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'Acta Crystallogr.,Sect.D' 70 2316 2330 2014 ABCRE6 DK 0907-4449 0766 ? 25195746 10.1107/S1399004714013789 1 'Refined structure of satellite tobacco mosaic virus at 1.8 A resolution.' J.Mol.Biol. 277 37 59 1998 JMOBAK UK 0022-2836 0070 ? 9514737 10.1006/jmbi.1997.1570 2 'Three-dimensional structure of satellite tobacco mosaic virus at 2.9 A resolution.' J.Mol.Biol. 231 375 391 1993 JMOBAK UK 0022-2836 0070 ? 8510153 10.1006/jmbi.1993.1289 3 'Double-helical RNA in satellite tobacco mosaic virus.' Nature 361 179 182 1993 NATUAS UK 0028-0836 0006 ? 8421525 10.1038/361179a0 4 'Macromolecular crystal growth experiments on International Microgravity Laboratory--1.' 'Protein Sci.' 1 1254 1268 1992 PRCIEI US 0961-8368 0795 ? 1303744 10.1002/pro.5560011004 5 'Preliminary analysis of crystals of satellite tobacco mosaic virus.' J.Mol.Biol. 209 323 325 1989 JMOBAK UK 0022-2836 0070 ? 2585487 ? 6 'Satellite tobacco mosaic virus RNA: structure and implications for assembly.' Curr.Opin.Struct.Biol. 11 59 65 2001 COSBEF UK 0959-440X 0801 ? 11179893 ? 7 'A model for the structure of satellite tobacco mosaic virus.' J.Struct.Biol. 180 110 116 2012 JSBIEM US 1047-8477 0803 ? 22750417 10.1016/j.jsb.2012.06.008 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Larson, S.B.' 1 ? primary 'Day, J.S.' 2 ? primary 'McPherson, A.' 3 ? 1 'Larson, S.B.' 4 ? 1 'Day, J.' 5 ? 1 'Greenwood, A.' 6 ? 1 'McPherson, A.' 7 ? 2 'Larson, S.B.' 8 ? 2 'Koszelak, S.' 9 ? 2 'Day, J.' 10 ? 2 'Greenwood, A.' 11 ? 2 'Dodds, J.A.' 12 ? 2 'McPherson, A.' 13 ? 3 'Larson, S.B.' 14 ? 3 'Koszelak, S.' 15 ? 3 'Day, J.' 16 ? 3 'Greenwood, A.' 17 ? 3 'Dodds, J.A.' 18 ? 3 'McPherson, A.' 19 ? 4 'Day, J.' 20 ? 4 'McPherson, A.' 21 ? 5 'Koszelak, S.' 22 ? 5 'Dodds, J.A.' 23 ? 5 'McPherson, A.' 24 ? 6 'Larson, S.B.' 25 ? 6 'McPherson, A.' 26 ? 7 'Zeng, Y.' 27 ? 7 'Larson, S.B.' 28 ? 7 'Heitsch, C.E.' 29 ? 7 'McPherson, A.' 30 ? 7 'Harvey, S.C.' 31 ? # _cell.entry_id 4OQ9 _cell.length_a 172.690 _cell.length_b 190.300 _cell.length_c 201.690 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 120 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 4OQ9 _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Coat protein' 17533.949 15 ? ? ? ? 2 polymer nat ;RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3') ; 3247.100 15 ? ? ? 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'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 NA non-polymer . 'SODIUM ION' ? 'Na 1' 22.990 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PO4 non-polymer . 'PHOSPHATE ION' ? 'O4 P -3' 94.971 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SO4 non-polymer . 'SULFATE ION' ? 'O4 S -2' 96.063 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 4OQ9 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 6 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.27 _exptl_crystal.density_percent_sol 45.74 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 296 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.50 _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K ; _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 315' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2003-10-03 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Double crystal, Si(111)' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.06 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ALS BEAMLINE 8.2.2' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ALS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 8.2.2 