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5 5 1 1 I 81 I 81 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 6 1 1 K 81 K 81 ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? # _struct.entry_id 4WXY _struct.title 'PLPS (inactive glutaminase mutant) co-crystallized with glutamine and R5P.' _struct.pdbx_descriptor 'PdxS, PdxT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 4WXY _struct_keywords.text 'beta/alpha barrel, glutamine amidotransferase, vitamin b6, pyridoxal 5-phosphate, TRANSFERASE' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? T N N 3 ? U N N 3 ? V N N 3 ? W N N 3 ? X N N 3 ? # _struct_biol.details 'biological unit is the same as asym.' _struct_biol.id 1 _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? _struct_biol.pdbx_formula_weight ? _struct_biol.pdbx_formula_weight_method ? _struct_biol.pdbx_aggregation_state ? _struct_biol.pdbx_assembly_method ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 16 ? MET A 26 ? THR A 6 MET A 16 1 ? 11 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 37 ? GLY A 48 ? 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GLY G 235 LYS G 240 1 ? 6 HELX_P HELX_P59 AG5 ASN D 253 ? HIS D 267 ? ASN G 243 HIS G 257 1 ? 15 HELX_P HELX_P60 AG6 ASP D 270 ? LYS D 279 ? ASP G 260 LYS G 269 1 ? 10 HELX_P HELX_P61 AG7 THR E 16 ? MET E 26 ? THR I 6 MET I 16 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 AG8 ASN E 37 ? GLY E 48 ? ASN I 27 GLY I 38 1 ? 12 HELX_P HELX_P63 AG9 VAL E 58 ? GLY E 66 ? VAL I 48 GLY I 56 1 ? 9 HELX_P HELX_P64 AH1 ASP E 73 ? VAL E 84 ? ASP I 63 VAL I 74 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 AH2 HIS E 96 ? LEU E 106 ? HIS I 86 LEU I 96 1 ? 11 HELX_P HELX_P66 AH3 ASP E 127 ? PHE E 131 ? ASP I 117 PHE I 121 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 AH4 ASP E 141 ? GLU E 151 ? ASP I 131 GLU I 141 1 ? 11 HELX_P HELX_P68 AH5 ILE E 167 ? MET E 187 ? ILE I 157 MET I 177 1 ? 21 HELX_P HELX_P69 AH6 SER E 188 ? ASP E 190 ? SER I 178 ASP I 180 5 ? 3 HELX_P HELX_P70 AH7 GLU E 191 ? GLY E 200 ? GLU I 181 GLY I 190 1 ? 10 HELX_P HELX_P71 AH8 PRO E 202 ? GLY E 213 ? PRO I 192 GLY I 203 1 ? 12 HELX_P HELX_P72 AH9 THR E 227 ? LEU E 237 ? THR I 217 LEU I 227 1 ? 11 HELX_P HELX_P73 AI1 GLY E 245 ? LYS E 250 ? GLY I 235 LYS I 240 1 ? 6 HELX_P HELX_P74 AI2 ASN E 253 ? HIS E 267 ? ASN I 243 HIS I 257 1 ? 15 HELX_P HELX_P75 AI3 ASP E 270 ? LYS E 279 ? ASP I 260 LYS I 269 1 ? 10 HELX_P HELX_P76 AI4 THR F 16 ? MET F 26 ? THR K 6 MET K 16 1 ? 11 HELX_P HELX_P77 AI5 ASN F 37 ? GLY F 48 ? ASN K 27 GLY K 38 1 ? 12 HELX_P HELX_P78 AI6 VAL F 58 ? GLY F 66 ? VAL K 48 GLY K 56 1 ? 9 HELX_P HELX_P79 AI7 ASP F 73 ? VAL F 84 ? ASP K 63 VAL K 74 1 ? 12 HELX_P HELX_P80 AI8 HIS F 96 ? LEU F 106 ? HIS K 86 LEU K 96 1 ? 11 HELX_P HELX_P81 AI9 ASP F 127 ? PHE F 131 ? ASP K 117 PHE K 121 5 ? 5 HELX_P HELX_P82 AJ1 ASP F 141 ? GLY F 152 ? ASP K 131 GLY K 142 1 ? 12 HELX_P HELX_P83 AJ2 ILE F 167 ? MET F 187 ? ILE K 157 MET K 177 1 ? 21 HELX_P HELX_P84 AJ3 SER F 188 ? ASP F 190 ? SER K 178 ASP K 180 5 ? 3 HELX_P HELX_P85 AJ4 GLU F 191 ? GLY F 200 ? GLU K 181 GLY K 190 1 ? 10 HELX_P HELX_P86 AJ5 PRO F 202 ? GLY F 213 ? PRO K 192 GLY K 203 1 ? 12 HELX_P HELX_P87 AJ6 THR F 227 ? LEU F 237 ? THR K 217 LEU K 227 1 ? 11 HELX_P HELX_P88 AJ7 GLY F 245 ? LYS F 250 ? GLY K 235 LYS K 240 1 ? 6 HELX_P HELX_P89 AJ8 ASN F 253 ? HIS F 267 ? ASN K 243 HIS K 257 1 ? 15 HELX_P HELX_P90 AJ9 ASP F 270 ? SER F 278 ? ASP K 260 SER K 268 1 ? 9 HELX_P HELX_P91 AK1 ALA G 43 ? CYS G 54 ? ALA B 11 CYS B 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P92 AK2 LYS G 63 ? GLU G 68 ? LYS B 31 GLU B 36 5 ? 6 HELX_P HELX_P93 AK3 GLU G 79 ? TYR G 90 ? GLU B 47 TYR B 58 1 ? 