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'C5 H11 N O2 Se' 196.106 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 4L3I _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 5.92 _exptl_crystal.density_percent_sol 79.22 _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 294 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 8.0 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;Concentration: 5-10 mg/ml Protein buffer: 80 mM PIPES (pH 6.8), 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 150 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K ; # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100.0 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 315' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2011-06-30 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Si(111)' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.9787 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'APS BEAMLINE 24-ID-C' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site APS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 24-ID-C _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.9787 # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 4L3I _reflns.observed_criterion_sigma_I 1.4 _reflns.observed_criterion_sigma_F 1.4 _reflns.d_resolution_low 30 _reflns.d_resolution_high 3.55 _reflns.number_obs 31794 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 96.2 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 3.55 _reflns_shell.d_res_low 3.68 _reflns_shell.percent_possible_all 83.7 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs ? _reflns_shell.pdbx_redundancy ? # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 4L3I _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 30429 _refine.ls_number_reflns_all 30429 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.00 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? 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_refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 1.24 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct SAD _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values TWIN_LSQ_F _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML . _refine.pdbx_overall_phase_error 37.22 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 6446 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 6446 _refine_hist.d_res_high 3.6005 _refine_hist.d_res_low 29.734 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.003 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' . 3.6904 3.7900 1957 0.3759 85.00 0.4095 . . 134 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.7900 3.9012 1987 0.3584 89.00 0.4340 . . 135 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.9012 4.0269 1993 0.3178 88.00 0.3305 . . 133 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.0269 4.1704 2076 0.3094 91.00 0.3508 . . 143 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.1704 4.3369 2060 0.2899 91.00 0.3796 . . 139 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.3369 4.5337 2076 0.2561 93.00 0.2944 . . 139 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.5337 4.7718 2046 0.2621 91.00 0.3139 . . 144 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.7718 5.0694 2104 0.2570 92.00 0.2331 . . 143 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.0694 5.4585 2055 0.2790 92.00 0.3125 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.4585 6.0038 2073 0.3450 91.00 0.4478 . . 144 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 6.0038 6.8632 2066 0.3389 91.00 0.4444 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 6.8632 8.6119 2080 0.2191 92.00 0.2332 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 8.6119 29.7349 2059 0.1588 90.00 0.2053 . . 143 . . # _pdbx_refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _pdbx_refine.entry_id 4L3I _pdbx_refine.R_factor_all_no_cutoff ? _pdbx_refine.R_factor_obs_no_cutoff ? _pdbx_refine.free_R_factor_no_cutoff ? _pdbx_refine.free_R_error_no_cutoff ? _pdbx_refine.free_R_val_test_set_size_perc_no_cutoff ? _pdbx_refine.free_R_val_test_set_ct_no_cutoff ? _pdbx_refine.R_factor_all_4sig_cutoff ? _pdbx_refine.R_factor_obs_4sig_cutoff ? _pdbx_refine.free_R_factor_4sig_cutoff ? _pdbx_refine.free_R_val_test_set_size_perc_4sig_cutoff ? _pdbx_refine.free_R_val_test_set_ct_4sig_cutoff ? _pdbx_refine.number_reflns_obs_4sig_cutoff ? # _struct.entry_id 4L3I _struct.title 'Structure of the microtubule associated protein PRC1 (Protein Regulator of Cytokinesis 1)' _struct.pdbx_descriptor 'Protein regulator of cytokinesis 1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4L3I _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.text 'Spectrin, Helical, Coiled-coil, Microtubule binding, microtubule crosslinking, Spindle midzone, STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ARG A 6 ? ILE A 33 ? ARG A 2 ILE A 29 1 ? 28 HELX_P HELX_P2 2 PRO A 36 ? GLU A 86 ? PRO A 32 GLU A 82 1 ? 51 HELX_P HELX_P3 3 THR A 99 ? CYS A 140 ? THR A 95 CYS A 136 1 ? 42 HELX_P HELX_P4 4 SER A 153 ? ASP A 193 ? SER A 149 ASP A 189 1 ? 41 HELX_P HELX_P5 5 THR A 198 ? GLU A 207 ? 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TRP B 436 LEU B 441 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale ? ? 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A MSE 398 A LEU 399 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale20 covale ? ? A PHE 425 C ? ? ? 1_555 A MSE 426 N ? ? A PHE 421 A MSE 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale21 covale ? ? A MSE 426 C ? ? ? 1_555 A VAL 427 N ? ? A MSE 422 A VAL 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale22 covale ? ? A PHE 432 C ? ? ? 1_555 A MSE 433 N ? ? A PHE 428 A MSE 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale23 covale ? ? A MSE 433 C ? ? ? 1_555 A GLU 434 N ? ? A MSE 429 A GLU 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale24 covale ? ? A GLU 441 C ? ? ? 1_555 A MSE 442 N ? ? A GLU 437 A MSE 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale25 covale ? ? A MSE 442 C ? ? ? 1_555 A HIS 443 N ? ? A MSE 438 A HIS 439 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale26 covale ? ? B ASP 56 C ? ? ? 1_555 B MSE 57 N ? ? B ASP 52 B MSE 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale27 covale ? ? B MSE 57 C ? ? ? 1_555 B MSE 58 N ? ? B MSE 53 B MSE 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale28 covale ? ? B MSE 58 C ? ? ? 1_555 B ILE 59 N ? ? 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