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'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 4MXW _struct.title 'Structure of heterotrimeric lymphotoxin LTa1b2 bound to lymphotoxin beta receptor LTbR and anti-LTa Fab' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4MXW _struct_keywords.pdbx_keywords 'CYTOKINE/IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.text ;TNF, Tumor Necrosis Factor, TNFR Receptor, lymphotoxin beta receptor, lymphotoxin alpha, Lymphoid development, Tumor immunity, Auto-immunity, CYTOKINE-IMMUNE SYSTEM complex ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 1 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 5 ? 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HIS B 225 VAL B 229 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 6 HIS G 183 ? VAL G 187 ? HIS D 225 VAL D 229 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 7 THR I 28 ? TYR I 32 ? THR W 28 TYR W 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 8 GLU I 62 ? LYS I 65 ? GLU W 62 LYS W 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P9 9 LYS I 200 ? ASN I 203 ? LYS W 200 ASN W 203 5 ? 4 HELX_P HELX_P10 10 THR J 28 ? TYR J 32 ? THR H 28 TYR H 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 11 GLU J 62 ? LYS J 65 ? GLU H 62 LYS H 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P12 12 LYS J 74 ? LYS J 76 ? LYS H 74 LYS H 76 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 13 LYS J 200 ? ASN J 203 ? LYS H 200 ASN H 203 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 14 SER K 121 ? SER K 127 ? SER V 121 SER V 127 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 15 LYS K 183 ? HIS K 189 ? LYS V 183 HIS V 189 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 16 SER L 121 ? SER L 127 ? SER L 121 SER L 127 1 ? 7 HELX_P HELX_P17 17 LYS L 183 ? HIS L 189 ? LYS L 183 HIS L 189 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 25 SG ? ? ? 1_555 A CYS 40 SG ? ? S CYS 43 S CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 41 SG ? ? ? 1_555 A CYS 54 SG ? ? S CYS 59 S CYS 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 44 SG ? ? ? 1_555 A CYS 62 SG ? ? S CYS 62 S CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 65 SG ? ? ? 1_555 A CYS 80 SG ? ? S CYS 83 S CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 83 SG ? ? ? 1_555 A CYS 98 SG ? ? S CYS 101 S CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf6 disulf ? ? A CYS 86 SG ? ? ? 1_555 A CYS 106 SG ? ? S CYS 104 S CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? ? disulf7 disulf ? ? H CYS 25 SG ? ? ? 1_555 H CYS 40 SG ? ? R CYS 43 R CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf8 disulf ? ? H CYS 41 SG ? ? ? 1_555 H CYS 54 SG ? ? R CYS 59 R CYS 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? ? disulf9 disulf ? ? H CYS 44 SG ? ? ? 1_555 H CYS 62 SG ? ? R CYS 62 R CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? ? disulf10 disulf ? ? H CYS 65 SG ? ? ? 1_555 H CYS 80 SG ? ? R CYS 83 R CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf11 disulf ? ? H CYS 83 SG ? ? ? 1_555 H CYS 98 SG ? ? R CYS 101 R CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf12 disulf ? ? H CYS 86 SG ? ? ? 1_555 H CYS 106 SG ? ? R CYS 104 R CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf13 disulf ? ? H CYS 108 SG ? ? ? 1_555 H CYS 121 SG ? ? R CYS 126 R CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? disulf14 disulf ? ? H CYS 114 SG ? ? ? 1_555 H CYS 124 SG ? ? R CYS 132 R CYS 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? ? disulf15 disulf ? ? H CYS 130 SG ? ? ? 1_555 H CYS 149 SG ? ? R CYS 148 R CYS 167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf16 disulf ? ? H CYS 152 SG ? ? ? 1_555 H CYS 167 SG ? ? R CYS 170 R CYS 185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? H CYS 173 SG ? ? ? 1_555 H CYS 192 SG ? ? R CYS 191 R CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf18 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 96 SG ? ? W CYS 22 W CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf19 disulf ? ? I CYS 139 SG ? ? ? 1_555 I CYS 195 SG ? ? W CYS 139 W CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf20 disulf ? ? J CYS 22 SG ? ? ? 1_555 J CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf21 disulf ? ? J CYS 139 SG ? ? ? 1_555 J CYS 195 SG ? ? H CYS 139 H CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf22 disulf ? ? K CYS 23 SG ? ? ? 1_555 K CYS 88 SG ? ? V CYS 23 V CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? ? disulf23 disulf ? ? K CYS 134 SG ? ? ? 