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'polypeptide(L)' no no ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQE ; ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQE ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESGR MDLVEKYLIRRQNYQSLSKRGGKA ; ;PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESGR MDLVEKYLIRRQNYQSLSKRGGKA ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no PSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK PSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK R ? 19 'polypeptide(L)' no no PRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYR PRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYR S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;RNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRKSRLMRK VRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; ;RNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRKSRLMRK VRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRK GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRK V ? 22 polyribonucleotide no no AUGAAA AUGAAA W ? 23 polyribonucleotide no yes '(PSU)CGGGCC(RSQ)AUACCCCGA' UCGGGCCXAUACCCCGA X ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 24 'MAGNESIUM ION' MG 25 PAROMOMYCIN PAR 26 'ZINC ION' ZN # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 G n 1 3 G n 1 4 A n 1 5 G n 1 6 A n 1 7 G n 1 8 U n 1 9 U n 1 10 U n 1 11 G n 1 12 A n 1 13 U n 1 14 C n 1 15 C n 1 16 U n 1 17 G n 1 18 G n 1 19 C n 1 20 U n 1 21 C n 1 22 A n 1 23 G n 1 24 G n 1 25 G n 1 26 U n 1 27 G n 1 28 A n 1 29 A n 1 30 C n 1 31 G n 1 32 C n 1 33 U n 1 34 G n 1 35 G n 1 36 C n 1 37 G n 1 38 G n 1 39 C n 1 40 G n 1 41 U n 1 42 G n 1 43 C n 1 44 C n 1 45 U n 1 46 A n 1 47 A n 1 48 G n 1 49 A n 1 50 C n 1 51 A n 1 52 U n 1 53 G n 1 54 C n 1 55 A n 1 56 A n 1 57 G n 1 58 U n 1 59 C n 1 60 G n 1 61 U n 1 62 G n 1 63 C n 1 64 G n 1 65 G n 1 66 G n 1 67 C n 1 68 C n 1 69 G n 1 70 C n 1 71 G n 1 72 G n 1 73 G n 1 74 G n 1 75 U n 1 76 U n 1 77 U n 1 78 U n 1 79 A n 1 80 C n 1 81 U n 1 82 C n 1 83 C n 1 84 G n 1 85 U n 1 86 G n 1 87 G n 1 88 U n 1 89 C n 1 90 A n 1 91 G n 1 92 C n 1 93 G n 1 94 G n 1 95 C n 1 96 G n 1 97 G n 1 98 A n 1 99 C n 1 100 G n 1 101 G n 1 102 G n 1 103 U n 1 104 G n 1 105 A n 1 106 G n 1 107 U n 1 108 A n 1 109 A n 1 110 C n 1 111 G n 1 112 C n 1 113 G n 1 114 U n 1 115 G n 1 116 G n 1 117 G n 1 118 U n 1 119 G n 1 120 A n 1 121 C n 1 122 C n 1 123 U n 1 124 A n 1 125 C n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 G n 1 129 G n 1 130 A n 1 131 A n 1 132 G n 1 133 A n 1 134 G n 1 135 G n 1 136 G n 1 137 G n 1 138 G n 1 139 A n 1 140 C n 1 141 A n 1 142 A n 1 143 C n 1 144 C n 1 145 C n 1 146 G n 1 147 G n 1 148 G n 1 149 G n 1 150 A n 1 151 A n 1 152 A n 1 153 C n 1 154 U n 1 155 C n 1 156 G n 1 157 G n 1 158 G n 1 159 C n 1 160 U n 1 161 A n 1 162 A n 1 163 U n 1 164 C n 1 165 C n 1 166 C n 1 167 C n 1 168 C n 1 169 A n 1 170 U n 1 171 G n 1 172 U n 1 173 G n 1 174 G n 1 175 A n 1 176 C n 1 177 C n 1 178 C n 1 179 G n 1 180 C n 1 181 C n 1 182 C n 1 183 C n 1 184 U n 1 185 U n 1 186 G n 1 187 G n 1 188 G n 1 189 G n 1 190 U n 1 191 G n 1 192 U n 1 193 G n 1 194 U n 1 195 C n 1 196 C n 1 197 A n 1 198 A n 1 199 A n 1 200 G n 1 201 G n 1 202 G n 1 203 C n 1 204 U n 1 205 U n 1 206 U n 1 207 G n 1 208 C n 1 209 C n 1 210 C n 1 211 G n 1 212 C n 1 213 U n 1 214 U n 1 215 C n 1 216 C n 1 217 G n 1 218 G n 1 219 A n 1 220 U n 1 221 G n 1 222 G n 1 223 G n 1 224 C n 1 225 C n 1 226 C n 1 227 G n 1 228 C n 1 229 G n 1 230 U n 1 231 C n 1 232 C n 1 233 C n 1 234 A n 1 235 U n 1 236 C n 1 237 A n 1 238 G n 1 239 C n 1 240 U n 1 241 A n 1 242 G n 1 243 U n 1 244 U n 1 245 G n 1 246 G n 1 247 U n 1 248 G n 1 249 G n 1 250 G n 1 251 G n 1 252 U n 1 253 A n 1 254 A n 1 255 U n 1 256 G n 1 257 G n 1 258 C n 1 259 C n 1 260 C n 1 261 A n 1 262 C n 1 263 C n 1 264 A n 1 265 A n 1 266 G n 1 267 G n 1 268 C n 1 269 G n 1 270 A n 1 271 C n 1 272 G n 1 273 A n 1 274 C n 1 275 G n 1 276 G n 1 277 G n 1 278 U n 1 279 A n 1 280 G n 1 281 C n 1 282 C n 1 283 G n 1 284 G n 1 285 U n 1 286 C n 1 287 U n 1 288 G n 1 289 A n 1 290 G n 1 291 A n 1 292 G n 1 293 G n 1 294 A n 1 295 U n 1 296 G n 1 297 G n 1 298 C n 1 299 C n 1 300 G n 1 301 G n 1 302 C n 1 303 C n 1 304 A n 1 305 C n 1 306 A n 1 307 G n 1 308 G n 1 309 G n 1 310 G n 1 311 C n 1 312 A n 1 313 C n 1 314 U n 1 315 G n 1 316 A n 1 317 G n 1 318 A n 1 319 C n 1 320 A n 1 321 C n 1 322 G n 1 323 G n 1 324 G n 1 325 C