12 HELX_P HELX_P94 AK4 LEU G 92 ? ALA G 102 ? LEU B 60 ALA B 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P95 AK5 CYG G 110 ? LEU G 116 ? CYG B 78 LEU B 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P96 AK6 ARG G 142 ? SER G 146 ? ARG B 110 SER B 114 5 ? 5 HELX_P HELX_P97 AK7 ASN G 201 ? THR G 205 ? ASN B 169 THR B 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P98 AK8 HIS G 208 ? ALA G 221 ? HIS B 176 ALA B 189 1 ? 14 HELX_P HELX_P99 AK9 ALA H 43 ? CYS H 54 ? ALA D 11 CYS D 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P100 AL1 LYS H 63 ? GLU H 68 ? LYS D 31 GLU D 36 1 ? 6 HELX_P HELX_P101 AL2 GLU H 79 ? TYR H 90 ? GLU D 47 TYR D 58 1 ? 12 HELX_P HELX_P102 AL3 LEU H 92 ? ALA H 102 ? LEU D 60 ALA D 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P103 AL4 CYG H 110 ? LEU H 116 ? CYG D 78 LEU D 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P104 AL5 ARG H 142 ? GLU H 145 ? ARG D 110 GLU D 113 5 ? 4 HELX_P HELX_P105 AL6 ASN H 201 ? THR H 205 ? ASN D 169 THR D 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P106 AL7 HIS H 208 ? ALA H 224 ? HIS D 176 ALA D 192 1 ? 17 HELX_P HELX_P107 AL8 ALA I 43 ? CYS I 54 ? ALA F 11 CYS F 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P108 AL9 LYS I 63 ? GLU I 68 ? LYS F 31 GLU F 36 5 ? 6 HELX_P HELX_P109 AM1 GLU I 79 ? TYR I 90 ? GLU F 47 TYR F 58 1 ? 12 HELX_P HELX_P110 AM2 LEU I 92 ? ALA I 102 ? LEU F 60 ALA F 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P111 AM3 CYG I 110 ? LEU I 116 ? CYG F 78 LEU F 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P112 AM4 ARG I 142 ? GLU I 145 ? ARG F 110 GLU F 113 5 ? 4 HELX_P HELX_P113 AM5 ASN I 201 ? THR I 205 ? ASN F 169 THR F 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P114 AM6 HIS I 208 ? SER I 225 ? HIS F 176 SER F 193 1 ? 18 HELX_P HELX_P115 AM7 ALA J 43 ? CYS J 54 ? ALA H 11 CYS H 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P116 AM8 LYS J 63 ? GLU J 68 ? LYS H 31 GLU H 36 5 ? 6 HELX_P HELX_P117 AM9 GLU J 79 ? TYR J 90 ? GLU H 47 TYR H 58 1 ? 12 HELX_P HELX_P118 AN1 LEU J 92 ? ALA J 102 ? LEU H 60 ALA H 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P119 AN2 CYG J 110 ? LEU J 116 ? CYG H 78 LEU H 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P120 AN3 ARG J 142 ? GLU J 145 ? ARG H 110 GLU H 113 5 ? 4 HELX_P HELX_P121 AN4 ASN J 201 ? THR J 205 ? ASN H 169 THR H 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P122 AN5 HIS J 208 ? ALA J 224 ? HIS H 176 ALA H 192 1 ? 17 HELX_P HELX_P123 AN6 ALA K 43 ? CYS K 54 ? ALA J 11 CYS J 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P124 AN7 LYS K 63 ? GLU K 68 ? LYS J 31 GLU J 36 5 ? 6 HELX_P HELX_P125 AN8 GLU K 79 ? TYR K 90 ? GLU J 47 TYR J 58 1 ? 12 HELX_P HELX_P126 AN9 LEU K 92 ? ALA K 102 ? LEU J 60 ALA J 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P127 AO1 CYG K 110 ? LEU K 116 ? CYG J 78 LEU J 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P128 AO2 ARG K 142 ? SER K 146 ? ARG J 110 SER J 114 5 ? 5 HELX_P HELX_P129 AO3 ASN K 201 ? THR K 205 ? ASN J 169 THR J 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P130 AO4 HIS K 208 ? ALA K 221 ? HIS J 176 ALA J 189 1 ? 14 HELX_P HELX_P131 AO5 ALA L 43 ? CYS L 54 ? ALA L 11 CYS L 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P132 AO6 LYS L 63 ? GLU L 68 ? LYS L 31 GLU L 36 5 ? 6 HELX_P HELX_P133 AO7 GLU L 79 ? TYR L 90 ? GLU L 47 TYR L 58 1 ? 12 HELX_P HELX_P134 AO8 LEU L 92 ? ALA L 102 ? LEU L 60 ALA L 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P135 AO9 CYG L 110 ? LEU L 116 ? CYG L 78 LEU L 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P136 AP1 ARG L 142 ? GLU L 145 ? ARG L 110 GLU L 113 5 ? 4 HELX_P HELX_P137 AP2 ASN L 201 ? THR L 205 ? ASN L 169 THR L 173 5 ? 