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;RYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTI MPKDIQLARRIRGIEGGL ; A,E,K,O ? 4 'polypeptide(L)' no no DNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG DNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG B,F,L,P ? 5 'polypeptide(L)' no no ;SRSNRAGLQFPVGRIHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVMEYLAAEVLELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNK LLSGVTIAQGGVLPNIQAVLLP ; ;SRSNRAGLQFPVGRIHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVMEYLAAEVLELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNK LLSGVTIAQGGVLPNIQAVLLP ; C,G,M,Q ? 6 'polypeptide(L)' no no ;ESYAIYIYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDIFERIAAEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEG TKAVTKYTSS ; ;ESYAIYIYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDIFERIAAEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEG TKAVTKYTSS ; D,H,N,R ? 7 'polypeptide(L)' no no PNVRRSNRIRLKPLEYWRGERIDYQ PNVRRSNRIRLKPLEYWRGERIDYQ V,U,X,W ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DA n 1 2 DT n 1 3 DC n 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SER n 6 90 SER n 7 1 PRO n 7 2 ASN n 7 3 VAL n 7 4 ARG n 7 5 ARG n 7 6 SER n 7 7 ASN n 7 8 ARG n 7 9 ILE n 7 10 ARG n 7 11 LEU n 7 12 LYS n 7 13 PRO n 7 14 LEU n 7 15 GLU n 7 16 TYR n 7 17 TRP n 7 18 ARG n 7 19 GLY n 7 20 GLU n 7 21 ARG n 7 22 ILE n 7 23 ASP n 7 24 TYR n 7 25 GLN n # loop_ _entity_src_gen.entity_id _entity_src_gen.pdbx_src_id _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag _entity_src_gen.pdbx_seq_type _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num _entity_src_gen.gene_src_common_name _entity_src_gen.gene_src_genus _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene _entity_src_gen.gene_src_species _entity_src_gen.gene_src_strain _entity_src_gen.gene_src_tissue _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction _entity_src_gen.gene_src_details _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 7 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 25 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Rattus norvegicus' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name Rat _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 10116 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 4X23 4X23 ? 1 ? 1 2 PDB 4X23 4X23 ? 2 ? 1 3 UNP H3_DROME P02299 ? 3 ;RYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTI MPKDIQLARRIRG ; 41 4 UNP H4_DROME P84040 ? 4 DNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG 25 5 UNP H2A_DROME P84051 ? 5 ;SRSNRAGLQFPVGRIHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVMEYLAAEVLELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNK LLSGVTIAQGGVLPNIQAVLLP ; 16 6 UNP H2B_DROME P02283 ? 6 ;ESYAIYIYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDIFERIAAEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEG TKAVTKYTSS ; 33 7 UNP Q66LH7_RAT Q66LH7 ? 7 PNVRRSNRIRLKPLEYWRGERIDYQ 710 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4X23 I 1 ? 147 ? 4X23 1 ? 147 ? 1 147 2 2 4X23 J 1 ? 147 ? 4X23 1 ? 147 ? 1 147 3 3 4X23 A 1 ? 93 ? 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'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 294K ; _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range '7.4 - 7.6' # loop_ _diffrn.ambient_environment _diffrn.ambient_temp _diffrn.ambient_temp_details _diffrn.ambient_temp_esd _diffrn.crystal_id _diffrn.crystal_support _diffrn.crystal_treatment _diffrn.details _diffrn.id _diffrn.ambient_pressure _diffrn.ambient_pressure_esd _diffrn.ambient_pressure_gt _diffrn.ambient_pressure_lt _diffrn.ambient_temp_gt _diffrn.ambient_temp_lt ? 274 ? ? 1 ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? 274 ? ? 1 ? ? ? 2 ? ? ? ? ? ? # loop_ _diffrn_detector.details _diffrn_detector.detector _diffrn_detector.diffrn_id _diffrn_detector.type _diffrn_detector.area_resol_mean _diffrn_detector.dtime _diffrn_detector.pdbx_frames_total _diffrn_detector.pdbx_collection_time_total _diffrn_detector.pdbx_collection_date ? CCD 1 'ADSC QUANTUM 315' ? ? ? ? 2012-08-13 ? CCD 2 'ADSC QUANTUM 315' ? ? ? ? 2012-06-22 # loop_ _diffrn_radiation.collimation _diffrn_radiation.diffrn_id _diffrn_radiation.filter_edge _diffrn_radiation.inhomogeneity _diffrn_radiation.monochromator _diffrn_radiation.polarisn_norm _diffrn_radiation.polarisn_ratio _diffrn_radiation.probe _diffrn_radiation.type _diffrn_radiation.xray_symbol _diffrn_radiation.wavelength_id _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l _diffrn_radiation.pdbx_wavelength_list _diffrn_radiation.pdbx_wavelength _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol _diffrn_radiation.pdbx_analyzer _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type ? 1 ? ? GRAPHITE ? ? ? ? ? 1 M ? ? 'SINGLE WAVELENGTH' ? x-ray ? 2 ? ? GRAPHITE ? ? ? ? ? 2 M ? ? 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S DA 146 T DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog600 hydrog ? ? M DA 146 N6 ? ? ? 