n 1 326 C n 1 327 C n 1 328 C n 1 329 A n 1 330 C n 1 331 U n 1 332 C n 1 333 C n 1 334 U n 1 335 A n 1 336 C n 1 337 G n 1 338 G n 1 339 G n 1 340 A n 1 341 G n 1 342 G n 1 343 C n 1 344 A n 1 345 G n 1 346 C n 1 347 A n 1 348 G n 1 349 U n 1 350 U n 1 351 A n 1 352 G n 1 353 G n 1 354 A n 1 355 A n 1 356 U n 1 357 C n 1 358 U n 1 359 U n 1 360 C n 1 361 C n 1 362 G n 1 363 C n 1 364 A n 1 365 A n 1 366 U n 1 367 G n 1 368 G n 1 369 G n 1 370 C n 1 371 G n 1 372 C n 1 373 A n 1 374 A n 1 375 G n 1 376 C n 1 377 C n 1 378 U n 1 379 G n 1 380 A n 1 381 C n 1 382 G n 1 383 G n 1 384 A n 1 385 G n 1 386 C n 1 387 G n 1 388 A n 1 389 C n 1 390 G n 1 391 C n 1 392 C n 1 393 G n 1 394 C n 1 395 U n 1 396 U n 1 397 G n 1 398 G n 1 399 A n 1 400 G n 1 401 G n 1 402 A n 1 403 A n 1 404 G n 1 405 A n 1 406 A n 1 407 G n 1 408 C n 1 409 C n 1 410 C n 1 411 U n 1 412 U n 1 413 C n 1 414 G n 1 415 G n 1 416 G n 1 417 G n 1 418 U n 1 419 G n 1 420 U n 1 421 A n 1 422 A n 1 423 A n 1 424 C n 1 425 U n 1 426 C n 1 427 C n 1 428 U n 1 429 G n 1 430 A n 1 431 A n 1 432 C n 1 433 C n 1 434 C n 1 435 G n 1 436 G n 1 437 G n 1 438 A n 1 439 C n 1 440 G n 1 441 A n 1 442 A n 1 443 A n 1 444 C n 1 445 C n 1 446 C n 1 447 C n 1 448 C n 1 449 G n 1 450 A n 1 451 C n 1 452 G n 1 453 A n 1 454 G n 1 455 G n 1 456 G n 1 457 G n 1 458 A n 1 459 C n 1 460 U n 1 461 G n 1 462 A n 1 463 C n 1 464 G n 1 465 G n 1 466 U n 1 467 A n 1 468 C n 1 469 C n 1 470 G n 1 471 G n 1 472 G n 1 473 G n 1 474 U n 1 475 A n 1 476 A n 1 477 U n 1 478 A n 1 479 G n 1 480 C n 1 481 G n 1 482 C n 1 483 C n 1 484 G n 1 485 G n 1 486 C n 1 487 C n 1 488 A n 1 489 A n 1 490 C n 1 491 U n 1 492 C n 1 493 C n 1 494 G n 1 495 U n 1 496 G n 1 497 C n 1 498 C n 1 499 A n 1 500 G n 1 501 C n 1 502 A n 1 503 G n 1 504 C n 1 505 C n 1 506 G n 1 507 C n 1 508 G n 1 509 G n 1 510 U n 1 511 A n 1 512 A n 1 513 U n 1 514 A n 1 515 C n 1 516 G n 1 517 G n 1 518 A n 1 519 G n 1 520 G n 1 521 G n 1 522 C n 1 523 G n 1 524 C n 1 525 G n 1 526 A n 1 527 G n 1 528 C n 1 529 G n 1 530 U n 1 531 U n 1 532 A n 1 533 C n 1 534 C n 1 535 C n 1 536 G n 1 537 G n 1 538 A n 1 539 U n 1 540 U n 1 541 C n 1 542 A n 1 543 C n 1 544 U n 1 545 G n 1 546 G n 1 547 G n 1 548 C n 1 549 G n 1 550 U n 1 551 A n 1 552 A n 1 553 A n 1 554 G n 1 555 G n 1 556 G n 1 557 C n 1 558 G n 1 559 U n 1 560 G n 1 561 U n 1 562 A n 1 563 G n 1 564 G n 1 565 C n 1 566 G n 1 567 G n 1 568 C n 1 569 C n 1 570 U n 1 571 G n 1 572 G n 1 573 G n 1 574 G n 1 575 C n 1 576 G n 1 577 U n 1 578 C n 1 579 C n 1 580 C n 1 581 A n 1 582 U n 1 583 G n 1 584 U n 1 585 G n 1 586 A n 1 587 A n 1 588 A n 1 589 G n 1 590 A n 1 591 C n 1 592 C n 1 593 A n 1 594 C n 1 595 G n 1 596 G n 1 597 C n 1 598 U n 1 599 C n 1 600 A n 1 601 A n 1 602 C n 1 603 C n 1 604 G n 1 605 U n 1 606 G n 1 607 G n 1 608 G n 1 609 G n 1 610 G n 1 611 A n 1 612 G n 1 613 C n 1 614 G n 1 615 U n 1 616 G n 1 617 G n 1 618 G n 1 619 A n 1 620 U n 1 621 A n 1 622 C n 1 623 G n 1 624 C n 1 625 U n 1 626 C n 1 627 A n 1 628 G n 1 629 G n 1 630 C n 1 631 U n 1 632 A n 1 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DH N N 26 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 GB X07998 48256 1 ;UGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUAC UCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCU AAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCU AGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACA CGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAG GAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGC GCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUG UAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGG GAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUG GUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUG CGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGA AACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAG GCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCGCGAGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCG UCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGG CACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGA CACACGUGCUACAAUGCCCUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAU UGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGG GCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGG UAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU ; 4 ? 