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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP Q3HZ71_STREE Q3HZ71 3 ;MSKKEININNYNDDAIQVLEGLDAVRKRPGMYIGSTDGAGLHHLVWEIVDNAVDEALSGFGDRIDVTINKDGSLTVQDHG RGMPTGMHAMGIPTVEVIFTILHAGGKFGQGGYKTSGGLHGVGSSVVNALSSWLEVEITRDGAVYKQRFENGGKPVTTLK KIGTAPKSKTGTKVTFMPDATIFSTTDFKYNTISERLNESAFLLKNVTLSLTDKRTDEAIEFHYENGVQDFVSYLNEDKE ILTPVLYFEGEDNGFQVEVALQYNDGFSDNILSFVNNVRTKDGGTHETGLKSAITKVMNDYARKTGLLKEKDKNLEGSDY REGLAAVLSILVPEEHLQFEGQTKDKLGSPLARPVVDGIVADKLTFFLMENGELASNLIRKAIKARDAREAARKARDESR NGKKNKKDKGLLSGKLTPAQSKNPAKNELYLVEGDSAGGSAKQGRDRKFQAILPLRGKVINTAKAKMADILKNEEINTMI YTIGAGVGADFSIEDANYDKIIIMTDADTDGAHIQTLLLTFFYRYMRPLVEAGHVYIALPPLYKMSKGKGKKEEVAYAWT DGELEELRKQFGKGATLQRYKGLGEMNADQLWETTMNPETRTLIRVTIEDLARAERRVNVLMGDKVEPRRKWIEDNVKFT LEEATVF ; 1 ? 2 UNP D6ZLV0_STRP0 D6ZLV0 3 ;MSNIQNMSLEDIMGERFGRYSKYIIQDRALPDIRDGLKPVQRRILYSMNKDSNTFDKSYRKSAKSVGNIMGNFHPHGDSS IYDAMVRMSQNWKNREILVEMHGNNGSMDGDPPAAMRYTEARLSEIAGYLLQDIEKKTVPFAWNFDDTEKEPTVLPAAFP NLLVNGSTGISAGYATDIPPHNLAEVIDAAVYMIDHPTAKIDKLMEFLPGPDFPTGAIIQGRDEIKKAYETGKGRVVVRS KTEIEKLKGGKEQIVITEIPYEINKANLVKKIDDVRVNNKVAGIAEVRDESDRDGLRIAIELKKDANTELVLNYLFKYTD LQINYNFNMVAIDNFTPRQVGIVPILSSYIAHRREVILARSRFDKEKAEKRLHIVEGLIRVISILDEVIALIRASENKAD AKENLKVSYDFTEEQAEAIVTLQLYRLTNTDVVVLQEEEAELREKIAMLAAIIGDERTMYNLMKKELREVKKKFATPRLS SLEDTAKA ; 1 ? 3 PDB 4I3H 4I3H 1 ? ? ? 4 PDB 4I3H 4I3H 2 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4I3H A 1 ? 647 ? 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'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 4I3H _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.02 _exptl_crystal.density_percent_sol 59.34 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 296 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 5 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;4% isopropanol, 50 mM sodium citrate, 600 nL + 400 nL (protein + precipitant) drop ratio, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K ; # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector PIXEL _diffrn_detector.type 'DECTRIS PILATUS 2M' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2012-07-23 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Single bounce monochromator' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.92000 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'DIAMOND BEAMLINE I04-1' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site Diamond _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline I04-1 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.92000 # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 4I3H _reflns.observed_criterion_sigma_I -1 _reflns.observed_criterion_sigma_F -1 _reflns.d_resolution_low 72.19 _reflns.d_resolution_high 3.7 _reflns.number_obs 39884 _reflns.number_all 39884 _reflns.percent_possible_obs 99.75 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.124 _reflns.pdbx_Rsym_value 0.124 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 3.1256 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 12.11 _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 3.7 _reflns_shell.d_res_low 3.9 _reflns_shell.percent_possible_all 100 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.45 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 1.71 _reflns_shell.pdbx_redundancy 11.46 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? 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J N N 5 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'Asymmetric unit consists of one biological dimer formed by two chains: A and B' # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ARG C 28 ? ILE C 33 ? ARG A 28 ILE A 33 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 GLY C 40 ? SER C 58 ? GLY A 40 SER A 58 1 ? 