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'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 L3P non-polymer . "2,3-DI-O-PHYTANLY-3-SN-GLYCERO-1-PHOSPHORYL-3'-SN-GLYCEROL-1'-PHOSPHATE" ? 'C46 H94 O11 P2 -2' 885.179 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 RET non-polymer . RETINAL ? 'C20 H28 O' 284.436 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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Before data collection, the crystal was soaked in an alkaline solution containing no halide ions, illuminated with red light, and then soaked in a solution at pH 7. ; _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? # _diffrn.ambient_environment ? _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.ambient_temp_esd ? _diffrn.crystal_id 1 _diffrn.crystal_support ? _diffrn.crystal_treatment ? _diffrn.details ? _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_pressure ? _diffrn.ambient_pressure_esd ? _diffrn.ambient_pressure_gt ? _diffrn.ambient_pressure_lt ? _diffrn.ambient_temp_gt ? _diffrn.ambient_temp_lt ? # _diffrn_detector.details ? _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.type 'RAYONIX MX225HE' _diffrn_detector.area_resol_mean ? _diffrn_detector.dtime ? _diffrn_detector.pdbx_frames_total ? _diffrn_detector.pdbx_collection_time_total ? _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2015-06-11 # _diffrn_radiation.collimation ? _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.filter_edge ? 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A LYS 256 NZ A ? ? 1_555 G RET . C15 A ? A LYS 256 A RET 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale2 covale one ? B LYS 256 NZ A ? ? 1_555 N RET . C15 A ? B LYS 256 B RET 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? ? covale3 covale one ? C LYS 256 NZ A ? ? 1_555 Q RET . C15 A ? D LYS 256 D RET 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? ? covale4 covale one ? D LYS 256 NZ B ? ? 1_555 S RET . C15 B ? E LYS 256 E RET 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? ? covale5 covale one ? E LYS 256 NZ B ? ? 1_555 T RET . C15 B ? F LYS 256 F RET 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? ? covale6 covale one ? F LYS 256 NZ B ? ? 1_555 X RET . C15 B ? G LYS 256 G RET 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 92 ? LEU A 94 ? SER A 92 LEU A 94 AA1 2 VAL A 117 ? THR A 119 ? VAL A 117 THR A 119 AA2 1 SER B 92 ? LEU B 94 ? SER B 92 LEU B 94 AA2 2 VAL B 117 ? THR B 119 ? VAL B 117 THR B 119 AA3 1 SER C 92 ? LEU C 94 ? SER D 92 LEU D 94 AA3 2 VAL C 117 ? THR C 119 ? VAL D 117 THR D 119 AA4 1 SER C 106 ? LEU C 109 ? SER D 106 LEU D 109 AA4 2 GLU C 112 ? ASP C 115 ? GLU D 112 ASP D 115 AA5 1 SER D 92 ? LEU D 94 ? SER E 92 LEU E 94 AA5 2 VAL D 117 ? THR D 119 ? VAL E 117 THR E 119 AA6 1 SER E 92 ? LEU E 94 ? SER F 92 LEU F 94 AA6 2 VAL E 117 ? THR E 119 ? VAL F 117 THR F 119 AA7 1 SER F 92 ? LEU F 94 ? SER G 92 LEU G 94 AA7 2 VAL F 117 ? THR F 119 ? VAL G 117 THR G 119 AA8 1 SER F 106 ? LEU F 109 ? SER G 106 LEU G 109 AA8 2 GLU F 112 ? ASP F 115 ? GLU G 112 ASP G 115 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N SER A 92 ? N SER A 92 O THR A 119 ? O THR A 119 AA2 1 2 N LEU B 94 ? N LEU B 94 O VAL B 117 ? O VAL B 117 AA3 1 2 N SER C 92 ? N SER D 92 O THR C 119 ? O THR D 119 AA4 1 2 N LEU C 109 ? N LEU D 109 O GLU C 112 ? O GLU D 112 AA5 1 2 N SER D 92 ? N SER E 92 O THR D 119 ? O THR E 119 AA6 1 2 N SER E 92 ? N SER F 92 O THR E 119 ? O THR F 119 AA7 1 2 N SER F 92 ? N SER G 92 O THR F 119 ? O THR G 119 AA8 1 2 N VAL F 107 ? N VAL G 107 O VAL F 114 ? O VAL G 114 # _atom_sites.entry_id 5B0W _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006480 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005186 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010211 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012615 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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LEU 47 47 47 LEU LEU A . n A 1 48 SER 48 48 48 SER SER A . n A 1 49 ILE 49 49 49 ILE ILE A . n A 1 50 LEU 50 50 50 LEU LEU A . n A 1 51 LEU 51 51 51 LEU LEU A . n A 1 52 PHE 52 52 52 PHE PHE A . n A 1 53 VAL 53 53 53 VAL VAL A . n A 1 54 PHE 54 54 54 PHE PHE A . n A 1 55 MET 55 55 55 MET MET A . n A 1 56 THR 56 56 56 THR THR A . n A 1 57 ARG 57 57 57 ARG ARG A . n A 1 58 GLY 58 58 58 GLY GLY A . n A 1 59 LEU 59 59 59 LEU LEU A . n A 1 60 ASP 60 60 60 ASP ASP A . n A 1 61 ASP 61 61 61 ASP ASP A . n A 1 62 PRO 62 62 62 PRO PRO A . n A 1 63 ARG 63 63 63 ARG ARG A . n A 1 64 ALA 64 64 64 ALA ALA A . n A 1 65 LYS 65 65 65 LYS LYS A . n A 1 66 LEU 66 66 66 LEU LEU A . n A 1 67 ILE 67 67 67 ILE ILE A . n A 1 68 ALA 68 68 68 ALA ALA A . n A 1 69 VAL 69 69 69 VAL VAL A . n A 1 70 SER 70 70 70 SER SER A . n A 1 71 THR 71 71 71 THR THR A . n A 1 72 ILE 72 72 72 ILE ILE A . n A 1 73 LEU 73 73 73 LEU LEU A . n A 1 74 VAL 74 74 74 VAL VAL A . n A 1 75 PRO 75 75 75 PRO PRO A . n A 1 76 VAL 76 76 76 VAL VAL A . n A 1 77 VAL 77 77 77 VAL VAL A . n A 1 78 SER 78 78 78 SER SER A . n A 1 79 ILE 79 79 79 ILE ILE A . n A 1 80 ALA 80 80 80 ALA ALA A . n A 1 81 SER 81 81 81 SER SER A . n A 1 82 TYR 82 82 82 TYR TYR A . n A 1 83 THR 83 83 83 THR THR A . n A 1 84 GLY 84 84 84 GLY GLY A . n A 1 85 LEU 85 85 85 LEU LEU A . n A 1 86 ALA 86 86 86 ALA ALA A . n A 1 87 SER 87 87 87 SER SER A . n A 1 88 GLY 88 88 88 GLY GLY A . n A 1 89 LEU 89 89 89 LEU LEU A . n A 1 90 THR 90 90 90 THR THR A . n A 1 91 ILE 91 91 91 ILE ILE A . n A 1 92 SER 92 92 92 SER SER A . n A 1 93 VAL 93 93 93 VAL VAL A . n A 1 94 LEU 94 94 94 LEU LEU A . n A 1 95 GLU 95 95 95 GLU GLU A . n A 1 96 MET 96 96 96 MET MET A . n A 1 97 PRO 97 97 97 PRO PRO A . n A 1 98 ALA 98 98 98 ALA ALA A . n A 1 99 GLY 99 99 99 GLY GLY A . n A 1 100 HIS 100 100 100 HIS HIS A . n A 1 101 PHE 101 101 101 PHE PHE A . n A 1 102 ALA 102 102 102 ALA ALA A . n A 1 103 GLU 103 103 103 GLU GLU A . n A 1 104 GLY 104 104 104 GLY GLY A . n A 1 105 SER 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