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.06 # _reflns.entry_id 4OQ9 _reflns.observed_criterion_sigma_I 0 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 48.35 _reflns.d_resolution_high 1.4 _reflns.number_obs 613720 _reflns.number_all 643001 _reflns.percent_possible_obs 95.4 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.100 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 11.6 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 26.95 _reflns.pdbx_redundancy 7.23 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared 1.65 _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # loop_ _reflns_shell.d_res_high _reflns_shell.d_res_low _reflns_shell.percent_possible_all _reflns_shell.Rmerge_I_obs _reflns_shell.pdbx_Rsym_value _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs _reflns_shell.pdbx_redundancy _reflns_shell.percent_possible_obs _reflns_shell.number_unique_all _reflns_shell.number_measured_all _reflns_shell.number_measured_obs _reflns_shell.number_unique_obs _reflns_shell.pdbx_chi_squared _reflns_shell.pdbx_ordinal _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1.40 1.45 67.3 .354 ? 2.9 2.17 ? 43070 831527 ? ? ? 1 1 1.45 1.51 95.5 .363 ? 3.2 2.90 ? 61111 705358 ? ? ? 2 1 1.51 1.58 98.0 .387 ? 3.7 4.01 ? 62700 561327 ? ? ? 3 1 1.58 1.66 99.0 .419 ? 4.1 5.74 ? 63508 510647 ? ? ? 4 1 1.66 1.76 99.5 .413 ? 4.7 7.14 ? 63761 483716 ? ? ? 5 1 1.76 1.90 99.1 .400 ? 5.2 7.61 ? 63596 455293 ? ? ? 6 1 1.90 2.09 98.6 .359 ? 6.0 8.06 ? 63318 364831 ? ? ? 7 1 2.09 2.39 98.6 .266 ? 7.7 8.85 ? 63441 251372 ? ? ? 8 1 2.39 3.02 99.2 .146 ? 14.2 11.01 ? 64091 177148 ? ? ? 9 1 3.02 48.35 99.4 .066 ? 31.4 12.77 ? 65124 93374 ? ? ? 10 1 # _refine.entry_id 4OQ9 _refine.ls_number_reflns_obs 570721 _refine.ls_number_reflns_all 570721 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 48.35 _refine.ls_d_res_high 1.45 _refine.ls_percent_reflns_obs 98.55 _refine.ls_R_factor_obs 0.21817 _refine.ls_R_factor_all 0.21817 _refine.ls_R_factor_R_work 0.21652 _refine.ls_R_factor_R_free 0.24973 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0 _refine.ls_number_reflns_R_free 28359 _refine.ls_number_parameters 247916 _refine.ls_number_restraints 452738 _refine.occupancy_min 0.10 _refine.occupancy_max 1.00 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.971 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.964 _refine.B_iso_mean 45.601 _refine.aniso_B[1][1] -0.74 _refine.aniso_B[2][2] 0.93 _refine.aniso_B[3][3] -0.19 _refine.aniso_B[1][2] 0.00 _refine.aniso_B[1][3] 0.00 _refine.aniso_B[2][3] 0.00 _refine.solvent_model_details 'BABINET MODEL WITH MASK' _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.40 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.80 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.80 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS; NCS restraints were applied to equivalent chains (entities 1, 2 and 3, but not 4); NCS restraints for entities 2 and 3 were divided into 2 sets for each entity (4 NCS groups in total) based on the part id assigned to each individual chain. Close contacts between RNA atoms are due to inherent disorder that exists in the crystal lattice. ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB entry 1A34' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model 'Mixed isotropic/anisotropic' _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.097 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.086 _refine.overall_SU_ML 0.068 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B 4.012 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI 0.0974 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min 10.93 _refine.B_iso_max 200.0 _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free 0.2706 _refine.ls_wR_factor_R_work 0.2348 _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 16770 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 6720 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 125 _refine_hist.number_atoms_solvent 4276 _refine_hist.number_atoms_total 27891 _refine_hist.d_res_high 1.45 _refine_hist.d_res_low 48.35 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function _refine_ls_restr.pdbx_refine_id r_bond_refined_d 0.009 0.022 ? 26291 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_bond_other_d 0.002 0.020 ? 21955 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_angle_refined_deg 1.250 2.276 ? 37559 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_angle_other_deg 0.786 3.003 ? 49911 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_dihedral_angle_1_deg 6.901 5.000 ? 2568 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_dihedral_angle_2_deg 33.548 22.485 ? 809 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_dihedral_angle_3_deg 12.822 15.000 ? 3197 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_dihedral_angle_4_deg 16.148 15.000 ? 199 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_chiral_restr 0.073 0.200 ? 4636 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_gen_planes_refined 0.009 0.021 ? 25150 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_gen_planes_other 0.004 0.020 ? 5674 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_nbd_refined 0.214 0.300 ? 2943 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_nbd_other 0.197 0.300 ? 17720 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_nbtor_refined 0.178 0.500 ? 8737 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_nbtor_other 0.087 0.500 ? 11721 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_xyhbond_nbd_refined 0.202 0.500 ? 4396 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_xyhbond_nbd_other 0.124 0.500 ? 20 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_metal_ion_refined 0.205 0.500 ? 14 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_metal_ion_other ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_mcbond_it 1.956 2.000 ? 11633 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_mcbond_other 1.811 2.000 ? 4524 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_mcangle_it 3.069 3.000 ? 19452 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_mcangle_other 2.039 3.000 ? 16033 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_scbond_it 5.504 9.000 ? 14658 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_scbond_other 5.700 9.000 ? 17431 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_scangle_it 8.388 12.000 ? 17910 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_scangle_other 6.189 12.000 ? 33878 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_rigid_bond_restr 2.443 3.000 ? 20102 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_symmetry_vdw_refined 0.238 0.300 ? 249 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_symmetry_vdw_other 0.210 0.300 ? 997 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_symmetry_hbond_refined 0.195 0.500 ? 459 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_symmetry_hbond_other 0.120 0.500 ? 1 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_symmetry_metal_ion_refined 0.201 0.500 ? 1 ? 'X-RAY DIFFRACTION' r_symmetry_metal_ion_other ? ? ? ? ? 