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_refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.83 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ;TWO REGIONS IN ELP4 RESIDUES 137-144 AND 169-233, TWO SHORT LOOPS IN ELP5 AND ITS C--TERMINUS RESIDUES 93-98, 144-148 AND 233-270 AND TWO SHORT LOOPS AND THE N-TERMINAL 6XHIS-TAG OF ELP6 RESIDUES 64-66 AND 227-231 ARE DISORDERD. ; _refine.pdbx_starting_model NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct MIRAS _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ML _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML 0.49 _refine.pdbx_overall_phase_error 29.75 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 12143 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 862 _refine_hist.number_atoms_total 13005 _refine_hist.d_res_high 2.1 _refine_hist.d_res_low 46.2 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.01 ? ? 12396 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_d 1.158 ? ? 16815 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_dihedral_angle_d 15.7 ? ? 4577 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_chiral_restr 0.078 ? ? 1970 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_plane_restr 0.005 ? ? 2130 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso 1 A 2203 ? ? POSITIONAL 1 1 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 D 2203 0.040 ? POSITIONAL 1 2 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 1 C 2034 ? ? POSITIONAL 2 3 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 F 2034 0.038 ? POSITIONAL 2 4 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 1 B 1781 ? ? POSITIONAL 3 5 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? 2 E 1781 0.061 ? POSITIONAL 3 6 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.1012 2.1250 3213 0.3331 90.00 0.3421 . . 169 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.1250 2.1500 3538 0.3047 100.00 0.3091 . . 186 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.1500 2.1763 3513 0.2774 100.00 0.2741 . . 184 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.1763 2.2038 3543 0.2733 100.00 0.2778 . . 187 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.2038 2.2328 3548 0.2646 100.00 0.3125 . . 187 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.2328 2.2634 3534 0.2571 100.00 0.2775 . . 185 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.2634 2.2957 3558 0.2553 100.00 0.2737 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.2957 2.3300 3530 0.2426 100.00 0.2879 . . 186 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.3300 2.3664 3546 0.2348 100.00 0.2827 . . 187 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.3664 2.4052 3593 0.2349 100.00 0.2649 . . 189 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4052 2.4467 3518 0.2328 100.00 0.2420 . . 186 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4467 2.4911 3535 0.2306 100.00 0.2612 . . 186 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4911 2.5391 3567 0.2207 100.00 0.2663 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.5391 2.5909 3530 0.2133 100.00 0.2697 . . 186 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.5909 2.6472 3572 0.2080 100.00 0.2215 . . 189 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.6472 2.7088 3564 0.2071 100.00 0.2401 . . 187 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.7088 2.7765 3563 0.2030 100.00 0.2512 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.7765 2.8516 3550 0.2159 100.00 0.2560 . . 187 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.8516 2.9355 3562 0.2132 100.00 0.2628 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.9355 3.0302 3546 0.2012 99.00 0.2223 . . 185 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0302 3.1385 3581 0.1980 100.00 0.2389 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1385 3.2641 3569 0.1939 99.00 0.2645 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.2641 3.4126 3582 0.1927 99.00 0.2452 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.4126 3.5925 3548 0.1915 99.00 0.2183 . . 186 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.5925 3.8175 3583 0.1793 99.00 0.2165 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.8175 4.1120 3596 0.1665 99.00 0.1765 . . 189 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.1120 4.5255 3587 0.1511 99.00 0.1690 . . 189 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.5255 5.1796 3584 0.1481 98.00 0.1717 . . 188 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.1796 6.5229 3636 0.1959 98.00 0.2232 . . 192 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 6.5229 46.2077 3499 0.2011 91.00 0.2215 . . 184 . . # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 1.000000 0.001000 -0.000300 0.001000 -1.000000 -0.000900 -0.000400 0.000900 -1.000000 -0.21490 227.18940 -0.02510 2 given ? 0.999900 0.006700 0.008400 0.006700 -1.000000 0.000300 0.008400 -0.000200 -1.000000 -0.71090 226.89460 -0.42180 3 given ? 1.000000 0.002900 0.002300 0.002900 -1.000000 0.001100 0.002300 -0.001000 -1.000000 -0.37760 227.13230 0.05610 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 ? 