2 UNP RS2_THET8 P80371 2 ;VKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDIVRMEAE RAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPDAIFVVD PTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQ ; 7 ? 3 UNP RS3_THET8 P80372 3 ;GNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRGG ERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGAE QARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEV ; 2 ? 4 UNP RS4_THET8 P80373 4 ;GRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFEE ASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQN LEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; 2 ? 5 UNP RS5_THET8 Q5SHQ5 5 ;DFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEIEVEF GASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKG ; 5 ? 6 UNP RS6_THET8 Q5SLP8 6 ;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; 1 ? 7 UNP RS7_THET8 P17291 7 ;ARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRVG GANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; 2 ? 8 UNP RS8_THET8 Q5SHQ2 8 ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; 1 ? 9 UNP RS9_THET8 P80374 9 ;EQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGHFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLGI ARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; 2 ? 10 UNP RS10_THET8 Q5SHN7 10 ;KIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRKTI EQLMTLDLPTGVEIEIKT ; 3 ? 11 UNP RS11_THET8 P80376 11 ;KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAG REQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; 11 ? 12 UNP RS12_THET8 Q5SHN3 12 ;PTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVVL IRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEA ; 2 ? 13 UNP RS13_THET8 P80377 13 ;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; 2 ? 14 UNP RS14Z_THET8 Q5SHQ1 14 ARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW 2 ? 15 UNP RS15_THET8 Q5SJ76 15 ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; 2 ? 16 UNP RS16_THET8 Q5SJH3 16 ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQE ; 1 ? 17 UNP RS17_THET8 Q5SHP7 17 ;PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESGR MDLVEKYLIRRQNYESLSKRGGKA ; 2 ? 18 UNP RS18_THET8 Q5SLQ0 18 PSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK 16 ? 19 UNP RS19_THET8 Q5SHP2 19 ;PRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYR ; 2 ? 20 UNP RS20_THET8 P80380 20 ;RNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRKSRLMRK VRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; 8 ? 21 UNP RSHX_THET8 Q5SIH3 21 GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRK 2 ? 22 PDB 4GKJ 4GKJ 22 ? ? ? 23 PDB 4GKJ 4GKJ 23 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4GKJ A 1 ? 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Q5SIH3 2 ? 25 ? 2 25 22 22 4GKJ W 1 ? 6 ? 4GKJ 1 ? 6 ? 1 6 23 23 4GKJ X 1 ? 17 ? 4GKJ 27 ? 43 ? 27 43 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 4GKJ C A 1001 ? GB 48256 ? ? insertion 1005 1 1 4GKJ G A 1009 ? GB 48256 ? ? insertion 1013 2 1 4GKJ C A 1221 ? GB 48256 ? ? insertion 1225 3 1 4GKJ A A 1222 ? GB 48256 ? ? insertion 1226 4 1 4GKJ U A 1509 ? GB 48256 C 1508 conflict 1517 5 1 4GKJ U A 1511 ? GB 48256 C 1510 conflict 1519 6 9 4GKJ ARG I 57 ? UNP P80374 HIS 58 conflict 58 7 17 4GKJ GLN Q 95 ? UNP Q5SHP7 GLU 96 conflict 96 8 18 4GKJ GLY R 45 ? 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UNP P80380 ILE 41 conflict 41 10 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 23-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 23 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 52810 ? 1 MORE -479 ? 1 'SSA (A^2)' 247760 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN B 19 ? ARG B 24 ? ASN B 25 ARG B 30 5 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 ASP B 37 ? ARG B 58 ? ASP B 43 ARG B 64 1 ? 22 HELX_P HELX_P3 3 ASP B 73 ? ARG B 81 ? ASP B 79 ARG B 87 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 4 ASN B 98 ? SER B 103 ? ASN B 104 SER B 109 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 5 ARG B 105 ? LEU B 115 ? ARG B 111 LEU B 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 6 GLU B 135 ? LEU B 143 ? GLU B 141 LEU B 149 1 ? 9 HELX_P HELX_P7 7 GLU B 164 ? LEU B 174 ? GLU B 170 LEU B 180 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 8 ASP B 187 ? VAL B 191 ? ASP B 193 VAL B 197 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 9 ILE B 202 ? ILE B 217 ? ILE B 208 ILE B 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P10 10 HIS C 5 ? LEU C 11 ? HIS C 6 LEU C 12 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 11 GLN C 27 ? LEU C 46 ? GLN C 28 LEU C 47 1 ? 