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? ? ? ? ? 8 'X-RAY DIFFRACTION' 1 8 'LOOSE POSITIONAL' a 331 0.010 0.020 ? ? ? ? ? ? 9 'X-RAY DIFFRACTION' 1 1 'LOOSE THERMAL' P 331 0.050 0.500 ? ? ? ? ? ? 10 'X-RAY DIFFRACTION' 1 2 'LOOSE THERMAL' Q 331 0.040 0.500 ? ? ? ? ? ? 11 'X-RAY DIFFRACTION' 1 3 'LOOSE THERMAL' R 331 0.040 0.500 ? ? ? ? ? ? 12 'X-RAY DIFFRACTION' 1 4 'LOOSE THERMAL' T 331 0.060 0.500 ? ? ? ? ? ? 13 'X-RAY DIFFRACTION' 1 5 'LOOSE THERMAL' V 331 0.040 0.500 ? ? ? ? ? ? 14 'X-RAY DIFFRACTION' 1 6 'LOOSE THERMAL' X 331 0.050 0.500 ? ? ? ? ? ? 15 'X-RAY DIFFRACTION' 1 7 'LOOSE THERMAL' Y 331 0.040 0.500 ? ? ? ? ? ? 16 'X-RAY DIFFRACTION' 1 8 'LOOSE THERMAL' a 331 0.050 0.500 ? ? ? ? ? ? 17 'X-RAY DIFFRACTION' 2 1 'LOOSE POSITIONAL' e 301 0.010 0.020 ? ? ? ? ? ? 18 'X-RAY DIFFRACTION' 2 2 'LOOSE POSITIONAL' g 301 0.010 0.020 ? ? ? ? ? ? 19 'X-RAY DIFFRACTION' 2 3 'LOOSE POSITIONAL' h 301 0.010 0.020 ? ? ? ? ? ? 20 'X-RAY DIFFRACTION' 2 4 'LOOSE POSITIONAL' i 301 0.010 0.020 ? ? ? ? ? ? 21 'X-RAY DIFFRACTION' 2 5 'LOOSE POSITIONAL' m 301 0.010 0.020 ? 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LE 9 HOH 1 201 5173 HOH HOH o . LE 9 HOH 2 202 5176 HOH HOH o . LE 9 HOH 3 203 5182 HOH HOH o . LE 9 HOH 4 204 5244 HOH HOH o . LE 9 HOH 5 205 5264 HOH HOH o . LE 9 HOH 6 206 5665 HOH HOH o . LE 9 HOH 7 207 5666 HOH HOH o . LE 9 HOH 8 208 5667 HOH HOH o . LE 9 HOH 9 209 5668 HOH HOH o . ME 9 HOH 1 201 6169 HOH HOH p . ME 9 HOH 2 202 6170 HOH HOH p . ME 9 HOH 3 203 6171 HOH HOH p . ME 9 HOH 4 204 6173 HOH HOH p . ME 9 HOH 5 205 6184 HOH HOH p . ME 9 HOH 6 206 6277 HOH HOH p . NE 9 HOH 1 201 6665 HOH HOH q . NE 9 HOH 2 202 6666 HOH HOH q . NE 9 HOH 3 203 6667 HOH HOH q . NE 9 HOH 4 204 6668 HOH HOH q . NE 9 HOH 5 205 6677 HOH HOH q . NE 9 HOH 6 206 6760 HOH HOH q . NE 9 HOH 7 207 6761 HOH HOH q . NE 9 HOH 8 208 6777 HOH HOH q . NE 9 HOH 9 209 6779 HOH HOH q . NE 9 HOH 10 210 6784 HOH HOH q . OE 9 HOH 1 201 673 HOH HOH r . OE 9 HOH 2 202 681 HOH HOH r . OE 9 HOH 3 203 7160 HOH HOH r . OE 9 HOH 4 204 7161 HOH HOH r . OE 9 HOH 5 205 7162 HOH HOH r . OE 9 HOH 6 206 7165 HOH HOH r . OE 9 HOH 7 207 7168 HOH HOH r . OE 9 HOH 8 208 7173 HOH HOH r . OE 9 HOH 9 209 7257 HOH HOH r . OE 9 HOH 10 210 7270 HOH HOH r . PE 9 HOH 1 201 668 HOH HOH s . PE 9 HOH 2 202 671 HOH HOH s . PE 9 HOH 3 203 677 HOH HOH s . PE 9 HOH 4 204 5178 HOH HOH s . PE 9 HOH 5 205 7668 HOH HOH s . PE 9 HOH 6 206 7669 HOH HOH s . PE 9 HOH 7 207 7814 HOH HOH s . QE 9 HOH 1 201 7553 HOH HOH t . RE 9 HOH 1 201 2769 HOH HOH x . RE 9 HOH 2 202 3053 HOH HOH x . SE 9 HOH 1 201 5261 HOH HOH 4 . TE 9 HOH 1 201 6810 HOH HOH 6 . UE 9 HOH 1 201 7802 HOH HOH 8 . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete point assembly' ? 240-meric 240 2 'point asymmetric unit' ? 60-meric 60 3 'point asymmetric unit, std point frame' ? 60-meric 60 4 'crystal asymmetric unit, crystal frame' ? 60-meric 60 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-4)' ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE ; 2 1 ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE ; 3 P ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE ; 4 '(X0)(1)' ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE ; # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 X0 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 # _pdbx_point_symmetry.entry_id 4OQ9 _pdbx_point_symmetry.Schoenflies_symbol D _pdbx_point_symmetry.circular_symmetry 2 _pdbx_point_symmetry.H-M_notation ? # _pdbx_struct_special_symmetry.id 1 _pdbx_struct_special_symmetry.PDB_model_num 1 _pdbx_struct_special_symmetry.auth_asym_id L _pdbx_struct_special_symmetry.auth_comp_id HOH _pdbx_struct_special_symmetry.auth_seq_id 5269 _pdbx_struct_special_symmetry.PDB_ins_code ? _pdbx_struct_special_symmetry.label_asym_id ID _pdbx_struct_special_symmetry.label_comp_id HOH _pdbx_struct_special_symmetry.label_seq_id . # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OD1 ? A ASP 68 ? A ASP 68 ? 