1 2 ? 1 1 ? 2 2 ? 2 1 ? 3 2 ? 3 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'CHAIN A AND (RESSEQ 67:136 OR RESSEQ 145:168 OR RESSEQ 234:416 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 'CHAIN D AND (RESSEQ 67:136 OR RESSEQ 145:168 OR RESSEQ 234:416 )' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'CHAIN C AND (RESSEQ 5:62 OR RESSEQ 68:115 OR RESSEQ 120:226 OR RESSEQ 229:273 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'CHAIN F AND (RESSEQ 5:62 OR RESSEQ 68:115 OR RESSEQ 120:226 OR RESSEQ 229:273 )' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'CHAIN B AND (RESSEQ 2:92 OR RESSEQ 98:142 OR RESSEQ 149:232 )' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'CHAIN E AND (RESSEQ 2:92 OR RESSEQ 98:142 OR RESSEQ 149:232 )' # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? # _struct.entry_id 4A8J _struct.title 'Crystal Structure of the Elongator subcomplex Elp456' _struct.pdbx_descriptor 'ELONGATOR COMPLEX PROTEIN 4, ELONGATOR COMPLEX PROTEIN 5, ELONGATOR COMPLEX PROTEIN 6' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4A8J _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION _struct_keywords.text TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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SER D 90 LEU D 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 33 PHE D 53 ? ARG D 70 ? PHE D 118 ARG D 135 1 ? 18 HELX_P HELX_P34 34 ASN D 92 ? LEU D 99 ? ASN D 157 LEU D 164 5 ? 8 HELX_P HELX_P35 35 PRO D 199 ? ASN D 214 ? PRO D 264 ASN D 279 1 ? 16 HELX_P HELX_P36 36 PRO D 233 ? PHE D 237 ? PRO D 298 PHE D 302 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 37 GLU D 238 ? TYR D 256 ? GLU D 303 TYR D 321 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 38 THR D 272 ? PHE D 283 ? THR D 337 PHE D 348 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 39 ASN D 293 ? TYR D 304 ? ASN D 358 TYR D 369 1 ? 12 HELX_P HELX_P40 40 GLN D 307 ? ILE D 311 ? GLN D 372 ILE D 376 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 41 VAL D 323 ? GLY D 328 ? VAL D 388 GLY D 393 1 ? 6 HELX_P HELX_P42 42 ASN E 7 ? SER E 17 ? ASN E 7 SER E 17 1 ? 11 HELX_P HELX_P43 43 SER E 35 ? LYS E 49 ? SER E 35 LYS E 49 1 ? 15 HELX_P HELX_P44 44 ASP E 79 ? TYR E 90 ? ASP E 79 TYR E 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 45 SER E 108 ? ILE E 112 ? SER E 108 ILE E 112 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 46 SER E 113 ? GLU E 115 ? SER E 113 GLU E 115 5 ? 3 HELX_P HELX_P47 47 TYR E 116 ? ALA E 125 ? TYR E 116 ALA E 125 1 ? 10 HELX_P HELX_P48 48 ASP E 156 ? ALA E 165 ? ASP E 156 ALA E 165 1 ? 10 HELX_P HELX_P49 49 ASP E 180 ? GLU E 190 ? ASP E 180 GLU E 190 1 ? 11 HELX_P HELX_P50 50 PRO F 26 ? GLN F 31 ? PRO F 19 GLN F 24 5 ? 6 HELX_P HELX_P51 51 PRO F 49 ? GLY F 63 ? PRO F 42 GLY F 56 1 ? 15 HELX_P HELX_P52 52 GLU F 92 ? LYS F 102 ? GLU F 85 LYS F 95 1 ? 11 HELX_P HELX_P53 53 PRO F 106 ? ASN F 108 ? PRO F 99 ASN F 101 5 ? 3 HELX_P HELX_P54 54 ASP F 118 ? ASN F 123 ? ASP F 111 ASN F 116 1 ? 6 HELX_P HELX_P55 55 PRO F 128 ? GLN F 145 ? PRO F 121 GLN F 138 1 ? 18 HELX_P HELX_P56 56 LEU F 160 ? VAL F 165 ? LEU F 153 VAL F 158 1 ? 6 HELX_P HELX_P57 57 THR F 169 ? PHE F 177 ? THR F 162 PHE F 170 1 ? 9 HELX_P HELX_P58 58 PHE F 177 ? GLN F 184 ? PHE F 170 GLN F 177 1 ? 8 HELX_P HELX_P59 59 ASP F 195 ? ASN F 198 ? ASP F 188 ASN F 191 5 ? 4 HELX_P HELX_P60 60 ASP F 203 ? SER F 208 ? ASP F 196 SER F 201 1 ? 6 HELX_P HELX_P61 61 SER F 208 ? SER F 222 ? SER F 201 SER F 215 1 ? 15 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 MSE 183 A . ? MSE 248 A PRO 184 A ? PRO 249 A 1 -4.13 2 MSE 183 D . ? MSE 248 D PRO 184 D ? PRO 249 D 1 -3.73 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA ? 3 ? AB ? 9 ? AC ? 2 ? BA ? 9 ? CA ? 9 ? DA ? 3 ? DB ? 9 ? DC ? 2 ? EA ? 9 ? 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GLY F 234 ARG F 240 FA 8 ASN F 264 ? GLU F 271 ? ASN F 257 GLU F 264 FA 9 SER F 274 ? PHE F 278 ? 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N ASN B 208 O LEU B 216 ? O LEU B 216 BA 8 9 N ASN B 223 ? N ASN B 223 O GLU B 228 ? O GLU B 228 CA 1 2 N ASN C 111 ? N ASN C 104 O ALA C 84 ? O ALA C 77 CA 2 3 N VAL C 85 ? N VAL C 78 O ILE C 152 ? O ILE C 145 CA 3 4 N VAL C 153 ? N VAL C 146 O VAL C 187 ? O VAL C 180 CA 4 5 N LEU C 188 ? N LEU C 181 O ASN C 37 ? O ASN C 30 CA 5 6 N PHE C 40 ? N PHE C 33 O ILE C 224 ? O ILE C 217 CA 6 7 N ASN C 229 ? N ASN C 222 O SER C 242 ? O SER C 235 CA 7 8 N VAL C 245 ? N VAL C 238 O ASN C 264 ? O ASN C 257 CA 8 9 N GLU C 271 ? N GLU C 264 O SER C 274 ? O SER C 267 DA 1 2 N ARG D 11 ? N ARG D 76 O THR D 20 ? O THR D 85 DA 2 3 N THR D 21 ? N THR D 86 O LEU D 37 ? O LEU D 102 DB 1 2 N THR D 192 ? N THR D 257 O VAL D 86 ? O VAL D 151 DB 2 3 N HIS D 85 ? N HIS D 150 O LEU D 218 ? O LEU D 283 DB 3 4 N ILE D 221 ? N ILE D 286 O VAL D 261 ? O VAL D 326 DB 4 5 N ALA D 264 ? N ALA D 329 O VAL D 43 ? O VAL D 108 DB 5 6 N LEU D 44 ? N LEU D 109 O SER D 285 ? O SER D 350 DB 6 7 N GLU D 290 ? 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