data_4B2Q # _entry.id 4B2Q # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.284 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 4B2Q PDBE EBI-53397 WWPDB D_1290053397 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type _pdbx_database_related.details PDB 1VZS unspecified 'SOLUTION STRUCTURE OF SUBUNIT F6 FROM THE PERIPHERAL STALK REGION OF ATP SYNTHASE FROM BOVINE HEART MITOCHONDRIA' PDB 2BO5 unspecified 'BOVINE OLIGOMYCIN SENSITIVITY CONFERRAL PROTEIN N-TERMINAL DOMAIN' PDB 2CLY unspecified 'SUBCOMPLEX OF THE STATOR OF BOVINE MITOCHONDRIAL ATP SYNTHASE' PDB 2WPD unspecified 'THE MG.ADP INHIBITED STATE OF THE YEAST F1C10 ATP SYNTHASE' PDB 2WSS unspecified 'THE STRUCTURE OF THE MEMBRANE EXTRINSIC REGION OF BOVINE ATP SYNTHASE' PDB 2XOK unspecified 'REFINED STRUCTURE OF YEAST F1C10 ATPASE COMPLEX TO 3 A RESOLUTION' PDB 3ZRY unspecified 'ROTOR ARCHITECTURE IN THE F(1)-C(10)-RING COMPLEX OF THE YEAST F-ATP SYNTHASE' EMDB EMD-2161 'associated EM volume' 'STRUCTURE OF THE YEAST F1FO-ATP SYNTHASE DIMER' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 4B2Q _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2012-07-17 _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Davies, K.M.' 1 'Kuehlbrandt, W.' 2 # _citation.id primary _citation.title 'Structure of the Yeast F1Fo-ATP Synthase Dimer and its Role in Shaping the Mitochondrial Cristae.' _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_volume 109 _citation.page_first 13602 _citation.page_last ? _citation.year 2012 _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0027-8424 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 22864911 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/PNAS.1204593109 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Davies, K.M.' 1 primary 'Anselmi, C.' 2 primary 'Wittig, I.' 3 primary 'Faraldo-Gomez, J.D.' 4 primary 'Kuhlbrandt, W.' 5 # _cell.entry_id 4B2Q _cell.length_a 1.000 _cell.length_b 1.000 _cell.length_c 1.000 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4B2Q _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL' 52376.539 4 ? ? 'RESIDUES 61-545' ? 2 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL' 52447.617 2 ? ? 'RESIDUES 60-545' ? 3 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL' 50438.348 2 3.6.3.14 ? 'RESIDUES 39-508' ? 4 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL' 50752.641 4 3.6.3.14 ? 'RESIDUES 39-511' ? 5 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL' 30657.160 2 ? ? 'RESIDUES 34-311' ? 6 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL' 14080.876 2 ? ? 'RESIDUES 29-160' ? 7 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL' 6388.076 2 ? ? 'RESIDUES 2-60' ? 8 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT 9, MITOCHONDRIAL' 7762.375 20 ? ? ? ? 9 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT B, MITOCHONDRIAL' 15408.768 2 3.6.3.14 ? 'RESIDUES 121-249' ? 10 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL' 13768.688 2 ? ? 'RESIDUES 5-124' ? 11 polymer nat 'ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL' 7829.806 2 ? ? 'RESIDUES 36-101' ? 12 polymer nat 'ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL' 13240.513 2 3.6.3.14 ? 'RESIDUES 24-143' ? 13 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 6 ? ? ? ? 14 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 10 ? ? ? ? 