1_555 NA A KB NA . ? A NA 203 ? 1_555 OD1 ? O ASP 68 ? O ASP 68 ? 1_555 127.5 ? 2 OD1 ? A ASP 68 ? A ASP 68 ? 1_555 NA A KB NA . ? A NA 203 ? 1_555 O ? LD HOH . ? O HOH 337 ? 1_555 159.2 ? 3 OD1 ? O ASP 68 ? O ASP 68 ? 1_555 NA A KB NA . ? A NA 203 ? 1_555 O ? LD HOH . ? O HOH 337 ? 1_555 72.5 ? 4 OD1 ? A ASP 68 ? A ASP 68 ? 1_555 NA A KB NA . ? A NA 203 ? 1_555 O ? LD HOH . ? O HOH 434 ? 1_555 80.7 ? 5 OD1 ? O ASP 68 ? O ASP 68 ? 1_555 NA A KB NA . ? A NA 203 ? 1_555 O ? LD HOH . ? O HOH 434 ? 1_555 82.9 ? 6 O ? LD HOH . ? O HOH 337 ? 1_555 NA A KB NA . ? A NA 203 ? 1_555 O ? LD HOH . ? O HOH 434 ? 1_555 110.4 ? 7 O4 C IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 B IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 20.6 ? 8 O4 C IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 E IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 33.6 ? 9 O4 B IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 E IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 35.6 ? 10 O4 C IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 A IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 32.4 ? 11 O4 B IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 A IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 18.0 ? 12 O4 E IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 A IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 25.9 ? 13 O4 C IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 D IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 21.2 ? 14 O4 B IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 D IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 38.7 ? 15 O4 E IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 D IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 27.2 ? 16 O4 A IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 MG ? UB MG . ? E MG 203 ? 1_555 O4 D IB PO4 . ? A PO4 201 ? 1_555 42.4 ? 17 O ? XC HOH . ? A HOH 520 ? 1_555 NA B WC NA . ? O NA 202 ? 1_555 O B XC HOH . ? A HOH 725 ? 1_555 122.3 ? 18 O ? XC HOH . ? A HOH 520 ? 1_555 NA B WC NA . ? O NA 202 ? 1_555 OD1 ? O ASP 68 ? O ASP 68 ? 1_555 150.2 ? 19 O B XC HOH . ? A HOH 725 ? 1_555 NA B WC NA . ? O NA 202 ? 1_555 OD1 ? O ASP 68 ? O ASP 68 ? 1_555 87.4 ? 20 OD2 ? B ASP 68 ? B ASP 68 ? 1_555 NA ? MB NA . ? B NA 202 ? 1_555 O ? YC HOH . ? B HOH 516 ? 1_555 86.5 ? 21 OD1 ? B ASP 68 ? B ASP 68 ? 1_555 NA ? NB NA . ? B NA 203 ? 1_555 O ? YC HOH . ? B HOH 426 ? 1_555 91.1 ? 22 OD1 ? C ASP 68 ? C ASP 68 ? 1_555 NA B PB NA . ? C NA 202 ? 1_555 O ? ZC HOH . ? C HOH 498 ? 1_555 75.7 ? 23 OD1 ? E ASP 68 ? E ASP 68 ? 1_555 NA ? VB NA . ? E NA 204 ? 1_555 O ? CD HOH . ? F HOH 325 ? 1_555 138.3 ? 24 OD1 ? E ASP 68 ? E ASP 68 ? 1_555 NA ? VB NA . ? E NA 204 ? 1_555 O ? CD HOH . ? F HOH 423 ? 1_555 111.2 ? 25 O ? CD HOH . ? F HOH 325 ? 1_555 NA ? VB NA . ? E NA 204 ? 1_555 O ? CD HOH . ? F HOH 423 ? 1_555 110.3 ? 26 OD2 ? E ASP 68 ? E ASP 68 ? 1_555 NA ? WB NA . ? E NA 205 ? 1_555 O ? BD HOH . ? E HOH 432 ? 1_555 67.6 ? 27 OD2 ? E ASP 68 ? E ASP 68 ? 1_555 NA ? WB NA . ? E NA 205 ? 1_555 O ? BD HOH . ? E HOH 496 ? 1_555 87.9 ? 28 O ? BD HOH . ? 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