20 HELX_P HELX_P12 12 TYR C 47 ? ALA C 49 ? TYR C 48 ALA C 50 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 13 ARG C 82 ? THR C 94 ? ARG C 83 THR C 95 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 14 ASN C 107 ? LEU C 110 ? ASN C 108 LEU C 111 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 15 SER C 111 ? ARG C 125 ? SER C 112 ARG C 126 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 16 ALA C 128 ? 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THR M 19 ? ARG M 14 THR M 20 1 ? 7 HELX_P HELX_P61 61 GLY M 25 ? LYS M 35 ? GLY M 26 LYS M 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 62 ARG M 43 ? LEU M 47 ? ARG M 44 LEU M 48 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 63 THR M 48 ? TRP M 63 ? THR M 49 TRP M 64 1 ? 16 HELX_P HELX_P64 64 GLU M 66 ? ILE M 83 ? GLU M 67 ILE M 84 1 ? 18 HELX_P HELX_P65 65 CYS M 85 ? GLY M 94 ? CYS M 86 GLY M 95 1 ? 10 HELX_P HELX_P66 66 ALA M 106 ? GLY M 111 ? ALA M 107 GLY M 112 1 ? 6 HELX_P HELX_P67 67 ARG N 2 ? ILE N 6 ? ARG N 3 ILE N 7 5 ? 5 HELX_P HELX_P68 68 PHE N 15 ? ALA N 19 ? PHE N 16 ALA N 20 5 ? 5 HELX_P HELX_P69 69 CYS N 39 ? GLY N 50 ? CYS N 40 GLY N 51 1 ? 12 HELX_P HELX_P70 70 THR O 3 ? ALA O 15 ? THR O 4 ALA O 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P71 71 SER O 23 ? HIS O 45 ? SER O 24 HIS O 46 1 ? 23 HELX_P HELX_P72 72 ASP O 48 ? ASP O 73 ? ASP O 49 ASP O 74 1 ? 26 HELX_P HELX_P73 73 ASP O 73 ? LEU O 84 ? ASP O 74 LEU O 85 1 ? 12 HELX_P HELX_P74 74 ASP P 52 ? SER P 61 ? ASP P 52 SER P 61 1 ? 10 HELX_P HELX_P75 75 THR P 69 ? ALA P 77 ? THR P 69 ALA P 77 1 ? 9 HELX_P HELX_P76 76 ARG Q 80 ? ASN Q 93 ? ARG Q 81 ASN Q 94 1 ? 14 HELX_P HELX_P77 77 TYR Q 94 ? SER Q 96 ? TYR Q 95 SER Q 97 5 ? 3 HELX_P HELX_P78 78 LYS R 6 ? LEU R 11 ? LYS R 21 LEU R 26 1 ? 6 HELX_P HELX_P79 79 ASN R 21 ? LYS R 26 ? ASN R 36 LYS R 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P80 80 ARG R 27 ? LEU R 29 ? ARG R 42 LEU R 44 5 ? 3 HELX_P HELX_P81 81 PRO R 37 ? GLY R 42 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P82 82 SER R 44 ? LEU R 61 ? SER R 59 LEU R 76 1 ? 18 HELX_P HELX_P83 83 ASP S 11 ? LEU S 21 ? ASP S 12 LEU S 22 1 ? 11 HELX_P HELX_P84 84 VAL S 40 ? VAL S 44 ? VAL S 41 VAL S 45 5 ? 5 HELX_P HELX_P85 85 THR S 62 ? VAL S 66 ? THR S 63 VAL S 67 5 ? 5 HELX_P HELX_P86 86 LYS S 69 ? ALA S 74 ? LYS S 70 ALA S 75 5 ? 6 HELX_P HELX_P87 87 ALA T 5 ? GLU T 39 ? ALA T 12 GLU T 46 1 ? 35 HELX_P HELX_P88 88 LYS T 41 ? ALA T 60 ? LYS T 48 ALA T 67 1 ? 20 HELX_P HELX_P89 89 HIS T 66 ? LEU T 85 ? HIS T 73 LEU T 92 1 ? 20 HELX_P HELX_P90 90 THR U 7 ? ARG U 14 ? 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A G 152 A MG 1602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.990 ? ? metalc10 metalc ? ? A A 197 OP2 ? ? ? 1_555 SF MG . MG ? ? A A 201 A MG 1752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? ? metalc11 metalc ? ? A G 242 O6 ? ? ? 1_555 VD MG . MG ? ? A G 246 A MG 1703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.899 ? ? metalc12 metalc ? ? A G 248 O6 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? A G 252 A MG 1603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? ? metalc13 metalc ? ? A G 251 O6 ? ? ? 1_555 UA MG . MG ? ? A G 255 A MG 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? ? metalc14 metalc ? ? A U 252 O4 ? ? ? 1_555 UA MG . MG ? ? A U 256 A MG 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? ? metalc15 metalc ? ? A G 280 OP2 ? ? ? 1_555 YF MG . MG ? ? A G 284 A MG 1758 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? ? metalc16 metalc ? ? A G 290 O6 ? ? ? 1_555 YD MG . MG ? ? A G 294 A MG 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? ? metalc17 metalc ? ? A G 296 O6 ? ? ? 1_555 ZF MG . MG ? ? A G 300 A MG 1759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.932 ? ? metalc18 metalc ? ? A G 297 OP2 ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? A G 301 A MG 1618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? ? metalc19 metalc ? ? A C 343 OP2 ? ? ? 1_555 AG MG . MG ? ? A C 347 A MG 1760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? ? metalc20 metalc ? ? A C 363 O2 ? ? ? 1_555 BG MG . MG ? ? A C 367 A MG 1761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? ? metalc21 metalc ? ? A C 363 "O2'" ? ? ? 1_555 BG MG . MG ? ? A C 367 A MG 1761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? ? metalc22 metalc ? ? A U 366 O4 ? ? ? 