015 130 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'CRISPR-associated protein Cas10/Cmr2, subtype III-B' 2 'CRISPR type III-B/RAMP module-associated protein Cmr3' 4 'CRISPR type III-B/RAMP module-associated protein Cmr5' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMVKDPTLLRIKIVPVQPFIANSRKQLDLWASSHLLSMLMYKALEVIVDKFGPEHVIYPSL RDQPFFLKFYLGENIGDEILVANLPNKALAIVSGKEAEKIEEEIKKRIRDFLLQLYREAVDWAVENGVVKVDRSEKDSML KEAYLKIVREYFTVSITWVSLSEKEDIYQVTENAGLSDEDVKKWLKFAEKKENSRVLERIAIYPLLVKILDSLGERKVTE ERFEKSEQLKGWKCHVCGENLAIFGDMYDHDNLKSLWLDEEPLCPMCLIKRYYPVWIRSKTGQKIRFESVVDVALLYKNW RKIFDEKYGKDLVSKAREVSEDFVKDNMLVDSDLYYSSTWESGLSKKLKNKKEIDEEKVKEVVDFLNAAYKEIGNPPKYY AILVMDGDDMGKVISGEVLGEISTRIHPNIRDYVEIPEAKYYSTPQVHVAISQALANFSIREVRSVVKDEGLLIYAGGDD VLAILPVDKALEVAYKIRKEFGKSFENGSLLPGWKLSAGILIVHYKHPLYDALEKARDLLNNKAKNVPGKDTLAIGLLKR SGSYYISLVGWELIRVFYNSELRKKLLEEKGGVGKRFIYHVLREVDTWPKVGIDEMLKFEVIRHIRGRNKEETKELREKI YGEIKDLLEHVRGNNEVEKVRGLFTFLKIITDAEVFP ; ;MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMVKDPTLLRIKIVPVQPFIANSRKQLDLWASSHLLSMLMYKALEVIVDKFGPEHVIYPSL RDQPFFLKFYLGENIGDEILVANLPNKALAIVSGKEAEKIEEEIKKRIRDFLLQLYREAVDWAVENGVVKVDRSEKDSML KEAYLKIVREYFTVSITWVSLSEKEDIYQVTENAGLSDEDVKKWLKFAEKKENSRVLERIAIYPLLVKILDSLGERKVTE ERFEKSEQLKGWKCHVCGENLAIFGDMYDHDNLKSLWLDEEPLCPMCLIKRYYPVWIRSKTGQKIRFESVVDVALLYKNW RKIFDEKYGKDLVSKAREVSEDFVKDNMLVDSDLYYSSTWESGLSKKLKNKKEIDEEKVKEVVDFLNAAYKEIGNPPKYY AILVMDGDDMGKVISGEVLGEISTRIHPNIRDYVEIPEAKYYSTPQVHVAISQALANFSIREVRSVVKDEGLLIYAGGDD VLAILPVDKALEVAYKIRKEFGKSFENGSLLPGWKLSAGILIVHYKHPLYDALEKARDLLNNKAKNVPGKDTLAIGLLKR SGSYYISLVGWELIRVFYNSELRKKLLEEKGGVGKRFIYHVLREVDTWPKVGIDEMLKFEVIRHIRGRNKEETKELREKI YGEIKDLLEHVRGNNEVEKVRGLFTFLKIITDAEVFP ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MIEVTFTPYDVLLFRESRPFDAGSESVARSIIPLPQTVAGAIRTLLFYKGLKNCVGVGEEEPEFTLVGIAIGTEKGRIYP LPFNIIKSEKFYKVVNPGRFLGKLILPPKGKYKSGYVTESILEKYLKGELKEVEENKVIRIEKEKRIGIKLSREKKVVEE GMLYTVEFLRIEKIYAWIEDPGCGIKDILSSYEFLTLGGESRVAFVEVDDKTPDIFNRELGSTKKALFYFSTPTIGKVGE IVQELEKRLNAKIDDYLLVSSRPTAISGWDMHEKKPKGTKFAIPPGSVLFVEFKEEVEVPPYIKLGKLKKLGYGLALGGI WE ; ;MIEVTFTPYDVLLFRESRPFDAGSESVARSIIPLPQTVAGAIRTLLFYKGLKNCVGVGEEEPEFTLVGIAIGTEKGRIYP LPFNIIKSEKFYKVVNPGRFLGKLILPPKGKYKSGYVTESILEKYLKGELKEVEENKVIRIEKEKRIGIKLSREKKVVEE GMLYTVEFLRIEKIYAWIEDPGCGIKDILSSYEFLTLGGESRVAFVEVDDKTPDIFNRELGSTKKALFYFSTPTIGKVGE IVQELEKRLNAKIDDYLLVSSRPTAISGWDMHEKKPKGTKFAIPPGSVLFVEFKEEVEVPPYIKLGKLKKLGYGLALGGI WE ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGMFDMFEKAVVFGLYSITPVHAGSGAELSVIDLPIQRERHTGFPVIWGQSLKGVLRSRFRQLELDEKIEVESQKWKWKE KTKEVLKEKADEFIKKVEERKRDPLLTEIVFGPATDGASEHAGAVSVGDAKILLFPVRSAKGVFAFVTSPIVIQRLKEDF ELVSEIENDIELKQILSRFKVELSNNETIAGNALILNGENKVILEDIVLKVKSDSNVIENLVEVLKTLFGDNFFGKPIES IKERIAIVSDDVFKSFTRFSTEIVARVRIDAEKGTVARGGLWYEEFLPSDTLMYSLIAVGSPKKENLPKEVDNTQKIVNV LKVTFNNAFLQIGGDETVGKGFVKVRAGVLTGGHKGN ; ;MGMFDMFEKAVVFGLYSITPVHAGSGAELSVIDLPIQRERHTGFPVIWGQSLKGVLRSRFRQLELDEKIEVESQKWKWKE