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A A 574 A MG 741 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? ? metalc46 metalc ? ? A A 574 OP2 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A A 574 A MG 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? metalc47 metalc ? ? A A 574 OP1 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A A 574 A MG 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? ? metalc48 metalc ? ? A U 581 OP1 ? ? ? 1_555 DD MG . MG ? ? A U 581 A MG 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? ? metalc49 metalc ? ? QA MG . MG ? ? ? 1_555 B C 16 OP2 ? ? A MG 741 B C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.000 ? ? metalc50 metalc ? ? RA MG . MG ? ? ? 1_555 B A 15 "O3'" ? ? A MG 742 B A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.600 ? ? metalc51 metalc ? ? RA MG . MG ? ? ? 1_555 B C 16 OP2 ? ? A MG 742 B C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.430 ? ? metalc52 metalc ? ? TA MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 744 A HOH 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? ? metalc53 metalc ? ? VA MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 746 A HOH 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.864 ? ? metalc54 metalc ? ? GB MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? 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A MG 808 A HOH 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? ? metalc64 metalc ? ? GD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 809 A HOH 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? ? metalc65 metalc ? ? GD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 809 A HOH 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? ? metalc66 metalc ? ? GD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 809 A HOH 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? ? metalc67 metalc ? ? GD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 809 A HOH 910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? ? metalc68 metalc ? ? GD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 809 A HOH 911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? ? metalc69 metalc ? ? GD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 809 A HOH 912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.230 ? ? metalc70 metalc ? ? HD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 810 A HOH 913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? metalc71 metalc ? ? HD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 810 A HOH 914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? ? metalc72 metalc ? ? HD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 810 A HOH 915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? ? metalc73 metalc ? ? HD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 810 A HOH 916 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? ? metalc74 metalc ? ? HD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 810 A HOH 917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? ? metalc75 metalc ? ? HD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 810 A HOH 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.300 ? ? metalc76 metalc ? ? ID MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 811 A HOH 919 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? ? metalc77 metalc ? ? ID MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 811 A HOH 920 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? ? metalc78 metalc ? ? ID MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 811 A HOH 921 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? ? metalc79 metalc ? ? ID MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 811 A HOH 922 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? ? metalc80 metalc ? ? ID MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 811 A HOH 923 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.210 ? ? metalc81 metalc ? ? ID MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 811 A HOH 924 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? ? metalc82 metalc ? ? JD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 812 A HOH 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? ? metalc83 metalc ? ? JD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 812 A HOH 926 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? ? metalc84 metalc ? ? JD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 812 A HOH 927 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? ? metalc85 metalc ? ? JD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 812 A HOH 928 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? ? metalc86 metalc ? ? JD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 812 A HOH 929 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? ? metalc87 metalc ? ? JD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 812 A HOH 930 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? ? metalc88 metalc ? ? KD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 813 A HOH 931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? ? metalc89 metalc ? ? KD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 813 A HOH 932 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? ? metalc90 metalc ? ? KD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 813 A HOH 933 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? ? metalc91 metalc ? ? KD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 