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REFINEMENT WAS PERFORMED AGAINST ELLIPTICALLY TRUNCATED DATA (RESOLUTION LIMITS OF 1/5.4, 1/5.4, AND 1/4.0 A IN A*, B*, C*, RESPECTIVELY) CORRECTED BY ANISOTROPIC SCALE FACTORS AND AN ISOTROPIC B OF -99.88 A2 USING THE UCLA DIFFRACTION ANISOTROPY SERVER (STRONG ET AL., 2006). ; _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 4ZWT _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high 4.2000 _refine.ls_d_res_low 49.6170 _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs 25395 _refine.ls_number_reflns_R_free 1271 _refine.ls_number_reflns_R_work 24124 _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs 64.6700 _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0000 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs 0.2754 _refine.ls_R_factor_R_free 0.3078 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2737 _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details 'FLAT BULK SOLVENT MODEL' _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 1.360 _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method 'FREE R-VALUE' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 'PDB entry 4ZWR' _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ML _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.3000 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 1.1000 _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error 38.3600 _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML 0.8600 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # _refine_hist.cycle_id final _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.d_res_high 4.2000 _refine_hist.d_res_low 49.6170 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 11717 _refine_hist.pdbx_number_residues_total 1779 _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 11717 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'X-RAY DIFFRACTION' ? 0.008 ? 11849 ? f_bond_d ? ? 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'X-RAY DIFFRACTION' 4.3684 4.5670 742 . 37 705 17.0000 . . . 0.3419 . 0.3118 . . . . . . 9 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 4.5670 4.8076 1194 . 59 1135 28.0000 . . . 0.3647 . 0.3029 . . . . . . 9 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 4.8076 5.1086 1862 . 94 1768 43.0000 . . . 0.3391 . 0.3128 . . . . . . 9 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 5.1086 5.5025 3406 . 170 3236 79.0000 . . . 0.3703 . 0.3526 . . . . . . 9 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 5.5025 6.0554 4347 . 217 4130 100.0000 . . . 0.3971 . 0.3881 . . . . . . 9 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 6.0554 6.9296 4364 . 219 4145 100.0000 . . . 0.3694 . 0.3586 . . . . . . 9 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 6.9296 8.7228 4424 . 221 4203 100.0000 . . . 0.2714 . 0.2394 . . . . . . 9 . . . 'X-RAY DIFFRACTION' 8.7228 49.6208 4621 . 232 4389 100.0000 . . . 0.2568 . 0.2044 . . . . . . 9 . . . # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 'chain A' 1 2 'chain B' 1 3 'chain C' 1 4 'chain D' 1 5 'chain E' 1 6 'chain F' 1 7 'chain G' 1 8 'chain H' 1 9 'chain I' 1 10 'chain J' 1 11 'chain K' 1 12 'chain L' 1 13 'chain M' 1 14 'chain N' # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 A ARG 22 . A ALA 155 . A ARG 2 A ALA 135 ? 'chain A' 1 2 1 B MET 21 . B ALA 155 . B MET 1 B ALA 135 ? 'chain B' 1 3 1 C MET 21 . C GLU 154 . C MET 1 C GLU 134 ? 'chain C' 1 4 1 D MET 21 . D ALA 155 . D MET 1 D ALA 135 ? 'chain D' 1 5 1 E MET 21 . E ALA 155 . E MET 1 E ALA 135 ? 'chain E' 1 6 1 F MET 21 . F ALA 155 . F MET 1 F ALA 135 ? 'chain F' 1 7 1 G ARG 22 . G ALA 155 . G ARG 2 G ALA 135 ? 'chain G' 1 8 1 H MET 21 . H ALA 155 . H MET 1 H ALA 135 ? 'chain H' 1 9 1 I MET 21 . I ALA 155 . I MET 1 I ALA 135 ? 'chain I' 1 10 1 J MET 21 . J ALA 155 . J MET 1 J ALA 135 ? 'chain J' 1 11 1 K MET 21 . K ALA 155 . K MET 1 K ALA 135 ? 'chain K' 1 12 1 L MET 21 . L ALA 155 . L MET 1 L ALA 135 ? 'chain L' 1 13 1 M MET 21 . M ALA 155 . M MET 1 M ALA 135 ? 'chain M' 1 14 1 N MET 21 . N ALA 155 . N MET 1 N ALA 135 ? 'chain N' # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _struct.entry_id 4ZWT _struct.title 'Crystal Structure of the Bacteriophage T4 recombination mediator protein UvsY, Lattice Type IV' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 4ZWT _struct_keywords.text 'recombination, DNA binding, homo-heptamer, asymmetry, alpha barrel, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 1 ? N N N 1 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 22 ? PHE A 35 ? ARG A 2 PHE A 15 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 40 ? GLY A 86 ? LYS A 20 GLY A 66 1 ? 47 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA A 101 ? ALA A 109 ? ALA A 81 ALA A 89 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 110 ? ALA A 155 ? ASP A 90 ALA A 135 1 ? 46 HELX_P HELX_P5 AA5 ARG B 22 ? PHE B 35 ? ARG B 2 PHE B 15 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS B 40 ? GLY B 86 ? 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