15 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 4 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 5 'F-ATPASE GAMMA SUBUNIT' 6 'F-ATPASE DELTA SUBUNIT' 7 'ATPASE SUBUNIT EPSILON' 8 'LIPID-BINDING PROTEIN, OLIGOMYCIN RESISTANCE PROTEIN 1' 9 'ATPASE SUBUNIT B' 10 'ATPASE SUBUNIT D' 11 'ATPASE SUBUNIT F6' 12 'OLIGOMYCIN SENSITIVITY CONFERRAL PROTEIN, OSCP' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;NLNETGRVLAVGDGIARVFGLNNIQAEELVEFSSGVKGMALNLEPGQVGIVLFGSDRLVKEGELVKRTGNIVDVPVGPGL LGRVVDALGNPIDGKGPIDAAGRSRAQVKAPGILPRRSVHEPVQTGLKAVDALVPIGRGQRELIIGDRQTGKTAVALDTI 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LLGRVVDALGNPIDGKGPIDAAGRSRAQVKAPGILPRRSVHEPVQTGLKAVDALVPIGRGQRELIIGDRQTGKTAVALDT ILNQKRWNNGSDESKKLYCVYVAVGQKRSTVAQLVQTLEQHDAMKYSIIVAATASEAAPLQYLAPFTAASIGEWFRDNGK HALIVYDDLSKQAVAYRQLSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKLSEKEGSGSLTALPVIETQGGDVSAYIPTNV ISITDGQIFLEAELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQVKALKQVAGSLKLFLAQYREVAAFAQFGSDLDASTKQTLVRGE RLTQLLKQNQYSPLATEEQVPLIYAGVNGHLDGIELSRIGEFESSFLSYLKSNHNELLTEIREKGELSKELLASLKSATE SFVATF ; ;ANLNETGRVLAVGDGIARVFGLNNIQAEELVEFSSGVKGMALNLEPGQVGIVLFGSDRLVKEGELVKRTGNIVDVPVGPG LLGRVVDALGNPIDGKGPIDAAGRSRAQVKAPGILPRRSVHEPVQTGLKAVDALVPIGRGQRELIIGDRQTGKTAVALDT ILNQKRWNNGSDESKKLYCVYVAVGQKRSTVAQLVQTLEQHDAMKYSIIVAATASEAAPLQYLAPFTAASIGEWFRDNGK HALIVYDDLSKQAVAYRQLSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKLSEKEGSGSLTALPVIETQGGDVSAYIPTNV ISITDGQIFLEAELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQVKALKQVAGSLKLFLAQYREVAAFAQFGSDLDASTKQTLVRGE RLTQLLKQNQYSPLATEEQVPLIYAGVNGHLDGIELSRIGEFESSFLSYLKSNHNELLTEIREKGELSKELLASLKSATE SFVATF ; B,b ? 3 'polypeptide(L)' no no ;STPITGKVTAVIGAIVDVHFEQSELPAILNALEIKTPQGKLVLEVAQHLGENTVRTIAMDGTEGLVRGEKVLDTGGPISV PVGRETLGRIINVIGEPIDERGPIKSKLRKPIHADPPSFAEQSTSAEILETGIKVVDLLAPYARGGKIGLFGGAGVGKTV FIQELINNIAKAHGGFSVFTGVGERTREGNDLYREMKETGVINLEGESKVALVFGQMNEPPGARARVALTGLTIAEYFRD EEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGLLQERITTTKKGSVTSVQAVYVPADDLTDPAPATT FAHLDATTVLSRGISELGIYPAVDPLDSKSRLLDAAVVGQEHYDVASKVQETLQTYKSLQDIIAILGMDELSEQDKLTVE RARKIQRFLSQPFAVAEVFTGIPGKLVRLKDTVASFKAVLEGKYDNIPEHAFYMVGGIEDVVAKAEKLAA ; ;STPITGKVTAVIGAIVDVHFEQSELPAILNALEIKTPQGKLVLEVAQHLGENTVRTIAMDGTEGLVRGEKVLDTGGPISV PVGRETLGRIINVIGEPIDERGPIKSKLRKPIHADPPSFAEQSTSAEILETGIKVVDLLAPYARGGKIGLFGGAGVGKTV FIQELINNIAKAHGGFSVFTGVGERTREGNDLYREMKETGVINLEGESKVALVFGQMNEPPGARARVALTGLTIAEYFRD EEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGLLQERITTTKKGSVTSVQAVYVPADDLTDPAPATT FAHLDATTVLSRGISELGIYPAVDPLDSKSRLLDAAVVGQEHYDVASKVQETLQTYKSLQDIIAILGMDELSEQDKLTVE RARKIQRFLSQPFAVAEVFTGIPGKLVRLKDTVASFKAVLEGKYDNIPEHAFYMVGGIEDVVAKAEKLAA ; D,d ? 4 'polypeptide(L)' no no ;STPITGKVTAVIGAIVDVHFEQSELPAILNALEIKTPQGKLVLEVAQHLGENTVRTIAMDGTEGLVRGEKVLDTGGPISV PVGRETLGRIINVIGEPIDERGPIKSKLRKPIHADPPSFAEQSTSAEILETGIKVVDLLAPYARGGKIGLFGGAGVGKTV FIQELINNIAKAHGGFSVFTGVGERTREGNDLYREMKETGVINLEGESKVALVFGQMNEPPGARARVALTGLTIAEYFRD EEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGLLQERITTTKKGSVTSVQAVYVPADDLTDPAPATT FAHLDATTVLSRGISELGIYPAVDPLDSKSRLLDAAVVGQEHYDVASKVQETLQTYKSLQDIIAILGMDELSEQDKLTVE RARKIQRFLSQPFAVAEVFTGIPGKLVRLKDTVASFKAVLEGKYDNIPEHAFYMVGGIEDVVAKAEKLAAEAN ; ;STPITGKVTAVIGAIVDVHFEQSELPAILNALEIKTPQGKLVLEVAQHLGENTVRTIAMDGTEGLVRGEKVLDTGGPISV PVGRETLGRIINVIGEPIDERGPIKSKLRKPIHADPPSFAEQSTSAEILETGIKVVDLLAPYARGGKIGLFGGAGVGKTV FIQELINNIAKAHGGFSVFTGVGERTREGNDLYREMKETGVINLEGESKVALVFGQMNEPPGARARVALTGLTIAEYFRD EEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGLLQERITTTKKGSVTSVQAVYVPADDLTDPAPATT FAHLDATTVLSRGISELGIYPAVDPLDSKSRLLDAAVVGQEHYDVASKVQETLQTYKSLQDIIAILGMDELSEQDKLTVE RARKIQRFLSQPFAVAEVFTGIPGKLVRLKDTVASFKAVLEGKYDNIPEHAFYMVGGIEDVVAKAEKLAAEAN ; E,F,e,f ? 