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UK ? ? primary 'Nat Commun' ? ? 2041-1723 ? ? 6 ? 10048 10048 'Structural basis of DNA gyrase inhibition by antibacterial QPT-1, anticancer drug etoposide and moxifloxacin.' 2015 ? 10.1038/ncomms10048 26640131 ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 'Acta Crystallogr F Struct Biol Commun' ACSFEN ? 2053-230X ? ? 71 ? 1242 1246 ;Crystallization and initial crystallographic analysis of covalent DNA-cleavage complexes of Staphyloccocus aureus DNA gyrase with QPT-1, moxifloxacin and etoposide. ; 2015 ? 10.1107/S2053230X15015290 26457513 ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Chan, P.F.' 1 primary 'Srikannathasan, V.' 2 primary 'Huang, J.' 3 primary 'Cui, H.' 4 primary 'Fosberry, A.P.' 5 primary 'Gu, M.' 6 primary 'Hann, M.M.' 7 primary 'Hibbs, M.' 8 primary 'Homes, P.' 9 primary 'Ingraham, K.' 10 primary 'Pizzollo, J.' 11 primary 'Shen, C.' 12 primary 'Shillings, A.J.' 13 primary 'Spitzfaden, C.E.' 14 primary 'Tanner, R.' 15 primary 'Theobald, A.J.' 16 primary 'Stavenger, R.A.' 17 primary 'Bax, B.D.' 18 primary 'Gwynn, M.N.' 19 1 'Srikannathasan, V.' 20 1 'Wohlkonig, A.' 21 1 'Shillings, A.' 22 1 'Singh, O.' 23 1 'Chan, P.F.' 24 1 'Huang, J.' 25 1 'Gwynn, M.N.' 26 1 'Fosberry, A.P.' 27 1 'Homes, P.' 28 1 'Hibbs, M.' 29 1 'Theobald, A.J.' 30 1 'Spitzfaden, C.' 31 1 'Bax, B.D.' 32 # _cell.angle_alpha 90.000 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 103.300 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.000 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 5CDQ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 87.930 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 170.550 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 125.670 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 8 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5CDQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'DNA gyrase subunit A' 54664.223 4 5.99.1.3 ? 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;LPGKLADCSSKSPEECEIFLVEGDSAGGSTKSGRDSRTQAILPLRGKILNVEKARLDRILNNNEIRQMITAFGTGIGGDF DLAKARYHKIVIMTDADVDGAHIRTLLLTFFYRFMRPLIEAGYVYIAQPPTGYKGLGEMNADQLWETTMNPEHRALLQVK LEDAIEADQTFEMLMGDVVENRRQFIEDNAVYA ; B,D,S,U ? 3 polydeoxyribonucleotide no no '(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)' GAGCGTATGGCCATACGCTT E,F,V,W ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ASN n 1 2 GLU n 1 3 ARG n 1 4 ASN n 1 5 ILE n 1 6 THR n 1 7 SER n 1 8 GLU n 1 9 MET n 1 10 ARG n 1 11 GLU n 1 12 SER n 1 13 PHE n 1 14 LEU n 1 15 ASP n 1 16 TYR n 1 17 ALA n 1 18 MET n 1 19 SER n 1 20 VAL n 1 21 ILE n 1 22 VAL n 1 23 ALA n 1 24 ARG n 1 25 ALA n 1 26 LEU n 1 27 PRO n 1 28 ASP n 1 29 VAL n 1 30 ARG n 1 31 ASP n 1 32 GLY n 1 33 LEU n 1 34 LYS n 1 35 PRO n 1 36 VAL n 1 37 HIS n 1 38 ARG n 1 39 ARG n 1 40 ILE n 1 41 LEU n 1 42 TYR n 1 43 GLY n 1 44 LEU n 1 45 ASN n 1 46 GLU n 1 47 GLN n 1 48 GLY n 1 49 MET n 1 50 THR n 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VAL U 625 ALA U 637 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale both ? A ARG 113 C A ? ? 1_555 A PTR 114 N ? ? A ARG 122 A PTR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale2 covale both ? A ARG 113 C B ? ? 1_555 A PTR 114 N ? ? A ARG 122 A PTR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale3 covale both ? A PTR 114 C ? ? ? 1_555 A THR 115 N ? ? A PTR 123 A THR 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? covale4 covale none ? A PTR 114 O3P ? ? ? 1_555 E DG 9 "C5'" ? ? A PTR 123 E DG 2009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? metalc1 metalc ? ? A TYR 313 O ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? A TYR 322 A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc2 metalc ? ? A THR 316 O ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? A THR 325 A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? metalc3 metalc ? ? A GLN 319 O ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? A GLN 328 A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc4 metalc ? ? B ASP 95 OD2 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B ASP 508 B MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc5 metalc ? ? B ASP 97 OD2 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B ASP 510 B MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? covale5 covale both ? C ARG 113 C ? ? ? 1_555 C PTR 114 N ? ? C ARG 122 C PTR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.363 ? covale6 covale both ? C PTR 114 C ? ? ? 1_555 C THR 115 N ? ? C PTR 123 C THR 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale7 covale none ? C PTR 114 O1P ? ? ? 