KTKEVLKEKADEFIKKVEERKRDPLLTEIVFGPATDGASEHAGAVSVGDAKILLFPVRSAKGVFAFVTSPIVIQRLKEDF ELVSEIENDIELKQILSRFKVELSNNETIAGNALILNGENKVILEDIVLKVKSDSNVIENLVEVLKTLFGDNFFGKPIES IKERIAIVSDDVFKSFTRFSTEIVARVRIDAEKGTVARGGLWYEEFLPSDTLMYSLIAVGSPKKENLPKEVDNTQKIVNV LKVTFNNAFLQIGGDETVGKGFVKVRAGVLTGGHKGN ; C,D,E ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MDIREIEQERASFAFKVVSDIKDKYSQNKKVQGKYSSYAEKAPTIILNNGLGATLAFFLSKLEKPIDDVDYKSINPESFG NAENIAYAFLYKHLSTWLAEGNGKDSAFSGLTNGEDPLKYIMEKTAIDVAISTEEALSILNWIKKFAKAMLEEEL ; ;MDIREIEQERASFAFKVVSDIKDKYSQNKKVQGKYSSYAEKAPTIILNNGLGATLAFFLSKLEKPIDDVDYKSINPESFG NAENIAYAFLYKHLSTWLAEGNGKDSAFSGLTNGEDPLKYIMEKTAIDVAISTEEALSILNWIKKFAKAMLEEEL ; F,G ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MKSNVVVKYPVNSELANYAEKFWKKELAIYNLSLILNKMTPFVKRRSESYKSSLSAVKEIFKNVDDFQNFLNSVLRRSLD EYRVFFENYERLFNSFSSKIFSMRTKSRLVVGLGDESVYETSIRLHRNYGVPYIPGSALKGVAKHYAFSILARENGDEIL RIYESVKEDLKARIAKRDKIKKNDVPEDYYLTAAVIQELFEKKFDELGAIRNTRVEIGDTVISVGDIVKIFGTQKEEGSV IFFDAFPTPEQLKDKPNLELDIMNPHYQPYYQHGEPPGDWHSPNPIFFLTVPAGVEFTFAVASRDLDDLAEKAEKLLKEA LKKFGVGAKTSLGYGRFDARDDRHHHHHH ; ;MKSNVVVKYPVNSELANYAEKFWKKELAIYNLSLILNKMTPFVKRRSESYKSSLSAVKEIFKNVDDFQNFLNSVLRRSLD EYRVFFENYERLFNSFSSKIFSMRTKSRLVVGLGDESVYETSIRLHRNYGVPYIPGSALKGVAKHYAFSILARENGDEIL RIYESVKEDLKARIAKRDKIKKNDVPEDYYLTAAVIQELFEKKFDELGAIRNTRVEIGDTVISVGDIVKIFGTQKEEGSV IFFDAFPTPEQLKDKPNLELDIMNPHYQPYYQHGEPPGDWHSPNPIFFLTVPAGVEFTFAVASRDLDDLAEKAEKLLKEA LKKFGVGAKTSLGYGRFDARDDRHHHHHH ; H ? 6 polyribonucleotide no no AUUGAAAGUUGUAGUAUGCGGUCCUUGCGGCUGAGAGCA AUUGAAAGUUGUAGUAUGCGGUCCUUGCGGCUGAGAGCA I ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DA)(DC)(DC) (DG)(DC)(DA)(DT)(DA)(DC)(DT)(DA)(DC)(DA)(DA) ; TGCTCTCAGCCGCAAGGACCGCATACTACAA J ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 8 'ZINC ION' ZN 9 'MAGNESIUM ION' MG 10 water HOH # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLY n 1 3 SER n 1 4 SER n 1 5 HIS n 1 6 HIS n 1 7 HIS n 1 8 HIS n 1 9 HIS n 1 10 HIS n 1 11 SER n 1 12 SER n 1 13 GLY n 1 14 LEU n 1 15 VAL n 1 16 PRO n 1 17 ARG n 1 18 GLY n 1 19 SER n 1 20 HIS n 1 21 MET n 1 22 VAL n 1 23 LYS n 1 24 ASP n 1 25 PRO n 1 26 THR n 1 27 LEU n 1 28 LEU n 1 29 ARG n 1 30 ILE n 1 31 LYS n 1 32 ILE n 1 33 VAL n 1 34 PRO n 1 35 VAL n 1 36 GLN n 1 37 PRO n 1 38 PHE n 1 39 ILE n 1 40 ALA n 1 41 ASN n 1 42 SER n 1 43 ARG n 1 44 LYS n 1 45 GLN n 1 46 LEU n 1 47 ASP n 1 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I C 24 N3 ? ? ? 1_555 J DG 16 N1 ? ? I C 24 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? I C 24 N4 ? ? ? 1_555 J DG 16 O6 ? ? I C 24 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? I C 24 O2 ? ? ? 1_555 J DG 16 N2 ? ? I C 24 J DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? I U 25 N3 ? ? ? 1_555 J DA 15 N1 ? ? I U 25 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? I U 25 O4 ? ? ? 