1_555 K CYS 194 SG ? ? V CYS 134 V CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf24 disulf ? ? L CYS 23 SG ? ? ? 1_555 L CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf25 disulf ? ? L CYS 134 SG ? ? ? 1_555 L CYS 194 SG ? ? L CYS 134 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ALA 96 A . ? ALA 114 S PRO 97 A ? PRO 115 S 1 0.60 2 THR 144 C . ? THR 186 Y PRO 145 C ? PRO 187 Y 1 -1.45 3 THR 144 F . ? THR 186 B PRO 145 F ? PRO 187 B 1 -0.77 4 ALA 96 H . ? ALA 114 R PRO 97 H ? PRO 115 R 1 -4.87 5 PHE 145 I . ? PHE 145 W PRO 146 I ? PRO 146 W 1 -4.87 6 GLU 147 I . ? GLU 147 W PRO 148 I ? PRO 148 W 1 -1.05 7 PHE 145 J . ? PHE 145 H PRO 146 J ? PRO 146 H 1 -4.77 8 GLU 147 J . ? GLU 147 H PRO 148 J ? PRO 148 H 1 -0.40 9 THR 94 K . ? THR 94 V PRO 95 K ? PRO 95 V 1 2.56 10 TYR 140 K . ? TYR 140 V PRO 141 K ? PRO 141 V 1 -6.75 11 THR 94 L . ? THR 94 L PRO 95 L ? PRO 95 L 1 3.02 12 TYR 140 L . ? TYR 140 L PRO 141 L ? PRO 141 L 1 -4.89 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 2 ? B ? 2 ? C ? 2 ? D ? 3 ? E ? 5 ? F ? 5 ? G ? 5 ? H ? 3 ? I ? 5 ? J ? 5 ? K ? 3 ? L ? 5 ? M ? 5 ? N ? 3 ? O ? 5 ? P ? 5 ? Q ? 3 ? R ? 5 ? S ? 5 ? T ? 3 ? U ? 5 ? V ? 5 ? W ? 2 ? X ? 2 ? Y ? 2 ? Z ? 2 ? AA ? 2 ? AB ? 4 ? AC ? 6 ? AD ? 4 ? AE ? 4 ? AF ? 4 ? AG ? 7 ? AH ? 4 ? AI ? 6 ? AJ ? 4 ? AK ? 4 ? AL ? 4 ? AM ? 3 ? AN ? 4 ? AO ? 2 ? AP ? 4 ? AQ ? 4 ? AR ? 4 ? AS ? 4 ? AT ? 6 ? AU ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel F 4 5 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel G 4 5 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel I 4 5 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel J 4 5 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel O 4 5 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel P 4 5 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel S 4 5 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel U 4 5 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel V 4 5 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AB 3 4 ? anti-parallel AC 1 2 ? parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AC 4 5 ? anti-parallel AC 5 6 ? anti-parallel AD 1 2 ? parallel AD 2 3 ? anti-parallel AD 3 4 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AE 3 4 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AF 3 4 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AG 3 4 ? parallel AG 4 5 ? anti-parallel AG 5 6 ? anti-parallel AG 6 7 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AH 2 3 ? anti-parallel AH 3 4 ? anti-parallel AI 1 2 ? parallel AI 2 3 ? anti-parallel AI 3 4 ? anti-parallel AI 4 5 ? anti-parallel AI 5 6 ? anti-parallel AJ 1 2 ? parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AK 2 3 ? anti-parallel AK 3 4 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AL 2 3 ? anti-parallel AL 3 4 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? anti-parallel AO 1 2 ? parallel AP 1 2 ? anti-parallel AP 2 3 ? anti-parallel AP 3 4 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AQ 2 3 ? anti-parallel AQ 3 4 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? anti-parallel AR 3 4 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AS 3 4 ? anti-parallel AT 1 2 ? parallel AT 2 3 ? anti-parallel AT 3 4 ? anti-parallel AT 4 5 ? anti-parallel AT 5 6 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? anti-parallel AU 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 GLU A 31 ? 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CA sing N N 304 TRP N H sing N N 305 TRP N H2 sing N N 306 TRP CA C sing N N 307 TRP CA CB sing N N 308 TRP CA HA sing N N 309 TRP C O doub N N 310 TRP C OXT sing N N 311 TRP CB CG sing N N 312 TRP CB HB2 sing N N 313 TRP CB HB3 sing N N 314 TRP CG CD1 doub Y N 315 TRP CG CD2 sing Y N 316 TRP CD1 NE1 sing Y N 317 TRP CD1 HD1 sing N N 318 TRP CD2 CE2 doub Y N 319 TRP CD2 CE3 sing Y N 320 TRP NE1 CE2 sing Y N 321 TRP NE1 HE1 sing N N 322 TRP CE2 CZ2 sing Y N 323 TRP CE3 CZ3 doub Y N 324 TRP CE3 HE3 sing N N 325 TRP CZ2 CH2 doub Y N 326 TRP CZ2 HZ2 sing N N 327 TRP CZ3 CH2 sing Y N 328 TRP CZ3 HZ3 sing N N 329 TRP CH2 HH2 sing N N 330 TRP OXT HXT sing N N 331 TYR N CA sing N N 332 TYR N H sing N N 333 TYR N H2 sing N N 334 TYR CA C sing N N 335 TYR CA CB sing N N 336 TYR CA HA sing N N 337 TYR C O doub N N 338 TYR C OXT sing N N 339 TYR CB CG sing N N 340 TYR CB HB2 sing N N 341 TYR CB HB3 sing N N 342 TYR CG CD1 doub Y N 343 TYR CG CD2 sing Y N 344 TYR CD1 CE1 sing Y N 345 TYR CD1 HD1 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