19 HELX_P HELX_P3 3 VAL C 95 ? ILE C 101 ? VAL A 95 ILE A 101 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 4 SER C 125 ? LEU C 130 ? SER A 125 LEU A 130 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 5 LYS C 189 ? PHE C 202 ? LYS A 189 PHE A 202 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 6 ASN C 226 ? ASN C 236 ? ASN A 226 ASN A 236 1 ? 11 HELX_P HELX_P7 7 GLY C 284 ? LYS C 304 ? GLY A 284 LYS A 304 1 ? 21 HELX_P HELX_P8 8 GLY C 317 ? GLU C 322 ? GLY A 317 GLU A 322 5 ? 6 HELX_P HELX_P9 9 LEU C 351 ? ASN C 371 ? LEU A 351 ASN A 371 1 ? 21 HELX_P HELX_P10 10 GLY C 372 ? LYS C 394 ? GLY A 372 LYS A 394 1 ? 23 HELX_P HELX_P11 11 GLY C 434 ? ARG C 445 ? GLY A 434 ARG A 445 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 12 LYS C 466 ? LYS C 472 ? LYS A 466 LYS A 472 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 13 ASN C 473 ? GLY C 484 ? ASN A 473 GLY A 484 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 14 ASP C 508 ? TYR C 525 ? ASP A 508 TYR A 525 1 ? 18 HELX_P HELX_P15 15 MET C 526 ? ALA C 532 ? MET A 526 ALA A 532 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 16 GLY C 582 ? MET C 586 ? GLY A 582 MET A 586 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 17 ASN C 587 ? THR C 595 ? ASN A 587 THR A 595 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 18 ASP C 610 ? GLY C 623 ? ASP A 610 GLY A 623 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 19 LYS C 625 ? VAL C 637 ? LYS A 625 VAL A 637 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 20 LEU C 657 ? ASP C 675 ? LEU A 1009 ASP A 1027 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 21 LYS C 686 ? ASP C 699 ? LYS A 1038 ASP A 1051 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 22 SER C 710 ? PHE C 721 ? SER A 1062 PHE A 1073 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 23 GLY C 725 ? MET C 736 ? GLY A 1077 MET A 1088 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 24 SER C 772 ? LEU C 779 ? SER A 1124 LEU A 1131 1 ? 8 HELX_P HELX_P25 25 ASP C 781 ? LYS C 785 ? ASP A 1133 LYS A 1137 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 PRO C 808 ? ASN C 813 ? PRO A 1160 ASN A 1165 1 ? 6 HELX_P HELX_P27 27 ASN C 830 ? HIS C 844 ? ASN A 1182 HIS A 1196 1 ? 15 HELX_P HELX_P28 28 LYS C 848 ? MET C 853 ? LYS A 1200 MET A 1205 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 GLY C 869 ? GLY C 880 ? GLY A 1221 GLY A 1232 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 30 ASN C 912 ? VAL C 925 ? ASN A 1264 VAL A 1277 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 31 ASN C 955 ? THR C 967 ? ASN A 1307 THR A 1319 1 ? 13 HELX_P HELX_P32 32 GLY C 989 ? 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GLY B 227 ASN B 236 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 47 GLY D 284 ? THR D 305 ? GLY B 284 THR B 305 1 ? 22 HELX_P HELX_P48 48 PRO D 333 ? LEU D 337 ? PRO B 333 LEU B 337 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 49 LEU D 351 ? PHE D 367 ? LEU B 351 PHE B 367 1 ? 17 HELX_P HELX_P50 50 GLY D 372 ? SER D 399 ? GLY B 372 SER B 399 1 ? 28 HELX_P HELX_P51 51 GLY D 434 ? ARG D 445 ? GLY B 434 ARG B 445 1 ? 12 HELX_P HELX_P52 52 LYS D 466 ? ASN D 473 ? LYS B 466 ASN B 473 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 53 ASN D 473 ? ILE D 483 ? ASN B 473 ILE B 483 1 ? 11 HELX_P HELX_P54 54 SER D 492 ? ALA D 496 ? SER B 492 ALA B 496 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 55 ASP D 508 ? MET D 526 ? ASP B 508 MET B 526 1 ? 19 HELX_P HELX_P56 56 MET D 526 ? GLY D 533 ? MET B 526 GLY B 533 1 ? 8 HELX_P HELX_P57 57 GLY D 582 ? MET D 586 ? GLY B 582 MET B 586 5 ? 5 HELX_P HELX_P58 58 ASN D 587 ? MET D 596 ? ASN B 587 MET B 596 1 ? 10 HELX_P HELX_P59 59 LEU D 611 ? MET D 622 ? LEU B 611 MET B 622 1 ? 12 HELX_P HELX_P60 60 LYS D 625 ? VAL D 637 ? 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VAL D 1055 ? ASN B 1397 VAL B 1407 1 ? 11 HELX_P HELX_P75 75 THR D 1060 ? THR D 1069 ? THR B 1412 THR B 1421 1 ? 10 HELX_P HELX_P76 76 GLN D 1071 ? LEU D 1075 ? GLN B 1423 LEU B 1427 5 ? 5 HELX_P HELX_P77 77 ASP D 1079 ? ASP D 1103 ? ASP B 1431 ASP B 1455 1 ? 