1_555 BG MG . MG ? ? A U 370 A MG 1761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? ? metalc23 metalc ? ? A G 367 O6 ? ? ? 1_555 BG MG . MG ? ? A G 371 A MG 1761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.837 ? ? metalc24 metalc ? ? A U 378 OP1 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? A U 382 A MG 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? ? metalc25 metalc ? ? A C 448 OP2 ? ? ? 1_555 BC MG . MG ? ? A C 452 A MG 1657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.911 ? ? metalc26 metalc ? ? A C 451 OP2 ? ? ? 1_555 BC MG . MG ? ? A C 455 A MG 1657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.668 ? ? metalc27 metalc ? ? A A 475 "O2'" ? ? ? 1_555 BE MG . MG ? ? A A 479 A MG 1709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? ? metalc28 metalc ? ? A C 483 OP1 ? ? ? 1_555 DG MG . MG ? ? A C 487 A MG 1763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.473 ? ? metalc29 metalc ? ? A G 484 OP1 ? ? ? 1_555 DG MG . MG ? ? A G 488 A MG 1763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? ? metalc30 metalc ? ? A A 488 OP2 ? ? ? 1_555 CC MG . MG ? ? A A 492 A MG 1658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? ? metalc31 metalc ? ? A A 489 OP2 ? ? ? 1_555 CC MG . MG ? ? A A 493 A MG 1658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.000 ? ? metalc32 metalc ? ? A U 495 O4 ? ? ? 1_555 CE MG . MG ? ? A U 499 A MG 1710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? ? metalc33 metalc ? ? A C 498 O2 ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A C 502 A MG 1610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? ? metalc34 metalc ? ? A A 512 OP2 ? ? ? 1_555 CE MG . MG ? ? A A 516 A MG 1710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.760 ? ? metalc35 metalc ? ? A A 512 OP1 ? ? ? 1_555 CE MG . MG ? ? A A 516 A MG 1710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? ? metalc36 metalc ? ? A U 513 "O3'" ? ? ? 1_555 OF MG . MG ? ? A U 517 A MG 1748 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? ? metalc37 metalc ? ? A A 514 OP1 ? ? ? 1_555 OF MG . MG ? ? A A 518 A MG 1748 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.866 ? ? metalc38 metalc ? ? A G 537 OP1 ? ? ? 1_555 YD MG . MG ? ? A G 541 A MG 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? ? metalc39 metalc ? ? A U 539 OP2 ? ? ? 1_555 DC MG . MG ? ? A U 543 A MG 1659 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? ? metalc40 metalc ? ? A U 539 OP1 ? ? ? 1_555 YD MG . MG ? ? A U 543 A MG 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.936 ? ? metalc41 metalc ? ? A A 551 OP1 ? ? ? 1_555 EC MG . MG ? ? A A 555 A MG 1660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? ? metalc42 metalc ? ? A A 551 OP2 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A A 555 A MG 1711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? ? metalc43 metalc ? ? A A 552 OP2 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A A 556 A MG 1711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? ? metalc44 metalc ? ? A A 553 OP2 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A A 557 A MG 1711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.891 ? ? metalc45 metalc ? ? A C 557 OP1 ? ? ? 1_555 XB MG . MG ? ? A C 561 A MG 1653 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc46 metalc ? ? A G 567 OP2 ? ? ? 1_555 CD MG . MG ? ? A G 571 A MG 1684 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? ? metalc47 metalc ? ? A C 575 OP2 ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? A C 579 A MG 1663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? ? metalc48 metalc ? ? A G 576 OP2 ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? A G 580 A MG 1663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? ? metalc49 metalc ? ? A U 577 O4 ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? A U 581 A MG 1663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.933 ? ? metalc50 metalc ? ? A A 587 OP2 ? ? ? 1_555 GE MG . MG ? ? A A 591 A MG 1714 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? ? metalc51 metalc ? ? A A 644 "O3'" ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? A A 648 A MG 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? ? metalc52 metalc ? ? A U 684 OP1 ? ? ? 1_555 FG MG . MG ? ? A U 688 A MG 1765 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? ? metalc53 metalc ? ? A C 728 OP2 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? A C 732 A MG 1644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? ? metalc54 metalc ? ? A G 729 OP2 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? 