813 A HOH 934 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? ? metalc92 metalc ? ? KD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 813 A HOH 935 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? ? metalc93 metalc ? ? KD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 813 A HOH 936 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? ? metalc94 metalc ? ? LD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 814 A HOH 937 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? metalc95 metalc ? ? LD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 814 A HOH 938 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? ? metalc96 metalc ? ? LD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 814 A HOH 939 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? ? metalc97 metalc ? ? LD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 814 A HOH 940 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? ? metalc98 metalc ? ? LD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 814 A HOH 941 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? ? metalc99 metalc ? ? LD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 814 A HOH 942 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? ? metalc100 metalc ? ? MD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 815 A HOH 943 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.230 ? ? metalc101 metalc ? ? MD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 815 A HOH 944 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc102 metalc ? ? MD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 815 A HOH 945 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? ? metalc103 metalc ? ? MD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 815 A HOH 946 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? ? metalc104 metalc ? ? MD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 815 A HOH 947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? metalc105 metalc ? ? MD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 815 A HOH 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? ? metalc106 metalc ? ? ND MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 816 A HOH 949 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? ? metalc107 metalc ? ? ND MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 816 A HOH 950 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? ? metalc108 metalc ? ? ND MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 816 A HOH 951 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? ? metalc109 metalc ? ? ND MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 816 A HOH 952 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? ? metalc110 metalc ? ? ND MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 816 A HOH 953 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.210 ? ? metalc111 metalc ? ? ND MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 816 A HOH 954 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? ? metalc112 metalc ? ? OD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 817 A HOH 955 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? ? metalc113 metalc ? ? OD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 817 A HOH 956 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? ? metalc114 metalc ? ? OD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 817 A HOH 957 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? ? metalc115 metalc ? ? OD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 817 A HOH 958 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? ? metalc116 metalc ? ? OD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 817 A HOH 959 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? ? metalc117 metalc ? ? OD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 817 A HOH 960 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.230 ? ? metalc118 metalc ? ? PD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 818 A HOH 961 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? ? metalc119 metalc ? ? PD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 818 A HOH 962 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? ? metalc120 metalc ? ? PD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 818 A HOH 963 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? ? metalc121 metalc ? ? PD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 818 A HOH 964 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? ? metalc122 metalc ? ? PD MG . MG ? ? ? 1_555 ME HOH . O ? ? A MG 818 B HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? ? metalc123 metalc ? ? PD MG . MG ? ? ? 