25 HELX_P HELX_P78 78 ARG D 1105 ? ALA D 1123 ? 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A DA 11 N6 ? ? ? 1_555 B DT 24 O4 ? ? E DA 2 F DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DA 12 N1 ? ? ? 1_555 B DA 22 N6 ? ? E DA 3 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_1_PAIR ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DA 12 N6 ? ? ? 1_555 B DA 22 N1 ? ? E DA 3 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_1_PAIR ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DA 12 N1 ? ? ? 1_555 B DT 23 N3 ? ? E DA 3 F DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DA 12 N6 ? ? ? 1_555 B DT 23 O4 ? ? E DA 3 F DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DT 13 N3 ? ? ? 1_555 B DA 22 N1 ? ? E DT 4 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DT 13 O4 ? ? ? 1_555 B DA 22 N6 ? ? E DT 4 F DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DA 14 N1 ? ? ? 1_555 B DG 20 N1 ? ? E DA 5 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DA 14 N6 ? ? ? 1_555 B DG 20 O6 ? ? E DA 5 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DA 14 N1 ? ? ? 1_555 B DT 21 N3 ? ? E DA 5 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DA 14 N6 ? ? ? 1_555 B DT 21 O4 ? ? E DA 5 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DC 15 N3 ? ? ? 1_555 B DG 20 N1 ? ? E DC 6 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DC 15 N4 ? ? ? 1_555 B DG 20 O6 ? ? E DC 6 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DC 15 O2 ? ? ? 1_555 B DG 20 N2 ? ? E DC 6 F DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 16 N1 ? ? ? 1_555 B DC 19 N3 ? ? E DG 7 F DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 16 N2 ? ? ? 1_555 B DC 19 O2 ? ? E DG 7 F DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 B DC 19 N4 ? ? E DG 7 F DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 17 N1 ? ? ? 1_555 B DC 18 N3 ? ? E DG 8 F DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 17 N2 ? ? ? 1_555 B DC 18 O2 ? ? E DG 8 F DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 17 O6 ? ? ? 1_555 B DC 18 N4 ? ? E DG 8 F DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DT 18 N3 ? ? ? 1_555 B DA 17 N1 ? ? E DT 9 F DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DT 18 O4 ? ? ? 1_555 B DA 17 N6 ? ? E DT 9 F DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DT 19 N3 ? ? ? 1_555 B DA 16 N1 ? ? E DT 10 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DT 19 O4 ? ? ? 1_555 B DA 16 N6 ? ? E DT 10 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DA 20 N1 ? ? ? 1_555 B DT 15 N3 ? ? E DA 11 F DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DA 20 N6 ? ? ? 1_555 B DT 15 O4 ? ? E DA 11 F DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DT 21 N3 ? ? ? 1_555 B DA 14 N1 ? ? E DT 12 F DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DT 21 O4 ? ? ? 1_555 B DA 14 N6 ? ? E DT 12 F DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DC 22 N3 ? ? ? 1_555 B DG 13 N1 ? ? E DC 13 F DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A DC 22 N4 ? ? ? 1_555 B DG 13 O6 ? ? E DC 13 F DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A DC 22 O2 ? ? ? 1_555 B DG 13 N2 ? ? E DC 13 F DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A DC 23 N4 ? ? ? 1_555 B DT 11 O4 ? ? E DC 14 F DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A DC 23 N3 ? ? ? 1_555 B DG 12 N1 ? ? E DC 14 F DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DC 23 N4 ? ? ? 1_555 B DG 12 O6 ? ? E DC 14 F DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DC 23 O2 ? ? ? 1_555 B DG 12 N2 ? ? E DC 14 F DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DA 24 N1 ? ? ? 1_555 B DT 11 N3 ? ? E DA 15 F DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DA 24 N6 ? ? ? 1_555 B DT 11 O4 ? ? E DA 15 F DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? E DG 8 N1 ? ? ? 