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N1 A C 114 ? ? "C1'" A C 114 ? ? 130.83 118.80 12.03 1.10 N 28 1 N3 A U 118 ? ? C4 A U 118 ? ? C5 A U 118 ? ? 109.19 114.60 -5.41 0.60 N 29 1 C4 A U 118 ? ? C5 A U 118 ? ? C6 A U 118 ? ? 123.31 119.70 3.61 0.60 N 30 1 C5 A U 118 ? ? C4 A U 118 ? ? O4 A U 118 ? ? 131.13 125.90 5.23 0.60 N 31 1 "C3'" A G 123 ? ? "O3'" A G 123 ? ? P A A 124 ? ? 127.39 119.70 7.69 1.20 Y 32 1 N1 A A 124 ? ? C6 A A 124 ? ? N6 A A 124 ? ? 122.59 118.60 3.99 0.60 N 33 1 N3 A C 125 ? ? C2 A C 125 ? ? O2 A C 125 ? ? 117.54 121.90 -4.36 0.70 N 34 1 "C3'" A U 189 ? ? "O3'" A U 189 ? ? P A G 190 ? ? 128.08 119.70 8.38 1.20 Y 35 1 "O4'" A G 211 ? ? "C1'" A G 211 ? ? N9 A G 211 ? ? 112.76 108.50 4.26 0.70 N 36 1 N9 A G 227 ? ? C4 A G 227 ? ? C5 A G 227 ? ? 102.82 105.40 -2.58 0.40 N 37 1 N3 A C 232 ? ? C4 A C 232 ? ? C5 A C 232 ? ? 124.87 121.90 2.97 0.40 N 38 1 C8 A G 233 ? ? N9 A G 233 ? ? C4 A G 233 ? ? 103.95 106.40 -2.45 0.40 N 39 1 "C3'" A U 239 ? ? "O3'" A U 239 ? ? P A C 240 ? ? 126.93 119.70 7.23 1.20 Y 40 1 C6 A G 250 ? ? C5 A G 250 ? ? N7 A G 250 ? ? 126.53 130.40 -3.87 0.60 N 41 1 N1 A G 250 ? ? C6 A G 250 ? ? O6 A G 250 ? ? 124.04 119.90 4.14 0.60 N 42 1 N3 A G 261 ? ? C4 A G 261 ? ? C5 A G 261 ? ? 131.92 128.60 3.32 0.50 N 43 1 C2 A A 274 ? ? N3 A A 274 ? ? C4 A A 274 ? ? 106.02 110.60 -4.58 0.50 N 44 1 C6 A C 275 ? ? N1 A C 275 ? ? C2 A C 275 ? ? 122.78 120.30 2.48 0.40 N 45 1 "C3'" A A 310 ? ? "O3'" A A 310 ? ? P A G 311 ? ? 130.65 119.70 10.95 1.20 Y 46 1 C6 A C 317 ? ? N1 A C 317 ? ? C2 A C 317 ? ? 123.55 120.30 3.25 0.40 N 47 1 C6 A C 323 ? ? N1 A C 323 ? ? C2 A C 323 ? ? 117.07 120.30 -3.23 0.40 N 48 1 N1 A C 323 ? ? C2 A C 323 ? ? O2 A C 323 ? ? 124.47 118.90 5.57 0.60 N 49 1 N3 A C 323 ? ? C2 A C 323 ? ? O2 A C 323 ? ? 115.05 121.90 -6.85 0.70 N 50 1 C5 A C 323 ? ? C4 A C 323 ? ? N4 A C 323 ? ? 124.56 120.20 4.36 0.70 N 51 1 "C3'" A C 323 ? ? "O3'" A C 323 ? ? P A A 324 ? ? 128.43 119.70 8.73 1.20 Y 52 1 N1 A G 326 ? ? C6 A G 326 ? ? O6 A G 326 ? ? 124.15 119.90 4.25 0.60 N 53 1 N1 A G 327 ? ? C6 A G 327 ? ? O6 A G 327 ? ? 123.66 119.90 3.76 0.60 N 54 1 N7 A A 445 ? ? C8 A A 445 ? ? N9 A A 445 ? ? 116.89 113.80 3.09 0.50 N 55 1 C8 A A 445 ? ? N9 A A 445 ? ? C4 A A 445 ? ? 102.95 105.80 -2.85 0.40 N 56 1 "C3'" A A 445 ? ? "O3'" A A 445 ? ? P A A 446 ? ? 127.12 119.70 7.42 1.20 Y 57 1 N1 A G 465 ? ? C6 A G 465 ? ? O6 A G 465 ? ? 124.19 119.90 4.29 0.60 N 58 1 "C3'" A G 469 ? ? "O3'" A G 469 ? ? P A U 470 ? ? 127.33 119.70 7.63 1.20 Y 59 1 "C3'" A C 494 ? ? "O3'" A C 494 ? ? P A U 495 ? ? 128.02 119.70 8.32 1.20 Y 60 1 N3 A G 500 ? ? C4 A G 500 ? ? C5 A G 500 ? ? 125.16 128.60 -3.44 0.50 N 61 1 N3 A G 500 ? ? C4 A G 500 ? ? N9 A G 500 ? ? 130.23 126.00 4.23 0.60 N 62 1 "C3'" A G 500 ? ? "O3'" A G 500 ? ? P A C 501 ? ? 127.73 119.70 8.03 1.20 Y 63 1 C6 A C 501 ? ? N1 A C 501 ? ? C2 A C 501 ? ? 117.31 120.30 -2.99 0.40 N 64 1 N1 A C 501 ? ? C2 A C 501 ? ? O2 A C 501 ? ? 123.17 118.90 4.27 0.60 N 65 1 N3 A C 501 ? ? C2 A C 501 ? ? O2 A C 501 ? ? 116.23 121.90 -5.67 0.70 N 66 1 C2 A C 501 ? ? N1 A C 501 ? ? "C1'" A C 501 ? ? 127.35 118.80 8.55 1.10 N 67 1 C5 A C 539 ? ? C6 A C 539 ? ? N1 A C 539 ? ? 117.64 121.00 -3.36 0.50 N 68 1 "C3'" A A 542 ? ? "O3'" A A 542 ? ? P A U 543 ? ? 128.91 119.70 9.21 1.20 Y 69 1 N7 A G 558 ? ? C8 A G 558 ? ? N9 A G 558 ? ? 110.01 113.10 -3.09 0.50 N 70 1 C8 A G 558 ? ? N9 A G 558 ? ? C4 A G 558 ? ? 109.57 106.40 3.17 0.40 N 71 1 C8 A G 560 ? ? N9 A G 560 ? ? C4 A G 560 ? ? 108.82 106.40 2.42 0.40 N 72 1 C6 A C 569 ? ? N1 A C 569 ? ? C2 A C 569 ? ? 123.23 120.30 2.93 0.40 N 73 1 C5 A C 569 ? ? C6 A C 569 ? ? N1 A C 569 ? ? 117.94 121.00 -3.06 0.50 N 74 1 "C3'" A U 669 ? ? "O3'" A U 669 ? ? P A A 670 ? ? 127.22 119.70 7.52 1.20 Y 75 1 "O3'" A U 669 ? ? P A A 670 ? ? OP1 A A 670 ? ? 117.24 110.50 6.74 1.10 Y 76 1 N1 A G 674 ? ? C6 A G 674 ? ? O6 A G 674 ? ? 125.67 119.90 5.77 0.60 N 77 1 "C3'" A C 684 ? ? "O3'" A C 684 ? ? P A A 685 ? ? 126.98 119.70 7.28 1.20 Y 78 1 C6 A U 726 ? ? N1 A U 726 ? ? C2 A U 726 ? ? 125.21 121.00 4.21 0.60 N 79 1 N3 A U 772 ? ? C2 A U 772 ? ? O2 A U 772 ? ? 117.85 122.20 -4.35 0.70 N 80 1 C5 A U 772 ? ? C4 A U 772 ? ? O4 A U 772 ? ? 129.59 125.90 3.69 0.60 N 81 1 "C3'" A A 775 ? ? "O3'" A A 775 ? ? P A U 776 ? ? 129.04 119.70 9.34 1.20 Y 82 1 C6 A C 788 ? ? N1 A C 788 ? ? C2 A C 788 ? ? 