5 'polypeptide(L)' no no ;ATLKEVEMRLKSIKNIEKITKTMKIVASTRLSKAEKAKISAKKMDEAEQLFYKNAETKNLDVEATETGAPKELIVAITSD KGLCGSIHSQLAKAVRRHLNDQPNADIVTIGDKIKMQLLRTHPNNIKLSINGIGKDAPTFQESALIADKLLSVMKAGTYP KISIFYNDPVSSLSFEPSEKPIFNAKTIEQSPSFGKFEIDTDANVPRDLFEYTLANQMLTAMAQGYAAEISARRNAMDNA SKNAGDMINRYSILYNRTRQAVITNELVDIITGASSLG ; ;ATLKEVEMRLKSIKNIEKITKTMKIVASTRLSKAEKAKISAKKMDEAEQLFYKNAETKNLDVEATETGAPKELIVAITSD KGLCGSIHSQLAKAVRRHLNDQPNADIVTIGDKIKMQLLRTHPNNIKLSINGIGKDAPTFQESALIADKLLSVMKAGTYP KISIFYNDPVSSLSFEPSEKPIFNAKTIEQSPSFGKFEIDTDANVPRDLFEYTLANQMLTAMAQGYAAEISARRNAMDNA SKNAGDMINRYSILYNRTRQAVITNELVDIITGASSLG ; G,g ? 6 'polypeptide(L)' no no ;SSGLKLQFALPHETLYSGSEVTQVNLPAKSGRIGVLANHVPTVEQLLPGVVEVMEGSNSKKFFISGGFATVQPDSQLCVT AIEAFPLESFSQENIKNLLAEAKKNVSSSDAREAAEAAIQVEVLENLQSVLK ; ;SSGLKLQFALPHETLYSGSEVTQVNLPAKSGRIGVLANHVPTVEQLLPGVVEVMEGSNSKKFFISGGFATVQPDSQLCVT AIEAFPLESFSQENIKNLLAEAKKNVSSSDAREAAEAAIQVEVLENLQSVLK ; H,h ? 7 'polypeptide(L)' no no SAWRKAGISYAAYLNVAAQAIRSSLKTELQTASVLNRSQTDAFYTQYKNGTAASEPTPI SAWRKAGISYAAYLNVAAQAIRSSLKTELQTASVLNRSQTDAFYTQYKNGTAASEPTPI I,i ? 8 'polypeptide(L)' no no MQLVLAAKYIGAGISTIGLLGAGIGIAIVFAALINGVSRNPSIKDTVFPMAILGFALSEATGLFCLMVSFLLLFGV MQLVLAAKYIGAGISTIGLLGAGIGIAIVFAALINGVSRNPSIKDTVFPMAILGFALSEATGLFCLMVSFLLLFGV J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s ? 9 'polypeptide(L)' no no ;GEFADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYH ISVQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKK ; ;GEFADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYH ISVQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKK ; T,t ? 10 'polypeptide(L)' no no ;KLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPIPED KYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRN ; ;KLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPIPED KYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRN ; U,u ? 11 'polypeptide(L)' no no LDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFE LDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFE V,v ? 12 'polypeptide(L)' no no ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTV ; ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTV ; W,w ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ASN n 1 2 LEU n 1 3 ASN n 1 4 GLU n 1 5 THR n 1 6 GLY n 1 7 ARG n 1 8 VAL n 1 9 LEU n 1 10 ALA n 1 11 VAL n 1 12 GLY n 1 13 ASP n 1 14 GLY n 1 15 ILE n 1 16 ALA n 1 17 ARG n 1 18 VAL n 1 19 PHE n 1 20 GLY n 1 21 LEU n 1 22 ASN n 1 23 ASN n 1 24 ILE n 1 25 GLN n 1 26 ALA n 1 27 GLU n 1 28 GLU n 1 29 LEU n 1 30 VAL n 1 31 GLU n 1 32 PHE n 1 33 SER n 1 34 SER n 1 35 GLY n 1 36 VAL n 1 37 LYS n 1 38 GLY n 1 39 MET n 1 40 ALA n 1 41 LEU n 1 42 ASN n 1 43 LEU n 1 44 GLU n 1 45 PRO n 1 46 GLY n 1 47 GLN n 1 48 VAL n 1 49 GLY n 1 50 ILE n 1 51 VAL n 1 52 LEU n 1 53 PHE n 1 54 GLY n 1 55 SER n 1 56 ASP n 1 57 ARG n 1 58 LEU n 1 59 VAL n 1 60 LYS n 1 61 GLU n 1 62 GLY n 1 63 GLU n 1 64 LEU n 1 65 VAL n 1 66 LYS n 1 67 ARG n 1 68 THR n 1 69 GLY n 1 70 ASN n 1 71 ILE n 1 72 VAL n 1 73 ASP n 1 74 VAL n 1 75 PRO n 1 76 VAL n 1 77 GLY n 1 78 PRO n 1 79 GLY n 1 80 LEU n 1 81 LEU n 1 82 GLY n 1 83 ARG n 1 84 VAL n 1 85 VAL n 1 86 ASP n 1 87 ALA n 1 88 LEU n 1 89 GLY n 1 90 ASN n 1 91 PRO n 1 92 ILE n 1 93 ASP n 1 94 GLY n 1 95 LYS n 1 96 GLY n 1 97 PRO n 1 98 ILE n 1 99 ASP n 1 100 ALA n 1 101 ALA n 1 102 GLY n 1 103 ARG n 1 104 SER n 1 105 ARG n 1 106 ALA n 1 107 GLN