1_555 ME HOH . O ? ? A MG 818 B HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? ? metalc124 metalc ? ? RD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 820 A HOH 965 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? ? metalc125 metalc ? ? RD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 820 A HOH 966 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? ? metalc126 metalc ? ? RD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 820 A HOH 967 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? ? metalc127 metalc ? ? RD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 820 A HOH 968 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? ? metalc128 metalc ? ? RD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 820 A HOH 969 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? ? metalc129 metalc ? ? RD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 820 A HOH 970 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? ? metalc130 metalc ? ? SD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 821 A HOH 971 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? ? metalc131 metalc ? ? SD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 821 A HOH 972 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? ? metalc132 metalc ? ? SD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 821 A HOH 973 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? ? metalc133 metalc ? ? SD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 821 A HOH 974 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? ? metalc134 metalc ? ? SD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 821 A HOH 975 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.260 ? ? metalc135 metalc ? ? SD MG . MG ? ? ? 1_555 LE HOH . O ? ? A MG 821 A HOH 976 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? ? metalc136 metalc ? ? B U 7 OP1 ? ? ? 1_555 KE MG . MG ? ? B U 5 B MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? ? metalc137 metalc ? ? B A 8 OP2 ? ? ? 1_555 KE MG . MG ? ? B A 6 B MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.590 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A G 3 N1 ? ? ? 1_555 A C 107 N3 ? ? A G 3 A C 107 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 3 N2 ? ? ? 1_555 A C 107 O2 ? ? A G 3 A C 107 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 3 O6 ? ? ? 1_555 A C 107 N4 ? ? A G 3 A C 107 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A C 4 N3 ? ? ? 1_555 A G 106 N1 ? ? A C 4 A G 106 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A C 4 N4 ? ? ? 1_555 A G 106 O6 ? ? A C 4 A G 106 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A C 4 O2 ? ? ? 1_555 A G 106 N2 ? ? A C 4 A G 106 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A A 6 N6 ? ? ? 1_555 A G 346 O6 ? ? A A 6 A G 346 1_555 ? ? ? ? ? ? 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A HOH 942 ? 1_555 89.3 ? 158 O ? LE HOH . ? A HOH 940 ? 1_555 MG ? LD MG . ? A MG 814 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 942 ? 1_555 89.2 ? 159 O ? LE HOH . ? A HOH 941 ? 1_555 MG ? LD MG . ? A MG 814 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 942 ? 1_555 86.5 ? 160 O ? LE HOH . ? A HOH 943 ? 1_555 MG ? MD MG . ? A MG 815 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 944 ? 1_555 92.2 ? 161 O ? LE HOH . ? A HOH 943 ? 1_555 MG ? MD MG . ? A MG 815 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 945 ? 1_555 85.8 ? 162 O ? LE HOH . ? A HOH 944 ? 1_555 MG ? MD MG . ? A MG 815 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 945 ? 1_555 168.6 ? 163 O ? LE HOH . ? A HOH 943 ? 1_555 MG ? MD MG . ? A MG 815 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 946 ? 1_555 87.0 ? 164 O ? LE HOH . ? A HOH 944 ? 1_555 MG ? MD MG . ? A MG 815 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 946 ? 1_555 86.2 ? 165 O ? LE HOH . ? A HOH 945 ? 1_555 MG ? MD MG . ? A MG 815 ? 1_555 O ? LE HOH . ? A HOH 946 ? 1_555 82.5 ? 166 O ? LE HOH . ? A HOH 943 ? 1_555 MG ? MD MG . ? A MG 815 ? 1_555 O ? LE HOH . ? 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SPM H92 H N N 171 SPM HN0 H N N 172 SPM H111 H N N 173 SPM H112 H N N 174 SPM H121 H N N 175 SPM H122 H N N 176 SPM H131 H N N 177 SPM H132 H N N 178 SPM HN41 H N N 179 SPM HN42 H N N 180 U OP3 O N N 181 U P P N N 182 U OP1 O N N 183 U OP2 O N N 184 U "O5'" O N N 185 U "C5'" C N N 186 U "C4'" C N R 187 U "O4'" O N N 188 U "C3'" C N S 189 U "O3'" O N N 190 U "C2'" C N R 191 U "O2'" O N N 192 U "C1'" C N R 193 U N1 N N N 194 U C2 C N N 195 U O2 O N N 196 U N3 N N N 197 U C4 C N N 198 U O4 O N N 199 U C5 C N N 200 U C6 C N N 201 U HOP3 H N N 202 U HOP2 H N N 203 U "H5'" H N N 204 U "H5''" H N N 205 U "H4'" H N N 206 U "H3'" H N N 207 U "HO3'" H N N 208 U "H2'" H N N 209 U "HO2'" H N N 210 U "H1'" H N N 211 U H3 H N N 212 U H5 H N N 213 U H6 H N N 214 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A OP3 P sing N N 1 A OP3 HOP3 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N N 172 SPM C12 C13 sing N N 173 SPM C12 H121 sing N N 174 SPM C12 H122 sing N N 175 SPM C13 N14 sing N N 176 SPM C13 H131 sing N N 177 SPM C13 H132 sing N N 178 SPM N14 HN41 sing N N 179 SPM N14 HN42 sing N N 180 U OP3 P sing N N 181 U OP3 HOP3 sing N N 182 U P OP1 doub N N 183 U P OP2 sing N N 184 U P "O5'" sing N N 185 U OP2 HOP2 sing N N 186 U "O5'" "C5'" sing N N 187 U "C5'" "C4'" sing N N 188 U "C5'" "H5'" sing N N 189 U "C5'" "H5''" sing N N 190 U "C4'" "O4'" sing N N 191 U "C4'" "C3'" sing N N 192 U "C4'" "H4'" sing N N 193 U "O4'" "C1'" sing N N 194 U "C3'" "O3'" sing N N 195 U "C3'" "C2'" sing N N 196 U "C3'" "H3'" sing N N 197 U "O3'" "HO3'" sing N N 198 U "C2'" "O2'" sing N N 199 U "C2'" "C1'" sing N N 200 U "C2'" "H2'" sing N N 201 U "O2'" "HO2'" sing N N 202 U "C1'" N1 sing N N 203 U "C1'" "H1'" sing N N 204 U N1 C2 sing N N 205 U N1 C6 sing N N 206 U C2 O2 doub N N 207 U C2 N3 sing N N 208 U N3 C4 sing N N 209 U N3 H3 sing N N 210 U C4 O4 doub N N 211 U C4 C5 sing N N 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_ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 3 1_555 A C 107 1_555 -0.501 -0.696 -0.009 -0.548 -1.571 -5.169 1 A_G3:C107_A A 3 ? 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