122.92 120.30 2.62 0.40 N 83 1 N3 A C 788 ? ? C4 A C 788 ? ? C5 A C 788 ? ? 124.84 121.90 2.94 0.40 N 84 1 C6 A C 795 ? ? N1 A C 795 ? ? C2 A C 795 ? ? 116.81 120.30 -3.49 0.40 N 85 1 "C3'" A C 795 ? ? "O3'" A C 795 ? ? P A U 796 ? ? 129.32 119.70 9.62 1.20 Y 86 1 N1 A A 802 ? ? C2 A A 802 ? ? N3 A A 802 ? ? 133.02 129.30 3.72 0.50 N 87 1 C6 A A 802 ? ? C5 A A 802 ? ? N7 A A 802 ? ? 127.93 132.30 -4.37 0.70 N 88 1 N1 A A 802 ? ? C6 A A 802 ? ? N6 A A 802 ? ? 123.47 118.60 4.87 0.60 N 89 1 N1 A U 822 ? ? C2 A U 822 ? ? O2 A U 822 ? ? 127.48 122.80 4.68 0.70 N 90 1 C2 A U 822 ? ? N1 A U 822 ? ? "C1'" A U 822 ? ? 126.89 117.70 9.19 1.20 N 91 1 "C3'" A U 847 ? ? "O3'" A U 847 ? ? P A U 848 ? ? 127.02 119.70 7.32 1.20 Y 92 1 C6 A C 852 ? ? N1 A C 852 ? ? C2 A C 852 ? ? 122.99 120.30 2.69 0.40 N 93 1 "C3'" A U 861 ? ? "O3'" A U 861 ? ? P A G 862 ? ? 130.25 119.70 10.55 1.20 Y 94 1 C2 A G 904 ? ? N3 A G 904 ? ? C4 A G 904 ? ? 108.78 111.90 -3.12 0.50 N 95 1 N3 A G 904 ? ? C4 A G 904 ? ? C5 A G 904 ? ? 132.25 128.60 3.65 0.50 N 96 1 N3 A G 910 ? ? C4 A G 910 ? ? C5 A G 910 ? ? 131.63 128.60 3.03 0.50 N 97 1 N1 A G 922 ? ? C6 A G 922 ? ? O6 A G 922 ? ? 123.53 119.90 3.63 0.60 N 98 1 N3 A G 948 ? ? C4 A G 948 ? ? C5 A G 948 ? ? 132.32 128.60 3.72 0.50 N 99 1 N1 A G 948 ? ? C6 A G 948 ? ? O6 A G 948 ? ? 123.72 119.90 3.82 0.60 N 100 1 N1 A A 954 ? ? C6 A A 954 ? ? N6 A A 954 ? ? 114.99 118.60 -3.61 0.60 N 101 1 C6 A C 1036 ? ? N1 A C 1036 ? ? C2 A C 1036 ? ? 116.04 120.30 -4.26 0.40 N 102 1 N3 A C 1036 ? ? 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"O3'" A A 1220 ? ? P A U 1221 ? ? 128.25 119.70 8.55 1.20 Y 115 1 "C3'" A G 1286 ? ? "O3'" A G 1286 ? ? P A A 1287 ? ? 127.93 119.70 8.23 1.20 Y 116 1 N1 A C 1316 ? ? C2 A C 1316 ? ? O2 A C 1316 ? ? 122.54 118.90 3.64 0.60 N 117 1 "C3'" A A 1327 ? ? "O3'" A A 1327 ? ? P A G 1328 ? ? 127.53 119.70 7.83 1.20 Y 118 1 "C3'" A G 1328 ? ? "O3'" A G 1328 ? ? P A U 1329 ? ? 127.82 119.70 8.12 1.20 Y 119 1 "C3'" A U 1346 ? ? "O3'" A U 1346 ? ? P A G 1347 ? ? 129.34 119.70 9.64 1.20 Y 120 1 C6 A C 1364 ? ? N1 A C 1364 ? ? C2 A C 1364 ? ? 117.52 120.30 -2.78 0.40 N 121 1 C6 A C 1371 ? ? N1 A C 1371 ? ? C2 A C 1371 ? ? 122.72 120.30 2.42 0.40 N 122 1 "C3'" A A 1378 ? ? "O3'" A A 1378 ? ? P A C 1379 ? ? 128.64 119.70 8.94 1.20 Y 123 1 C5 A C 1379 ? ? C4 A C 1379 ? ? N4 A C 1379 ? ? 124.50 120.20 4.30 0.70 N 124 1 C6 A C 1385 ? ? N1 A C 1385 ? ? C2 A C 1385 ? ? 117.82 120.30 -2.48 0.40 N 125 1 C4 A C 1386 ? ? C5 A C 1386 ? ? C6 A C 1386 ? ? 113.75 117.40 -3.65 0.50 N 126 1 C2 A G 1398 ? ? 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N N 200 GLN CA C sing N N 201 GLN CA CB sing N N 202 GLN CA HA sing N N 203 GLN C O doub N N 204 GLN C OXT sing N N 205 GLN CB CG sing N N 206 GLN CB HB2 sing N N 207 GLN CB HB3 sing N N 208 GLN CG CD sing N N 209 GLN CG HG2 sing N N 210 GLN CG HG3 sing N N 211 GLN CD OE1 doub N N 212 GLN CD NE2 sing N N 213 GLN NE2 HE21 sing N N 214 GLN NE2 HE22 sing N N 215 GLN OXT HXT sing N N 216 GLU N CA sing N N 217 GLU N H sing N N 218 GLU N H2 sing N N 219 GLU CA C sing N N 220 GLU CA CB sing N N 221 GLU CA HA sing N N 222 GLU C O doub N N 223 GLU C OXT sing N N 224 GLU CB CG sing N N 225 GLU CB HB2 sing N N 226 GLU CB HB3 sing N N 227 GLU CG CD sing N N 228 GLU CG HG2 sing N N 229 GLU CG HG3 sing N N 230 GLU CD OE1 doub N N 231 GLU CD OE2 sing N N 232 GLU OE2 HE2 sing N N 233 GLU OXT HXT sing N N 234 GLY N CA sing N N 235 GLY N H sing N N 236 GLY N H2 sing N N 237 GLY CA C sing N N 238 GLY CA HA2 sing N N 239 GLY CA HA3 sing N N 240 GLY C O doub N N 241 GLY C OXT sing N N 242 GLY OXT HXT sing N N 243 HIS N CA sing N N 244 HIS N H sing N N 245 HIS N H2 sing N N 246 HIS CA C sing N N 247 HIS CA CB sing N N 248 HIS CA HA sing N N 249 HIS C O doub N N 250 HIS C OXT sing N N 251 HIS CB CG sing N N 252 HIS CB HB2 sing N N 253 HIS CB HB3 sing N N 254 HIS CG ND1 sing Y N 255 HIS CG CD2 doub Y N 256 HIS ND1 CE1 doub Y N 257 HIS ND1 HD1 sing N N 258 HIS CD2 NE2 sing Y N 259 HIS CD2 HD2 sing N N 260 HIS CE1 NE2 sing Y N 261 HIS CE1 HE1 sing N N 262 HIS NE2 HE2 sing N N 263 HIS OXT HXT sing N N 264 ILE N CA sing N N 265 ILE N H sing N N 266 ILE N H2 sing N N 267 ILE CA C sing N N 268 ILE CA CB sing N N 269 ILE CA HA sing N N 270 ILE C O doub N N 271 ILE C OXT sing N N 272 ILE CB CG1 sing N N 273 ILE CB CG2 sing N N 274 ILE CB HB sing N N 275 ILE CG1 CD1 sing N N 276 ILE CG1 HG12 sing N N 277 ILE CG1 HG13 sing N N 278 ILE CG2 HG21 sing