n 1 108 VAL n 1 109 LYS n 1 110 ALA n 1 111 PRO n 1 112 GLY n 1 113 ILE n 1 114 LEU n 1 115 PRO n 1 116 ARG n 1 117 ARG n 1 118 SER n 1 119 VAL n 1 120 HIS n 1 121 GLU n 1 122 PRO n 1 123 VAL n 1 124 GLN n 1 125 THR n 1 126 GLY n 1 127 LEU n 1 128 LYS n 1 129 ALA n 1 130 VAL n 1 131 ASP n 1 132 ALA n 1 133 LEU n 1 134 VAL n 1 135 PRO n 1 136 ILE n 1 137 GLY n 1 138 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THE SHEETS PRESENTED AS "BA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 10-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 11-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "CA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 10-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 11-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "AA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 10-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 11-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "BA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 10-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 11-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "CA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 10-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 11-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. ; # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 4B2Q _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details 'METHOD--RIGID BODY REFINEMENT PROTOCOL--X-RAY' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 2WPD _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.details ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 4B2Q _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.num_particles 121 _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'WEIGHTED BACK-PROJECTION' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 5.76 _em_3d_reconstruction.resolution 37 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details 'MODEL BASED ON PDBS 2WPD,2CLY AND 2BO5. SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-2161. (DEPOSITION ID: 10941).' _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.details '250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'ATP SYNTHASE DIMER FROM MITOCHONDRIA OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE' _em_entity_assembly.type CELL _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 4B2Q _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 75 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 4B2Q _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI POLARA 300' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2009-03-11 _em_imaging.temperature 80 _em_imaging.nominal_defocus_min 6500 _em_imaging.nominal_defocus_max 7500 _em_imaging.tilt_angle_min -50 _em_imaging.tilt_angle_max 60 _em_imaging.nominal_cs 2 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 41000 _em_imaging.calibrated_magnification 24500 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 4B2Q _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details ;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS., ; _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 4B2Q _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state CELL _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method TOMOGRAPHY # _em_single_particle_entity.entry_id 4B2Q _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 CD T LYS 196 ? ? 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