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_pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 5 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 2 'Structure model' 'Structure summary' 3 3 'Structure model' 'Database references' 4 4 'Structure model' 'Database references' 5 5 'Structure model' 'Data collection' 6 5 'Structure model' 'Database references' 7 5 'Structure model' 'Derived calculations' 8 5 'Structure model' Other 9 5 'Structure model' 'Refinement description' 10 5 'Structure model' 'Source and taxonomy' 11 5 'Structure model' 'Structure summary' 12 6 'Structure model' 'Data collection' 13 6 'Structure model' 'Database references' 14 6 'Structure model' 'Structure summary' 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_citation.year 2014 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/nature13548 _citation.pdbx_database_id_PubMed 25008524 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Lee, C.H.' 1 ? primary 'Lu, W.' 2 ? primary 'Michel, J.C.' 3 ? primary 'Goehring, A.' 4 ? primary 'Du, J.' 5 ? primary 'Song, X.' 6 ? primary 'Gouaux, E.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'receptor subunit GluN1' 92722.305 2 ? ;C22A, K51F, K52F, N300Q, N350Q, N368D, N440D, N469D, K493A, K494A, E495A, G610R, I617L, D656R, N769E, Del(K588-E595), Replacement of 845-853 with SRAEAKRMK ; 'UNP residues 22-836' ? 2 polymer man 'receptor subunit GluN2B' 93088.461 2 ? ;M20S, G21R, C22A, A64E, N69Q, K216C, N343D, T490V, C585A, E654R, E655R, V615L, Del(K382-V385), Del(R584-G593), Replacement of 854-864 with YKSRAEAKRMK ; 'UNP residues 20-839' ? 3 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 7 ? ? ? ? 4 non-polymer syn '1-AMINOCYCLOPROPANECARBOXYLIC ACID' 101.104 1 ? ? ? ? 5 non-polymer syn '4-[(1R,2S)-3-(4-benzylpiperidin-1-yl)-1-hydroxy-2-methylpropyl]phenol' 339.471 2 ? ? ? ? 6 non-polymer syn 'trans-1-aminocyclobutane-1,3-dicarboxylic acid' 159.140 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'N-methyl-D-aspartate receptor subunit NR1-8a' 2 'Ionotropic glutamate receptor subunit NR2B' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;ADPKIVNIGAVLSTKKHEQIFREAVNQANFFHFTRKIQLNATSVTHRPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPAPTDH 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N-Glycosylation covale3 covale one ? D ASN 652 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? D ASN 671 D NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ALA 388 B . ? ALA 407 B PRO 389 B ? 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NE sing N N 41 ARG CD HD2 sing N N 42 ARG CD HD3 sing N N 43 ARG NE CZ sing N N 44 ARG NE HE sing N N 45 ARG CZ NH1 sing N N 46 ARG CZ NH2 doub N N 47 ARG NH1 HH11 sing N N 48 ARG NH1 HH12 sing N N 49 ARG NH2 HH21 sing N N 50 ARG NH2 HH22 sing N N 51 ARG OXT HXT sing N N 52 ASN N CA sing N N 53 ASN N H sing N N 54 ASN N H2 sing N N 55 ASN CA C sing N N 56 ASN CA CB sing N N 57 ASN CA HA sing N N 58 ASN C O doub N N 59 ASN C OXT sing N N 60 ASN CB CG sing N N 61 ASN CB HB2 sing N N 62 ASN CB HB3 sing N N 63 ASN CG OD1 doub N N 64 ASN CG ND2 sing N N 65 ASN ND2 HD21 sing N N 66 ASN ND2 HD22 sing N N 67 ASN OXT HXT sing N N 68 ASP N CA sing N N 69 ASP N H sing N N 70 ASP N H2 sing N N 71 ASP CA C sing N N 72 ASP CA CB sing N N 73 ASP CA HA sing N N 74 ASP C O doub N N 75 ASP C OXT sing N N 76 ASP CB CG sing N N 77 ASP CB HB2 sing N N 78 ASP CB HB3 sing N N 79 ASP CG OD1 doub N N 80 ASP CG OD2 sing N N 81 ASP OD2 HD2 sing N N 82 ASP OXT HXT sing N N 83 CYS N CA sing N N 84 CYS N H sing N N 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