N N 279 ILE CG2 HG22 sing N N 280 ILE CG2 HG23 sing N N 281 ILE CD1 HD11 sing N N 282 ILE CD1 HD12 sing N N 283 ILE CD1 HD13 sing N N 284 ILE OXT HXT 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RSQ C5 C10 sing N N 530 RSQ H6 C6 sing N N 531 RSQ "C2'" "C1'" sing N N 532 RSQ "H1'" "C1'" sing N N 533 RSQ "C1'" "O4'" sing N N 534 RSQ H10 C10 sing N N 535 RSQ C10 O30 doub N N 536 RSQ "O2'" "C2'" sing N N 537 RSQ "C2'" "C3'" sing N N 538 RSQ "C2'" "H2'" sing N N 539 RSQ "HO2'" "O2'" sing N N 540 RSQ "O3'" "C3'" sing N N 541 RSQ "C3'" "C4'" sing N N 542 RSQ "C3'" "H3'" sing N N 543 RSQ "O3'" "HO3'" sing N N 544 RSQ "H4'" "C4'" sing N N 545 RSQ "C4'" "O4'" sing N N 546 RSQ "C4'" "C5'" sing N N 547 RSQ "H5'" "C5'" sing N N 548 RSQ "C5'" "H5'A" sing N N 549 RSQ "C5'" "O5'" sing N N 550 RSQ OP2 HOP2 sing N N 551 RSQ OP3 HOP3 sing N N 552 SER N CA sing N N 553 SER N H sing N N 554 SER N H2 sing N N 555 SER CA C sing N N 556 SER CA CB sing N N 557 SER CA HA sing N N 558 SER C O doub N N 559 SER C OXT sing N N 560 SER CB OG sing N N 561 SER CB HB2 sing N N 562 SER CB HB3 sing N N 563 SER OG HG sing N N 564 SER OXT HXT sing N N 565 THR N CA sing N N 566 THR N H sing N N 567 THR N H2 sing N 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"HO3'" sing N N 651 U "C2'" "O2'" sing N N 652 U "C2'" "C1'" sing N N 653 U "C2'" "H2'" sing N N 654 U "O2'" "HO2'" sing N N 655 U "C1'" N1 sing N N 656 U "C1'" "H1'" sing N N 657 U N1 C2 sing N N 658 U N1 C6 sing N N 659 U C2 O2 doub N N 660 U C2 N3 sing N N 661 U N3 C4 sing N N 662 U N3 H3 sing N N 663 U C4 O4 doub N N 664 U C4 C5 sing N N 665 U C5 C6 doub N N 666 U C5 H5 sing N N 667 U C6 H6 sing N N 668 VAL N CA sing N N 669 VAL N H sing N N 670 VAL N H2 sing N N 671 VAL CA C sing N N 672 VAL CA CB sing N N 673 VAL CA HA sing N N 674 VAL C O doub N N 675 VAL C OXT sing N N 676 VAL CB CG1 sing N N 677 VAL CB CG2 sing N N 678 VAL CB HB sing N N 679 VAL CG1 HG11 sing N N 680 VAL CG1 HG12 sing N N 681 VAL CG1 HG13 sing N N 682 VAL CG2 HG21 sing N N 683 VAL CG2 HG22 sing N N 684 VAL CG2 HG23 sing N N 685 VAL OXT HXT sing N N 686 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 4GKJ 'double helix' 4GKJ 'a-form double helix' 4GKJ 'parallel strands' 4GKJ 'hairpin loop' 4GKJ tetraloop 4GKJ 'bulge loop' 4GKJ 'mismatched base pair' 4GKJ 'internal loop' 4GKJ 'triple helix' 4GKJ 'quadruple helix' 4GKJ 'three-way junction' 4GKJ 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 3 1_555 A U 539 1_555 4.143 1.518 1.100 21.952 6.461 -79.668 1 A_G7:U543_A A 7 ? A 543 ? ? ? 1 A G 290 1_555 A G 545 1_555 2.237 2.881 -1.218 40.919 0.446 -90.139 2 A_G294:G549_A A 294 ? A 549 ? 6 3 1 A A 291 1_555 A U 544 1_555 3.044 1.053 -1.032 12.537 36.520 98.785 3 A_A295:U548_A A 295 ? A 548 ? ? 5 1 A G 537 1_555 A A 22 1_555 6.640 -4.458 -0.290 -18.361 0.501 4.322 4 A_G541:A26_A A 541 ? A 26 ? 11 9 1 A G 5 1_555 A C 21 1_555 -0.131 -0.202 -0.043 -3.641 -1.987 -3.862 5 A_G9:C25_A A 9 ? A 25 ? 19 1 1 A A 6 1_555 A U 20 1_555 0.230 -0.071 -0.008 3.696 -8.681 5.318 6 A_A10:U24_A A 10 ? A 24 ? 20 1 1 A G 7 1_555 A C 19 1_555 0.370 -0.033 -0.292 -5.106 -19.348 1.484 7 A_G11:C23_A A 11 ? A 23 ? 19 1 1 A U 8 1_555 A G 18 1_555 2.362 -0.522 -0.191 1.506 -10.336 -2.439 8 A_U12:G22_A A 12 ? A 22 ? 28 1 1 A A 887 1_555 A G 17 1_555 -6.819 -4.631 -0.095 6.437 5.599 -7.292 9 A_A891:G21_A A 891 ? A 21 ? 11 10 1 A U 9 1_555 A U 16 1_555 -3.154 -0.292 -0.008 25.516 -1.002 -80.749 10 A_U13:U20_A A 13 ? A 20 ? ? ? 1 A G 889 1_555 A C 15 1_555 -0.091 -0.117 -0.518 -14.018 -10.321 4.819 11 A_G893:C19_A A 893 ? A 19 ? 19 1 1 A G 890 1_555 A C 14 1_555 -0.215 -0.194 -0.504 -19.486 -19.072 4.116 12 A_G894:C18_A A 894 ? A 18 ? 19 1 1 A A 891 1_555 A U 13 1_555 0.318 -0.184 0.287 2.344 -3.421 3.255 13 A_A895:U17_A A 895 ? A 17 ? 20 1 1 A A 892 1_555 A A 12 1_555 2.435 1.109 -0.960 0.070 -20.400 6.444 14 A_A896:A16_A A 896 ? A 16 ? ? 1 1 A U 893 1_555 A G 11 1_555 2.067 -0.571 -0.260 -6.963 -3.346 -7.853 15 A_U897:G15_A A 897 ? A 15 ? 28 1 1 A U 894 1_555 A A 1374 1_555 -0.216 0.036 -0.057 -4.592 -6.754 0.177 16 A_U898:A1378_A A 898 ? A 1378 ? 20 1 1 A G 895 1_555 A C 1373 1_555 -0.270 -0.038 0.046 -8.473 -29.829 5.374 17 A_G899:C1377_A A 899 ? A 1377 ? 19 1 1 A A 896 1_555 A U 1371 1_555 -0.060 0.018 0.897 6.912 -9.875 -3.421 18 A_A900:U1375_A A 900 ? A 1375 ? 20 1 1 A C 897 1_555 A G 1370 1_555 0.199 -0.319 0.151 8.739 -24.385 -5.246 19 A_C901:G1374_A A 901 ? 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