1_555 N DT 2 O4 ? ? S DA 146 T DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog601 hydrog ? ? M DT 147 N3 ? ? ? 1_555 N DA 1 N1 ? ? S DT 147 T DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog602 hydrog ? ? M DT 147 O4 ? ? ? 1_555 N DA 1 N6 ? ? S DT 147 T DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 2 ? 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W . n # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? dodecameric 12 2 author_defined_assembly ? dodecameric 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 2 1 M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2014-12-10 2 'Structure model' 1 1 2014-12-24 3 'Structure model' 1 2 2016-07-13 4 'Structure model' 1 3 2017-11-22 5 'Structure model' 1 4 2023-09-27 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Derived calculations' 2 3 'Structure model' 'Derived calculations' 3 4 'Structure model' Advisory 4 4 'Structure model' 'Derived calculations' 5 4 'Structure model' 'Refinement description' 6 5 'Structure model' Advisory 7 5 'Structure model' 'Data collection' 8 5 'Structure model' 'Database references' 9 5 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' pdbx_struct_oper_list 2 4 'Structure model' pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms 3 4 'Structure model' software 4 5 'Structure model' chem_comp_atom 5 5 'Structure model' chem_comp_bond 6 5 'Structure model' database_2 7 5 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model 8 5 'Structure model' pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation' 2 4 'Structure model' '_software.classification' 3 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 4 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' # loop_ _software.citation_id _software.classification _software.compiler_name _software.compiler_version _software.contact_author _software.contact_author_email _software.date _software.description _software.dependencies _software.hardware _software.language _software.location _software.mods _software.name _software.os _software.os_version _software.type _software.version _software.pdbx_ordinal ? refinement ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? PHENIX ? ? ? '(phenix.refine: 1.9_1690)' 1 ? 'data scaling' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? XDS ? ? ? . 2 ? 'data collection' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Blu-Ice ? ? ? . 3 ? 'data collection' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? CBASS ? ? ? . 4 ? 'data scaling' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? HKL-2000 ? ? ? . 5 ? refinement ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? CNS ? ? ? 1.3 6 ? phasing ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? PHASER ? ? ? . 7 ? 'data reduction' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? XDS ? ? ? . 8 ? 'data scaling' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? SCALEPACK ? ? ? . 9 # _pdbx_entry_details.entry_id 4X23 _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;THE DISCREPANCY AT THE C-TERM OF H3 SEQUENCES (CHAINS A,E,K,O) IS A RESULT OF CHIMERIC CENP-A, I.E. THE LAST THREE RESIDUES OF H3 (-ERA) TO THE LAST SIX RESIDUES OF CENP-A (-IEGGLG) ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 TYR A 41 ? ? -91.59 -152.27 2 1 PRO A 43 ? ? -61.31 93.45 3 1 ASP A 81 ? ? 55.15 70.30 4 1 LYS B 44 ? ? -99.44 -61.45 5 1 GLN B 93 ? ? -149.83 38.08 6 1 ARG B 95 ? ? -107.93 48.27 7 1 LEU C 96 ? ? -96.67 34.35 8 1 PRO C 108 ? ? -59.79 102.71 9 1 HIS D 46 ? ? -157.25 87.36 10 1 PRO D 100 ? ? -41.86 -84.47 11 1 SER D 120 ? ? -101.78 -96.64 12 1 TYR E 41 ? ? -88.87 -150.08 13 1 PRO E 43 ? ? -60.26 94.58 14 1 ASP E 81 ? ? 55.79 70.72 15 1 LYS F 44 ? ? -99.44 -61.86 16 1 GLN F 93 ? ? -149.38 37.66 17 1 ARG F 95 ? ? -107.72 49.42 18 1 LEU G 96 ? ? -96.91 34.04 19 1 GLN G 103 ? ? 37.22 43.44 20 1 HIS H 46 ? ? -158.99 89.42 21 1 GLU H 102 ? ? 64.13 -25.92 22 1 ARG V 713 ? ? -125.45 -152.29 23 1 ARG V 717 ? ? -129.80 -162.58 24 1 LEU V 720 ? ? -125.65 -96.99 25 1 LEU V 723 ? ? 67.90 -9.19 26 1 GLU V 724 ? ? 58.34 -161.43 27 1 TYR V 725 ? ? -179.02 -143.50 28 1 TRP V 726 ? ? 42.40 -13.76 29 1 ARG V 727 ? ? -154.41 -34.28 30 1 ARG U 717 ? ? -73.76 -160.47 31 1 TYR K 41 ? ? -92.76 41.98 32 1 PRO K 43 ? ? -62.16 92.48 33 1 ASP K 81 ? ? 55.67 70.79 34 1 LYS L 44 ? ? -99.62 -61.40 35 1 GLN L 93 ? ? -149.58 38.07 36 1 ARG L 95 ? ? -108.45 47.76 37 1 LEU M 96 ? ? -96.88 33.76 38 1 GLN M 103 ? ? 37.52 43.59 39 1 HIS N 46 ? ? -157.50 88.22 40 1 GLU N 102 ? ? 68.73 -30.33 41 1 SER N 120 ? ? -101.57 -161.04 42 1 PRO O 43 ? ? -60.83 94.55 43 1 ASP O 81 ? ? 55.44 70.59 44 1 LYS P 44 ? ? -98.84 -62.06 45 1 GLN P 93 ? ? -148.53 37.79 46 1 ARG P 95 ? ? -108.14 48.38 47 1 LEU Q 96 ? ? -97.08 33.21 48 1 GLN Q 103 ? ? 37.51 44.02 49 1 HIS R 46 ? ? -158.25 88.74 50 1 LEU X 720 ? ? -127.24 -99.12 51 1 LEU X 723 ? ? 70.11 -10.92 52 1 ARG X 727 ? ? -149.13 -33.16 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 A ARG 72 ? 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