1_555 F DG 9 "C5'" ? ? C PTR 123 F DG 2009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? metalc6 metalc ? ? C TYR 313 O ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? C TYR 322 C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? metalc7 metalc ? ? C THR 316 O ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? C THR 325 C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.831 ? metalc8 metalc ? ? C GLN 319 O ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? C GLN 328 C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc9 metalc ? ? D ASP 95 OD2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? D ASP 508 D MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? metalc10 metalc ? ? D ASP 97 OD2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? D ASP 510 D MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.942 ? covale8 covale both ? G ARG 113 C ? ? ? 1_555 G PTR 114 N ? ? R ARG 122 R PTR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? covale9 covale both ? G PTR 114 C ? ? ? 1_555 G THR 115 N ? ? R PTR 123 R THR 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale10 covale none ? G PTR 114 O3P ? ? ? 1_555 K DG 9 "C5'" ? ? R PTR 123 V DG 2009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? metalc11 metalc ? ? H ASP 95 OD2 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? S ASP 508 S MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? metalc12 metalc ? ? H ASP 97 OD2 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? S ASP 510 S MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.932 ? covale11 covale both ? I ARG 113 C ? ? ? 1_555 I PTR 114 N ? ? T ARG 122 T PTR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.367 ? covale12 covale both ? I PTR 114 C ? ? ? 1_555 I THR 115 N ? ? T PTR 123 T THR 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale13 covale none ? I PTR 114 O1P ? ? ? 1_555 L DG 9 "C5'" ? ? T PTR 123 W DG 2009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? metalc13 metalc ? ? I TYR 313 O ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? T TYR 322 T MG 4502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.910 ? metalc14 metalc ? ? I THR 316 O ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? T THR 325 T MG 4502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc15 metalc ? ? I GLN 319 O ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? T GLN 328 T MG 4502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc16 metalc ? ? J ASP 95 OD2 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? U ASP 508 U MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc17 metalc ? ? J ASP 97 OD2 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? U ASP 510 U MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.934 ? metalc18 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 W MFX . O02 ? ? A MG 501 E MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? metalc19 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 W MFX . O ? ? A MG 501 E MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? metalc20 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 SA HOH . O ? ? A MG 501 E HOH 2201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? metalc21 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 SA HOH . O ? ? A MG 501 E HOH 2211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.970 ? metalc22 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 SA HOH . O ? ? A MG 501 E HOH 2213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc23 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 TA HOH . O ? ? A MG 501 F HOH 2214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc24 metalc ? ? Q MG . MG ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? B MG 1001 B HOH 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? metalc25 metalc ? ? Q MG . MG ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? B MG 1001 B HOH 1111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc26 metalc ? ? Q MG . MG ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? B MG 1001 B HOH 1116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? metalc27 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 X MFX . O02 ? ? C MG 501 F MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc28 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 X MFX . O ? ? C MG 501 F MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc29 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 SA HOH . O ? ? C MG 501 E HOH 2214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc30 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 TA HOH . O ? ? C MG 501 F HOH 2201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.920 ? metalc31 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 TA HOH . O ? ? C MG 501 F HOH 2208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.957 ? metalc32 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 TA HOH . O ? ? C MG 501 F HOH 2213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc33 metalc ? ? V MG . MG ? ? ? 1_555 RA HOH . O ? ? D MG 1001 D HOH 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.944 ? metalc34 metalc ? ? V MG . MG ? ? ? 1_555 RA HOH . O ? ? D MG 1001 D HOH 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc35 metalc ? ? V MG . MG ? ? ? 1_555 RA HOH . O ? ? D MG 1001 D HOH 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc36 metalc ? ? V MG . MG ? ? ? 