5 HELX_P HELX_P138 AP3 HIS L 208 ? ALA L 224 ? HIS L 176 ALA L 192 1 ? 17 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale one ? A ALA 90 C ? ? ? 1_555 A L5P 91 N ? ? A ALA 80 A L5P 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale2 covale both ? A L5P 91 C1 ? ? ? 1_555 A VAL 92 N ? ? A L5P 81 A VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale3 covale one ? B ALA 90 C ? ? ? 1_555 B L5P 91 N ? ? C ALA 80 C L5P 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale4 covale both ? B L5P 91 C1 ? ? ? 1_555 B VAL 92 N ? ? C L5P 81 C VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale5 covale one ? C ALA 90 C ? ? ? 1_555 C L5P 91 N ? ? E ALA 80 E L5P 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale6 covale both ? C L5P 91 C1 ? ? ? 1_555 C VAL 92 N ? ? E L5P 81 E VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.357 ? covale7 covale one ? D ALA 90 C ? ? ? 1_555 D L5P 91 N ? ? G ALA 80 G L5P 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.308 ? covale8 covale both ? D L5P 91 C1 ? ? ? 1_555 D VAL 92 N ? ? G L5P 81 G VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale9 covale one ? E ALA 90 C ? ? ? 1_555 E L5P 91 N ? ? I ALA 80 I L5P 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale10 covale both ? E L5P 91 C1 ? ? ? 1_555 E VAL 92 N ? ? I L5P 81 I VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale11 covale one ? F ALA 90 C ? ? ? 1_555 F L5P 91 N ? ? K ALA 80 K L5P 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? covale12 covale both ? F L5P 91 C1 ? ? ? 1_555 F VAL 92 N ? ? K L5P 81 K VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale13 covale both ? G THR 109 C ? ? ? 1_555 G CYG 110 N ? ? B THR 77 B CYG 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale14 covale both ? G CYG 110 C ? ? ? 1_555 G ALA 111 N ? ? B CYG 78 B ALA 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale15 covale both ? H THR 109 C ? ? ? 1_555 H CYG 110 N ? ? D THR 77 D CYG 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale16 covale both ? H CYG 110 C ? ? ? 1_555 H ALA 111 N ? ? D CYG 78 D ALA 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale17 covale both ? I THR 109 C ? ? ? 1_555 I CYG 110 N ? ? F THR 77 F CYG 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale18 covale both ? I CYG 110 C ? ? ? 1_555 I ALA 111 N ? ? F CYG 78 F ALA 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale19 covale both ? J THR 109 C ? ? ? 1_555 J CYG 110 N ? ? H THR 77 H CYG 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale20 covale both ? J CYG 110 C ? ? ? 1_555 J ALA 111 N ? ? H CYG 78 H ALA 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale21 covale both ? K THR 109 C ? ? ? 1_555 K CYG 110 N ? ? J THR 77 J CYG 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale22 covale both ? K CYG 110 C ? ? ? 1_555 K ALA 111 N ? ? J CYG 78 J ALA 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale23 covale both ? L THR 109 C ? ? ? 1_555 L CYG 110 N ? ? L THR 77 L CYG 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale24 covale both ? L CYG 110 C ? ? ? 1_555 L ALA 111 N ? ? L CYG 78 L ALA 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 9 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 8 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 9 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 8 ? AA8 ? 8 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 9 ? AB2 ? 7 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 7 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 7 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 7 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 7 ? 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