1_555 F DC 27 N3 ? ? G DG 8 H DC 27 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? E DG 9 N1 ? ? ? 1_555 F DC 26 N3 ? ? G DG 9 H DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? E DG 9 N2 ? ? ? 1_555 F DC 26 O2 ? ? G DG 9 H DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? E DG 9 O6 ? ? ? 1_555 F DC 26 N4 ? ? G DG 9 H DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? E DT 10 N3 ? ? ? 1_555 F DA 25 N1 ? ? G DT 10 H DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? E DT 10 O4 ? ? ? 1_555 F DA 25 N6 ? ? G DT 10 H DA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? E DA 11 N1 ? ? ? 1_555 F DT 24 N3 ? ? G DA 11 H DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? E DA 11 N6 ? ? ? 1_555 F DT 24 O4 ? ? G DA 11 H DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? E DA 12 N1 ? ? ? 1_555 F DT 23 N3 ? ? G DA 12 H DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? E DA 12 N6 ? ? ? 1_555 F DT 23 O4 ? ? G DA 12 H DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? E DT 13 N3 ? ? ? 1_555 F DA 22 N1 ? ? G DT 13 H DA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? E DT 13 O4 ? ? ? 1_555 F DA 22 N6 ? ? G DT 13 H DA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? E DA 14 N1 ? ? ? 1_555 F DT 21 N3 ? ? G DA 14 H DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? E DA 14 N6 ? ? ? 1_555 F DT 21 O4 ? ? G DA 14 H DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? E DC 15 N3 ? ? ? 1_555 F DG 20 N1 ? ? G DC 15 H DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? E DC 15 N4 ? ? ? 1_555 F DG 20 O6 ? ? G DC 15 H DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? E DC 15 O2 ? ? ? 1_555 F DG 20 N2 ? ? G DC 15 H DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? E DG 16 N1 ? ? ? 1_555 F DC 19 O2 ? ? G DG 16 H DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? E DG 17 N2 ? ? ? 1_555 F DC 18 O2 ? ? G DG 17 H DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? E DG 17 N1 ? ? ? 1_555 F DC 19 N3 ? ? G DG 17 H DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog61 hydrog ? ? E DT 18 N3 ? ? ? 1_555 F DA 17 N1 ? ? G DT 18 H DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog62 hydrog ? ? E DT 18 N3 ? ? ? 1_555 F DC 18 N3 ? ? G DT 18 H DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog63 hydrog ? ? E DT 18 O4 ? ? ? 1_555 F DC 18 N4 ? ? G DT 18 H DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog64 hydrog ? ? E DT 19 N3 ? ? ? 1_555 F DA 16 N1 ? ? G DT 19 H DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog65 hydrog ? ? E DA 20 N1 ? ? ? 1_555 F DT 15 N3 ? ? G DA 20 H DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog66 hydrog ? ? E DA 20 N6 ? ? ? 1_555 F DT 15 O4 ? ? G DA 20 H DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog67 hydrog ? ? 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'DG-DC PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 37 C . ? ASP 37 A GLY 38 C ? GLY 38 A 1 0.97 2 LYS 547 C . ? LYS 547 A GLY 548 C ? GLY 548 A 1 -0.98 3 THR 640 C . ? THR 640 A LEU 641 C ? LEU 641 A 1 -6.29 4 THR 816 C . ? 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491 TYR OH HH sing N N 492 TYR OXT HXT sing N N 493 VAL N CA sing N N 494 VAL N H sing N N 495 VAL N H2 sing N N 496 VAL CA C sing N N 497 VAL CA CB sing N N 498 VAL CA HA sing N N 499 VAL C O doub N N 500 VAL C OXT sing N N 501 VAL CB CG1 sing N N 502 VAL CB CG2 sing N N 503 VAL CB HB sing N N 504 VAL CG1 HG11 sing N N 505 VAL CG1 HG12 sing N N 506 VAL CG1 HG13 sing N N 507 VAL CG2 HG21 sing N N 508 VAL CG2 HG22 sing N N 509 VAL CG2 HG23 sing N N 510 VAL OXT HXT sing N N 511 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 4I3H 'double helix' 4I3H 'a-form double helix' 4I3H 'b-form double helix' 4I3H 'triple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DA 11 1_555 B DT 23 1_555 0.769 0.126 -1.096 11.579 31.414 -17.994 1 E_DA2:DT14_F E 2 ? 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