1_555 RA HOH . O ? ? D MG 1001 D HOH 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc37 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z MFX . O02 ? ? F MG 2102 F MFX 2103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc38 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 Z MFX . O ? ? F MG 2102 F MFX 2103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? metalc39 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 TA HOH . O ? ? F MG 2102 F HOH 2207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? metalc40 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 TA HOH . O ? ? F MG 2102 F HOH 2212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc41 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 YA HOH . O ? ? R MG 4301 V HOH 2201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? metalc42 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 YA HOH . O ? ? R MG 4301 V HOH 2204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? metalc43 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 YA HOH . O ? ? R MG 4301 V HOH 2206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? metalc44 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 ZA HOH . O ? ? R MG 4301 W HOH 2210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc45 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 JA MFX . O02 ? ? R MG 4301 V MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.050 ? metalc46 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 JA MFX . O ? ? R MG 4301 V MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.945 ? metalc47 metalc ? ? EA MG . MG ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? S MG 1001 S HOH 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc48 metalc ? ? EA MG . MG ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? S MG 1001 S HOH 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc49 metalc ? ? EA MG . MG ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? S MG 1001 S HOH 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc50 metalc ? ? EA MG . MG ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? S MG 1001 S HOH 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? metalc51 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 YA HOH . O ? ? T MG 4501 V HOH 2207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc52 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 KA MFX . O02 ? ? T MG 4501 W MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc53 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 KA MFX . O ? ? T MG 4501 W MFX 2101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? metalc54 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 ZA HOH . O ? ? T MG 4501 W HOH 2201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.885 ? metalc55 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 ZA HOH . O ? ? T MG 4501 W HOH 2208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? metalc56 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 ZA HOH . O ? ? T MG 4501 W HOH 2209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.090 ? metalc57 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 XA HOH . O ? ? U MG 1001 U HOH 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc58 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 XA HOH . O ? ? U MG 1001 U HOH 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? metalc59 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 XA HOH . O ? ? U MG 1001 U HOH 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc60 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 XA HOH . O ? ? U MG 1001 U HOH 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.843 ? metalc61 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 MA MFX . O02 ? ? W MG 2102 W MFX 2103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.966 ? metalc62 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 MA MFX . O ? ? W MG 2102 W MFX 2103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? metalc63 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 ZA HOH . O ? ? W MG 2102 W HOH 2202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? metalc64 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 ZA HOH . O ? ? W MG 2102 W HOH 2206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.930 ? metalc65 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 OA HOH . O ? ? F MG 2102 A HOH 624 2_646 ? ? ? ? ? ? ? 2.170 ? metalc66 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 UA HOH . O ? ? W MG 2102 R HOH 4425 2_755 ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? hydrog1 hydrog ? ? E DA 2 N1 ? ? ? 1_555 F DT 19 N3 ? ? E DA 2 F DT 2019 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? hydrog2 hydrog ? ? E DG 3 N1 ? ? ? 1_555 F DC 18 N3 ? ? E DG 3 F DC 2018 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? E DG 3 N2 ? ? ? 1_555 F DC 18 O2 ? ? E DG 3 F DC 2018 1_555 ? ? ? ? ? ? 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