1_555 J DA 15 N6 ? ? I U 25 J DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? I G 27 N1 ? ? ? 1_555 J DC 13 O2 ? ? I G 27 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? I G 27 N2 ? ? ? 1_555 J DC 13 N3 ? ? I G 27 J DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? I C 28 N3 ? ? ? 1_555 J DG 12 N1 ? ? I C 28 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? I C 28 N4 ? ? ? 1_555 J DG 12 O6 ? ? I C 28 J DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'G-DC PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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C sing N N 504 PHE CA CB sing N N 505 PHE CA HA sing N N 506 PHE C O doub N N 507 PHE C OXT sing N N 508 PHE CB CG sing N N 509 PHE CB HB2 sing N N 510 PHE CB HB3 sing N N 511 PHE CG CD1 doub Y N 512 PHE CG CD2 sing Y N 513 PHE CD1 CE1 sing Y N 514 PHE CD1 HD1 sing N N 515 PHE CD2 CE2 doub Y N 516 PHE CD2 HD2 sing N N 517 PHE CE1 CZ doub Y N 518 PHE CE1 HE1 sing N N 519 PHE CE2 CZ sing Y N 520 PHE CE2 HE2 sing N N 521 PHE CZ HZ sing N N 522 PHE OXT HXT sing N N 523 PRO N CA sing N N 524 PRO N CD sing N N 525 PRO N H sing N N 526 PRO CA C sing N N 527 PRO CA CB sing N N 528 PRO CA HA sing N N 529 PRO C O doub N N 530 PRO C OXT sing N N 531 PRO CB CG sing N N 532 PRO CB HB2 sing N N 533 PRO CB HB3 sing N N 534 PRO CG CD sing N N 535 PRO CG HG2 sing N N 536 PRO CG HG3 sing N N 537 PRO CD HD2 sing N N 538 PRO CD HD3 sing N N 539 PRO OXT HXT sing N N 540 SER N CA sing N N 541 SER N H sing N N 542 SER N H2 sing N N 543 SER CA C sing N N 544 SER CA CB sing N N 545 SER CA HA sing N N 546 SER C 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sing N N 631 U "C4'" "O4'" sing N N 632 U "C4'" "C3'" sing N N 633 U "C4'" "H4'" sing N N 634 U "O4'" "C1'" sing N N 635 U "C3'" "O3'" sing N N 636 U "C3'" "C2'" sing N N 637 U "C3'" "H3'" sing N N 638 U "O3'" "HO3'" sing N N 639 U "C2'" "O2'" sing N N 640 U "C2'" "C1'" sing N N 641 U "C2'" "H2'" sing N N 642 U "O2'" "HO2'" sing N N 643 U "C1'" N1 sing N N 644 U "C1'" "H1'" sing N N 645 U N1 C2 sing N N 646 U N1 C6 sing N N 647 U C2 O2 doub N N 648 U C2 N3 sing N N 649 U N3 C4 sing N N 650 U N3 H3 sing N N 651 U C4 O4 doub N N 652 U C4 C5 sing N N 653 U C5 C6 doub N N 654 U C5 H5 sing N N 655 U C6 H6 sing N N 656 VAL N CA sing N N 657 VAL N H sing N N 658 VAL N H2 sing N N 659 VAL CA C sing N N 660 VAL CA CB sing N N 661 VAL CA HA sing N N 662 VAL C O doub N N 663 VAL C OXT sing N N 664 VAL CB CG1 sing N N 665 VAL CB CG2 sing N N 666 VAL CB HB sing N N 667 VAL CG1 HG11 sing N N 668 VAL CG1 HG12 sing N N 669 VAL CG1 HG13 sing N N 670 VAL CG2 HG21 sing N N 671 VAL CG2 HG22 sing N N 672 VAL CG2 HG23 sing N N 673 VAL OXT HXT sing N N 674 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3X1L 'double helix' 3X1L 'a-form double helix' 3X1L 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id 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